4AZ6A

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 175
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
175
sequence length
435
structure length
435
Chain Sequence
SHNEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGWYNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDLNRYTAESVTAVKEAEKAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQETVNNLTLT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 175
structure length 435
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4az6A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4az6A01
4HOXA 5IFPA 5A95A 2WMIA 5D9OA 4AEEA 1C8YA 3KEHA 2ZUUA 4AD3A 4AZ5A 5CG0A 3UR7A 2DT1A 3SCUA 1KGUA 2ZXBA 4B15A 1C92A 2CIPA 1E6PA 4DUVA 1NWRA 3OGVA 3WEZA 6TAAA 4IPNB 5JBDA 3S6TA 3ARXA 1NWTA 4H8VA 1B3VA 1VFMA 1UD4A 1CYGA 1WP6A 3CMGA 1V6XA 4B9YA 3VX0A 1ODUA 2DPEA 4AZ7A 1CXFA 4ZENA 4R27A 2DSKA 3UESA 3L2MA 3WF4A 3ZJ8A 4AW7A 2BY0A 1A47A 4UCFA 4F79A 1GNXA 3WDIA 5BCAA 4PYSA 2AMGA 1J0JA 4DM1A 2J7GA 4GZIA 2PWFA 2BHYA 4CGTA 3EBVA 1IZKA 1DWHM 1VAHA 3WQ6A 3OIHA 2B31A 4FLSA 2WM0A 1US3A 3AI0A 1ZJBA 3SCWA 3RM9A 1CLVA 2W66A 1CLXA 1GHRA 2RGLA 5FOOA 5JUVA 1SMAA 2MANA 2WZHA 3K46A 4JIEA 3LPOA 5A6BD 2WMFA 4DWSD 3T0BA 2DIJA 3WD4A 1E56A 2OYLA 2QMKA 5TD4A 2CYGA 4W7UA 2PBOA 4YHEA 1EXPA 3PTQA 5IHRA 3BXWA 4X9YA 1UQYA 1YHTA 1V3HA 1E6NA 1E9LA 8A3HA 3BAXA 1Z32X 4UFKA 2X8RA 2V38A 2TAAA 4KRTA 2ZXQA 1J0ZA 4L4OA 1VIWA 3VVGA 3GXDA 1BG4A 2CESA 3O6AA 1CXIA 4MB5A 3ZJ7A 4PTVA 2JF6A 3CIVA 1L0PA 3VGGA 1DP0A 4UFMA 1BVZA 2DDXA 3AIEA 5FIPA 4H41A 2WSPA 1IZJA 1DWJM 3KL3A 3VDCA 5BYWA 2BS9A 2EEXA 4BS0A 2ZUNA 1C7SA 3CGTA 3WUFA 2WVVB 4PBGA 2E3ZA 5GNZA 1IV8A 2WVSA 1W9XA 1KWGA 4MPKA 2WMGA 4AC1X 4M1RA 2WPGA 2IXVA 4XX6A 2A3AA 3MUY1 3OZPA 1LL6A 2VJXA 3ZIZA 1AVAA 3K8KA 2VX7A 3AISA 1W9BM 2CNCA 2XWDA 3ARQA 3W25A 4UOZA 1UH4A 4PEEA 3WD0A 5BROA 2Y24A 4JL1A 3FY1A 1CGTA 3NJ3A 5CLTA 1HNYA 4BQ3A 3F5LA 3T2PA 5LA0A 3GH7A 1JZ3A 3AS3A 3CUFA 4PMQA 3PZIA 4JZ5A 5E0FA 5A8QA 1GW1A 5FL1A 5CPQA 1KR0A 1B3YA 1B3WA 4MAVA 4WIWA 2YIHA 3VGDA 2O9OA 4A3YA 3K1DA 4PUEA 2YKKA 1M03A 3I3DA 3N04A 5LA2A 2GDVA 2NSXA 1E72M 1CXLA 2J8FA 2D1ZA 2O9RA 4J3SA 1BGGA 4XZWA 1H09A 3K4DA 4IPLA 4ACZB 4UZUA 4ZEPA 3QHOA 1JZ8A 3BLKA 4UFJA 1BPLB 3GDBA 3T09A 1WO2A 3WIJA 3VIKA 2W61A 2G41A 4R5EA 3PHAA 1KB3A 1XH0A 3WDQA 4TVUA 1JGIA 1QNPA 3BCDA 3AYSA 2X05A 4JHOA 3EMQA 4DM2A 1G5AA 2VR4A 2RGMA 3ZSTA 1XD1A 4X0NA 1EGZA 1RP8A 1CGVA 3AMLA 4UFHA 1VBRA 3DHPA 3SIMA 1HKKA 3GNPA 1J18A 1B0IA 1GJUA 1Q6DA 1QNOA 2QHAA 4WLCA 3AS0A 4ATWA 2DGAA 2WSKA 1EA9C 3N15A 3U7BA 3NDZA 4H04A 2JF7A 3EDKA 5CGMA 1S46A 2VVSA 4M24A 3PZGA 1V6VA 1DWGM 4NSBA 4C7DA 1QI2A 4RE2A 2E9BA 4AZ6A 3A47A 4OJYA 4LYQA 2BY1A 1JZ6A 3VIOA 2F2HA 1HF6A 1G9HA 2WW5A 1VRXA 2XGBA 2D2OA 3SUSA 2J78A 4BQ4A 1PIGA 2VX5A 4AWEA 4BZYA 3CHCA 2XTKA 6A3HA 3LPPA 1VEMA 1E15A 2FGZA 1MFVA 5DF0A 4PMYA 4DUXA 2XPKA 1ITXA 4Z2LA 1W9UA 4HZ7A 5M03A 1VFOA 1V02E 2BXYA 4CN6A 4J7RA 4LYPA 2YL8A 4PSRA 1RP9A 3VIGA 3WUEA 3GBDA 5DT7A 3MV11 4S3KA 1XYFA 5C71A 4Z2JA 3POHA 3W28A 1CBGA 4MNLA 4FF5A 1LG2A 1QW8A 4MJ2A 4BF7A 2WVVA 4CU8A 4GI9A 2VRQA 3OLDA 4H2CA 3M6DA 1KQYA 3OBAA 1BLIA 3NIYA 2XFRA 5AYIA 1XCXA 3SCVA 2JEQA 3HU7A 4MNKA 2FDMA 1LF1A 2XVKA 4D1JA 5FKYA 4ML4A 3WH7A 2WVTA 4WK9A 1J12A 5CPSA 3UCQA 3WDPP 1GQLA 4GPNA 4UOJA 4IISA 5EMYA 4D72A 1V3MA 3PZ9A 4AXNA 2YA0A 3WNMA 2ZX6A 2FH8A 2CBIA 1E6XM 1GOWA 1HJWA 1TUXA 3CHDA 4KGLA 1ESWA 1HVXA 3WUGA 3FHAA 2ZX5A 2FGLA 3ZO9A 4YPJA 3N1AA 2BVDA 2DEPA 1I75A 2VURA 3BAJA 1EQPA 3W6MA 2BFGA 1G1YA 4HP5A 3U5UA 2VZVA 1JNDA 3W4RA 4H7VA 1C8QA 3WH8A 4D6IA 1JYNA 3VIFA 4JKKA 3NUKA 4Z2HA 4HMDA 1D3CA 5DEZA 1KGXA 2XVPA 2D24A 1MXDA 5E0CA 3ARZA 1K9TA 5I77A 3W82A 5LA1A 1KCLA 4W84A 1LG1A 4PMNA 2VR5A 4PMUA 5A2BA 1W9PA 4IM4A 1B2YA 3TTOA 3OA5A 4EAMA 3AMGA 1B90A 1WPCA 3GXIA 3RJYA 1N82A 3SCRA 4LQ1A 3TTSA 1JF5A 2G3MA 2FHBA 4MDPA 1XSIA 3NYDA 1E6QM 3B9AA 3ZSSA 3UG3A 5C8BB 1BGAA 3VGEA 4HPGA 3WBEA 3WQWA 1VF8A 2OO2A 1XYZA 4GZJA 5I78A 5M3WA 4OKDA 2PI6A 4AISA 2XG9A 3B8SA 4M29A 4UFIA 2WMJA 3W6LA 1UYQA 4D1IA 1UQZA 5KZ6A 1GONA 1QNRA 3T08A 2PMRA 1B1YA 1CXHA 2YDRA 2QF8A 1UR2A 3WF1A 1KWKA 4JFTA 3NDYA 1QBBA 3AROA 1FP9A 2G3IA 2WC7A 4V27A 3MKKA 2YLAA 4TX8A 3QHNA 4B16A 2X1IA 3MUAA 1BHGA 3EDFA 1EIBA 1HL9A 1W3LA 2CHOA 2WHKA 4JFUA 1B9ZA 4D6HA 1JAEA 4JFSA 2YJQA 1ISYA 3WKZA 4UQBA 2G8ZA 4HZ6A 1V02A 2J75A 1QI3A 1E4NA 1PIFA 3WDJA 3GNOA 3PZOA 3FXYA 4U31A 2GJPA 3CUHA 3UERA 4MB4A 6CGTA 3AHVA 5I6SA 2XFFA 1HVQA 4UZSA 3EDDA 5HOSA 8CGTA 1TVNA 3VD7A 4W8BA 1LWHA 3WNOA 1ISXA 4U5KA 5IXEA 2V5DA 3WMBA 3UETA 4U2ZA 3A4AA 2Y8VA 4M56A 4LYRA 2GDUA 2CETA 4Z2IA 4CD5A 1RH9A 3F4VA 2WKLA 4LX4A 1UR0A 5A69A 1B3ZA 5HBFA 2OWCA 3POCA 1UWQA 1QOXA 3RPMA 1NM9A 3CLWA 3M07A 3GXFA 2EBNA 3OB8A 5A2AA 3L4XA 4F66A 3I3EA 3W27A 2G3JA 3MSGA 5JBEA 1GCYA 4A3HA 3ZT7A 4AIUA 1SFSA 5A6MA 1W3JA 2V3DA 3GM8A 1P6WA 1ZBWA 3WN6A 4QCEA 1TA3B 2J7CA 3BGAA 1C7TA 2VOTA 2WB5A 1UH2A 3FNDA 3MMDA 3WFLA 1V3IA 2A3EA 1D2KA 2ZX7A 5CXPA 1WKYA 1JZ4A 1HJVA 3U7VA 2YA2A 4MB1A 5A6LA 2WLYA 4X0VA 3VX1A 1XGZA 1JYWA 3II1A 3TTYA 3L4YA 4CD6A 3VNZA 4W88A 4AZGA 2ZXAA 3AMKA 3GH4A 4BCEA 3ZMRA 4HTYA 4U5IA 3ZOAA 1YQ2A 1C8XA 5E6YA 3N17A 3EMZA 3NSXA 1V3LA 4LXFA 2J7HA 3W37A 3VMOA 3HN3A 2D0HA 4J3XA 3CMJA 4V28A 4D6GA 2CEQA 3BMVA 2BV9A 1JDAA 1OGSA 3MV01 4F9DA 4UQEA 4YN5A 9CGTA 4UOQA 1JF6A 4GO8A 1QI0A 2BY3A 3CZLA 1JAKA 1J0HA 1ZBCA 3SURA 1CECA 3CHFA 3AS1A 4W8LA 4PMZA 1V03A 4EKJA 1MVYA 4DUWA 2WVUA 4OBSA 1HT6A 1QI5A 3MUZ1 2F61A 3QOKA 4CKQA 4KWUA 3OLEA 1SYTA 3WQVA 3CZJA 1PX4A 3S2CA 1G01A 1QHOA 3RMEA 1H2JA 3WF2A 3EDJA 7TAAA 3DC0A 3L4ZA 4W89A 1HP4A 3VM5A 3WBAA 4ZXOA 3ARTA 3VGHA 1TMQA 3CTTA 4PMVA 4NZCA 1BYCA 2EO7A 4NRSA 1OIFA 4CVWA 1XHGA 2G3NA 1E5JA 1KBBA 1LLOA 2CHNA 1BYDA 5GQBA 3AXXA 3BAYA 4RE3A 2JEPA 1QNQA 2VX4A 2QPUA 2HISA 3A4WA 1UHVA 5I24A 1HL8A 5I3DA 4E4PA 2J7BA 3KZSA 3PZTA 5ABGA 1KXHA 1W1YA 4LPCA 1NP2A 4EK7A 1HJUA 4PRWA 4HPHA 2JIWA 4UFLA 2D0GA 3HMCA 3WUBA 5DT5A 3SUUA 3OGRA 3MO4A 1EH9A 1H5VA 1VB9A 1A3HA 2GUYA 3WELA 4W8AA 4AYSA 1M01A 3N12A 1JXJA 5E6ZA 3SEPA 1OT2A 2VQTA 2WMHA 1NARA 5HDRA 4D6DA 2WANA 2E9MA 3NSNA 4FLOA 4J3WA 3AQUA 5HNNA 1BAGA 3OLGA 1CIUA 1DWAM 1V0NA 2V3FA 1MQQA 2VC9A 2EQDA 4M81A 1J0IA 4CCCA 4CD4A 3ZM8A 1NP0A 5ABEA 4TTUA 2WHLA 3KL0A 3AMDA 2D22A 4D6FA 4UQCA 1VBUA 3FAWA 4PTMA 1QHZA 2WKGA 2NW0A 1MW3A 4MAZA 3LPFA 1HJQA 2WC3A 1CTNA 1DEDA 1RPKA 1U33A 1QW9A 2W63A 2VZUA 4MNMA 1BTCA 4GI6A 3CH9A 3WY1A 3K4AA 1AQ0A 1TFVA 1TA3A 4P8VA 5BRPA 1JNEA 1PX8A 4B3LA 1DWFM 1JDDA 1WZLA 2ZX8A 1W1PA 3WFZA 3B9EA 1NOFA 1FH8A 3DYOA 4AD0A 1JIBA 3WL0A 3EDEA 1PBGA 4L4PA 2OSWA 3M46A 1G0CA 5F7UA 3ZT5A 1AQHA 1FHDA 4OBRA 3ZR6A 2WYSA 4RE4A 3BLPX 3BH4A 3ARRA 5IFTA 1W2VA 3FN9A 2X0HA 4P7OA 3O9NA 3TOPA 1CGUA 2JIEA 2G4FA 2PBGA 4JL2A 3IJ9A 1UA7A 3VIJA 4GIAA 5HPCA 4ZE5A 1GOQA 4E8DA 3W24A 1NQ6A 2WK2A 2XSAA 4W93A 2E0PA 1J0KA 2ZUTA 3PN8A 4QP0A 3PTMA 1CGYA 1FHLA 4J28A 4CD8A 1JL8A 4U33A 3E1F1 3UG4A 1UR8A 4UQDA 1R87A 2PB1A 4WKFA 4H8UA 1JFHA 2W91A 1HKJA 1KR1A 2C8NA 1GUVA 2E9LA 4HMCA 4HOWA 1ITCA 2X09A 3VIHA 3WMCA 1L8NA 5BXSA 3VDHA 1GOOA 1UWSA 2WHJA 2YBTA 3CPUA 2PF0A 2WNWA 4ZFMA 4WSJA 4D6CA 3UEQA 4AY1A 3W53A 4H8HA 1Q6GA 4BQ5A 3THDA 1KXVA 3L2LA 3WQ5A 5EB8A 1K6AA 4PSPA 3ZJKA 1WAWA 3SCTA 3AHZA 5A6KA 3CBWA 1V0MA 4BA0A 1R86A 1NH6A 5DMYA 3VMPA 1OCQA 1BFNA 3HJEA 4HU0A 3WH6A 1B31A 1V6WA 1GOMA 3QOMA 1GQIA 1R8LA 1UA3A 1E71M 1D7FA 1GZJA 1WDRA 5HPOA 1QPKA 2CKRA 3BMWA 1JZ5A 2YBUA 3WNPA 4ACYA 3SCPA 4TOQA 1PJ9A 2EPNA 2ZWZA 4DWSB 4DWSC 2PWHA 5ABHA 1XSJA 1GHSA 1H0GA 5D9NA 1KXQA 4TUFA 1Q6CA 1FH7A 5A8OA 3AFBA 3I3BA 2WCGA 3VIIA 3WNNA 3WD3A 1ZS2A 4PTWA 2YOCA 1H11A 4HMEA 1WDQA 3GYCA 4QFUA 1KCKA 5LYRA 3J7HA 1UWRA 3SUTA 3ZJ6A 1J01A 3CZGA 3QGVA 2ZWYA 1E4IA 4GZEA 2J7EA 3N9KA 4GQRA 3AZRA 2EPOA 3CZKA 2WC4A 2GVYA 5CGTA 1VJSA 5DFAA 3IJ8A 3ARYA 3ARSA 3MSDA 3GBEA 4MNJA 1V6YA 4WJXA 5I79A 3WDHA 3IK2A 4W86A 3AXHA 1J11A 2NT1A 4HA4A 2ZX9A 4TVCA 1XRVA 4QDMA 4PMOA 1C3FA 2QPSA 3VIMA 2E8YA 3FW6A 4UQAA 3PZNA 2D3LA 3PZMA 2O9TA 2JNKA 2W4XA 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 4DYL A;  2Q3O A;  3TN4 A;  2SFP A;  3C0L A;  1P0B A;  4FOU A;  2FZ8 A;  3PG8 A;  3BAK A;  2OSY A;  4W7V A;  4JWI A;  1IYX A;  3VTR A;  5GPR A;  2X7V A;  4HPN A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 4HOX A;  5IFP A;  5A95 A;  2WMI A;  5D9O A;  4AEE A;  1C8Y A;  3KEH A;  2ZUU A;  4AD3 A;  4AZ5 A;  5CG0 A;  3UR7 A;  2DT1 A;  3SCU A;  1KGU A;  2ZXB A;  4B15 A;  1C92 A;  2CIP A;  1E6P A;  4DUV A;  1NWR A;  3OGV A;  3WEZ A;  6TAA A;  4IPN B;  5JBD A;  3S6T A;  3ARX A;  1NWT A;  4H8V A;  1B3V A;  1VFM A;  1UD4 A;  1CYG A;  1WP6 A;  3CMG A;  1V6X A;  4B9Y A;  3VX0 A;  1ODU A;  2DPE A;  4AZ7 A;  1CXF A;  4ZEN A;  4R27 A;  2DSK A;  3UES A;  3L2M A;  3WF4 A;  3ZJ8 A;  4AW7 A;  2BY0 A;  1A47 A;  4UCF A;  4F79 A;  1GNX A;  3WDI A;  5BCA A;  4PYS A;  2AMG A;  1J0J A;  4DM1 A;  2J7G A;  4GZI A;  2PWF A;  2BHY A;  4CGT A;  3EBV A;  1IZK A;  1DWH M;  1VAH A;  3WQ6 A;  3OIH A;  2B31 A;  4FLS A;  2WM0 A;  1US3 A;  3AI0 A;  1ZJB A;  3SCW A;  3RM9 A;  1CLV A;  2W66 A;  1CLX A;  1GHR A;  2RGL A;  5FOO A;  5JUV A;  1SMA A;  2MAN A;  2WZH A;  3K46 A;  4JIE A;  3LPO A;  5A6B D;  2WMF A;  4DWS D;  3T0B A;  2DIJ A;  3WD4 A;  1E56 A;  2OYL A;  2QMK A;  5TD4 A;  2CYG A;  4W7U A;  2PBO A;  4YHE A;  1EXP A;  3PTQ A; 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