4AZCA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
419
structure length
416
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 166
structure length 416
sequence length 419
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azcA01
3VMOA 4DUXA 4URIA 3K46A 3PZVA 1BG9A 3B9DA 4KGLA 2D0HA 4J3SA 1UQYA 1UR9A 3MO4A 1GJWA 2WVVB 3TTSA 2GJXB 4AD0A 1VJSA 1MWOA 2VT0A 3KL3A 1ECEA 5A2AA 1FFQA 1G01A 2EO7A 1J0YA 2PC8A 4UQDA 2BY2A 5DT7A 4EANA 2E3ZA 4D6GA 4FLQA 1JYXA 1GOMA 1B1YA 1HT6A 1M03A 3RIKA 4WKAA 4AD5A 3SCPA 1JFHA 1W9PA 4MNJA 3WMSA 4B9ZA 4UTFA 4W84A 4CD4A 4DUWA 4U5IA 5A2CA 1QHPA 4AY1A 1UH3A 4HTYA 4EAMA 1EDGA 1HP4A 2VZUA 4D6EA 4AIOA 1VFUA 2WVVA 1SFSA 1V03A 4JHZA 4U33A 1DWGM 3VGHA 3BCFA 1W9DM 3F4VA 4U3CA 3KEHA 1S46A 2D2OA 1HJWA 3WDIA 1CGUA 3KL5A 3GH7A 1NWSA 4JFVA 1PX3A 3T0AA 2XVNA 1B3WA 3BC9A 3DYPA 1LLOA 4PMRA 1PZ3A 2WMGA 4KWUA 4GI6A 4J27A 1RD6A 1WE5A 3QHOA 4MADA 3QGVA 2XFRA 1CBGA 5A6BA 1DP0A 1UA3A 4E8DA 1JZ3A 1D7FA 4XZBA 5CXPA 1WB0A 1UWIA 4OOUA 4YN5A 1RPKA 2QPUA 3GYCA 3WDRA 4QCFA 3WF4A 4OKDA 5A8MA 2V5DA 3UG4A 5A8OA 4HZ8A 1UKTA 1V0MA 1E0XA 3K8LA 4PMXA 3EMZA 4PMQA 3KWXA 3PZUA 4CU6A 4TX6A 5GNZA 2VX5A 1HKKA 3AHXA 3IJ8A 1ISVA 3FHAA 1J11A 1U30A 1EO7A 4PMYA 2VCAA 1HJVA 4WF7A 2WMHA 1C93A 6CGTA 1TUXA 4JZ5A 2NT1A 1XCXA 4PMDA 2D3LA 5M5DA 1CGVA 3U7VA 3WH8A 2GJPA 3D5HA 3D3AA 1CXKA 3WNOA 1ZBCA 5JUVA 1C90A 1B3XA 1E9LA 7A3HA 5BWFA 1OD8A 1KXHA 2G4FA 5GNYA 3EMCA 4CN1A 2WC3A 2XG9A 5A6MA 2A3EA 4ATDA 2WZHA 2CIPA 4B3LA 3BMVA 1F4AA 1SMAA 3ARYA 1QBAA 1CTNA 1H0IA 2J47A 3A47A 1GHSA 2DT1A 1UZ1A 2VCCA 5I5RA 2IUZA 3HJEA 4NRRA 2XYLA 4ZENA 4BQ3A 3W6LA 3ZM8A 3QR3A 3JUGA 4RL3A 3SUWA 2GJRA 2JFEX 4EE9A 2ZWYA 3WUEA 3DYOA 1E1EA 3MV11 2ZX5A 4HA1A 3ZSTA 2CPUA 3A4XA 2AOSA 5TD4A 4CCDA 4AZCA 4N0RA 1TG7A 2BY1A 2WVUA 2VX6A 4ACZA 4H8HA 1EGZA 1UH2A 1C8XA 2ZXDA 3GXFA 5JBEA 2E40A 3K8KA 3PZIA 1J18A 2WKGA 3VVGA 4K68A 1Z32X 3OIHA 2IXVA 4NF7A 1JAEA 4W88A 1BPLB 3VIJA 4ML4A 3VU2A 1GHRA 4M29A 3UESA 2CKSA 3CHCA 3CHDA 1W3KA 2DPEA 2X8RA 3EDKA 1US3A 3AHTA 1GPFA 2PBGA 4AZBA 4MPKA 5BRPA 3AFBA 2EQDA 3WD1A 1B3ZA 2BXYA 5A69A 1FP9A 1RP8A 2V5CA 3SIMA 1IT0A 3BSGA 2XHYA 2CETA 2BY3A 2VJXA 3VMPA 5DF0A 1DWJM 2X0YA 2WHLA 1C7SA 3MU7A 3BAWA 4UZUA 2BS9A 1JYVA 1LF1A 5AC5A 3SUVA 1MQRA 1QI4A 2OSXA 2WHKA 2FHFA 1UR8A 3BAXA 1DEDA 1V6YA 1XGZA 2WCGA 1DTUA 2VZTA 2XTKA 3WDJA 1OT2A 5C71A 4ZEPA 3GNRA 3TTQA 3GXDA 1QI0A 3AIEA 1MW3A 2XUCA 3B8SA 4P8UA 4QLLA 1XHGA 2X2YA 1CWYA 2OZNB 2A3BA 1LQ0A 4GXPA 3MKKA 2EPLX 1G9HA 3W29A 2JALA 1XH2A 4LGXA 1WNOA 3AZTA 1CDGA 1WZKA 2FH6A 1V3IA 4KRUA 1E43A 1XSIA 5JBDA 1GOQA 3GBDA 5E70A 4MDOA 1QNSA 3T2QA 3II1A 1KQYA 3PZNA 1XSJA 3W37A 1M53A 3I3EA 5A6JA 4W85A 4H8UA 2O9TA 3WDHA 1HF6A 1NP2A 1SYTA 5BXSA 4GQRA 2O9OA 5A6SA 1JI2A 1P6WA 4MTVA 4HA3A 1FHLA 1JYWA 2J78A 3AS2A 1BSIA 2FH8A 5AC4A 4AZHA 5FIPA 5CSYA 2D23A 1TZ7A 2D22A 2ZUMA 1YQ2A 3LMYA 5JBFA 2WWDA 1PIGA 3PTMA 1XCWA 2XPKA 1E6NA 1GZJA 1E73M 1GOOA 1KBKA 5EFDA 1E6PA 4CCCA 1KWKA 3VGDA 3PZ9A 1W9UA 1UKSA 1C8QA 1J0IA 1FFRA 3TTYA 3FAWA 1G1YA 2VZSA 1R87A 2BHUA 4S3KA 3VIIA 3BCDA 4ZXLA 3L4YA 1ZBKA 4TTGA 4TOQA 5I24A 1CECA 4HOZA 4FZOA 3L4VA 4AXNA 4HA4A 1C3FA 3AMGA 2JNKA 1E55A 5FKYA 4TVCA 3WELA 3GNOA 4HZ7A 3AHZA 5A8PA 3EYPA 3GBEA 3VGFA 1ISXA 2OYLA 1BYAA 4IISA 1I1XA 4AZGA 1UR4A 3PZQA 1KWGA 1QOXA 1JZ8A 1UD2A 4XZWA 3ALFA 4LYQA 1CPUA 5BXPA 4P8XA 3SCWA 1HJSA 1BYDA 3AS1A 4KGJA 3VM7A 4TXEA 3CUHA 9CGTA 2CXGA 3CUGA 2A3HA 3WEMA 4PBGA 2W91A 3VO0A 2F8QA 4C7DA 4Y7EA 1FA2A 3LPFA 4WKHA 3AIVA 4AZ6A 2VVNA 4MJ4A 3VMNA 1UKQA 5A6AA 5GPRA 5E09A 3KZSA 2WAGA 3WD4A 4W87A 4AD2A 4U5KA 4J3TA 5ABHA 2YLAA 3AIWA 3PHAA 2GSJA 1B90A 1KBBA 3NUKA 2EPKX 4DWSB 5AYIA 1UD8A 2BNJA 3NCOA 1W1TA 1QI5A 4UNIA 1NWTA 4GZEA 3AIUA 4PN2A 3GM8A 4CN6A 4PMVA 1XD0A 2VR4A 3MMDA 3N17A 2DSKA 3AYRA 4PSRA 3W53A 3G6LA 3W0KA 4Z2IA 4B16A 1W91A 3W38A 4H7VA 2YDSA 5C70A 6A3HA 2J7DA 4PMZA 4CGTA 2WVSA 3W81A 2XGBA 3SURA 3MMUA 3VNZA 1JF5A 3WNPA 1PZ2A 3ZQ9A 1WDQA 2WBGA 2PB1A 2JE8A 2DSVA 1C91A 3GNPA 1LL6A 3KE0A 4YHGA 4CU8A 8A3HA 4D6HA 4B15A 3WUBA 3AS0A 3M7SA 1ZU8A 1JNDA 1UHVA 2UY4A 7CGTA 1HX0A 4MNKA 1U33A 3AIQA 2CITA 1EHNA 2GFTA 3GXMA 2YL5A 5KEZA 2Y8KA 4TX8A 5ABFB 2A3AA 4NSBA 1GUVA 3GH5A 4P8VA 5F7UA 3GTNA 4HMDA 1DWIM 4RE3A 1GQIA 1UWSA 3L2MA 5D4YA 1H3GA 4PTVA 3WQ4A 5BYWA 4ATWA 4FMVA 1OGGA 4HZ6A 1V6UA 1LL7A 5CQ1A 1JZ7A 1H0GA 1ZBWA 2WSKA 3BSHA 1V6XA 5I3DA 1KR0A 1DHKA 3FXYA 1O6IA 2VQUA 3HN3A 3I3DA 2OWWA 4MAVA 3SCSA 5EB8A 2E9LA 2WMJA 3WMCA 1GOIA 1OSEA 2J25A 2XVLA 3QHMA 3CUFA 1W9XA 4AIEA 2JEQA 5A6BD 1XC6A 3VDHA 1W1YA 3LPOA 1QVBA 2UY5A 4UFKA 2NT0A 5E0FA 1KCKA 2DH3A 3VIHA 2VI0A 1KR1A 1HN1A 4PUDA 3NDYA 1IZJA 5D8WA 3WL1A 1WZLA 3FN9A 3FY1A 4IPNB 2X05A 3RILA 5JIPA 4H04A 1MQQA 2GJXA 4PYSA 5HPCA 3N15A 1BQCA 3N18A 3J7HA 1DWAM 4NI3A 3WNMA 1E71M 2XIIA 4H41A 5LYRA 4PSPA 4OJYA 3AMDA 1BFNA 5IHRA 4U2YA 3RO8A 2G41A 2NW0A 4CVWA 1JD7A 3CMGA 1W3JA 2BHYA 1V3LA 2YA0A 3VINA 4CKQA 4P7RA 1VEPA 5E0CA 3CMJA 1V02E 4N42A 1HXJA 5AY7A 4MB3A 4NRSA 3VIGA 2CCRA 4OZOA 2GK1B 5M3WA 1AQMA 3EDJA 3NJ3A 1NWUA 3PN8A 3N04A 4UQAA 4CN4A 1LWJA 3AROA 1MFUA 2D0GA 1CLXA 1N82A 3IJ9A 4GO9A 4DM2A 2W4XA 2WZEA 5FD0A 5I78A 4JL2A 4B3KA 3UERA 6TAAA 5I2UA 1H41A 4B9YA 4UFJA 2J77A 4AZ5A 3BAKA 1UR2A 3NIYA 5GQBA 3BAJA 1XYFA 4OBRA 2XWDA 1MXGA 1Q6EA 2DH2A 3BAYA 3WFZA 3NSMA 1NWRA 3ZMRA 1JG9A 3VM5A 1EXPA 2Y2WA 2ZE0A 3L4ZA 3NYDA 1BGAA 3CZGA 3MUZ1 1H4PA 5DFAA 1UOKA 3OLGA 2XGIA 3W25A 5CLTA 1PJ9A 3RDKA 4ZE4A 4GZJA 1DWFM 4FLSA 3ARXA 2X1IA 3CHEA 3N9KA 4LXFA 2CBVA 1CENA 3DYMA 5HOSA 1GNXA 2NSXA 1EDQA 1W3HA 2CHNA 4P8WA 1X6NA 3U5YA 2WXDM 4UFLA 8CGTA 3WF2A 3WDPP 2YA2A 2YKKA 2RGMA 2WANA 4CCEA 3AHYA 1KGWA 1NP0A 1X6LA 1E15A 4JCMA 2ZXBA 3ARZA 1FOBA 2OLHA 1UWRA 2XVPA 1NOUA 1GQKA 2BHZA 1R8LA 4AEEA 1E40A 1E70M 4M81A 3VGGA 2XIBA 4QLJA 1R7OA 1AVAA 5HDRA 3VGBA 3IAPA 1SMDA 1C92A 2PWHA 2YOCA 4PTMA 2WM0A 4OIFA 1JNEA 4IM4A 4GIAA 1EO5A 1HKIA 4BQ4A 3WNNA 2FHBA 2MANA 3VDBA 2ZX9A 3CGTA 2D3NA 1CEOA 2CBUA 3OLDA 3ZIZA 1UD3A 1WDRA 5LA0A 2W5FA 1WDSA 3RPMA 1XYZA 3VD5A 3L4UA 3WD0A 1CXLA 3S2CA 4FK9A 2J8GA 1Q6CA 2W61A 4D1IA 3TP4A 1BGGA 3CZ8A 2WHMA 2QHAA 1A47A 4J7RA 4BA0A 2J62A 3SUUA 1WCGA 3RJYA 2J75A 3VIPA 4Z2HA 2A3CA 1IZKA 4XUYA 3A4AA 3IANA 1E6ZA 1TA3B 4Z2LA 4UFHA 1HKJA 1R85A 1G5AA 3W27A 1JD9A 2XSBA 2XM2A 1OIFA 3VD4A 2UY3A 1E0WA 2WBKA 4PMOA 1I1WA 1JXJA 3VPLA 1LWHA 2J7HA 4GI9A 3O2LA 3VIKA 1VIWA 4AD1A 4AYSA 1UD4A 2V3GA 3MV01 4C7GA 2Q8XA 4W8BA 2WLZA 4WK9A 1YHTA 2WPGA 5GNXA 3CO4A 5FL1A 1H09A 1C7TA 4DUVA 1CXFA 1E6SM 3ZT7A 4W5ZA 2XM1A 1UKOA 4LYPA 3ZJ7A 1EIBA 3ZR6A 3BH4A 2GUYA 1WPCA 2QLYA 1VFOA 4HPHA 1US2A 4FLRA 1VBUA 2YJQA 3SCQA 1UR0A 2DEPA 4JIEA 4HMCA 2CHOA 1D3CA 4PMNA 4FLOA 4CU7A 3WH7A 4JFUA 1IV8A 1ZS2A 4MAZA 4QCEA 2VZVA 5CLWA 3RJXA 4JKLA 4F9JA 1FH7A 4D1JA 2W67A 5D9PA 3PZMA 4OUEA 3U5UA 4AISA 2YDRA 4LPCA 3SUSA 3WBAA 5D8ZA 1J12A 3DHUA 1MYRA 2G3IA 3W6MA 1WKYA 2ZXQA 1JXKA 2UWFA 2WK2A 2WMIB 4CD6A 1JAKA 3WUFA 1UWUA 5ABEA 3ARSA 2X09A 2QMJA 3WIJA 1GOKA 2Y4SA 4QAWA 1TFVA 1XD1A 4WLCA 4HU0A 4M1RA 1B30A 1GW1A 3RM9A 3WFLA 4M82A 3WQ5A 4F9DA 1Y7VA 4UQ9A 3VTRA 3ECQA 1HL8A 1FH9A 2C8NA 1E56A 4AWEA 1E0VA 3K4AA 4Z2JA 3VGEA 3ALGA 1BF2A 3E1F1 1UA7A 3O6AA 4W8LA 4X0VA 3OA5A 2PBOA 4M8UA 2HVMA 2WSPA 4JFSA 4J3XA 5A6KA 1MW0A 4HU8A 2D0FA 3WH9A 2YBTA 3AMLA 1E6RA 1K9TA 1NARA 2GVYA 1VFFA 1HJQA 1JZ4A 1WO2A 3WEOA 4D72A 4W7WA 1BHGA 1G0CA 1W9BM 1QBBA 4L4OA 3L4WA 4M80A 2G3NA 1V02A 3VDCA 2YL8A 2J7EA 3VDAA 2BY0A 1TR1A 5BXRA 1O7AA 2PWDA 1UG6A 2VZOA 4FZPA 4CD5A 3ARTA 2DSWA 5JIWA 3AOFA 4W86A 2EJ1A 3CZKA 2OYKA 3SCVA 4IPLA 2VCBA 2WC7A 3BLPX 3WH6A 4AD3A 2VL4A 1TMQA 1QNPA 4XB3A 2O92A 1KGXA 1H1NA 1DWHM 1BTCA 4GINA 4LYRA 5LA1A 3UEQA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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