4AZCA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 166
50100150200250300350400020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
419
structure length
416
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGK
50100150200250300350400400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 166
structure length 416
sequence length 419
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azcA01
3DECA 1K9DA 4LPCA 2JIEA 3AZSA 2CXGA 3VIPA 1QHZA 2UWFA 4JHZA 3BAWA 2WC4A 3WSUA 3U5UA 5A8QA 1CGTA 2PWGA 1VFUA 2Y2WA 4NZCA 1GOOA 2OO2A 1EHAA 1JNEA 4CD6A 2JIWA 5I24A 4EKJA 3PZVA 1E4MM 1UOKA 3W28A 2V5DA 3U5YA 3O6AA 2PWDA 2ZIDA 1MQQA 3SCUA 5I0DA 4MNJA 1QNSA 4P7NA 1M03A 3OZOA 2FH6A 1HVQA 2Q8XA 3QHMA 1QNPA 4OZOA 3CZJA 1RD6A 3FAWA 4AZCA 2WC3A 1ZBVA 1LWJA 1GHRA 5DF0A 2ZX9A 2NT1A 2WVVB 1VENA 4PRWA 2BY3A 1KBKA 1UA7A 4AZ5A 2XWEA 1O6IA 1OD0A 1EDTA 4FLOA 4PMXA 2W61A 3IJ7A 2BVDA 3WQ6A 2WKGA 2CETA 4AWEA 3OLIA 3ZT7A 2YJQA 1V3LA 1NARA 1G5AA 1JFXA 1UD2A 4TX8A 3VD7A 4PEEA 4HA1A 3AHVA 3RM9A 3WNOA 3CTTA 4AD2A 1C90A 2VRKA 5FKYA 4YHEA 1PBGA 1KR1A 3AS0A 4S3KA 4CD5A 3F4VA 3FAXA 3OLGA 3PZUA 1GUVA 3A4WA 3GXFA 3BC9A 2X0HA 5D8WA 2WWDA 3ARRA 1K9FA 3ARXA 3CUJA 3LPGA 1XV8A 2D23A 4JFSA 3AXHA 1W1VA 2J7GA 2VX7A 4IM4A 1ZBCA 4W86A 1EIBA 2PBOA 2CHNA 2WAGA 4W8BA 1UWUA 2BHUA 1C92A 3PZQA 1V3IA 5TD4A 4B9YA 3PZNA 3TP4A 3ZOAA 2BNJA 3WMCA 4H8VA 4JZ5A 1TA3B 3SCQA 3GXDA 3ARTA 2BHYA 2ZUTA 4JL1A 4PMQA 4KMQA 1GNXA 1MQPA 1I75A 3AS2A 1FH7A 2WVSA 1CXHA 4F9DA 1DP0A 1NOFA 3SCWA 1UKSA 5FOOA 2VI0A 3WELA 3O9NA 4JFVA 4TXEA 2WMJA 3FHAA 1QPKA 1HN1A 1JXJA 4GQRA 1AQHA 3O2LA 1FHDA 4J7RA 4MADA 4QAWA 1M53A 4PSPA 2J7HA 1CGYA 3MO4A 1CLXA 3MS8A 1JZ2A 4JKLA 5FD0A 5IHRA 1R8LA 4ATDA 4ZXOA 1QW9A 4GPNA 4L4OA 2XVGA 3VIMA 4DM2A 1GZJA 4HPHA 1W91A 2XJ7A 1DHKA 4V28A 5HBFA 1KQYA 3VUPA 3D5HA 2VO5A 5BROA 4JFUA 3WFZA 2VZSA 3T0BA 4MAZA 5A6BD 3L4VA 2PMRA 4HPGA 1HKMA 3ZIZA 1UH3A 5A6JA 3A3HA 3WDJA 2ZWYA 5AY7A 4J3UA 1DTUA 1NWRA 3WH8A 4ACZA 1A47A 2BS9A 2QF8A 2EBNA 1W32A 4UZUA 3ARUA 3U57A 3N13A 3MU7A 7CGTA 1S46A 2OLHA 1V6UA 4MJ4A 5E0FA 2W67A 4RE4A 3EYPA 4GXPA 1PZ2A 2D3LA 4M82A 1E70M 1ODZA 2QMJA 3SIMA 1WPCA 2WMHA 1J0JA 1VJZA 4LYPA 1M7XA 1KB3A 2VVNA 3WUFA 3DYOA 4PYSA 1CGWA 2EEXA 1UD8A 2X1IA 1ODUA 5JBEA 2DH2A 2WSPA 1UHVA 4PMOA 1C8XA 1JXKA 4W93A 2ZUVA 3I3DA 1EOMA 1C7TA 1GOMA 3A47A 5I23A 1PX3A 4U3CA 3CLWA 1KR0A 2F2HA 3WEMA 1GHSA 4AZBA 1VIWA 2ZE0A 4UFKA 1G1YA 1U30A 4Q22A 2VX6A 4C7DA 2O9OA 4EK7A 3MMWA 4AZHA 4XUYA 1JGIA 1M04A 4PUEA 2PWFA 4RL3A 4H8HA 2J4GA 3PN8A 1FOBA 2XWDA 2XIBA 1XCWA 2EQDA 2XSAA 3BLPX 7TAAA 2ZICA 2BV9A 1W9VA 2X05A 1Y7VA 3KEHA 1HIZA 2W5FA 1JD9A 2B31A 4UQAA 1B0IA 5I79A 1R7AA 5CLTA 3L4WA 3WF1A 1OGBA 3VNYA 4HZ8A 2AOSA 4P7RA 4ZE5A 5JBDA 1CEOA 1CZ1A 5I77A 3RMEA 1CWYA 3EMZA 2EXOA 1KXTA 2YKKA 3PZGA 3GBEA 1DWAM 1OB0A 2ZUUA 3OZPA 4AIEA 1HJXA 2VUYA 3EDDA 2WCGA 6TAAA 2V3FA 2VX4A 7A3HA 2V3GA 5CPSA 4PMUA 1E6XM 2CIPA 2DEPA 2VJXA 3BAJA 1EDGA 3ZMRA 1ZU8A 4HU0A 5A1AA 1RP9A 3VGFA 4AIOA 1VAHA 3W24A 2J25A 1HX0A 1XGZA 3G6LA 3WF0A 3APGA 1GPFA 5EMYA 2WZEA 4MB1A 4WIWA 2WW5A 4TTUA 5JUVA 4ZXLA 3AXXA 3LPFA 4HOWA 1K9EA 4OJYA 1KXQA 4FF5A 1IZKA 1E43A 1N82A 1ZS2A 2JE8A 3CMJA 1JZ7A 1ESWA 4HZ6A 3WKZA 2XIIA 3MMDA 2DSVA 2ZOXA 1UR8A 3WF4A 2XHYA 1CNVA 1HL8A 3CO4A 4MPKA 1B3VA 2WPGA 4J3VA 4JHOA 5CGTA 2XGBA 2WHKA 3N11A 4CD4A 2BFGA 1LL4A 1KGWA 2Y4SA 2ZXDA 3U7VA 3DC0A 1MW2A 4CCEA 3W26A 2WK2A 1E6ZA 2PB1A 4K68A 3CZGA 4UNIA 2UY2A 1L8NA 3HMCA 1ZJAA 2BVYA 4D6EA 1E3XA 3TTSA 3I3BA 1R87A 5KEZA 3FN9A 4QLKA 2G3NA 1CECA 4D6HA 5D9MA 3WQVA 3E1F1 2FGZA 3ZSSA 1E0VA 2BY2A 2ZUSA 5CQ1A 5A6BA 1WO2A 2YBTA 2HISA 2MANA 3PBGA 4HU8A 3DHUA 4B16A 1OSEA 1UH2A 4JIEA 2HVMA 4FLRA 1E6SM 1C8QA 1R86A 1W2PA 1W9UA 4AMCA 1E4LA 1VEOA 2J7BA 5ECUA 2WCAA 4QCEA 2CHOA 2G8ZA 5EFDA 1CTNA 1V02E 3CIVA 4BF7A 4U2YA 5HPCA 5EBAA 3CHEA 3SCPA 3VU2A 4E4PA 4GI6A 2TAAA 1SMDA 2NW0A 2W62A 3MSGA 3VIKA 3WD4A 2VZVA 5CPTA 4AYSA 5ABGA 1CXEA 4PMNA 4BQ4A 2GK1B 1MQRA 3OIHA 3SCSA 3WUGA 4BQ2A 2WKLA 1KCKA 1Q6CA 3VOCA 1XCXA 3VMPA 3SUVA 1E1EA 1FH9A 4S3JA 5DO8A 2ZX7A 3MV01 3GNOA 4CUCA 4MNKA 3W25A 1OCQA 1UR4A 5D9PA 4AD0A 1HVXA 1VF8A 3CZ8A 3N04A 4FLQA 1JG9A 3WQ5A 3M6DA 1OBAA 4A3YA 4IPLA 4NRRA 2ZXAA 1W1PA 2EJ1A 3BGAA 4MNLA 4A3HA 1QBBA 1E5NA 1WZAA 5A8MA 1W2VA 5A6SA 3CBWA 1WDPA 4GKLA 2BXYA 3N15A 4JFWA 3PZ9A 3MSDA 3UR7A 3N17A 1E1FA 4UQEA 1BGAA 3PHAA 5HNNA 2GUYA 5I5RA 1JZ6A 1MW3A 1B31A 3OG2A 1UUQA 1FFQA 1UA3A 2XG9A 1JNDA 2C0HA 3VD5A 1IT0A 1H1NA 2IUZA 4D6IA 4J27A 3DYMA 2VQUA 1EDQA 3OGRA 3WMSA 1K9TA 5A69A 1WKYA 5FCZA 3SCVA 3VM7A 2YLAA 1E56A 4QP0A 3MKKA 2XVKA 5A2AA 1ISXA 1V0LA 5BRPA 1UD5A 1V3MA 1FFRA 1VRXA 1HJWA 2VMFA 3MUAA 3M46A 1PAMA 1US2A 1LJYA 4B3LA 1BTCA 2XPKA 1WB0A 4MTVA 3WNMA 1SFSA 2CBIA 2WVUA 2OSYA 1HJVA 4KGJA 3VGEA 1MXDA 2J74A 3AICA 5A95A 3NYDA 2W4XA 3N18A 3AS1A 1B3WA 1NH6A 1W3LA 3DYPA 1CLVA 1WZMA 3LPOA 3TTQA 2WANA 5GNXA 3WD3A 4Z2JA 1R85A 1LL6A 5KZ6A 1H5VA 4ML4A 2WHLA 3T2PA 3FY1A 3ALFA 2CBVA 1O7AA 2CERA 3BSGA 3II1A 4HOZA 3GXIA 2YL6A 2Y24A 3PZMA 3GH4A 3UCQA 5E0CA 3ZT6A 3CHCA 1BGGA 1UKTA 5C70A 1E40A 1NQ6A 2EPNA 3CGTA 1RPKA 5IFTA 1E0XA 2Z1KA 1D3CA 2D3NA 1UKPA 3GNRA 1BFNA 1UQYA 4AZ6A 4MB5A 2G4FA 4CU7A 2J75A 4CCCA 3VNZA 2GJPA 1LG1A 4FK9A 4GI9A 4ZEPA 4MAVA 1H11A 1BAGA 4UTFA 5A3HA 3ZQ9A 4XX6A 1G0CA 3KWXA 2WMIB 5CSUA 2NT0A 1KWKA 3CMGA 2WVVA 1E5JA 1VB9A 2E0PA 2QHAA 1AQMA 1BQCA 1QHPA 4ACYA 4KH2A 4D6CA 2XTKA 2VVSA 3VIGA 3GXMA 5D9NA 1B1YA 4AEFA 3WFLA 4OUEA 3LPPA 4PTWA 2WHMA 1UD4A 1WDQA 3NDYA 3VO0A 4AXNA 4WKFA 2E40A 2ZUNA 2VNCA 3WD2A 4GO9A 3GDBA 5CZKA 2WVTA 5EB8A 4Z2GA 1V6YA 3L4ZA 3ZT5A 4ZE4A 5ABEA 2J8GA 3B9EA 2UY3A 2WXDM 1WE5A 2Y5EA 4GINA 4AD1A 8A3HA 4WLCA 3WBEA 1NOWA 4XZWA 3L4TA 3AIVA 4CN6A 1F4HA 2JNKA 2OWXA 4LXFA 1J0IA 1RP8A 5JIPA 5A8OA 3VIHA 1SMAA 4HMDA 2E4TA 3ALGA 3SUSA 1WDRA 3UR8A 3VVGA 4EAMA 3L4XA 2VTFA 5HXMA 2YA0A 3ZJ8A 1HL9A 3W0KA 2WLYA 2F8QA 3OGSA 2VZOA 3NCOA 3BSHA 2DT2A 5E6YA 1JF6A 3IANA 1TA3A 1UR9A 1NWSA 3T0DA 4M56A 4W7UA 2X8RA 2F61A 1KFWA 5E70A 1QI2A 2GSJA 3ARSA 4Y7EA 1V3JA 2V3DA 2VX5A 4URIA 4KWUA 3WD0A 4YHGA 3NIYA 3L2MA 2W91A 2VL4A 1AQ0A 1XH1A 5CGMA 5A2CA 2VT0A 4UFIA 1J0ZA 1TUXA 2WWCA 1FH8A 3WF3A 5A8PA 4XB3A 1UR0A 4FMVA 2JALA 1JZ8A 3ZO9A 4D1IA 4UOJA 1JZ3A 4UQBA 5DEZA 1ISYA 3UG3A 5AYBA 2DSZA 1GJWA 4H8UA 2UY5A 4KRUA 1V03A 2A3EA 5LA0A 3W38A 1H41A 1BYCA 2DT0A 4B15A 3WF2A 1LG2A 2Y8KA 5C8BB 1KCLA 3QHNA 4MB3A 5AC5A 1BYDA 4MNMA 2VURA 4PMZA 1BG4A 4QFUA 4BQ3A 2A3AA 3J7HA 4DWSC 3RO8A 2VRJA 1GONA 2J62A 4H41A 2EO7A 4N42A 1LL7A 1QI4A 4H04A 4U5IA 2YDRA 2X2YA 1UKOA 4F8XA 4HOXA 4TX6A 1GORA 1PIFA 1OWQA 3NJ3A 3IJ9A 1TFVA 2EPKX 2DGAA 3WH6A 4Z2IA 5GQBA 3T09A 1EQPA 3NDZA 5HDRA 3AOFA 1JDAA 1JYXA 3IAPA 4C7FA 1HJQA 1XD0A 1EA9C 1ZBKA 4JCLA 1G9HA 2YA1A 3POHA 1X6NA 3N9KA 1LLOA 2O9TA 2J7FA 1PX8A 1YHTA 4XZBA 4LGXA 5CPQA 2JF7A 4PN2A 2WBGA 1LF1A 2RGMA 1QNRA 1WZKA 3WDPP 1XD1A 1XH2A 2XVNA 3UG5A 4D6FA 1UD3A 4AC1X 1UWIA 1XH0A 1EGZA 4YN5A 4W84A 2WB5A 3AZRA 4E8DA 1PIGA 3CUIA 1J9YA 1DEDA 4PTVA 1B9ZA 5F7UA 1EQCA 1JI1A 1B3XA 1XRVA 1E73M 3BAXA 4HA4A 2VQTA 1OGSA 2IXVA 1BLIA 1I1WA 1WZLA 4DWSD 2WZHA 4CGTA 1V6WA 3GM8A 4AD3A 1R7OA 1MW1A 3VGGA 3AIUA 4W85A 1D2KA 4QCFA 1J12A 5BWFA 2GJRA 3RPMA 4HZ7A 2CCRA 3MV11 5A8NA 4U31A 4PTMA 2YDQA 4TUFA 4DUWA 2ZWZA 2YL9A 3VD4A 3NSMA 2YL8A 1UD6A 2GFTA 1ITCA 4QLJA 3AHYA 3SCNA 2VCAA 1CGUA 3VPLA 5DMYA 4PCSA 1E6RA 3W81A 3GH7A 4PMRA 5ABFA 1W9BM 1MXGA 4OOUA 3EMCA 4U5KA 3VX0A 3AYSA 1H49A 2EPMX 3MANA 5IXEA 3K8KA 2PC8A 3VILA 4M24A 1GCYA 4ATLA 4TVCA 5LYRA 6CGTA 3QGVA 3FW6A 2VCBA 2WC7A 2D1ZA 1W9XA 3AISA 1HKJA 2C7FA 4TOQA 1GQKA 1VFMA 2GJXA 5D4YA 2EPOA 4AZ7A 1RH9A 1EO5A 3WL1A 5JIWA 3AIEA 4P7QA 1V0MA 1W1TA 2XM1A 4PSRA 5EFFA 4WKHA 2CKSA 4E2OA 1L0PA 1OIMA 2JF6A 2WHJA 4MDPA 4AISA 2E9MA 5BXTA 4PMVA 3VDHA 1V02A 2V38A 4CU8A 1KQZA 5D8ZA 2YOCA 1FP9A 1TG7A 2GVYA 2AAAA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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