4AZCA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
419
structure length
416
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 166
structure length 416
sequence length 419
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azcA01
1E6NA 3WD2A 2CERA 3W28A 2V3FA 2YDSA 2BNJA 3WF1A 4CCDA 1EHNA 1SFSA 5DFAA 4AISA 4C7GA 4H41A 4J3XA 1C90A 4AXNA 2EPNA 4UFMA 1UH4A 1E0VA 2W91A 2X2YA 5DT7A 2WVVA 4CCCA 4PUDA 2VCCA 2W92A 3OLEA 1QI0A 4XZWA 5LA2A 5CLWA 1V3JA 4J27A 2DT0A 2D0FA 4GO9A 1FHLA 3WF3A 5D9OA 4D6DA 4PTMA 1HVQA 1H49A 4A3YA 4BZYA 2WVTA 3RMEA 3BAXA 3CZEA 3BAIA 3VDCA 1JYNA 3UETA 3WL0A 3W4RA 1NOUA 4QAWA 3CBWA 3NJ3A 3GH7A 3VX1A 1B3YA 1X6NA 4FZOA 5CQ1A 1V3KA 4AD4A 3WY1A 2DPEA 1KXHA 1UR4A 4AEFA 4CUCA 4OJYA 2Y5EA 4JCMA 2WHMA 1E0XA 6CGTA 4HTYA 1CBGA 4B15A 3MANA 1UR9A 4U3CA 2WHJA 4QLLA 4PRWA 2GJPA 3SEPA 1LF1A 1HKJA 1V6WA 2DEPA 2JE8A 3SUUA 3N15A 1B0IA 3CMJA 1UQYA 1O7AA 2GDUA 4HP5A 2VX7A 1X6LA 1VEMA 1JDCA 1KB3A 1CGYA 3AS1A 3VGHA 5ABFA 4P8WA 2VL4A 1TZ7A 3U5YA 4UNIA 2VZTA 4CD4A 1QI4A 4M1RA 1V6UA 2DSZA 2BVYA 2WVVB 3VKKA 4HA1A 5GNXA 2WSPA 3AHVA 2O9PA 4Z2HA 1H0IA 4U2YA 3HU7A 3W0KA 1HP5A 4MAVA 4AY1A 1E6RA 2G8ZA 3PZOA 2E8ZA 3WQ6A 1QPKA 4YHEA 1WZMA 4BA0A 2CEQA 2ZUSA 4HU0A 1CYGA 5M5DA 3AHTA 3SUVA 3VIHA 1BYCA 4LGXA 5DF0A 4QCFA 1BYBA 3U7BA 4JFTA 4RL3A 5A6KA 1W32A 1Q4NX 3CTTA 5FD0A 3WH5A 3ZO9A 4AD0A 1E6QM 2WCAA 2WMIA 1CTNA 5A2CA 4QFUA 3VGBA 2V3EA 1WZKA 1S46A 2BHUA 3WUEA 3WMSA 3VUPA 1B90A 4MNJA 1BTCA 3CHDA 4H04A 1GQJA 3SCTA 5LYRA 3TA9A 1HVXA 5BROA 4N0RA 2YKKA 1HJWA 4PMYA 1M53A 4NF7A 2DH2A 2WMFA 3GNRA 1UWRA 4WLCA 1H0GA 5A1AA 3B9AA 4UQBA 3KEHA 1SMDA 3AIVA 3WUBA 5M3WA 2EPMX 2ZXBA 2QMJA 5ABFB 3GNOA 4JIEA 4Z2KA 4CD5A 4GPNA 4ZE5A 3WUGA 1HIZA 1QBAA 2YBUA 1JYVA 4UQCA 9CGTA 5C71A 1Q6CA 1C3FA 3FNDA 1KXVA 4HOWA 2G3JA 1JAEA 1ZU8A 4WKFA 4W8LA 3EYPA 3EDJA 1MWOA 1KGXA 2G3IA 4P7LA 4UOZA 3L4WA 2ZWYA 4MB4A 3BCDA 1W91A 1YHTA 4XX6A 3NYDA 5DEZA 4QDMA 1J10A 5HBFA 2IXUA 3T08A 5A69A 3WSUA 2WMIB 1CGWA 3VX0A 1HKMA 2GJRA 3SCQA 1LG2A 2V5DA 3QOMA 3O9NA 3KL0A 4S3KA 1E1EA 1GOOA 5A6AA 8A3HA 3AQUA 1XH1A 4D1JA 5BRQA 5M17A 1MFVA 2VURA 4W8AA 3W24A 3AFBA 3K46A 2BXYA 4IM4A 1OD8A 3GH5A 3T0DA 5GNZA 1E73M 3IAPA 4GZIA 2A3EA 3KWXA 4KH2A 4W85A 1HJXA 1TR1A 4E8CA 3L2MA 3ZOAA 1C92A 4GKLA 4R27A 1WDQA 3N12A 3WBAA 3QR3A 1V3MA 4NSBA 5FL1A 1HL8A 2JEQA 2V38A 4HU8A 3W25A 1UD3A 4P7OA 3NSMA 1ISYA 4J3SA 1XH0A 1GCYA 1UA3A 1NWSA 4D6CA 4TUFA 1C91A 1B1YA 2NSXA 1SMAA 1UWTA 4BCEA 1V0KA 2WBGA 2CHNA 2Y24A 3T09A 4BQ4A 5D9NA 1QI2A 2E40A 1W9DM 4NI3A 1KCLA 1W3LA 2JF7A 3RJYA 1Q6GA 2RGLA 3B9EA 1UD2A 5CLTA 1KR0A 2AAAA 3WKZA 2XM2A 2GFTA 5BXPA 2QHAA 3WNPA 2NT0A 1EDTA 2CBVA 5EBAA 2IXVA 4CN4A 4HA4A 3OLDA 3VD9A 1RH9A 3PZQA 1J11A 1CGXA 1B3XA 1GOIA 1OGGA 3FN9A 3L2LA 2IUZA 1E71M 3ARXA 3SCRA 3WF2A 3BSGA 5BCAA 3WFZA 3AXXA 1PX3A 1JFHA 1VF8A 4H8UA 4D6HA 3WELA 1JI2A 3WDIA 3WF4A 1EDQA 3OA5A 1OT2A 2OSWA 1DWHM 7A3HA 4EKJA 3ARRA 4CKQA 2WZEA 4UR9A 4NZCA 5CPTA 2DSKA 3TTSA 4LYQA 1XV8A 1CWYA 1BVZA 1E55A 3AIUA 2G4FA 3PTMA 4S3JA 2J4GA 1E1FA 4D71A 3WENA 1IZKA 3UG4A 2WB5A 2EQDA 1H41A 5I79A 2OLHA 1EQPA 2XUCA 3ZSTA 2NT1A 3ARQA 2VQTA 1E15A 1JZ3A 1KWGA 1J18A 2CBIA 1V08A 4E8DA 3IANA 4ZENA 4AZ7A 1J9YA 1CLVA 1E6PA 3D5HA 1H09A 3AOFA 4U5IA 1GJUA 1V03A 3ECQA 4PMUA 1VBRA 3IJ7A 1PIFA 1C7TA 2QLYA 2CYGA 3IK2A 5I78A 1E56A 1U30A 4AZ5A 1XGZA 1Y7VA 4U3AA 2VRQA 3AXIA 1HX0A 2PC8A 3A4AA 3AMDA 3TTOA 2V5CA 2J7BA 5ECUA 4D6JA 3RDKA 3VGGA 1O6IA 1C8QA 1BAGA 3TP4A 1ODZA 1VEOA 2BY1A 2J47A 1ZS2A 3VD5A 1NOFA 4ZE4A 2XHYA 1B3ZA 1NWRA 3LPGA 3NDZA 4FLQA 4P7QA 3AZSA 4HPGA 4PMRA 4W7WA 4Y7EA 3ZIZA 3AS3A 2YIHA 4P8XA 4H8HA 2DT2A 3VIJA 1OGSA 2WLZA 2XVGA 1QHZA 1KBKA 1I75A 2YJQA 1ISXA 3IJ9A 2WHKA 4W89A 3WH9A 2XG9A 3ARZA 1C8YA 1EO5A 2QMKA 2XIBA 2VCBA 1US3A 1CZ1A 1WP6A 2ZWZA 1LG1A 3PTKA 5AC4A 2D3LA 4FF5A 1CGTA 4UCFA 1GONA 1ZBVA 3F5LA 1WE5A 1HJSA 4KRUA 5CSUA 2FGZA 2XVLA 3GH4A 1EO7A 2DT3A 2Y2WA 5GQBA 5BXTA 1SYTA 5JBDA 4DWSB 3AS2A 4TVUA 4JKKA 3MMUA 3AS0A 1IZJA 2WC7A 2WXDM 1QNRA 3AROA 3W29A 1ZB5A 3AJ7A 1LLOA 3AXHA 4UZUA 3MV11 1TA3A 3ZJ6A 1D7FA 2VRJA 1VJZA 3BLKA 2DIEA 4MTVA 3WEZA 1N82A 4URIA 5A6JA 5BYWA 1GVYA 5BXRA 3WD4A 1PZ2A 4OIFA 3K4AA 4H2CA 3EDKA 2X0HA 1VB9A 4FLRA 2G41A 1EH9A 2UY4A 2VC9A 3M46A 1GJWA 4GQQA 3ARWA 3VTRA 3VGDA 3ZMRA 4V27A 2UY3A 1NQ6A 1R7AA 1ZJAA 3K4DA 5IDIA 1DWAM 5AY7A 3VIPA 2DSUA 2JIWA 3THCA 1BF2A 2DT1A 2DSWA 2WWDA 3WQ5A 3VU2A 1B3VA 4AC1X 3A3HA 1TFVA 4B3KA 1CXIA 3VIMA 5CG0A 1XRVA 4UTFA 1WPCA 4RE2A 2VO5A 1J0HA 3WD1A 4K68A 4CN1A 4NRRA 3S2CA 1V3IA 1OINA 2WMGA 4GXPA 4D6EA 1LWJA 1JF5A 1JFXA 3RM9A 4AD5A 1K9DA 2WVUA 5D4YA 3CH9A 1U33A 3WNMA 1E6SM 7CGTA 2BY3A 4DWSC 2DIJA 2BVDA 2YA2A 3CUFA 1BHGA 1HL9A 3N17A 1GOQA 3VOCA 2CIPA 1PAMA 2GSJA 2EPLX 5I6SA 4AYSA 3A4WA 2ZUVA 4DUXA 1LL4A 2DH3A 2PWDA 1H1NA 2A3AA 4GI6A 2ZX8A 1RP8A 5HXMA 3W81A 4ACZA 1OIMA 5A8PA 2E8YA 1W9BM 1G01A 2J77A 2EPOA 3ZR5A 5DMYA 1GHSA 3VO0A 4FLOA 2G3NA 1KQYA 4IPLA 2D0HA 5FOOA 3ZR6A 5EMYA 5E9AA 4TXEA 3WBEA 4AZHA 1JDDA 1PEZA 3WNNA 2BVTA 2E4TA 4UFHA 3PHAA 3DYMA 5DT5A 2D22A 1UYQA 1OWQA 3L4ZA 2WZIA 2XGBA 4GZJA 5HNNA 1QNOA 1UG6A 1UWUA 1UKSA 4Q22A 4Z2GA 2ZXQA 1MVYA 3ARTA 1WDRA 4LX4A 3FAWA 3WD3A 5E0FA 3N11A 3SCPA 1HJVA 1XD1A 1MW0A 1SR0A 1KXTA 1AVAA 1EQCA 2ESCA 5LA0A 1FA2A 2XFYA 2XSBA 3WIJA 2XVKA 4MAZA 3TOPA 2W5FA 2CETA 3POCA 1V02A 4V2XA 4A3HA 2BY0A 3WD0A 1FH7A 5D9MA 1X1NA 1W1PA 1J0IA 1U2YA 2D1ZA 1XC6A 2F8QA 4GQRA 1QOXA 1WDSA 4M82A 1ISWA 2VRKA 1UZ4A 1YQ2A 4H8VA 4ATDA 4OOUA 1QI3A 3CZLA 1FFRA 1LL7A 1UKPA 2W66A 3AMCA 3AHZA 2ZX6A 4UOJA 1GW1A 1JL8A 1W9PA 3S6TA 2UWFA 4JZ5A 2WNWA 3W38A 2F61A 4CVUA 3CHFA 4AZCA 4W5UA 1GPFA 1WNOA 4LYRA 1AQ0A 3VMPA 3OGSA 1VEPA 4M24A 3ALFA 1W2PA 1BVNP 4PMZA 4QLJA 3SUWA 2WK2A 3ZJ8A 2VZVA 4CD8A 4MJ4A 1JAKA 1GNXA 1CXKA 1K9TA 3NCOA 4HZ8A 4UQDA 1B2YA 1MXDA 5A6LA 1WCGA 1JGIA 2A3BA 2Y8VA 3CLWA 3KE0A 1NWTA 3CZ8A 1B31A 1XYFA 1H2JA 3CZGA 2JFEX 3CUHA 4ZEPA 3WQ4A 1G5AA 5IFTA 2MANA 1Z32X 1HN1A 1W9VA 1ISZA 1GQIA 4X0VA 4TX6A 3PZMA 2CNCA 1QI5A 1JNDA 1QNSA 2WM0A 1V0NA 4MNLA 4BQ5A 1JZ2A 3WDHA 1G94A 3VIOA 1EA9C 1L8NA 2XVPA 1K6AA 1C8XA 3MO4A 1G9HA 3CPUA 3VPLA 4CCEA 3KL3A 2OWWA 3WDJA 1E4IA 4M80A 3OLGA 1UR1A 4IUGA 2J7EA 3LMYA 1MYRA 1UD5A 1WZAA 2DQXA 3BCFA 2EPKX 3CUJA 4JCLA 2WKLA 3W53A 3OZPA 4AZCB 2E9LA 2VZUA 3MKKA 4BS0A 4PMVA 3WH7A 5HOSA 2QV4A 3VIKA 1UD8A 4LYPA 2HISA 1ISVA 1ECEA 3UESA 1BG9A 5HPOA 3NIYA 5BXSA 3AYSA 2V3DA 3VM5A 2WCSA 1V3LA 3UEQA 3U5UA 1XYZA 3EDFA 2CBJA 2A3HA 2C8NA 3WH8A 4JAWA 4PTXA 1AQHA 4B9ZA 2BHYA 4CU8A 4PMOA 2CKSA 3VIGA 4ZFMA 2XJ7A 1TCMA 5DO8A 3PZIA 2J7DA 1QW9A 1KGWA 1OM0A 1CXHA 4QLKA 3WDPP 5CGTA 2EEXA 4PMXA 3JUGA 4PTWA 1E5NA 3A47A 3T2PA 3G6MA 4X9YA 1JI1A 4WJXA 1LWHA 4F79A 3FAXA 3PZNA 3GZAA 4L4PA 2AMGA 1GOWA 1UR8A 5A8OA 3VIIA 4AEEA 1OSEA 3RPMA 4JL1A 2WKGA 2YL5A 3L4XA 1XH2A 1E70M 4UQEA 3CO4A 3LPPA 4WIWA 3HMCA 5A8NA 3UG3A 1XHGA 4WF7A 3SIMA 3BSHA 4M81A 2D3NA 1DWJM 3BAJA 3ZJ7A 3OIHA 1PZ3A 1Q6FA 3GXIA 2WLYA 2BHZA 2XIIA 3BMVA 2XSAA 2WMKA 4PCSA 1VFUA 4J3TA 1M7XA 3CHCA 3VD7A 4GIAA 3GXDA 1F4AA 4L4OA 2YL6A 1E4LA 5IFPA 1CGUA 1GVIA 2ZE0A 2VT0A 2W63A 2ZUNA 4MNMA 3K8LA 1TVNA 1ZBWA 4D6GA 4OKDA 4F9DA 3MMDA 1JZ5A 1QVBA 2PWHA 3AYRA 2D2OA 2XVNA 1JD7A 4IISA 2YL8A 1ITCA 4GI9A 4W7UA 8CGTA 5I2UA 2OYKA 1JF6A 1DHKA 3VMNA 2ZOXA 1UR0A 3PZUA 4J3VA 3L4VA 4ZXLA 2HVMA 1V02E 4YHGA 5I3DA 1BFNA 1E4NA 3BAKA 2ZX5A 3BAWA 3A4XA 4EANA 1GORA 3PZTA 3OZOA 4F66A 4XUYA 2VVSA 3LPFA 4OBSA 3U57A 3L4UA 4EE9A 5E09A 5JUVA 1MW2A 2VOTA 3NDYA 1CDGA 2VR4A 3DHUA 1K9EA 1KR1A 5A3HA 4J3UA 1V0LA 3ARVA 1HXJA 1UQZA 1IT0A 1E40A 4GINA 3SURA 5CPQA 4AWEA 4DM2A 6A3HA 1CXEA 1EOKA 2VQUA 2JALA 4QP0A 2Z1SA 2YA0A 1BPLB 4GZEA 4F8XA 1A3HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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