4J8FA

Crystal structure of a fusion protein containing the nbd of hsp70 and the middle domain of hip
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
551
structure length
551
Chain Sequence
FMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGLESDLEIDNEGVIEADTDAPQEMGDENAEITEAMMDEANEKKGAAIDALNDGELQKAIDLFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFVKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAARDLALACKLDYDEDASAMLREVQPRAQKIAEHRRKYERKREE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of Hip, an attenuator of the Hsp70 chaperone cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 183
structure length 551
sequence length 551
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.25.40.10 Mainly Alpha Alpha Horseshoe Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat 4j8fA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4j8fA03
2H3GX 2ONDA 3MN7A 1IJJA 1NGIA 1T6DA 1U2VB 2ZF5O 5AZIB 4AM9A 5KPRA 2J9QA 4BRCA 4B1UB 2P9LB 4K41A 2P9LA 5KPTA 1JCGA 1SAZA 2MHKA 4BC2A 2UWJG 3PDNA 4I2WA 1ELRA 3CK7A 3FE1A 1GLCG 5M72A 5BREA 5ADXA 3QBWA 4AY5A 2P9IB 3BF3A 3S7DA 3CJ1A 3VEWA 4AIFA 4PL7A 1BU6O 1ATNA 2XCCA 1FCHA 2P9SA 4CBXA 4H7XA 2YHYA 5FPNA 2YHXA 4CGVA 3HTVA 3HM8A 5FPDA 3W0LA 2GEMA 3ZHEA 3CHWA 3H45C 3KS2A 1ATSA 2DBAA 4BQZA 1NGBA 3ENOA 3Q4AB 5JLHA 4BQLA 1HPMA 4YDUA 4BVPA 3DJCA 4JD2A 3GZ2A 3PE3A 4YNDA 1NGHA 4BRNA 3OXLA 4N2SA 4GA0A 3ZETB 5AYWD 2PZIA 1QQEA 5AQHA 3KAEA 4N3CA 1HX1A 3QB0A 5ARGA 4FPAA 4G2VA 2QWOA 4IJNA 1RGIA 3S41A 4J8FA 3CV0A 1K8KA 2CGLA 2YCHA 3U4TA 3MCPA 2VYPA 1NBWA 4FO0A 1J6ZA 2BUGA 3QWWA 5EX5A 1KT1A 4YDUC 5BPMA 1SQKA 3QWVA 3RSEA 2CGKA 4DHYA 1HJOA 4IO8A 1Q18A 2V7ZA 2XPIA 5A6CA 5E26A 4BR0A 2XGMA 4G1TA 3RKVA 3FWVA 3QOUA 4CJ7A 5AFUA 4H7YA 4EHUA 4N39A 4CZFA 3KD7A 1NA3A 4JHRA 2GWJA 2QWQA 2YHCA 3D2EB 3D2EA 4ISEA 4WQ4A 2NLXA 4BTBA 5AR0A 4CBWA 1A17A 4AM7A 4CD1A 1DKGD 5JJ7A 4I9CA 4UI9C 2Q7FA 3EO3A 3O08A 5G04J 4FWLA 4PL8A 4XH1A 3LDPA 4ME2A 5FZRA 1BA0A 2HOEA 3CJAA 1NLVA 5EX0A 1R59O 3VPZA 4CZGA 5HI7A 4APOA 5BPNA 4GY2B 5AQZA 4PKGA 4CI6A 5AQJA 1GLDG 3ZX3A 3UKRB 1G99A 3CI5A 1S22A 2D0OA 3QFUA 4WQ4C 4PKHA 1X3MA 3PE4A 4K42A 4XH4A 2FXUA 2QWNA 4DCHA 3MV2B 2HF3A 1Y8MA 4I6MA 2AA4A 2YI1A 4U07A 3EKSA 4FWSA 4DB3A 1P8ZA 2IVOA 1HH8A 5AZJB 1V4SA 2PAVA 1BA1A 1E4GT 4CDRA 3DWLA 4I2ZA 4A62A 3AARA 4BC4A 3NF1A 1C0FA 4HORA 3EL2A 3A0IX 4UI9J 5KJMA 1SZ2A 2FF6A 3H3NO 5AQKA 5AQUA 3JXUA 3M6GA 3HSCA 3OHRA 4FL9A 1HKCA 1X3NA 5EKQD 5AQLA 3DXMA 1KT0A 4BG8A 4BR7A 1WUAA 2NRHA 4HOSA 5AQVA 2Q0UA 3Q47B 4BRHA 2VGXA 4YVQC 1GLFO 4QS9A 2P58C 3ZPJA 4H0OA 3ZX2A 5BRHA 4QS8A 3A5LC 4H0PA 3CJBA 2F9WA 3ZFWA 2GWKA 1LOTB 3F9MA 3Q5MA 1TYQA 3TG5A 1D4XA 3SLCA 4CZKA 5AQMA 3DXKB 2D1KA 3RU0A 4RTFD 1TUYA 2Y4UA 1PC2A 4LC9B 4NB4A 1QZ5A 3SMSA 3I8BA 4NO7A 4B1WB 2VQ2A 3OXGA 3TG4A 1MWKA 4GYOA 1GLLO 4BRLA 4H5TA 3R6MA 2W41A 4GZ6A 3QMLA 5AQRA 4BRIA 4BRQA 4U0SA 4A61A 3QFPA 1B89A 3LCAA 1QQNA 5LCWC 2E2PA 3MA5A 3ZX0A 3QBXA 2VGYA 4BR4A 3LM2A 4Y6CA 3FFKB 3HI0A 5F2RA 3WXJA 1HZ4A 3HYMB 3VGMA 4B1VA 1IHGA 2XEVA 5AQXA 3MDQA 1XC3A 3KVGA 5KPZA 1ESVA 3VEVA 3K9IA 4G25A 3WEEA 2VSNA 4BRGA 4H5RA 4JHDA 4BGBA 1NMDA 1NGFA 3E4BA 1E4FT 4JN4A 1ELWA 3CJ7A 1Z05A 3ULQA 2P9SB 3WUHA 3O6WA 1WOQA 3A5OC 2E1ZA 3CQYA 5AQFA 2UY1A 2A3ZA 4IWVA 3CK9A 3MMVA 4IZ9A 5EOYA 4CD3A 4EAHD 3ZHEB 2HR2A 2PBDA 4XEIA 5AQGA 2KATA 3IEGA 3AAPA 3CJCA 3SJHA 2GTDA 4JA7A 4JD2B 2V52B 2EWSA 2VWBA 3SMPA 5EXWA 2NC9A 1ZU2A 1LCUA 4KBOA 5LCWJ 1QZ6A 2HMPA 4QS7A 3CJ9A 2E1YA 3MN5A 3WXLA 3WXIA 3VESA 3CK8A 1MDUB 3LKUA 2WQHA 1K8KB 5AQNA 3CIPA 1NGGA 4RCHA 4IJAA 4BVOA 3FLCO 5AQPA 2W40A 3GG4A 3KHYA 3UPVA 3O80A 4FSVA 4H0XB 2CGJA 5CHEE 2KCVA 2VSYA 3CERA 2F9TA 3R8EA 3CKCA 3VETA 3CEQA 4GA1A 1RDWX 3RSEB 2ASOA 3AAQA 1V4TA 1T6CA 2Q31A 2YHWA 5ADXH 2I7PA 3WXKA 3L4IA 3LDLA 4AM6A 4FWQA 4GCNA 3ENHA 4WYBA 4HOTA 3TGOA 4C23A 3UUXA 4F3VA 3CVLA 3QDNA 4B94A 1ZC6A 4BR5A 2LNIA 3VOVA 2HO1A 5FTPA 3O1BA 1HKGA 2Q2RA 4G26A 3HZ6A 4MO4A 4WQ5A 3AS5A 3EZWA 2LSVA 1Z6RA 3RJVA 5FPMA 4BGAA 4UQZA 4H5WA 5KQ8A 5KJNA 2C2LA 2FI7A 5JJ6A 3H1QA 5G05C 3O8MA 3GBTA 4MO5A 2UYTA 3BEXA 1C0GA 5AQOA 1GLAG 2E8AA 2KCLA 2I7NA 3GW4A 2E2EA 1WM5A 4GA2A 2Q1NA 4FOIA 2CH6A 1KAXA 3GOIA 3A5NC 3CVPA 3LDNA 3ASDA 4I1AA 2NZTA 4KBQA 3O1WA 4I6MB 1TJCA 4BWRA 3JS6A 2E2QA 4B1XB 4N3BA 4CZJA 1P5QA 3RIBA 4WQ5C 3VEXA 4IN3B 3C7NA 4GYWA 2PQNA 3AY9A 2FSNA 1NGCA 2FBNA 2YJFA 3QWPA 4J0UA 1NGDA 2P9KA 3EKUA 4JAXA 4M63C 3UKUA 2GUPA 4FWKA 3W3DA 2C0LA 2P9NA 1KAYA 2OOEA 2QWMA 1YUWA 4GYYA 1YAGA 5BN8A 1DEJA 4O5FA 5AFUH 4I9EA 2VYIA 4CGWA 5BRDA 3UQ3A 3HBTA 4A1SA 3QICA 3A5MC 3VEOA 3BUZB 3DXMB 1NA0A 1NGEA 4B1ZA 3WQUA 2VGXB 1ZBPA 4RG6A 1RFQA 3BF1A 4DQ8A 3WQTA 4O8KA 2HYZA 4B1YB 4EIAA 2GW1A 2XGOA 4JL0A 3A8YA 1ATRA 1MA9B 2P9UB 3AS4A 1BG3A 2AP1A 2P9UA 3GDQA 4FWRA 4BRDA 4BRPA 2FSJA 3WT0A 4NRHB 1T44A 3TU5A 4ISFA 4F9OA 1TYQB 4PKIA 3FZLA 3U4LA 2YQ8A 5EVZA 5D0QD 2FO7A 1E96B 3MN6A 4MLEA 5E84A 4BRKA 5BR9A 3GYZA 4FWPA 5ARFA 5JLFA 5AQTA 2ASPA 1BOTO 3ZEUB 4HTLA 3U8XA 1NGAA 3ZEUA 1NGJA 3MK6A 4H5NA 3CETA 5BT1A 2C0MA 3FFLA 5ELZA 1XQSC 2V7YA 4BRAA 2KCKA 2E20A 4FPBA 3VERA 4BC5A 4RWTA 5FT9A 3M3ZA 4WUYA 3CQXA 5BRFA 4FWNA 4N5CA 3L0QA 4WNFA 2P9PA 3ULEA 5B8HA 3EN9A 3U9DA 3WEEB 3IUCA 4JHDB 2FSKA 4L3QA 1JCFA 2Y4TA 4HOUA 5C1DA 5CE3A 4ISGA 4O6FA 3U3WA 3UKRA 4A2BA 3BP8A 3VGKA 2UY1B 1U2VA 2XGSA 4UQXA 4G23A 5AZIA 2V5FA 5AQYA 4EHTA 4J8EA 4N3AA 2A6AA 3FP3A 3MKRA 2JLBA 3SZ7A 2PQRA 3SF4A 1X9JA 2A42A 2I6HA 3URZA 1HXIA 2ZWHA 2D0PA 3VTXA 5CCLA 4Y0WA 5BPLA 4BRMA 3U9ZA 2A5XA 3H1VX 2BUPA 3IDHA 5F0XA 5LY3A 1W3BA 5EX3A 2WPVA 3ASGA 4XIFA 2P9IA 2ZGYA 1XNFA 3LL3A 3TAXA 2GELA 4GZ5A 3GE1A 4RG9A 3ASHA 5BW8C 2LSUA 3G25A 4HOQA 5AQQA 2R5SA 3Q49B 1YVNA 2QXLA 3I33A 5KJKA 3BEEA 3VTYA 2D4WA 5FZSA 3FZHA 3LM9A 3QKYA 4M7XA 5F1XA 5CCMA 4IXCA 1BWFO 4BTAA 3IMXA 3O5BA 4GCOA 5DIZA 3H6EA 2KHOA 3L6QA 2L6JA 1EQYA 1QZ2A 3FGUA 4H5VA 4BROA 2ZGZA 1QQMA 3LDOA 4JA9A 5FZQA 3LY7A 1JCEA 1Y64A 2OANA 3ZETA 1DGKN 3MN9A 5HQ8A 2VCPA 3D2FB 3D2FA 4WNDA 4UQYA 4Y6WA 2IFUA 3B8AX 5KJLA 5G04C 1ZBSA 4GNIA 1CZAN 4FOEA 1GLBG 3N71A 1IYGA 3LDQA 4BRFA 3RO3A 1BDGA 2AVPA 5AQSA 1MWMA 4U0UA 3ATUA 1XUPO 3Q15A 3AS8A 4CBUA 4GZ3A 3VENA 1GLJO 3ZGQA 3S7FA 3JYSA 1GLEG 1KXPA 4BC3A 4KYOB 3TPQA 1NZNA 4BT8A 5EY4A 3MV3B 3O48A 4U0ZA 4UI9K 1BUPA 3R9AB 4BT9A 4LEUA 2J4RA 4CZLA 3IFRA 3VEYA 1NWKA 4CZMA 3EDTB 1HUXA 1U6ZA 4BR2A 5JJTA 4NQ0A 1HKBA 2BTFA 4FWMA 3UE5A 3LPZA 3C7NB 4MLHA 3VF4A 3KZBA 4I17A 1YXQA 4WNGA 4G24A 2P9KB 4U04A 3UKUB 4BG9A 2YJEA 4EFHA 4Z94A 2QW9A 2P9NB 2E2NA 3O4WA 4HWIA 4KXKB 2QWRA 1OUVA 1WAO1 2A40A 5JMVA 4BREA 4A2AA 2ITMA 1H1VA 2QWPA 3M1FA 5G05J 4ABNA 4AY6A 2FLOA 3DAWA 5LJWA 5D0OD 4JNEA 2E2OA 3LY9A 4H0TB 5JICA 1IG8A 3H3OB 3J8AA 5KQDA 4GPKA 5FPEA 2E88A 3OXFA 3ASFA 3ZN3A 2IVNA 5DBKA 2A41A 3UB5A 3VEZA 3VGLA 5AZJA 2ASMA 4FWOA 3H46O 4H0VB 3FR0A 4EQFA 2QFCA 3VF2A 1OKJA 4CZEA 3LY8A 3LYAA 3CVNA 5AQWA 3S7BA 4J8DA 3CKBA 3CVQA 3FZMA 3C0BA 4N2QA 2IVPA 2V51B 5AQIA 2FF4A 1QQOA 5BN9A 2IF4A 3ID8A 5BNWA 1TUUA 5FJYA 2IIRA 2KC7A 3VF6A 5I9EB 1KLXA 2Q97A 2QWLA 4H0YB 4XI0A 2QM1A 2PL2A 4W9RA 2Q0RA 1BO5O 2XCBA 3MEKA 3FZKA 1YA0A 1HLUA 4WNEA 3GL1A 4YVOA 2WUSA 4CZHA 3D7EO 1ZXOA 3ATVA 1QHAA 4XI9A 3QDKA 4K43A 4E1JA 2FF3B 3SK3A 2CH5A 3ULEB 2P9PB 3S7JA 5LJVA 1KAZA 4XH5A 3GZ1A 5TKYA 3RO2A 3DXKA 2Q36A 2FEZA 3P4IA 4H03B 3FZFA 4K25A 4CZIA 2HF4A 3R9PA 4BR9A 3WXXA 4B9QA 5A7DB 1NM1A 1S3XA 4M7YA 2DPNA 3ESKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H3GX 1IJJA 1NGIA 2ZF5O 3F73A 5KPRA 3VQ8A 3CQ8A 5C25A 3C6TA 2CHZA 1LWEA 3DEOA 4KHPK 3E9OA 4KHNA 1JCGA 1SAZA 4BC2A 4DPRA 3PDNA 1RTIA 1HYSA 4CEFA 4I2WA 2GRRB 4JEHA 3CK7A 3OYBA 1GLCG 3O4QA 5BREA 2CG2A 3QNOA 3PZ1A 4KI4A 3R1XA 3V9SA 3FTSA 3CJ1A 4FZZA 1BIZA 3SD5A 1ATNA 2PFUA 4BY6A 3KWGA 2YHYA 4NACA 2ZE2A 4CGVA 1ATSA 5HRSA 1UN9A 2CFZA 3FDHA 4CEBA 1JCSA 4OVUA 3ZSQA 1HPMA 4YDUA 3THVA 3DJCA 3TWXA 3GZ2A 1NGHA 4BRNA 4AXHA 4C8LA 2IS3A 4BE2A 3RMDA 4HI9A 5AYWD 3QERA 1HMVA 2E4LA 5D66A 5ARGA 1IQUA 2D0CA 4O44A 4OGEA 2XEHA 4EECA 1RW2A 2BKGA 3CV0A 1K8KA 3DLGA 3RVCA 3T1HK 3MCPA 1DC2A 3DEPA 2VYPA 3OBYA 4CGGA 4R5PA 1TYQG 4Q69A 3Q78A 3TSQA 2OPQA 3UIPC 4CCAA 4LNBA 1VQ6N 3SHFA 1XNQK 3PLAA 1O5MA 3SAFA 4IG3A 3ZSRA 3F5TA 2IQCA 3SFYA 5IWAK 5E26A 3RKVA 1WG0A 4OKKA 4RG8A 1TN8A 4H7YA 4CZFA 4TRQA 3FU6A 4JHRA 3RRUA 2YHCA 4LNUD 2NLXA 3T1YK 1SW6A 4CD1A 5JJ7A 1OWOA 3V2XA 2Q7FA 3EO3A 3O08A 2ZJPL 5G04J 2X74A 4FWLA 3I4GA 3MECA 3LDPA 4XH1A 4ME2A 4IDHA 5BUZA 4CK2A 4QQIA 1IKXA 4PUOA 2P9SG 2HMIA 4B9SA 4FJJA 4GY2B 3ZYKA 3THXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1TNY A;  3HVE A;  5CMW A;  1HLU A;  5C12 A;  4CZH A;  3KK2 A;  3HPO A;  1RDB A;  3E33 A;  3ATV A;  1JXE A;  4XI9 A;  1VSD A;  4BDY A;  1U48 A;  1BI7 B;  3SK3 A;  4E7H A;  2PM6 A;  4LF4 K;  5LJV A;  1KAZ A;  5GIP A;  4O5B A;  3AA3 A;  3HST B;  4YHH K;  3KLG A;  1NJX A;  1X9M A;  3IBE A;  3R9P A;  4MQ3 A;  5A7D B;  3R7R A;  3TXN A;  5ENP D;  1S3X A;  1QSS A;  3ESK A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2H3G X;  1IJJ A;  1NGI A;  2ZF5 O;  5KPR A;  2CHZ A;  3E9O A;  1JCG A;  1SAZ A;  4BC2 A;  4DPR A;  3PDN A;  4I2W A;  4JEH A;  3CK7 A;  1GLC G;  5BRE A;  2CG2 A;  3R1X A;  3FTS A;  3CJ1 A;  3SD5 A;  1ATN A;  2PFU A;  4BY6 A;  3KWG A;  2YHY A;  4NAC A;  4CGV A;  1ATS A;  1UN9 A;  2CFZ A;  3FDH A;  4OVU A;  1HPM A;  4YDU A;  3DJC A;  3GZ2 A;  1NGH A;  4BRN A;  4AXH A;  5AYW D;  5ARG A;  1IQU A;  4EEC A;  3CV0 A;  3RVC A;  1K8K A;  3MCP A;  2VYP A;  3OBY A;  4Q69 A;  3TSQ A;  4CCA A;  1VQ6 N;  3PLA A;  3SHF A;  3SAF A;  3F5T A;  2IQC A;  5E26 A;  3RKV A;  4H7Y A;  4CZF A;  4TRQ A;  3FU6 A;  4JHR A;  3RRU A;  2YHC A;  2NLX A;  4CD1 A;  5JJ7 A;  1OWO A;  2Q7F A;  3EO3 A;  3O08 A;  2ZJP L;  5G04 J;  4FWL A;  3I4G A;  4XH1 A;  3LDP A;  4ME2 A;  4IDH A;  5BUZ A;  4GY2 B;  3ZYK A;  4PKG A;  1GLD G;  3ZX3 A;  1G99 A;  3CI5 A;  5J90 A;  2DCP A;  1Y8M A;  3EKS A;  5AEN A;  4ACL A;  1JPL A;  2PAV A;  3CIA A;  3FUF A;  4C0E A;  3L4Q A;  1H2U A;  3PRE A;  3FUD A;  3NF1 A;  3EL2 A;  3A0I X;  3PS6 A;  5AQU A; 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