4J8FA

Crystal structure of a fusion protein containing the nbd of hsp70 and the middle domain of hip
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
551
structure length
551
Chain Sequence
FMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGLESDLEIDNEGVIEADTDAPQEMGDENAEITEAMMDEANEKKGAAIDALNDGELQKAIDLFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFVKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAARDLALACKLDYDEDASAMLREVQPRAQKIAEHRRKYERKREE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of Hip, an attenuator of the Hsp70 chaperone cycle.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein
total genus 183
structure length 551
sequence length 551
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.25.40.10 Mainly Alpha Alpha Horseshoe Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat 4j8fA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4j8fA03
2KCVA 2YI1A 3SLCA 4CZMA 4FO0A 3CJCA 1MDUB 4KBQA 4Y0WA 5KJMA 3KHYA 4U0ZA 1Q18A 3O08A 4FPAA 4DHYA 3ESKA 2JLBA 2YJFA 4PL7A 2R5SA 5CE3A 1HLUA 3FE1A 1GLFO 3MKRA 1QZ5A 4XI9A 5FT9A 4K41A 2GWKA 2KCKA 3H3OB 4A62A 1XC3A 2XCBA 4IN3B 4NO7A 1LCUA 2E20A 3NF1A 2C0LA 1DGKN 1BA0A 4YVQC 1LOTB 5FZSA 5EOYA 1YVNA 3LY7A 4YDUC 2YQ8A 1GLAG 1K8KA 3PE3A 3ZHEB 3W3DA 5FZRA 4GZ6A 3WXJA 5JJ7A 4FWMA 3ASGA 2FSJA 2FO7A 3MDQA 1DEJA 4RG6A 2FSKA 2UWJG 3QWPA 3OXFA 3CI5A 3DXKB 2HF4A 4H5TA 5JJTA 5AQKA 3RO3A 2YHXA 3VEVA 1NBWA 4JL0A 3CVQA 5AQSA 1NA3A 2GUPA 1NGCA 3H3NO 3TGOA 1BA1A 2PQNA 1X3MA 4U04A 2FSNA 2YCHA 1QQOA 3D7EO 3GG4A 2XCCA 2VSNA 3MN5A 3H46O 3ZN3A 4JD2A 1NM1A 3ZETA 3FZMA 4FWPA 4J8FA 4BWRA 2VQ2A 5CCMA 4BR9A 3S7FA 3RKVA 3WXLA 2FF6A 3VPZA 1PC2A 1TJCA 1ZU2A 1XQSC 2DBAA 4CGVA 3IFRA 4XIFA 2BUPA 5AQNA 4BRAA 2YHCA 2E88A 2PBDA 5AQOA 5AZJB 3BEEA 1NGGA 3VGLA 3VEOA 3VF2A 2D0PA 3QOUA 1YAGA 3O5BA 4Y6WA 4FWLA 3TAXA 3ZX0A 3SMSA 3LDPA 4EAHD 2W41A 2IVNA 4JHDB 4PKIA 3FFLA 3IUCA 3U4LA 3A5LC 4JAXA 3FWVA 2P9NA 1G99A 4EIAA 5AQQA 3CETA 5G04C 5FJYA 3ASFA 4QS7A 2QWNA 4M7XA 2GTDA 3QBWA 5AQVA 3ASDA 4BRPA 2P9LA 4MLEA 1MWMA 1KT0A 5G04J 4UI9K 4GA1A 4KXKB 3RSEA 1RFQA 2ASPA 4BR2A 1K8KB 2HF3A 4HORA 3VESA 2GELA 1KT1A 3KAEA 5ARFA 3KS2A 4BRNA 4IZ9A 4ISFA 2HMPA 1NGDA 3CK8A 1U6ZA 2I7PA 5BN8A 4GYOA 4Y6CA 2WPVA 2Q97A 3BF1A 3BF3A 4AIFA 4HOSA 3C7NB 2IFUA 3L0QA 3D2FA 2IF4A 3CJ7A 3ZETB 4I17A 1BU6O 5ADXA 1NGEA 4H5NA 2A41A 3FZKA 4E1JA 4FSVA 5AQZA 4BROA 2UY1B 2LSUA 3AAPA 2ZF5O 2ASOA 4KBOA 2A40A 5F1XA 2OOEA 4K25A 4J0UA 4K43A 1KAYA 3WT0A 3WXIA 4FWNA 2VYIA 4B1ZA 1C0FA 4I9EA 2QFCA 3VEWA 4BR0A 3EL2A 4AM9A 2J4RA 3KZBA 4G24A 5AFUA 1QQMA 3Q4AB 2E2PA 4B1VA 4HTLA 3ZEUB 2XGOA 5BPNA 4BC3A 3ATVA 3S41A 5F2RA 4H0YB 3RU0A 4N5CA 3CKCA 2Q2RA 3H1VX 3MMVA 5AQPA 4LC9B 2CH6A 4CBUA 3DXMA 3HZ6A 2OANA 4CZGA 5EKQD 1GLBG 1TYQB 4ISGA 3SF4A 3WXXA 1NGAA 5AQYA 1ATSA 2QM1A 3WUHA 2GEMA 3O80A 4WQ5A 5AR0A 4BRDA 5TKYA 4GNIA 1HJOA 3ULQA 2AP1A 3CHWA 3ASHA 4AY5A 3D2FB 4NQ0A 2I6HA 2LSVA 3Q15A 1HX1A 3RIBA 1KXPA 1S22A 3SK3A 2C0MA 3A8YA 3P4IA 3UQ3A 4APOA 3LYAA 5AQTA 4H0OA 5BN9A 4QS8A 3MN6A 1GLCG 3MV2B 4FWSA 1U2VA 2NZTA 4XEIA 3O48A 4XI0A 4G26A 4G25A 2H3GX 5FTPA 3GE1A 3PE4A 4G23A 4B94A 3ZX2A 1HZ4A 2E8AA 2VCPA 4N3CA 5AQHA 3CVNA 4JNEA 4CBXA 3UKRA 4O8KA 3UKUB 4UI9C 5A7DB 4RTFD 2QWPA 2I7NA 4N2QA 1TUYA 1BO5O 1A17A 2P9IA 3QMLA 1SZ2A 3GL1A 2DPNA 5FPEA 4UI9J 3WEEB 3EZWA 1FCHA 2VGXA 2QWOA 2CGJA 3QFUA 1NWKA 4FPBA 4I6MA 2QWQA 4EHUA 1GLEG 5HQ8A 4H7YA 2D4WA 4FWQA 1HKBA 2P9SB 2XEVA 3VGMA 1YA0A 2E2QA 2P9UA 3AAQA 4DB3A 3LKUA 2C2LA 5AQXA 5EXWA 5BREA 1NGFA 4BRHA 3MEKA 3OXLA 2VYPA 1RGIA 3HBTA 3EO3A 4UQXA 2V5FA 4J8DA 3FGUA 3Q49B 4LEUA 1S3XA 4BRIA 3ENOA 4N3AA 4GPKA 3U8XA 3QFPA 2FF3B 5ADXH 4A2AA 3SMPA 1SQKA 2YHWA 3FZHA 5AQGA 4BVOA 3MA5A 4GA0A 3FZLA 1E4GT 3GDQA 3CJ9A 1P8ZA 3TG4A 2A42A 1NA0A 3WQTA 1WM5A 2Q0RA 3R9AB 3TPQA 4IWVA 3U3WA 3SZ7A 3J8AA 2AVPA 1JCGA 2W40A 1QZ2A 1GLDG 3HYMB 5KPTA 4JA9A 2CGLA 3D2EA 4F9OA 1IYGA 5AFUH 3R8EA 4RG9A 3UKRB 4BC5A 4WNFA 4BRMA 4BRGA 2HO1A 3LY9A 3MK6A 4FOEA 3VTYA 5BNWA 4GCNA 2WQHA 4WNDA 3G25A 5BW8C 2VGXB 5CCLA 1V4SA 1YUWA 2P58C 4I6MB 2KATA 3VF6A 3CJ1A 1H1VA 1NMDA 3LM9A 3FFKB 2XGSA 2A3ZA 4PKGA 4A1SA 3OXGA 1HH8A 2P9UB 5E26A 2IIRA 3S7BA 2Q1NA 1JCEA 3HSCA 4Z94A 2D0OA 3U4TA 2QXLA 3QWVA 1KAXA 4JD2B 3VENA 4CZHA 2YJEA 2VGYA 5JMVA 1IHGA 4BT8A 1GLJO 4IXCA 2E2NA 2V51B 3LL3A 3QBXA 5AQIA 5D0QD 5JLHA 4IJAA 3CJBA 4BRLA 2FI7A 1ATRA 3F9MA 3BP8A 4CD3A 3IMXA 2LNIA 4U0SA 2P9PA 4BRFA 3DJCA 2NRHA 2NC9A 4BTBA 4HOUA 5AQRA 3H6EA 5F0XA 1ZC6A 3ID8A 4XH4A 2FBNA 1Z6RA 3D2EB 2E2OA 4HOQA 4N39A 2D1KA 2XGMA 2P9NB 4GZ5A 2P9KA 2QWRA 4I2ZA 1KLXA 5KJNA 3VEYA 2P9LB 3QICA 4L3QA 4CZEA 1HUXA 2HOEA 5G05C 5EX5A 3RSEB 3ULEA 1ZBSA 3CKBA 4WQ5C 3FP3A 3JS6A 2QWMA 1CZAN 1WOQA 5G05J 3BUZB 5FPMA 4PL8A 3M1FA 4IJNA 3VTXA 4CZJA 4RCHA 5AQWA 1BWFO 2HR2A 3QDKA 2IVPA 5HI7A 3EKUA 4BR7A 1X3NA 4JN4A 2J9QA 3GZ2A 3MV3B 1NGJA 2GWJA 3ZHEA 2PL2A 1Y64A 2XPIA 4HWIA 3DXKA 3VF4A 3LDNA 1E96B 4GZ3A 3CEQA 1ELRA 2V7YA 4PKHA 3C0BA 4XH5A 5EVZA 5FPNA 3UE5A 3CK9A 2ZWHA 4WYBA 5ARGA 2GW1A 1YXQA 3UPVA 3W0LA 5DIZA 3FLCO 3CVLA 1JCFA 3EKSA 3LDOA 3VOVA 5FZQA 1J6ZA 4H5VA 4WQ4A 4WUYA 1RDWX 4JA7A 3MN9A 4I2WA 5AQFA 2IVOA 1TUUA 5JICA 3GYZA 4BRKA 4NRHB 1ZXOA 2F9TA 1Z05A 2P9KB 4GY2B 4H03B 4BRQA 5JLFA 1ZBPA 5KQDA 4UQYA 5ELZA 2BUGA 5AZJA 3GZ1A 3DAWA 4AY6A 4JHRA 4MLHA 3A5OC 5I9EB 1NGIA 3ULEB 3CIPA 3DXMB 2FEZA 1XNFA 3M3ZA 3VERA 5JJ6A 5LJVA 1NLVA 1R59O 4M63C 4DQ8A 4GCOA 3EN9A 5LCWC 3CQYA 2V52B 2ZGYA 4JHDA 3EDTB 3HI0A 3ZPJA 4AM7A 3ZFWA 5KJKA 4BG8A 1W3BA 5LCWJ 3VETA 2MHKA 4BVPA 1OUVA 3CERA 3AS5A 4BC2A 5C1DA 4BGBA 3CVPA 5EY4A 4GYWA 5AQUA 3LY8A 1GLLO 1HKGA 3TU5A 1BDGA 1XUPO 5KPZA 5EX0A 3QDNA 3VEXA 1NGBA 3WXKA 3A5MC 4M7YA 4B1YB 1SAZA 1IJJA 4K42A 2F9WA 4YDUA 4CBWA 1X9JA 3HM8A 3E4BA 4U0UA 4H5RA 1U2VB 3URZA 2PZIA 2VSYA 2FF4A 1V4TA 3AS8A 2A6AA 3C7NA 3CQXA 3M6GA 3O8MA 4BTAA 3VEZA 4AM6A 4BGAA 4BQLA 3ZGQA 1QHAA 3K9IA 4BREA 3JYSA 2ZGZA 3I33A 4N2SA 2NLXA 3OHRA 3I8BA 5AQMA 3LPZA 3RO2A 3KD7A 2UY1A 4FWRA 4EQFA 1QZ6A 2P9IB 3A5NC 4ME2A 3GOIA 2QW9A 4H7XA 2VWBA 5M72A 4EFHA 4B9QA 4CJ7A 4G2VA 2Q36A 3A0IX 4MO5A 3LCAA 1QQEA 3O1WA 2HYZA 2CH5A 5BRFA 1T6DA 1KAZA 1WAO1 4GA2A 4FWKA 3RJVA 3L6QA 4BT9A 1DKGD 3AARA 2YHYA 3TG5A 2ASMA 2UYTA 3ZEUA 2E1ZA 3QB0A 4WNGA 3H1QA 3JXUA 4C23A 1WUAA 4CI6A 1EQYA 5BR9A 5BRDA 2KC7A 2EWSA 5AQJA 4RWTA 5DBKA 1D4XA 3CJAA 3IDHA 5BT1A 1BUPA 4A61A 1TYQA 2PAVA 4XH1A 4I1AA 3DWLA 5CHEE 1C0GA 4FOIA 2ITMA 1ESVA 3ENHA 3VGKA 2A5XA 3Q5MA 4MO4A 1HPMA 4B1XB 4B1WB 1BG3A 3O4WA 5AZIA 2WUSA 1E4FT 5D0OD 2FXUA 3AY9A 4J8EA 4U07A 3U9DA 1Y8MA 2E2EA 3FZFA 4CZIA 2Y4UA 2ONDA 4DCHA 2FLOA 3GW4A 4NB4A 3QWWA 1HXIA 4CGWA 2QWLA 3L4IA 4A2BA 4BQZA 3R6MA 4H0TB 5BRHA 3S7DA 2Y4TA 3ATUA 1ELWA 2Q7FA 5AQLA 4BR5A 3MCPA 4UQZA 4G1TA 4N3BA 4BR4A 4BG9A 5BPMA 5B8HA 4W9RA 3MN7A 5A6CA 5KQ8A 2BTFA 3S7JA 4ABNA 5KJLA 3KVGA 2AA4A 3AS4A 3HTVA 2KCLA 3CV0A 3UKUA 1T6CA 2KHOA 4HOTA 3LDLA 4H0VB 4IO8A 3SJHA 4B1UB 4CZLA 4BRCA 2V7ZA 4KYOB 3UB5A 4YNDA 5BPLA 3BEXA 4O6FA 4QS9A 3UUXA 1NGHA 3WEEA 5KPRA 4CZKA 2PQRA 1BOTO 3O1BA 4WNEA 2E1YA 4ISEA 3N71A 4CZFA 4YVOA 4CDRA 1HKCA 2Q0UA 3WQUA 5FPDA 4I9CA 3O6WA 2P9SA 4FWOA 3LDQA 3R9PA 1B89A 3PDNA 1IG8A 1OKJA 4WQ4C 3U9ZA 3LM2A 2L6JA 3FR0A 4H0PA 3IEGA 2P9PB 2CGKA 5E84A 4BC4A 4EHTA 4F3VA 1P5QA 3QKYA 5EX3A 2Q31A 3B8AX 4FL9A 4O5FA 5LJWA 3GBTA 1QQNA 4H5WA 5AZIB 3CK7A 4GYYA 3H45C 1T44A 1ATNA 5LY3A 4CD1A 3ZX3A 1MWKA 1MA9B 4H0XB 3Q47B 1NZNA 5AYWD
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YI1A 4B9VA 4FK0A 1SA5A 1MZCA 3CJCA 5AARA 3CPWM 5HOOA 3APDA 3CC4N 2O8EB 1RDUA 3KHYA 3WNFA 3O08A 4D10C 2VQEK 2CHZA 2MYOA 4FPAA 4GV3A 1KVAA 3VQ7A 2R5SA 5CE3A 3FE1A 1NK4A 5AAOA 1GLFO 1TKDA 1FKOA 1HPZA 1QZ5A 4A1GA 2BTDA 3ESLA 4UWFA 3CGHA 5FT9A 2GWKA 3N4PA 3NBPA 4A62A 4JI0K 4NO7A 4F6RD 1LCUA 3NF1A 2C0LA 1LOTB 1BA0A 1RT2A 1YT3A 3P31A 4OKJA 5EOYA 4IG0A 3SAHA 1TAQA 1VRTA 4BY9C 2OZMA 3ZHEB 5FZRA 2FSJA 2ILRA 4RG6A 2UWJG 3QWPA 5AQKA 2MRIA 2HF4A 1WSJA 4G1QA 4JL0A 2X6NA 3B95A 1NA3A 5HP1A 2WM9A 4DLOA 3CC7N 1BA1A 5EU7A 3VEOA 3D7EO 4DLEA 3S2AA 5BV1A 3MN5A 2XCCA 4JD2A 2WQ6A 3ZETA 3ASNE 4FYDA 4E72A 3FZMA 3SD5A 4BETA 3K57A 4JKCA 1VSMA 1S64A 4DU3A 3WXLA 5HRYA 3EEQA 3PVLA 3K2PA 2G8FA 2HHHK 1PC2A 1TJCA 1N36K 4U63A 4DSJA 3UM2A 4XIFA 2OEVA 2YHCA 1D9SA 2E88A 4AEZC 3Q9NC 2UUAK 2HHXA 4GTMA 2DIWA 1TNOA 1HR0K 3AA2A 4FWLA 1NJZA 1JPLA 4QCLA 1IQUA 3PZ4A 4XEIG 3ZU7B 4JAXA 4EIAA 5KGXA 4CEAA 3E30A 4I43A 3ASFA 4QS7A 2QWNA 2ZJQL 1TGOA 3CIAA 1TN6A 4MLEA 3CVXA 4W5NA 3T5VA 3B6OA 5G04J 2FC0A 4KXKB 3JUIA 5EYLA 1K8KB 2HF3A 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 1T44 A;  1ATN A;  5LY3 A;  4CD1 A;  3ZX3 A;  1MWK A;  1MA9 B;  4H0X B;  3Q47 B;  1NZN A;  5AYW D; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YI1 A;  4B9V A;  4FK0 A;  1SA5 A;  1MZC A;  3CJC A;  5AAR A;  3CPW M;  5HOO A;  3APD A;  3CC4 N;  2O8E B;  1RDU A;  3KHY A;  3WNF A;  3O08 A;  4D10 C;  2VQE K;  2CHZ A;  2MYO A;  4FPA A;  4GV3 A;  1KVA A;  3VQ7 A;  2R5S A;  5CE3 A;  3FE1 A;  1NK4 A;  5AAO A;  1GLF O;  1TKD A;  1FKO A;  1HPZ A;  1QZ5 A;  4A1G A;  2BTD A;  3ESL A;  4UWF A;  3CGH A;  5FT9 A;  2GWK A;  3N4P A;  3NBP A;  4A62 A;  4JI0 K;  4NO7 A;  4F6R D;  1LCU A;  3NF1 A;  2C0L A;  1LOT B;  1BA0 A;  1RT2 A;  1YT3 A;  3P31 A;  4OKJ A;  5EOY A;  4IG0 A;  3SAH A;  1TAQ A;  1VRT A;  4BY9 C;  2OZM A;  3ZHE B;  5FZR A;  2FSJ A;  2ILR A;  4RG6 A;  2UWJ G;  3QWP A;  5AQK A;  2MRI A;  2HF4 A;  1WSJ A;  4G1Q A;  4JL0 A;  2X6N A;  3B95 A;  1NA3 A;  5HP1 A;  2WM9 A;  4DLO A;  3CC7 N;  1BA1 A;  5EU7 A;  3VEO A;  3D7E O;  4DLE A;  3S2A A;  5BV1 A;  3MN5 A;  2XCC A;  4JD2 A;  2WQ6 A;  3ZET A;  3ASN E;  4FYD A;  4E72 A;  3FZM A;  3SD5 A;  4BET A;  3K57 A;  4JKC A;  1VSM A;  1S64 A;  4DU3 A;  3WXL A;  5HRY A;  3EEQ A;  3PVL A;  3K2P A;  2G8F A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2YI1 A;  3CJC A;  3CPW M;  5HOO A;  3APD A;  3CC4 N;  1RDU A;  3KHY A;  3O08 A;  4D10 C;  2CHZ A;  4FPA A;  4GV3 A;  2R5S A;  5CE3 A;  3FE1 A;  1GLF O;  1QZ5 A;  4A1G A;  2BTD A;  3ESL A;  4UWF A;  3CGH A;  5FT9 A;  2GWK A;  3N4P A;  4A62 A;  4NO7 A;  1LCU A;  3NF1 A;  2C0L A;  1LOT B;  1BA0 A;  3P31 A;  3SAH A;  5EOY A;  4BY9 C;  3ZHE B;  5FZR A;  2FSJ A;  2ILR A;  4RG6 A;  2UWJ G;  3QWP A;  5AQK A;  2MRI A;  2HF4 A;  4JL0 A;  1NA3 A;  2WM9 A;  4DLO A;  3CC7 N;  1BA1 A;  3VEO A;  3D7E O;  3S2A A;  5BV1 A;  3MN5 A;  2XCC A;  4JD2 A;  2WQ6 A;  3ZET A;  3FZM A;  3SD5 A;  4JKC A;  3WXL A;  3PVL A;  1PC2 A;  1TJC A;  4U63 A;  4XIF A;  2YHC A;  2E88 A;  4AEZ C;  2DIW A;  4FWL A;  1JPL A;  1IQU A;  4JAX A;  4EIA A;  4I43 A;  3ASF A;  4QS7 A;  2QWN A;  3CIA A;  4MLE A;  3CVX A;  3T5V A;  5G04 J;  4KXK B;  3JUI A;  1K8K B;  2HF3 A;  5GAE P;  3KS2 A;  4IYP A;  4BRN A;  4IZ9 A;  1NGD A;  5BRH A;  3C7N B;  3PIP L;  2WB2 A;  3NQP A;  3FZK A;  5T8I A;  4ANX A;  4UWK A;  4KBO A;  2PFU A;  4KH6 A;  4K43 A; 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