4J8FA

Crystal structure of a fusion protein containing the nbd of hsp70 and the middle domain of hip
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
551
structure length
551
Chain Sequence
FMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGLESDLEIDNEGVIEADTDAPQEMGDENAEITEAMMDEANEKKGAAIDALNDGELQKAIDLFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFVKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAARDLALACKLDYDEDASAMLREVQPRAQKIAEHRRKYERKREE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein
publication title Structure and function of Hip, an attenuator of the Hsp70 chaperone cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 183
structure length 551
sequence length 551
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.25.40.10 Mainly Alpha Alpha Horseshoe Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat 4j8fA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4j8fA03
2P9LB 2XPIA 4MO4A 3AS4A 4GZ5A 1MWMA 3AY9A 4XIFA 5FZSA 2QFCA 3S7JA 3VTXA 2CGLA 3O6WA 3QBXA 4DQ8A 4MLHA 5BPLA 3RSEA 4H0YB 2UY1B 1GLBG 2P9IA 4H5VA 3SF4A 3R9PA 3FFLA 3R9AB 3PE3A 4W9RA 3CVQA 1GLDG 1GLLO 1NGEA 1RGIA 2PAVA 3F9MA 1JCEA 2V5FA 4FWNA 1Z05A 2I7PA 3C7NB 4FSVA 4FWPA 5F2RA 3VEXA 2LSUA 3LDOA 1ATRA 5AQIA 5ARGA 3PE4A 3QDNA 2F9WA 4RTFD 4AM7A 3CJ7A 4CBXA 2J4RA 3BEXA 4BRAA 1KAZA 1HKGA 4KBOA 3QWVA 1A17A 4JNEA 3ZETB 2VGXA 4BR9A 1TYQB 2QWMA 1BA0A 1YUWA 3FZHA 1ESVA 3ATVA 3CEQA 5I9EB 2WQHA 4IJAA 3LKUA 1Q18A 5FTPA 4K25A 1K8KB 3VENA 4MO5A 4B94A 4K41A 2QWLA 3GDQA 4FWRA 4BWRA 1TUYA 4BRMA 2F9TA 2Q2RA 1NGFA 3AS5A 3VEOA 4H7YA 4GYYA 3MN5A 2CGKA 2KATA 2IVOA 3L6QA 3ZEUB 2VSYA 4HOQA 4FPAA 4XI0A 3QFUA 4RG6A 4G1TA 4U0UA 1BDGA 2P9UA 1XC3A 4CI6A 3GZ2A 1NM1A 2GELA 3O1BA 3U3WA 4J8DA 1HXIA 1KT0A 3RU0A 3ZFWA 4L3QA 4FWMA 3SMSA 2XGSA 5BW8C 1WUAA 2Q0UA 3FE1A 2GWKA 3EN9A 3A5NC 2NLXA 2CGJA 3GZ1A 1T44A 4APOA 2YI1A 3ATUA 2GEMA 4XI9A 3P4IA 2ITMA 5KJNA 2D0PA 5F0XA 3CKCA 1WAO1 3ZHEA 3IMXA 4WNDA 4RG9A 3I33A 4G2VA 4HORA 5D0QD 3M1FA 2XGOA 5KJKA 4JA9A 4BGAA 3VF4A 2LSVA 4G26A 4N3CA 4PL8A 1HH8A 1EQYA 1DGKN 5JLHA 3TG5A 4O8KA 3ESKA 3VETA 3CQXA 3KD7A 4Y0WA 5BN8A 2Y4TA 3GL1A 3BUZB 2CH6A 2FLOA 3ENHA 1GLFO 3FR0A 1H1VA 4I17A 2QM1A 4FWQA 4BRDA 5B8HA 4KXKB 3ULQA 3H3NO 5JLFA 3R8EA 1ZU2A 4GCNA 5KJLA 4YDUA 3D2FA 5AQWA 3UKRA 4BRHA 1HX1A 5BR9A 3EL2A 3GE1A 4DCHA 3CQYA 3ASGA 4H5WA 3WQUA 2C0MA 1XQSC 3MKRA 3FFKB 1ZBSA 4BRQA 1G99A 1NA3A 4CGVA 4BRGA 4UQYA 5G05J 3URZA 3VEYA 2EWSA 2ASMA 4U04A 3AAQA 1WOQA 5FZRA 2E2QA 3A5LC 2P9SB 1JCGA 3CKBA 3ZPJA 2BTFA 3SK3A 1ELWA 4YVQC 4JD2B 5AQKA 3ZN3A 5KPZA 5LJVA 1NGIA 5G04C 3B8AX 5ARFA 3Q5MA 4JHDA 1SAZA 3H46O 4LEUA 2E1ZA 4O6FA 1T6DA 3CJAA 3BP8A 4UI9C 5CCLA 1KAXA 2FEZA 3QB0A 1IHGA 3TGOA 1NGBA 5D0OD 2FI7A 3DXKA 4WQ4A 3UPVA 3U4TA 4B1UB 4N5CA 3VGKA 3Q49B 4IN3B 2E20A 1JCFA 5AQGA 4BVPA 5AZJA 5F1XA 1GLEG 1ATSA 3VERA 3CJ9A 3VESA 1NGHA 2Q0RA 3CK7A 4K42A 1BOTO 4XH5A 4JA7A 2E2EA 2QWPA 2V7YA 3VEZA 4BC5A 1DEJA 2Q36A 4CZGA 3KVGA 4BR4A 3QWPA 4BRKA 4WUYA 3H3OB 3HZ6A 5CHEE 2PQRA 3S7FA 5AQJA 4BQZA 4FWOA 1Y8MA 3SMPA 1B89A 2FSJA 2P9KA 5BRFA 5CE3A 4K43A 1QZ6A 2OOEA 4JN4A 3TU5A 3HBTA 2PBDA 3EDTB 4CBWA 3O4WA 5AQMA 2XCCA 2QWQA 5AQUA 3N71A 5AZIB 3ZX2A 4IJNA 4PL7A 2YHWA 3U8XA 2A40A 4AY6A 1LOTB 1D4XA 3W0LA 2IF4A 2LNIA 1YA0A 3RO2A 2YJEA 3DJCA 4FL9A 2FO7A 3MA5A 3M3ZA 4QS8A 4IWVA 2XEVA 3GYZA 5M72A 5AQZA 4WNEA 5JJTA 1ZBPA 2I7NA 2NZTA 4F9OA 4MLEA 1ATNA 4HWIA 3S7BA 4I6MA 3A5OC 3D2EA 4EQFA 3ASDA 3BEEA 4NQ0A 5KJMA 4DHYA 1NGAA 1U6ZA 2QW9A 2P9NB 2E2OA 5EX3A 4JL0A 5LJWA 3UKUA 2WPVA 3HYMB 4XH4A 4HOUA 4BTBA 4CJ7A 3ASHA 3EKSA 2C0LA 1MDUB 2A41A 4G23A 2IIRA 4B1WB 1E96B 1QZ5A 3LDQA 4N3BA 5C1DA 5BRDA 1KT1A 2P9PA 5AFUH 1E4GT 2VGYA 4LC9B 3VPZA 4UI9J 4N2SA 3WXJA 2ONDA 4CDRA 4CZMA 2R5SA 3TG4A 2V51B 1HZ4A 1NZNA 3MCPA 3WXLA 5FZQA 3LDPA 3HM8A 5AQNA 3E4BA 4BT8A 1MWKA 2CH5A 5FJYA 3SJHA 3K9IA 2ZF5O 3FZKA 4BGBA 5JJ6A 2E88A 4HOTA 2Q1NA 3CVNA 5AQQA 1YAGA 3IFRA 3UB5A 4BC3A 1IYGA 2Q97A 1Z6RA 2QWOA 3MMVA 2BUPA 4G25A 3WT0A 3ZX3A 4GNIA 3OXGA 2P9LA 4N3AA 5LY3A 3FLCO 5AQVA 4J0UA 2AA4A 5JICA 3KZBA 3QICA 5CCMA 2MHKA 1NGDA 2D4WA 3CJ1A 2DBAA 3ASFA 1YXQA 4H0OA 4WQ5A 4B1YB 2UY1A 2Y4UA 3O80A 2J9QA 3Q15A 4I9EA 1RFQA 3HTVA 4XEIA 2PQNA 2W41A 4PKHA 1NMDA 3WEEB 4BC4A 2QXLA 4J8FA 3CK8A 4NB4A 4BRFA 3C7NA 4CBUA 1BG3A 3A0IX 5EX0A 2VQ2A 4IZ9A 2VWBA 2YQ8A 4CZJA 3GBTA 2FSNA 5EKQD 4KYOB 1BU6O 3VEVA 1V4SA 4E1JA 5BNWA 4O5FA 3RIBA 1XNFA 1NGGA 3ZETA 1NWKA 1U2VB 1DKGD 3MN9A 3DXMB 1BO5O 1T6CA 1TYQA 4H5RA 2YJFA 4Y6CA 5EVZA 4UI9K 3EO3A 4BRIA 5DIZA 4H5TA 2QWRA 2KCVA 4Y6WA 3HSCA 1K8KA 3FZFA 3VF6A 3CJCA 3RSEB 1GLAG 2Q7FA 2P9IB 4Z94A 3LCAA 1KXPA 4I2ZA 3O8MA 4HTLA 2PZIA 1NGCA 3MV3B 2FSKA 3U9DA 3D7EO 2A5XA 2AP1A 3LDLA 4BG8A 5ELZA 3ZEUA 2YHCA 4FWKA 4ISFA 4JAXA 4M63C 2HYZA 5AQTA 4N39A 4CZKA 2E2PA 3QDKA 4BROA 4A2BA 4EFHA 2HR2A 2L6JA 3I8BA 3QBWA 4M7YA 1BA1A 4ISGA 3DAWA 4M7XA 4EHUA 1CZAN 2HF4A 3IDHA 3L0QA 4WNGA 4ABNA 1S22A 1OKJA 1QQEA 3VF2A 3LYAA 5AFUA 1R59O 3H1QA 3GOIA 2GTDA 3UE5A 2V52B 4B1ZA 4YDUC 4CZLA 2KC7A 3ID8A 3MDQA 3NF1A 3TAXA 4YNDA 5BT1A 5KQDA 4U0ZA 2W40A 1HJOA 3IEGA 4HOSA 2HF3A 3ULEB 4FOEA 5A6CA 3JYSA 4BR2A 1MA9B 1QQOA 3O5BA 3OHRA 3EKUA 5AQFA 3H45C 5LCWC 3S41A 5BPNA 2IVPA 5JJ7A 3RJVA 1HKCA 2UWJG 2P9UB 3SZ7A 2PL2A 1HPMA 4IXCA 2V7ZA 3Q4AB 3MN7A 3WXKA 4CZFA 2ASOA 2IFUA 1ZXOA 4BRLA 4CD1A 3QMLA 1NBWA 4G24A 2QWNA 4BR7A 1HLUA 2E2NA 4GZ6A 4NRHB 5FPEA 2XCBA 3ZHEB 3CHWA 5E84A 5AQSA 3WXXA 3C0BA 1KLXA 1X3MA 4WQ4C 3CIPA 5EY4A 2YHYA 4JHRA 5E26A 4B1VA 3HI0A 3H1VX 1QZ2A 3LY8A 2VYPA 2P58C 1WM5A 3AAPA 2GW1A 3J8AA 5JMVA 2P9SA 2FBNA 2A42A 4BC2A 2D1KA 3LDNA 3O08A 4JD2A 4BR5A 4QS7A 3CETA 4PKIA 4F3VA 3WUHA 3CERA 2NC9A 4UQZA 1X3NA 2D0OA 5AQPA 4BREA 3G25A 5G04J 3CVLA 3EZWA 2YCHA 4I1AA 3UKRB 3D2FB 4AM6A 4CZEA 4AIFA 5ADXH 5EOYA 4GA2A 3GG4A 3PDNA 4I9CA 5DBKA 4BG9A 1P5QA 1LCUA 3LL3A 4DB3A 1GLCG 5G05C 3O1WA 3CVPA 4BRNA 2FF4A 5FPMA 4A1SA 3OXLA 5AQOA 3VOVA 1QQMA 1RDWX 3KHYA 3GW4A 1NA0A 4IO8A 1J6ZA 2A3ZA 4FPBA 4FWSA 1C0GA 3BF1A 1TUUA 4PKGA 3QOUA 5EXWA 4H0VB 4WYBA 4B1XB 1QQNA 3H6EA 3ULEA 4JHDB 3LM2A 5FPNA 4XH1A 4AM9A 3CI5A 2ZGZA 4RWTA 2ASPA 2KCLA 3MN6A 4RCHA 4EAHD 5EX5A 5AZIA 1GLJO 5LCWJ 3QKYA 3DXKB 3LY9A 1V4TA 4B9QA 1HKBA 2I6HA 4KBQA 1BWFO 5HQ8A 3MV2B 2DPNA 5AZJB 3O48A 3QFPA 3LY7A 5BN9A 1OUVA 2GWJA 3ZX0A 2VYIA 1X9JA 3S7DA 2HOEA 3CV0A 4CD3A 4U07A 5AR0A 4YVOA 4GCOA 4J8EA 4C23A 3LM9A 4U0SA 4FO0A 5BPMA 3JXUA 4GA0A 4AY5A 2P9KB 2C2LA 1C0FA 2HMPA 2VCPA 2P9NA 1W3BA 3FP3A 3KS2A 1ZC6A 1S3XA 3FGUA 4CZIA 2BUGA 1P8ZA 4BTAA 3RKVA 3WQTA 4EHTA 4ISEA 5FPDA 1XUPO 4BRPA 4GY2B 3JS6A 1YVNA 1HUXA 2NRHA 2ZWHA 3M6GA 3VGMA 5AQHA 2IVNA 2YHXA 4FWLA 4QS9A 3VEWA 3WXIA 3AS8A 3UQ3A 5A7DB 5KPRA 5AYWD 3LPZA 3VTYA 3ZGQA 2H3GX 3AARA 4N2QA 4WQ5C 1ELRA 4I6MB 3SLCA 3BF3A 3D2EB 3FZMA 4BVOA 4BQLA 2VGXB 4BT9A 1E4FT 3FZLA 3QWWA 5AQYA 4A62A 1Y64A 2UYTA 3OXFA 4H7XA 1KAYA 4WNFA 3UUXA 1BUPA 3UKUB 3VGLA 5HI7A 5ADXA 3MK6A 5AQXA 3KAEA 4UQXA 3A5MC 5TKYA 4GZ3A 2VSNA 1PC2A 3DWLA 1SQKA 2JLBA 3Q47B 1IJJA 1QHAA 2FF3B 3R6MA 4A61A 4GYOA 3TPQA 2FXUA 3A8YA 2OANA 3L4IA 4GPKA 2A6AA 4EIAA 4FOIA 1TJCA 1SZ2A 3U4LA 5KPTA 2P9PB 3FWVA 4ME2A 5AQLA 1NLVA 3RO3A 4H0PA 4A2AA 4CZHA 4GA1A 3MEKA 1NGJA 3ENOA 2WUSA 4BR0A 5FT9A 2AVPA 2XGMA 4CGWA 3WEEA 3CK9A 2KHOA 4H0XB 5BREA 5KQ8A 2ZGYA 1IG8A 1FCHA 2HO1A 2Q31A 4I2WA 2KCKA 2E8AA 4BRCA 3W3DA 4H03B 4GYWA 5BRHA 4H5NA 5AQRA 3IUCA 3CJBA 4H0TB 1U2VA 3DXMA 2E1YA 4NO7A 2GUPA 3U9ZA 2FF6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KPYA 2HHSA 4FYDA 1IQUA 3D45A 4B9TA 4CGDA 1VRTA 1MWMA 2R02A 3AY9A 2WXJA 1WSGA 3QBXA 4DQ8A 4DFJA 4U95D 1GLBG 3SF4A 4W9RA 1J54A 2PAVA 3F9MA 4OX9K 1HNIA 1XHXA 2V5FA 3D9HA 3TXNA 1Z05A 3RMDA 3TWQA 1FXXA 3C7NB 4X64K 3VEXA 2LSUA 3K9JA 3M8PA 3ZT1A 5AQIA 3PE4A 2YHAA 3V79K 3QDNA 3CJ7A 2J4RA 2PYLA 2BEDA 4BRAA 2GRPB 3NBPA 4CK2A 3QWVA 4NXNK 4DV3K 1EWQA 4Z68A 5BUZA 2QWMA 1YUWA 1ESVA 2VWJA 1VAZA 2ZJQL 2WQHA 2H6HA 5FTPA 1Q18A 4CDNA 1S64A 1REVA 2BANA 4B94A 1YYHA 2B0OE 4YDOA 4YDEA 2HBMA 4K41A 4JI2K 4AP2A 4FWRA 3C3RA 3NDKA 1NG9A 3UX4A 1NGFA 4GYYA 2KATA 1GOAA 3L6QA 4MFBA 3NAWA 3CMAN 2VSYA 2AJQA 4XI0A 4Y1CA 3LJNA 1BDGA 2IOCA 3ULEG 1YTAA 4AHVA 2QTDA 4JYAK 1TK5A 1BD8A 3BG1B 5CERB 5CZ1A 1HXIA 3ZFWA 1BCOA 4L3QA 3SMSA 4LFCK 1WUAA 4WCEL 3OBWA 5ENQD 1VQNN 3O3HA 2ZQBA 1H6KA 4X65K 2RPIA 4WF9L 3DI6A 4LERA 3VQ9A 5KJNA 3KSLA 3ZHEA 3JSMA 4B3OA 3OYMA 3HSTB 4WNDA 4RG9A 3HVTA 4G2VA 3I33A 4HORA 3W9FA 1AWCB 1SUQA 3AO3A 1IBMK 1ZBFA 4U8HA 3M1FA 3KLFA 3BY5A 4ATZD 3HM9A 3M5RA 4CW7B 2LSVA 3V1QA 3AO2A 4FJHA 4O8KA 3ESKA 3L2QA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1IQU A;  1MWM A;  3AY9 A;  2WXJ A;  3QBX A;  4DQ8 A;  1GLB G;  3SF4 A;  4W9R A;  2PAV A;  3F9M A;  2V5F A;  3TXN A;  1Z05 A;  3C7N B;  3VEX A;  2LSU A;  3K9J A;  5AQI A;  3PE4 A;  3QDN A;  3CJ7 A;  2J4R A;  4BRA A;  3QWV A;  5BUZ A;  2QWM A;  1YUW A;  1ESV A;  1VAZ A;  2ZJQ L;  2WQH A;  1Q18 A;  5FTP A;  4CDN A;  4B94 A;  4K41 A;  2HBM A;  4AP2 A;  4FWR A;  3UX4 A;  1NGF A;  4GYY A;  2KAT A;  3L6Q A;  3CMA N;  2VSY A;  4XI0 A;  1BDG A;  2QTD A;  3BG1 B;  1HXI A;  3ZFW A;  4L3Q A;  3SMS A;  1WUA A;  4WCE L;  3OBW A;  1VQN N;  1H6K A;  4WF9 L;  4LER A;  5KJN A;  3ZHE A;  4WND A;  4RG9 A;  3I33 A;  4G2V A;  4HOR A;  4U8H A;  3M1F A;  3M5R A;  2LSV A;  4O8K A;  3ESK A;  4Y0W A;  3I3N A;  3CCV N;  4UWK A;  1GLF O;  3FR0 A;  4A57 A;  4JC8 A;  4FWQ A;  3PUJ A;  1K9M O;  3GE1 A;  5G55 A;  2KM4 A;  3J7Z O;  4BRG A;  4UQY A;  1OWO A;  1INZ A;  3PEU B;  3AAQ A;  5M1Q A;  2E2Q A;  3A5L C;  3FDH A;  3CVV A;  2BTF A;  3R1X A;  4NLB A;  1NGI A;  2V0P A;  3Q5M A;  1SAZ A;  5FQ7 A;  1SZA A;  3ZYY X;  4AV7 A;  3TGO A;  1N52 A;  5D0O D;  4Q96 A;  1SZ9 A;  4N5C A;  3VGK A;  3AU4 A;  1KQS M;  1JCF A;  5AQG A;  4BVP A;  2WC9 A;  3VER A;  3LXU X;  2QEX N;  4XH5 A;  1BOT O;  4I43 A;  2E2E A;  2QWP A;  5C2D A;  2I2O A;  2Q36 A;  2A5U A;  3HRG A;  4A55 A;  4O8U A;  5CHE E;  2PQR A;  3S7F A;  5AQJ A;  4BQZ A;  1PAQ A;  1B89 A;  5CE3 A;  1QZ6 A;  2OOE A;  4JN4 A;  3DLL L;  2PBD A;  4CBW A;  5AQM A;  2XCC A;  3ZX2 A;  2WB2 A;  4PL7 A;  2A40 A;  5MLC Q;  1LOT B;  1NJI O;  1D4X A;  4FL9 A;  4IWV A;  3CHO A;  4HLE A;  1OVY A;  4WNE A;  5JJT A;  4MLE A;  2X6K A;  1ATN A;  2PM6 A;  4EQF A;  4B8A A;  2W00 A;  4K0R A;  2E2O A;  2HBL A;  5LJW A;  2WPV A;  3HYM B;  4XH4 A;  4CJ7 A;  2XQ0 A;  1E96 B;  4YOT A;  1KT1 A;  5AFU H;  1E4G T;  3CHR A;  4N2S A;  4ACL A;  3WXL A;  3LDP A;  4GML A;  1U3D A;  3T5V A;  3T69 A;  3HM8 A;  2CH5 A;  3K9I A;  4UY8 O;  4E6H A;  3FTW A;  2CFU A;  1Z6R A;  3CC2 N;  4NUR A;  2BUP A;  3WT0 A;  4FAD A;  4U7B A;  3KZB A;  3QIC A;  5HOO A;  1NGD A;  3CJ1 A;  2WXL A;  5E75 A;  4TRQ A;  3CCL N; 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