1ISWA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with xylobiose
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 169
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1iswA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1iswA02
4IZEA 4RE2A 4BZYA 1K9FA 1BFNA 3WMVA 1PZ2A 2YBUA 4HPHA 1H0IA 4PMDA 2QLYA 4B15A 2YBTA 3EF2A 5F8YA 1WBAA 1TWEA 3L2MA 1E4IA 3LPPA 2P39A 5M5DA 3AZVA 2WBCA 2EPMX 4QP0A 1AVAC 4J3WA 1TVPA 1UH3A 3ARPA 3BAOA 4PTWA 5EMYA 4CN1A 4JHZA 4H04A 4W7VA 1GQLA 1BGAA 3MMDA 2VT0A 2BFGA 4M82A 1C8YA 3K8LA 2PB1A 3WINA 2XIBA 1UD4A 3AXIA 1WZAA 1DWAM 5D63A 1ZBCA 3AROA 1KXQA 4D1JA 2OSYA 2YIHA 4LPCA 1VEMA 4IZXA 4ZKTB 2G3MA 3I3DA 4TX6A 2X0YA 1G0CA 5A6JA 4GI8A 4RL3A 4TUFA 4F34A 3GNOA 1G94A 2VTFA 2GJXA 4I4QA 2J25A 1JAEA 5GNYA 2LIEA 3WEZA 2JF7A 2PWDA 4LO2C 4J3XA 3N17A 5ABEA 1FWVA 1EO5A 4MADA 2OYKA 1ODZA 2D0FA 1I75A 4PCSA 2PWGA 3WBAA 2Z1KA 4DUWA 2UUSA 3CA6A 4GP0A 3IK2A 1UR1A 3UESA 1QI2A 1CLVA 3VUPA 1KFWA 4CJMA 3KWXA 1W1YA 3UG4A 1DWGM 5CQ1A 1JZ5A 1JTCA 3UD9A 3U57A 1HKMA 1D7FA 2D43A 3MSDA 2WHJA 3CA1A 3FJAA 1CYGA 3CZJA 4I4XA 3PTMA 4HU0A 2XFRA 1AVUA 1FH8A 3BAHA 1CXFA 4AZ6A 1D0HA 3FJ9A 4E4PA 1CLXA 1WDPA 4Q22A 2WRYA 4PMVA 4E2OA 1WDRA 2WMFA 5E09A 1FMZA 1V03A 4LYPA 1AVAA 4MPKA 4X0NA 1FHLA 1H11A 2GK1B 1CDGA 2Z1SA 4AW7A 3PZ9A 4NRRA 4KMQA 3BAWA 2CPUA 1GUVA 5FZUA 3AYRA 3F5JA 1E0VA 2D0HA 1UR0A 2FGZA 2B31A 2E8YA 3BLPX 3FHQA 3GXDA 3K8KA 2YOCA 2IHOA 4W7UA 3VOCA 3VIMA 1E56A 1UWRA 2EBNA 2ZX8A 3VMNA 2QN4A 4G6MA 3N7MA 3FW6A 2AAIB 4GQRA 1OT2A 4PUEA 1NH6A 1FH9A 3PHZA 3POKA 3HJEA 1RH9A 4N42A 4LO2A 3AIRA 4UQEA 2PWEA 3ZSSA 1AQHA 3EDFA 1MD6A 3RM8A 4QD2C 4AY1A 1VENA 3BC9A 3S8JA 3W37A 4GAFA 3WENA 1E72M 4FLQA 1QXMA 3V0BB 2F8QA 1BVZA 5EHAA 5BROA 1E5NA 2QPSA 1QNSA 2QF8A 1MW3A 4Q91A 1UD5A 3FJDA 1BHGA 1VCLA 2E40A 1ISYA 4Z8SB 5CPSA 4QLKA 2PC8A 4CD4A 3PG0A 4KH2A 5DFAA 1VJZA 5CSYA 2NZ9A 1MC9A 1PUUB 5CLTA 4AEFA 3SEPA 4L4PA 3N0KA 4Y7EA 3ZMRA 1GOIA 1L8NA 4F8XA 4YHGA 4LXFA 4ZFYB 2A3EA 4Z2JA 3R4UA 3PZMA 1H1NA 2A3BA 2J7EA 1H0GA 4W8LA 5FKYA 1XRVA 5FZZA 2ZX9A 4MJ4A 3WF1A 4PMOA 4P7QA 2WPGA 1CENA 4J23B 3CBWA 3ALFA 3BMVA 1PEZA 1HVQA 4PSRA 3RMYA 4LQ1A 5I0DA 3KL0A 2D22A 3EBVA 2BEBA 2VCBA 3VGGA 3OBTA 5BYWA 4S3JA 4ACZB 2RGMA 3VGEA 5JUVA 3A4AA 3FUOA 1JLYA 7I1BA 3VM5A 4J2XA 2HW9A 3T0BA 2DIJA 4X37A 1VFOA 4GI6A 3BAVA 3L4TA 2VUYA 4U31A 1CEOA 1JDCA 3N1AA 2WMJA 1EDQA 4Z2LA 3AOFA 3GBDA 2GK1A 5ABGA 1CIUA 2BVYA 4QBVA 3VU2A 3VDCA 2HWAA 2NVHA 1WD3A 1B3YA 2MC2A 3ZO9A 3MANA 2ZOXA 1ITXA 3BB2A 4TVDA 2ZX5A 4XFTA 2XVKA 3FY1A 2XGIA 3OJ2A 4WJXA 4A3YA 1HCDA 3O4AA 1VBUA 2DT2A 2VC9A 4ZXOA 6A3HA 2PBOA 3HALA 3PZGA 4I4OA 2J75A 2ZIDA 3AHZA 3WN6A 5JIWA 2XSBA 2KI6B 4EB2B 3ZJ6A 2W91A 2Q9XA 1W9PA 1JIBA 6TAAA 4AIOA 4PUDA 1E55A 3S6TA 4GXPA 1V6UA 4NI3A 5JLVA 1GONA 3BSHA 4MB4A 2Y9GA 2A3HA 5BQUC 3AHYA 4AZ5A 2ZWZA 4J7RA 3BRGC 1UHVA 3BLKA 1ZBKA 1UG6A 5EBAA 5JBEA 3S2CA 4KRUA 3BH4A 1G9AA 1UKSA 3PMEA 3AHTA 4MDOA 2C8NA 4TXEA 3L4WA 2VZOA 1C7TA 1HJVA 4OJYA 3KL3A 5A6MA 3AKHA 3K8MA 2ZUMA 4U3AA 3U5YA 2VZVA 4LO3C 1OB0A 3AIEA 1UYQA 4I4VA 3AS0A 4D8HA 3VMOA 1IILA 4H8VA 3QR5A 1XCXA 1DLLA 1US2A 2X2YA 3BSGA 4CD5A 5D61A 1UKPA 4GOVA 4LO7B 2G41A 1UD2A 1UQYA 3RMEA 3TTQA 2D7RA 3RILA 1K5VA 3MKKA 3SNVA 3VIFA 1OIMA 1WZKA 1KXVA 2WMKA 3GNRA 4OWKA 2CBJA 4AWEA 5GQBA 1V3HA 1JLXA 1JYNA 2BHUA 1JDAA 2J7CA 5IHSA 2YKKA 3H6RB 1UA3A 3ARVA 1G01A 3ARUA 1TP0A 2J3PA 2XM2A 3CRHA 4OWLA 2VR5A 3E1F1 5I23A 3Q7YA 4P7OA 1BFFA 1KR1A 5A2AA 2YA1A 2J78A 2XTKA 4BS0A 4E8CA 4QCEA 3K1DA 1SMDA 1IT0A 2DPEA 1H09A 2X1IA 1W3FA 5EFFA 3VIKA 3SCPA 1HNYA 4C7FA 5CGTA 1J0HA 3W29A 3R4SA 1Z4SA 3F1RA 2BY1A 1ZJBA 3HN3A 3QOKA 3H6QA 2PWFA 4XFSA 3ZR6A 4ZEPA 1PZZA 3I3BA 4U33A 1VAHA 1BARA 3AMCA 3ZOAA 3EDKA 1Z2VA 3EMZA 4P0LA 4U5KA 3CAHA 4I4RA 3VPLA 3EDEA 1R7OA 1WKYA 2VL4A 3MSGA 3WNPA 5GNXA 5A6LA 1B30A 3FFZA 2Y5EA 3VD9A 4AD3A 1PWAA 1R86A 3W27A 4WLCA 1KGXA 5BQUA 3N12A 5LA1A 4DWSB 4MNKA 5EFDA 3APGA 2HVMA 4IUGA 2TAAA 1CGTA 1OD8A 2GJPA 3AJ6A 4TLPA 5ECUA 1EQCA 1DHKA 2CYGA 3ZC9A 2VQUA 3BAUA 4Q7NA 2G3JA 4LO3A 3SUUA 3CUIA 5IFTA 1DQGA 3OGVA 3LTQA 3CHEA 1GPFA 4OOUA 2ZQOA 1I1XA 2ZXBA 3VDHA 5A8PA 1U2YA 2I1BA 1OD0A 3VD5A 4DWSD 4HMCA 3TTSA 3OGSA 5I79A 3UDAA 2VZTA 4GINA 1II4A 1SR4C 3P6IA 1UA7A 1V0MA 4DM2A 5D62A 1W91A 3TTYA 1W1VA 5BXSA 1OM0A 2DSKA 2D0GA 2FHCA 1YYNA 3GH4A 3DC0A 4R27A 2F2FC 3W81A 2C0HA 4LYRA 2DREA 5HPZA 1KWKA 2J8GA 1V3IA 1P63A 3A22A 3OZOA 2D24A 4BQ3A 5KZ6A 3I3EA 1WD4A 4UQ9A 2BHZA 9CGTA 4CD8A 1FP8A 5AYBA 4CCDA 1ECEA 4OUJA 3IIRA 1R85A 5EB8A 6CGTA 1G9HA 1GVIA 5HXMA 1XSIA 2WLZA 1R8OA 3RTIB 3BAQA 1QNOA 3FJJA 1UQZA 1FGAA 4JRAA 3H6RA 3TTOA 2ZX6A 4GQQA 2V3EA 1CVSA 4BQ5A 3JUTA 2DSVA 2GDUA 5ABFA 1TFMB 1ISWA 3BMWA 1TWMA 2WKGA 3N9KA 1W1PA 4ZOTA 4LGXA 3FAWA 4ZE5A 2NTDA 1DP0A 5DZUA 1CXKA 4PSPA 3UR8A 3WL0A 1TOOA 1FFQA 4BCEA 1FN0A 1KCLA 2VRQA 4I7IA 2VSAA 4URIA 1G5AA 3VX1A 3AZWA 1CPUA 3SCTA 2WMIA 1TA3B 1QNRA 2G4FA 4IY9A 3QOMA 3WO2A 1OT1A 5I5RA 2E8ZA 3WNOA 3AICA 1HL8A 3WF2A 2DRZA 4AMCA 1NP2A 5BRPA 2VLCA 2X2SA 1BYCA 1O6IA 2YA0A 3WNLA 4UQBA 3M07A 3MV01 1EA9C 2W62A 3IM5A 3VGFA 2DS0A 2AXMA 1UWSA 3HN1A 3BRFA 2UY5A 1XC6A 5F90A 4FLSA 3WINC 3VD7A 3U7BA 3WBEA 2KKIA 3WDJA 3OGRA 3V0AA 3N13A 1ZU8A 3RCNA 1S0DA 4HU8A 1SR4A 4GO9A 3P6JA 4DWSA 1YTOA 2Z48A 1JQZA 4PYSA 4KWUA 5FIPA 2YA2A 3UD8A 4D6HA 1FV2A 1OWQA 3CLWA 3MUY1 4J27A 4AZHA 4F83A 3VSZA 2Y24A 3F5KA 3IM6A 2VMFA 4G9NA 3VEQA 2F2FA 3THCA 4V28A 2DGAA 5E9AA 4A7ZA 3ARSA 4UOQA 1WP6A 4P7RA 5A8QA 3GH7A 1I1WA 3O4BA 1LQ0A 2WWCA 1V6XA 2ESUA 1EXPA 4X0VA 1CECA 4TX8A 1E6QM 1FV3A 3SUWA 3T8SA 3NSXA 2E4TA 1NZKA 3SCUA 2VRKA 1C3FA 1Z32X 1HJXA 2J47A 2WVVB 3GZAA 1WDSA 3WEOA 3A6OA 3DYOA 5I2UA 2CEQA 1MWOA 2WAGA 4Z2KA 4E8DA 3BTAA 5JBFA 1B3VA 1B31A 2E3ZA 4U5IA 3ZJ8A 4P8UA 1PJ9A 4II0A 4C7GA 3AHVA 5DF0A 1A3HA 3AI0A 1JY0A 2AFGA 1JAKA 4HMEA 5TD4A 4DUXA 1VIWA 5M3WA 2QYIB 2D3LA 3VD3A 1HJSA 4M80A 4P0KA 3WY1A 2BXZA 1XD1A 1E6ZA 1W3HA 1UR8A 2HZ9A 3RO8A 3CHCA 2VX4A 4HZ8A 2BY0A 4ZLBB 1DWHM 2VNCA 1W3KA 3S8KA 4HZ7A 1IZKA 5D4YA 5D9PA 3T2PA 3SURA 5F7UA 1LG2A 3GXMA 1S46A 2ZUSA 1E73M 1HJWA 4OBRA 3WFZA 2ZE0A 3TONA 1JF6A 4JFTA 5ABHA 3O9NA 4USPA 1HWNB 4QLLA 2J62A 3FJHA 1Q6DA 1K5UA 5BRQA 1K6AA 4Z9WB 1EQPA 2YDRA 4JZ5A 1VF8A 4I4SA 2G3IA 3NBCA 1EHAA 2VJXA 3VNYA 3WH6A 4X38A 5DSSB 1NUNA 1JT4A 3B9AA 4UZSA 1ONKB 1BYBA 3C9ZA 1GHRA 1ODUA 4PC4A 3OLEA 1OGBA 1D3CA 3D7WB 2WHMA 2BVTA 3AS3A 1S0LA 2X8RA 2Y2WA 4WIWA 5A95A 4K68A 1BGGA 4B9YA 2O9PA 4AZCA 5BXTA 4HPGA 4KBBA 3UETA 2FGFA 4GI9A 1V3LA 4CGTA 1JZ2A 3NYDA 3WMUA 4X3AA 1CXEA 4CUCA 2VR4A 3RSJA 2VOTA 1GQKA 2F61A 3HMYA 4ACYA 5I1BA 5DT5A 2Y9XE 4QKSA 21BIA 4ZXLA 3U5UA 1QI3A 4IPLA 1RY7A 3EDJA 2GSJA 5JBDA 2OWWA 5IFPA 6I1BA 1NOWA 3SCVA 4FLRA 4CVWA 3ZR5A 1TVNA 5CG0A 2G3NA 3ZT7A 2WHKA 2YDSA 1AMYA 4HOZA 3ZXGA 1O7AA 4LO8B 2VZUA 4HA3A 4PEEA 2P23A 1Q1UA 4IPNB 3UCQA 4AD2A 5F8SA 2VUAA 3IM7A 1VRXA 3L4UA 1UZ1A 3AXHA 4XX6A 2WC3A 1M01A 2YUGA 4EEEB 1GNXA 1JYVA 1M2TB 4N0RA 3VIOA 1SR0A 3BCDA 2DT3A 2WWDA 4G1RA 1LL7A 5HDRA 1MW0A 3DYPA 1CTNA 4JIEA 2E9MA 1YBIA 2D1ZA 4DEPA 1ZS2A 1DZDA 4W86A 3FUQA 4JPZA 4IY8A 2YL6A 2IXVA 4D6DA 2CERA 4H8UA 3BAGA 4PRWA 4XKIA 2DRYA 2NM1A 2CCRA 1BG9A 2FFVA 2VU9A 1PZ3A 3L4XA 5A94A 4M56A 3BA5A 2V5CA 2V3FA 5FNXA 1WB0A 3UJ4A 2VX5A 3WF3A 2FH8A 4B16A 4PMUA 5I77A 4B3LA 4OWJA 2CESA 4W84A 3ARTA 1AVXB 2X05A 2WLYA 3VDAA 2A3AA 1QHOA 2J77A 4HTYA 5I6SA 2XWDA 4I4PA 1G1YA 3WO4A 1EYLA 4H9WA 1AFCA 1VFFA 3TA9A 3WNKA 1HP4A 5A6BD 2DQXA 2VZSA 3TOPA 3SUVA 4AZIA 1HT6A 2W4XA 5CXPA 4HOWA 2IUZA 4Q9PA 1EOMA 4D1IA 3BAIA 4JCMA 1K9TA 1TTUA 1RPKA 2X2TA 4BQ2A 1Y7VA 1B1YA 2BHYA 1PX3A 1J18A 3VGHA 3WH9A 4CD6A 1GCYA 3WSUA 1SMAA 3CZ8A 3VIGA 3F62B 3N7KA 1UWQA 4TVCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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