1ISXA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with xylotriose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 168
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1isxA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1isxA02
1B30A 3MMDA 1HWNB 5HPZA 4J3UA 1QNOA 3T8SA 2WCSA 4JKQA 1EVTA 3FY1A 3EDKA 5M5DA 1JLYA 4TX8A 4GZEA 4ZBVB 2GUYA 5DUYA 3GNRA 2D43A 3WO3A 3GXMA 4N0RA 3ZSSA 4PSPA 2J75A 3K46A 2YL5A 1UR2A 4J3XA 3DYMA 2QPSA 1VBUA 2WYSA 1VF8A 1E3ZA 3HMCA 4JKKA 3SCSA 3W29A 3ARXA 4E4PA 6TAAA 2OWWA 2FHFA 4ZLBB 3NJ5A 5JBDA 1XG6A 4DENA 1NH6A 1UHVA 1UR0A 4TTGA 1UPSA 2ZXAA 1B3ZA 3A4WA 3AQUA 5A6KA 2QN4A 4W93A 3VX0A 3SCNA 3IK2A 2VUYA 4EANA 2C0HA 3KWXA 3O4DA 1K9FA 1QXMA 3CRIA 4JAWA 2YBTA 2X8RA 1MWOA 1ISZA 3BADA 1EIBA 4L4PA 1VBRA 2OYMA 1V0MA 4YN5A 3BAVA 3EYPA 2XIIA 4LPCA 4PUEA 3W53A 2YUGA 2FGFA 3FJBA 5GQBA 2OWCA 1EYLA 2IXUA 3EMQA 3VGHA 1IRAX 1LQ0A 4JKLA 1H1NA 1GHRA 2DRZA 3OBTA 3I3BA 5FZUA 1HL8A 5D61A 1WKYA 4CD5A 1FFRA 1BYDA 1QHOA 2CYGA 3B9EA 4H04A 3CRGA 3H6RB 1KR0A 3CA6A 1J0YA 2BY3A 1AVAC 3WO4A 1ISWA 2Q3NB 2XYLA 4D6EA 2VX4A 1JYNA 2YLLA 1W1VA 3VD7A 4Z9WB 2DSVA 1Z0HA 3U57A 5I23A 3EF2A 1G0CA 1G9HA 1TA3A 4G9MA 3GH7A 4MB1A 5C70A 4UOJA 1SZ6B 4CGTA 3CHCA 1BA7A 3N7LA 2XVGA 2DGAA 2P39A 3AMGA 4ZXOA 1YYNA 3BAHA 1CYGA 1DLLA 1GPFA 2DT0A 1PEZA 3G6LA 3NCOA 1QI4A 5GPRA 5BWFA 2WBKA 3A22A 1JT4A 1CZ1A 4ZA3B 3UJ0A 3PZVA 4EKXB 3BA7A 1PUUB 2W62A 2ERMA 2DDXA 1L0PA 1QW8A 1DQOA 1EH9A 4EB2B 1XSKA 4AZGA 1XCWA 2WAGA 4I6IA 2DIEA 1W3FA 4GOVA 1DIWA 4LO1A 2ZR1B 4L4HA 2YA2A 1GVIA 1G01A 3AHYA 5B2HA 4OJYA 1BASA 4Z2HA 1VEOA 3T0DA 2E0PA 1GJWA 1K6AA 2D0GA 2Z48A 4WBCA 3OG2A 3IM7A 1WDRA 2VX5A 3ZMRA 3VKKA 4IZEA 2JE8A 4PMXA 1TWEA 4QBCA 2NM1A 4PMZA 4HOXA 3A4AA 2D24A 2NVHA 1PX8A 4OBRA 4E2OA 3UETA 2GK1A 4DUWA 1OCQA 1E15A 3BA5A 2WM0A 3O49A 4MB4A 1JZ8A 3L4VA 5I1BA 3IANA 5CPQA 1DEDA 2BY2A 1GW1A 3WD4A 3AJ6A 4P0LA 1CGUA 2ZXBA 2CERA 1Q04A 1UH2A 1CXLA 4D6DA 3MKKA 1WAWA 1GJUA 1CGXA 2XTKA 1LL4A 1NP2A 5A2AA 1E6PA 3OLIA 3VX1A 2VO5A 3VIHA 3FJAA 1VFMA 2VQTA 1E55A 2XSAA 1PX3A 5HNNA 3VGGA 2PWGA 1PZ2A 3AISA 3OGVA 4PMUA 5I77A 1LL7A 6I1BA 4I4SA 1JYXA 4RE2A 1A47A 1HF6A 4V28A 2LIEA 1WNOA 4JFUA 1Z4SA 5DSSB 4MB5A 3VINA 4OZOA 1RG8A 4P8WA 3SUVA 4PSRA 1GORA 1CNVA 2WMHA 5KZ6A 3CUHA 4LQ1A 3WSUA 1MYRA 2WC3A 4OW4A 1IZKA 1GCYA 2WB5A 1UH3A 2K4AB 4NRRA 4A3HA 2EO7A 1W9PA 5HPCA 5DFAA 1UG6A 5G00A 2DT2A 1PPIA 1FWVA 2G41A 1BF2A 4W85A 3UEQA 3K8LA 3U7VA 4HPHA 3THDA 4HTYA 1GOQA 1XV8A 3WDPP 5KEZA 5FNWA 2MLLB 4KGJA 3HU7A 3BSGA 5A3HA 4FLOA 4AEFA 4ZKTB 3ALFA 3W38A 3EMZA 4MTVA 1UD6A 2DIJA 1QW9A 1FHLA 1V03A 1HWPB 3K4AA 3PZIA 1KB3A 4B9ZA 3K4DA 5EB8A 2GFTA 3ILAA 1QHPA 4UFMA 3CUFA 1DFCA 2GDVA 4I3NA 1KCLA 2ZX7A 1OGSA 1M01A 1H11A 5A6LA 1W9XA 4W8BA 1OT1A 3IAQA 2PWHA 1I1BA 4W5ZA 4B3KA 2CHNA 4W7UA 5C8BB 1E0XA 2E9BA 5A6MA 4BA0A 2WANA 1CPUA 3FW6A 3AZRA 5D9MA 4HP5A 4D6JA 1LLOA 2GDUA 3N1AA 4AN6A 4NRSA 2XM1A 4QCFA 3IAGC 4UFHA 1NWTA 1HIBA 4AZIA 4FMVA 5AC5A 2JEQA 2V3FA 2WHMA 3FJKA 2ZUWA 4D8HA 3KL0A 4XB3A 1YQ2A 3GTNA 2NSXA 3AHTA 3WNNA 3BA4A 3C9ZA 1JAKA 4BQ5A 3H6QA 3ZC8A 2WVTA 3TTOA 5D9OA 4F79A 3CZEA 4J27A 3K8KA 1EQCA 1LG2A 2DT1A 2XOAA 5FOOA 2WCAA 1BFGA 2ZUVA 3L4WA 5F8WA 1OBAA 1CTNA 3E1F1 3ARSA 3U7BA 4UFIA 4CU7A 4QALA 4JHOA 3K1XA 1TG7A 3FAXA 5FCZA 2ZX5A 4C7GA 2W67A 3AJ7A 1CXFA 2X09A 2YIHA 2EPNA 3RIKA 1AQHA 5CPTA 1FWUA 3FFZA 1E72M 1KR1A 2OSXA 3ZR5A 1UA3A 1BAGA 41BIA 3WUBA 2VZUA 3BRDA 3P53A 5F8SA 2AOSA 1JZ7A 4YPJA 1H41A 2VVNA 3FJFA 3W0KA 4E8DA 1BYCA 3H6RA 1OIFA 1RD6A 4R27A 3MMWA 3VMOA 1WZMA 5JBFA 1IILA 4CVUA 2J4GA 3W26A 4LX4A 3GDBA 1US3A 3PZUA 3PZGA 1EDQA 4AXNA 1OD0A 4W84A 1EGZA 1H3GA 2VURA 4PMYA 4UCFA 3L4TA 1UD8A 1PBGA 3AMKA 5HBFA 4PBGA 1D2KA 4OWLA 4GAIA 1M7XA 3QYDA 1DHKA 1Q6FA 3MUAA 1IV8A 2RQ9A 3W24A 1N4KA 2VX7A 3CUIA 4RE4A 4D6FA 4A7YA 3VD4A 2VZOA 4EKJA 4HMCA 3F62B 1JFXA 2QMJA 1E71M 4ISQA 1VENA 4H8HA 1IT0A 1TOOA 1FP8A 1XYZA 2AQZA 3T2QA 2Z49A 4DCKC 4H41A 2ESUA 1IRPA 1KNMA 3UCQA 1Q6DA 3TONA 2VSAA 1DWAM 2EBNA 4U5KA 5DVHA 3PZTA 7TAAA 2FFVA 3JRRA 1HCDA 1FN0A 1BPLB 3ZC9A 2F8XC 4KRTA 1FGAA 3PG0A 1YHTA 3N13A 2AXMA 1XCXA 1XC6A 3HSMA 1JI2A 4TUFA 5BYWA 2E8ZA 1ILR1 3AS3A 2VT0A 3B8SA 2WW5A 4U33A 3WINA 1HJSA 3VO0A 1VCLA 3MUZ1 2WK2A 4IPNB 2QV4A 3AFBA 5CGTA 3WY1A 4WSKA 2C7FA 4MJ4A 1W3HA 4K68A 4AD3A 2MIBA 5LA1A 1W3LA 4M80A 3W6MA 3WNPA 3QR5A 1WDSA 1E43A 3L4UA 3VIGA 3WUFA 4JFTA 2VXTI 1QQLA 3D5HA 1PZZA 3GNOA 2FDMA 2XSBA 2G3JA 4EK7A 1OGGA 4PRWA 1C93A 4AIOA 3ARWA 1XGZA 3O6AA 4ENDA 5FD0A 1FH7A 4LO3A 5A1AA 3VNZA 3N12A 2X2SA 4B9YA 2W92A 1W3JA 1HL9A 1EHAA 2VI0A 1CEOA 1QNSA 3MU7A 4AYSA 2VCCA 4JCMA 2PF0A 2VLCA 3PHZA 2EPMX 4XV0A 2QPUA 4USPA 2HW9A 1E1EA 4I4XA 1V3IA 5CG0A 2Q9XA 1OD8A 4QBVA 2VC9A 3WQ4A 1UWTA 4LXFA 2WRYA 3LLPA 2BV9A 4I1BA 1D3CA 2JF6A 2BVYA 4AW7A 5AC4A 1M16A 2HWAA 1CWYA 1TFVA 4Q9GA 2WMKA 1DWJM 3WBEA 3ZJ8A 5I3DA 1UKSA 3WUGA 1MW0A 1OM0A 2J25A 1B3YA 1UQZA 4W7WA 4A3YA 1JT7A 3WUEA 4M8UA 1N82A 1MFVA 1TUXA 3OGRA 4AIUA 2FH8A 4D6IA 2B31A 4D6CA 4U2YA 3FAWA 4H7VA 3F5LA 5AY7A 3V79C 1ISVA 4I7IA 1PIGA 4UFKA 3SURA 1NARA 2GJPA 2KI4A 1UKOA 5A95A 2E4TA 3TC2A 3A3HA 3CHEA 1EPWA 3BAQA 4ZFYB 4CCDA 2V5DA 4AIEA 1E4IA 4YHEA 1KCKA 1DWIM 1XYFA 5BP5A 1E9LA 4MNJA 3CZ8A 1MXGA 1R85A 1WDQA 31BIA 3OJVA 1KBBA 1A8DA 3BAWA 5E70A 4J2YA 3WKZA 3VSZA 4HOZA 5LYRA 1UR9A 2K8RA 3ZOAA 3CZLA 1NOWA 1AVUA 3LPGA 4P7NA 2XWDA 5ECUA 2O9PA 4OWJA 1HKNA 3W37A 1J11A 1OT2A 3A21A 1OINA 2FHCA 2WHLA 4GP0A 4XZBA 4ATWA 7CGTA 2CCRA 1HKKA 3HALA 2ZUUA 1WD3A 4W7VA 4UFJA 1K9TA 3M46A 4PEEA 1PC8B 5HXMA 4M1RA 2WBCA 1HP4A 5GNYA 2HWMA 5ABFB 5I79A 4KWUA 4U2ZA 4WIWA 2CBUA 4HJJA 2DPEA 3IAPA 2XM2A 1Q6EA 3OB8A 5BROA 3SCUA 4DWSB 4AWEA 1E73M 5CSYA 3UESA 3GZAA 4UQCA 1UKPA 3RSJA 1E6XM 3OGFA 1JNDA 1E0OA 3APGA 2IUZA 2W61A 3VGBA 1LWHA 3MANA 1BHGA 2JEPA 2MANA 2WSPA 1DZCA 3PTQA 2P23A 1E4NA 3AJ5A 2XFYA 3VOCA 1V0NA 4MB3A 4JKXB 2DT3A 4BQ4A 1ZS2A 2KLLA 1ABRB 3EBVA 1V3MA 3WF4A 3CH9A 2W91A 1FMMS 3F4VA 1GQKA 3T2OA 2UY3A 5ABEA 1KWKA 1DWHM 4AD2A 2F61A 2OYKA 3BAGA 3CIVA 3THCA 1GGPB 3PZMA 2UY5A 3AMCA 2WWDA 4LO2A 3N11A 1U33A 1J0KA 1UZ1A 2J7FA 1S0FA 3WDQA 1JD7A 1DTUA 3CO4A 4Z2IA 2HZ9A 3WNKA 5E6YA 2ZXQA 3E8LC 2Y2WA 1R7AA 3FHQA 2WZHA 3T2PA 3AI0A 1ODUA 3VIOA 3NBCA 5EFFA 3NSNA 1NWUA 2X0HA 3VUPA 3AH4A 4I2SA 1AF9A 4HZ6A 1TVPA 1KGUA 4Y7EA 5BXPA 2HISA 4U3AA 1PIFA 3FJCA 2L5XA 1VFOA 1BG9A 4I37A 5IHSA 3WNMA 3RM8A 5F90A 1B3VA 3AZVA 4EEEB 3OJ2A 4P8VA 1GUVA 2Z1SA 1O7AA 2KKIA 1M2TB 1MW2A 3WNOA 3VUOA 4KC3A 3RMXA 1UD2A 1C8QA 4MDOA 3S8KA 4X9YA 1AQ0A 2JFEX 3AXIA 5EBAA 3AKHA 3MV01 1CLVA 3EDFA 2IWTB 1R86A 1VRXA 4AZ6A 3WDIA 2BHYA 4CD6A 4P7QA 3T09A 5ABGA 5DO8A 2XFFA 1JF6A 3WD1A 3OGSA 8CGTA 5BQUA 1X6LA 4W8AA 3HJEA 3FJJA 5A6BD 2D7RA 4CU8A 3CGTA 1J0JA 5A8QA 4PMOA 3WD0A 1BFCA 2ZWYA 1HJQA 1I1XA 5DT7A 2J3PA 1HNYA 2CETA 3WO2A 2VMFA 3AIWA 2UY2A 4W89A 3KMVA 1UD3A 4YHGA 4WSJA 1BTCA 4AD0A 4GZJA 4G1RA 2ZE0A 4MAZA 2XVLA 1C8XA 4P8UA 1QNPA 1G9CA 4PTMA 1HWMB 1ZJAA 3WF1A 5D8WA 3WINC 3I3DA 1UKQA 3IIRA 1OB0A 1FH8A 3AOFA 4Q91A 3KZSA 3NSMA 4JL1A 1ZL1A 4M82A 1G9DA 4UQEA 1KQYA 3POKA 1NOFA 1M04A 4CD4A 3WEMA 4F9JA 3HMYA 1IOBA 4X3AA 3V0BB 1LJYA 1R8LA 4UOQA 1AFCA 2VVSA 4OEEA 4QD2B 1E6ZA 2DH2A 1V0LA 2J78A 3RM4A 4UQ9A 1SMAA 2AFGA 4W86A 5CGMA 2XWEA 3NBNA 1L2HA 5D4YA 1EV2A 4JFSA 4AZCB 3VMPA 1II4A 3SUTA 5A8OA 7A3HA 3WNLA 3MSDA 3WFZA 1C8YA 1R87A 4LO3C 2G8ZA 3CMJA 1JT3A 3FJDA 1S0GA 1MW1A 4DWSD 3VTRA 1QBBA 5DF0A 2JIEA 3BAKA 2J8FA 1Q03A 3QR3A 5EMYA 4KRUA 1HKMA 5FZZA 3N9KA 3BX1C 5A6BA 4J2KA 3ZX7A 1E4LA 1KWGA 2FO1A 1UZ4A 3MALA 1JXJA 5EC5A 4M29A 3SCPA 4HA4A 3DECA 1CXEA 1V3KA 2KI6B 1CLXA 4ACZB 4CKQA 1JZ4A 4BQ2A 4KGLA 2C8NA 1JQZA 1H5VA 1IZJA 3N15A 3F5JA 4JQ0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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