1ISZA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with galactose
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 160
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1iszA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1iszA02
2O9TA 2J78A 2OWXA 4DUVA 1B3ZA 1AQMA 1V0MA 2IXVA 3NUKA 5CLWA 3QHMA 2NYYA 1K9FA 4OOZA 4PMQA 3SUUA 4ATWA 1UR8A 2X8RA 2DPEA 4JFSA 4JZ5A 3VM5A 4I4OA 1E0OA 2WM0A 1PZZA 4L4OA 1HWMB 1CENA 4D6EA 3WNOA 4X9YA 2WHLA 2ESUA 1UOKA 2YA1A 2GZBA 1OB0A 1HL8A 4TX6A 3ECQA 3NSNA 4GINA 1Z32X 5BXSA 3EDEA 3MUZ1 1EXPA 1UD3A 3GBDA 1BVNP 2DIJA 1BG4A 1R8LA 3OJVA 2G41A 2Z1KA 1XSIA 1GOQA 4TUFA 2ZUNA 1UWQA 1Q6GA 4W93A 1EHAA 1SMAA 1VIWA 5ABFA 4LO3A 1GPFA 3ZO9A 3BCDA 2HWMA 2W5FA 2XG9A 3WINC 3ZC9A 4Q22A 4PMXA 4I4VA 2YBUA 1CIUA 4Z2GA 2WHKA 4JFUA 1HT6A 5JUVA 1N4KA 3CGTA 1K5UA 1KQZA 4L4IA 2XVKA 1TFMB 1PZ2A 1UR4A 3AHVA 3B8SA 4IUGA 4D6CA 1QBBA 4F79A 3NDZA 1R7OA 1UYQA 4A3HA 3NJ5A 1WO2A 2JEQA 5E0FA 3W81A 1NUNA 2W66A 4BCEA 1C7SA 2K8RA 3ALGA 4AMCA 2QYIB 3AXIA 4TLPA 4I3NA 2OWWA 4HMDA 3WD2A 3FJ9A 3AYRA 3VIKA 3VD4A 4OKDA 4GAFA 4ZOTA 1U33A 2VX7A 4CVWA 3VOCA 2KI4A 1B30A 2D20A 1UH4A 1EPWA 1DZDA 2VMFA 3CTTA 4EFPA 1XC6A 3WNNA 5G00A 3CRIA 5DO8A 3SUVA 3N12A 4IQPA 2AAIB 4ZXLA 4JKLA 3BMVA 3CZGA 3IANA 1E3ZA 4MJ4A 2F8QA 4QBVA 4AWEA 3V79C 3UJ4A 3P6IA 1E6XM 1QI4A 1C8QA 4OUJA 2UY5A 2V5DA 3BMWA 2VSEA 1ITBA 4CVUA 4GQQA 1HX0A 2O9PA 2DDXA 1NWRA 2DH3A 2DIEA 1GQJA 3CBWA 4FGFA 4OWLA 1QBAA 3O2LA 5A6AA 3L4WA 1UR9A 2AAAA 6A3HA 1E4NA 4JFTA 1BA7A 1CZ1A 2DT2A 2XGIA 2WCAA 4JL1A 3WKZA 3SNVA 3ARPA 1JZ5A 5F7UA 3EMQA 4HA3A 3EBVA 2EBNA 3NDYA 1E4IA 1JXKA 1K9TA 4MNKA 3B9EA 4HOWA 3WO4A 2TAAA 3T08A 4HU0A 1AQHA 4XFSA 2VO5A 1G0CA 2CBVA 5CZKA 2QMKA 2XUCA 3BAKA 3CUHA 3OLDA 4EFRA 3HSMA 1G9AA 2DH2A 3FNDA 3VNZA 1GZJA 3VILA 1PJ9A 2OYMA 4PTXA 2WLZA 3A4AA 3PBGA 1CGUA 1XH0A 3PG0A 5BP5A 1KR0A 5FL0A 3W0KA 3N18A 1J0KA 1TE1A 4UFJA 4AD4A 3TC2A 4P7RA 4CD8A 1HKNA 1W32A 3H6SE 1EDQA 4ZE4A 2VCCA 4X37A 1B31A 8A3HA 4HPGA 1NP2A 4HZ6A 2VNCA 3AH2A 2QN4A 1KQYA 4KMQA 5IHRA 1VJSA 2YL9A 4DWSD 1TIEA 2YDRA 4B9YA 5GQBA 4R6UB 4U3AA 2ERMA 2FGFA 3BXWA 3N1AA 1BYCA 4CU6A 1FGAA 1XCXA 2J7FA 4CKQA 3T0DA 3QOMA 4OBRA 2VR4A 4H2CA 4J2KA 1W3HA 4XV0A 3DHUA 2X0YA 2DSWA 3FJJA 2FHFA 4GXPA 3ZT5A 2DRYA 1CXLA 1B9ZA 4CCCA 1KWGA 3GXIA 2GDUA 4WF7A 3SCQA 3VSZA 4AN7B 1KXQA 2ZX5A 3RJYA 4H7VA 5A6SA 3CLWA 1ZBCA 3WMSA 1BQCA 1XH2A 2GFTA 1C93A 4CN6A 2VZSA 1VF8A 5BXTA 4MB5A 1LL6A 4N42A 3AZRA 4JIEA 1MQPA 1GOKA 4XUYA 5HPZA 4Q9GA 5FIPA 3AIQA 4EKJA 1DFCA 2EPKX 3CUJA 4AIOA 4GIAA 2QF8A 3AKFA 1PBGA 3RILA 5LYRA 1WZLA 4CD5A 4UOZA 2B31A 3B9UA 5BQUA 1UHVA 1IV8A 3SCWA 1ZS2A 4PBGA 3SCRA 1QPKA 3N7JA 1KB3A 5GPRA 3N0KA 3GH4A 1JT3A 3WNMA 3UJ0A 4CD7A 3T2QA 4LO3C 1FP9A 3V0BB 3VX0A 2VRQA 3ZJ6A 4W89A 4OEFA 3DYOA 2WVVB 4DUWA 2D23A 3VIMA 3CUIA 3VIGA 1JZ3A 1R85A 2J75A 1J0SA 1JZ7A 3U5UA 3S8KA 5D63A 1JFXA 1JGIA 3O5WB 4F83A 3LPPA 2F8XC 2J7GA 1MD6A 3CH9A 1V02E 2E8YA 4AIEA 2Y9FA 3EDFA 4GI9A 4E8DA 3VDAA 3VM7A 2A3AA 1XSKA 3F1RA 2XGBA 3AXHA 1C91A 3AS2A 5EB8A 1UD4A 1V3KA 3GNPA 5M17A 2J74A 4WJXA 3AYSA 1QNQA 3AS0A 3CZEA 2XM2A 3QHNA 5GAQA 2X2SA 4I4XA 2DSKA 3L2MA 1AFCA 1GORA 3BRDA 4H8VA 5CJ5A 3WNPA 1ZJAA 2E9BA 3FY1A 4GP3A 4DEPA 5DSSB 1LL4A 5CPSA 1BFNA 4MDOA 4UNIA 1U30A 1ISWA 1OCQA 4W86A 4YHEA 3GM8A 2D3NA 4M81A 1CXIA 4G6JA 3K1DA 1S0DA 5M03A 2E9LA 4OW4A 2YDSA 4W5ZA 1KWKA 3NBDA 4HA2A 1HKMA 1BG9A 3NBCA 1F4HA 4NRRA 2PWHA 4W8AA 3LPOA 1GONA 1H3GA 1BLAA 1FFQA 3SCTA 2JIWA 3WEMA 2ZIDA 4TVDA 1C90A 3AQUA 4HA1A 4LYRA 4QD2B 1KBKA 5EMYA 2G4FA 1SR4A 4BQ3A 1CTNA 3EMCA 5DT5A 4Z8SB 2VUYA 3N15A 4P8VA 2BHUA 2VX5A 3D7WB 4P0JA 2GVYA 3PZIA 4YPJA 5FKYA 1C8XA 4DM1A 1W9DM 1GQIA 3CHEA 4JCMA 3FW6A 1EHNA 3BAQA 3EDJA 3VIIA 4X38A 5E6ZA 3ARVA 1RMLA 1E1FA 4ZFYB 4UCFA 4BQ5A 3BRGC 1BGGA 5B2HA 3THCA 3WA1A 1XD1A 3JUTA 5A6KA 3EMZA 2GJRA 1AVUA 3G6MA 1VFFA 4WKFA 1ISZA 4ZKTB 4ZGRB 3OBRA 1WDRA 3AMGA 4I4QA 2WBCA 3N13A 2Q9XA 5BP5C 2UY3A 2WMJA 3PZQA 2E4TA 4ISRA 1DP0A 2WZIA 3AZSA 1CYGA 3T09A 1RD6A 1C92A 3FAXA 4QC4A 1GGPB 1HVQA 3LPGA 3PUBA 1DEDA 1MW0A 1M2TB 3VGEA 1H5VA 2J77A 1UKQA 3CZKA 2GO2A 1YQ2A 1WBCA 5DZUA 1JNEA 1LJYA 5F90A 1XYZA 3AHXA 3UR8A 3W27A 2VZVA 4X0NA 1TP0A 3K4DA 5A2CA 2RG9B 3N17A 2WVUA 1JF6A 1JIBA 4B15A 1QHZA 3I2XA 3QR3A 4PUDA 1EOMA 4UZUA 3AICA 5JIWA 5M5DA 3UD8A 1EQPA 3H6RA 4JL2A 3OB8A 2BVDA 2FGZA 5FCZA 3O6AA 3A22A 2WKGA 4W8BA 3RMYA 4OOUA 4MB4A 1H49A 3L4YA 3SCUA 2Y9XE 3DYMA 4FMVA 1JZ8A 3BC9A 1TR1A 4D6HA 3VX1A 3POHA 4JRAA 1B3XA 4P7QA 1UZ1A 3WUEA 3ZC8A 4I96A 2D24A 4Z2HA 2K4AB 1J0YA 2XVPA 1CWYA 3E1F1 4PC4A 2WPGA 1JZ6A 4W7WA 1E6SM 1B90A 3J7HA 1QNRA 4NF7A 1XSJA 3TTSA 4IPNB 3CZ8A 2VJXA 5BQUC 1O6IA 2D0FA 4HP5A 3WUFA 1D0HA 3FJCA 4LO0A 2VU9A 1YXWA 4USPA 5D62A 3WNLA 2V3DA 1WZMA 2MC2A 5BXPA 3VU2A 3NJ3A 2YOCA 1MQQA 1UA7A 3M6DA 4LYPA 6TAAA 3N7MA 3HMYA 5ABFB 2YIHA 1FA2A 1B3YA 4KC3A 1FWUA 1BGAA 3CUGA 2EPNA 1KXTA 3HALA 3AS1A 1E5JA 3K8KA 2ZUSA 3BAWA 4QLLA 4LXFA 3VMPA 2EPLX 1HJVA 2WVSA 5I2UA 1EA9C 2BS9A 4UFHA 4B16A 2XSAA 5D9PA 1A8DA 2O9RA 2XVGA 3O9NA 4U2YA 4IY8A 5M3WA 1UPSA 1DTUA 3MALA 2VURA 3ARZA 2WMKA 1W1YA 5A6JA 2O92A 4I4UA 3FJHA 3BAXA 4JKMA 1JI1A 1G9CA 3BB2A 4URIA 4CUCA 5IFPA 2G3NA 4ATDA 2DT3A 1R86A 4LO2A 4HMEA 4FLOA 5I23A 4HMCA 3IJ7A 3SUSA 3M07A 1FHDA 2BY1A 1E5NA 4FF5A 3O4AA 1EGZA 1K9DA 3OBAA 5BXRA 4CU8A 2WXDM 2WMIA 3ARYA 3SIMA 2UWFA 1MW2A 1V3JA 4IYBA 3SUWA 3GDBA 2WCGA 2YBTA 3PZUA 1VBRA 2D3LA 4PMDA 4BZYA 4F8XA 1X6LA 1B1YA 4D6FA 3EDDA 3PTMA 3RM8A 4AD0A 3PN8A 3ARWA 5A69A 3CA0A 4HPHA 3PZOA 5E70A 5JMCA 5I78A 3L4TA 4Q91A 2VXRA 1I75A 2FDBM 1K9EA 1WB0A 5EC5A 3AROA 2DSVA 1ITXA 1SR4C 3CRGA 3OGFA 1W9VA 4UOQA 3GXDA 3N7KA 2GJPA 3AMKA 5A8PA 1KR1A 2WSPA 2XSBA 1PX3A 5BOWA 3BGAA 3WL0A 4NZCA 4DM2A 4UFLA 4M1RA 1ILR1 1W9PA 2XWEA 1K5VA 2AFGA 2WZEA 5I79A 2X09A 1CXEA 1G9HA 4YHGA 5IDIA 4UZSA 1BARA 3HJEA 1UKTA 4ATLA 4QKRA 5EFDA 2IWTB 3AJ7A 2A3EA 3KL0A 5A8NA 1PIFA 1WNOA 2KH2A 1Z2VA 2J7EA 1W3KA 1FWVA 1DHKA 5A1AA 2VZOA 4LO8B 3IK2A 3P53A 2Y4SA 1QHPA 2WBKA 3ZQ9A 3BCFA 4PCSA 2IUZA 3GXMA 3VPLA 3WF2A 3VIPA 2DSZA 3Q7XA 3WO3A 4J3UA 4HOXA 5I0DA 2VCBA 1PUUB 1ZJBA 5FD0A 3NYDA 1FH7A 3OGVA 4AZBA 2YLAA 1MWOA 2DT1A 3C9ZA 3V0AA 1E71M 5ABHA 1BTCA 2J3PA 2MLLB 4IY9A 2G3MA 3UD7A 1EYLA 1UWIA 1JY0A 3WDHA 3R4SA 2XJ7A 3GYCA 5A6BA 5A6LA 3WEZA 4KEIA 3PZGA 1D3CA 3UG4A 1CXHA 3HMCA 3MUAA 3OGRA 3CMGA 1TMQA 1DWHM 4PMOA 2P23A 3VKKA 4ENDA 2YJQA 1H11A 3ARQA 1EO7A 4GAIA 4M8UA 4PMUA 3W26A 3OLEA 3WUBA 3B9AA 4FK9A 1CNVA 1BYDA 1I1XA 2RSTA 4I37A 3ZOAA 3NCOA 4I4PA 1QI0A 2WANA 2FDMA 4C7DA 2ZX7A 3VMNA 2ZE0A 1DQOA 2CBUA 2NZ9A 3APGA 3FJDA 2CKSA 2JIEA 2DRZA 4LO7C 3MANA 3ARSA 3WDJA 2BHYA 1XCWA 5DEZA 5ABEA 2J47A 3I29B 1B0IA 2J7DA 4JKKA 4D1IA 3UG3A 1RH9A 4MAVA 3VIOA 3AKGA 4P8XA 1JT7A 4J7RA 2Y9WC 3ARTA 2BFHA 2Y5EA 4HOZA 2GUYA 3RM4A 2EPMX 1SR0A 4QD2C 2YDQA 1YF8B 3SCSA 4LO0C 3AIRA 2ZX9A 1CPUA 2EQDA 4PUEA 1GUVA 2WK2A 2OSWA 3THDA 3KE0A 3NIYA 1HKIA 3SURA 5DF0A 4QALA 4MAZA 1ISXA 1EDTA 1UWTA 5EG6C 1OIMA 2ZUUA 3CPUA 2WYSA 4TX8A 4AIUA 3MKKA 4W85A 5A94A 1IT0A 1BLDA 3BAHA 2YA0A 4IISA 1WE5A 3OZOA 3K1XA 2KLLA 2J7CA 2PBOA 2Q8XA 2WKLA 4NSBA 2CYGA 1GHRA 4W88A 1EVTA 1G9DA 4QAWA 3VVGA 1ZBKA 3NSMA 4J27A 2VC9A 3IM7A 4IHZA 3ZR6A 2QHAA 3F4VA 5IFTA 4HJJA 2C8NA 4EB2B 1JD7A 1NWUA 4MPKA 2KKIA 2J4GA 3CQAA 3TTOA 4E8CA 2JE8A 3AI0A 5DFAA 3FGMA 3CA3A 4LO2C 1SFSA 3BLKA 2DS0A 4WLCA 4QLJA 4GZJA 3OJ2A 2P39A 4JFWA 5AC4A 3BAJA 3KEHA 4AZ6A 3BAOA 1A3HA 5E6YA 3GH7A 4CU7A 1TWEA 3WL1A 3CU1B 4I6IA 2L5XA 4QBCA 3VSFA 4KRTA 4WSKA 3VGHA 1OINA 1J0IA 2AXMA 4EKXB 3P6JA 3CUFA 1V6UA 3S8JA 1IOBA 1GOMA 3WDIA 4M80A 4TTGA 3Q7WA 4D71A 1UKSA 3WDQA 3N11A 4KRUA 4XB3A 5BRQA 3ZSTA 1JTCA 3VTRA 5EHAA 4PMZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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