1V6UA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 2(2)-alpha-l-arabinofuranosyl-xylobiose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
total genus 168
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6uA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6uA02
4AZCB 1GCYA 3ARPA 3AHYA 2J7HA 4PSRA 2YUGA 1C7SA 3RTJB 1BVNP 2XM2A 1Q03A 1EO5A 1W2PA 2WHLA 1UWQA 1MD6A 1J0ZA 4Q22A 3GNOA 4ZLBB 2J25A 4Z2JA 5I1BA 5A8NA 1S0BA 4ZXOA 1EH9A 4Z8SB 3BCDA 1Q04A 4KMQA 1W9PA 2X09A 1UUQA 1OD0A 3PZNA 1B90A 3HU7A 1E6QM 3CBWA 3WNOA 2DT1A 4EFQA 3IJ8A 1QW8A 1B3VA 5D4YA 1NARA 1IRAX 2CBJA 1JY0A 4PEEA 1WZMA 5HXMA 4C7GA 4I4RA 1B9ZA 4LO1C 2O9RA 1P6WA 1OM0A 3FJ9A 3WUBA 5AC4A 4ZFWB 2QV4A 4KC3A 2O9TA 2NM1A 1V03A 1C8XA 1OGGA 2X0HA 3I3DA 3OGVA 1UZ1A 3AHXA 3N13A 2WWCA 3MMDA 2ZUWA 3BADA 1UD5A 3ALGA 2VUYA 3W81A 1QVBA 2FGFA 4JKLA 4KWUA 4OUJA 3I3BA 1K5UA 3AXXA 2VUAA 2BVTA 2AQZA 2VU9A 4MDPA 1L8NA 3NCOA 1VBUA 3UR7A 4ACZA 4CN1A 3SCUA 2A3EA 1UWIA 3HSMA 2F61A 3ZQ9A 3CPUA 4AEFA 1V3MA 2WLYA 5E09A 1N4KA 1MW3A 3WDPP 3N04A 4IUGA 4AD0A 1H11A 2VR4A 1UD6A 4KRTA 2DT2A 5JUVA 4L4IA 3NJ5A 2V3FA 2WAGA 2L5XA 3VIMA 1V3IA 2JF7A 1BSIA 1V08A 1L2HA 1W3JA 3VVGA 2QMKA 2ZUNA 1BF2A 1B3ZA 2FH6A 2WC7A 1H49A 1W9XA 2OYMA 2GZBA 4U2ZA 3SCWA 3S8KA 1SR4C 1R8LA 1E70M 4M80A 5EFFA 4AWEA 1ZBKA 4P0JA 4ATLA 1DFQA 1T9FA 2JIEA 1V6YA 3NDYA 3OIHA 5E6ZA 1Z2VA 1S0CA 1NP2A 5BXPA 2VMFA 3EDKA 1J10A 3B9UA 5I3DA 4OWKA 3NUKA 4MDOA 2X2TA 3OJ2A 8CGTA 3VD4A 4AZHA 4A3YA 1O7AA 1DWIM 4WIWA 2DSWA 1I1WA 3AIUA 1QNPA 2V5DA 1FGAA 1QQLA 2X8RA 1GOWA 1SYTA 1TVNA 3OB8A 1RZOB 2AAIB 2WMIB 3VGFA 4UZSA 1ILR1 2LIEA 4GOYA 4LO3C 2BHYA 1WPCA 3EDDA 1J0JA 1KWGA 4HOZA 4PTWA 5EG6C 3QHNA 3MKKA 1RH9A 3G6LA 1NZKA 2WC4A 5D63A 3GYCA 4G9NA 1EXPA 1F31A 4GINA 2QYIB 4Z2GA 2D3LA 4CD4A 4FK9A 3ARVA 4CVWA 1HJQA 3K1DA 3QOKA 1AVAC 3M46A 1XZZA 1ISYA 1XCWA 4UQ9A 1OB0A 4CD6A 2OSWA 4MNJA 2G3IA 2YL6A 1H4PA 4CU6A 2C7FA 1VEPA 5F8WA 2WLZA 1W3GA 3OG2A 1JYXA 4A4AA 1UYQA 1XGZA 1PZ3A 4I4OA 2BY1A 2D0HA 4I1BA 2WMGA 1TFVA 4GIAA 3IJ7A 3N15A 4W7VA 3L4UA 3DECA 1QNSA 3AXIA 3TONA 4HJJA 1RY7A 3K8KA 1GQLA 2CEQA 2V38A 4IY9A 4JRAA 4DENA 1QI3A 3WD3A 3A22A 2YA1A 4M29A 2J8FA 1MW0A 3CRGA 1AMYA 1VFUA 3V79C 1ABRB 1CGWA 3WUEA 4AW7A 2W92A 1ISWA 3H6RA 1JD9A 4IPLA 3VIOA 1BTCA 4FMVA 3VUPA 5F90A 3M7SA 3O2LA 4AIUA 3E8LC 2WCGA 4AISA 1IOBA 2G3MA 2BV9A 5FL1A 1L0PA 2C8NA 1EDTA 1CXHA 2G3NA 3BXWA 3GXDA 1E1FA 3VM7A 4KGJA 1TUXA 1KCLA 5A8OA 2EPNA 1DFCA 3AHZA 4PMQA 4NRSA 4LO2A 2Y9XE 1WE5A 1E1EA 1GQJA 1RP8A 1UH3A 4F9DA 4I3NA 2ZUVA 4TXEA 3FXYA 4FVVA 1BFNA 3OLEA 3R4SA 3WMBA 2VLCA 3BAJA 2DSVA 2J8GA 4P0LA 4D1IA 1K9FA 1M03A 3WUGA 4QBCA 1HKMA 1GORA 4IHZA 2FFUA 4D0TA 4OZOA 5IHRA 21BIA 9CGTA 2R9KB 1K9TA 2XPKA 1JD7A 1LL6A 4I4PA 1WO2A 3PG0A 4ZOTA 1GOOA 3A47A 3Q7YA 2WKGA 1H09A 3SUVA 4M82A 4KEIA 4PUDA 1WP6A 1BYBA 2ZXBA 5FL0A 3SCRA 3AQUA 3BMVA 4JFTA 1ISXA 5A2CA 5EFDA 1W2VA 3SUUA 1GUVA 2YOCA 4Q9PA 2RQ9A 1CXIA 1X1NA 3N1AA 3VDAA 3OA5A 3SEPA 2AXMA 2NT1A 1Q6GA 1JZ3A 4EKXB 2YL9A 1GPFA 5LA1A 3VOCA 4MJ4A 5FCZA 1XHGA 3RJYA 1CGUA 2ZUUA 2ZXDA 2G3JA 1S0DA 1WD3A 1VCLA 2IHOA 4IZEA 4MNLA 1QHZA 4PYSA 1PJ9A 1MQPA 1GGPB 1PX4A 4J27A 2OWWA 1GHRA 2QN4A 3RO8A 1BYDA 2X05A 1ITBA 2RSTA 1LG1A 1NWUA 2A3AA 1BA7A 3B8SA 2BVYA 5KEZA 1ZS2A 4GQQA 1G01A 3UR8A 2Y8VA 3WKZA 3FJKA 1WZKA 3BGAA 3ARZA 3KMVA 4PN2A 1ZBCA 3ZC9A 3F5JA 4S3JA 3MMWA 4I6IA 3L4WA 3WDHA 1MFVA 2DS0A 1KQZA 2J7BA 1B3XA 1AVUA 3VIJA 3C9ZA 3ZT6A 3FNDA 2GJRA 5HBFA 3UEQA 4AZ6A 1VFOA 4QLKA 2KH2A 5A95A 4EFRA 3CH9A 1W3FA 1F4AA 3TTYA 5BCAA 5A6LA 3WL1A 1U2YA 4F83A 1QHOA 1XSKA 3T2QA 3M07A 3WDIA 2WK2A 1R86A 1Z0HA 1V0MA 2X2SA 2YKKA 1PIGA 3WO3A 1J01A 4N42A 4HMCA 3VX1A 5A6BD 3HMCA 1R85A 5DO8A 5IHSA 2W67A 1KXHA 3D3AA 4WKFA 2VI0A 5BROA 3WY1A 5E0FA 1B3YA 2W61A 1CGVA 4B3KA 2Y8KA 1WAWA 3QR3A 3H6RB 1JIBA 4TVDA 4DUWA 4D1JA 2PWHA 2EEXA 4LYRA 3GXMA 1HVXA 3L4ZA 4LO8B 3TTQA 1VRXA 1E4IA 4D6JA 4JCMA 1GOIA 3CTTA 1BYAA 3UJ0A 4L4HA 4YPJA 1CPUA 3SUSA 5FD0A 3PZGA 4BQ3A 3WO4A 4JCLA 1D2KA 1XG6A 3E1F1 1NOFA 3TC2A 1CNVA 3W6MA 5A6SA 5CSUA 3PZ9A 2F8XC 3WH6A 5IFPA 1C7TA 1MWOA 3VD3A 2UY4A 1HL9A 4QALA 2WVTA 4PMRA 3NBDA 4IQPA 3AMCA 1JZ8A 2J47A 4OBRA 1E4NA 2Q9XA 1TWEA 4I2SA 2WZEA 3RCNA 4R27A 4NRRA 4JFVA 1RP9A 3U7BA 3IANA 2FO1A 4OKDA 3AIQA 3MPPG 2CESA 3W26A 4HPGA 7A3HA 2XTKA 3N9KA 1VJSA 3BAUA 1W3KA 4Z9WB 3HJEA 4Q91A 3CA0A 2UWFA 3FJCA 4IONA 3PUBA 1HXJA 4AYSA 3EMZA 1XRVA 1XH2A 4GP3A 3QYDA 3WD4A 1MYRA 1CGTA 2F2FC 3CZEA 4PTVA 2GJPA 3BAVA 3WMUA 4GXPA 1W3HA 2RGLA 5CQ1A 3W29A 4W8AA 2Q3NB 2ZICA 3CUIA 1PPIA 3OGSA 3RMXA 2WM0A 3SIMA 1V02E 3BSGA 1NM9A 3ARTA 4U31A 5BOWA 1DWFM 2Y4SA 5BQUC 2HZ9A 1BQCA 4WSKA 1S0FA 5D8ZA 3FHQA 3H6SE 4F79A 3V0BB 4F66A 4FLRA 4LX4A 1OGSA 1OT1A 3BAXA 3WNMA 3CRHA 4U3AA 1HWPB 2NP0A 4LO0C 4FLOA 5ABFA 1DWGM 4I8MA 2E40A 3WD2A 4J2SA 1MC9A 2WVVB 3PZQA 2DRYA 2DH2A 4U3CA 2CKSA 1C93A 4C7DA 1E56A 1TWMA 1FFQA 1BFBA 5BWFA 1E55A 3SCNA 3BX1C 2BFHA 1Q6CA 1I1EA 4WSJA 2DQXA 2ZX5A 5CGMA 1JYVA 2CYGA 5A2BA 4ZENA 1WNOA 2DSKA 4HPHA 1KB3A 4V27A 5BRPA 3AOFA 1HKKA 3UD9A 1A3HA 3ARUA 1IZKA 1Y7VA 3BA4A 4ZXLA 4H8UA 4UFIA 4EK7A 1FWUA 1EA9C 2ZXQA 4LYQA 1XC6A 2IXUA 5AYIA 3BAGA 2W63A 3GH5A 1C92A 3DYPA 1S0LA 5BP5A 2DPEA 5EMYA 1V3JA 1TFMB 4MAVA 1GQIA 1JZ7A 1KNMA 2D43A 2WBCA 2P23A 1CIUA 1M04A 3OLIA 1EPWA 3N17A 2XOAA 2BFGA 4L4PA 3UERA 3ZMRA 2MLLB 2GSJA 3WNPA 1G9AA 2D3NA 3GBDA 3WDRA 1AXMA 2NT0A 3UG3A 1ZU8A 1NWRA 3GBEA 1V6WA 2XFYA 4ZA3B 3T0AA 1JYWA 3EYPA 1W1TA 3PMEA 2FHCA 2ZXAA 4II0A 1TTUA 2Y9FA 3ZXGA 1SMAA 3VDCA 4A7KA 2WMIA 2FGLA 2DEPA 2ZWYA 1S0EA 1JZ6A 3WINA 4LGXA 1RMLA 3WDJA 4QDMA 2MIBA 4J3UA 3S8JA 4GZJA 1HWOB 5GQBA 4P8UA 1PAMA 1CYGA 1ZBWA 3CLWA 1CTNA 2WBKA 3W53A 4CCEA 2D0FA 2E9BA 8I1BA 4CN6A 1FQ9A 4PC4A 1UG6A 4GAIA 3L4XA 4UFHA 1LWHA 5HNNA 4TLPA 4GP0A 1E0XA 5IDIA 2WCAA 4V28A 1E6RA 2I1BA 1JFHA 2OSXA 1B31A 4IISA 4AZIA 1GW1A 2XGBA 1YQ2A 4F9JA 3WMVA 2VURA 3WA1A 3HMYA 4HA1A 1NOWA 1OGBA 3FJFA 2E4MA 5BRQA 3K4AA 3MV11 3NJ3A 1UR4A 1JLYA 3AZVA 4G9MA 3TP4A 2CBUA 1WDPA 3S2CA 1FHDA 4HA3A 2W5FA 3WFZA 4TOQA 3AI0A 1XD1A 1SMDA 1FV3A 3BAIA 1B1YA 3CZJA 3RPMA 2VXRA 1JAKA 4CVUA 1UR9A 2O92A 3SCSA 5ABFB 1W1VA 1M2TB 1OIFA 2WMJA 2A3HA 3AS2A 4HP5A 4DM1A 1UKTA 1N82A 1OBAA 4BCEA 2PWEA 1S46A 1MXGA 5A1AA 2KKIA 4QCEA 3QR5A 1D7FA 5GNZA 3LLPA 1UD2A 1DP0A 4UNIA 2BY3A 3IM7A 2DGAA 5AC5A 1JQZA 1OIMA 5D9NA 1JFXA 1R87A 1PX3A 1NWSA 1ESWA 5A6KA 2W91A 1Q6FA 4CCDA 1JT5A 4B9ZA 4D6FA 1TCMA 2KI4A 3A23A 1JXJA 1DZDA 4DWSB 3AYSA 3CZLA 3WENA 3ZSSA 1J18A 1E5NA 3FY1A 4NI3A 5ABEA 1G0CA 4XV0A 5A6JA 4URIA 3CMGA 1J12A 1E0OA 1NUNA 1G1YA 3T0DA 3FJEA 4OWJA 4ZEPA 2QLYA 1E73M 5HPCA 4P7LA 3AMDA 1IILA 4JHZA 5F7UA 1BG4A 1E15A 3EDFA 3LPPA 2CIPA 1XH0A 1KCKA 4TX6A 4J2XA 2OLHA 3WNNA 4AZGA 1JTCA 3N7LA 2A3CA 2VZOA 3VILA 1UWTA 2JIWA 2DSZA 3OGRA 1EYLA 5FZZA 2YBTA 3AHTA 2XGIA 4JKQA 3ZT7A 1DEDA 3VGHA 1CXFA 1WCGA 4H41A 3WH8A 4DM2A 3VWCA 1PZZA 2ERMA 2VX4A 1YXWA 4D6CA 1FOBA 2ESCA 3WO2A 4UTFA 1WDRA 3WQVA 3WF3A 2DIJA 3P53A 4CUCA 3WIJA 3BLPX 2G41A 3VMNA 4P7OA 2BVDA 3IJ9A 2G4FA 3UESA 1QXMA 4JKKA 4P7QA 3W25A 1AVWB 2VVNA 3FAWA 1D3CA 1HNYA 3WQ4A 4OOZA 3BLKA 4I37A 1UR2A 4R6UB 2J62A 3Q7XA 4P8VA 2YDQA 2W4XA 1RG8A 4HMDA 1AQMA 2X0YA 3OGFA 2HVMA 4GI9A 3ZO9A 4X37A 2JALA 3BRGC 3SCTA 2FGZA 1OT2A 4X9YA 3AJ6A 1TMQA 1R8NA 3A21A 3K1XA 5E0CA 4ZGRB 3A4AA 4Z2KA 4J7RA 3UD8A 5DFAA 1D0HA 3B9EA 1V3LA 5JLVA 4QO3A 4J3TA 2D0GA 1VENA 4QBVA 5ECUA 3WF4A 1FA2A 5A8QA 1GQKA 5HPZA 4PMUA 1GOQA 1JDDA 2BXYA 2CERA 3CMJA 4ATDA 3VPLA 1XYFA 2PF0A 1MFUA 4JFWA 3WF2A 1E3ZA 1QPKA 3FUQA 2XVNA 4OJYA 4J23B 2XSAA 4H04A 3CRIA 3AKGA 4USOA 1MQQA 4F34A 3AIRA 3W28A 4USPA 1SR0A 5A2AA 1EGZA 1GZJA 5GPRA 1ZL1A 4OOUA 2PBOA 1LJYA 1KR0A 1BFCA 3AMKA 3RILA 2YL8A 3JUGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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