1V6VA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 3(2)-alpha-l-arabinofuranosyl-xylotriose
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 162
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6vA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6vA02
3BLKA 1ZBKA 41BIA 5I78A 3MUAA 3POHA 3WMUA 3F62B 4TOQA 1RP9A 3W4RA 2QV4A 3WH8A 1SZ6B 2EO7A 5FD0A 3VGDA 5HDRA 4PMNA 5M17A 4XX6A 3A4WA 2EPOA 3AJ5A 1GOWA 3CPUA 3QOKA 4IISA 2LIQA 5EB8A 1QBBA 1Q6FA 3U5YA 2ZOXA 3UG5A 2D23A 2JEPA 4TLPA 2AAIB 5BRPA 5BVPI 1KQYA 2Z1KA 2BV9A 2FHFA 2ZXBA 2C7FA 3S2CA 5A2AA 3GXIA 1H1NA 4E4PA 5JIWA 2HWMA 3HSMA 4EB2B 3MSGA 3SCRA 4EFQA 3AIUA 1XSJA 4FLSA 1K5UA 1QI4A 1O7AA 4AZ5A 1G0CA 5C71A 4IY8A 4QDMA 5FKYA 2VRKA 1W3LA 4ZLBB 3EDEA 1LWHA 3PZQA 1C8XA 4EAMA 2YA0A 4V27A 4UFHA 4EANA 5BWFA 4IZEA 4Y7EA 4CCDA 1W1TA 4HTYA 4F79A 4J7RA 1W3KA 1H11A 4H8UA 3Q7YA 2VI0A 4JCLA 4MTVA 2NSXA 3IAGC 4URIA 3BSGA 3CZGA 2Y4SA 5HPZA 1K6AA 4QCEA 1JI1A 1UWRA 3GNRA 3WQ8A 1BFBA 3RSJA 2Y9WC 3SEPA 1H2JA 2EXOA 1W3FA 5F8YA 4BQ4A 3UJ4A 1DZCA 1H3GA 2AMGA 2VCBA 3ARXA 2DSWA 2WZHA 4PMQA 4EEEB 1BFFA 3WNOA 4QLKA 2HVMA 5I1BA 1UOKA 4TTGA 3ARQA 4UTFA 2B31A 3EDFA 1CE7B 2X0YA 1B2YA 1MXGA 1J0JA 2GO2A 4P0JA 1EHAA 4J28A 1EOMA 1XH1A 3O3QA 4I4XA 1W3HA 3AXXA 4D72A 3ZOAA 2VX7A 3IJ8A 5A8QA 1YTOA 1WD4A 3H6RB 3ZC8A 1JZ8A 4PMZA 3WSUA 2ZUMA 4U3CA 1CNVA 3T08A 1CENA 3ZJKA 3T0AA 2YIHA 5FZZA 3BA5A 1MQQA 4GQQA 3IAPA 2W66A 3RMYA 1L2HA 2Y9XE 4X9YA 2D22A 4HA1A 3OZOA 5HBFA 3BADA 3WDQA 5A6MA 5FCZA 1KB3A 4OIFA 2DH2A 5A2BA 3BRDA 1C8QA 3VMOA 4OJYA 2J7GA 1QBAA 4W8AA 1W9BM 4NI3A 3TTOA 4KRUA 1IHKA 4PN2A 1BGAA 1E6SM 3NDZA 3W26A 4XFUA 5E09A 2WMHA 1CTNA 5DMYA 1TFVA 2PB1A 4W5UA 3ZT6A 1E5NA 2GZBA 2FGFA 2Y5EA 2UUSA 3QR5A 1G5AA 4HZ8A 4AZ7A 1JT7A 1ZBWA 3QHNA 5I0DA 1JZ7A 1P6WA 3GTNA 4GXPA 1XV8A 4ZKTB 5FZUA 2WVVA 3PTMA 3Q7WA 2OWXA 5DZUA 2CEQA 3K8KA 2A3EA 2JEQA 2IWTB 3H6SE 4JFSA 1UR1A 2PWDA 4P0KA 2WLZA 3CA4A 5JBEA 4M82A 1C91A 1BAGA 1JDCA 4JL1A 2Y2WA 1AVUA 4LO2A 2J78A 2Y9GA 3OA5A 5CLTA 2XVLA 3BB2A 1T4QA 5D62A 4M56A 2XSAA 4R27A 4J27A 2WRYA 2WVVB 3D3AA 4U2ZA 1PPIA 1NH6A 1PIGA 1G9AA 1PX4A 1Y7VA 3K4AA 4CN1A 2E8YA 2KKIA 3FJ9A 2W67A 2XWDA 1W9XA 1CDGA 3BAIA 2E3ZA 1ISYA 3BA4A 1WZLA 1XRVA 3B9DA 3RPMA 1GQJA 5GPRA 4GO9A 1R8LA 1BPLB 5GNYA 4P7NA 3VGBA 1KXTA 5AYBA 4QFUA 4MAZA 3BXWA 3T09A 3B9AA 1FGAA 5AC5A 2PWFA 2VXTI 3FJJA 4ZENA 3T2PA 3WDHA 4AIOA 1G9BA 1D3CA 3SCTA 1I1WA 2XIBA 3FJEA 4MNKA 2PBOA 1UA7A 4IY9A 3MO4A 4B3KA 3B9UA 4OUEA 2FFUA 4Z8SB 4L4OA 5I6SA 2FGLA 4EKJA 1PX8A 3FJAA 2ZX7A 3VNYA 4I1BA 1SYTA 4IQPA 1TWMA 1QQKA 4AN6A 1WNOA 3AQUA 3NJ3A 1OCQA 3WEMA 3GDBA 4AZBA 3OBTA 1EOKA 4JFWA 3MMUA 2J8GA 4B15A 3R4SA 5A8OA 1FN0A 2BY1A 3GNPA 3CTTA 1WDSA 1MYRA 5EFFA 1L0PA 1QHPA 2GUYA 3MMDA 2WMGA 1JXJA 2ZUVA 1UUQA 4LQ1A 1W3AA 1PWAA 4OWKA 1JGIA 1O6IA 1S0CA 4GQRA 1B3WA 1IZJA 1KQZA 1OGSA 3AMCA 1SR4C 1G94A 3EDJA 3N0KA 2VRQA 3MUZ1 5JMCA 3FJKA 1G9HA 3ARPA 5A6AA 2BHYA 1ZL1A 1ZS2A 1S0BA 3T2OA 1FHDA 4OUJA 4HJJA 1EPWA 1GQIA 4QLLA 2VSEA 3AISA 4YHEA 3WD2A 3H6RA 3AMLA 1JIBA 5HNNA 1VEPA 4KBBA 3PG0A 2NYYA 4ZGRB 1PZZA 3W25A 1B1YA 2GDVA 1Q1UA 1ZJAA 2DPEA 3GH5A 3TOPA 1PUMB 3GXDA 1KWKA 1IV8A 2VR5A 2FO1A 4AZCA 4PTXA 3OGSA 4ZE5A 1HT6A 4D0TA 1HKNA 1AVXB 1MVYA 3GXFA 4BA0A 4HOWA 4LO3C 1UWSA 2VCAA 4FF5A 4WBCA 3GH4A 3EMCA 5F90A 1N4KA 1CGWA 2QHAA 5CPSA 3HU7A 4MB5A 1I1EA 2YDRA 3WO3A 1BGGA 3CUHA 1OINA 2E8ZA 3IIRA 4A3YA 2G3NA 3CAHA 3WMCA 4DUWA 5A8PA 5CLWA 2DIEA 1SMDA 3FY1A 3SIMA 4WJXA 4XFSA 1BHGA 5E70A 1LL4A 2Q9XA 4AEFA 3AS1A 3HBWA 4C7FA 2HZ9A 2WAGA 4D6IA 1IZKA 3BSHA 4CJMA 1V03A 2VZOA 3VU2A 21BIA 1EDQA 5ABFB 1NOUA 2E9LA 1HP4A 2PWHA 1E3ZA 4JAWA 3VIKA 5JLVA 5FOOA 4LYQA 3AH1A 3LLPA 1CWYA 3AZSA 1UHVA 4RE4A 3S8JA 1KNMA 2XM2A 2BS9A 3PZMA 4PTWA 1QI2A 3K46A 4I8MA 2I1BA 2DSKA 4GI6A 1UR4A 4JKQA 3M46A 2QYIB 4JP0A 4CVUA 5M5DA 1JAEA 3ARZA 1JNDA 1M04A 2MANA 4OBRA 1TP0A 4EFPA 3OLIA 3KWXA 2F61A 2NW0A 4GPNA 7I1BA 1FQ9A 3OBRA 1KBKA 1XSKA 4J3TA 4KMQA 2XVNA 1B3VA 3AHTA 4QLJA 3VUPA 5A3HA 1MC9A 1IJTA 4BQ2A 2VVSA 4Z2KA 3BAJA 1CXHA 1V0KA 3SCVA 4KH2A 1DLLA 2J3PA 3CUIA 4CU7A 4J3VA 5C70A 3U5UA 4V2XA 1PBGA 2VL4A 2J62A 3N7LA 5D9MA 3AIBA 4PMDA 1DWJM 1EQCA 1JFHA 1UD6A 9ILBA 3MV11 3ARYA 1DP0A 3FGMA 1JI2A 1Z2VA 5IXEA 2HWAA 1L8NA 2W91A 4IM4A 4RE2A 4MNJA 1VBRA 4Q9GA 4MPKA 2YDSA 1V3LA 2MIBA 4ATLA 1AXMA 4J3UA 2QF8A 1EO7A 2ZX5A 1WCGA 3N1AA 3UG3A 1VAHA 3FFZA 5BXRA 4PMXA 2P23A 3WMBA 3F5JA 3WL1A 4LO0C 4OW4A 5BXPA 1JXKA 3L2LA 3CUJA 1K5VA 1FP9A 1G9CA 3K8MA 3BCFA 5M3WA 3AS0A 3I3DA 4X3AA 1CXEA 2BXYA 2ZXDA 3VGGA 1AVWB 1LQ0A 3UD9A 2F8QA 3AS3A 3AJ7A 3UR7A 3WF1A 3E8LC 2VZVA 3FW6A 2FHCA 4GZIA 2CYGA 4AZGA 1QHZA 4C7GA 2KI4A 4EE9A 2J7HA 4UR9A 4HZ6A 2WYSA 1C7TA 1KXQA 4KEIA 2F2FC 2X2YA 5BP5C 3WDIA 4U5KA 4PMUA 3WQWA 1NZKA 2VXRA 1FH9A 1BYDA 1WD3A 4GOVA 3OBAA 4P7LA 4A7ZA 2VU9A 4DWSA 3HN1A 3CHCA 3V0AB 5A6BD 4D6EA 3A6OA 3VDHA 1J01A 1GORA 2D1ZA 2HW9A 3O6AA 6A3HA 1CZ1A 4AD5A 2CHNA 1JYWA 2Y24A 4GIAA 4OEGA 4CCCA 2VSAA 2XJ7A 4IPLA 4AC1X 1FV3A 3MV01 5BCAA 1Z4SA 1V6XA 1YF8B 3PZNA 3OJMA 4I0YA 2YL8A 2X1IA 2VMFA 4AD1A 3O4OA 2CXGA 4W5ZA 4L4PA 5CSUA 4S3KA 2YLAA 4I3NA 3T0DA 1NUNA 3LPPA 1LG1A 1UH4A 1MW0A 4HOXA 4Z9WB 2J75A 1W2PA 3WD4A 2BFGA 3APGA 4QD2C 2A3AA 4JIEA 1JFXA 1I75A 4Q22A 5A94A 3OLEA 1HIBA 1Z0HA 4ZXLA 3KL3A 2A3CA 5DUYA 5D61A 1IT0A 4NRSA 3HMCA 2EPLX 4W7VA 4QCFA 1US3A 1AQMA 1ITCA 3IANA 2GJPA 5IHSA 1J0KA 4D8HA 3KL5A 4AD4A 5CG0A 3QHOA 4PCSA 1OBAA 1WZKA 2AFGA 3FJCA 3WQ5A 1LJYA 1W9DM 3VMPA 3WELA 1BVNP 1CGTA 3WMSA 1ITBA 2ZICA 2F8XC 2WWCA 2CHOA 1BTCA 3ZSTA 4U33A 4YHGA 3BX1C 4N42A 1BVZA 4M29A 4J3SA 3W27A 2PI6A 3IM6A 4PEEA 1TWEA 4UQCA 1UH2A 3BH4A 1E43A 1LL7A 3ZXGA 1JDDA 4ACZB 5EG6C 4G1RA 1RY7A 1P63A 1HWOB 2J4GA 2WVSA 1FH8A 3W28A 3P53A 1XZZA 2PC8A 4FGFA 2O9OA 3UESA 5I5RA 2CBUA 1MXDA 3WH9A 3I2AA 3ZO9A 1W9VA 4AY1A 3M7SA 3VPLA 1ZU8A 1PJ9A 2VZUA 1V6YA 4UOJA 4KRTA 3VIMA 4R5EA 1JYXA 2D44A 2YDQA 3BA7A 4GO8A 1J0SA 1JF5A 4DCKC 4GAFA 5DVHA 4USPA 4EFRA 3N17A 3AFBA 4PUEA 2WWDA 4IONA 1C93A 2WCGA 1RD6A 3SNVA 3SUSA 2V5DA 3B9EA 4JZ5A 3VKKA 4PTVA 1W3GA 4UFKA 4W89A 4J2YA 5HPOA 1J18A 2Z48A 5F8WA 4J2XA 3EDKA 3FJHA 4X0VA 1JZ2A 3MPPG 2NZ9A 1QXMA 1IRAX 4M24A 7A3HA 1HWNB 1HJUA 1U30A 5BROA 2D2OA 3UD8A 3ILAA 1ZBVA 2V3FA 3QOMA 4D1IA 1EDTA 2ZXQA 2VUAA 1JAKA 3ZMRA 4YOLA 2DT0A 1S0FA 2WMJA 2ZWZA 2XPKA 5GQBA 1DTUA 4P0LA 4MNLA 3VDAA 5E9AA 5JBFA 2YUGA 2EPKX 4LYRA 4W93A 4AWEA 1CGYA 1YYNA 1R8OA 2J7CA 4JKMA 1II4A 4JFTA 3RTJB 4OOZA 4W87A 1NWSA 3MS8A 4UQ9A 4I4QA 3T2QA 3I3BA 5IFPA 1VIWA 1S0LA 4MAVA 2GJXA 2HISA 4BQ3A 3KE0A 2E4TA 3MKKA 3V0AA 4F9DA 3WDJA 4ZEPA 3VD4A 3VILA 4HA4A 1NP0A 3E1F1 4GOYA 3MSDA 1HNYA 2WVTA 3I29B 4E8CA 2WZEA 5GNZA 2CBVA 4UOQA 1HWPB 4KWUA 2UY4A 1W32A 3PBGA 3VEQA 1VJZA 2JIWA 3AKIA 2IXUA 3M07A 4WIWA 3UERA 2O92A 3VDCA 1NOWA 1MW1A 2X0HA 3EF2A 3WO4A 2VX5A 3N13A 5KZ6A 3SUVA 2XOAA 2D0GA 3ZXDA 1N82A 1FFRA 1QNRA 1CVSA 1C8YA 4HPGA 4UQBA 4TX6A 1AVAA 2V3GA 3WENA 2CKRA 5A69A 1M16A 5HOSA 1YXWA 2FH6A 3ARUA 2BVYA 3AHZA 1FP8A 4PMYA 2VJXA 2Y9FA 1GGPB 3OG2A 3NBEA 4OWLA 4UFJA 3NSMA 3DYPA 3NBCA 3NYDA 4E8DA 3SCUA 2WK2A 3U7BA 3L4TA 4Q7NA 3BAVA 2QPSA 2WBKA 3BAXA 3DECA 3BCDA 1T9FA 4FLRA 3VINA 1V0MA 1E6QM 2VRJA 2DSUA 3WUGA 2V3DA 4JFUA 2VLCA 1WZMA 2YOCA 8CGTA 1VFOA 4JKXB 3O4CA 3TONA 5BQUC 2XFYA 3SCOA 4BF7A 4CD4A 1E55A 1VFFA 1CGUA 1AFCA 3W37A 5A6BA 3PZIA 2BVDA 4HOZA 5JUVA 4I4UA 3CLWA 3M6DA 3ZIZA 2YBTA 4ACZA 4B9ZA 1V6UA 4QC4A 5EFDA 3N11A 4KEJA 4IZXA 4P6AA 1NQ6A 4W7UA 4D6JA 4OKDA 5A6LA 1UH3A 4U5IA 3WDRA 5A8NA 2GFTA 4NF7A 2WMIB 4MNMA 3NBDA 1BFNA 1GONA 1G1YA 2OSYA 1XCWA 1BFCA 1B9ZA 1R7OA 1E9LA 4D1JA 3W6MA 1TMQA 4TXEA 1KBBA 1QNPA 3WBAA 4IUGA 4UFMA 1E0VA 4LXFA 1F4AA 3CRIA 3PZVA 1Q04A 5DO8A 4ZFYB 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