1V6WA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 2(2)-4-o-methyl-alpha-d-glucuronosyl-xylobiose
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 163
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6wA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6wA02
1XC6A 3EBVA 1JAEA 4OZOA 2G3JA 3GYCA 3HMCA 3ARPA 5DEZA 3QHMA 1FHLA 1OD8A 2Y8VA 1K5VA 4A7KA 4V28A 4UFMA 4CD5A 5E9AA 2WHMA 3AHZA 1VBUA 5I5RA 1UUQA 5FL0A 2UUSA 4I4OA 3VT2A 4D1JA 3Q7YA 1ITCA 2AMGA 5CG0A 3O2LA 1UR0A 2ZUVA 1PX8A 5EBAA 1CXHA 3PZVA 1HN1A 2J7CA 1EGZA 2DSUA 3FJFA 1HIBA 1XG6A 2NT0A 4DUVA 4XKIA 1XD0A 3PZIA 1UZ4A 4ACYA 1JI1A 4I4SA 4XFSA 3PTKA 4Z2KA 4U33A 3Q7WA 1J11A 2G3IA 5A8NA 1J12A 2G3NA 3HOMA 2D7RA 4JRAA 3SCSA 2MC2A 2MANA 3AIQA 2WM0A 4FVVA 4QLKA 5E09A 4BQ4A 4GO8A 1TCMA 1PWAA 1E72M 4KMQA 4ACZB 3WINA 1PZZA 4CD6A 2VSAA 3EF2A 3VDBA 1K9FA 5BCAA 2BFHA 1RPKA 3AXHA 5F8WA 5D4YA 4H7VA 4OUEA 1VAHA 1B3WA 3ZXDA 4EE9A 1VBRA 3AFBA 3TTYA 1UKSA 2I1BA 5FOOA 4ATWA 3ILAA 3U7VA 4WIWA 4I1BA 4Q91A 3CPUA 1PUMB 2BHZA 1NM9A 2ZX8A 5FNWA 5M17A 2J3PA 4GINA 3SCOA 1E0VA 8A3HA 3AS3A 4GI8A 4Q22A 2VSEA 2VR5A 5LA0A 4IISA 2BVDA 1NQ6A 4DCKC 3AS1A 1ECEA 2XSBA 4UQCA 3PN8A 4B16A 3WSUA 2VU9A 2KI6B 4XZBA 1OWQA 5HBFA 3OGGA 4AZGA 3QHNA 1EYLA 3ARVA 4MJ4A 3FHQA 3IJ8A 1ZBKA 5CPSA 1OIMA 1AVAC 1MVYA 4G9MA 1U2YA 1PX3A 3BH4A 4AD5A 1QW8A 1HJXA 4XZWA 3AIWA 1S46A 1BASA 3CZLA 4Q9GA 2RG9B 2KI4A 4JFTA 4KC3A 4M24A 1HJQA 3OZPA 3MV11 1DFQA 4EFRA 4HOZA 2FO1A 1V02A 4LPCA 3UEQA 1ZBVA 4D6CA 4OBSA 4GOVA 2VI0A 1BG9A 3SCQA 2VCCA 3O4DA 1R85A 2OYMA 2CNCA 2W62A 5CQ1A 4AZ7A 2QLYA 2J7EA 1EXPA 4HA4A 1KCKA 1ODZA 2XWEA 2D24A 2JF6A 3FJJA 3RJYA 2ZX7A 4JZ5A 3L4VA 4Z2GA 3BA5A 2ZR1B 5C71A 4IY8A 3BAGA 3S2CA 4LO0A 3VMOA 1GQLA 2W5FA 3OLDA 3O6AA 1BSIA 3MS8A 3R4SA 1JD7A 2DSZA 1B2YA 3VX1A 1HKIA 2CESA 3PG0A 5DVHA 4MNMA 3H6QA 1KXHA 2QHAA 3AS0A 1ISVA 4LO2A 3ZXGA 4AN7B 5BP5C 1UPSA 2XWDA 1IV8A 3CLWA 3GDBA 4AD0A 5F90A 4V2XA 3AKHA 1MFVA 1KQYA 3AROA 4XV0A 1GW1A 2CYGA 3CA6A 3LPOA 1Q6DA 2QN4A 3UJ4A 1ZBCA 3OGFA 1UKPA 1CBGA 4WSJA 4DUWA 1MC9A 5A6JA 3KE0A 1XGZA 3VD4A 2D1ZA 4ZGRB 1V6XA 3VDHA 1CGWA 2YBTA 1GGPB 1C90A 3WD4A 4LGXA 5IHSA 1IT0A 3UR7A 4W93A 1CZ1A 1W1TA 3AH2A 3VDCA 2WMIB 2Z1KA 1JDDA 3T08A 1QHOA 4GAFA 4UFLA 4J7RA 4Z2HA 1XSJA 1SFSA 4P8UA 1HVXA 2E3ZA 3GXMA 3WMUA 2R9KB 2BHYA 3PZGA 3RILA 1Z0HA 3NBDA 3KEHA 1GCYA 2NT1A 4H9WA 4P7LA 5DFAA 4P6AA 1C91A 1US2A 2QPSA 4J23B 2OSWA 3NSMA 3OZOA 2PBGA 1QBAA 3WO2A 5HPZA 2WSPA 4BA0A 4QLJA 2QMKA 4F83A 4EAMA 3CIVA 1JL8A 1RMLA 2CCRA 2WWCA 3RCNA 5GQBA 1DWGM 1VFFA 1M53A 4CVUA 4PCSA 1L2HA 1M16A 3AIUA 1C8XA 4J2KA 3G6MA 3PZUA 3EDFA 2XFYA 3DYPA 2XVNA 1J0SA 1DWIM 2VRKA 1BLAA 4H41A 1QVBA 3IJ7A 1H4PA 1LL7A 1EQCA 2J7HA 3WINC 1BHGA 1GOIA 3CH9A 3CHDA 1DJSB 2J7BA 3VD5A 1PEZA 3VT0A 1KB3A 3CA1A 3W82A 1GOQA 4LYPA 2WMJA 4GKLA 4U3CA 4YHEA 4GP0A 1ESWA 2GZBA 2Y9FA 4P7OA 1T4QA 1GQIA 3OGRA 5KEZA 3W81A 4W89A 5HOSA 1Q6GA 2O9RA 5CLWA 2Z49A 3VVGA 1HXJA 4I4PA 2BNJA 3RMXA 1JFHA 1V08A 4I0YA 1HL9A 2FHCA 3LPGA 4BQ5A 2KLLA 3VO0A 1SZ6B 4M8UA 1ABRB 1LWJA 2WAGA 3W25A 1E1FA 4QAWA 3N13A 2MLLB 1CNVA 3CA0A 1JT7A 2XHYA 1QI0A 4YPJA 4MNJA 1W9UA 2IWTB 2Q9XA 5DSSB 4FK9A 4AEFA 4ZXOA 1E3XA 3CRIA 1DP0A 1W32A 1UQYA 1F31A 1K9EA 1JGIA 1LLOA 2XG9A 2A3BA 3BAJA 1CXFA 1JZ8A 3CUIA 3FJAA 5JLVA 3CZ8A 1OT1A 4P7NA 1BVZA 4KBBA 1G9BA 5E6YA 3WH5A 4J3SA 1IZJA 3Q7XA 2K43A 1E56A 1RY7A 4DENA 4YHGA 3CZKA 3OJVA 4NZCA 3WL0A 2CERA 2WW5A 4LO0C 4LQ1A 4TOQA 5EFDA 2JEQA 1GJUA 2DSVA 1CWYA 1J0YA 2ZXQA 1M2TB 4W5ZA 2XM2A 2FHFA 2DREA 3W28A 1NWTA 5BWFA 3G6LA 4JPZA 5A8PA 1S0EA 3VUPA 3DYOA 5FKYA 1I1XA 4LO2C 5GAQA 2XPKA 3AIEA 1HKKA 4C7DA 5BXSA 1BYCA 2NYYA 3HMYA 1S0FA 2BXYA 2XOAA 5ABEA 1BFFA 3FJKA 3RTIB 3GBEA 1ISXA 1VEPA 3WEMA 1V6VA 3FUQA 3K8MA 4L4IA 2FFUA 2P23A 1ISYA 4X38A 3DC0A 3K4AA 1R86A 3AJ6A 2BS9A 4S3JA 5EHAA 3L4YA 1C8YA 4UOQA 1NWRA 3MMUA 4MJ2A 4V27A 5FL1A 5A8OA 4EANA 3AHYA 1FA2A 2VURA 2W91A 3CUGA 3VINA 1H09A 3QHOA 4CCCA 4ZOTA 1BG4A 3WQ4A 1G9DA 2VX6A 3UERA 1NP2A 3CZGA 4UCFA 1AMYA 4TVCA 1UD2A 4QCEA 1W1VA 1UWRA 2DSWA 2W92A 4HU8A 3ARSA 1HVQA 3VIIA 1AQHA 1NOUA 4GZIA 4E4PA 1IZKA 1CDGA 4A3HA 5IXEA 4X39A 4ACZA 1S0LA 4W85A 2CKSA 1EH9A 2XTKA 3O4OA 3WBAA 1AF9A 3BAKA 4PTWA 3MSDA 1KNMA 4F9DA 3BRDA 4J2SA 3VX0A 3PMEA 3BMVA 4RE2A 3WD2A 3WUGA 1HP4A 1F4AA 3C9ZA 2WHLA 4ATDA 3B9UA 1G1YA 1HIZA 3PZ9A 2DT0A 4GO9A 2X09A 5HPCA 2ZX6A 1GNXA 4PMNA 1GQKA 1A3HA 1RZOB 1GVYA 5FNXA 1EA9C 3VWCA 3WMBA 1W91A 3WENA 1TUXA 2AOSA 2FGLA 1B3XA 2ZOXA 1UWQA 3VT1A 3P53A 3FNDA 1XV8A 4W7UA 2F2FA 4PCTA 1CPUA 5GNYA 5BRPA 2FGFA 1V3MA 2WZHA 3ZX7A 1AQ0A 3K8LA 2HISA 2O9OA 4USOA 1W2VA 4M80A 1UA3A 4JKLA 4LYRA 4CN4A 1VEMA 1ISWA 2XFFA 2YA1A 5F8SA 4F79A 2ET2A 4MB3A 5JMCA 2CBVA 2VUYA 5M03A 4GI6A 2AXMA 1H0GA 3ZM8A 5A8MA 1TZ7A 1CXLA 2ZWYA 1HKNA 5CLTA 2EPOA 5BXPA 1ZU8A 2WWDA 3PTMA 3OGSA 4AZIA 3BAYA 4WF7A 1V0NA 3N7JA 2IXVA 4USPA 1W3HA 1NP0A 2NVHA 3SUVA 1CECA 4B9ZA 1ONKB 1W2PA 1LL4A 2VO5A 2WVSA 1QNPA 1E4IA 5GNXA 1VJSA 3BAQA 4HOWA 1IILA 3W6LA 4II0A 2ZX9A 1E55A 1TE1A 4A7YA 2NTDA 4IONA 4P7QA 3MKKA 2YLAA 4HU0A 2ZQOA 1CVSA 1DWAM 3MUY1 1E73M 1UKTA 4U5IA 2V3FA 3AMDA 1J18A 3FJ9A 4OEFA 3WY1A 2DEPA 1AQMA 4K68A 3OB8A 1TOOA 1EHNA 2D7IA 3VIPA 5CZKA 1FWVA 4CU7A 1EOMA 4HTYA 3WQVA 2HW9A 3VNYA 4D8HA 4ISQA 3CUFA 4P8WA 2CHOA 1WBCA 2XVPA 3BAWA 4HPGA 1EV2A 2WNWA 3BADA 1GZJA 3IM6A 3O5WB 5I23A 5JBEA 1E0WA 4I4QA 2DDXA 2WBKA 3WDHA 2CETA 3A07A 3CMGA 4EK7A 3CA5A 1BFGA 3A21A 4JAWA 2XGIA 2LIEA 3CBWA 1MQPA 5I77A 3L2LA 1JZ6A 4I37A 3BAUA 3VM5A 3AH4A 3DHUA 3HN1A 1Q6FA 4AD1A 2E8YA 3LPFA 1UR4A 4NRSA 3WNPA 1ZS2A 4PMVA 1QQLA 1MQRA 3TA9A 3VIOA 4UFJA 3VGGA 3W6MA 5JUVA 2DS0A 4JHZA 2CKRA 3WN6A 3WF4A 3TONA 4F66A 1JNEA 1TVNA 2YOCA 4G6JA 3O9NA 1CGTA 1WDPA 3NDYA 3WUEA 1PZ2A 2GJPA 3WO4A 4EFPA 1IHKA 3IAGC 3P6IA 7I1BA 1E9LA 1EIBA 1CTNA 1JY0A 2DH2A 2YJQA 3FFZA 4JFUA 4CU8A 4UQEA 1KCLA 1UR2A 1SYTA 3GH5A 3UR8A 1JYXA 4MAVA 2OYLA 2EXOA 3AKIA 4F9JA 3VTRA 1R7OA 4FLQA 3JUGA 2V5DA 2V5CA 4G6MA 1XHGA 2AAAA 2FH6A 4FLRA 2VNCA 3TOPA 4I7IA 3MMWA 1VIWA 1LJYA 2GVYA 4UFHA 1TFVA 4QD2B 1FH8A 1V3IA 2VQTA 4DWSB 4U5KA 3PZQA 1MXGA 5C8BB 1B3YA 5CSYA 2GFTA 3CO4A 7CGTA 4UZUA 4R6UB 1WD3A 4U31A 1JF6A 2WYSA 1V6UA 1MD6A 4P7RA 3ZMRA 3OA5A 5AC4A 3GNOA 3VU2A 4HMEA 1TP0A 4Q7NA 3W38A 4OBRA 1WZMA 5E70A 3NDZA 1E6NA 4EEEB 5GPRA 1VFUA 2ZXAA 2WRYA 1H5VA 3UESA 2VZSA 1JT5A 3GNRA 1W9DM 1ITXA 4ZKTB 3P6JA 2F2FC 1O7AA 1XYFA 4YOLA 3AQUA 3TTOA 1W9XA 4QO3A 3WFLA 3RTJB 4OWLA 4FLSA 4HA2A 3EDEA 4PSRA 2WKLA 1FMMS 2NM1A 1DIWA 3OG2A 1WB0A 4QLLA 2WXDM 1UD6A 2X8RA 1XRVA 2VTFA 3OBRA 4I4VA 3MALA 2F8XC 3ALGA 1XHBA 1HJWA 4MB4A 2E9MA 5A6KA 3VIKA 1B3ZA 4TLPA 1HKMA 3W24A 6CGTA 1HJVA 3RMYA 2J77A 3IIRA 4F8XA 3VD3A 4ZBVB 1BARA 4QC4A 3N9KA 1MXDA 3S6TA 2ERMA 3QGVA 1W9PA 4AWEA 2EO7A 3SUWA 4I8MA 4EFQA 2E8ZA 3ZJ7A 3VPLA 1OB0A 4CU6A 3BAOA 4GOYA 4R27A 1HWPB 3BGAA 2D0FA 1HT6A 3SCTA 4ZE4A 3GZAA 2P39A 1G94A 4LYQA 4D0TA 2VX5A 3IK2A 4BS0A 4TXEA 1EDGA 3SCNA 4UFIA 5FCZA 2DH3A 3LPPA 3WKZA 4TX8A 4IPNB 1D7FA 4JL2A 5A2BA 2YDQA 4NF7A 4DM1A 3CA3A 4GZJA 1JZ7A 1B0IA 1UD4A 4AIEA 4I4UA 3NBCA 1WDSA 3DHPA 1EDQA 1FV2A 3PZOA 2X2TA 2ZWZA 1UQZA 2BFGA 2GJRA 3ZJ6A 4GP3A 1OD0A 1S0GA 4TTUA 2X0YA 4KH2A 4AIOA 3E8LC 1A47A 4X9YA 2DIEA 3WNLA 2YL8A 4OWKA 4UQ9A 2YUGA 1CGXA 1GORA 3FAXA 2L5XA 3O4AA 3AI0A 1DWJM 1NH6A 4TTGA 3WELA 2X2SA 1L0PA 4I3NA 2O92A 1J01A 3ZJ8A 1P6WA 2WMHA 3T2QA 3WH9A 41BIA 1FQ9A 3I3DA 4KRUA 4OUJA 1H41A 2WMGA 5D9NA 3PHAA 3VNZA 3GXDA 2IHOA 2D0HA 5FZZA 4ZFWB 3UD8A 3F5LA 4JHOA 3BSGA 4ZXLA 3PUBA 1NOFA 1OBAA 1Q6EA 3AOFA 3L4XA 1XD1A 1HCDA 1NZKA 3D7WB 1UD3A 5HXMA 3WH7A 3WF2A 2TAAA 3GTNA 3L4ZA 4BQ3A 2NSXA 1GOKA 4PMOA 3W53A 1QPKA 1OINA 1BYBA 4OJYA 3AZSA 2J47A 2F8QA 1ILR1 4XFTA 1E40A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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