1V6WA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 2(2)-4-o-methyl-alpha-d-glucuronosyl-xylobiose
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
total genus 163
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6wA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6wA02
1YXWA 3WEOA 5JBDA 2O9PA 1HNYA 2PC8A 1UZ1A 4IY9A 4ENDA 1RP8A 4MDPA 2MIBA 1E0OA 3UDAA 2DH2A 4W85A 1UUQA 2VRJA 5E6ZA 3WQ6A 4A3HA 4CCCA 4P8UA 1JT3A 1J0YA 4P0LA 1CXHA 4IY8A 4JAWA 3GZAA 2VZOA 1DWJM 3UERA 4D0TA 4JFWA 2CBUA 4LO0C 4UFJA 4BCEA 2CKRA 2G41A 5E70A 4Q91A 5A69A 1XYFA 4J3UA 4TVCA 1W1PA 3RTIB 9ILBA 1R87A 1DTUA 2E9LA 5A6SA 2OLHA 1EQPA 1ITBA 1CEOA 3CTTA 5DT5A 2QPSA 4JKXB 2KH2A 4AISA 3GBEA 3OBAA 4XX6A 2WM0A 3EDKA 3GYCA 3RILA 1AVXB 3WD1A 3BCDA 3FHAA 4W93A 3AKFA 3BAKA 3N11A 5D8ZA 3GXIA 3L4WA 4W8BA 4QC4A 3VDAA 1S0EA 3PUBA 1AVUA 3Q7WA 4WSKA 1RMLA 1E1FA 3PZIA 3PZMA 1V3HA 4D8HA 4P8VA 2HZ9A 1IRAX 3ARRA 2JF6A 3EDJA 1QQLA 1JXKA 4YHEA 3GNPA 2X0HA 1MD6A 4II0A 1HKJA 2V38A 4FK9A 4OIFA 2F8XC 1Z4SA 3AZTA 3H6QA 2Y5EA 3T08A 3BB2A 1EIBA 1NUNA 3A07A 3K4AA 2JALA 1BG9A 4JFSA 1NOWA 4PMUA 3AKGA 1G9CA 1IV8A 1Y7VA 4AIUA 3MANA 4KC3A 2Q9XA 1UR9A 2GJXA 1DFCA 5BXRA 4D6CA 1PZ2A 4CD7A 3CIVA 3TTSA 3PTKA 3VO0A 4G9NA 1JD9A 2X8RA 4LXFA 4CVWA 3F62B 1HL9A 1WDPA 2DGAA 4BQ3A 3ZOAA 3WUBA 5DT7A 4HA4A 2CESA 3MPPG 3CZLA 3IM7A 1AQ0A 1QNOA 1YHTA 1TOOA 3WH7A 3S8JA 2BY0A 2XVPA 3AXXA 3RMXA 3VSFA 3FJCA 4M1RA 1DJSB 1H5VA 2CPUA 1ISYA 5FD0A 4AZBA 1W9PA 2FH6A 2YL5A 3N0KA 2J75A 4UQEA 5BWFA 4UQ9A 4LYRA 3PZOA 4J3SA 7TAAA 4AZ6A 4TOQA 1CWYA 2BHZA 4HP5A 4MJ2A 2WVVA 2WAGA 4HZ6A 2CNCA 4D72A 4JKMA 1SR0A 1PWAA 3AJ5A 2J47A 3L4ZA 1I1WA 2QYIB 1BLIA 3NBEA 1FP8A 4IQPA 2W4XA 2HWMA 1HXJA 3SCQA 4DUVA 3SCNA 1FGAA 5IFTA 1D0HA 1AQHA 1KQZA 3W27A 5ABHA 1ISZA 1PEZA 5AC4A 1CLVA 2RQ9A 2ZIDA 4UQBA 1G0CA 1V6YA 1GPFA 2VURA 5DMYA 1EO5A 1MQQA 2BEBA 4PN2A 4QCEA 2CIPA 2F61A 2VCCA 1C91A 1GOIA 2LIQA 1WBAA 2KLLA 2VUAA 1XH2A 4B3KA 1JG9A 1UKQA 4TUFA 4P7OA 1QBAA 3W4RA 3V79C 4G6MA 2WHKA 3VMPA 1LQ0A 1NWRA 3N1AA 4GI6A 2ZX9A 3W6MA 2Y9WC 3P53A 2GO2A 3AJ7A 3LPGA 3NSNA 4I37A 4UOQA 2XSAA 2XUCA 3E8LC 1W3AA 2GSJA 1CVSA 3FJKA 3IIRA 3ZX7A 6I1BA 3WA1A 2CETA 2OWCA 3W24A 3VNYA 3ZIZA 3VUOA 4Z9WB 3ILAA 4UCFA 1TMQA 4ISQA 4RE3A 5DZUA 3AS0A 4OUJA 1HJVA 2WLZA 2E0PA 2VT0A 1ZBCA 1DQGA 3AMKA 3BAGA 1B9ZA 4M81A 1UKPA 3NJ5A 4HA3A 5D4YA 3U5YA 1VENA 1E5NA 3BSGA 3CGTA 1IZJA 1MWOA 3M07A 4QALA 2PB1A 2VZTA 2D2OA 1W32A 1VFMA 3CA3A 2GUYA 4BF7A 3AHZA 2DSWA 4ACYA 1HX0A 4XFUA 3ARPA 2Y8VA 4ZENA 2NW0A 1EHAA 3VIKA 2O92A 4PMDA 1E6ZA 4PC4A 1BYAA 3NCOA 2D7RA 4JZ5A 1G1YA 3W0KA 3AROA 2JE8A 2UUSA 1CNVA 1W3LA 1QBBA 1GQIA 2VC9A 3BAVA 1S0CA 3WMVA 1DEDA 1H2JA 1B0IA 3ARVA 4JFTA 1H09A 2ZICA 5FOOA 3AKHA 4LO1C 4GIAA 2DT0A 4BQ2A 1JZ8A 1FH7A 3PZ9A 2VR5A 2D44A 3MUIA 2WMFA 2XVLA 3WH9A 1BVNP 4JFVA 4MB1A 3SCTA 2OWWA 3L4TA 3VM5A 1FH8A 1NH6A 2XWEA 3AFBA 3FJ8A 1GOQA 4HMEA 2JEPA 1W9VA 2ZX5A 5FIPA 3GDBA 1BSIA 1BARA 4PBGA 5CQ1A 5DVHA 1JNDA 4RE4A 3MU7A 5EC5A 4LQ1A 2JEQA 4OJYA 4UNIA 5IHSA 1FFRA 2WB5A 3L4VA 4B9ZA 4GO8A 2KI4A 4GQRA 4ML4A 3O5WB 1DWGM 4USPA 3GH7A 1L0PA 2J25A 3KL3A 5A2BA 3VGBA 1AVAC 4KEIA 3L2MA 4JKKA 3OGSA 4B16A 7CGTA 1Q6GA 1D3CA 3OB8A 2X0YA 1G82A 4GZIA 5EB8A 2VRKA 1I1BA 1PX8A 3UJ4A 3W81A 2ZUTA 2XG9A 4D6HA 3OJ2A 1LJYA 5EBAA 4XFSA 4W7VA 3I3EA 4ZFMA 3LPPA 2X09A 1HT6A 3VIOA 4DWSA 5EFDA 1EDTA 4I4YA 2DDXA 1GONA 3PHAA 4OOUA 2V3FA 1W2VA 3BAYA 4WLCA 4QO3A 2DEPA 3OZOA 4D6JA 3CA0A 3EDFA 3LPOA 1OIFA 3ZXDA 2WYSA 4EFRA 4WSJA 4TX8A 2W62A 4I1BA 5E24E 1MC9A 2NT0A 3Q7YA 2XJ7A 1OCQA 2BNJA 4JKQA 2J7EA 3AI0A 3HBWA 1M16A 3HJEA 1A8DA 2WHLA 1W3GA 4W8AA 1LF1A 3WD0A 2GJRA 5EG6C 1BASA 3O4BA 3PZQA 1LLOA 1K6AA 4HR6C 1PIFA 5GNYA 3UG3A 3F1RA 2ESCA 4PCSA 3WIJA 2L5XA 2E4MC 4C7DA 3VT0A 5LA0A 1BYBA 5ECUA 1JL8A 1QHPA 1VJZA 3O4CA 1NM9A 2WZEA 2BEAA 3T0BA 3KEHA 1GHRA 2G3NA 3FUQA 3RIKA 2C7FA 3O4AA 1WKYA 3WF2A 1VAHA 3GXMA 1QW9A 3VUPA 2BXYA 2ZWYA 3AHVA 3MUZ1 3ALFA 2DS0A 3JRRA 1E9LA 5JUVA 1CZ1A 1PX4A 2Z48A 4MB5A 5GNZA 4PMOA 2WW5A 2Q3NB 5G00A 3CUHA 4E8CA 1EYLA 4ZXLA 1MVYA 1DLLA 3GH5A 1GQKA 4ISRA 1E4LA 3W26A 3GNRA 1J0IA 2YOCA 4TVDA 1UD4A 2DT2A 2ZX7A 1HVXA 5A6AA 4HA2A 3DHPA 1LL6A 4FLRA 4AY1A 3AH1A 3W25A 1B1YA 3RO8A 1E56A 5M17A 3VM7A 1J0JA 3K1XA 4TXEA 5HPOA 3ZC9A 2DIEA 3AISA 2NP0A 5BRQA 3NDYA 2BY2A 1E6QM 1NQ6A 3VGEA 2WVUA 3L4UA 3VT1A 3BGAA 2QHAA 4G1RA 4X38A 3CUFA 3WENA 3ZO9A 4JKLA 5BXTA 4QDMA 4UQDA 4LO1A 4MPKA 2VVSA 4Z2GA 4JIEA 1V3JA 4CJMA 2YUGA 1V03A 3A21A 1M03A 3SCSA 1V3KA 1C7SA 3C9ZA 1VIWA 4ZKTB 1JGIA 4QD2C 2J7BA 2VZVA 5I6SA 2WLYA 1H11A 8I1BA 3FY1A 4EANA 1XD0A 2Z1SA 4XZBA 4H7VA 1MXGA 1KXHA 1HJWA 1R85A 4I1EA 1H0IA 1VCLA 4JP0A 2WC3A 2Y9GA 1R8LA 2WKGA 5LA1A 4OZOA 4J2KA 1UOKA 3QHMA 3RJXA 2AOSA 2JFEX 4OWJA 3WFLA 1Q6CA 4ATWA 1QHZA 1U30A 1C93A 3EMCA 3ZR5A 3POHA 3CLWA 4BS0A 2WZIA 5CG0A 3V0AA 4UFKA 1T4QA 4NRRA 1AVAA 2UY4A 1BTCA 3DYOA 2KI6B 1DP0A 1V02A 3ZJ6A 3L4XA 3BC9A 1ZB5A 1CPUA 4MNKA 3VILA 1XHBA 2AMGA 2GDUA 2ZUWA 3PHZA 2DRYA 5FKYA 3JUTA 2GJXB 3SCOA 2YL9A 1QNPA 5BOWA 4AD5A 1YBIA 3BADA 3WNOA 1EOMA 2ZXDA 3G6LA 1GZJA 4J3WA 4UOJA 2W91A 1TE1A 4JCLA 4HTYA 1UWTA 3POKA 4A7ZA 3BAXA 1UR0A 4E8DA 2F2FA 1N82A 3PZVA 5ABEA 3WEZA 2GJPA 1IZKA 3F5JA 1BHGA 2EPMX 3AS2A 3ARYA 1UA3A 4I3NA 1BFNA 2X05A 4AD0A 1TZ7A 2ZXAA 3POCA 4F79A 2D3NA 1MFUA 4UOZA 2BXZA 8CGTA 3WL0A 3L2LA 3O44A 4H8VA 3VU2A 4HOZA 3A6OA 2NSXA 1ITXA 3VGDA 4MB4A 1D7FA 1WP6A 4PMNA 2D0FA 4HU8A 1TWMA 3W38A 3T09A 1KBBA 1BPLB 1K5VA 2BFHA 3FJDA 3WINC 1QXMA 3VD9A 1CIUA 2XSBA 3GXFA 1W1VA 2BV9A 2Y4SA 5AY7A 4UR9A 3EDDA 5E09A 4M80A 1FN0A 2WVVB 2VOTA 2PWHA 1OIMA 3AIVA 3BH4A 3QHNA 1C90A 1BF2A 4ZGRB 1SFSA 2E4MA 1AQMA 3ZXGA 1VEPA 2GZBA 3AXIA 2DIJA 3F5KA 4IISA 1PUUB 1XCWA 1KWGA 2BVDA 1M2TB 3AKIA 1E70M 4CD6A 2CHOA 3N17A 2DSVA 1K9DA 1H4PA 1VB9A 2X2TA 4J27A 1C3FA 1UD2A 4IZXA 2NTDA 3CRGA 4IONA 3WDJA 3MSDA 4KWUA 3RM4A 3GXDA 3WDIA 1UQZA 3SUTA 3SEPA 4AEFA 1W91A 1NWUA 2NVHA 4I4PA 3PZUA 3BMVA 3TTQA 4CU7A 3O9NA 9CGTA 3WO3A 2WRYA 1E55A 1HN1A 1W3HA 4V28A 2VX4A 2W63A 4EK7A 3N7KA 1HIZA 4CD8A 3BX1C 1ODZA 4J3VA 2DSKA 3MV11 2TAAA 2EEXA 1EPWA 2WANA 3OG2A 1TCMA 5F7UA 3EMQA 3HALA 4JCMA 1O7AA 2ZOXA 1MQPA 1PBGA 4H8HA 2I1BA 3VVGA 3ZJ8A 4KMQA 1OINA 3FW6A 4OUEA 3QGVA 2OYMA 4LX4A 1FMZA 5A2CA 1YF8B 4D6FA 1OD0A 1KR1A 2W66A 5A1AA 1G94A 4GQQA 4IYBA 5JLVA 4I4XA 4F9JA 4TTUA 3W37A 2EPKX 5JIPA 2EPLX 4GZEA 3GH4A 3OBRA 3THDA 2YL6A 3VD3A 1ZJAA 1ZL1A 3SCPA 2OYKA 1FOBA 1WZMA 1XRVA 1JI2A 4P7NA 1UWSA 4L4HA 1CXFA 3ARTA 1AVWB 1EHNA 4HPGA 2ZXQA 2VXTI 4I4UA 2CKSA 5HNNA 3N7MA 1VEMA 1XH1A 5I23A 1AXMA 1B31A 3F4VA 5I5RA 3UETA 1NZKA 1YQ2A 4C7FA 3PG0A 1XZZA 2YL8A 1Q03A 5HPCA 2P23A 3CAHA 2FHCA 3AICA 2DSUA 5BQUC 3OGRA 4QKSA 4ZBVB 1ITCA 4OBRA 3D3AA 1VFUA 2CXGA 3WF0A 3UCQA 3CA6A 4QCFA 1G9HA 1V3IA 1RP9A 4J3XA 1GOOA 3OGVA 4I2SA 2K8RA 3JUGA 4FF5A 3BAQA 2OYLA 1X6NA 2WNWA 4P7QA 3BA5A 4I6IA 1L2HA 3ZT7A 1JZ2A 4DCKC 3BA7A 4HMCA 2D0HA 4LO2A 4D6EA 2FGZA 1PAMA 1JF5A 1CGXA 4D0ZA 1ISXA 1JF6A 3OGFA 2RGMA 4AZIA 1UR1A 1CE7B 3M6DA 2WC7A 1SYTA 1UD6A 3ARQA 1HKKA 3IM6A 2VXRA 3DC0A 3WUEA 4GI8A 3WBAA 3WQWA 1Q6DA 3DECA 4FLQA 4K68A 3ALGA 2J3PA 1BLAA 3CHDA 4YPJA 5C71A 2F8QA 4AD4A 4F34A 3HOMA 2HVMA 1WDQA 3K1DA 3MUY1 1BYCA 4N0RA 2UY5A 3IK2A 1E1EA 5LA2A 3LMYA 2J8FA 2IXUA 2EPOA 2WSKA 2WKLA 4XV0A 3FXYA 1H1NA 3DYMA 3QOKA 1EQCA 1ISVA 1JDDA 3FJBA 3KL5A 1OGGA 1VFFA 2FDMA 3RCNA 2WHMA 2RGLA 4NRSA 1JLXA 3UEQA 4V27A 4DWSB 1FP9A 5FNWA 1HKIA 2V3DA 1B3YA 4CN1A 2XHYA 3IM5A 1YTOA 4OWLA 2WPGA 4AC1X 3CZJA 5A8PA 4AD3A 2YDQA 3WDQA 3I2AA 2WC4A 3Q7XA 2OSXA 2BFGA 1HJQA 4USOA 4U2YA 3BXWA 3BAUA 1UWQA 4J7RA 4D6GA 3NUKA 3MS8A 3WF1A 4LO0A 2XVNA 2YJQA 3WY1A 2Z49A 4R6UB 2G4FA 1GOMA 5A6BD 2BS9A 3WL1A 4BQ4A 2VZSA 3UR8A 1OSEA 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