1XYFA

Endo-1,4-beta-xylanase from streptomyces olivaceoviridis
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of Streptomyces olivaceoviridis E-86 beta-xylanase containing xylan-binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
molecule tags Hydrolase
total genus 163
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1999-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1xyfA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1xyfA02
1C7TA 1QNSA 3AJ7A 1JZ2A 2D0GA 2C8NA 1P6WA 3WD4A 4FMVA 1BASA 1KGWA 4LYRA 4PMZA 3RCNA 4IM4A 4TOQA 4E4PA 5CPSA 1T4QA 1OD0A 2WC7A 1UR9A 3VINA 1V0MA 5EB8A 4CCEA 1JFHA 4JZ5A 3K4DA 3OLIA 1EV2A 5JBEA 2OSXA 2VC9A 3CMJA 4AW7A 5A2CA 4M81A 4DUWA 1DWHM 2RGLA 5E6ZA 1GVYA 2V38A 3RJXA 1TR1A 3Q7WA 3VNZA 1VFOA 2UUSA 2YL6A 2VX5A 3JUTA 3LTQA 1H2JA 3OBTA 1QOXA 3LMYA 3T08A 4H8VA 2EBNA 4TVDA 2VMFA 4MJ4A 3QR3A 4EE9A 4AEEA 3VUPA 1Z2VA 2ZUVA 2YA0A 4WLCA 1VBUA 1PUUB 2DRYA 1HIBA 1HL9A 1PX4A 3AHTA 4CD5A 3ZR5A 3A47A 1HKMA 3CA5A 4D6DA 3TTSA 4J3XA 3VOCA 2ZUMA 4G6JA 4PMXA 1D7FA 4AZBA 3ARVA 4AZGA 5A8PA 2D2OA 2WSPA 3BAHA 2J8FA 1BAGA 2CXGA 3OB8A 1OD8A 1W9VA 4QBVA 2WBGA 1XCXA 1E6PA 3O4BA 2X0HA 4CN6A 4W93A 3CQAA 1W32A 4XZWA 4S3JA 1C8XA 3VSZA 2VU9A 1JXKA 3OIHA 2EXOA 3ECQA 1VENA 1GOOA 1OIMA 4JKQA 2WC4A 2JEPA 4CD7A 1GHRA 2ZXAA 4JAWA 1J18A 4G1RA 5LA1A 4D1JA 1Q1UA 1OIFA 3WIJA 3PHZA 1GUVA 3T0BA 1V3HA 1JFXA 3BH4A 3UD7A 3JRRA 3AISA 3QYDA 4X38A 1UKQA 3UJ4A 2WANA 2VO5A 1M53A 3DHPA 4FLSA 3HALA 2D43A 2PWFA 3OLDA 2FH8A 3CUGA 4QLJA 1ZBVA 1HKIA 4EK7A 3RM8A 3AZWA 5I1BA 1GPFA 1JF6A 1W9DM 3C9ZA 1VF8A 4MB1A 4DUVA 2DH2A 4D72A 3OGFA 3EMCA 4FLRA 5FZUA 2J62A 3FXYA 4YHEA 1V3IA 1BLIA 1VJSA 2IXUA 3WD1A 3MMUA 3WMVA 4W8BA 1H49A 3AFBA 2CESA 1US3A 1ITCA 3CGTA 4Y7EA 3VGFA 1CGVA 2O9RA 2OYMA 4UZSA 4TX6A 2PF0A 1JI1A 1JF5A 4NF7A 3HJEA 4KEJA 4WIWA 4N0RA 3GZAA 4BQ5A 2WNWA 2KI6B 3MS8A 4D6IA 1PX8A 4QD2C 5DT5A 1FWVA 3VSFA 4QLKA 1BYCA 4JKXB 4I8MA 2ESCA 1GVIA 5FD0A 4C7GA 3CLWA 1WZAA 4LXFA 1BHGA 1HWPB 1PEZA 1AVWB 3PZTA 1JY0A 3N17A 1G5AA 1V0LA 1VB9A 3H6RB 2XWDA 4PTMA 1O7AA 2J47A 4BQ2A 4QDMA 1F31A 3M07A 1E43A 1V08A 3FNDA 4JP0A 2V3GA 3WQ8A 1S0DA 3OLEA 2ZWZA 4B9ZA 2CHOA 3BXWA 3RTIB 4AIOA 3Q7XA 6I1BA 1V0KA 3VX0A 1MQQA 1SR4A 3TTYA 4UFMA 5A3HA 1I1WA 2C7FA 4AY1A 4MAVA 5HPOA 3AI0A 1E72M 1EIBA 3AH4A 1R87A 4DWSD 3AS0A 4KBBA 3WEOA 3WELA 2DSWA 5EMYA 3VD5A 4PMNA 1CWYA 1DQGA 3CA6A 3BC9A 5HBFA 1DWJM 5DF0A 2VZTA 2DT0A 5JBFA 3N7LA 2HVMA 2E3ZA 3AQUA 1BPLB 3IM7A 2IWTB 4CCDA 4X0NA 2XIBA 2LIEA 1O6IA 3OJMA 1NOUA 3VMNA 5TD4A 1W3GA 3N7KA 2XVNA 3WUGA 3MMWA 2WCSA 4U5IA 3IAPA 2YLLA 4MNMA 2J7HA 1E15A 5FKYA 2ERMA 3AROA 1HT6A 4W7UA 1UWSA 2J3PA 3ZM8A 3DYMA 3IAGC 2IXVA 2X2YA 5F8WA 1M16A 6TAAA 4D0TA 1EA9C 1HJXA 3N18A 2BEAA 3O49A 4ZFMA 1RP8A 2D23A 2CNCA 2TAAA 4OIFA 2Y5EA 3FJCA 4R27A 2BS9A 4P7OA 1ISXA 4D6FA 4LPCA 4JPZA 5KZ6A 3VUOA 2NP0A 1UD6A 4GAIA 3WQWA 1XCWA 2AQZA 2RGMA 1HWOB 4QD2B 4PUDA 4W8AA 5A1AA 1W3LA 1W3HA 5D61A 1PIFA 3UD9A 1XH0A 5I2UA 2Q3NB 1RMLA 6CGTA 1W3AA 2CHNA 1B2YA 1EOMA 4GQQA 5D9PA 3DC0A 3FUQA 5BXTA 1A3HA 2VR5A 3AZSA 3FHQA 4PTWA 3VDAA 1SMDA 1HCDA 4MPKA 4I4PA 2WRYA 2GDUA 1JGIA 3ILAA 4KRTA 2VT0A 1OBAA 1TZ7A 1ZL1A 2WMGA 1Y7VA 4J3VA 2OSWA 1XZZA 1UWIA 4MDOA 1XRVA 1AQ0A 5FL1A 1TA3A 3FJDA 1E0OA 3WDRA 3WINA 5HXMA 1I1BA 3BADA 2V3DA 2FGLA 1WKYA 1KXTA 3EMQA 1B31A 5BVPI 2E0PA 1M7XA 4P8WA 1JZ6A 3CA3A 1S0CA 1GORA 3CAHA 2DIEA 3GM8A 4A7YA 1XSIA 4OKDA 3QHOA 2ZX8A 1FHDA 3DECA 5EFDA 4I4UA 3AJ5A 4V27A 4J27A 3NBDA 1VEMA 1BARA 1LJYA 1A8DA 1MFVA 2VL4A 2VCAA 3NDYA 3W6LA 3UR7A 1XGZA 1TWMA 2J7EA 1B1YA 5FL0A 1AXMA 3RTJB 5HPZA 2WZHA 4PSPA 4UQAA 4IUGA 4PCTA 4CGTA 1JTCA 3O4OA 2A3BA 3RM4A 4Z9WB 1EDTA 3VIFA 4JFUA 4NZCA 1W9PA 1FWUA 1HWNB 1EGZA 4IHZA 4TTUA 3AMGA 5BP5C 3WA1A 1UWQA 2W63A 4IY8A 2OWCA 2QF8A 3AHVA 4D6GA 1LWHA 1EDGA 1ESWA 4BA0A 5DFAA 4C7DA 5E9AA 1C7SA 2WVVA 1XD1A 1GHSA 3WD0A 1GCYA 3VD7A 2FH6A 4BF7A 5JIWA 3UERA 3BAJA 2WAGA 2CYGA 1HN1A 1E3XA 4QO3A 1JIBA 5KEZA 1UZ1A 5FIPA 1JAKA 2XHYA 1CXKA 2PWEA 2XSAA 2YKKA 4GZJA 3WF4A 2V5CA 4IY9A 3BCFA 2WBKA 3AIVA 1JT7A 3WDHA 4IZEA 1DWFM 3W38A 1LQ0A 2GJXB 3CRHA 4AZ5A 3UCQA 3MANA 2WVTA 2BXYA 4DUXA 3VGDA 1HF6A 2G3JA 5ABHA 4UOJA 1WZMA 1JNDA 1H41A 5I6SA 3FJKA 1UWUA 2VCBA 5EBAA 1BFBA 3MV01 3ZO9A 1G9BA 1GZJA 1YBIA 2XOAA 3VILA 1UHVA 3VMOA 1EYLA 3BAVA 4LO3C 5B2HA 5IXEA 4PMQA 4P7RA 4OWKA 3AMKA 4HP5A 3CRIA 2YA1A 4MNJA 4JFVA 1NUNA 2DS0A 3WH9A 1UA7A 3AKHA 1CLVA 1R8OA 1CXEA 3VGEA 4USOA 4UQDA 2DPEA 5M17A 4DM1A 3CZ8A 2FHCA 3G6MA 4RE3A 3K1DA 4ACZA 2V5DA 5DSSB 1OB0A 3F62B 3W53A 2BV9A 4HMCA 4JKKA 4W85A 1PZZA 5ABFB 1KBBA 2WMKA 5CJ5A 1GJWA 3D5HA 2MLLB 4CD4A 2GSJA 4JL1A 5A8QA 1JYVA 2E40A 1YHTA 4EKJA 1E4NA 8A3HA 2ZUNA 4I4OA 1EPWA 4AZHA 1IHKA 1UR1A 4ZXOA 4IPLA 4WSJA 1IRPA 2VQUA 4PUEA 3F1RA 3CUJA 5IFTA 3BAIA 1B90A 1E0WA 3FJBA 3A22A 2WZIA 1ONKB 3I2XA 1FV2A 1ITBA 1E6RA 3F5JA 4LO8B 1AVAA 3BAXA 5DVHA 4XB3A 4HZ8A 4I4SA 1K9EA 2CBIA 3OLGA 4ML4A 1XSKA 3GXIA 3JUGA 4HU8A 1GJUA 3S6TA 3U57A 3VT2A 4L4HA 2QYIB 1EQPA 3BA4A 2BNJA 1E40A 2JIEA 2Q9XA 2JE8A 2OWWA 5I5RA 4Q9GA 4KMQA 3BAGA 2CKSA 1GOMA 4C7FA 4HOZA 4FLQA 3I3BA 1FH7A 2CERA 1YXWA 1OSEA 3GXFA 4P8UA 2NTDA 1FGAA 3WUEA 2WW5A 3AOFA 2Y9XE 4U3AA 5D4YA 4OWJA 2Y9WC 4CUCA 3PMEA 4JRAA 2XM2A 2XM1A 3BMVA 4LO0C 1FH8A 3E1F1 3S8KA 4L4PA 3VD9A 1JD7A 5CLTA 3MPPG 2BY3A 4UCFA 4V2XA 1TP0A 3U5YA 4ZENA 1UR2A 4M29A 1ZBKA 4YPJA 4J3TA 3A3HA 3RMXA 3FJIA 4TTGA 3PZVA 1CXIA 2XFRA 5A95A 1FMMS 3AS3A 1VFFA 4PCSA 4H04A 4B9YA 4ATLA 1LF1A 4Z2GA 3T2PA 3WQ6A 3A21A 1G9DA 1T9FA 4I1BA 1QPKA 3RJYA 3WMSA 5I0DA 1VCLA 2ZX5A 2D0FA 2VSEA 4ISQA 4OOZA 3PZQA 2ESUA 3MUAA 1IILA 1CPUA 1KCKA 1UKOA 3HN3A 3AIEA 4P0LA 2K4AB 2X2SA 1GQKA 1UG6A 1E56A 1TFMB 1V02E 1W3JA 3GH5A 2ZR1B 1UOKA 3W4RA 5M03A 4W8LA 4J23B 3W29A 1PZ3A 4FGFA 4CN1A 2CETA 2BFHA 2F8XC 3WH5A 5CGTA 3S2CA 4ATDA 4DWSA 2Z48A 3WKZA 8I1BA 3UG4A 4ZGRB 1CBGA 3VO0A 4JFWA 1PPIA 3L4ZA 3EDKA 3OZPA 2XWEA 1C92A 3W25A 3IIRA 4J2YA 3WFZA 3SUVA 4OBRA 3AJ6A 2VX4A 1C90A 2VZUA 1BSIA 3LPOA 4U33A 1BGAA 3QR5A 1VAHA 4U2ZA 3BAKA 3UESA 3HBWA 4AZCA 4D71A 4IPNB 3VIMA 1W9XA 3RDKA 4UFIA 1MW1A 4HOWA 2WYSA 1NZKA 4JHOA 3U7VA 3SCVA 1W1PA 3ARQA 3WNKA 1SYTA 1NP0A 1CGXA 1WP6A 3VDCA 1HJWA 1KQZA 3K46A 5D8ZA 5LA2A 2AMGA 2ZXDA 4RL3A 1X1NA 3H6QA 1DZDA 1RY7A 41BIA 4GXPA 1J9YA 3AIWA 2FGZA 1ISVA 3GNPA 4B15A 1CEOA 2KLLA 2WSKA 2D24A 3O3QA 2XGIA 4UOQA 5GNYA 3O4DA 1UQZA 3VD3A 3T09A 3H6RA 2VUAA 1W9UA 1WDQA 3ARUA 3W82A 1BYAA 3ALFA 3AHZA 3VMPA 1JI2A 3CA4A 4AEFA 3VGHA 5C8BB 2E4MC 3LPFA 1HJQA 4UFJA 3VPLA 5C71A 3T2QA 2UWFA 2F61A 1G1YA 2BVDA 2FDMA 4I96A 1DLLA 4I37A 1KBKA 4ISRA 3OGSA 1J0JA 2WC3A 3NSNA 3ZJ8A 4W84A 4BQ3A 1WZLA 2JEQA 2WMIA 1J12A 1YTOA 3N0KA 2WKLA 3PUBA 4W7WA 3CPUA 1CLXA 1E1FA 3NYDA 1QHOA 1UPSA 3I2AA 5EFFA 3O4CA 4UFLA 5I79A 3EDEA 2FGFA 1V6UA 4F34A 4E8DA 4OBSA 2DSUA 4ZE5A 4LO7C 4LQ1A 5JLVA 2VJXA 2GK1B 3VT1A 2AXMA 1EO5A 4WKHA 1W9BM 4II0A 1Q03A 4PRWA 1CXHA 4ZE4A 2GO2A 1SR0A 3CBWA 4WKAA 1OT1A 4JHZA 3EBVA 1BYBA 1NWRA 2J8GA 1MW3A 1QQKA 3HMYA 3FGMA 1OGSA 1WD3A 3VIHA 4P7LA 2Y4SA 3I3EA 4AD3A 3CZKA 2XVLA 4H8UA 2DT1A 1U33A 1WO2A 3ALGA 2EEXA 2WPGA 1FFQA 2Q8XA 4J2SA 1B3WA 3UG3A 1I1EA 3DYOA 9CGTA 1QW9A 3WEMA 3WH6A 4P8VA 3K8KA 1ZBWA 1B0IA 4EKXB 3HOMA 1TTUA 1C91A 1V6XA 2DEPA 2EPLX 1EDQA 3B9AA 1G94A 4MB5A 1OINA 4JQ0A 5CZKA 1UKSA 1WBCA 3VDHA 3AMLA 1K5VA 3WO3A 3WF3A 1DWIM 4UFHA 1HKKA 3VTRA 1RP9A 3AIRA 4TX8A 4TVCA 3VEQA 1B30A 3L4XA 5JUVA 2J25A 2O9OA 3THCA 4CD8A 1UD8A 1S0FA 1V3LA 4JL2A 4XFUA 2D1ZA 5A8NA 1V02A 4I4XA 3AHYA 3VIJA 4M1RA 2F2HA 3K8LA 3VD4A 1CE7B 3AHXA 1RD6A 5M3WA 1A47A 2WVSA 1XG6A 1QHZA 3VWCA 2CBUA 4E8CA 1W1VA 5I77A 2ZXQA 4AN6A 4U3CA 1DWAM 5JBDA 5AY7A 4G9NA 4D0ZA 3BRGC 1G9CA 4FVVA 3SUUA 2GUYA 1QNOA 2E4TA 3V0AB 3ARPA 1V3MA 2W62A 5DZUA 4HA1A 5A8OA 2W91A 1PWAA 5ECUA 4UQ9A 4GPNA 2CBVA 3NJ3A 1M2TB 2X1IA 4LO7B 3BSHA 4JFTA 1OM0A 4J3SA 1N82A 3A4AA 2XSBA 1MQRA 4B3LA 1DP0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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