1ISZA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with galactose
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
total genus 160
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1iszA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1iszA02
4EFPA 4TXEA 1GONA 4LYRA 2RQ9A 4J3XA 3N0KA 1ODUA 3WNOA 1ODZA 4CVWA 1E0XA 5F8YA 3N1AA 1CGWA 1HWPB 2VO5A 2NYYA 1CEOA 1UH4A 2YUGA 4NZCA 2EPMX 5BXSA 1HKJA 3AXIA 3O3QA 2YOCA 2DEPA 4OOZA 4X0VA 1CXHA 3FN9A 3AS3A 1ILR1 1J0YA 3CA1A 4MDOA 5CXPA 3RCNA 1TWEA 3RTJB 3WMUA 1TVPA 2R9KB 5I1BA 3KL3A 2ZXQA 1D2KA 3HMYA 4Q91A 2D24A 1B3XA 1JFHA 1XHBA 3AQUA 4GI9A 3WENA 4IUGA 2XUCA 3EF2A 3OLGA 3T08A 3ARZA 1KXHA 1SR0A 2D7RA 1MW3A 4QD2C 3S8KA 1M53A 4HOZA 1W1YA 4P8UA 1DZDA 1QHPA 4UQ9A 4IM4A 1G1YA 3AMCA 3IIRA 3LTQA 1VENA 3VM7A 2OWWA 4U3CA 5TD4A 1FFQA 2DT3A 4IPNB 3HSMA 4FK9A 1GVIA 1EH9A 1W3HA 2XWDA 1H09A 3QOMA 4TTUA 3T2PA 4USOA 1HT6A 3AZVA 1BFNA 1PJ9A 4HA1A 1XZZA 2EEXA 3O6AA 2VZSA 3QHMA 1IOBA 4HOXA 2WSKA 1C7SA 1YHTA 1R86A 2EPLX 1R87A 1W9PA 1V6VA 3RO8A 1UA3A 1E56A 4USPA 2DH3A 1GNXA 1BGAA 5BQUC 1E6XM 5BP5A 1JF6A 2E9BA 4D6IA 4E2OA 4NRRA 1Q6DA 1C93A 1TFMB 1V02A 2V38A 1YBIA 3H6RB 2VVSA 1P6WA 4U2YA 2B31A 2V5CA 1PZ2A 1XGZA 4Y7EA 3AHVA 4EB2B 3VOCA 2NVHA 2V5DA 1GHRA 3WD4A 1EXPA 1XSKA 1FOBA 3FHQA 1W9DM 1BA7A 2BY2A 4I8MA 4ML4A 2X0YA 2GK1A 1WD4A 1DIWA 1TA3B 2WHJA 2DPEA 4U5KA 4ZFUB 2Y24A 1BFGA 3FGMA 2D43A 3VIFA 3SEPA 3S2CA 1R7AA 3U7VA 3KMVA 4I4OA 3UD8A 1DTUA 1L2HA 3VNYA 3F5LA 2ESUA 4BCEA 1E6ZA 4D6DA 3AICA 2FDMA 4ZE5A 1AVAA 3AYSA 4DM2A 4L4PA 1KGXA 4Z2HA 2DSKA 1FV2A 4WSKA 1Q6GA 2X2SA 1YQ2A 5JLVA 3WQ8A 2BNJA 2VRJA 2WC7A 1AQMA 1BLAA 3CUIA 4AD0A 2FO1A 4JFTA 1HIZA 2DRYA 2K43A 3FUOA 6I1BA 1W1PA 4HOWA 1M03A 1UOKA 4HTYA 3BAXA 1W3FA 1FH9A 2XSBA 3A4WA 3TTOA 2ZUMA 1GQJA 3ZJ6A 3PZTA 3HMCA 1JDAA 1Q6EA 2Y8VA 1JDCA 5BVPI 2EPNA 4AZCB 3O4AA 1DZCA 4IYBA 4GZEA 3KWXA 1ZBWA 2DDXA 1ISXA 2XG9A 3CA3A 2QN4A 1BQCA 1EGZA 1EO7A 2TAAA 4R6UB 1SZ6B 1U2YA 3BGAA 5HXMA 1M04A 5A8MA 1JTCA 3H6SE 2NM1A 2DT2A 1G9CA 5CLTA 3KL0A 3SCTA 4CU6A 3EDEA 1S0CA 3NJ3A 3AH4A 1EA9C 4D6JA 3KEHA 1E0WA 2YDSA 3JUGA 2XM2A 4ZFWB 3OBTA 4C7FA 1V6XA 1C7TA 5DSSB 2ZIDA 3OG2A 2OWXA 4EE9A 3MANA 2E40A 2MLLB 1B1YA 1BG9A 1K9DA 3A3HA 2ZUTA 3WFLA 1E4NA 2NTDA 1MW1A 5BWFA 4D6EA 1VFUA 3IAQA 3CMJA 4D0ZA 2F8XC 1V3JA 1W9XA 2YA2A 5I24A 4AZGA 1S0EA 3CAHA 4WKFA 1AVXB 1LWJA 1FA2A 1ITBA 1ZJBA 3DC0A 2NW0A 5ABEA 2UWFA 1XD0A 3VDHA 1WZKA 3ILAA 2CITA 3FJJA 1E71M 2YL9A 1KB3A 1E1FA 4EFRA 3AH2A 2WBCA 4JFSA 2J3PA 4PMNA 2F2HA 3ECQA 4QLKA 4LO7C 3ZSTA 1HNYA 1BTCA 3CTTA 2WBKA 3WO2A 2P23A 2NT1A 5CSYA 2D2OA 3U5YA 4UNIA 1H0GA 1H41A 3BTAA 4UQBA 1FMZA 3CA6A 2VRQA 2OWCA 1JF5A 3UR8A 5HDRA 1JT3A 3ARYA 3EDFA 3MO4A 2OYLA 2FGLA 3O4BA 2XFRA 3AJ7A 3VX0A 4UCFA 4H2CA 1W2PA 1HJQA 4X3AA 2X2TA 1B3ZA 4D6GA 4OWJA 1FWVA 4C7DA 4WLCA 4V28A 1R8NA 2D22A 5BQUA 2BXYA 2CHOA 1WZAA 5F8WA 3VGDA 4ACZB 3JUTA 4JKMA 3HALA 5C71A 4BQ2A 4WSJA 3RIKA 3DYOA 4UFKA 1LLOA 3O9NA 3N7MA 1OGSA 3GNRA 3DHUA 5HPOA 1GQKA 3NUKA 1MFUA 2WVTA 1Q4NX 3CUHA 4HZ7A 4LQ1A 4R27A 1NWUA 1BASA 1ZJAA 4HJJA 2CHNA 5DO8A 3WNMA 3AMGA 4UFMA 4P8WA 3AIRA 2XVPA 1R8LA 2VRKA 1EHAA 3N15A 1J0ZA 1R8OA 3P53A 1JZ8A 1CVSA 1C3FA 1UR9A 2Q9XA 2X2YA 3SNVA 2DRZA 1GOQA 2YJQA 6A3HA 1MW2A 3BAYA 3VM5A 3T8SA 4C7GA 4HPHA 1JT4A 1FQ9A 2BS9A 1EIBA 2WSPA 2CBJA 3FJIA 1G94A 1V0MA 2WVSA 3WNNA 2UY5A 4P7OA 1MYRA 1PEZA 2W67A 1FP9A 5D61A 3L2LA 3A23A 3WUEA 1WO2A 1UG6A 2VX7A 5GAQA 3VUPA 4NSBA 2I1BA 1UWIA 4UFIA 4ZXOA 1TOOA 4JKKA 4LO0C 1D7FA 2GJXB 3F1RA 5JBEA 3ARWA 4X39A 2VZOA 1PUMB 2CYGA 1C90A 1JL8A 1J18A 3B9AA 5A3HA 4WIWA 1V02E 2VVNA 3FNDA 3AJ5A 3N11A 4RE3A 3M7SA 4LO8B 3SCVA 5D9MA 1U30A 3IAGC 1X6NA 1JZ3A 1TFVA 1DWIM 2GUYA 1PUUB 2CCRA 2LIEA 1CLXA 3G6LA 3LPGA 4MB3A 5C8BB 4AC1X 1E5NA 2G3MA 1NP0A 5BXTA 5JIPA 3O2LA 3AHXA 1NWTA 3OJMA 1E3XA 1XH1A 2BY1A 1BHGA 4ACYA 1B3YA 1KR0A 4BQ3A 2C7FA 3H6RA 2ZQNA 3HJEA 3WFZA 3IJ7A 4UQAA 4EAMA 2J78A 4DWSB 3W26A 6CGTA 5E09A 4AIEA 3FHAA 1TG7A 4NI3A 3VMNA 1CGTA 4QCFA 3FJKA 2VXRA 3VSFA 3L4VA 2HWMA 2V3EA 5GNZA 3EBVA 4CD5A 3VGHA 5FL1A 5IXEA 3CGTA 3WD2A 4IZEA 5FNWA 3L4UA 2G3NA 2RGLA 2J7BA 1O6IA 4KMQA 5FNXA 5D63A 3WELA 4PMQA 1UKOA 1QNQA 3UR7A 4AZIA 3P6JA 2WB5A 2JFEX 3WF4A 4KBBA 4EFQA 3SUTA 5ABFB 2PBOA 5M3WA 4JKLA 5ABGA 3E8LC 1ISWA 4KGLA 3SURA 2VUAA 2UY3A 3BCFA 1QI5A 1GJWA 3ALFA 4H7VA 2WHKA 1WD3A 2WKLA 4FVVA 5I78A 4FLSA 4AN7B 2O92A 1G9BA 2WAGA 1UR8A 2PB1A 3D3AA 5A1AA 3AMLA 4AY1A 3VD3A 2FDBM 5DVHA 2WKGA 4V27A 3UD7A 4M82A 4J3WA 2BY3A 3A6OA 1VFOA 4PUEA 3RM8A 1FP8A 3ARTA 5JIWA 3PG0A 3T2OA 31BIA 5GQBA 3GZAA 4AZCA 3ZJKA 1UR0A 2KH2A 3K1DA 3VTRA 4MNJA 4YPJA 1X6LA 3F5KA 3RILA 4GOVA 5EC5A 2X0HA 5FCZA 3VIMA 3AHTA 5CZKA 5F8SA 4HMEA 1B0IA 1QHZA 1QI0A 1CXIA 1DHKA 2VCBA 4D71A 1W3LA 5B2HA 2WVVB 3GNPA 1HP5A 3CZ8A 3PBGA 3FUQA 4QC4A 1UWRA 1E43A 2GVYA 4DWSC 4KGJA 4PN2A 5EFDA 1E73M 4GI6A 4E8CA 3I2XA 4DEPA 3EMQA 4CD8A 2FH6A 3DHPA 3ZC8A 4TVUA 1GQIA 3R4UA 2HVMA 1E3ZA 1O7AA 5JBFA 3WD1A 1BSIA 2RSTA 2XWEA 4I4PA 5D4YA 3A07A 2Z1KA 2CNCA 4CU7A 4UOZA 1JXJA 2E8YA 4J3TA 3AS2A 3BA5A 1DP0A 4KRUA 4GPNA 2YBUA 3PUBA 3CLWA 4Z2GA 3ZMRA 5LA2A 3SIMA 3WBAA 3A22A 3O49A 3NDYA 3A4XA 2VMFA 1BARA 2VQUA 4GIAA 4WF7A 5HBFA 4A4AA 4LO0A 4F8XA 5A8OA 1GOIA 5D9OA 4W7VA 1VB9A 3WO3A 2CEQA 1MQRA 3GXMA 1NOWA 3NSXA 1G9AA 4NF7A 3ZXGA 3WQ5A 1EYLA 1FV3A 1I1XA 1JZ7A 1BVZA 4A3HA 4KC3A 1WDQA 2EBNA 1UHVA 5E9AA 3PHZA 1B30A 3CUFA 2CESA 4M56A 5D8WA 2VSAA 2YLAA 1LWHA 2Y9GA 1XH0A 1UD2A 3AMDA 2QF8A 3VIOA 3ZC9A 1J0KA 1OGBA 4G9MA 1H49A 5DZUA 4D1JA 2ET2A 1NQ6A 3K46A 2J4GA 3BAOA 3F62B 1QW9A 4PBGA 3VGBA 3WH8A 4P0LA 3K8KA 7TAAA 4BQ4A 4W5ZA 3WEZA 1JT5A 3OGFA 3E1F1 3R4SA 1HCEA 1OINA 1PIGA 2VURA 4PUDA 3V0BB 3FJ8A 1JAKA 1H0IA 3G6MA 2UUSA 2NT0A 1EPWA 2XFYA 1KQYA 2W4XA 1IV8A 2E4TA 2AMGA 8CGTA 1PPIA 2XVGA 3PZGA 3T09A 2WPGA 1I1BA 4LXFA 4IONA 1LL6A 1H3GA 5BROA 2JIWA 2IXUA 2UY2A 2G8ZA 1VBUA 4P7RA 5LYRA 2WNWA 3CUGA 4IQPA 5CPQA 2GDVA 3CH9A 2DSWA 4W93A 3BRDA 1XSIA 3WUFA 1JZ5A 4DUWA 4IHZA 4PMUA 1KQZA 4X37A 4AD1A 4UQDA 4M80A 4QO3A 1Q04A 3QGVA 4BZYA 3LPFA 4JP0A 2FH8A 5GNYA 1TUXA 5A69A 1CNVA 2C8NA 3U7BA 5CPSA 1GUVA 2BHZA 1XC6A 3PZIA 4HZ6A 2DGAA 1J12A 2GJXA 2WMIA 4W8LA 2VNCA 3L4ZA 4EKXB 1C92A 2EQDA 4PMVA 4BS0A 3RM4A 1JZ2A 1W32A 3VD9A 1OQLB 2AAAA 1KBBA 4CN6A 2WMFA 3AS1A 1EHNA 2J79A 1HKKA 2WANA 4V2XA 4EKJA 5C70A 4FLRA 3O4DA 1JLYA 3IJ8A 1C8YA 1NUNA 2JF7A 1WB0A 2Y8KA 1YYNA 2VOTA 1UPSA 3W4RA 4W8BA 2Q8XA 4P7QA 1LQ0A 4AD4A 4B9YA 1NM9A 1UWTA 1UD5A 2XIIA 4F34A 4PCSA 2VCAA 1D0HA 3SUVA 2ERMA 1M2TB 1ZU8A 2ZX5A 4DUXA 1MQQA 1DQOA 3MUY1 3RTIB 1AVUA 1RP8A 2FHFA 1F4AA 4MB5A 2ZWYA 1DWHM 4DWSA 5FIPA 1MW0A 3APGA 2ZX7A 3K8MA 4UTFA 4XV0A 1M7XA 4IY9A 1TZ7A 4MNMA 3M07A 2A3BA 3AIUA 1BYCA 1G0CA 3ZR6A 1RPKA 3UEQA 2G3IA 1II4A 4NRSA 3MS8A 3NJ5A 1W9VA 3II1A 3Q7YA 1HJWA 3OGVA 4CCDA 3SCNA 1DFQA 3WUBA 5KEZA 2GSJA 3IK2A 3DECA 4QP0A 4LX4A 1HVQA 4P0KA 4PMRA 2BHYA 3GH7A 1K9EA 5ECUA 5GNXA 3A4AA 3QR3A 2OSXA 4QFUA 3OGSA 5E0CA 3NBEA 3FY1A 1F31A 3WQ4A 2CKSA 4I1BA 1Z32X 3VVGA 2JEPA 3BAKA 3IJ9A 1E6NA 4TVCA 1SYTA 3PZVA 1AFCA 2X8RA 1UR2A 1XCXA 4YN5A 3PMEA 1QHOA 4GO9A 1W1VA 4AIOA 4I37A 3ARXA 4P0JA 1SFSA 4DUVA 1V3MA 2KKIA 5A6LA 5JBDA 2Y4SA 3SCOA 3WA1A 2J75A 1KWKA 3VNZA 1SMDA 4BF7A 2K4AB 1LL4A 3BSGA 3AJ6A 1IRPA 4PYSA 1BYBA 3D5HA 5A8QA 4KRTA 1B31A 4PEEA 1US2A 1DWAM 2BV9A 4WJXA 3EMZA 5A6AA 3W37A 4I4VA 1B90A 2Z49A 3VMOA 4BQ5A 3QHOA 4CD6A 3EYPA 3AHYA 5HNNA 3WKZA 2Y9XE 3ARQA 1AF9A 3MSGA 3VDBA 1I1WA 1JY0A 4JCLA 4TUFA 4II0A 2WVVA 4OWKA 1KBKA 4HMDA 3WD0A 4F9JA 4F79A 1K9TA 3WH5A 2XHYA 4BA0A 2AAIB 2FGFA 2D7IA 1EO5A 9ILBA 4Z2JA 3BAGA 1MD6A 2J7CA 5A6KA 4W89A 1EQPA 4DWSD 1EDGA 1EV2A 1VIWA 1BYDA 3VX1A 2XOAA 1WE5A 1ZBVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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