1V6VA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 3(2)-alpha-l-arabinofuranosyl-xylotriose
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
total genus 162
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6vA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6vA02
4HMCA 2E4MA 3CZ8A 3ARXA 2QYIB 4URIA 4TTGA 4EFQA 2BFGA 2FH8A 4PUEA 4TUFA 4B3KA 3K1DA 2WLYA 2GFTA 4FVVA 2A3CA 1E4MM 5I6SA 3CH9A 2ZUSA 1C8YA 1UKTA 4LO7C 4GI8A 3VTRA 2ESCA 2WCAA 3MPPG 3U7BA 3CA4A 2D3LA 1UA3A 1HKKA 2G4FA 3K8KA 3ZT5A 1H09A 1NWUA 1W1VA 1B90A 1E5NA 2Y24A 4MNMA 3WNPA 3WDQA 1C8QA 1JL8A 3WQ8A 4WJXA 1JZ5A 3VD9A 3FUOA 1WBCA 1SFSA 2J7GA 1HVQA 5CQ1A 4V27A 3U5YA 4AZ6A 3RIKA 4IZEA 2VO5A 1ESWA 2PWGA 1E6QM 3GXDA 1BLAA 1L0PA 5AC5A 2PWEA 4D72A 1QI4A 4AWEA 5DFAA 4JCMA 4WSJA 3LPFA 3NSMA 3VIMA 4U5KA 3HN1A 4M1RA 2NT0A 1QHOA 4XKIA 2V5DA 2XWDA 1E4IA 1ZBVA 5D9MA 1F4AA 3ZC8A 1B30A 1ZBKA 4PRWA 4F66A 4CJMA 4TXEA 3AZTA 1PIGA 1SR0A 6A3HA 5F8SA 2G8ZA 2FH6A 5EBAA 3BAHA 1W3KA 2HZ9A 4LYRA 4AEFA 3AH4A 1JYNA 5A8NA 4W93A 1WBAA 4J3WA 2W66A 2WSPA 3VGBA 1HKNA 3CRIA 1LL7A 2DPEA 1H11A 3AHVA 1GOKA 5CG0A 3VGFA 5E24E 1E6XM 2E8ZA 1W3HA 3FJFA 5EHAA 4L4PA 3CA3A 4JKMA 2Q8XA 1HJUA 1QBAA 3BX1C 1HWOB 1KR1A 2Y9FA 3NDYA 4PSRA 1W3GA 2MLLB 4F83A 3WO3A 1JYXA 4ZFMA 3AKHA 1G9CA 3WUFA 4CUCA 4E8CA 1VEPA 5F8WA 1I1EA 3BAYA 3A6OA 4HMEA 1UQZA 3BLKA 3OBRA 2FDMA 4TLPA 1ZS2A 4UCFA 5AC4A 1WKYA 4I4QA 1FHLA 4ZENA 1G9HA 4WIWA 3LTQA 1OBAA 1WCGA 3AROA 4LO3A 1R85A 2XGIA 1E70M 3P6JA 1GJUA 4DENA 1K9FA 3CUGA 3KE0A 3BA7A 1W3JA 3EMZA 1W32A 3CZJA 4AD0A 4I4OA 4EK7A 3S2CA 3WMUA 2WHKA 2GJXA 3W6MA 3GBEA 1W9VA 4Z2HA 2XG9A 3OGFA 2C7FA 2JIWA 2DH3A 3O4BA 2YUGA 3T0BA 2GJRA 4P8WA 3AIBA 4HPGA 1Q1UA 1AF9A 1JNDA 1II4A 4I4RA 3BH4A 1PPIA 3PZTA 4EFRA 2XIBA 1M03A 2G3NA 5CGMA 4AIOA 1IHKA 1VENA 3ARSA 1JD7A 3IJ8A 2BY2A 4E2OA 3BSGA 4PN2A 4XZWA 3T0DA 2DT1A 5A2AA 3O49A 1U2YA 1JZ8A 4FLQA 3OJVA 2WCSA 3MV01 3CZLA 3BLPX 5JIWA 1V3KA 2VT0A 1QNPA 4QBCA 4GZEA 4YOLA 1FV3A 2RGMA 1BF2A 4PTWA 3THCA 1HXJA 2CNCA 2I1BA 3AJ5A 1OB0A 1YYNA 3L4TA 1OWQA 3D3AA 4II0A 1L2HA 3UEQA 4F79A 1JZ4A 1UKPA 3W81A 4GAFA 3UCQA 3WSUA 3L4ZA 3WBAA 4LO1C 1BYDA 5C70A 3EBVA 1UUQA 4H04A 4DWSC 4JKXB 1EO7A 2D0GA 1GW1A 5BP5C 1CGUA 2W5FA 4X3AA 3KL0A 1JZ6A 3O3QA 1G9AA 1H1NA 4PMDA 3VD4A 1YTOA 3GH7A 4D6JA 3W24A 1E0WA 1UH2A 1MVYA 4LO2A 1W3FA 1QNSA 4BF7A 3TTSA 2P23A 2K4AB 1E43A 2WSKA 3OIHA 4TTUA 1TWEA 4ZE5A 3CUHA 2AAAA 2EPLX 5F8YA 1W9BM 3FW6A 2OYLA 1W9UA 2WVTA 4PUDA 4D0ZA 4W8BA 4OEEA 2XVKA 5A2CA 2WRYA 3VVGA 2UY4A 4TX8A 5DT5A 1A3HA 1LJYA 1JT5A 3KWXA 1UH3A 2MIBA 1R8OA 2X0YA 2CHNA 4JFTA 3IIRA 1S0GA 1HCDA 1UG6A 2VC9A 1VJSA 4L4OA 1WZMA 1LL4A 2ESUA 3AHXA 4ENDA 3WD4A 3HOMA 4I3NA 4PBGA 4A3YA 3ZOAA 2WLZA 5DT7A 1A8DA 2J47A 2LIQA 4ZFWB 3S8KA 3BAUA 3UDAA 8CGTA 4FGFA 3DECA 1OIMA 2FDBM 2MC2A 5I0DA 4X0NA 5FNWA 1QI2A 1UR8A 4W7VA 1EHAA 2J78A 1K9TA 4CKQA 3NSXA 3SURA 2OWXA 3VIHA 2ET2A 2Y2WA 1BYBA 2YDSA 4AZ5A 2ZUNA 3WO4A 4HU8A 1A47A 3VD7A 2NZ9A 3NJ5A 1QNRA 4PEEA 3NBNA 3VIIA 3VDBA 3I2XA 5HOSA 3JUTA 2RQ9A 1FN0A 1G1YA 2Y4SA 3POCA 2D7RA 4KH2A 3IAPA 3PZGA 4NF7A 4J2YA 3GXMA 3VIFA 4ZKTB 3AXXA 4ZXOA 7I1BA 1WB0A 2WBCA 3ARZA 2X8RA 5A6KA 2EPKX 4JZ5A 4B9ZA 3WF3A 1E71M 1GOIA 3GM8A 3POHA 1R7OA 2PC8A 4AZCB 2GDVA 4WBCA 3HSMA 3VSFA 3N12A 4BQ3A 4LO7B 1JT4A 3H6SE 3SCQA 1V6YA 1E0OA 1BFNA 1H3GA 2O9RA 3AH2A 1CNVA 3ALGA 1PWAA 4UFMA 4ISRA 3VUPA 2ZX6A 2J75A 2FO1A 1DZCA 1AXMA 4PMVA 3PZQA 2HVMA 1FP9A 4QCFA 1UKQA 1QW8A 4GI6A 4WF7A 2X2TA 1FGAA 1UD2A 4F9JA 2X05A 3WMVA 1E55A 2OLHA 5FZUA 2NM1A 4JFSA 4TVCA 4OWKA 3G6LA 3WINA 2DSVA 1AVAC 5DO8A 1E4NA 4FMVA 3WUGA 1RY7A 3GZAA 4ATLA 5M17A 1UWRA 1I1WA 3RJYA 1SR4C 2VXTI 2JFEX 3OA5A 3FJCA 3A21A 3BAIA 1PC8B 3VWCA 2X0HA 4W5UA 1W1YA 2WK2A 4JFWA 3RDKA 1G9BA 1UZ4A 2FHCA 1BGAA 3ZR6A 2VL4A 4P6AA 4LO8B 2XVLA 2FGFA 1PUMB 2KI6B 3R4UA 5JBDA 2PF0A 5CSUA 5AYIA 2E9BA 4GO8A 5I1BA 3AMGA 1TFMB 2FFVA 1GOMA 2DRYA 1O6IA 5JUVA 4Z2JA 3CPUA 5HDRA 3MMDA 3WMCA 4JRAA 4MPKA 1CECA 4W84A 1BARA 5B2HA 1H0IA 1ISWA 3EDJA 3WD1A 4U3CA 1EQCA 1CIUA 2CHOA 2W62A 3IM7A 4W88A 1QQKA 5GAQA 2WVUA 3AIWA 5IFTA 4AY1A 2F2FC 1IT0A 1RH9A 3BAOA 3CUJA 3FAWA 3ZJ8A 4GP3A 1IZKA 2OWWA 3GH5A 4XUYA 4I4YA 5DF0A 4KBBA 4U5IA 1OT1A 1BFCA 1V6VA 4S3JA 2D24A 2V3GA 1CYGA 1UQYA 4W8AA 2DDXA 4X0VA 3ZT7A 3WH8A 4J2XA 1ZJAA 1JAKA 2WHMA 1WZKA 1LG1A 3VGGA 3VNYA 1BVZA 1MC9A 1JFXA 3W38A 3WNKA 2P39A 3UD9A 1JI1A 3PZ9A 3SCUA 3K4DA 1TIEA 2VX4A 1UWUA 5FZYA 3WH6A 1TMQA 4M24A 1S0BA 5BQUC 5BXPA 1K9DA 4ZGRB 4GQQA 31BIA 4D1JA 2J3PA 3VUOA 3PUBA 1EYLA 1OGBA 5LYRA 1JYVA 3VD3A 1V0MA 3LPOA 2WMIB 1W2VA 4OWJA 2VRKA 1V6XA 1C7TA 1B3WA 1V3MA 1P6WA 3H6RB 4UOQA 1SMDA 2DT2A 5EC5A 4PSPA 2Y8KA 2JEQA 1HWNB 3A23A 3MANA 1V08A 4PCTA 5BRQA 2D20A 3B9UA 1RP8A 4CD4A 1O7AA 3ARPA 3U57A 3BAKA 1TVNA 2YKKA 4QP0A 8I1BA 3VM5A 4JHOA 4MB1A 3VIGA 5HXMA 1PEZA 1YXWA 2BNJA 4D6FA 1S0DA 3FJJA 3MALA 2V38A 2VR4A 3OJ2A 3FHQA 1UWIA 3B9DA 4HP5A 4HZ8A 4UOJA 5EFFA 1EDQA 3IAQA 3BAQA 5HPCA 2VQTA 3NBCA 1E0VA 2UWFA 5A8QA 2OYMA 1SZ6B 2ZXBA 4UZSA 1GUVA 2E9LA 5A6BD 4EKXB 2D0FA 2VSAA 1J12A 2VVNA 2NYYA 4HJJA 1CGXA 4QKSA 3BAGA 3W27A 5E6ZA 5DMYA 3ARUA 4WKFA 8A3HA 1WD4A 5ABFB 1UD8A 2WZEA 4KRTA 5AYBA 4PMNA 3T2OA 5CPQA 3DC0A 3NJ3A 3EDKA 4TVDA 2ZUTA 1DFQA 1AMYA 1OGGA 1TOOA 4EB2B 5A6LA 5GNZA 2WPGA 1CXIA 4NRSA 4P8VA 3VKKA 1AQMA 5EMYA 3MV11 1AQHA 5E6YA 9CGTA 1XH1A 1B3YA 4MB3A 1MW1A 3SUUA 2OSYA 4H41A 4AZHA 3AKGA 4AMCA 3L2LA 2UY5A 1E4LA 5A69A 1CXLA 3VMNA 3A07A 4MNJA 2JF7A 4D6EA 4A7YA 1GNXA 2ZUWA 5GNXA 3AKIA 2PB1A 2XTKA 2ZIDA 3WDJA 5IXEA 1BVNP 4B9YA 3SCOA 4J23B 4Z9WB 1QI0A 1WD3A 4LQ1A 1V02A 4OW4A 3CZKA 3VMPA 2DS0A 4JHZA 4LXFA 3GNOA 2O9OA 2G41A 1FFRA 1BTCA 2YJQA 1OT2A 1NWSA 5CZKA 1VAHA 4HA2A 2WAGA 1BFFA 1WE5A 1CE7B 1W9XA 3OLIA 4JKQA 2BEAA 1FH8A 4J3UA 3I2AA 3CAHA 1L8NA 1TCMA 5I2UA 4AIEA 5M5DA 4RE4A 3BCFA 1JZ3A 4OEFA 4LO3C 1JQZA 4MAVA 4GIAA 2DT0A 1DQGA 1LQ0A 3BXWA 3W28A 3W9TA 1C90A 4IYBA 2HWAA 4J3VA 3ARVA 4AZ7A 5DZUA 3VGHA 1U33A 3DHPA 3VX0A 2WZIA 1QBBA 2HISA 3CUIA 4JFVA 3PN8A 2CERA 4IY8A 4NZCA 3WBEA 2K43A 4PTVA 2BXYA 3VM7A 3CA1A 5D9PA 1LWJA 3JUGA 1UOKA 1JZ7A 5JMCA 4AZGA 2EPMX 2WBGA 1KWKA 1HP4A 3AICA 2J7HA 1EH9A 2YIHA 3QR3A 2OSWA 2E0PA 4K68A 4KRUA 5BYWA 2CBVA 2X2YA 4U31A 3IJ7A 3CMJA 2WMHA 3CBWA 3TTOA 7CGTA 3WFZA 1EDGA 5D8WA 1NOUA 3IM6A 4JP0A 2EJ1A 4ZLBB 2TAAA 5HBFA 1CEOA 4HOZA 1ISYA 1DWFM 2ERMA 1XD0A 3AHZA 2EPOA 4NRRA 3AZWA 1B0IA 1Q04A 1UYQA 3BAJA 4W7WA 5D8ZA 5E0FA 1QW9A 4PYSA 1VEOA 4C7DA 3OGSA 3O44A 3ARWA 4W8LA 1RG8A 3PZUA 1V03A 1MD6A 4CCCA 2VCBA 1VBUA 3CO4A 3FJDA 1J0ZA 3PBGA 1KGUA 4HOWA 3AH1A 4AW7A 3FAXA 1J0JA 1J0KA 3WNMA 4PC4A 1E1FA 1E40A 2R9KB 4MJ4A 1R7AA 2BS9A 1HWPB 3WO2A 4AN7B 1US3A 3N7LA 1EIBA 2BV9A 3AMDA 2VXRA 1PAMA 3UR7A 4P7LA 4IQPA 1C92A 1JDDA 1Z0HA 1M53A 4DM2A 2V5CA 3AZSA 5HNNA 3BTAA 2XVGA 5BXRA 3DYPA 4ACZB 1JLXA 1XZZA 1DP0A 3ZMRA 1H5VA 2K8RA 3IK2A 4M8UA 3CHDA 3OZPA 2GO2A 3HU7A 1H49A 2Y9GA 3PTKA 4XX6A 5F7UA 1CZ1A 5JIPA 3VDHA 3ARYA 1PX3A 3RMYA 2PI6A 4I0YA 2BY0A 1FQ9A 2WC7A 4LPCA 1M16A 1S0CA 3Q7YA 1E3XA 1XG6A 2WXDM 3AIEA 4UQ9A 4UQCA 2XVNA 3GH4A 4H8HA 3VX1A 4PCSA 2DIEA 1GZJA 4XZBA 1HJVA 4QAWA 1CLVA 1G0CA 3QHOA 1XCXA 2JF6A 3N9KA 4R5EA 1HF6A 1MWOA 3EYPA 1LG2A 3OBAA 3MMUA 2XFYA 4NI3A 3NBDA 5FKYA 1ODZA 4P7QA 2ZXDA 1VFOA 4AZCA 2WHJA 2J4GA 4W85A 1K5UA 1JY0A 4UFLA 2CXGA 3AIRA 4BQ2A 3Q7WA 1S0LA 4JIEA 5I78A 2YA2A 1B1YA 1GOOA 1HN1A 3A47A 1E1EA 1G94A 1EO5A 4V2XA 1GHSA 2G3JA 1EPWA 1P63A 3FFZA 2VUAA 3SCVA 3AS3A 4P7RA 1M2TB 1GCYA 3OZOA 1RD6A 1R87A 5JBFA 1TP0A 1US2A 4IM4A 1OSEA 4IPLA 4TOQA 4IISA 1XSKA 1JNEA 4H2CA 3EDFA 5ECUA 4G9NA 2XGBA 3WD3A 1ABRB 2FHFA 3HBWA 2DREA 1OGSA 3QGVA 4RE2A 1FFQA 2WHLA 2FFUA 1Q6EA 3GTNA 3AOFA 2CESA 1VF8A 5EG6C 4I4PA 3A4XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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