1XYFA

Endo-1,4-beta-xylanase from streptomyces olivaceoviridis
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of Streptomyces olivaceoviridis E-86 beta-xylanase containing xylan-binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
total genus 163
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1999-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1xyfA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1xyfA02
2W66A 1KGWA 3H6RA 3RILA 5DMYA 3UJ0A 3VIMA 1PZ3A 7TAAA 5ABFA 1T9FA 1BF2A 4IQPA 4A3YA 4U5KA 3RTIB 5BQUA 3WD0A 3FJKA 4DUWA 1HX0A 3OLIA 3ZIZA 2VJXA 2WMHA 2CIPA 5EMYA 1BLIA 4L4OA 3AYRA 5FKYA 2OSWA 3F62B 1WDSA 3HMYA 2DSVA 4JAWA 3RJXA 4D71A 2HISA 3ZC9A 4MB1A 1KCKA 5F90A 3T8SA 2CEQA 2G8ZA 4W85A 3W38A 3Q7WA 4W89A 1W9DM 1NH6A 4JZ5A 3K1XA 1YTOA 5AYIA 3FGMA 4YHGA 3M46A 1BYAA 1WNOA 1NOUA 4IM4A 2UUSA 4AZ6A 4I4PA 3GM8A 8A3HA 3IANA 1J18A 4JIEA 1TIEA 3VU2A 3LLPA 2A3CA 2E9MA 3ZSTA 2O9PA 4Q7NA 2J7FA 3TTSA 3OLDA 1XH0A 1HVQA 3ZR6A 4EFRA 1R7AA 6TAAA 4IZXA 4BS0A 5D63A 3K4DA 1W1TA 5AY7A 1JQZA 2GUYA 2F61A 3MUY1 3VSFA 5ABEA 3MS8A 3A23A 1F4HA 3IJ8A 3VSZA 3UERA 2UY2A 3WD4A 1JAKA 1XSJA 2QLYA 3VO0A 3U5UA 2WMJA 3O2LA 1JDDA 1HL8A 4GOYA 2QF8A 2EPLX 2D7RA 4FK9A 3AXHA 1HL9A 1ZBWA 1GOOA 3PZQA 2JALA 2FHBA 5EBAA 5JIWA 2C8NA 4OWKA 3VM7A 3SCTA 4HOZA 1CGTA 3AKIA 1LJYA 2AQZA 1CXIA 3MMUA 3ZQ9A 2FH8A 2ZR1B 1ITCA 2W5FA 4D6FA 4OBRA 1D0HA 3WMUA 3ARRA 5AYBA 4UFLA 1QNQA 2WHKA 3SCNA 5CJ5A 4I4UA 1Q6DA 5D4YA 2WMIB 3IJ9A 2GDUA 4X9YA 1QNRA 3UESA 5I5RA 4AN7B 3WH8A 1DWJM 1CLVA 4CCDA 4GO9A 4LO2C 4A4AA 1UUQA 4FLSA 5EG6C 1JDCA 3OGGA 2D20A 1XCWA 4I4YA 2VL4A 1HP5A 2D0HA 3AIQA 4YOLA 1E6QM 3SUWA 1HKIA 1B90A 3PTKA 3B9DA 4Z2JA 5A6BA 1E4MM 4JCLA 9CGTA 1TWEA 1W91A 2DH3A 2PF0A 1FHDA 4R27A 3GXMA 4DWSB 1SMAA 3BRFA 1NP0A 4CVWA 1HJVA 4UFKA 3T08A 3S8KA 1OM0A 2VU9A 3K8MA 2J75A 4HPGA 4JFTA 1G9BA 2XVNA 4AIEA 3AJ7A 4MNJA 2BS9A 3VD5A 1RZOB 2WC4A 1LLOA 3W6MA 4P8WA 2DSZA 1E40A 1MXGA 1Z2VA 2CBUA 2OSYA 2JEQA 3RMXA 1PIGA 3WH6A 5CPQA 3UETA 2V3GA 1B0IA 4JKQA 2VMFA 2DT3A 3VIKA 3O5WB 3OLEA 1GOKA 4ZFYB 3WEOA 3IK2A 1E4NA 2UY5A 4JFVA 1OIMA 4B3LA 2DRYA 4W86A 4D1IA 1FA2A 3BAXA 5LA1A 3II1A 4PEEA 3A6OA 4EK7A 4UOJA 1ILR1 2E0PA 3MMDA 3ILAA 1ZBKA 3EDEA 4J3WA 4IHZA 5HPCA 2NP0A 4QCFA 2ZX5A 2XGBA 2E9BA 4ATWA 5I77A 2GK1B 6I1BA 4OBSA 1K9TA 4BCEA 1TWMA 4J7RA 2GO2A 2VUAA 4JL1A 4AD3A 3BMVA 1EDQA 2XSAA 3CTTA 4TTGA 3NJ5A 2MC2A 3GNRA 5LA0A 1H0GA 4UQAA 2VCCA 3KL0A 2GJXB 5FIPA 4LO1C 4D0TA 1CBGA 1LG1A 2CBIA 1D7FA 1ODUA 5A8PA 2IUZA 5FNXA 2D7IA 1N4KA 2WVVB 5M17A 4C7FA 1K9EA 2XFRA 3ARYA 1WZLA 1ESWA 4PMUA 4W7WA 3RM4A 5KZ6A 1GQJA 5HPZA 1J11A 3ECQA 4QDMA 4QLKA 1DWIM 2PC8A 3NYDA 2D3LA 3CA5A 2WKLA 4CD4A 3FHAA 1SFSA 3N17A 3ARVA 1MVYA 2CNCA 4WIWA 1AVXB 2ZXDA 3IM6A 4J28A 1BFCA 2WM0A 1PEZA 1NUNA 3OBAA 4P7RA 1UWSA 1KFWA 5DT5A 4YPJA 3FUQA 3N7MA 5FZZA 1MXDA 1RH9A 4TXEA 4PSRA 3THCA 4PMNA 2RSTA 1HJUA 3WNPA 2WKGA 2P23A 2FDMA 3WDRA 1S0FA 1TTUA 2WWCA 4X37A 5E09A 1QNOA 4FGFA 4F9JA 4UZUA 4I1BA 1BLAA 4JQ0A 3M6DA 4IPNB 5GAQA 1DQOA 1UR0A 4QD2B 5EB8A 3AKFA 4UTFA 4I7IA 3O4AA 1E6ZA 3Q7YA 4FF5A 4F34A 1UG6A 3WMBA 3O9NA 4W7UA 1JI1A 3IM7A 3MPPG 2G3MA 3SCSA 1B3XA 2NT0A 5D9MA 1W2VA 4MNKA 3WUEA 3VT0A 2K8RA 3NUKA 3CBWA 2WYSA 2GDVA 5A1AA 3CRGA 2ZUUA 4D6DA 2LIEA 4USOA 1GNXA 1Q4NX 4G9NA 4X3AA 1W3LA 2BVYA 2X05A 5BWFA 1UR8A 3TTOA 3PZVA 4HPHA 4GOVA 3WF0A 1E70M 4NF7A 1X1NA 3N12A 3NBNA 3VGEA 4UQ9A 1RG8A 2XJ7A 3W0KA 2G41A 3RDKA 3KE0A 2PWDA 4QBVA 1WBCA 4PMXA 3EMCA 3VD4A 3W28A 1FN0A 1W32A 4PCTA 1KR0A 3OBRA 1MWOA 1TR1A 1HXJA 1I1BA 4NZCA 1YYNA 4KBBA 5JUVA 1UPSA 3CZGA 1ZBVA 4AZCB 4AEFA 1XHBA 4OEFA 1EXPA 3ZJ6A 3D3AA 5I0DA 2XYLA 4IISA 1UR9A 4P8VA 3ZXDA 1I1WA 1E3ZA 4Z2KA 2X09A 3OGFA 1EA9C 2VZSA 2ZXAA 3P53A 1FMZA 4J3XA 3O4DA 1XH2A 3E8LC 1S0LA 3W9TA 3D7WB 1JNEA 2A3BA 1BGGA 2VZVA 1BFBA 1MQQA 1M01A 1W9VA 2DQXA 3MKKA 6A3HA 1DWFM 1PX8A 4AZ7A 3T2OA 2QPUA 1UWRA 2W67A 4IUGA 2WBCA 1IOBA 4PBGA 3O3QA 2ZUTA 3RM8A 4ZE4A 4PCSA 1MW2A 2DEPA 3M07A 2HW9A 4GXPA 2JEPA 1VFMA 4NRRA 2Y4SA 3CU1B 5HPOA 2XGIA 1DP0A 3PMEA 2X0YA 1TE1A 4ZLBB 1KGUA 3HALA 4TX8A 2EPKX 3VNZA 3UD9A 1O6IA 1VRXA 2XFFA 2BNJA 2HWAA 1WDRA 2VZOA 5G00A 2ZWYA 4CU8A 2J8FA 4ZFWB 1V3KA 1H0IA 2IWTB 2J3PA 1EOMA 1JD9A 4UQBA 4IYBA 3FAXA 2GJPA 3NSMA 3BA5A 3AMKA 4PTMA 5A8OA 2Y9WC 2OYMA 1EGZA 3W81A 2Y2WA 4AD0A 1UH4A 2EEXA 3RMEA 5I3DA 1V6XA 3WF2A 1IHKA 3BAQA 1BQCA 3BAKA 4USPA 4GP0A 1K9FA 1E71M 4LO3A 2NM1A 3SNVA 4U5IA 3OLGA 4CD8A 1C3FA 4XKIA 3BCDA 3SUTA 3SCOA 1UKTA 5A8NA 3A4XA 3ZX7A 1XYZA 1CENA 4D6CA 1I1XA 2WB5A 2WC3A 4RE3A 3AZVA 4CVUA 3WINC 4MDOA 3EDKA 1FQ9A 1PJ9A 3AHVA 2BXZA 1FFRA 4MADA 3OJMA 2F8QA 1EDGA 3AHZA 1R86A 1J10A 3GNPA 3VNYA 4EKXB 4PMDA 4GI6A 3WN6A 3HBWA 1JZ4A 3R4SA 1VIWA 4J3UA 2JE8A 3CMGA 1QQLA 2Y9XE 4LO3C 4LXFA 1C93A 2XUCA 7A3HA 4AZIA 1SR4A 1VEOA 3VUPA 1UD5A 4MJ4A 2AMGA 5I23A 4KGLA 5D62A 3HSMA 3OZOA 3VIJA 4JP0A 1A8DA 4Q91A 5E0CA 2DREA 2WWDA 2CPUA 2QHAA 2XWEA 1EHAA 3AZRA 2XWDA 4GIAA 4JKMA 2VZTA 1M16A 2CKSA 4Q9PA 4UFMA 4XFUA 5FCZA 2FDBM 2J79A 5I24A 1L8NA 3F1RA 4IZEA 3N1AA 2X2SA 3MSDA 2YBTA 1QHOA 1UR1A 3FJIA 4JPZA 5HBFA 1WAWA 4ML4A 5BP5A 2CKRA 3K4AA 1JZ2A 2WPGA 4AZHA 5FD0A 2DT0A 4AIOA 1UHVA 2XOAA 1EQCA 1KBKA 1WZMA 5CSUA 1SR4C 1QBAA 3IM5A 3BAJA 3CHCA 9ILBA 2CETA 3BAUA 2BY2A 2OYKA 3SUVA 1KXTA 1IZJA 4Z2GA 1UWIA 4I8MA 2CYGA 3FFZA 1RD6A 1TFMB 4DM2A 3NSNA 5A2AA 4IPLA 5FL0A 4XZBA 1VCLA 4PMQA 5IDIA 3TC2A 3WO3A 3WENA 2YOCA 3UD8A 2E4TA 5CLWA 3WMVA 2GFTA 1CGVA 1WPCA 3VGFA 3PHZA 1QVBA 4J2KA 4CN4A 1J0HA 1KBBA 4I4QA 4UOQA 4BQ5A 2CERA 4P8UA 1J0SA 3WDQA 5IFTA 2VXRA 3BXWA 1HT6A 1LL6A 4DCKC 1XG6A 1ITXA 4JFSA 2YJQA 5A8MA 2D43A 2WCSA 4KGJA 3WFZA 3BA7A 2VLCA 4QLJA 3UG3A 4F9DA 1JYVA 4QKSA 2BY1A 2I1BA 4UOZA 4CKQA 1JFHA 3BSGA 1G5AA 3OBTA 4D8HA 2E3ZA 2YL6A 3WD2A 5E0FA 3T09A 2EQDA 5F8YA 1M04A 3CGTA 3E1F1 1TA3B 4PMOA 4AMCA 4CCCA 1W9BM 1E73M 1EOKA 1GOIA 4FLOA 1B9ZA 1GZJA 2ZUVA 1RPKA 4JL2A 4AZBA 3VVGA 1FWUA 3W26A 1J12A 3FJCA 4I4SA 4H04A 1XD1A 3T2PA 4D0ZA 2X1IA 4ZKTB 3WSUA 3SCPA 4A7ZA 3VDBA 1LL4A 1H4PA 1ISVA 4G9MA 1VF8A 2RG9B 1Z4SA 3SEPA 3EBVA 2Z1KA 3ARZA 4W8AA 3VDAA 1XGZA 4EEEB 4A7YA 2DGAA 3P6IA 1M03A 2YA0A 3VT1A 2X0HA 1OD0A 4WF7A 3ARQA 4CN6A 4HP5A 1TG7A 3W37A 1CPUA 3EYPA 3CIVA 1E43A 1NWSA 1JF5A 1FGAA 2CBJA 1E6SM 1DHKA 2VOTA 2WVTA 3LPFA 1HP4A 2YIHA 4U2ZA 2WRYA 5A95A 3WY1A 5FZUA 1V3HA 4HOWA 1Z0HA 3I2XA 3Q7XA 4QKRA 2ERMA 1R8NA 1Y7VA 1V0KA 4TTUA 3W29A 4BF7A 1XSIA 3BSHA 1JYXA 1L0PA 1FP8A 5EC5A 1DJSB 2YL8A 4MAVA 3WF3A 1CGYA 4D6EA 4B3KA 1FOBA 4ZFMA 3WEMA 2XVKA 1JZ3A 2IHOA 3N13A 3P6JA 2XM2A 1GJWA 4M82A 2VRJA 5BQUC 4HA1A 2AXMA 2D22A 2VRKA 3AS3A 4HA4A 2FFVA 3W24A 3WF1A 5ABHA 1TVPA 3AZSA 4X38A 1UKSA 1QPKA 1Z32X 3LPOA 4FMVA 1KXQA 1KB3A 2ET2A 1OINA 1I1EA 4PYSA 3QGVA 5IXEA 4QALA 4I4OA 3U7BA 2D23A 3MMWA 4N42A 2F8XC 1W1YA 1ZJAA 3VX0A 3H6SE 1HJWA 1C8QA 1L2HA 1G94A 1QNPA 4CN1A 1FH7A 1X6LA 3L4VA 3ZO9A 4D6HA 3L2MA 2KKIA 1CDGA 2J7HA 3AS1A 4BA0A 4P7OA 4DUXA 3VIGA 3FJHA 3CHFA 2YL9A 1W1VA 3CUHA 2E8ZA 2GJXA 1RY7A 4E8CA 4JHZA 1EPWA 1QI5A 2WVVA 4AYSA 5DUYA 2WNWA 4M80A 5BXTA 1G9CA 3QR5A 1ISXA 1UQYA 3O4CA 3WBAA 1WD4A 1BLDA 5EFFA 4CUCA 4PMYA 1DQGA 2F2FA 3VGGA 3S2CA 4HJJA 2VX7A 5JBEA 5DVHA 3POHA 2F2HA 4DM1A 3OJVA 1HKJA 3TONA 1HKNA 2IXVA 2FHFA 3AXXA 4P7LA 3VIIA 3U57A 1JD7A 3VMOA 1CGXA 3KL3A 1Q03A 3FY1A 5F8SA 3W4RA 1B30A 1JZ6A 3QHNA 3BCFA 3I29B 1GVIA 2Y8KA 1HVXA 1FHLA 1P63A 3POKA 1BYBA 2X8RA 3KEHA 4PUDA 4I96A 3NIYA 3PZ9A 1QXMA 3UDAA 4F79A 5BXRA 3V0BA 1BYDA 4M56A 3JRRA 1GOMA 2WSPA 1R8OA 4TVUA 2KI4A 1V03A 1Q1UA 4C7DA 1ODZA 2AOSA 3IAGC 2XM1A 4UQDA 3N9KA 2G3IA 3GYCA 3SCVA 1EV2A 1RMLA 1JF6A 2QPSA 3N7KA 2BEBA 1WO2A 4M8UA 1VAHA 1BASA 2Y24A 5D61A 4G6JA 1GQKA 4GINA 2UY3A 3CRHA 4OKDA 1B3WA 4H8UA 1JTCA 1IILA 2DS0A 2AFGA 1X6NA 3GXIA 4CD7A 3FJBA 1PBGA 2M49A 1K9DA 3CUJA 4OEGA 3CAHA 1WKYA 1JYWA 4CGTA 2Y5EA 1SR0A 5JLVA 1BGAA 3CUGA 4MB3A 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