2D24A

Crystal structure of es complex of catalytic-site mutant xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVSHAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic snapshots of an entire reaction cycle for a retaining xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 166
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d24A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2d24A01
1ZJAA 5FL1A 4X3AA 3II1A 1GOIA 2ZWZA 1J10A 3K4AA 1V6YA 2EXOA 1NH6A 3FJAA 3O5WB 4IY8A 2EEXA 1E55A 3FNDA 2HISA 5A6JA 1EVTA 3H6QA 4C7DA 3RIKA 3UG4A 4XZWA 3KZSA 3ARTA 1JQZA 3O6AA 1EGZA 1F31A 4ZKTB 1Q6FA 3QYDA 3TA9A 1K9TA 2GJRA 3VIIA 2DSZA 1LJYA 3VGHA 1TA3B 2CESA 4EB2B 2J78A 4RL3A 1HVXA 4OWKA 1V0NA 3Q7WA 5D9PA 3WD1A 2NM1A 4WJXA 7TAAA 4Q9GA 4AXNA 4J2SA 4HA4A 3BCDA 5BP5C 4H8HA 2QF8A 2BNJA 3AJ7A 1FP8A 3OLDA 4IY9A 4TX8A 2XUCA 1CGUA 3W6LA 4KEJA 3AZVA 3PBGA 1KBBA 2A3HA 1E56A 4DEPA 1NOUA 1PZZA 2DIEA 2HVMA 4MB4A 1O7AA 1RH9A 2XVGA 1TMQA 4GQRA 1W1YA 1GORA 1E15A 2XTKA 3CMJA 1UKTA 5BYWA 3AXXA 1E6PA 4IYBA 1E5JA 2VUAA 4KEIA 4ZXOA 1CPUA 1HKIA 1IILA 2WLYA 3EBVA 1HKJA 1Q1UA 3VSFA 1QHZA 1TUXA 3BA7A 4MTVA 4UFLA 5FNXA 1I1XA 2X1IA 4QBVA 3OGFA 2E8ZA 3M46A 3UD8A 4AD3A 1CE7B 3AZSA 5HPCA 3G6MA 1J11A 2EQDA 3POHA 4MJ4A 3RM8A 3VIHA 3WDRA 1UZ1A 8I1BA 1CXIA 2PC8A 4GI9A 2XFFA 1KXVA 3CA5A 5IFPA 2UY5A 2WVVA 1EQPA 4PSRA 5IXEA 1IRPA 3ARPA 2HWMA 4J3VA 2PWDA 5FL0A 3H6SE 2PWFA 4W8AA 1DZCA 3CZJA 5TD4A 5CSUA 1JF6A 4IUGA 4QBCA 3NJ5A 3APGA 4GINA 2J4GA 4JL2A 3HBWA 3WMSA 1WD4A 2BY1A 2QMKA 1E72M 1QNOA 3LPOA 4G6MA 1G5AA 1E4NA 1W9PA 4PUEA 3JUTA 3AYRA 1VEOA 1V3IA 2W61A 41BIA 2XGIA 3SCSA 3AHVA 3FJJA 3V79C 2WK2A 1H0IA 1GJWA 4HU8A 1EDTA 3AS0A 2WHLA 4J3WA 3D3AA 1HJVA 3WUGA 4P8UA 1R7OA 3CU1B 1BYBA 2WM0A 2XYLA 3IAQA 4OBSA 2ZUMA 2YL5A 1TTUA 3RMYA 5I24A 1RMLA 3MPPG 1OM0A 1GNXA 5E9AA 2DIJA 3BX1C 5BXTA 1UH4A 4KEKA 3GXMA 3O4DA 1V6XA 5JMCA 4IQPA 3UR8A 4WK9A 1QHOA 5LA2A 1AQMA 4GQQA 3N7KA 4PMXA 4HJJA 1Z2VA 3U7BA 3VX0A 4CVUA 4OWLA 1JGIA 4I4OA 4LO3C 3RMXA 1HWOB 1HX0A 1JF5A 3MO4A 3W37A 3OJVA 1LLOA 1W2VA 2W5FA 5HPOA 3I3DA 4B9YA 1G94A 2VRKA 4XFSA 1R87A 4AN6A 1LG1A 1AVAC 1HVQA 3T2QA 2YLAA 4IM4A 1X1NA 4GIAA 1UR2A 1U2YA 1XYFA 3CAHA 3D5HA 3POKA 1BQCA 4AZGA 4UQ9A 3UDAA 3GM8A 4JKXB 2BV9A 2O9OA 1CLVA 1K6AA 3A4WA 1H3GA 1JZ4A 3EDJA 1GZJA 3GZAA 1US3A 4W7WA 3AYSA 4B3LA 2IXUA 4J3SA 3WINC 1KNMA 3W26A 1PX4A 2XVKA 3BAJA 2OSXA 1S46A 2J7GA 3WIJA 2ZIDA 4TUFA 4LPCA 1V6WA 4FLOA 3AZWA 3AIUA 1Q04A 3GH5A 3N15A 2R9KB 1C8XA 1EOMA 3MUAA 1NWTA 1W1PA 2WVTA 3AIBA 4J2XA 1WB0A 4IONA 4JKKA 1SZ6B 3FXYA 5F8WA 1FV2A 4CCEA 4PMOA 3WKZA 3IM7A 4PMNA 2VC9A 3TC2A 3WO4A 3I29B 3KMVA 1ZS2A 4CN1A 2WHKA 3ZXGA 1B0IA 1KXTA 4P7QA 1C90A 1V3MA 1EPWA 5DFAA 3M6DA 3WUFA 1OGSA 2VU9A 4GOVA 4UCFA 4JP0A 3BAKA 5ABFB 1KWGA 4OOZA 4A4AA 3R4UA 1QI3A 2CNCA 4P8WA 3ARSA 1EO7A 2OSYA 3BRFA 3W82A 4ML4A 1J0IA 2GK1B 3VKKA 3LPFA 4KWUA 4AEEA 2BS9A 2VCCA 2VZSA 4LYPA 1ITXA 1FH8A 1E0OA 3BAHA 1NARA 5C70A 1P6WA 5M3WA 3SUWA 1WDSA 1VCLA 4TLPA 1B3VA 1UD5A 3FJHA 4R6UB 2ZX9A 4WKHA 3NBDA 5GAQA 1VEPA 3CHDA 4OBRA 2X05A 1GOOA 4DUXA 4PCTA 1JZ5A 1BFCA 4P8XA 5BWFA 4D6EA 3ARYA 2XSAA 3WF0A 3WNNA 5BXSA 1QQLA 4JFSA 2WZHA 2DH2A 4DM2A 2PF0A 4JPZA 2ZXBA 3BSHA 4D6HA 1V6VA 3RSJA 1NM9A 1UKOA 3HU7A 3FJFA 5JUVA 1HKKA 2X2YA 1VBUA 2Y9FA 5DSSB 3OBAA 2E40A 2YOCA 4JKMA 4M80A 3W25A 1XH2A 3WA1A 4HR6C 1DWHM 1G9AA 1C3FA 3MU7A 4JKLA 3ARQA 3AIWA 4Z2IA 1XC6A 2JEQA 3F5KA 3ZR5A 5EFFA 4UFIA 5JBDA 3SCQA 4PBGA 4W5ZA 3PUBA 4ZE4A 4MNMA 1WBAA 2VR5A 3BA4A 5A6AA 1EV2A 3T8SA 3M7SA 1ISYA 3PG0A 4M24A 3W4RA 4H41A 1D7FA 3HMCA 2LIEA 1ZBWA 5IFTA 2XFYA 5F7UA 2AXMA 3BC9A 5A6LA 3FGMA 3WSUA 2ZX5A 3WF2A 1BVNP 2WANA 1E70M 4D6FA 1VFUA 1NOFA 4FVVA 1WKYA 5EHAA 1NP0A 2OLHA 3AFBA 4IPLA 4U2ZA 3WNMA 3MSDA 1HKMA 3PZTA 1DFCA 3WFLA 1MD6A 4KGLA 5FZYA 3W24A 3MS8A 2NP0A 5D9NA 1B90A 5HXMA 2CPUA 4JIEA 4Z2HA 4Z9WB 1JD7A 2AMGA 1CGVA 2ET2A 4I4SA 3MV11 3L4WA 3AISA 5JIWA 3WBAA 1MW0A 2P39A 1C92A 1ISXA 1VIWA 3CBWA 4A3HA 3WMBA 3RM4A 1M03A 2WHJA 5D9OA 3VU2A 5ABHA 3S8JA 3ARWA 3CRIA 3WNLA 4Q22A 1EDQA 1CVSA 3WDQA 4URIA 1W32A 2UY2A 3AHYA 3ARUA 4D1JA 2F2FC 2Y5EA 1E3ZA 3PZ9A 1DQOA 5E24E 3ZC9A 4P0JA 1E40A 3MUY1 1GQIA 1UKSA 3K46A 1OD8A 1OCQA 4Q9PA 4E8DA 4L4IA 3EDEA 3WUBA 3BH4A 2GDVA 1H2JA 3VM5A 3OIHA 1HJSA 1PPIA 1JAEA 5CPSA 3T0DA 2ZX7A 2C0HA 3BRDA 3A6OA 1ZB5A 1QW9A 4ENDA 2WZIA 2UWFA 2DH3A 3CZ8A 4F8XA 2J75A 1TOOA 2BY0A 2FFUA 3L4XA 3AMCA 1FH7A 3BGAA 2C8NA 2WC4A 1KCLA 1C93A 1V3LA 4GKLA 1G9CA 2VZVA 4D6GA 3W28A 3ZMRA 3UG3A 1B3YA 2Z1SA 1ZL1A 3ALFA 1VENA 2VSAA 3F62B 1XCWA 2GVYA 5F8SA 3CUFA 1UQZA 2D20A 3KL0A 5LYRA 2E0PA 2BHYA 2PBGA 1T4QA 4CD7A 5JBFA 3L4YA 2EPKX 3OBTA 3EDFA 4JQ0A 3ZX7A 1UR0A 1E6SM 1JZ6A 1CTNA 4WSKA 1XYZA 3THDA 1V0LA 1EHNA 2ZUNA 3LMYA 3FJBA 4HOWA 4HMDA 2VR4A 5BRQA 6CGTA 4I4RA 4KC3A 1UD8A 3A4AA 4AZ7A 1FQ9A 4X39A 4AISA 3PZOA 2A3EA 4PMZA 5A8NA 5C8BB 2NVHA 1FWUA 1PIGA 1JZ2A 1CBGA 5D4YA 4M1RA 4LYRA 3CA1A 1K9EA 2FH6A 4EFPA 2V5DA 3OGRA 1HCEA 5JBEA 1RD6A 5GNYA 4I6IA 2JIWA 5IHSA 1QNQA 4OEEA 1AQHA 1JYVA 1C8YA 1UR8A 2G3IA 4JCMA 2Q8XA 1ABRB 1DZDA 4IPNB 2BXYA 2WVUA 4V2XA 3JUGA 4D6JA 3P6JA 1J0ZA 5E0FA 1JYWA 1YYNA 4JL1A 2Y8VA 3FW6A 4QC4A 2VO5A 1D3CA 2HW9A 2Y9XE 3AZTA 5ABFA 4JAWA 2ZQOA 1T9FA 5CJ5A 1KWKA 2J7EA 4UFHA 2WMFA 2FDBM 3CZEA 2PB1A 4CGTA 2FFVA 4FLQA 4ZOTA 2WLZA 5A8QA 2MC2A 2G3JA 5AC4A 2VSEA 2FH8A 1OBAA 4XKIA 1BARA 2XHYA 3PMEA 3WQ8A 1WAWA 1K9FA 3ARZA 2J7FA 3N7JA 3K8KA 3SCPA 1IZKA 1QHPA 2V3EA 2VX7A 1FMMS 3FAWA 3WMCA 3P6IA 1QW8A 1S0FA 1S0LA 3VIMA 1AF9A 1RG8A 5CXPA 2VI0A 4M56A 1ZBKA 2YDSA 3AH2A 5F8YA 2O9RA 3W0KA 2GJPA 4H7VA 4CN6A 4EANA 4PTXA 1B9ZA 4AD5A 1KCKA 3VTRA 2QV4A 5I0DA 1UR4A 4I4YA 2DSKA 1HIZA 4IISA 2KI6B 3QHNA 5I1BA 2D43A 4PRWA 4D6CA 1CGTA 4ZFMA 4DCKC 2VX6A 2WSPA 4W5UA 1WDPA 3VGDA 2CITA 4UOQA 2WBCA 4GO9A 4QCEA 1S0DA 2WVSA 1WBCA 4A3YA 3SCTA 3RJXA 2QLYA 1B2YA 2X0YA 2DQXA 1B1YA 4AIEA 4OOUA 2F2FA 4MDPA 3WMVA 5HBFA 4TX6A 3G6LA 3SCNA 4FMVA 4E4PA 4WIWA 1ISVA 1S0GA 4D0TA 2J3PA 4YN5A 4F79A 8CGTA 3EMQA 1V08A 4JHOA 3A21A 4ZFYB 2J7DA 2WB5A 3T08A 4TVDA 2WWDA 3O49A 3QR5A 4U5IA 1M2TB 2P23A 1J0SA 5AY7A 4BQ2A 1UKQA 1W9XA 4P0KA 2Y4SA 4OUJA 1QI5A 3BTAA 3IJ8A 5FZUA 3L2LA 3WDPP 4I1BA 1E6RA 3FUOA 1IZJA 4HZ8A 1V02A 4P0LA 3WH8A 3KL3A 2YA0A 2FO1A 5CG0A 4AN7B 4OWJA 1JT3A 3WD2A 1NWUA 3AI0A 4ZENA 1TR1A 5ABGA 4AW7A 1M04A 1JT5A 1PZ3A 3CUGA 1BHGA 1OGGA 4BF7A 4WBCA 1FWVA 2DS0A 2YJQA 4UZSA 4DENA 1CGWA 3FAXA 3VX1A 2EJ1A 3K4DA 3IIRA 1DTUA 1FH9A 2YDQA 3UJ4A 2WMIB 1JDCA 2BFGA 3VPLA 3IAGC 3A4XA 3AKHA 5FD0A 1WDRA 3SCOA 4CKQA 1QXMA 1MQPA 3HALA 3GXFA 1LL4A 1AXMA 1XSJA 1FGAA 3AJ5A 2ZWYA 5IDIA 1VRXA 4I4VA 3WEZA 3VNYA 4I1EA 1V3KA 1V6UA 3AMLA 3FJ9A 3SIMA 3UERA 2E8YA 1W9VA 4E2OA 3GXIA 3ZJ6A 5A6BD 3V0BB 1GVIA 1OIMA 1MXGA 4FF5A 4U5KA 2QHAA 2WHMA 1JT4A 3EDKA 2XIIA 1UWIA 4PMUA 4TTGA 4U3AA 3S2CA 1MFVA 1V02E 2PI6A 3QOMA 4M29A 3GXDA 3S6TA 4PC4A 1W9BM 1GJUA 4W88A 4EFQA 2E9BA 3WNOA 4W84A 2DGAA 1WDQA 2VQTA 1UOKA 3GBEA 2NYYA 2X2TA 3VM7A 3VD7A 4BA0A 4AYSA 3NUKA 1F4AA 1R8NA 3VSZA 5DO8A 4RE3A 5BRPA 1J0HA 2VX4A 2YA2A 3ZT7A 2O92A 4I4QA 1R8OA 5G00A 2YA1A 4D6IA 3VMOA 3VD5A 3WH7A 2Q9XA 4U33A 3VMNA 4Q7NA 1Q4NX 2WKGA 4H04A 4HZ6A 3FJKA 4LO8B 3VEQA 4IZEA 2CBIA 1KXHA 2Z48A 3GYCA 2G4FA 1UH3A 1DHKA 4PMYA 3SNVA 1NP2A 3OGVA 4ZXLA 4UNIA 3HJEA 3NBNA 3AQUA 3BLKA 4JKQA 4ISQA 3MANA 3AH1A 1PEZA 3T2PA 3W6MA 2QYIB 2W91A 2HWAA 2ZXAA 5CPQA 3NSMA 3QGVA 2OWXA 1BLIA 4W89A 3PHAA 2DPEA 1S0CA 4KGJA 5DEZA 4BQ4A 5IHRA 2FDMA 2F61A 1PUUB 1VJSA 1ISZA 1BGAA 2J8FA 5FNWA 3VT0A 4D71A 2NSXA 1DFQA 3VMPA 1NQ6A 4W8LA 4GZEA 5AYIA 2YL6A 4ACZA 4I4PA 4AZCA 4B15A 1EA9C 3T2OA 3AS3A 4L4PA 3NDZA 1C8QA 1MWOA 4D1IA 1EHAA 3BAXA 2XWEA 3GH4A 1PC8B 3NCOA 2RGMA 1PWAA 2WC3A 2D7RA 2NT0A 4U31A 1UKPA 2V5CA 1E43A 3W27A 4P7LA 3CMGA 5CGTA 3CUIA 5JLVA 4MNKA 3DC0A 3GNOA 1Q03A 4U3CA 1AVXB 1SMDA 5I77A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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