2D24A

Crystal structure of es complex of catalytic-site mutant xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVSHAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic snapshots of an entire reaction cycle for a retaining xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 166
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d24A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2d24A01
2WZHA 3CRIA 9ILBA 3FGMA 1ZJBA 1NOFA 4ZOTA 1CNVA 4ZA3B 5G00A 4EK7A 5JIPA 4DWSC 3A22A 4H04A 4JCMA 2WKLA 2VMFA 3WDPP 2VZUA 1GONA 4TVCA 3VSFA 2YDQA 3GDBA 4I4SA 2OSWA 2YDSA 3OZPA 3ARUA 1RY7A 5FNXA 2WVVA 4S3KA 2ZUWA 2WNWA 1SZ6B 1TP0A 4FF5A 4J23B 3NBCA 5A6BA 1OINA 1BFNA 2EPKX 3PHAA 1UR2A 1J0KA 3ARYA 4P7LA 2ZR1B 2ET2A 4QCEA 3VT2A 3CO4A 3UJ4A 4PMRA 5I23A 3RM9A 1BG4A 3L4UA 4X38A 3A4AA 5I3DA 4E8CA 4G1RA 1W3AA 4QALA 3GXDA 4GP0A 4CD6A 2WC7A 4MAZA 4PSPA 5DT5A 3K46A 2VRJA 5E6ZA 4AD1A 3MPPG 1ONKB 4AZIA 4PMYA 4FLRA 2G4FA 1EV2A 3I3DA 2X05A 3WENA 3ZOAA 3AKHA 1CENA 4LGXA 1FP8A 3ARWA 4EEEB 3CMJA 3NBDA 4ACYA 5EG6C 1HJUA 3V0AA 1MVYA 4ATWA 4CU8A 1AVWB 4UFHA 4PMDA 3BRDA 3AS3A 4UOJA 1KCKA 2DH3A 3CZLA 3KWXA 1FH8A 1CTNA 4ACZA 1AVUA 5KEZA 2DDXA 3AFBA 1WB0A 2GDVA 4PTMA 2AFGA 2WXDM 3OLDA 1BTCA 4AISA 3GTNA 1TVNA 3GNOA 1SFSA 3UETA 3RMXA 1B3ZA 2JF6A 2D43A 1J18A 4HMEA 4HP5A 3VGBA 5FCZA 2VX6A 3CA6A 3PZ9A 5DT7A 1UWQA 4JKLA 4XB3A 2EBNA 2J7DA 1BFFA 2VX7A 4GXPA 2XUCA 3N7LA 3HJEA 2D3NA 2YL6A 4MNJA 4CD8A 2ERMA 4UFKA 2WSKA 5JUVA 3PTKA 2VZOA 4LYRA 4UOZA 1NWTA 1JTCA 5HOSA 2Z48A 2J3PA 4PUEA 4CJMA 1R8NA 5A1AA 1V3MA 1ZL1A 3N13A 1J0JA 5F8WA 4JQ0A 3OGGA 4G6JA 3WH6A 3WNKA 2Z1KA 1ISYA 4ZE4A 1C93A 3CA3A 2AAAA 3GBDA 3BAOA 3ZT6A 2FH6A 3AHTA 3NIYA 5FL1A 3OBAA 4E8DA 1UKPA 1I1EA 2V3EA 2YA2A 1C90A 3VO0A 3GXIA 1JDCA 2DSWA 2V3FA 1PZ2A 3CA1A 2D22A 3VX0A 4CD5A 2FFUA 2NVHA 1G0CA 5CQ1A 2Q9XA 2WK2A 1DJSB 1JXJA 4YOLA 1VEOA 3AIWA 3ZMRA 1MFVA 4QO3A 1FWVA 3CA5A 1QI5A 5M3WA 1B2YA 1EXPA 4D1JA 2VZTA 3AMCA 1E0XA 1F4HA 2VZVA 1LG1A 2WZEA 2Y2WA 4HOXA 3WEZA 2A3AA 4IQPA 1KXVA 2GVYA 3ARVA 3SCUA 3WO4A 1E1FA 1JG9A 2GSJA 4AZBA 1JZ3A 2Z1SA 3VDCA 2XJ7A 4JPZA 1G9CA 4GI8A 2BV9A 1NWRA 1MQRA 1VENA 1ITCA 5EMYA 5GNYA 2AMGA 4J3VA 1YQ2A 2C8NA 4B3KA 3SCQA 4R5EA 5CPTA 2WHKA 2WHJA 1MXGA 4D6IA 1C8YA 3LPOA 1UZ1A 1ZS2A 3GM8A 3W38A 4J2YA 5I2UA 4S3JA 5AC4A 2WSPA 4JL1A 1FFQA 1H1NA 5GPRA 3D7WB 1CGWA 3ZJ8A 2Q3NB 1E3XA 1UR8A 3PZUA 3GZAA 3AJ6A 2VSEA 4D6DA 5FL0A 1BAGA 1BG9A 2VZSA 3VUPA 1E43A 2VCCA 1V0NA 3WMVA 4P0KA 3FJJA 1DHKA 1JZ8A 3CUHA 3ZT7A 3ZC8A 2FO1A 1HL9A 4Q9PA 2WLYA 3WA1A 3WDRA 4L4HA 2CBJA 4HA2A 1US2A 4IPLA 1RP9A 4KMQA 2CHOA 2BXYA 3KZSA 2FHFA 1HJVA 1EO7A 4R6UB 2XHYA 31BIA 1WZKA 1CXLA 1HJQA 2X09A 5LYRA 3T2PA 1TE1A 2G3NA 1CYGA 4FLQA 3AKGA 4A3HA 2KKIA 1G9HA 3OGSA 1EDQA 1V02E 3SCSA 3T0BA 3UD8A 3FNDA 3KEHA 1E3ZA 5IFTA 4EE9A 2WCAA 5EBAA 3FJEA 4PYSA 3W0KA 4IPNB 1FMMS 1DFCA 3CHDA 1UWIA 1KFWA 1OIMA 2E9MA 1F4AA 3CMGA 1YXWA 3VOCA 4OZOA 2WCSA 3PZIA 2DRYA 3BH4A 3UG4A 1FH9A 4MJ2A 4MB3A 2VT0A 3AMDA 5BOWA 3AZSA 2V38A 3RM8A 4W7WA 4OKDA 1HJSA 4QD2C 3FJFA 5E24E 4LO0C 4PMNA 4W8AA 3MANA 4Q22A 3ZJKA 1TR1A 4LPCA 21BIA 5JMCA 2ZUVA 5A94A 3I29B 3NJ5A 2LIEA 2GJPA 3ARTA 3VWCA 4JFSA 4X9YA 1GUVA 2PBOA 2FFVA 1V0MA 1BYBA 1KQYA 2DT3A 4G6MA 3T2OA 4KGLA 2E8YA 3U7BA 2W63A 4F79A 1BLDA 1N4KA 1UR0A 4BZYA 5A8PA 3WMCA 3MSGA 3R4UA 2WHLA 1WDPA 4HJJA 4W93A 8CGTA 4PMOA 3G6LA 3WUBA 4J3WA 5D9MA 2UUSA 3U7VA 3A21A 2CETA 3GH5A 3MUZ1 5BROA 3B9DA 3SCRA 2XIIA 2MIBA 1W9DM 4IONA 1F31A 1A8DA 3GH4A 5EHAA 3N9KA 4WSJA 3PZGA 1ITBA 1EOMA 1QHPA 4M81A 1RH9A 3ZR5A 4UQCA 3FAXA 3UD7A 4OIFA 3VM5A 4BQ5A 2NP0A 3FN9A 4XUYA 2FGFA 1V3JA 1CEOA 1Q03A 2DRZA 3AZRA 4EANA 3MS8A 1VFMA 4B15A 2FGLA 3F5LA 1JD9A 41BIA 4BQ3A 1JYWA 1H0IA 1JZ7A 1JZ4A 2PF0A 1PEZA 1PZ3A 4RE3A 1UD2A 1L8NA 2O9PA 1DIWA 4MDOA 4F34A 3FHQA 5A2CA 1AVAC 2ZX9A 1TA3B 2NTDA 3BAIA 5ABEA 4H8UA 3N11A 4I3NA 4XZWA 1G82A 2XFRA 1HWMB 5EFDA 2PWDA 2ZQNA 5CZKA 1K6AA 2A3EA 3F5JA 4CU6A 4NF7A 3VIGA 1DLLA 1JAEA 3VGFA 1H09A 4LO1A 3ZM8A 3HMYA 4XFSA 1E73M 1GHSA 1DZCA 3VKKA 1Z32X 3TA9A 1EDTA 2YUGA 1B1YA 4MADA 1RPKA 5C71A 1E5JA 3BADA 4ZLBB 4HOZA 1OT1A 2FGZA 4W7UA 2QN4A 3H6SE 4WF7A 3CHCA 2PWFA 3SEPA 1HKKA 2DPEA 1KB3A 2WBKA 3IANA 1B3WA 3N12A 3S6TA 2FHCA 4IZEA 3WMUA 1J01A 4I6IA 4OWLA 4HMCA 1FA2A 1SR0A 3Q7YA 1ISWA 2XOAA 1VFUA 3CRGA 4RE4A 4JHZA 1MW0A 3POHA 4GI6A 5DMYA 2XSAA 4I4UA 3VIMA 1PX3A 4YN5A 5BXSA 2DREA 2X2TA 4JFVA 3KL5A 1W1YA 1WDQA 1QOXA 5GQBA 3OBRA 1G5AA 1DQGA 4D1IA 1W3GA 1HL8A 1GQLA 1E0VA 1FHLA 1XG6A 1YBIA 1KNMA 5A6KA 1YTOA 2F2FA 2DT0A 3BAKA 2PC8A 3AIRA 4U31A 4DEPA 4HZ7A 3N1AA 3WD2A 1GJWA 2BS9A 4AZ6A 1VJSA 2D7IA 4XKIA 1PIFA 2YL5A 3O4OA 4I8MA 3TTSA 4OEGA 2LIQA 4OEFA 2J75A 1K5UA 3OA5A 2W92A 5CSYA 1EVTA 1BLIA 1LF1A 1ZB5A 1V0LA 2I1BA 1V03A 2UY4A 1H0GA 4LYQA 1W32A 1B3XA 5CPSA 1E6SM 3FJ9A 1Y7VA 2OYLA 1FHDA 3PBGA 8A3HA 5ABFB 2YJQA 1JNEA 2ZX5A 4OWJA 1FGAA 4AD4A 1NQ6A 2V3GA 2WMIB 4YHEA 1NM9A 2CYGA 2X2YA 1RD6A 2NT1A 2ZE0A 5GNXA 4X3AA 4NRRA 1CGYA 4D0ZA 4C7DA 3ILAA 2OWCA 5DEZA 1KWGA 3GH7A 3QOMA 1VBUA 1CPUA 1KQZA 3UEQA 1TCMA 2VLCA 4IM4A 1G9BA 1J0IA 4AMCA 3K4DA 2D23A 4FVVA 4JKMA 5DO8A 3TP4A 2DIJA 4KH2A 3VDBA 2VUYA 1UG6A 1UWSA 3KMVA 3EMCA 2UY2A 3ZJ6A 3A07A 2D44A 2DSUA 4XZBA 3WUEA 1W1VA 4JKXB 4H8VA 3B9AA 1QNSA 4HMDA 3AOFA 4JIEA 3EDDA 3W27A 4D71A 3VT0A 3O4CA 3QHMA 3AS2A 1JZ5A 3E1F1 3WD0A 4OUEA 4BF7A 4EAMA 4P8XA 4D6HA 4B9YA 1E4MM 4J2XA 1JGIA 3WQVA 2D0FA 3N7KA 1FWUA 1R7OA 2DT1A 3O3QA 2ZXQA 4CKQA 1PC8B 1BFBA 4LXFA 4J27A 4GOYA 1NARA 2G41A 4M24A 3BAUA 4J7RA 1JDDA 1T4QA 5BXPA 1XCWA 2VOTA 2Z49A 3D5HA 1IRPA 2BHZA 7I1BA 1U2YA 4CN1A 1XCXA 1WD4A 4JFTA 1NUNA 4W5UA 4GAIA 4HR6C 1K5VA 3WF0A 1CZ1A 1NP2A 4QAWA 4DCKC 5FOOA 3QOKA 3WMBA 1BARA 4GINA 1J0ZA 2WLZA 3ARRA 5A8MA 1TFVA 2ZUNA 4UQ9A 4I4PA 1UKQA 3OGRA 1LJYA 1UH2A 3P53A 2W62A 2ZX7A 4WJXA 4UQBA 3WY1A 1QW9A 4BCEA 2XWDA 3IM7A 1JXKA 3NUKA 1M2TB 1E5NA 1TZ7A 3VDHA 4JKQA 2DSVA 2E8ZA 5E09A 3WL1A 3HU7A 3K8MA 3WEOA 1KBKA 4PC4A 2EJ1A 2XVLA 4TUFA 3IIRA 2XIBA 5HXMA 2BXZA 1U33A 3OIHA 4A3YA 4GOVA 2K43A 2XWEA 2JEPA 1QHZA 2WPGA 3QR5A 4GQRA 3A4WA 1H41A 1V08A 3AIQA 1ZJAA 2VRKA 5EB8A 4MNLA 1QI3A 4LO3A 1FFRA 1JNDA 3CPUA 3L2MA 1TVPA 1XGZA 3POKA 1QNQA 2X0HA 1J9YA 4DUVA 1QNRA 1IILA 5A6JA 1LQ0A 1IZJA 4LO7C 2E9BA 3KL3A 5F7UA 4V28A 1J12A 4W87A 2RGLA 2Y24A 1FP9A 2J74A 3O44A 5BQUA 2VSAA 1TA3A 3DHUA 4NSBA 3LTQA 2IWTB 2BY2A 1M03A 2CBVA 5I0DA 3RCNA 2ESCA 4HPHA 7A3HA 2W67A 4CVUA 4GKLA 1JT4A 3OLIA 1TMQA 1JLYA 1CXHA 1WZAA 2CBIA 3A4XA 3WF1A 1GOWA 3T08A 1V3LA 2OLHA 1XC6A 4WKAA 2BY1A 2BVYA 3SIMA 3OBTA 2J7FA 2GK1B 3AMKA 2G8ZA 3QHNA 1MQPA 4GIAA 2NYYA 3MALA 3VMOA 4MTVA 3I2AA 3VGDA 1G9DA 1YF8B 5HNNA 2F8QA 4MB1A 3WDJA 4CN4A 4HOWA 5BRQA 3IM5A 2VJXA 3O9NA 5CSUA 1IJTA 1OGBA 2WC3A 4U5KA 1JT3A 1W2VA 1KXHA 2GUYA 3CH9A 4TOQA 1GCYA 4JP0A 3NSMA 1ISZA 1Z4SA 3PHZA 1NWUA 4OBRA 1L2HA 3W9TA 5D4YA 1Q6EA 2Q8XA 2UWFA 3G6MA 4Z2JA 4EKJA 1R87A 1EIBA 2YBTA 3CUGA 1EH9A 2PI6A 2D0HA 3AXIA 2VNCA 4AY1A 3BCFA 3MUY1 4U2ZA 3UR7A 2YL8A 3NCOA 3L4TA 4GAFA 1HP4A 1JYVA 5CLWA 1CXKA 2PWHA 3W26A 3RTJB 1KXQA 3LMYA 1IT0A 2J78A 4P7QA 3EMZA 1CVSA 3WKZA 3DYMA 4UR9A 4HA1A 3SUWA 3H6QA 3OLGA 4AC1X 4F8XA 4AN6A 3B9UA 1RZOB 4KEKA 2HVMA 3MO4A 1OGGA 3O49A 4TX6A 3T0DA 2QPUA 2D2OA 2XM1A 1UA3A 2AQZA 4ML4A 4JCLA 1KGUA 3GNRA 1BFGA 2VX5A 2G3MA 4C7GA 3VINA 4XFTA 5D63A 3AI0A 2JFEX 3VIHA 3WO2A 2DIEA 4OJYA 1W9VA 3IJ8A 1S0BA 1WO2A 3W4RA 1XHBA 3N0KA 5AYIA 2ZXAA 1BVZA 5JBDA 2XVKA 2YA0A 4UOQA 3FW6A 2HISA 2CBUA 5ABFA 4PUDA 1DZDA 5ABHA 4QFUA 5I24A 1C8QA 3AHVA 3CIVA 3VU2A 2F2HA 2VVNA 1N82A 3GXFA 3FAWA 1OIFA 1GOKA 1SR4A 3MMDA 3BGAA 3WN6A 4IZXA 4U5IA 1A3HA 2VO5A 4KWUA 4RE2A 5A6MA 1W1PA 2E40A 3WBAA 5IHRA 4V27A 4ZBVB 2VI0A 2XVNA 5I77A 4Q7NA 4QLLA 1E40A 1E55A 4FGFA 1JQZA 5IHSA 3OJMA 1CGXA 1UKTA 1EYLA 2BY0A 4JFWA 3WSUA 3WQ6A 2X1IA 4I4OA 1ZBVA 2WB5A 4TVUA 3VEQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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