2D24A

Crystal structure of es complex of catalytic-site mutant xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVSHAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic snapshots of an entire reaction cycle for a retaining xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 166
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d24A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2d24A01
4QLKA 4H7VA 4DUXA 4NRSA 9CGTA 4OW4A 3O4DA 2XIIA 4LGXA 4X9YA 3AZRA 3M07A 1CZ1A 1XSJA 1E40A 4CD7A 1CXLA 4U3CA 2Y8VA 1V08A 4QLLA 4ZE4A 3AIRA 2ZQNA 4CU8A 2VOTA 1CBGA 4G9MA 2WHMA 3D7WB 2Y24A 3OJVA 2YLAA 2D20A 3I2XA 4YN5A 3CU1B 4YPJA 1QHOA 3FJ9A 3IM5A 1CTNA 1HXJA 2HZ9A 5FNXA 1ZJAA 4MNMA 1H11A 3WQ6A 1KCLA 1OT2A 4GQRA 3VIMA 5E9AA 4BCEA 1AVAC 1C8QA 1VBUA 1GQKA 3I29B 1OGSA 5CZKA 2ZUMA 1DWFM 4C7DA 1HWPB 3KMVA 1I1EA 4UR9A 2FGZA 4PMDA 3U5UA 3KE0A 2WC3A 4QBVA 1XHBA 5E09A 1MW0A 3NSMA 2F2FA 4GZIA 3W6MA 3CO4A 1R7OA 2FHBA 3K8KA 3RTJB 4EKJA 2Y9WC 3K4DA 1BFFA 1LG2A 4W5UA 1KBBA 4CCCA 2A3AA 3O3QA 2W63A 2VL4A 2WKGA 4I4OA 1LL4A 1D0HA 1RMLA 1MQRA 3AIBA 1SMDA 1TCMA 5JBDA 1ZBCA 5A95A 4QD2B 2V3EA 1JY0A 3CH9A 3AXHA 3OLDA 2VZSA 4B15A 3RM8A 2K8RA 4F8XA 4I1BA 1E0OA 3CUGA 3WFLA 2W4XA 1BFCA 4Z2IA 3NBEA 1H41A 1ITXA 1W9DM 2EPLX 4EE9A 2XSBA 4XB3A 4DCKC 1UR2A 2CCRA 1E71M 4I0YA 5I1BA 1BG9A 2PI6A 1JZ4A 4CN1A 3FN9A 2K4AB 2VUAA 1GQIA 4HR6C 3OGSA 4U2ZA 1XD0A 2CITA 1CXEA 3U7VA 4MADA 1W9XA 4GINA 4EANA 3FJ8A 4UNIA 3SCUA 1DFQA 2D7RA 2LIQA 4BQ2A 5GNZA 1YTOA 3FJHA 1PZ3A 5A6SA 5FOOA 2DT2A 5IHSA 2ZQOA 1IZKA 3GM8A 3OGGA 1V6VA 3AZSA 3SCTA 3T0BA 1B1YA 4B3LA 3K1XA 1C93A 2PC8A 5ABFA 3WINA 3MKKA 2Y4SA 1TE1A 2J7FA 3GH5A 5DVHA 5A2CA 1OT1A 3A23A 4ATWA 3T2QA 1M04A 4QLJA 1HJVA 3W37A 2WLYA 4GAFA 3VGDA 1HL8A 5AC4A 1GW1A 3AISA 3VD4A 1AF9A 4HOZA 4TUFA 1JZ7A 4JKKA 5BRQA 2G3IA 2WVVB 4Q9GA 1TUXA 2P23A 3WEZA 2OWCA 2BY1A 4I1EA 4J27A 2AFGA 2EEXA 3WO2A 1ZBKA 3BAJA 4DM1A 4ACZB 3NJ3A 4LO1C 1QVBA 2G8ZA 2ZX9A 4UQ9A 3W24A 5F90A 4W8BA 4QALA 2HW9A 3I2AA 3BMVA 2D0HA 4PC4A 2VTFA 4AY1A 3UG4A 4MJ2A 2M49A 1UD3A 3FY1A 3IANA 5A8MA 1I1WA 3BAGA 5EHAA 1RP9A 2VJXA 4N42A 3SCSA 2EPMX 1M2TB 4CVUA 4AN7B 1OGGA 4IONA 3LLPA 3BAUA 1EHNA 2WVTA 4LYPA 2VCAA 4ZFMA 4J3WA 3OG2A 4PSRA 2IHOA 1VAHA 1UH2A 3VIFA 2J3PA 3CMGA 4J3VA 1TA3A 1AVUA 3IM7A 3QOMA 3WDJA 3T0AA 3FJEA 1QNPA 2WKLA 1UKOA 1CXFA 1QOXA 3B9UA 2XPKA 3W0KA 4M80A 3VDCA 1E6RA 4PMXA 5IHRA 3VT0A 2ZX8A 4DEPA 3MS8A 3WNOA 4U31A 3FHAA 5D9MA 3PZUA 2DEPA 3PTKA 4Z2HA 4HMDA 3K4AA 1NWUA 5HNNA 2A3CA 3VIPA 1WD4A 2XWEA 4OBSA 5HDRA 4S3JA 1W1PA 4XZWA 1JDDA 2GJXB 3ARWA 4Q7NA 2PWEA 1BPLB 3U57A 3CRHA 2VRJA 2VI0A 2G3NA 3NDZA 4USOA 2WMJA 3KWXA 5FCZA 2BFGA 2MC2A 1CLVA 3IJ9A 3ARVA 1Z2VA 4QP0A 4KEKA 1IRPA 1LF1A 1KB3A 1FV2A 1EQPA 3N0KA 3H6RB 2X8RA 3B9AA 3QR5A 2OWWA 1DFCA 1WZAA 1DIWA 1XYFA 1R7AA 3W53A 3FJJA 1K9FA 3MMUA 1FHLA 4ML4A 3FFZA 1UD5A 3ALFA 1MWOA 5A6LA 1FP9A 1UWTA 1FMZA 1JD9A 1XYZA 1B3WA 5BXSA 2XUCA 2AOSA 3VMOA 1W9BM 2A3EA 1FN0A 2BEBA 2R9KB 3PMEA 1VENA 2CERA 3WNLA 3ZT5A 1Q6CA 3CHFA 2V3GA 3NYDA 2FFUA 4ZXOA 3VDHA 1QHZA 3AYRA 4P8UA 2ERMA 3OBTA 1EQCA 2XHYA 3QOKA 4KGLA 4XFUA 1EA9C 1KXQA 2ZX5A 2OYLA 5A6AA 2YLLA 5DZUA 4R6UB 1I75A 4D72A 3EF2A 3AS3A 3THDA 2RSTA 2DSZA 4MJ4A 1R87A 2WHJA 2YL6A 3PN8A 4KC3A 2VMFA 3EDJA 5DO8A 3GBEA 2WAGA 1XH0A 2VX5A 1EDTA 1W2VA 2ZXBA 3LPGA 4CJMA 1VEMA 3BA5A 3S2CA 4WIWA 1WPCA 2ZWZA 1E6QM 4UFJA 4QCFA 1GOIA 1BLDA 4M24A 1F31A 3CAHA 4JCLA 2NTDA 4EKXB 1UYQA 1MFUA 1ITBA 2KLLA 1W3AA 1C90A 3WF4A 4IYBA 2VC9A 1KXVA 1JLYA 2Z49A 4AZ5A 4LO0C 3OGRA 1V3IA 4EAMA 3WUEA 1J12A 1ZJBA 1PX8A 3BMWA 4A7KA 2C8NA 1CLXA 4JKXB 1KNMA 4GI6A 3ARTA 4PCSA 3W4RA 2WYSA 2D3NA 3DYMA 1HF6A 4D6HA 2WMIA 1E43A 1JZ2A 1FMMS 1HJWA 3LPPA 4LO2C 4AZCA 4A3YA 4TX8A 2BVDA 4X0VA 2F8QA 3VEQA 1Q6FA 2YA2A 3FW6A 4NF7A 5F8WA 1UZ1A 3DECA 3V0AB 1FGAA 3R4SA 3DHPA 1BHGA 4GI9A 2XWDA 2VQTA 5LA1A 4W5ZA 3DHUA 2E0PA 1FV3A 3AMDA 2DSWA 4ZFYB 4J3TA 2O9PA 1E4NA 2JIEA 2XVGA 4QFUA 4A7ZA 3O5WB 1W3KA 1XC6A 2VVSA 1EGZA 4H04A 1GUVA 2VVNA 2O92A 2GSJA 3SUUA 4W88A 3L4VA 1NOWA 3WD4A 4MNLA 4PMZA 4HA2A 3FXYA 3AMGA 3ZJ6A 1UD2A 1EIBA 1PEZA 1E6XM 2IUZA 4DWSA 1AFCA 1KQYA 4EK7A 2RGLA 3WH6A 5I0DA 1BYAA 1K5VA 4ZGRB 1H09A 4M1RA 4F9DA 3VX1A 1JYXA 4JRAA 2E40A 1FP8A 3AIEA 3AKHA 2WC4A 2VZVA 2X2TA 2D22A 1Q04A 4JFTA 3WD0A 4CD8A 1A47A 1VJZA 4PMRA 3ALGA 3IJ8A 1X1NA 1JLXA 4LX4A 5M03A 3WMUA 1X6NA 3WH8A 4CGTA 3GNRA 1Z4SA 4W8LA 5HPOA 1UD4A 2V5CA 3CUJA 4DM2A 3EYPA 1E4MM 3BCFA 1L8NA 2WVUA 4J2YA 4OIFA 4P8XA 3W27A 1GOQA 3QGVA 1GJUA 5HXMA 4AN6A 1MW3A 2J7DA 2XTKA 3TTOA 3WUBA 5G00A 1DJSB 1MD6A 1JI1A 4JFUA 1V3JA 3BAWA 3PZNA 2BY2A 5GNXA 5HPZA 4PTMA 1MC9A 1JDAA 4J7RA 4L4PA 3T2PA 3WEOA 3BAYA 1HWMB 1H0IA 1NWSA 3POKA 2GUYA 2BEAA 1NP2A 4LO3A 2O9RA 3O9NA 3CIVA 5BROA 2LIEA 3PZ9A 5F8YA 4UFHA 5EC5A 4JAWA 3PTMA 3ARYA 1PAMA 3T0DA 1HP5A 4IPNB 3WQVA 4F9JA 1ESWA 2ZICA 5A8OA 1X6LA 2W5FA 3RMXA 4ISRA 2BHUA 4D6JA 3ZSSA 3ILAA 4OWLA 3GZAA 2DH3A 2L5XA 3F4VA 3GNOA 4XFTA 3FAXA 3N18A 4DWSC 3QR3A 1WZKA 2QMKA 2PWGA 3PBGA 1B3YA 1KCKA 4QKRA 3AJ6A 4HTYA 1V03A 2J79A 1VFOA 3SCRA 2QLYA 4UQCA 5F7UA 1CEOA 4D6CA 2GDUA 3N9KA 2YL5A 3OBRA 4ZENA 1AVAA 4AD3A 4ACYA 1YYNA 4AZ6A 1BGAA 3ARSA 1V6WA 3O2LA 1W3JA 4UZUA 2DGAA 1E55A 4JHZA 1DZDA 4Z9WB 1QBAA 2W66A 2DSVA 4JFSA 3EDEA 1TTUA 4U33A 1NZKA 1HJXA 3SUWA 7TAAA 5DF0A 4ZXLA 4GOVA 4HZ6A 2E9BA 1S0EA 3HU7A 3CA0A 3OLIA 3ZC8A 3PZGA 3VILA 4DUWA 3EDDA 1D2KA 4ZEPA 3AIWA 1WDSA 1XH2A 5IDIA 4PTVA 1R8NA 1UKQA 3FJKA 1CXKA 1R85A 1G94A 1KXHA 3I3DA 5FZZA 5CJ5A 3VMNA 1JXKA 4QBCA 4KWUA 4AISA 2ZUSA 4OOZA 4R5EA 3LPFA 2YL9A 2E8YA 1WE5A 5EMYA 5D61A 4PTWA 1FA2A 4P0LA 3WF3A 1NUNA 4A3HA 3ZR5A 3PZMA 3U5YA 1YQ2A 5I79A 4X39A 3GH7A 4IQPA 2Z48A 3FGMA 2NP0A 4HA3A 2FGFA 1UZ4A 5LA2A 3MUAA 1WB0A 4CN6A 5C8BB 2QHAA 5FZYA 3LPOA 2NYYA 4CKQA 3UESA 5ABFB 3ZT7A 4AEFA 3GNPA 1UQZA 3AHTA 1W3GA 2YOCA 1W1VA 2V5DA 2CBVA 1J18A 1V02E 4H41A 1NQ6A 2XG9A 2CXGA 2FGLA 1S0CA 2G4FA 1ILR1 1VFMA 4WLCA 5A8NA 4PSPA 4MB1A 4TLPA 1BF2A 1FH9A 1WZLA 2Y8KA 1JT3A 3ZT6A 5BXPA 2XFRA 2EQDA 1LL7A 4TVCA 3Q7WA 4I3NA 1D3CA 1DWGM 1BYDA 1A3HA 1E5NA 1V0MA 2J74A 2XJ7A 1NOUA 5JBFA 3RJXA 1DLLA 2K43A 2QV4A 2V3DA 2VSEA 1CPUA 1W9PA 3SCQA 1H0GA 1TVPA 2E3ZA 4Q22A 2CHNA 1HJQA 3SNVA 4UOJA 3AI0A 3BA4A 3F62B 4V27A 4LO1A 3BAIA 1ZB5A 2NT0A 1KGUA 1W1YA 3POCA 4HPGA 1CGVA 2CESA 3RSJA 4GZJA 3VM7A 1FFRA 1PJ9A 2DIJA 3C9ZA 3A3HA 1C7SA 2ZUWA 1J0SA 3GXIA 3AMCA 1CECA 1TFMB 3MV01 2CYGA 4AD2A 5A6BA 1C92A 1CGYA 1TA3B 3CHEA 3VGBA 2YA0A 3ZO9A 4LO7C 3PZVA 1IHKA 2VO5A 3SCWA 1FHDA 4OUJA 5JUVA 2CKSA 1ISVA 2FDBM 1GPFA 4HU8A 1E3XA 3W82A 1OM0A 1CDGA 2X2SA 1KFWA 2E4TA 2OYMA 1VEOA 1J0IA 3UETA 4EFPA 1QNOA 3WUGA 1TZ7A 3VOCA 2D44A 3Q7XA 2AMGA 4CD6A 5A2AA 1XCWA 5E70A 3R4UA 4I4YA 3MANA 3ZMRA 1CVSA 1B3VA 3CUIA 3NDYA 2DRYA 1WZMA 2FHCA 4X3AA 3HOMA 2VRKA 3EDKA 3KL0A 1VCLA 5CXPA 4UQAA 4AXNA 3MUZ1 5KEZA 1UR0A 2WMGA 4OZOA 3AJ5A 4UFMA 5EB8A 2XVPA 4IUGA 2OSXA 2CBJA 1MXDA 3BAHA 3WBEA 4JKMA 4KH2A 1M01A 4PMQA 3QHMA 1IOBA 2ZX7A 4WK9A 1PIGA 4E8CA 1KXTA 1DP0A 5BWFA 2WHLA 2F61A 3F5KA 4WBCA 3WDRA 1GCYA 4I4VA 1F4HA 3IK2A 3P6JA 1SYTA 4UTFA 3FJBA 1DHKA 1BG4A 3VIHA 4QO3A 1ZBVA 4NI3A 2WBCA 2DS0A 4H8UA 2ZE0A 4D6FA 3D5HA 1ODUA 5CQ1A 3TTQA 5IXEA 3CTTA 2WBGA 3CA4A 5A69A 3CZGA 4D6IA 1XGZA 2UY4A 4P8WA 1I1BA 3MO4A 5JMCA 1Q6EA 2D0FA 4AWEA 2XIBA 2ZX6A 3FJDA 4KBBA 1B3XA 5BYWA 4A7YA 2BNJA 3VUOA 1MW2A 2JFEX 3FJFA 2EPOA 2X0HA 1GJWA 2Q8XA 4GP0A 1AVXB 1JFXA 1UPSA 3ZJ8A 1G1YA 1WAWA 4P7NA 1VRXA 3AZVA 3AH4A 1AXMA 3MPPG 2Z1KA 4K68A 2WM0A 3IJ7A 4H8VA 1WBCA 2P39A 2WANA 5EBAA 3TTYA 3BB2A 5EFFA 2JALA 2WXDM 4MDOA 4P8VA 3J7HA 1YHTA 2VX4A 1QW8A 4HA1A 4QKSA 2V3FA 1TR1A 3PZIA 2G41A 2DPEA 3PZQA 2WMIB 4HOXA 1CXHA 3VD3A 1Z0HA 1FQ9A 4LO0A 3BRFA 2J78A 2UWFA 3AKIA 3DYOA 4AZCB 3CPUA 2V38A 8I1BA 4QCEA 4S3KA 4C7GA 2D7IA 4MB5A 3V0BA 4IZEA 1QNQA 2WCAA 6CGTA 4XX6A 2J25A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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