1HKJA

Crystal structure of human chitinase in complex with methylallosamidin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEQSGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Crystal Structures of Allosamidin Derivatives in Complex with Human Macrophage Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITOTRIOSIDASE
total genus 123
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1hkjA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hkjA01
2E3ZA 3WQ8A 1ZBVA 4FLSA 5CQ1A 2HVMA 2ZUTA 1G9HA 3U5YA 1XSIA 3GXDA 3FNDA 1HN1A 3SCUA 2QHAA 1XCXA 3M6DA 1XD1A 2J7FA 5DMYA 3ZOAA 4E8DA 1BG9A 3W82A 1XH1A 1V6VA 2GJPA 4F9DA 1MW3A 3UERA 2BV9A 4OJYA 3BAJA 4RE4A 1C93A 1FP8A 1IT0A 1EGZA 3NYDA 4P7RA 3OA5A 1PAMA 2OWXA 3FHQA 3VIGA 1UD5A 1QOXA 3WD1A 3DHPA 4AD4A 1LF1A 1E0VA 3MSGA 3N11A 2D23A 4H7VA 2FDMA 4KRUA 2WANA 3BMWA 1OGSA 3WQ6A 5EFFA 4DUXA 1BYAA 3ARXA 5A8OA 3U7VA 5GNXA 5A2AA 5A8PA 3SUTA 2BVTA 2YKKA 1HIZA 2EJ1A 4L4PA 3WEMA 1W9BM 2WXDM 3CUHA 3WMBA 1KWKA 5A6SA 1J01A 1CPUA 1PIGA 2HISA 3BMVA 4DUVA 3VD4A 3WDRA 1DWGM 3I3EA 2YDSA 2BFGA 1OB0A 4JZ5A 1TUXA 1KQZA 2OLHA 1UKSA 5FOOA 1ZJAA 2XGIA 1BSIA 2JF6A 4C7DA 2Q8XA 2CNCA 4MB4A 4P7QA 2VVNA 3VNZA 3OZPA 2MANA 3WEOA 5BXTA 2BXZA 1XSJA 1TA3B 2PB1A 4OOUA 2PF0A 1V6YA 3UCQA 1JYWA 2XFYA 5HXMA 1V3LA 4OBRA 1MXGA 4A3YA 3CUJA 4FLQA 3VILA 2G3MA 1BYBA 3PZ9A 3ALFA 1HL9A 4JL1A 4DWSB 3BLPX 1CXKA 4JHOA 1E1FA 3DECA 1J0HA 3WNOA 4CVUA 1UKTA 1MW2A 2VI0A 4P8VA 5AY7A 3AMGA 1TFVA 5HPOA 5JBFA 1C8XA 2D24A 1LQ0A 2ESCA 4QLLA 2VX5A 2NT0A 1P6WA 4Q7NA 1B90A 3KEHA 1LL4A 1QNRA 1UHVA 1GOIA 1FP9A 1LL6A 1H3GA 4FLRA 2DIJA 2ZWYA 4AEEA 1HJUA 2PC8A 4M56A 3ARWA 4U33A 4ACYA 2W63A 4TX8A 1E0XA 2EO7A 3M07A 4WLCA 4PEEA 4AZ6A 4W5UA 1W3JA 2F61A 2BY3A 3TTOA 3U7BA 2Z1SA 1QVBA 1QI4A 4OKDA 1NP0A 2VCBA 4HA1A 3WDIA 3MUY1 5EMYA 2CPUA 1EO7A 2D0FA 2VCAA 3AXIA 1GNXA 3EBVA 1UYQA 4MNMA 4J3XA 5E9AA 3ARVA 4CD6A 2XSBA 4XZWA 3F5KA 1ZB5A 4J7RA 3GZAA 1GPFA 2ZUMA 3VMNA 2XWEA 4AWEA 1GQKA 2WMGA 4KRTA 5ECUA 1A3HA 2IXVA 1ZU8A 3VD9A 1R8LA 2VCCA 1CXIA 1TA3A 4RE2A 1E4IA 2GDVA 4UQBA 3AROA 1C91A 1WO2A 2VX7A 2VUYA 1US3A 4U2YA 3T0BA 1OIMA 3NUKA 7TAAA 3LPFA 1HJQA 2VR4A 2BY1A 4GZJA 3ZJKA 1KR1A 1NWRA 4TXEA 4Y7EA 5AYBA 3VGFA 4DWSC 3WMCA 5BRPA 1CGYA 1W3HA 4EKJA 2EQDA 3WENA 2DH2A 3KL0A 4HU8A 5GPRA 1MQQA 4GPNA 3ARTA 4HOXA 1VFUA 3AMCA 3T09A 3M46A 1QI0A 4D6EA 2DSKA 5E0CA 1TZ7A 5A6AA 2JIWA 4J3WA 3SUUA 1V0MA 2TAAA 1UQYA 5DF0A 2F8QA 2VRKA 3J7HA 3OLIA 1TR1A 2CKSA 1LWHA 3MV11 1W1VA 3OIHA 2DH3A 3VIPA 1OD8A 1B3WA 3K4DA 1E6RA 4WKHA 4LXFA 1S46A 3VGHA 3WF2A 1NARA 1GUVA 1J0KA 3AS2A 3EMZA 5BRQA 1XSKA 4W84A 3VX1A 3BLKA 4HU0A 1OGGA 1ESWA 3BAXA 3EDEA 4P7LA 1JZ7A 3BH4A 3D3AA 1FFQA 2DT3A 4PMZA 2J74A 5FL1A 1MXDA 2WMJA 3THDA 4QCEA 1E0WA 3WFZA 1WDPA 4WJXA 3ALGA 4BCEA 3U5UA 3K1DA 1EO5A 1BFNA 3PZGA 3RDKA 3FHAA 3GH4A 3CH9A 3WUEA 5CLTA 4H2CA 2JFEX 3TP4A 4ML4A 1HVXA 1V6UA 1J12A 3PZMA 1UA7A 3AOFA 3WF0A 1WAWA 2XVGA 2QPUA 3WNMA 1C8YA 3L2MA 1ODZA 2W5FA 4HA3A 1FHDA 3WELA 4UOJA 1CTNA 3L4ZA 4GO8A 1JZ6A 4JL2A 4GXPA 1M04A 3AYSA 1KXHA 3TTYA 3ARZA 4J3TA 5A1AA 3AISA 1GOWA 1CYGA 3AHVA 3SCTA 1R85A 1MW0A 5JIPA 4GI9A 4MDOA 2E9MA 2BVYA 4J3VA 3CBWA 1CXEA 5M3WA 3GXIA 2VJXA 1Q4NX 2ZX5A 2G4FA 3VM7A 1KGXA 2GJXA 2XWDA 4HZ8A 4WF7A 4JFVA 1N82A 3ZO9A 2PWFA 3JUGA 3WQ4A 2EBNA 4PBGA 4PSRA 3EMQA 2A3BA 3NJ3A 1W2PA 3WH6A 1BAGA 1WDQA 3GBDA 3QHNA 1ZS2A 3W24A 4AXNA 3BSHA 3FW6A 4U3AA 1WZLA 4H8VA 2WC4A 1PPIA 2CYGA 3PTMA 3PN8A 2QF8A 2DQXA 5LA1A 1G94A 3VO0A 1KGWA 2XM2A 4FMVA 2XIIA 4HMEA 1XC6A 2CXGA 3B9AA 3W6LA 3VTRA 4JKLA 2E9BA 3N1AA 1CEOA 2XVLA 1YHTA 3W29A 2VZVA 1FH7A 1UG6A 1MWOA 3W25A 3WNLA 4MADA 4ZE4A 3EDJA 4M80A 1X6LA 2DSZA 1VJSA 3RMEA 3FXYA 2J7GA 4HOZA 1ZJBA 1B1YA 3UG5A 3SURA 4TVDA 5A2BA 1NM9A 1H09A 1OBAA 2VURA 4D1IA 3CHCA 2D2OA 4GI8A 3W27A 3RM8A 4QCFA 1US2A 4AZCB 3WMSA 1UR8A 4CD7A 1C92A 2C0HA 4GIAA 1XHGA 3CUFA 3VOCA 4JFWA 2XSAA 2E8ZA 1UD2A 1WDSA 5E6YA 2UY2A 5A2CA 5A95A 2G3NA 4M81A 1NWTA 4P8XA 4J28A 1E43A 1KCLA 3BAIA 1ECEA 4MAZA 3SCPA 5HNNA 1J11A 4BZYA 2WMIB 3AIBA 2YBTA 3AIQA 3WH5A 4AZIA 4R27A 3AHTA 3AIWA 4AY1A 2GK1B 5C71A 3CUIA 2WKGA 4QAWA 2VQUA 4QP0A 4BQ3A 3DYMA 1VB9A 1J0YA 3EMCA 1VBRA 2Y5EA 1UD3A 2QV4A 1H4PA 2G3JA 1HL8A 1JZ4A 1GHRA 4BF7A 4Z2JA 3HJEA 1VJZA 4ZENA 4URIA 2BHUA 1W2VA 4Z2GA 3GNOA 1V3KA 4UTFA 3CUGA 2PWHA 3AS3A 2WBGA 1OM0A 1GJUA 5CSYA 7CGTA 4B3LA 5IFPA 5A8QA 2D3LA 4A4AA 2OYLA 5IHRA 2PI6A 1SMDA 1HJSA 1UWTA 1CXFA 1JXKA 4IPLA 1UZ1A 2FHFA 1ISVA 4B3KA 1E72M 1EQPA 5A6LA 1DWAM 4PMOA 3CHEA 4ZFMA 2VOTA 2ZX6A 4R5EA 4TX6A 1PIFA 4PSPA 3NCOA 1W9VA 4M8UA 1VEMA 1CIUA 4JKMA 3ARUA 1JNDA 5A6KA 2YIHA 1XH2A 1OWQA 2UWFA 1DHKA 4AZCA 3SCRA 4XX6A 3VIHA 2VX6A 1OSEA 3VMPA 1NWUA 1QHZA 2ZX9A 4W7VA 3ZT6A 5KEZA 1KXTA 4NRSA 2W92A 3AS1A 4AD5A 1M7XA 1AQMA 4MAVA 2ZUNA 4TOQA 1V08A 2D0HA 2WMIA 3WUGA 2JEQA 3CPUA 1WDRA 4NF7A 5A6JA 1FA2A 3WL1A 1WPCA 2J75A 2GK1A 3N18A 1VEOA 2DSVA 3A6OA 5CGTA 4GZIA 2CBUA 2F2HA 5M17A 1NOWA 3PTKA 1OIFA 4AZ5A 1KXVA 2EPKX 2J78A 5D9NA 1XH0A 4MJ4A 3TA9A 1H11A 6TAAA 4NI3A 1UH4A 3GYCA 4PUEA 3VIKA 3K4AA 1QHOA 2CBVA 1B31A 1QI2A 4TTUA 2JALA 4UFLA 5AC5A 2CKRA 4PYSA 1KWGA 1J0JA 2WZHA 3FY1A 3MANA 4BA0A 3UR8A 4DWSD 3ZT7A 2XVKA 1UH2A 3RPMA 1QNQA 3L4TA 5FKYA 2NW0A 1PZ3A 3AIUA 3WF3A 2V3DA 4S3JA 3QGVA 3N04A 1E4LA 1FFRA 1LG2A 2ZOXA 2ZUUA 1GQJA 4UQCA 4NSBA 1E3ZA 4F66A 1TE1A 3SEPA 3F5LA 4D6JA 1EDQA 3WN6A 5DFAA 1DEDA 4M82A 3AI0A 3VPLA 4MTVA 1WE5A 1NP2A 5JH8A 1JAKA 4GKLA 4V27A 3SUSA 4C7FA 3VNYA 1IV8A 1C90A 1E5NA 4U2ZA 3VVGA 1WB0A 1V6XA 1XYFA 2XM1A 3A47A 3ZQ9A 3MMUA 4JKKA 5A8MA 3AMDA 3WD3A 4XB3A 3VGDA 3THCA 1QNPA 5C70A 1HT6A 4N42A 1EHAA 2CESA 1QI5A 2CBJA 3CZJA 4GO9A 5IXEA 3ZR5A 4D6GA 5BXRA 4PMNA 1JYVA 2ZX7A 4UFKA 4D1JA 3B8SA 1UUQA 1JD7A 2PWEA 3WQ5A 5E70A 1RP8A 1DP0A 5I78A 5JBEA 2BHZA 1SR0A 1B0IA 3TOPA 4D6CA 4TUFA 4YHGA 2FGLA 3AIEA 1ZBKA 3WDHA 5I23A 3W38A 5KZ6A 3EDDA 4D71A 1E9LA 2XVPA 3T0AA 2DIEA 4ATLA 1OINA 1UWUA 2V5CA 1DWHM 1QW8A 2J79A 4X0VA 3VMOA 1JZ2A 2X0HA 1ZL1A 1HXJA 2YLLA 4F8XA 1UZ4A 1U33A 3E1F1 1FH8A 1V0KA 4HTYA 5C8BB 3NDZA 1UKOA 1NOUA 1PX4A 5HOSA 1TVNA 2EPOA 3F4VA 2JF7A 4H41A 2CCRA 1JDCA 3CTTA 2VX4A 3SCNA 1PZ2A 5I5RA 1EIBA 1CENA 3BAYA 5TD4A 2OWCA 3ZT5A 2QPSA 1MVYA 2EEXA 4TTGA 4PMRA 2DDXA 4YHEA 1HKKA 4HMDA 2VTFA 1UKQA 5EB8A 3APGA 1UH3A 2XTKA 1K6AA 2G8ZA 1D2KA 4W8BA 4DWSA 1XV8A 4AISA 5E09A 3W0KA 4LX4A 1BYCA 2C7FA 1BGGA 2J8GA 5HDRA 1F4AA 3NSXA 1CBGA 4HOWA 1E6XM 4GQRA 2BNJA 1G5AA 4KH2A 1EHNA 1ODUA 2ZXAA 5ABFB 4V2XA 3GNRA 3RIKA 3VINA 1E73M 4JIEA 1JDDA 3U57A 4Q22A 3IJ8A 1UD8A 4AZ7A 2E40A 2CEQA 2WZIA 4DUWA 5I77A 3ZR6A 4H8HA 1UWSA 5LYRA 3RM4A 4W89A 4X9YA 2Y24A 5EBAA 2FGZA 1C7SA 3KWXA 3SCOA 1KXQA 3AHXA 3AJ7A 4PRWA 1PJ9A 2XFFA 3AYRA 4OOZA 5CG0A 1GVYA 1L0PA 4PCTA 3OG2A 3CMJA 1EDGA 1V3JA 3IJ9A 4U5KA 1E71M 1JF5A 1TCMA 5BXSA 2AMGA 1B9ZA 1GVIA 1HX0A 4Z2LA 2YL5A 3T2OA 3TONA 5GQBA 4W7WA 4FK9A 2BY2A 1E15A 4FLOA 2OYKA 1XYZA 4TVUA 4UFHA 4D6FA 3WEZA 4MB5A 1V02A 4M29A 4W7UA 1KGUA 5M03A 4M24A 1SYTA 2XGBA 4U3CA 3BC9A 3ZIZA 2QMJA 4Z2IA 2WWCA 1Q6DA 3ARPA 3A3HA 2FH6A 3SCVA 3LMYA 1VRXA 4Z2KA 3AQUA 4B9ZA 2VR5A 4AW7A 2RGMA 2ZICA 2ZX8A 1CGVA 5LA2A 4JFTA 4ATDA 4PMYA 1VF8A 3A4XA 1GQIA 1AVAA 3OLDA 3VGEA 1PX8A 1CXHA 5E0FA 1E3XA 3NSNA 2EXOA 1H5VA 2XJ7A 2GSJA 3L4YA 2WPGA 1BTCA 3MKKA 4AZBA 4OZOA 5FIPA 2BHYA 1GOQA 2D3NA 5DT7A 3ZM8A 3BXWA 3K8KA 1LG1A 2QMKA 4EE9A 1MQRA 3CLWA 3RJYA 4IISA 4MB1A 2PBGA 4AZGA 1QNOA 5ABFA 3HN3A 3KE0A 4PTXA 2PBOA 3A4WA 4W87A 3NIYA 3PHAA 1IZJA 3OBAA 1RH9A 3CMGA 3ZSTA 5FD0A 4UOZA 1BLIA 2ZXBA 1K9TA 3VKKA 1HKMA 3DHUA 2CHOA 4PTWA 2XHYA 1HF6A 2XPKA 1GJWA 1CNVA 1RP9A 5D8ZA 1UKPA 4LQ1A 1DTUA 2ZUVA 2CHNA 4XV0A 1G01A 3VD3A 3ARQA 4PN2A 2YOCA 1UR2A 3TTQA 3PZOA 1K9FA 3OLEA 3PTQA 1GW1A 3CGTA 3WUFA 3L4WA 4HPHA 1JIBA 6CGTA 1VAHA 2JIEA 2VRJA 1L8NA 2DT1A 3B9EA 4H8UA 2OYMA 1W3LA 1ZBCA 3MMWA 1JG9A 3RJXA 3GTNA 3GBEA 4DM2A 2CIPA 2J77A 4UQDA 5HBFA 2OSWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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