1HKKA

High resoultion crystal structure of human chitinase in complex with allosamidin
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEQSGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Allosamidin Derivatives in Complex with Human Macrophage Chitinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITOTRIOSIDASE-1
molecule tags Hydrolase
total genus 132
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1hkkA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hkkA01
1UKQA 1LL4A 1H41A 3UG5A 4C7FA 2OYLA 3NYDA 3FHQA 4KGJA 1RP8A 3T09A 4JAWA 3AQUA 4QP0A 1CDGA 2W61A 2VOTA 3SUVA 2F8QA 3N17A 1XYFA 1W9BM 1E1EA 2A3CA 3W53A 4CUCA 4V2XA 1C7TA 2ZUSA 4WJXA 3W26A 2YA2A 3AS0A 4ZEPA 3WBEA 4U33A 1UR2A 1HVQA 1H49A 2VI0A 5BXTA 4HU0A 1DWGM 3K8KA 2WC7A 3FHAA 2D20A 3SCVA 4D71A 3AXIA 2XFYA 1VFOA 2C8NA 4HOXA 3VVGA 1GVIA 2BHYA 2DEPA 5CXPA 1JNDA 1E40A 3LMYA 2VX6A 4CD5A 1BVNP 1JYVA 3THCA 3WFZA 3KZSA 1WB0A 1ZL1A 1H3GA 1TVPA 1OGGA 2XVPA 5DF0A 4UQCA 1CXLA 3BH4A 3N11A 3EDFA 1UR4A 4DM2A 1EQCA 3ARQA 2X0HA 1U30A 2BNJA 1B3YA 3OLDA 4W7WA 3L4ZA 1SFSA 2WHKA 1ITXA 3TTOA 1R8LA 2RGLA 2VC9A 3VNZA 5KZ6A 1H0IA 3WD4A 1QBAA 2Z1KA 2DSUA 4QFUA 4FK9A 8A3HA 1W1VA 2XYLA 3RJYA 2DT3A 1E70M 2VCCA 3W37A 1J10A 1EDTA 3WQ5A 3AYRA 1FFRA 1ZBWA 1VBUA 1M04A 4KWUA 3GH7A 1WCGA 3GNRA 1E4NA 2YKKA 3G6LA 3BSHA 3RM9A 2CKSA 5DO8A 3GNPA 2YA1A 3CZ8A 4H41A 4HA4A 1J0HA 3QGVA 2VTFA 4W85A 5CJ5A 3AI0A 3EDJA 1GQJA 3WEZA 3GM8A 4TXEA 1JGIA 1HX0A 4FF5A 2JIWA 1FFQA 1UH2A 6TAAA 1V6YA 3K8LA 3WMSA 3CZLA 3HMCA 1VB9A 4OIFA 3VMOA 3SURA 4Z2IA 5LA0A 4GI6A 1GCYA 2B31A 3ARZA 2UY4A 4OOZA 2WB5A 1UA7A 1UHVA 1E3XA 1OB0A 3HU7A 2GDVA 3VIKA 1GVYA 3BAWA 1EHNA 2FH8A 3VKKA 1Y7VA 3AIVA 5A6LA 5A6AA 3PN8A 1ZS2A 1FP8A 3OGSA 2YJQA 2XSBA 1J11A 2W5FA 4LX4A 2Z1SA 1EOKA 2E40A 3WUGA 3TP4A 9CGTA 4U31A 4GINA 2ZWYA 3CO4A 4MNLA 1W9PA 2UWFA 4AZBA 1UWQA 3KE0A 1LQ0A 1TE1A 7A3HA 1VEOA 1E6QM 1VEPA 5I78A 1QOXA 2YDRA 2YDQA 4J3SA 1MVYA 1FH7A 3WDHA 1PEZA 2HVMA 4WKFA 3GZAA 1Q6EA 4PMOA 3VD4A 3SUSA 4UOJA 1CXFA 1J0YA 3K1DA 5HPOA 5EBAA 3BAIA 3UEQA 2WBKA 5M3WA 5ABFB 1GJWA 1J9YA 2ZWZA 1WE5A 2CKRA 1UKSA 1QHZA 3B9DA 1HF6A 4PRWA 4AD3A 1JD9A 4D6HA 5BROA 3JUGA 1E0WA 5D8WA 4OOUA 4TVCA 3AMGA 1V6XA 2CCRA 2CITA 1KB3A 5IDIA 4D1JA 1US2A 2AAAA 1GQIA 1W9DM 4PMXA 5CLTA 2WVVB 3D3AA 1ZBCA 2J7DA 5BRQA 3UETA 4CGTA 2W91A 4E4PA 1LG2A 5M03A 3W29A 2GDUA 4UFHA 1TG7A 1SYTA 1ISZA 4ZE4A 2J74A 1M7XA 3W81A 3AISA 1V08A 4IPNB 3VD3A 2GJRA 2O9PA 1JZ8A 4UZUA 4UQAA 3AS3A 2FGLA 3KL0A 3WD3A 3SCWA 1HJVA 3W28A 5D9OA 1GJUA 3FAXA 4C7DA 4DWSB 3EMCA 5CPTA 1J18A 3VGDA 2ZICA 1J12A 3OBAA 4PMZA 4CKQA 3ZJ6A 4H8UA 4W5UA 1EH9A 1Q4NX 4PTWA 2ZXAA 3ZSTA 3W82A 1CYGA 3ZJ7A 2BVDA 1V3JA 3NIYA 3CUJA 3ZT5A 3WF1A 3PZOA 3MMWA 3S6TA 4A3YA 1WKYA 2YL6A 5BWFA 4C7GA 2HISA 4QLLA 1EO7A 1CECA 2WMIB 4EANA 1G01A 4R5EA 1UWTA 3SCQA 4DUVA 4S3KA 1F4AA 1SMDA 3WD2A 2G3JA 1HN1A 3L4YA 1E5JA 1J0KA 3T08A 5F7UA 1ECEA 4H8HA 2F2HA 2W66A 3VDBA 4PMYA 4W89A 3T0DA 3A47A 2ZX7A 7CGTA 3AXXA 5A2BA 1WDSA 1UKTA 1HKMA 1LF1A 1MFUA 3VILA 4J27A 5LA1A 1W2PA 3WQ4A 2GJXB 4W87A 3SCUA 4BZYA 1KQYA 4P7RA 5CSUA 3BAXA 3SCSA 4PMVA 1UD5A 1PX3A 3VU2A 1XH0A 3WEOA 3T2OA 2VO5A 4LYQA 3BLKA 2OSYA 4BQ4A 4P8UA 2DT0A 2FHBA 4MTVA 2F61A 1L0PA 1TCMA 1QBBA 1GPFA 4GZIA 5BYWA 1JZ3A 2RGMA 1CXIA 1E56A 1YHTA 2W4XA 1UOKA 1K6AA 1H11A 3BC9A 3EMQA 4UFMA 1W3LA 3B9AA 1B3ZA 1E3ZA 2TAAA 3VIHA 3VNYA 3WQ8A 3PTKA 2ZX8A 4BA0A 5IXEA 4XUYA 4AIUA 1E15A 1QVBA 2VCBA 4PTXA 2WC3A 4U5IA 2QMKA 4B3LA 2FH6A 4F66A 1LL7A 1WDQA 1JDCA 1H1NA 3L4XA 4H7VA 2V5CA 2ZUVA 3NUKA 4DM1A 1HL8A 3VPLA 2D3NA 1SR0A 3AROA 1C93A 1KBBA 1QI0A 2CNCA 3ARUA 4ATDA 1EIBA 2VX4A 4WIWA 5BXPA 4TVDA 4NF7A 3U7VA 1J0ZA 1GHSA 1UH4A 1LG1A 3ZSSA 2DIJA 4B16A 1UD6A 1KFWA 2WKGA 3K8MA 4CVUA 1W3JA 1WZLA 2DIEA 3BMVA 3EMZA 5JBEA 4J3TA 1VEMA 1QNRA 5ABEA 4GKLA 2WSKA 4AZ7A 4Y7EA 2VURA 5JBDA 1UWUA 4PMDA 4PYSA 2D2OA 3FY1A 3AOFA 4M81A 4GI9A 4D72A 5JUVA 1W1PA 4A3HA 1GOWA 2YLAA 4GO8A 3ECQA 1UR0A 2GSJA 1MQRA 4J3VA 3CH9A 1MW3A 1NOFA 3WH5A 3F5JA 4TX8A 1WNOA 5FL1A 3CLWA 4UTFA 1RD6A 4MB1A 3L4VA 1E9LA 1B30A 3VIIA 1EGZA 4NZCA 5E6YA 4WKHA 4U5KA 1LLOA 2EPLX 2YDSA 2OWCA 1HIZA 4EAMA 4M24A 2ZX9A 4W8BA 2ZUTA 3POCA 5LYRA 3WH8A 4UQ9A 3K46A 1H4PA 1BFNA 3I3DA 1XC6A 3CUIA 3AHYA 4JKKA 4UQDA 1FH9A 2DPEA 3K4AA 2X1IA 1FH8A 4JIEA 3IJ7A 2PWGA 3WD1A 3PZ9A 2DH3A 3OLEA 4B9ZA 3PZVA 1TFVA 1RH9A 4AD1A 4CCCA 1BYCA 1JF5A 1DWIM 4UCFA 1JZ6A 3KEHA 3CBWA 1HJWA 1CGTA 5CG0A 3OIHA 3VDHA 1HP5A 1V0KA 1K9EA 1V02A 1UD8A 4OBSA 4W84A 1MW1A 3U7BA 3II1A 3AHXA 1JD7A 1QNSA 2XM1A 2WNWA 4TTUA 2WPGA 1E71M 2GFTA 2DT2A 3BCFA 3RILA 4HMCA 3ZT6A 3GNOA 1EA9C 4F9DA 1WAWA 4FLRA 3CMJA 5FOOA 4D6GA 5GQBA 3PZNA 2ZUNA 5CSYA 4JCLA 5BXRA 1OIFA 3WNOA 4DWSC 3WNNA 1JF6A 3VD5A 5BXSA 4CD8A 3AS2A 4TOQA 1EOMA 1I1WA 3AZRA 2QV4A 8CGTA 3OA5A 1BF2A 3AYSA 4YN5A 1B31A 2WANA 1E6PA 4LYRA 5CZKA 4JKLA 2YA0A 3SUTA 1BGGA 1VF8A 3VGFA 1HKIA 5IFPA 1XCWA 3GBDA 4XV0A 2XVGA 3MUAA 1JL8A 1CGWA 2UY2A 4GZEA 3AMKA 2XGIA 3CZEA 1HNYA 4AIEA 3UG3A 1N82A 1KCKA 2ZE0A 4RE2A 1W3HA 2XVLA 2J62A 5A6BA 1GNXA 2W67A 4QLJA 4W8AA 4WLCA 5I2UA 2XUCA 2PWDA 1KGUA 4JL1A 4P7QA 1M01A 3WIJA 3CHCA 1XD1A 3A3HA 2OWXA 1KXVA 2BY1A 2QMJA 4HOWA 4EK7A 4FLOA 2Y5EA 1JI1A 2VCAA 1C90A 1R86A 2FDMA 2Y4SA 3L2MA 3QOMA 4X0NA 2CETA 1UWSA 2BVYA 1OINA 4AD4A 1W2VA 1EDQA 3ALFA 2A3AA 3PZTA 4U2YA 1FHLA 1CGYA 2WBGA 2OSXA 4M1RA 1UQYA 5D4YA 5ABHA 1MWOA 1U33A 2OSWA 1KXHA 4MNMA 3CGTA 1JZ5A 4HZ6A 3DECA 2Y2WA 1QI3A 4JFSA 3SUUA 4Z2LA 3LPOA 1MW0A 3A4WA 3GTNA 1B3VA 2BY0A 2DGAA 5I0DA 4TUFA 2WSPA 3TTQA 1O6IA 1XGZA 1GOIA 5A6MA 3AIUA 5E09A 2XTKA 1VBRA 4JHOA 5JH8A 2WLZA 3ALGA 4H04A 1JIBA 3WD0A 4XB3A 1VENA 5I3DA 2WAGA 4PCSA 3NJ3A 2VMFA 1C7SA 3BAJA 3OGRA 1DWJM 1C8XA 5KEZA 2WWDA 2G3MA 1K9FA 2C7FA 1KXQA 3ARVA 4LPCA 3ARYA 3AMLA 3RM8A 1QI5A 3PZGA 2AMGA 2QPSA 4V28A 4CCEA 2EJ1A 4HZ8A 1XSKA 1ODUA 1R7OA 1KWGA 3IJ9A 1KR0A 2GVYA 4PN2A 4AZ5A 2WKLA 3VDAA 1GONA 2MANA 4OUEA 3ZOAA 4GI8A 1OM0A 4N42A 3AMCA 2NT1A 3O2LA 3WQWA 2IXUA 1V0LA 3O9NA 5I24A 2JALA 1X6NA 1KR1A 2V3FA 1R85A 4GIAA 3VX0A 1YQ2A 3A6OA 1XHGA 2EPMX 2W92A 5EFDA 4PMQA 4ZXOA 3T0BA 3UESA 4AC1X 5D9NA 4MDOA 2CHOA 3UR8A 1CPUA 2J8GA 4ATLA 5A2CA 1UQZA 4YPJA 6CGTA 1QNPA 4P7NA 1QW8A 2PI6A 4KGLA 1W3KA 2OWWA 2O9TA 3WDQA 4W88A 1ZU8A 2YL9A 5IHSA 3LPFA 1OSEA 2X2YA 3PBGA 3WL1A 1M03A 3WQVA 3HN3A 3AFBA 2DSVA 5DEZA 1BPLB 3FNDA 1LWJA 3SCRA 4D6CA 5BRPA 1EHAA 3MANA 5IFTA 2WC4A 2J25A 4AXNA 4J3XA 3IAPA 1C8QA 1ISYA 3DYMA 3OZOA 3APGA 1JDAA 4BS0A 2GK1A 4B9YA 1E4MM 3VTRA 1Z32X 1GORA 1QW9A 2XPKA 4M80A 3VUPA 1BG9A 4WSKA 1BYDA 2XG9A 4UR9A 1D2KA 2PWEA 3U5UA 5TD4A 1HT6A 4NRSA 2BXZA 3DHUA 1HP4A 4Z2GA 1R7AA 4JFTA 4J3UA 1UA3A 4MADA 5A6KA 3O6AA 5C71A 2JFEX 3B8SA 2JEQA 2DDXA 1OBAA 1CLXA 3RMEA 3MUY1 5A69A 3SCOA 1E4LA 1UG6A 1JYWA 2A3HA 3AIQA 1W9VA 2BV9A 1QHPA 2ZX5A 5EB8A 4UNIA 1JZ4A 3WH7A 2ZIDA 4JFWA 2J7HA 4XZWA 2J47A 4NSBA 3G6MA 1NWSA 1OGBA 3VIOA 2ZXDA 3MUIA 1B0IA 3ZT7A 2W62A 2WCAA 4DUXA 1PX4A 2G4FA 4AD5A 2BFGA 2A3EA 4DWSD 3SIMA 2CBIA 3BSGA 3NDYA 1Q6GA 4HA3A 1CIUA 5HDRA 1JFHA 2FHCA 4QAWA 1GQLA 2J7CA 2BHZA 1W9UA 1V0MA 1H09A 4WK9A 3OZPA 1BSIA 2WMFA 3WENA 1JFXA 3WBAA 2XIIA 5A3HA 4W5ZA 4AWEA 2VQUA 2VZSA 3F4VA 2PC8A 2ZXBA 4UQBA 1VJSA 2Y8KA 1UH3A 4IUGA 4PMRA 3I3BA 1I1XA 4Z2KA 3THDA 1VRXA 4FLQA 2J7BA 1OCQA 2J4GA 3VD7A 4E8DA 2FHFA 4MJ2A 1JAEA 5A6SA 4MJ4A 2EPKX 4AD2A 3TOPA 5A95A 3T2PA 2IUZA 2XHYA 1TMQA 1CGXA 4X9YA 4ML4A 4MAVA 2XGBA 1WP6A 5E6ZA 4XZBA 1H0GA 1GOKA 4GZJA 2VR5A 1Q6FA 1IZKA 3U57A 1KWKA 4WKAA 1UUQA 1MXDA 1HL9A 5A8QA 4GQRA 1X1NA 1NQ6A 4V27A 4PMUA 3RPMA 2VUYA 4PUDA 1V6VA 2YL5A 5GPRA 5D8ZA 2EQDA 3MKKA 1KBKA 2YBUA 1UR1A 1DWFM 1K9DA 2PB1A 3WMBA 5M5DA 2BY3A 4OKDA 4CD7A 1XRVA 1ISWA 1TVNA 1V6WA 3VDCA 1G94A 2VT0A 3ARRA 1MXGA 2CEQA 2D0FA 3QHOA 2J8FA 2X0YA 5HXMA 1V3HA 4NI3A 1LL6A 3BXWA 2DSKA 5FD0A 1XSJA 2D22A 5JIWA 3PTQA 4KMQA 3W6LA 4PTMA 2O92A 1B3WA 2X05A 1MW2A 2BS9A 1PJ9A 2VX7A 4JKMA 3T2QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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