1HKMA

High resolution crystal structure of human chitinase in complex with demethylallosamidin
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEQSGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Allosamidin Derivatives in Complex with Human Macrophage Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITOTRIOSIDASE
total genus 125
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1hkmA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hkmA01
1ODZA 3VIFA 1QHOA 3KE0A 6CGTA 1LJYA 1KXQA 3TTSA 5A94A 3BCFA 5LA2A 1W9DM 5EMYA 1ZBCA 1VBUA 1UWRA 1FFQA 1JI2A 1UD8A 1CZ1A 3VDCA 1PBGA 3D5HA 1K6AA 3WD1A 4E4PA 5A3HA 1B3YA 4W5UA 1KCLA 2WMIB 4B16A 1TG7A 1LLOA 3VD9A 1CEOA 4AD0A 1WDQA 2IUZA 3PTMA 3VGFA 4GZJA 1CENA 4UQAA 1ZS2A 2VX4A 2PBGA 3CUFA 2PWEA 3EMCA 2G4FA 4WSKA 1ITCA 3PZUA 4UFJA 4PTMA 1VJZA 3AS1A 2V3DA 2GK1B 2IXVA 3SCQA 3ARZA 3M07A 4J27A 2DQXA 3WBAA 3ARUA 3UCQA 1X6LA 1TFVA 4ML4A 1QI5A 1XV8A 4PMDA 3WDHA 1XYZA 3AHTA 4V27A 2WHKA 1G1YA 3GH4A 4KGLA 4TOQA 4F79A 5A6MA 1GQKA 2PB1A 1MXDA 1BYCA 1U30A 4FK9A 3GXIA 1WDRA 3AIUA 5LA1A 1NP0A 3AS2A 4JHOA 5E6YA 1TUXA 1PIFA 4ATDA 2WZHA 1V3JA 1JIBA 2WMJA 1GONA 3MS8A 3AZRA 2G3JA 3HU7A 1M7XA 1EHNA 2XWDA 2E4TA 4KMQA 4MB5A 5BXTA 3VIGA 3VMNA 1UH4A 4OJYA 1XCXA 2XVPA 2VZVA 4QLJA 3WD3A 1B0IA 5EFFA 1FOBA 2J75A 1E72M 4C7FA 1MQPA 1XD0A 2X09A 3AMGA 3EMZA 1E0WA 5HDRA 3WH5A 3FN9A 2CBIA 4PMVA 1JGIA 2ZX9A 1J0YA 2V3GA 4FF5A 3AZSA 1W2PA 3WF3A 1M04A 1MFUA 1QBBA 2VRJA 2E9BA 1ISXA 2ZOXA 1TVPA 1OD8A 2NSXA 1AQMA 4D1JA 3SIMA 5A1AA 2CKRA 4U31A 3WH6A 1C7SA 3FW6A 3WMCA 2RGMA 2E0PA 3AIEA 2CXGA 1UZ1A 2OYLA 1XCWA 4ZE4A 2D0HA 3RM8A 1UR2A 1PX8A 3T2OA 4MPKA 1RPKA 2VX6A 4FLSA 1HKJA 1SR0A 1HIZA 1X1NA 1WCGA 5A6SA 1JFXA 3GTNA 3TP4A 1QW9A 1WZAA 2UY3A 4WLCA 3RJXA 3VDBA 3ZJ6A 2DSWA 4UCFA 2VR4A 1XHGA 3L4VA 2ZX6A 5E09A 1B3VA 4MADA 4BS0A 5CGTA 1EDQA 1TZ7A 3VM7A 4RE2A 4XX6A 5I6SA 1G01A 3SEPA 1CNVA 1B31A 3VUPA 2OSXA 3CHDA 3WF4A 2D0GA 2NT0A 3PHAA 1VENA 5E0CA 4AD3A 3ZSTA 1BGAA 2YJQA 1PZ3A 3PZGA 4PSRA 3SUVA 5AC5A 1VFFA 1JDCA 4XZBA 4EKJA 3WSUA 3FAXA 3WNOA 1MVYA 4AWEA 1TA3B 1BLIA 1OIFA 4ACZB 1MYRA 2A3EA 2F61A 1QI0A 1KWGA 2DGAA 3L4ZA 2IXUA 5A2AA 1DEDA 1J18A 4WKAA 1H1NA 1W9UA 3W25A 2QV4A 5C71A 2ZX8A 3AISA 4XB3A 1CXKA 4JL2A 4UR9A 3II1A 5I0DA 1M03A 2CBUA 3OLGA 3ZT7A 2WW5A 2X1IA 4X9YA 2J25A 4ZFMA 3VPLA 2D22A 5E0FA 3A4XA 4MNLA 2GSJA 3SURA 5CQ1A 3BMWA 1G94A 4P7RA 1UR9A 2JIEA 5HOSA 4A3YA 2XWEA 5FKYA 2QMJA 1V02A 2XM1A 1V6VA 5BROA 1U2YA 1EXPA 4F8XA 3TTOA 3GBDA 2DEPA 1UD2A 2VR5A 3VD5A 3HJEA 4JFSA 4XV0A 2XTKA 4AISA 2VCCA 1KGXA 3O2LA 3PZIA 3VINA 1CXLA 4P7QA 3WMBA 1BYDA 5JBFA 1YHTA 1K9TA 2XYLA 4CN1A 2WAGA 3W29A 3MO4A 2NT1A 2OYMA 1LL6A 3AMLA 2WHLA 3AIBA 3WNKA 1V3IA 2FH6A 1E0XA 2WXDM 4UOQA 4UQ9A 3GXMA 4W93A 4YN5A 1G5AA 4ZENA 3DHUA 2Y4SA 3N12A 2Z1KA 2WVSA 3K4DA 3B8SA 1NM9A 1D7FA 3CZ8A 1ISYA 2G41A 3QR3A 4IUGA 1C8QA 3DYOA 1EO7A 4J3UA 4H2CA 2WC3A 3SCWA 1GOWA 3EDEA 7TAAA 4J28A 4LPCA 1E6PA 1YQ2A 3MKKA 3BAYA 2WYSA 3VD7A 3SCSA 3WQ8A 3O9NA 3WNLA 3VNZA 3L4XA 4IM4A 4U3AA 4AC1X 3WEOA 4JKMA 4HPGA 3IJ7A 3W4RA 4NF7A 4PTXA 1PX3A 2XHYA 2A3CA 3W27A 1BF2A 4GKLA 3W6MA 4KRUA 3BLKA 1WKYA 1HKIA 5GNXA 1QNRA 1CWYA 3RIKA 5I5RA 2WLZA 3AI0A 1B90A 3AICA 1V08A 5CG0A 1FHDA 1B3ZA 3VNYA 1GUVA 3WMSA 2E8YA 2J7CA 2CESA 4OUEA 1UG6A 4U3CA 1E71M 2WWDA 3KZSA 2WK2A 5ABGA 5HNNA 1E5JA 3PZMA 1C8XA 2W5FA 3T0DA 5IHSA 3KL0A 1BHGA 1FH9A 5E6ZA 1Q6CA 1ECEA 2UWFA 4M82A 1LWJA 1HX0A 1XH0A 3UG3A 3WUFA 1HT6A 4Z2KA 5JIPA 3VU2A 1E6NA 1MW0A 4RL3A 2J74A 3WEZA 4M81A 4PMXA 2X05A 3VO0A 5I77A 1QNOA 2J7HA 1UD5A 4D1IA 2WNWA 2E3ZA 1TE1A 3AIQA 5C70A 3IJ9A 4AIOA 1W3JA 3WQ5A 3T0BA 3ARTA 4CCEA 2VQTA 3WUEA 5M03A 5I79A 3IK2A 4U33A 4M8UA 1EDTA 4N0RA 5ABFB 3CZEA 2XM2A 3NIYA 1L0PA 3M46A 2WPGA 1LL4A 4LX4A 1QPKA 1I1XA 3F4VA 1KCKA 3ARPA 1J11A 1VEMA 3CUIA 5CPQA 1EA9C 4WJXA 2NW0A 1CYGA 1UUQA 1JNEA 3WKZA 2VRQA 3FY1A 1JDAA 4FLOA 1J0ZA 2Y8KA 3PZTA 3PZOA 1E73M 5FIPA 1CGVA 3FAWA 1UR8A 2WSPA 4D6HA 4ATLA 4UFIA 4U5IA 2ZUWA 4AZ5A 1GOQA 3VIMA 1R7OA 2FHFA 4OBSA 1H2JA 1OCQA 4WIWA 1LQ0A 2OLHA 3GXFA 3QOMA 5GQBA 4JHZA 3MSGA 1V03A 1I75A 1GJWA 1JF6A 3KWXA 5FD0A 3AXIA 2CETA 3WQWA 1EQPA 1J9YA 3VD3A 1CXIA 2V5CA 2JF6A 1WZLA 3T2PA 1KWKA 1K9DA 3F5JA 1HJSA 1DWAM 3DYPA 3THCA 2CHOA 3TOPA 4GINA 3WQ6A 2W62A 2WZEA 2EPKX 1BTCA 1PX4A 1UWUA 1HJVA 3AHYA 3B9EA 3MMUA 3VGGA 2W92A 3IJ8A 1XGZA 4FLRA 3ZMRA 4HMCA 5KZ6A 3AS0A 3SUSA 3AYSA 2XVGA 4AMCA 2YBUA 2EQDA 4GPNA 3ZJ8A 2J78A 5CJ5A 4CD8A 1J01A 4W85A 1W1VA 5JUVA 1WZKA 2WBKA 1GPFA 3K46A 1G9HA 2WMGA 3OBAA 4P8WA 1TVNA 2UY2A 1NP2A 2BY1A 2WHJA 2YA1A 4J3SA 1GW1A 5FCZA 5HPOA 1KBKA 1V3HA 1O7AA 5DFAA 2CBJA 4QP0A 1L8NA 1EGZA 1ZJBA 3BLPX 3WDRA 1DWIM 1E5NA 3EDKA 4W5ZA 2VVSA 1H09A 2VI0A 4PMRA 2GJPA 2V38A 3N1AA 3U57A 1Q4NX 2FH8A 3FXYA 1WZMA 3VIJA 1EH9A 2J79A 2PWFA 5A95A 2WCGA 3VIOA 3ALGA 2F2HA 2DSKA 3WH9A 2VCAA 3CZKA 1A47A 5GNZA 3U5UA 4CGTA 3O6AA 3CLWA 3MUAA 2WANA 1SMDA 3GNPA 2CEQA 4IPNB 1CGTA 4HZ6A 3WIJA 2DT3A 2D0FA 1AQHA 4EK7A 1FP8A 3AXHA 3U7VA 2J4GA 3VX0A 1ZBVA 5FL1A 5C8BB 4AY1A 3AYRA 3HMCA 5D8WA 5CLWA 4HMDA 2A3BA 2DIEA 3A4WA 3OZPA 1TR1A 3AMDA 4CU7A 3POHA 1UD4A 5CLTA 4MB1A 1E56A 2J7EA 5AYBA 4MDOA 4ZE5A 3WDQA 1UWQA 2WZIA 5JH8A 4MB4A 4MNMA 5AY7A 3M7SA 1XD1A 1HKMA 2PI6A 4BQ4A 4D6CA 3W24A 1VRXA 2O9PA 4PEEA 3AHZA 3MV01 2OWCA 3BC9A 2DSVA 1GQLA 2TAAA 4AZ6A 5A8QA 4W8AA 4GO8A 2BHYA 2GJXA 2V3EA 3PN8A 2VO5A 4X0NA 3UR7A 1E3XA 2ESCA 4J3WA 4QDMA 5BYWA 3ALFA 2PC8A 4JL1A 4LYPA 4PYSA 1HVXA 3APGA 1UR4A 1WO2A 2ZXBA 1KGUA 4GXPA 1E4IA 3CZGA 4E8CA 5A2BA 1M01A 2EPNA 1CGXA 3IAQA 2D1ZA 1CGUA 4TX8A 4TVCA 3AFBA 4BA0A 1KB3A 3CZLA 2YDRA 5BRQA 8CGTA 5A6JA 3T2QA 3WDJA 3KL5A 2B31A 3CUGA 1A3HA 4AZHA 1KR0A 4PMYA 1BFNA 4P7LA 4UQDA 2AAAA 3DC0A 2AMGA 2XUCA 1UKPA 5HXMA 1CGWA 1R7AA 3KL3A 2GDVA 3POCA 2EO7A 4NI3A 4W89A 3WD2A 1TCMA 3ZJ7A 1ZBKA 1UD3A 2E9LA 4H8VA 2VCBA 2WKGA 2O92A 1JZ8A 4CD6A 1HP5A 4W84A 1UZ4A 1JXJA 2JEQA 3SCOA 1D2KA 2BY0A 3N04A 1OT1A 4AEFA 4B3KA 1ZJAA 1BG4A 1XSIA 1US2A 1WPCA 3VGBA 4U2YA 4Y7EA 4DWSA 3AIRA 3SCTA 5CSUA 4NZCA 4CVUA 2EJ1A 4AD2A 2CCRA 2XJ7A 4OOZA 5TD4A 3EDFA 1J0IA 1OIMA 3MV11 3RDKA 1CTNA 1VJSA 2VVNA 1W3KA 1HL8A 1TMQA 4Z2GA 3AJ7A 1KXHA 2J8GA 3OG2A 4L4PA 4GZIA 1Q6GA 2XPKA 2CITA 1HP4A 1KBBA 1FH7A 1NOWA 3K8LA 1VB9A 4JAWA 4AXNA 3VTRA 4EAMA 4P8UA 1V6XA 1HXJA 4HZ8A 3VOCA 7CGTA 1CXHA 4HMEA 1JZ6A 1OGSA 4R5EA 2WCSA 1CECA 2YL6A 4UFHA 3S2CA 1BYBA 2ZUTA 2W61A 1MQQA 4CVWA 4AZCA 3WNPA 5A6BD 1E40A 3E1F1 2WVUA 1BAGA 1VEOA 2O9OA 2FDMA 2C7FA 1OSEA 1J0JA 3WQ4A 3NSNA 1XC6A 1PAMA 3MUIA 1GJUA 1BQCA 3CTTA 1NARA 4NRSA 5A6LA 4KWUA 2XVLA 4P7NA 4CU8A 5D9MA 4W7UA 4TVDA 4OKDA 1C90A 3AHXA 1JZ4A 1EOMA 3RM9A 3WEMA 7A3HA 2UY4A 3ZT6A 1E0VA 4V2XA 1OM0A 2VZTA 1V6YA 1W3HA 2Q8XA 1ESWA 4W86A 1D3CA 4V28A 1UHVA 5JBEA 4PRWA 3U5YA 4OZOA 1V02E 2GJRA 2BVYA 1N82A 3F5KA 2J7GA 2CYGA 1HNYA 4OBRA 3CUHA 1WB0A 4AZGA 4WF7A 3MSDA 4CCDA 3VMPA 2Y2WA 4HU8A 4HA4A 2VZOA 5LYRA 1JYWA 2ZUNA 4HTYA 3SCVA 3WNNA 3GBEA 1PIGA 1UKQA 3CBWA 1LL7A 2GDUA 4XZWA 2DT0A 2YIHA 4PCSA 5CXPA 2WMFA 3BAKA 4EE9A 4AZBA 3WY1A 4H7VA 1GOOA 1QHZA 4IISA 4GO9A 1W9XA 1CLXA 2Y24A 2WMHA 2WC4A 4D71A 5D8ZA 2Y5EA 2ZE0A 1B3WA 4DM1A 3AIWA 2ZX5A 4X0VA 1GHRA 1QNQA 3RM4A 5A2CA 4C7GA 1FFRA 4ZXLA 4P7OA 2YLAA 4HA3A 2BHUA 4TUFA 1W9PA 1WP6A 3A4AA 4W8BA 1HN1A 3PZQA 4HOWA 1MFVA 2JIWA 2VL4A 2OWXA 3EDDA 2WMIA 5BWFA 5M17A 2WM0A 4GIAA 5IHRA 6TAAA 4TXEA 5E9AA 3N18A 2QPSA 3IANA 3VD4A 1CXEA 3DECA 1AVAA 4WK9A 1PJ9A 4ZEPA 4U5KA 4B9ZA 3WNMA 5D4YA 1QI2A 3J7HA 4Z2IA 2YDSA 1H41A 1NWRA 4W87A 1Q6DA 3BAIA 1GVIA 3CHCA 4H8HA 1MW1A 2PF0A 5I2UA 2GFTA 1UH3A 4UNIA 4UFLA 3ZOAA 1EIBA 2BXZA 3ZR5A 1I1WA 2BXYA 3GZAA 5GPRA 4UOZA 1CGYA 4OOUA 1OGBA 2X0HA 3WL0A 1XRVA 2VC9A 4M29A 2X8RA 2YL5A 3AZTA 1QNPA 2PBOA 1E6RA 4K68A 1O6IA 3SUWA 1C3FA 4JZ5A 3W28A 4AD5A 3WD0A 2VNCA 1UR1A 3VIKA 4LGXA 1FP9A 4W7WA 3WF1A 2ZUUA 1HJWA 1QI3A 1OINA 1ZBWA 1W91A 4BZYA 3ARRA 5DEZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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