1JNDA

Crystal structure of imaginal disc growth factor-2
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
419
structure length
400
Chain Sequence
SNLVCYYDSSSYTREGLGKLLNPDLEIALQFCSHLVYGYAGLRGENLQAYSMNENLDIYKHQFSEVTSLKRKYPHLKVLLSVGGDHDIDPDHPNKYIDLLEGEKVRQIGFIRSAYELVKTYGFDGLDLAYQFPKNKPRKVIVDPHAALHKEQFTALVRDVKDSLRADGFLLSLTVLPNVNSTWYFDIPALNGLVDFVNLATFDFLTPARNPEEADYSAPIYHPDGSKDRLAHLNADFQVEYWLSQGFPSNKINLGVATYGNAWKLTKDSGLEGVPVVPETSGPAPEGFQSQKPGLLSYAEICGKLSNPQNQFLKGNESPLRRVSDPTKRFGGIAYRPVDGQITEGIWVSYDDPDSASNKAAYARVKNLGGVALFDLSYDDFRGQCSGDKYPILRAIKYRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hormone/growth factor
publication title Crystal structure of imaginal disc growth factor-2. A member of a new family of growth-promoting glycoproteins from Drosophila melanogaster.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Imaginal disc growth factor-2
total genus 143
structure length 400
sequence length 419
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1jndA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1jndA01
3M46A 2ZXQA 4YHGA 4V2XA 4PUEA 5I5RA 1NM9A 1SYTA 1Q4NX 1OGGA 3GZAA 5A95A 2WC4A 4WSJA 4GINA 2B31A 4Q7NA 2WW5A 1BPLB 4H41A 3W82A 3WKZA 4FF5A 2DGAA 2XSBA 1WO2A 1UD8A 5ECUA 3AYRA 2WCAA 1B2YA 3ARXA 3QHMA 2J4GA 4PMVA 2GJRA 3UG5A 1WKYA 2YKKA 1SMAA 3VD9A 4JHOA 3PZ9A 4W93A 3SEPA 1QW9A 4LX4A 1GONA 3OGSA 1PEZA 1BLIA 4LGXA 1PJ9A 2ZWZA 1NP2A 4TVDA 5IDIA 5ABGA 2C8NA 4CN4A 3RCNA 3CUHA 1V3JA 1WNOA 4Z2JA 2XM1A 5IHRA 3UCQA 1X1NA 2UWFA 3KL0A 1SFSA 3BSGA 3CH9A 3VM5A 1IZJA 3RMEA 4CN1A 4CU8A 2YIHA 4UFIA 3CBWA 3IAQA 5LA0A 1JYWA 1LG2A 3ARVA 3NJ3A 4LYPA 2CBUA 4J3WA 5BXSA 2WVTA 1BVZA 4HOWA 2VCAA 3AI0A 1GQIA 1XC6A 2JF7A 1GPFA 3QHNA 5FCZA 3APGA 4D1JA 2V3EA 1V02E 2ZE0A 4R27A 5LA2A 4UOZA 3FY1A 3POHA 3VMNA 4CD6A 2WMGA 2YL5A 3WSUA 3L2MA 3VIGA 5DT7A 2CPUA 1XCXA 1GOKA 1HL9A 3WD0A 4AD5A 1XRVA 3ARYA 1J0KA 2X05A 3GH7A 4AZIA 3CMGA 4JL1A 1B9ZA 1I1XA 4V27A 1HXJA 2OWCA 4AZGA 4XX6A 3SCOA 2W61A 1JL8A 4J3VA 2XVLA 4KRUA 2J8GA 1HF6A 2CITA 1LF1A 1J11A 3ZIZA 3PTKA 2QPUA 3DC0A 3CZJA 3PTQA 3WELA 2ZXBA 1CBGA 3MUZ1 3A4WA 3WNOA 4PTVA 3CHDA 3VOCA 3WD3A 1E0XA 5KEZA 4QLJA 3IJ8A 2XVGA 1UWTA 2NT1A 3WFZA 2DEPA 3T0DA 5AC4A 4Z2KA 4HMEA 5A6SA 3ARWA 1R7AA 3VD3A 4YN5A 1GOIA 2UY4A 4OUEA 4ZENA 5BROA 2HVMA 2YLLA 4BQ2A 1EGZA 5EMYA 3WFLA 1E71M 1HVQA 4AEEA 1JAEA 4E2OA 1JG9A 2F8QA 4CD7A 5DEZA 4A3YA 4DWSA 2A3CA 4N0RA 5I77A 5JBDA 5CLTA 3JUGA 3PZQA 2GJXA 2PBOA 1TE1A 4HPGA 4B9YA 3EDEA 2WHLA 4IPLA 3EYPA 1MYRA 3TP4A 4CGTA 4PSPA 1VBRA 1KR0A 2G4FA 5CLWA 5DFAA 5CJ5A 2W92A 4D6FA 2FGZA 1CTNA 3W6MA 1BGAA 3TTYA 1W9PA 1GHRA 4P8XA 3AIEA 2VX5A 3N04A 4DUXA 2EXOA 4UR9A 3SCNA 1UR0A 4PTWA 2WBGA 4CCEA 3OLIA 4E8CA 3RIKA 1W9UA 2OSXA 4UZUA 1GHSA 4MJ4A 1OD0A 1QVBA 3ALFA 2YL6A 1LJYA 2ZXAA 1UR1A 2WC7A 2XVPA 3WUFA 4ZXOA 3ARZA 1NH6A 4W86A 1TR1A 4ATWA 1JI1A 3MANA 3A6OA 3N12A 5CSUA 4CVUA 4ZE5A 1MVYA 1JZ7A 3VNYA 3MV01 1BQCA 4EK7A 3OGRA 3WEMA 3MUAA 3PHAA 3RM9A 1H09A 3VMOA 3AIUA 3F5JA 4MNJA 5I23A 1E1EA 4AD1A 3G6LA 3AZSA 2CBIA 3WIJA 4QDMA 5KZ6A 2EQDA 3PZUA 4QCFA 4W89A 1GZJA 1B3VA 1YQ2A 2ZIDA 4AZ7A 1FA2A 1MW2A 1WAWA 1IV8A 2YLAA 3I3DA 1GOQA 3L4UA 3AMKA 4U2YA 5M5DA 1JNEA 2PWDA 2OYKA 3CHEA 4Z2LA 2Z1SA 3T0BA 2Y2WA 4OJYA 2WLZA 1H3GA 4AWEA 3HU7A 1GQKA 5FL0A 1KGWA 3W37A 3UEQA 1GCYA 4L4OA 3RPMA 2WVVB 4AXNA 1UA7A 4GPNA 4JCLA 1CPUA 3EDJA 3W53A 3FHQA 1V3KA 2XTKA 3DECA 4OZOA 2O9TA 4YHEA 4S3JA 3POCA 3WQ6A 1NARA 3CUJA 4ATDA 4URIA 1XH2A 1EO5A 4FLSA 4XB3A 3WF3A 1XH0A 1V3MA 1E4MM 1XSKA 1KWKA 3BH4A 3W28A 1AMYA 2WCGA 3WF1A 4W7UA 2XJ7A 4XZBA 1VBUA 4PMUA 4JFTA 5CPTA 2AMGA 4Z2GA 3SCWA 2EPKX 5A6JA 4ML4A 1E3ZA 1QPKA 3WQ5A 1LL7A 5A8PA 1TVNA 2G3JA 2D0GA 2BV9A 2PWHA 2UY5A 1HIZA 4PRWA 1W3KA 1C8QA 4CD4A 2DSKA 3AXIA 4D6JA 5BRPA 5M03A 4OIFA 1TMQA 4IUGA 5A8MA 1CGUA 1MFVA 1J10A 2IXUA 3MSDA 4GO9A 4WKFA 4U2ZA 5A69A 1BF2A 1A47A 1UR2A 1XD1A 3AIRA 5EFFA 1JYVA 1ISXA 3BLPX 2DH3A 4CU6A 3AOFA 4TTGA 3AHTA 2VL4A 1HN1A 5CGTA 3WNLA 3BAXA 1BFNA 2O9OA 1HT6A 5E09A 3BSHA 3ZR5A 2O92A 1GQJA 1VJZA 4QP0A 3SCSA 5E6ZA 4PUDA 4W85A 1DWHM 4GIAA 2JALA 2ZX6A 3CZ8A 1V08A 2D24A 4P8VA 1M7XA 1PIFA 4W5UA 1VRXA 5I79A 3UR8A 1KCKA 4F66A 1CGYA 4D71A 4PEEA 3TA9A 6A3HA 1G1YA 3B9AA 3VD4A 2EO7A 1WDSA 5LYRA 2J79A 3ZO9A 1FP8A 1UH4A 2DSVA 4M24A 3L4VA 2BXZA 2G3MA 3CHFA 3K8MA 3WH8A 4H2CA 2Y5EA 4AZ5A 4MDPA 1TA3B 4CU7A 1E0VA 2D20A 1GOWA 4C7GA 1E72M 3WH6A 1J0ZA 1QNRA 1VEPA 2ZXDA 3GXDA 1CLXA 4R5EA 2BS9A 3FW6A 4PMYA 1OB0A 1FHLA 1CENA 1VFUA 5IFPA 1OM0A 1ZBWA 2VJXA 1MQQA 1OCQA 1OINA 4J27A 1O7AA 2Z1KA 1X6NA 1RH9A 1G0CA 1PAMA 3VIPA 3WBEA 4DM2A 2E0PA 2A3HA 3FHAA 3GH5A 1JF6A 4OOUA 2ZUUA 3ARTA 4M1RA 1WDRA 1QI4A 1E15A 1KBKA 4GZEA 2FHFA 1UOKA 3VIIA 3GDBA 4HZ8A 3ARSA 1WCGA 2W91A 1XD0A 5BXRA 2DSZA 2GVYA 2WAGA 1JZ6A 4WSKA 4P8UA 4PCTA 5E9AA 4JFVA 1XGZA 2VX4A 1CEOA 2BHZA 2FH6A 4UFJA 2ZX8A 2D3NA 1JZ3A 1H5VA 3VU2A 5A3HA 1R7OA 2G3NA 3HMCA 2WC3A 1V3LA 4JL2A 4JIEA 4YPJA 2WMIB 2O9PA 3U5UA 1QI0A 1BVNP 2WVVA 4GZIA 2C7FA 5ABFB 5A2AA 3CUIA 3SURA 4FK9A 1HJUA 2WHJA 1WDPA 2A3EA 4GQQA 1RP9A 3KL3A 2G41A 1KBBA 1WZLA 5GNXA 1TCMA 1V0KA 5I3DA 1G5AA 1WE5A 2YBTA 1V6UA 2CYGA 3DYOA 3RO8A 3CZLA 2PF0A 1UH3A 2DT0A 2AAAA 2E40A 1FHDA 2WZIA 4JHZA 2VTFA 3K8LA 1NQ6A 4AZBA 3VNZA 3ZMRA 4MB1A 5IHSA 2X8RA 4AW7A 3W38A 4W8LA 1V3IA 3U5YA 3ZT6A 5E0CA 2ZX7A 4CD8A 5D9OA 3AZRA 1GW1A 2J7EA 4M82A 3K46A 3WENA 3CZGA 3N17A 3OIHA 3WEZA 1R87A 2BFGA 4B15A 4HOZA 5A8OA 3IJ7A 7TAAA 1FFRA 3OZPA 4HMDA 4DM1A 4W8AA 5CZKA 1JZ2A 1K9DA 1VFOA 1UR8A 4F8XA 2BVDA 3BAKA 3VDAA 2XSAA 4MAVA 4AD0A 1V6VA 4KWUA 8A3HA 3IAPA 3VGEA 2XFYA 1ISZA 1ZBVA 1MW1A 3ZSTA 2PI6A 1XH1A 5AC5A 4TXEA 3MUIA 2DQXA 1QBBA 4PMNA 2Q8XA 2AOSA 5M3WA 3N13A 3WQWA 4JCMA 3VUPA 3WEOA 1PBGA 1QNOA 4MNLA 3ZJKA 4KMQA 2W4XA 3W24A 4FLRA 4CD5A 3AYSA 1G01A 3EMZA 1NWTA 1WDQA 4A3HA 2XGIA 3F5LA 4P7OA 1HVXA 1KXQA 3TTQA 7CGTA 1KQYA 3TONA 1J0YA 2O9RA 1Q6DA 2HISA 3VTRA 3VX0A 3WMCA 4Z2HA 2EJ1A 4QLLA 4C7FA 5A1AA 3O9NA 3AXHA 1ODUA 3WN6A 1L0PA 4B3LA 2XPKA 3OBAA 4RE3A 1OGBA 4QFUA 2VQUA 1TUXA 3EDDA 5FKYA 1VEOA 4BCEA 1PPIA 2E8YA 3GBDA 4UZSA 4FLQA 4AD4A 1DWJM 1V6XA 4RE4A 4OOZA 4P7LA 3AIBA 1J0HA 5TD4A 1UKTA 1V0NA 1Q6GA 1CXEA 4TUFA 3WDHA 3VVGA 3AHYA 1SMDA 2PWFA 2W66A 4V28A 2WVUA 1E3XA 2ZX9A 1M53A 1ISVA 2D3LA 4GKLA 1BSIA 4D1IA 4LQ1A 4U3CA 4OKDA 1QI3A 1CECA 2BHYA 2PBGA 2VUYA 4Z2IA 3PBGA 2EBNA 4PN2A 1BTCA 1QNPA 2OYMA 1HKIA 1BG4A 4BA0A 1F4AA 1J0JA 1XV8A 1K9EA 2QHAA 3ZQ9A 4N42A 1QNSA 4J3XA 4EANA 4E4PA 3NDYA 5JUVA 2WWCA 3DHPA 3BMWA 3DHUA 4X9YA 3WUGA 1UYQA 1V0LA 4DWSD 5HNNA 1EQCA 2CEQA 2DSUA 5A6BA 2DSWA 1KWGA 1RP8A 3WNKA 5I78A 4NRRA 4JFWA 3PTMA 2GDVA 4WF7A 1J9YA 1EHNA 3NSNA 3WNPA 2ZUMA 1FH7A 1YHTA 2D0FA 3ARQA 2EPOA 4ACYA 2WMFA 3AFBA 2VR5A 2BY3A 1VEMA 2J8FA 4A4AA 3GM8A 2VZTA 2VOTA 2WLYA 1NWRA 1JDCA 4MB5A 2VX7A 1GUVA 3E1F1 4IPNB 5DT5A 1HJVA 4U5KA 1CGWA 4UQAA 3T0AA 4K68A 1M04A 5HDRA 3EDFA 3UG3A 4M80A 1UD5A 2J7HA 2XIBA 4UCFA 1N82A 1J0IA 2VQTA 1HJQA 2VRKA 1OGSA 1UD6A 3PZOA 1L8NA 4AY1A 2WKLA 1KXTA 2TAAA 1LQ0A 3FAWA 1E6RA 1JDDA 3VIFA 1QHPA 2WMIA 1US3A 2VMFA 4P8WA 3K4DA 4P7QA 1Y7VA 4UQCA 2BY0A 3ARRA 1MXDA 4UFHA 1F4HA 1K6AA 4F79A 2J78A 1R86A 3ZR6A 4BQ4A 3NUKA 1KXHA 5FIPA 1B3WA 3LPFA 1JXJA 4AD2A 3AHXA 5C71A 1S46A 2ZUTA 1QHOA 4H8HA 5IFTA 2CKRA 1H2JA 1HP4A 3B9DA 4ZXLA 4J3SA 5CSYA 1BYBA 4X0VA 3PZGA 1B31A 2YDQA 1H0GA 1B0IA 3WQVA 1PIGA 2GK1B 4B3KA 2IUZA 5JH8A 1CXHA 1Q6EA 1LL4A 3WH9A 3K8KA 1CZ1A 1C7SA 3OB8A 1XCWA 3CPUA 1EDQA 1W1TA 1ISYA 2J77A 3L2LA 3VDBA 4MAZA 4CCCA 1VF8A 1CYGA 4AEFA 4TVCA 1HJXA 4GO8A 5JBFA 4D6EA 2G3IA 4W5ZA 1E9LA 2VO5A 2JIEA 2V5DA 1RD6A 1C91A 1EDTA 2OYLA 3OZOA 3ZM8A 4L4PA 1OSEA 3S6TA 2YJQA 1K9TA 1BGGA 4NZCA 1B3ZA 3DYPA 4IM4A 1M01A 4WK9A 3MU7A 2J7FA 2BY1A 2VCBA 1E1FA 1E4NA 1O6IA 3N15A 1MW3A 1PX4A 3IK2A 4UFLA 1W9XA 2J7GA 1CGVA 4GZJA 1C3FA 3GTNA 3MUY1 1ESWA 1E6PA 3AHZA 1BHGA 5E70A 4P7RA 1CGXA 4HTYA 1ZB5A 2FH8A 3WNMA 1NOWA 2ZICA 2WZEA 4QLKA 1EOMA 1UWUA 3SCRA 2J62A 1E4LA 3UESA 4BS0A 2XIIA 1DTUA 2GSJA 1KB3A 3OLDA 5A6AA 1UD3A 1R8LA 3CO4A 4PMDA 1PX8A 2GJPA 4UQ9A 2BHUA 1ZL1A 3W6LA 5BXTA 3WF2A 2WNWA 4WJXA 3FNDA 2VRQA 3PN8A 2E4TA 3TOPA 3WMBA 3AXXA 3CIVA 2W63A 2A3BA 3WD4A 1DHKA 3IANA 2YDSA 3BLKA 3W4RA 3UR7A 2EPMX 3GYCA 4DWSC 1PX3A 1E0WA 2V3DA 4GQRA 1C90A 3O2LA 3WMSA 4AIUA 1ZJBA 1QNQA 1U33A 1AQ0A 1UKPA 1PZ3A 4J3UA 1OT2A 4UQEA 2OWXA 4D6IA 5ABHA 2W5FA 4EAMA 1Q6CA 1US2A 2E9MA 4D72A 3LPPA 2J75A 2ZOXA 3OG2A 2QLYA 3VGBA 1E43A 2BNJA 5GNYA 1CXLA 3A4AA 3ZT7A 3EBVA 1IT0A 1ODZA 3F5KA 5I24A 1OT1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4IMD A;  1EX5 A;  4O1C A;  2LPV A;  1TJ1 A;  5HR7 A;  1FWI C;  4BFA A;  5BCA A;  1NWS A;  3AML A;  4JY8 A;  4Z0S A;  5CEW A;  4JFS A;  3QQ1 A;  2WJD A;  3GXP A;  2B4G A;  5BXJ A;  1DXF A;  3RRX A;  1NOF A;  1BQG A;  1GOO A;  2RUS A;  5EMK A;  3NQV A;  3JZE A;  2ZWY A;  3VIH A;  3P74 A;  1XYF A;  5HAT A;  2NV1 A;  5HWN A;  5K4Z A;  2PZN A;  3L4W A;  4HBK A;  3LUT A;  3AWN A;  1YTK A;  1A5N C;  2O55 A;  1FCB A;  2DPE A;  4OV9 A;  4A8L A;  2QQ6 A;  3HV8 A;  3MI2 A;  4ODN A;  4GUJ A;  1JFH A;  1M1B A;  4H7V A;  1E9Y B;  1E0U A;  3MV1 1;  4J3T A;  5F2M A;  2P53 A;  4G5D A;  1K8Z A;  4XZW A;  1Y5W A;  2INZ A;  2DT3 A;  3ITX A;  2RSE A;  1WB0 A;  1JDA A;  4HA4 A;  1CXF A;  4QAW A;  3O07 A;  3WCZ A;  2VGB A;  4LPC A;  1WBH A;  2GGG A;  2YOC A;  3RGC A;  4JGD A;  1RLD A;  4B91 A;  1G4T A;  4GX9 A;  3GHT A;  3LCW A;  1EA9 C;  1XRS A;  3O0K A;  4IQC A;  3AUO A;  3M0Y A;  1PZ2 A;  1OG6 A;  4CNO A;  4KH2 A;  4DZ3 A;  2W67 A;  3PAO A;  4XAY A;  3VAB A;  5C2C A;  5LNU A;  1K3U A;  4ITZ A;  3TIM A;  2JF6 A; 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 5HAO A;  1JR1 A;  3TQ0 A;  5KIN A;  1V6Y A;  1CXK A;  4F0L A;  4Q7B A;  1YDN A;  5AY7 A;  4I3G A;  4DI8 A;  2R1L A;  3SCP A;  1F2J A;  3L12 A;  1FWC C;  4GVI A;  2ZZ2 A;  2X0Y A;  3GRI A;  3M0H A;  1VPY A;  1LT8 A;  2PZ0 A;  4YCP A;  2WAN A;  4ZSU A;  2W79 A;  2XP9 A;  3WD2 A;  3ECQ A;  1GOM A;  3G6M A;  1VKF A;  3FYP A;  2VT0 A;  4EF8 A;  2QJI A;  4RNI A;  2BVT A;  4ICC X;  4B2D D;  1JND A;  2XIM A;  4TVU A;  1A7X A;  3CHC A;  3VA8 A;  1GVO A;  2GJL A;  2XFR A;  4JTU A;  3UG4 A;  4GKT A;  1DYS A;  1CIU A;  1EC9 A;  3NTY A;  1AW1 A;  1E40 A;  2HEJ A;  1EWE A;  3M16 A;  3WK3 A;  1IXN A;  2C15 A;  3PJX A;  2I5Q A;  5FA5 A;  4DWS B;  3QFE A;  1UD4 A;  3FV9 A;  1GOX A;  1OFE A;  2RDT A;  2XYL A;  4MJ2 A;  2CER A;  3VZY A;  4E4U A;  2PLC A;  2CHO A;  1TVP A;  4IGH A;  2Z28 A;  1S2W A;  1UB3 A;  1UJP A;  5HPO A;  4EPK A;  1OD8 A;  1I75 A;  3IUI A;  4A3R A;  4BI7 A;  3QPY A;  4DBE A;  4JII X;  1VIW A;  3S5Z A;  2YDR A;  3D3A A;  3UND A;  3VD5 A;  3WBA A;  4UBP C;  1KTC A;  1W1P A;  3S2C A;  3CXO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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