1JNDA

Crystal structure of imaginal disc growth factor-2
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
419
structure length
400
Chain Sequence
SNLVCYYDSSSYTREGLGKLLNPDLEIALQFCSHLVYGYAGLRGENLQAYSMNENLDIYKHQFSEVTSLKRKYPHLKVLLSVGGDHDIDPDHPNKYIDLLEGEKVRQIGFIRSAYELVKTYGFDGLDLAYQFPKNKPRKVIVDPHAALHKEQFTALVRDVKDSLRADGFLLSLTVLPNVNSTWYFDIPALNGLVDFVNLATFDFLTPARNPEEADYSAPIYHPDGSKDRLAHLNADFQVEYWLSQGFPSNKINLGVATYGNAWKLTKDSGLEGVPVVPETSGPAPEGFQSQKPGLLSYAEICGKLSNPQNQFLKGNESPLRRVSDPTKRFGGIAYRPVDGQITEGIWVSYDDPDSASNKAAYARVKNLGGVALFDLSYDDFRGQCSGDKYPILRAIKYRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of imaginal disc growth factor-2. A member of a new family of growth-promoting glycoproteins from Drosophila melanogaster.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Imaginal disc growth factor-2
molecule tags Hormone/growth factor
total genus 143
structure length 400
sequence length 419
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1jndA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1jndA01
4MJ4A 4LQ1A 1GOOA 4CKQA 3PBGA 1UKQA 1PJ9A 1WPCA 1K9EA 1JF6A 3MS8A 3U7BA 1UD3A 2JFEX 2ZUTA 3BAXA 4AZGA 1WZAA 2VX5A 5ECUA 4W84A 3M46A 1CXKA 1UWTA 1FA2A 2XSBA 4CN1A 3TTYA 2BS9A 1LWJA 2Y8KA 4M80A 3QHNA 5HXMA 4W89A 3L4ZA 1BYAA 3WUGA 4CCDA 2BVDA 2C0HA 2WCGA 3N13A 4GQRA 2WANA 1DWAM 4UZSA 4NF7A 4TTUA 5IFPA 1TCMA 3PZNA 1RP8A 3WQ8A 4PTMA 4BQ5A 4LXFA 2XSAA 1KGXA 3VIKA 3CMGA 4HU0A 1WZKA 2JE8A 4OJYA 1JZ8A 2OYMA 2VMFA 4AD0A 2DH2A 2CBUA 1Q6CA 2XTKA 2Y2WA 3AS0A 1JXJA 2CHOA 3WD1A 4JL2A 2WKGA 2NT0A 1UWSA 5LA2A 2WLZA 2ZUVA 1BF2A 2E9MA 3BAWA 3RPMA 4U5IA 4P7OA 4OBSA 1OIFA 3T2OA 3ZT5A 2BXZA 5DT7A 2GUYA 2CYGA 1E1FA 3FAXA 1QHPA 5FCZA 3VU2A 4XZWA 5HNNA 5AY7A 1KXVA 1KXHA 5AYBA 1UD4A 3D3AA 1FOBA 4AC1X 3VM5A 5GPRA 1CLVA 3MANA 1XCXA 3AXXA 3TOPA 4PEEA 3NSXA 2WC3A 2VZSA 4PSRA 5I77A 4J3UA 4NSBA 2XVLA 1FFRA 1XHGA 2DH3A 3IK2A 3WMCA 1QW9A 2DPEA 3WDQA 1ISYA 2CBJA 1MW3A 3TP4A 2WMGA 4PMYA 3RO8A 4PBGA 4MPKA 5DF0A 3OLGA 4ATLA 5BROA 3OGRA 2BY1A 3G6MA 1WDRA 4S3JA 1HL8A 1QNQA 4Q22A 4AZIA 2HISA 1W91A 3HJEA 4WSKA 1V0MA 2FHBA 5GNZA 3ARWA 1HNYA 4WKHA 4J7RA 4QLLA 3W81A 3THDA 4HMDA 1V3KA 4H8HA 3VTRA 4DUVA 3ARZA 3T09A 4D6JA 1KB3A 1E73M 1JIBA 4PMRA 4DWSA 2YLLA 4B9ZA 1TFVA 1GOIA 2VTFA 4F8XA 5A2CA 2G3IA 4L4PA 3AHZA 3DHUA 2FDMA 5A94A 1J01A 1IV8A 3W38A 1HVXA 1HF6A 2W62A 1E6SM 3WDHA 4AIUA 3WH9A 4PMDA 1F4AA 5HDRA 2XGIA 4EANA 4TVUA 1US2A 2DT2A 4URIA 1W9XA 1XSKA 2YL5A 3F5KA 5EMYA 1QOXA 5I23A 3K8MA 3WH8A 1KXQA 4AWEA 1W9DM 1Z32X 4PMOA 1HL9A 2WMHA 3UEQA 2YA2A 1PX8A 1QNRA 1B3YA 1LJYA 4GO9A 1PEZA 1ZJAA 1BGAA 2WB5A 3CUFA 1JL8A 1GOWA 1J0JA 5EBAA 5ABFA 1E4IA 2PWHA 6TAAA 3AOFA 1JI2A 2DT0A 5CG0A 2Y4SA 1CTNA 4W86A 1GJUA 2DDXA 5E0FA 3G6LA 3WNKA 5CPQA 1C92A 1E0VA 1BQCA 2FGZA 1HJXA 2XVPA 4KMQA 1CXFA 2CBVA 1VEOA 1XGZA 1NP0A 4UQBA 2V3GA 2PWDA 4OIFA 4HU8A 1E0XA 2YDRA 5JBEA 1KBBA 5A2AA 4M81A 3T0BA 4NZCA 4AZ6A 5A6SA 1I1XA 2VX6A 1XC6A 1EA9C 3AMDA 3CTTA 3FXYA 3W26A 3NYDA 4PN2A 1O6IA 2VZOA 1E6RA 1DWHM 5I24A 1EXPA 1HT6A 4UOJA 4HMCA 2W91A 1W3LA 4JHOA 4GIAA 3NJ3A 5DMYA 1OT1A 1C93A 2X1IA 4V27A 4W7VA 4FLOA 4JL1A 4RE3A 2CITA 2EXOA 1M53A 2Y24A 5D8ZA 4UFKA 3KEHA 1FH8A 1BGGA 3CHDA 3LPOA 4QDMA 4UOQA 1E55A 2PBOA 4AZCA 4KGLA 3THCA 1C7TA 3BMWA 1CZ1A 4W8AA 2BHUA 4TVCA 3AMLA 1OGBA 4Z2GA 1UR9A 3B9DA 3WBEA 2WZHA 2XHYA 1KCLA 1CXLA 1NARA 3WEZA 2GK1A 2WXDM 3I3EA 2EPMX 3UESA 2WNWA 1V6XA 4HZ8A 1NP2A 5CGTA 4AZBA 4QCFA 1GVIA 1LG1A 4HZ7A 1W3KA 5ABEA 3WL0A 4GKLA 4YPJA 5GQBA 3EDKA 1Q6GA 1R86A 1GQKA 3BLPX 3AZSA 4PTWA 4AZ7A 2J75A 4AZHA 3ZT7A 3WNOA 1E4MM 1UA7A 3GH7A 4TXEA 3VX0A 5HPOA 2W92A 1E43A 3CHCA 3SURA 4HPHA 3ARVA 3PTKA 2V5DA 4WLCA 1H5VA 1CGWA 3A3HA 3RIKA 2G3MA 3WF0A 1EHAA 2CHNA 4KGJA 2VRQA 1J0HA 3UR8A 2VZUA 2NW0A 2G4FA 3W82A 5A69A 3WBAA 2CIPA 3VDAA 1NOFA 5I6SA 3CHFA 3AICA 5GNXA 2BHYA 1QHZA 4D6FA 3T0AA 1JYNA 5IHRA 1V0LA 1KR1A 3DYPA 2V5CA 1TG7A 5BXSA 1JGIA 5D9OA 2WYSA 1HJVA 1NWTA 3FHAA 3WIJA 2GDVA 4B16A 2J74A 1XYFA 4IPNB 2WAGA 2X2YA 5E09A 2IUZA 2OSWA 1YHTA 5FL1A 4UNIA 3WDPP 3BGAA 3VD3A 3UG4A 2CERA 1GW1A 2VO5A 1ZBWA 1K9DA 2YKKA 2V3EA 5BRPA 4ACZB 2NT1A 2J7HA 3BLKA 1DWIM 1G94A 4U2ZA 1LL7A 4MB3A 3PZ9A 1W1VA 4GI6A 5D9MA 1WDSA 5IHSA 1E6XM 4CD4A 3CBWA 1GQJA 3M07A 2CCRA 2EBNA 1UUQA 1J12A 1GONA 3W29A 1R85A 4GZEA 3ALFA 3MUIA 4H8VA 3VGEA 4AYSA 3AHYA 3WFLA 1V02E 2PI6A 1DEDA 3K1DA 3PZGA 4D6HA 1W2VA 1WNOA 1US3A 4DM2A 3L4XA 1X1NA 3AS3A 4D71A 2VVNA 3AZRA 4Z2LA 1QBAA 1V3LA 2XIIA 3CMJA 1B3VA 1GNXA 5E6YA 3SUSA 2VL4A 1H0GA 4RL3A 4C7GA 4HPGA 4CUCA 3MO4A 4U31A 2DQXA 3WUFA 1UHVA 3RILA 3KL3A 5AYIA 1O7AA 1B3WA 3SCUA 2GJXA 2J47A 1E0WA 5JH8A 1E40A 2DSUA 2WZIA 3AJ7A 2W63A 4ATWA 4MJ2A 2J8GA 3W28A 4GQQA 4FMVA 1OSEA 3VX1A 3OLEA 2EQDA 3VNYA 3W24A 3FNDA 2F61A 3AISA 1MW2A 3KZSA 5E0CA 4NRSA 2RGLA 3F4VA 1W9UA 5BCAA 4UZUA 1V02A 2C8NA 1EIBA 3KL5A 1E56A 3AMCA 1H11A 4W7WA 4LYRA 4W8BA 2XG9A 3O2LA 1FFQA 3VIHA 1UD6A 3RM9A 3AI0A 3T0DA 4D1JA 5CLTA 3KL0A 4CU7A 2AOSA 1SMAA 4CGTA 3BSHA 2YDSA 2VCCA 1GQLA 1Q6FA 3VILA 3HN3A 4OOUA 2O9TA 5IDIA 4MB1A 5I78A 3S6TA 3TA9A 3VMNA 4JZ5A 3FHQA 1B3XA 2WVTA 4W93A 3U5YA 1ITCA 2DSZA 2WMIA 1OB0A 4UFHA 4BZYA 4JKKA 2VR4A 2BY2A 3VKKA 4UQEA 2J7BA 1VRXA 5BWFA 4UCFA 3WF2A 5EFDA 4PMVA 2J62A 1BVNP 2MANA 3N1AA 3WFZA 3SCTA 1JZ4A 5AC4A 3EDFA 2D20A 1JFHA 2VCBA 4LYPA 5CLWA 4E4PA 3ALGA 1BTCA 2VT0A 3BMVA 4CVWA 2E8YA 2OWXA 5EB8A 5DT5A 4AEEA 1C91A 1NOWA 1WAWA 4HOWA 1E3ZA 3VIMA 4XV0A 3VDHA 3NCOA 3WQ5A 3EMQA 4AZ5A 3L4WA 2ZXQA 4BF7A 1XSJA 1DWFM 1H49A 3EBVA 2VZVA 2X05A 3ZQ9A 2QMJA 4JFVA 3AMKA 3M7SA 3QOMA 4AIOA 3WD4A 2A3BA 1ECEA 4QP0A 5HOSA 3T2PA 4JCLA 4NRRA 1TMQA 2EJ1A 1C8YA 1J0YA 1JZ5A 2D1ZA 2BFGA 3IJ8A 2VUYA 1OD0A 2XFYA 5A6LA 1AVAA 4LPCA 2PBGA 4RE4A 3APGA 4OUEA 1UKTA 2Y5EA 2Y8VA 4QCEA 2V3FA 1H2JA 1HKMA 4OZOA 2E9LA 1ITXA 2BVTA 1C90A 2WHKA 3L4YA 4U3AA 2J78A 2J7CA 5JUVA 3CGTA 2VQTA 1JZ2A 1SYTA 5TD4A 2WVVA 3CUIA 2D3LA 2VRKA 4C7DA 4J3XA 1JD9A 2ZIDA 4C7FA 4XB3A 3WQ4A 1EH9A 2YOCA 4TX6A 1RP9A 3AROA 2JEQA 1SR0A 4WJXA 5IXEA 1TZ7A 3MSDA 4AIEA 2OSXA 4TVDA 4U2YA 3TONA 3WF3A 4ZEPA 4M8UA 2VCAA 1JYVA 3ZR5A 1EO7A 3DC0A 2YL9A 1LQ0A 3POCA 1MWOA 2ZXBA 3NUKA 2F2HA 2XM1A 4PUEA 5F7UA 2EEXA 2CEQA 1CGVA 5A6JA 3AHXA 2W66A 4HA3A 1XRVA 5BXRA 4D6EA 2A3HA 4UOZA 2D3NA 4BQ2A 1D3CA 5A6MA 3GNOA 3ZOAA 1CXHA 2D22A 3UR7A 3SCRA 3QHMA 1DTUA 2E0PA 2FH8A 2J7DA 4QLKA 3WF4A 2VNCA 3SCVA 4CN4A 2XVNA 1XD1A 5BYWA 4GXPA 1DP0A 4B15A 2YA0A 1MXDA 4JKMA 4OBRA 2QPUA 1E4NA 1PIFA 4QAWA 3VIPA 1PIGA 2QLYA 3VD7A 2FHCA 3OGVA 3AIVA 2WHJA 3ARPA 1H1NA 4N0RA 2ZX7A 2XGBA 1I1WA 3CUGA 5C70A 1FHDA 2UY5A 4AISA 1J10A 3A4WA 3MV11 1LL4A 3VIFA 3PZOA 4Z2KA 2WZEA 1B31A 2DSKA 4AXNA 1MQQA 4OKDA 4W7UA 2PWGA 4KRTA 2XIBA 1TUXA 2UY4A 5FD0A 1G5AA 2AMGA 4UFMA 3AHTA 5I2UA 1W3HA 3PHAA 1E6NA 3B9EA 2ZE0A 2EO7A 1PZ2A 1UWQA 3WNPA 1F4HA 3AYRA 3N12A 2BNJA 4WK9A 2OLHA 3TTQA 2ZX6A 1ZBCA 4W87A 5LA1A 3IJ9A 4DWSB 2Z1KA 2JALA 4E8CA 1JG9A 1QNSA 2TAAA 2X8RA 2J77A 4JKLA 1EO5A 4MB4A 3UG3A 3WNMA 2J7FA 3DYMA 3VIGA 1ZBVA 3RMEA 1OM0A 1JNEA 4P8VA 3WDIA 1OINA 4H41A 4F9JA 3ARXA 4CD8A 3K46A 4GI9A 1JI1A 1JDCA 4GINA 1N82A 2ZICA 2JIWA 4MNJA 5CXPA 2YIHA 1W9VA 1Q4NX 4CD5A 4HA4A 1D7FA 2X0YA 1XV8A 5I0DA 5A8NA 4GI8A 2PC8A 2OYKA 3ZJ7A 2DIEA 1J0KA 4UFIA 1H4PA 2XFRA 1B2YA 2O9PA 5HPCA 3GM8A 3SCSA 1KWKA 4XUYA 3T2QA 5IFTA 1UR0A 1JF5A 1WB0A 2XM2A 4WIWA 1UKPA 5D4YA 2CNCA 1QBBA 4TUFA 1E5JA 3T08A 1M01A 1E5NA 4A3HA 3N18A 4WF7A 1Y7VA 3LMYA 1BHGA 3L2LA 1PZ3A 2WMFA 4PMNA 4KWUA 3ZSTA 4W5ZA 3W53A 3W27A 2WHLA 3GBEA 2E3ZA 4EK7A 1X6NA 1ZB5A 3SIMA 3PZVA 1CDGA 3MKKA 1D2KA 2D0GA 3CHEA 4L4OA 4UR9A 1W3JA 3BCDA 1QI2A 2YBTA 3SUUA 1QPKA 3WQVA 1KQZA 2YA1A 3HU7A 3WQWA 3WDJA 1HJQA 1EDGA 4WKAA 1EQCA 4HA1A 2WMKA 1Q6DA 1L0PA 2PF0A 2EPOA 2GJPA 5E9AA 1BPLB 3NDYA 3GXDA 3L4VA 1UH2A 1GOMA 4TTGA 3UERA 4BQ3A 1GZJA 3ZJ6A 4F9DA 4DUWA 1B30A 1UQZA 1B9ZA 1VFOA 1VF8A 1G0CA 3VGDA 1EGZA 4AZCB 5C71A 1QNPA 3ZMRA 1NOUA 5A8MA 1TA3A 5I79A 3AIBA 2J8FA 2ZX9A 5CSUA 1YQ2A 2JEPA 5CJ5A 1DWJM 4CD7A 2GK1B 1GJWA 1H0IA 1VBUA 3WNNA 1PAMA 4DWSC 9CGTA 4D6IA 2W61A 4IISA 4PMQA 3J7HA 4PTXA 3KE0A 4ACYA 2WPGA 1WKYA 2PWEA 2E9BA 3UG5A 5A95A 1VB9A 1EOMA 3ZSSA 2BHZA 4WSJA 3AIRA 2XUCA 1NWSA 1UZ4A 1QVBA 4W88A 5E70A 1V3HA 3O6AA 4J27A 1TR1A 1VFMA 1M7XA 2UY3A 1JYWA 2ZUSA 5LYRA 1KR0A 3N04A 2ESCA 1EQPA 1K9FA 5D9NA 3A4AA 2VURA 1JZ3A 4UQCA 1DWGM 2XWDA 3FN9A 3EMZA 4M1RA 1E1EA 1MQPA 2VZTA 3IJ7A 1BLIA 1S46A 1PX3A 3N15A 4M82A 3VD5A 5KEZA 3KWXA 3VGHA 2YBUA 3QR3A 1ISZA 3AIUA 1CNVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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