1LG1A

Crystal structure of human chitotriosidase in complex with chitobiose
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of Human Chitotriosidase. Implications for Specific Inhibitor Design and Function of Mammalian Chitinase-Like Lectins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords chitotriosidase
total genus 114
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1lg1A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1lg1A01
1QNSA 2DSKA 1V3JA 1V0KA 1MFVA 1U2YA 5A8PA 1KGWA 1MW1A 4ATWA 1MQPA 4JKMA 4EANA 4HTYA 1E4NA 4CVWA 5D9OA 1JZ7A 2YA1A 3CO4A 3QR3A 3WMCA 1HT6A 2VRKA 1KR1A 4B3LA 4QDMA 5A6KA 2WLYA 2BHYA 2J79A 1NOUA 1A47A 1C90A 2JFEX 4MB4A 4CD8A 2BHZA 1LF1A 2WVSA 4PMUA 3ARUA 2VJXA 1R87A 2XG9A 3OLDA 3RPMA 3BAIA 1GVYA 3CZ8A 3GTNA 1BTCA 3AIQA 2VVNA 1W91A 1JNDA 2VX6A 1W1YA 1XYFA 3ZSSA 1GHSA 2J8FA 1J0IA 3EDJA 4AD0A 2XFYA 3N17A 1GOQA 3WH5A 1E6NA 5BCAA 2XVGA 4EKJA 1EDTA 4IISA 3WNNA 4AIOA 3MSGA 2ZXQA 4UQ9A 3VGHA 3W26A 3SUSA 3FHQA 4AD2A 2E9MA 1CGTA 3CH9A 4URIA 1UWIA 2VI0A 2ZX6A 5DT5A 5ABEA 1BFNA 1ITXA 4UFIA 2EPLX 5IXEA 8A3HA 3VO0A 4H8HA 1QW8A 3VIPA 2J7CA 3ZT6A 1J01A 3LPGA 2A3EA 2WYSA 4HZ6A 3TP4A 1LJYA 1Q6DA 3OGRA 4D6GA 2CHNA 3K4DA 2Y2WA 1J11A 3IJ8A 3OLGA 1ISYA 4WSJA 1I75A 1C7SA 1GNXA 4S3KA 3RILA 1VJZA 4MB3A 5C70A 2J7HA 4U3AA 4AD3A 1NOFA 1MW0A 1J9YA 3U7VA 5JUVA 3VUPA 4ATLA 1KBKA 4TVUA 3VOCA 1C93A 2ESCA 1CGYA 1UR0A 4HOXA 4HA3A 5A8NA 3FAXA 2CERA 4BQ2A 1N82A 4PTXA 4IPLA 1PBGA 1GOIA 2YKKA 3EDDA 2WCGA 2ZX9A 1V08A 4QLLA 1KFWA 4X9YA 1XD0A 1UR2A 2ZOXA 3THDA 1BG9A 2BY0A 1G1YA 3VD3A 3K1DA 5AYBA 2VQTA 4PMYA 1KR0A 3BLPX 4PMVA 4JHZA 2EJ1A 2YDQA 3WSUA 1JFHA 3BSGA 2ZXAA 4FLRA 5M17A 1AMYA 1JD7A 4MNKA 5M5DA 1LL6A 2AAAA 3WQ8A 3W29A 3BAKA 2X8RA 3WF3A 2QPUA 3WD2A 1M03A 1MQRA 2X0YA 2G41A 2WVUA 2QPSA 1LQ0A 5CQ1A 1E0WA 3MU7A 4P8VA 2WVVA 2JIEA 1VBRA 1W2VA 2DT3A 3MMDA 2V38A 4PUEA 4DUVA 2EEXA 3MV01 3IANA 5A94A 2VURA 4QP0A 3CPUA 3SCWA 5AY7A 3VD4A 1ZB5A 2DH2A 4N0RA 4J3TA 1LWHA 3ARQA 3HU7A 4MNLA 1E15A 4NF7A 1VFOA 3VMOA 3HMCA 3WDQA 3B8SA 1JF6A 1V3IA 1SYTA 4TVCA 4CD4A 2B31A 5BWFA 1IZJA 2WC3A 3QHOA 1W3KA 2VTFA 1BYBA 1EQCA 4W7UA 7CGTA 1WZLA 3CZLA 3AMLA 1JZ3A 3CZJA 1M53A 3CZEA 4AZCA 4AC1X 3BGAA 2EBNA 3W0KA 4DWSC 5BXPA 1NWSA 2VZSA 1RD6A 4YN5A 3ZJ6A 3O2LA 1QHOA 2CHOA 4JFVA 2W63A 3WF0A 5A2AA 3KZSA 5JIWA 1CLVA 4E8CA 1UD3A 1TG7A 3WD3A 1JDAA 3VMNA 1TE1A 1D7FA 4OOUA 3W53A 2QHAA 2YOCA 2XPKA 1G9HA 4LYPA 3ARVA 2D3LA 1EOKA 4UQBA 2ZX7A 4UCFA 1JF5A 4CGTA 1E6RA 4BS0A 4B9ZA 3SIMA 3FY1A 1NOWA 4GO9A 4CU7A 4J27A 4W86A 3ZOAA 4LGXA 3PZNA 2YL6A 3AZSA 3SCQA 4AIEA 2ZXDA 1XD1A 4UTFA 4JL2A 3SURA 5EFDA 2WANA 2J7BA 4GXPA 3L4YA 1EO5A 2XHYA 5M03A 2PB1A 1BYDA 3IJ9A 3MKKA 2ZWZA 1H3GA 1G94A 1K9TA 3NDYA 2XVKA 3AIEA 3AMKA 1DEDA 5HDRA 3PZVA 2WMFA 3WH8A 2J77A 2WAGA 1K6AA 7TAAA 1O6IA 5CGMA 4BA0A 2VZUA 1PZ2A 2VX7A 2OSXA 3AXIA 4QCFA 4FK9A 1EGZA 2XVLA 2WK2A 2FH6A 4D6IA 4P8UA 3THCA 4PTVA 4BQ4A 1JGIA 4D1JA 4D72A 2EPOA 1GHRA 3SCUA 5FOOA 4AZIA 4OBRA 2EO7A 4AY1A 1CXEA 1OSEA 4W8LA 4JL1A 3GXMA 1UH3A 2C0HA 3T0DA 4MAVA 3T08A 5E70A 1WO2A 2OWXA 1V6UA 2CESA 4V27A 3TA9A 3BCDA 4MTVA 3M07A 3VIHA 4GZIA 1G01A 3WNMA 4W8AA 3BCFA 4PYSA 2VCCA 1H1NA 5E6YA 2WC7A 2VZVA 4KWUA 1Q4NX 4JIEA 1WDRA 5IHSA 2E40A 3UR8A 1C91A 2DDXA 4J3VA 3DC0A 3QOMA 1US3A 5I5RA 2X2YA 2UY5A 3GM8A 3ZQ9A 4C7FA 5I6SA 1ZJAA 1BHGA 3TTYA 4EAMA 1K9FA 4TX6A 2ZUNA 1CBGA 1W9PA 1J12A 4CUCA 3ZR5A 3K46A 1BG4A 1QNOA 4UZSA 1Y7VA 4CCEA 3MV11 4JFTA 3DYMA 3FW6A 4OUEA 1DWIM 3N9KA 3VDCA 3WEOA 2VL4A 4Z2GA 3ZT5A 3DYPA 2YL9A 3VTRA 4D6EA 1H11A 3VDBA 3K8MA 3NSXA 1J0HA 3K4AA 1I1XA 3WBEA 1CENA 4LXFA 4R27A 4DWSA 2F2HA 2GSJA 1NH6A 5ABFA 1KCKA 5FL0A 1VEOA 3LMYA 5DF0A 2WHMA 3QOKA 1PJ9A 2WSPA 2BFGA 1VF8A 3W82A 1TCMA 2BXZA 4PMXA 1OD8A 2W61A 1GORA 2D0HA 4AZCB 1TMQA 2VVSA 5IDIA 1V6XA 5A2BA 4MB1A 2J4GA 2NT0A 2DT2A 4E8DA 3GDBA 3NYDA 3VIKA 3N04A 4PMNA 1GVIA 1B3XA 2WHKA 3AMGA 3KWXA 4CKQA 4D6FA 3AXXA 3WMSA 1XHGA 1WKYA 5FL1A 1BGGA 3OZPA 4M24A 3VDHA 2J7FA 1FOBA 2CYGA 5I77A 1HIZA 1JZ5A 4CVUA 3BC9A 3MANA 2W5FA 1SMDA 2WPGA 1PIFA 1D2KA 3VINA 2G3IA 1VAHA 3DHUA 3NSMA 3VX0A 4NSBA 4JFSA 2G4FA 2VMFA 3B9DA 2WZIA 4Y7EA 3OIHA 1HNYA 2A3AA 4F66A 1S46A 5E6ZA 2JF7A 2XSBA 3ZJKA 3VIGA 2AOSA 1KQZA 3PZOA 4Z2HA 2WBGA 2J78A 4GINA 3T2QA 1M04A 1C3FA 1JYWA 1H41A 4MAZA 2EPNA 3VVGA 1GQLA 3VM7A 4DUXA 2NW0A 1HL8A 1FA2A 4EE9A 4HMEA 5BXTA 2VC9A 3SUWA 5GNXA 4AYSA 3RM9A 2GJPA 3AFBA 2DSVA 5A8MA 4JHOA 1JNEA 1JZ6A 2VZOA 1JG9A 2GFTA 4HA4A 3VIFA 4B16A 2PWFA 3UG3A 2YBUA 1UKOA 5JBFA 1CECA 1W1TA 5DT7A 2EQDA 1R8LA 2CBUA 3VIOA 1UR8A 1V02A 4WF7A 1FHLA 1LG1A 1KXTA 4QLKA 4PN2A 4H8VA 3MUY1 1E1EA 1E70M 1UWSA 4NRSA 4HMCA 3AS3A 1UG6A 1OBAA 2WCAA 3K8KA 5CPSA 3ZJ7A 4ACYA 2BXYA 1HVXA 1BPLB 1R85A 2E4TA 1PAMA 4J7RA 4UOQA 2DGAA 2Z1KA 2O9RA 2D0GA 2EXOA 3RDKA 2A3BA 1CXKA 2WCSA 2WMKA 1IT0A 3MUZ1 1TZ7A 1R7AA 4LYQA 1ZU8A 1MYRA 4ACZA 1GJWA 3PN8A 1OB0A 5BXRA 4P8WA 1PZ3A 1WDPA 2ZX5A 3UG5A 4UFMA 4HOWA 2DSZA 1LL4A 2XGIA 3EDKA 1VFFA 1V3LA 1WB0A 1FP9A 2DEPA 4H2CA 3BH4A 3IK2A 3VGGA 2V5DA 3GBEA 2OWWA 3T09A 3A4AA 4C7DA 4DWSB 1GQKA 5ABFB 3ARWA 3RM8A 1MXGA 3APGA 1UOKA 1UD5A 3PZGA 3WENA 5A3HA 3VU2A 1P6WA 1V0NA 1FP8A 3OB8A 5CGTA 3UCQA 1PX8A 3AIRA 3VIJA 5CPTA 3VGFA 1GZJA 3SCPA 3GXFA 3GNPA 2BS9A 3WD4A 2WHJA 1KWKA 3WQVA 3AS1A 1KXHA 2WZHA 1AVAA 2CCRA 5A1AA 4HPHA 2BHUA 2GK1A 4JCLA 2YJQA 4AXNA 4A3YA 4AWEA 1XSJA 3EBVA 5AC5A 4D1IA 3ZM8A 4DM1A 3FXYA 1SMAA 4IPNB 1CIUA 2YL8A 1XRVA 1BSIA 4E2OA 2QV4A 1JDDA 5EFFA 1E40A 1NQ6A 1E0XA 2O9PA 2XVPA 1WNOA 4AZ6A 1EDGA 2E8YA 2WMJA 4P7QA 4PBGA 1BVNP 1B3VA 1EIBA 3M7SA 5CG0A 2V5CA 4EK7A 1R7OA 1C8YA 2E0PA 1XYZA 5I0DA 3WDRA 1JI1A 8CGTA 2YLLA 3CUHA 2F61A 2JALA 3WUGA 1VRXA 4AZ7A 3CMGA 4QCEA 1MW2A 3KE0A 1GOKA 1EH9A 1FH8A 2GJXB 5FCZA 2ZUVA 4HZ7A 4U31A 3VD9A 4P7LA 2ZE0A 4AZ5A 1LLOA 4FLQA 5JBDA 6CGTA 4S3JA 5HPCA 2J8GA 2FHCA 1BQCA 1OGBA 4J3UA 3GH7A 3HJEA 1M7XA 2BY2A 3A4XA 4K68A 4M8UA 1E6PA 5BRPA 4CN6A 1CTNA 4UFHA 1E43A 5E09A 1B3YA 4F8XA 3AJ7A 3MUAA 1W3LA 3WL0A 1XV8A 4LQ1A 1DHKA 1ISVA 2BY1A 1X6LA 2JEPA 1A3HA 3OGVA 4M81A 3K8LA 2Y8VA 4PTMA 3TTQA 4W89A 1CEOA 4ZENA 5BXSA 2G8ZA 4WJXA 1IV8A 3AOFA 3EYPA 1V0LA 1EXPA 4A3HA 1H2JA 2X05A 2YLAA 2CBIA 2PWHA 4PSPA 2YDSA 2BVYA 1UQYA 5A8QA 1U33A 4U33A 4NI3A 2JE8A 1MXDA 2YIHA 1WPCA 3KL3A 1J18A 2OYKA 1E6ZA 3UR7A 4J3WA 1FH9A 4JCMA 1JZ8A 2WVTA 1UWTA 3AYSA 1FH7A 1NARA 1GJUA 2DH3A 1B0IA 1C8XA 2X1IA 2E9BA 3VKKA 1E5NA 1QHPA 1QBBA 5I78A 1DWJM 3VNZA 4TOQA 1CGWA 2FGZA 4B9YA 2BV9A 1FFRA 1OD0A 3F5JA 1JI2A 4ZXOA 3BXWA 4M82A 3PZQA 4J3XA 1H49A 4MB5A 3ZSTA 3WUFA 4AD1A 1QI5A 5HNNA 2Y8KA 1CXHA 4UFJA 5ABGA 1KGXA 4ZE5A 3WNPA 3UG4A 3PZMA 1GOOA 2YDRA 1ITCA 1CGXA 3O9NA 1RP9A 2VUYA 1ODZA 1CGVA 4WLCA 2Z1SA 1AQMA 1V0MA 2PBOA 4GPNA 1HJVA 3W81A 4RE4A 3WH9A 5HOSA 1ZL1A 2A3CA 2FH8A 4IUGA 3IJ7A 1J0YA 3WL1A 2VRJA 3UETA 3ARXA 3SUUA 5IFTA 5E0CA 1PEZA 1GONA 3WQWA 2D3NA 2E8ZA 2IUZA 4FF5A 3BAXA 4PSRA 5A69A 3CHCA 4W93A 3ZJ8A 1UZ1A 4WIWA 1GOMA 1H09A 4KGJA 4UNIA 1L8NA 3E1F1 1BYAA 1OGSA 5A6LA 4TVDA 1HP5A 4BQ5A 1DWAM 5D9MA 1CXIA 3VD7A 1H4PA 3L2MA 2JEQA 4Z2LA 3CMJA 3W6MA 5ABHA 4BCEA 5A6MA 1AQHA 5D8ZA 4ZE4A 2WB5A 2V3FA 1L0PA 1W9XA 1QVBA 4CD6A 3PTQA 4H8UA 3IAPA 2XTKA 4CU8A 2PBGA 3NUKA 1WDSA 1E55A 1XH2A 4W88A 1E9LA 5DEZA 1QOXA 3NJ3A 3BSHA 4MPKA 1VJSA 2O9TA 3TONA 1OCQA 2FHFA 3VILA 2VR5A 1XGZA 1CPUA 3L4ZA 4ZEPA 1GW1A 2WM0A 3GXDA 3IAQA 3D3AA 1JAEA 1HVQA 4W85A 5CZKA 1LWJA 5CSUA 3WDIA 1BF2A 1JXJA 6TAAA 2WVVB 2XFFA 5I79A 4KRUA 1V02E 4PMRA 1H5VA 1OINA 3SUTA 1E4IA 2D1ZA 4KGLA 3AIWA 4HP5A 2BVDA 4ATDA 3QHNA 1EA9C 1DTUA 2ZUMA 3VNYA 3F5LA 4MNMA 4HMDA 1E5JA 5CSYA 1HX0A 4U2ZA 3WFZA 2WKGA 4XB3A 4AEEA 4B3KA 2NT1A 2IXUA 2FDMA 2WBKA 3A4WA 3G6LA 3AIBA 4TX8A 1GUVA 3PZUA 2YA0A 2OSWA 3WF1A 3SUVA 4F9JA 3AMDA 9CGTA 1VENA 4GI6A 4GKLA 4NRRA 1DWFM 3VIIA 2DIEA 3AICA 3T2PA 4AZGA 4AIUA 1Q6CA 4XX6A 4P7RA 4D6CA 3U7BA 3PTKA 2VOTA 3PBGA 2FHBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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