1LJYA

Crystal structure of a novel regulatory 40 kda mammary gland protein (mgp-40) secreted during involution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTALVKEMKAEFAREAQAGTERLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFRGNSDGSSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDGGAPISGPGIPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Novel Regulatory 40 kDa Mammary Gland Protein (MGP-40) secreted during Involution
pubmed doi rcsb
molecule keywords MGP-40
molecule tags Signaling protein
total genus 111
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ljyA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ljyA01
1RP9A 4B16A 4UFHA 1UZ4A 1WZKA 4H41A 1Q6GA 4GQRA 3QR3A 4J3XA 1UD6A 1J12A 3WF0A 1LL6A 5E6ZA 5DT7A 1CTNA 2XWDA 4L4PA 1HJWA 4JFTA 2PWEA 4KGJA 2XM1A 2ZX8A 4CU7A 4P7LA 3WBEA 3VDHA 3VD5A 3ARYA 2WKGA 3AQUA 3CZ8A 2V5DA 2VQTA 4RE4A 3AIQA 1E4MM 4AIUA 2JIWA 2ZWZA 2GUYA 4OBRA 3DECA 3ARZA 5HNNA 1OM0A 1MXDA 5DMYA 3KL5A 2VJXA 5IFTA 4S3JA 3AIBA 3WFLA 1CBGA 1HJVA 3FHQA 4AZBA 4PTMA 1J10A 3AICA 3BSGA 4AEFA 2QMKA 1W3LA 2PC8A 3II1A 3SCTA 3T09A 3W26A 3PBGA 4TVCA 3L4YA 3EMQA 2GJRA 4XZWA 3SCUA 1LWJA 2ZX5A 2D22A 2UY4A 4LXFA 5JH8A 4ATDA 2CESA 1NWSA 1ZBWA 1UA7A 3RIKA 6TAAA 5A6AA 3WSUA 3FY1A 1C92A 2YLAA 3LPFA 1TFVA 4PN2A 1CXFA 2YA0A 4N42A 2XPKA 4IM4A 4GZJA 4D71A 3OLGA 1HP4A 1TR1A 3FNDA 3ARTA 3N18A 4UFJA 3WNLA 5BXSA 4CN4A 1V3HA 1H3GA 2YBTA 4IISA 4JL1A 3W37A 3TP4A 1P6WA 2YDRA 4DM2A 4H2CA 4BA0A 4GO9A 5IFPA 2JALA 3CUGA 7A3HA 2XJ7A 5CXPA 5CGTA 1C7SA 1PX8A 2GDUA 3T2PA 2J7CA 4JCMA 1EIBA 3WUGA 4EE9A 1E6PA 3EDKA 4TTUA 1ISXA 1TG7A 1HIZA 2WHJA 5ABGA 3EDDA 4DWSD 5BCAA 4JL2A 1UKQA 1WDSA 3BCFA 1UWIA 2IXVA 2OWWA 4AIOA 2YL9A 2CKSA 2UY5A 4WLCA 5EMYA 3VIGA 2E3ZA 2BXYA 1J0JA 1R87A 5E09A 3TA9A 3WDRA 1EDTA 1QVBA 1MVYA 1TA3B 4F79A 2QPUA 5D8WA 4AZCB 2WPGA 1G9HA 1W3HA 1GVIA 5I78A 1ZS2A 1J0KA 2PWDA 3G6MA 3U57A 1UH4A 2D23A 1VEMA 5EFFA 2VL4A 2YL6A 5AC5A 4J28A 1ZU8A 5GNXA 4QCEA 1W9VA 2WM0A 2WVSA 4GXPA 3TTYA 4D6HA 2ZIDA 5A8OA 3AZRA 1H2JA 4N0RA 2OYMA 4DUXA 3SUTA 1UR2A 1E3ZA 1E0VA 4XUYA 3POCA 3IJ8A 2F2HA 4HA3A 4F66A 4EANA 5I23A 5LA2A 1UD8A 3ALFA 4HZ7A 1XC6A 4HA4A 2GDVA 4JCLA 4PUEA 1G5AA 2XSBA 3GYCA 2JF6A 3BLPX 3FHAA 2CKRA 2E40A 2WMIB 3APGA 3SCQA 3W53A 1UR8A 2O92A 4AIEA 1VIWA 3WIJA 4C7FA 1CPUA 1W1YA 2JE8A 4KWUA 1HNYA 5CSYA 3NDZA 5A95A 1GNXA 4IUGA 4TX6A 4RL3A 2BS9A 1E6RA 1MYRA 3W27A 2WNWA 1DWHM 3VM5A 4F8XA 1E72M 5EFDA 2YBUA 4OKDA 1SMAA 4YN5A 2VO5A 1FH7A 1EGZA 4NZCA 1EO7A 2G8ZA 4UFIA 1V3JA 1I1WA 3L4VA 1W91A 3I3EA 2C7FA 4PSPA 1EQPA 3WNMA 1EHNA 1VBRA 2BY3A 3D5HA 3HMCA 4NI3A 4HOZA 4D6JA 3N9KA 3DYOA 4CVWA 3GZAA 2NSXA 2G3MA 2J8FA 3VILA 1VENA 1WP6A 3N11A 3B9EA 4MAVA 1RH9A 1QW8A 2D3NA 4CCCA 1E15A 1UOKA 3T2OA 4GQQA 3UR8A 2PBOA 2OWCA 3CMJA 1NWTA 2WBGA 4TXEA 3VMPA 1E55A 3ZJ8A 1A47A 2VX4A 1VAHA 3OIHA 2YJQA 4WKHA 1GHSA 3WL1A 1TA3A 4UCFA 1E1FA 1V02A 2X8RA 4AZCA 4D6DA 3DYMA 4PMZA 4U2YA 2RGMA 1KGWA 5HXMA 2VZOA 1K9EA 2DQXA 4UQDA 2MANA 1XCXA 4PBGA 3BSHA 3ZT7A 3VX1A 1C90A 3EBVA 1F4HA 3PZ9A 1NM9A 1UG6A 3KWXA 3LMYA 2DT0A 3AZTA 3AZSA 2VRQA 3PZNA 3NDYA 1C8QA 2WCGA 1UR4A 3WH8A 4ZEPA 2ZXQA 2BHZA 1G94A 4E4PA 1CGWA 1MW3A 2TAAA 1CLVA 2J7DA 3WDQA 4KGLA 5FKYA 2BY2A 1JFXA 1E6ZA 1CECA 4U3CA 3N17A 3VVGA 2A3CA 4TOQA 3WQ8A 5M3WA 3WEZA 1EOMA 3QHOA 1UUQA 4V27A 2XVGA 2WMIA 5BXTA 4D6IA 1VFOA 3BAJA 3SUVA 2ZXAA 1W9PA 2X0HA 1H09A 3WEOA 4U2ZA 5DO8A 1FFQA 1K9FA 1XGZA 3MMWA 2Y24A 5ABHA 1CDGA 1HVXA 1V3IA 2VQUA 4EK7A 3F4VA 3VIPA 2G3JA 2VC9A 3W25A 4RE2A 4B9YA 3WNOA 2WWCA 2ZICA 2QLYA 2ZXBA 3RILA 3ZOAA 3PZQA 4HMCA 5LA1A 1JXJA 2Y4SA 4UQBA 1QNPA 1MW2A 1DTUA 3QOMA 3ARPA 4PMNA 1GOOA 4DM1A 3GH7A 2DSVA 5AC4A 3B9AA 5CPQA 5C70A 2DPEA 1WE5A 3VGEA 1ECEA 4URIA 4PMYA 3ZJ6A 1UWUA 1N82A 3ZSTA 1OT2A 1GW1A 1NOFA 4AWEA 5I24A 2VCAA 4FLRA 4P7QA 5JIWA 3UG4A 1WB0A 2WVTA 3NCOA 1BVZA 3T2QA 1FFRA 1QBBA 4AISA 4ATLA 1BFNA 2IXUA 3K1DA 1C91A 2VCBA 4U5IA 1KXHA 4U31A 1Q6EA 3N13A 3ZT6A 2DT2A 7CGTA 1PJ9A 2FHFA 1HJQA 3ZT5A 2CBJA 3PZMA 4JKLA 3WH6A 4PMRA 3WN6A 3RJXA 3AHYA 1TZ7A 1JZ4A 5CQ1A 3WF4A 1UWRA 3VIJA 2D24A 1KB3A 1TVPA 3CZJA 4MB5A 4MNMA 5FL1A 3WNPA 2VVNA 3WEMA 2E9LA 1SMDA 2O9PA 4UR9A 1LJYA 1QI0A 2E9BA 3EDFA 2FDMA 3WNKA 4PCTA 4A3YA 4PMUA 5CG0A 1YHTA 3VU2A 1QBAA 4QCFA 1E71M 1KWKA 1PBGA 2YA1A 3NSNA 2JIEA 2DH3A 2OYKA 5JBFA 3CZKA 1C7TA 3PHAA 2W91A 3W38A 1QI4A 1LLOA 3KE0A 1ZL1A 1UKTA 1JAKA 2XFFA 2PBGA 3SUWA 3WD4A 1OGGA 4MJ2A 3SCOA 1BAGA 2OWXA 3L4TA 1GOMA 4JKMA 5A2BA 3O9NA 3F5LA 1BYAA 4FMVA 1LL4A 5M5DA 1E43A 2C8NA 2A3AA 1W1PA 4JFUA 2EPLX 4AZ6A 2WZHA 2ZUMA 4W86A 1M01A 3GBEA 4J3WA 3W24A 1OSEA 4AMCA 3AI0A 4M24A 4PUDA 4A3HA 1VFMA 4BF7A 3WMCA 4J27A 5LYRA 4UFLA 3AXHA 1PX4A 3DHPA 3VTRA 2YKKA 3VINA 4PSRA 4LYRA 1IV8A 1MFUA 4AZ5A 1B3VA 1C93A 2FHBA 4J3TA 1QPKA 3VGBA 3SCRA 1HL8A 4JHOA 1ZBVA 1QHPA 4WJXA 4OIFA 5ABEA 5FOOA 3G6LA 1H4PA 4MPKA 3MMDA 3VNYA 3BH4A 5BXPA 3AMDA 1ODUA 3AXIA 3OG2A 2V38A 2IUZA 3QOKA 1VEPA 4AD3A 2GJPA 2VZUA 1VEOA 5JUVA 1O7AA 2F61A 3BGAA 4GKLA 3PZOA 1CEOA 8A3HA 3MO4A 4AZ7A 2CHNA 3I3DA 2EPOA 1JYXA 1JGIA 3A4AA 2VT0A 5DT5A 3DC0A 1UYQA 1HF6A 1W32A 2VI0A 3AHXA 3VD9A 1R8LA 4ZFMA 2FGLA 1KBBA 4WSJA 5A6LA 5C8BB 3WD3A 1KWGA 3CHFA 3SCSA 3VIMA 5CSUA 1E6QM 1PZ2A 1GVYA 4H8UA 3CUJA 1XSIA 3FW6A 5GPRA 4H04A 1QHZA 3N1AA 1J18A 3VD7A 2UY3A 2RGLA 1SYTA 1ISWA 4V28A 2OYLA 3SEPA 3CZLA 2A3EA 1EHAA 4CD4A 1G1YA 2Q8XA 3ALGA 3VMNA 1WZAA 1EOKA 2J4GA 4GIAA 5I3DA 4BQ2A 3RO8A 1LQ0A 4D6FA 1JZ2A 2PF0A 3AIWA 3L4ZA 2WMJA 1TUXA 2CHOA 4OZOA 1NWUA 4D1IA 4W87A 1TE1A 2CBUA 1OGBA 7TAAA 2A3BA 3FN9A 2PWGA 4E8DA 1JF6A 1PX3A 4CD5A 2VX6A 4F9DA 1G0CA 1MWOA 1JYNA 3KZSA 4QLLA 1AQMA 3PZTA 3AJ7A 3AHVA 3BCDA 2WW5A 2GJXB 2WSPA 3GNOA 4CU6A 5BRQA 3BAKA 3MMUA 2XVKA 1UQZA 1F4AA 5IXEA 3EMZA 4HP5A 1ZJBA 4PMXA 1AMYA 3VGGA 4BZYA 2WZIA 3MS8A 1UD5A 2BVTA 4GI6A 1UKPA 4ACZB 1JNEA 4WK9A 4HZ6A 1GJWA 4NRRA 4ZE4A 1QI3A 1XD1A 1V3LA 1R7AA 4YHEA 4UZSA 4V2XA 2Y2WA 5E0CA 3T0DA 4CN6A 2DH2A 3CUFA 5IHSA 2CXGA 1B1YA 4M29A 1JYWA 4EAMA 2CERA 3AFBA 4F9JA 5BRPA 1UD3A 1AQHA 1WZMA 1BGGA 3ZJKA 1VRXA 2WBKA 3AMCA 3CGTA 2W4XA 3ECQA 1YQ2A 1GQLA 3J7HA 3CO4A 4NF7A 1HL9A 2ZUTA 5A6JA 4UOZA 4P7RA 1MW0A 1WKYA 1LG1A 1CGTA 3HN3A 4J3VA 5CPSA 3W0KA 2DSZA 4XB3A 2WC3A 3VDCA 3GNPA 4CCDA 5BXRA 5CLWA 1W9DM 1US3A 5BROA 1XCWA 2WYSA 3PZIA 1HKIA 2VR5A 4D6EA 4BS0A 4OJYA 3AS2A 1DHKA 1GOKA 4ZENA 1WAWA 1B2YA 5A6KA 1XH0A 3FXYA 1FH9A 1HKKA 3B8SA 1JI2A 1RP8A 1PIFA 4PRWA 5HPOA 2WK2A 3WDPP 3OLDA 1BF2A 2EO7A 4M82A 1E70M 1VB9A 3IANA 2J7BA 4TX8A 1ZBCA 3WNNA 1XHGA 4WIWA 1CGUA 4JHZA 2V5CA 5E9AA 3WF2A 1QI5A 1NH6A 1CGXA 4GZIA 3WQ4A 3AHTA 1BQCA 2WZEA 2XFRA 1DEDA 4PMDA 1HKMA 4UZUA 3WDHA 2VMFA 3N12A 2YLLA 3W29A 2QV4A 3UERA 5KZ6A 3CHDA 3O2LA 3UESA 3MUAA 2E0PA 1CIUA 2E9MA 5CJ5A 4JIEA 3WBAA 3ZO9A 1V6UA 3WD0A 4CGTA 1XYFA 4GZEA 1QHOA 3WENA 4UQAA 2G41A 1DWGM 1HVQA 1WZLA 3ZSSA 5F7UA 3EMCA 2GJXA 1JNDA 3RM4A 1KBKA 1R85A 4OBSA 1E73M 2NT1A 1IZJA 1H5VA 4P8UA 2V3GA 4MB3A 1CGYA 3WD1A 1H49A 4L4OA 1JIBA 5A69A 4ACZA 2J7FA 1H41A 1B3WA 3WKZA 1HXJA 3CHEA 3VIHA 1J0HA 3WY1A 4H8HA 2Y5EA 1M7XA 1I1XA 4X0NA 2VVSA 1J11A 1EQCA 2FH8A 4PYSA 3SCVA 3AS0A 2BV9A 1KQZA 3HJEA 5E6YA 2UY2A 3EYPA 1K6AA 1IZKA 4TTGA 3THCA 4TVUA 1GOQA 1ISZA 4R27A 2G3IA 2ZUNA 1EH9A 1H11A 2DDXA 1US2A 2XSAA 3BAIA 3ARQA 1VJSA 1NWRA 1J0ZA 1BYCA 2ESCA 2ZUWA 2BHYA 2X09A 3KEHA 5E0FA 1JDAA 1OIFA 4JAWA 1G01A 9CGTA 2QMJA 3CZGA 1VJZA 1XSJA 4WF7A 4QDMA 3VPLA 3AOFA 2XYLA 4LX4A 1B9ZA 2CPUA 4OOUA 2WLYA 2W92A 3QHNA 1V03A 1CWYA 3OBAA 1JZ7A 3OGRA 4HOWA 2WVVA 4BQ5A 4YHGA 4AZHA 1WDRA 3UG3A 1CNVA 5E70A 1WDPA 1A3HA 1HP5A 2EEXA 2CNCA 3VOCA 2WHLA 3WUEA 1CXKA 5A2CA 3BC9A 3W81A 1VF8A 4HPHA 1ITCA 1JD7A 4GPNA 4A4AA 1LG2A 1UR0A 3CLWA 1TVNA 1C8XA 1C8YA 5A8NA 3MANA 5A6SA 1V3KA 2QF8A 3GTNA 3ARSA 1SR0A 3RPMA 1FOBA 1H1NA 3W6LA 3W6MA 4Z2JA 4KH2A 1W3JA 5D9PA 2PWHA 5LA0A 1E4IA 2CCRA 1UWTA 1HT6A 1BLIA 3AIUA 1JYVA 2D1ZA 2CBIA 5C71A 4UFKA 1GZJA 4MB4A 5AYBA 2WAGA 4Z2KA 1EDQA 3D3AA 1Z32X 4HTYA 2EQDA 1EA9C 4WSKA 3W82A 1AVAA 1JFHA 4J7RA 1E5NA 3I3BA 3AMLA 4DUVA 1JI1A 4XV0A 3TTQA 2OSWA 1E0XA 5A3HA 1X1NA 2D2OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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