1LJYA

Crystal structure of a novel regulatory 40 kda mammary gland protein (mgp-40) secreted during involution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTALVKEMKAEFAREAQAGTERLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFRGNSDGSSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDGGAPISGPGIPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Novel Regulatory 40 kDa Mammary Gland Protein (MGP-40) secreted during Involution
pubmed doi rcsb
molecule keywords MGP-40
molecule tags Signaling protein
total genus 111
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ljyA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ljyA01
3ZQ9A 1OT2A 2XUCA 3MKKA 1GNXA 2VMFA 1TR1A 4JFVA 1ZBWA 4CD4A 1R86A 2XVPA 3WDRA 4PCTA 2WZEA 7A3HA 2J7BA 1CLVA 4AEEA 1QI4A 1C92A 3ZJ8A 1JYXA 3OLEA 1XD1A 2WB5A 1W2VA 1GQJA 5JUVA 1JXJA 3OGRA 3NDZA 4W86A 2NT0A 3WQ5A 1PX4A 2BHUA 1H2JA 1GHSA 3WQWA 1JI1A 3VIKA 3GH4A 4IM4A 3DHUA 5FD0A 2IXUA 4TX8A 4HZ8A 5A6KA 3K4AA 2ZX5A 5CPTA 2XGBA 3VGFA 1E5NA 5C71A 3THCA 4TX6A 3THDA 2XIIA 2X0YA 3VD3A 3CIVA 3WNOA 1QNRA 2QLYA 4XZBA 2QMKA 1V0MA 2IXVA 3UEQA 1QI0A 2W5FA 3WD0A 4UFKA 1CGUA 2WMHA 4BS0A 3IJ9A 1EQCA 3WDQA 1HJSA 1JYNA 3ALFA 2BXYA 2PWGA 1C8QA 1DWGM 3GH7A 2A3EA 3AIEA 3T08A 4J7RA 3M07A 3VOCA 4ZFMA 1JAEA 2ZUSA 4CGTA 2WBKA 5BXSA 2FH6A 1KGUA 1LL4A 3SCPA 3ZJ6A 4AD3A 1UH4A 3M46A 2DH2A 1FFRA 1HKMA 1NOUA 1XSKA 2GJXB 1VEMA 3DHPA 4AMCA 5DMYA 4D6HA 1JFXA 2DDXA 4DUWA 2VZSA 5HDRA 5LA1A 4W88A 3GTNA 4JCMA 4ZE4A 4MNJA 3NIYA 1BPLB 2V5CA 2NT1A 1DWAM 4EKJA 4A3HA 3CHEA 4AWEA 2VQTA 1E6RA 3L4YA 1BHGA 1HX0A 1CGVA 3W37A 2WVUA 2E8YA 1GOIA 1MW2A 4W84A 1E0VA 2YJQA 5I0DA 1FH9A 2J7FA 1DHKA 2MANA 4P7OA 4J3UA 1HKKA 1GZJA 4D1JA 1WZAA 2DH3A 4BQ2A 4GI9A 3GBEA 2J4GA 1XGZA 4V2XA 3A4XA 2ZX9A 2WANA 4OJYA 2VVNA 1EQPA 4B16A 4MPKA 1E72M 1UR9A 3ARSA 3SUUA 4DWSB 3APGA 1B1YA 4PCSA 3MUZ1 4FLSA 4U5IA 4GQRA 4EAMA 3AIQA 3QGVA 1VEPA 3ZJKA 1R8LA 4JFUA 1GVYA 4JHZA 1H41A 2ZUWA 4HTYA 2O9OA 4H8VA 1JYWA 1UKTA 1BLIA 4LYQA 1WKYA 4WK9A 2VL4A 4CCDA 3T0DA 1CGWA 1E3ZA 3G6LA 3VIPA 3DC0A 1V02A 3TOPA 1C8XA 4HOWA 1BGAA 2ZUTA 3N1AA 4PMYA 4PMDA 1J12A 1ITCA 3GDBA 2DGAA 4JKKA 2WVVA 1HJXA 1V3MA 3BMVA 1WDPA 1W1YA 1XD0A 2YDRA 1EA9C 5EBAA 4IUGA 2VZUA 3II1A 2YBUA 5M17A 4J27A 3NCOA 1BG4A 3OZOA 1E3XA 3TP4A 4R5EA 1G94A 4CD5A 4B3LA 2PB1A 3B9EA 2CBVA 4MTVA 5HPOA 5I3DA 1MFUA 3VD4A 2WAGA 3SUTA 1QBBA 1MQRA 5D9NA 4OBSA 1GOOA 5A6MA 3WY1A 1PX3A 4TUFA 3W26A 4MNKA 1GQIA 3FNDA 1WPCA 4JKLA 4PRWA 3PTKA 3VGHA 1V0KA 1D3CA 2CEQA 1XH0A 1V6YA 3CHDA 2Z1SA 3L4VA 1MQQA 2PWFA 1UD6A 2BY1A 1L8NA 3KL5A 2YL8A 3RM4A 3CTTA 1XYZA 3W81A 1M01A 1UWRA 1TVNA 1PIFA 2EQDA 2OSYA 3GXMA 5EB8A 3I3DA 3L4ZA 3AIRA 1DP0A 4UCFA 1KB3A 1A47A 2ZX7A 5IHSA 2V3GA 3ZOAA 1OSEA 3GBDA 1RH9A 1V6UA 3AS3A 2YL5A 4PSRA 5BXTA 1JDAA 3MANA 2BY2A 3EYPA 1KWGA 4WJXA 2XGIA 1N82A 1KCLA 2G8ZA 3L4XA 3WKZA 2BS9A 2OWXA 1XYFA 5I2UA 3A4WA 2CKRA 2YOCA 4FMVA 4AISA 4XX6A 1K9DA 3D5HA 1K9FA 1EH9A 3QOKA 1V08A 3T0BA 1R7AA 4ZXLA 1WE5A 2DIJA 1EIBA 4HZ7A 3S6TA 2GDUA 2J47A 1DWHM 1UR0A 4J3TA 1C93A 1ZB5A 1GQLA 2EPKX 2FHCA 2Y4SA 3OZPA 5AYBA 1C7TA 3GNRA 1BFNA 3WSUA 5I79A 4LX4A 2GUYA 1JAKA 3HMCA 3MUAA 1B0IA 2ZX6A 3AIUA 4TTGA 1GPFA 3WF1A 1QNOA 3GNPA 2GK1B 1RD6A 1EHAA 1V03A 3N9KA 3NYDA 5FKYA 4AZ7A 3B9AA 1W9DM 3TTOA 4YHEA 1F4AA 5ABFB 3CLWA 1CTNA 3N11A 2D3NA 4HU8A 4UTFA 4Z2GA 4M1RA 8CGTA 4PEEA 2ZUUA 1SMDA 4MJ2A 5CXPA 3NSNA 2E3ZA 1EDGA 4HA4A 4D6GA 1W9BM 4D6CA 3LPOA 2XIBA 4UQBA 2Y5EA 4S3KA 3SCSA 2XM1A 3WQ4A 4AW7A 1WNOA 4WLCA 2WMKA 3WBAA 2WM0A 2VR4A 5M3WA 2CESA 1P6WA 1JZ8A 3LPGA 3VIFA 2JALA 3VD9A 2VI0A 1DWFM 1NWRA 1HN1A 1D7FA 4UZSA 2WMGA 2XFFA 1V3IA 2E9BA 1TVPA 1W1VA 1J0HA 1HVXA 3W24A 4Z2HA 1QI2A 2D2OA 3VX1A 4GO8A 4D1IA 5BXRA 2WMJA 3KE0A 1MXDA 4EANA 1WO2A 5CPQA 5I24A 5KEZA 1KR0A 3VM7A 1QI3A 1IV8A 1E6PA 2WCGA 4P8UA 1LWHA 2WVTA 2E0PA 4WF7A 3RM9A 4PTXA 4WKAA 1MFVA 2PC8A 3ARWA 3CZEA 2WKGA 1FFQA 4AY1A 2QPUA 3MO4A 4W8LA 1E0WA 2OSWA 2UY3A 3BAWA 1OWQA 5HOSA 3VX0A 2J25A 4DWSD 1TZ7A 4BA0A 4AZBA 1EXPA 1CENA 3QHOA 2TAAA 3G6MA 4W8BA 3AHTA 2J7EA 4DM1A 3SIMA 1ODZA 1JF5A 1NQ6A 3WEZA 1UZ4A 3PTMA 2WHKA 1JD9A 1HP4A 1JNDA 1UQZA 6A3HA 2Y24A 4LYPA 2C7FA 3RM8A 1XSIA 3POHA 4PMRA 4YN5A 4CD7A 2D20A 3AXHA 1E15A 1ISVA 1LL6A 1UHVA 1TG7A 3O2LA 4PTWA 3PZTA 4BCEA 3BAJA 1OIFA 1CNVA 2C0HA 3ZR6A 2XJ7A 4ZXOA 4AZ6A 4PBGA 2GSJA 3T09A 2CBIA 1D2KA 4P7QA 3FW6A 2XG9A 1CZ1A 4CCCA 4LPCA 1UD8A 3F5JA 1GW1A 4XUYA 4AIUA 5A8MA 3WH9A 4PUEA 7TAAA 4UFIA 4C7DA 1CXIA 1BYBA 1E1FA 3AIBA 1E70M 1YHTA 3A3HA 4TOQA 2VX5A 1UWTA 1H0GA 1UKSA 5A2CA 4NF7A 4RE3A 4AD5A 2EO7A 2BNJA 3WF0A 4P8VA 3VDBA 1SYTA 3IANA 4CD6A 3PZIA 2J7DA 1UOKA 4L4OA 3IAQA 4H2CA 1C3FA 1J0IA 2PBGA 2ZXBA 4HMDA 3I3BA 2X09A 4UNIA 4D6JA 3CZLA 3VMOA 3HJEA 2QV4A 4W7WA 2E9LA 1VBRA 2GJXA 1TE1A 3RPMA 1JFHA 2CERA 3GZAA 3WL0A 1VEOA 1VJSA 3BC9A 1GOQA 1B2YA 1OT1A 1C8YA 5AC4A 4JZ5A 3N18A 2GJRA 1GOWA 1FOBA 4KGJA 2YL6A 2CIPA 5D9OA 4UOQA 3TTQA 3L4WA 1J11A 4A3YA 1NM9A 1BQCA 3CHFA 2CETA 5A6AA 3QR3A 1HIZA 4FLQA 4WKFA 2W62A 1QVBA 5AC5A 4MNMA 2EBNA 4PTMA 1W3HA 2PI6A 1WCGA 2DT2A 1ECEA 1QNQA 2OLHA 1UR1A 1WDQA 4GI8A 1H09A 3BLPX 3VDAA 5CSUA 2XM2A 4UOZA 4HMCA 3WNKA 1BG9A 4DUXA 3B9DA 4DWSA 4D72A 1UA3A 2WHLA 3WF4A 4XB3A 5I6SA 4ACYA 5ECUA 3J7HA 3AYRA 4H8UA 3WQVA 2BXZA 4F8XA 4YHGA 3VMNA 5FL1A 1VFMA 1JZ5A 1HKJA 1W32A 2PBOA 1YQ2A 4TXEA 3RILA 2C8NA 1JNEA 3WF2A 5IDIA 2UWFA 1PEZA 5BROA 1BAGA 3A6OA 1BGGA 2GJPA 3VO0A 4MB4A 5I5RA 4GZEA 3W0KA 3OLGA 1GOKA 1JZ6A 1B3XA 1U2YA 3BAIA 2A3AA 4BQ4A 2J62A 1R7OA 4LGXA 1ZJAA 3AROA 4U3AA 3WDJA 1B9ZA 3NDYA 3I3EA 2ZWZA 3WEOA 1JZ7A 1SFSA 3ZJ7A 1JI2A 1QOXA 4PMXA 2J77A 2GVYA 5A8PA 4GQQA 1XCXA 5D9MA 1ZU8A 2BVTA 3MUY1 1WDRA 3PZNA 1H5VA 4MNLA 3A4AA 3MMUA 1TMQA 2WBGA 2RGMA 1V3LA 4TTUA 2NSXA 3EDKA 1CXLA 4W5UA 3F5KA 3S2CA 5A2AA 4OIFA 2GDVA 3D3AA 3M6DA 3AMKA 4D6EA 2PWDA 4UZUA 5A95A 4QLKA 1C7SA 3PZVA 4MB1A 5D8ZA 1UD2A 5FOOA 2XFRA 1UYQA 2JFEX 1G0CA 2ZWYA 3IAPA 4GO9A 2WMIB 2WHMA 3VIGA 3WUFA 5A6JA 1LLOA 3PZGA 1A3HA 3W6LA 4QP0A 4HP5A 3KL3A 1C91A 2Z1KA 1MW0A 3U5YA 2UY4A 4UQCA 4QCFA 3WDHA 1TCMA 1CLXA 3AIWA 3EMCA 4F9JA 1K9TA 1M04A 2CYGA 4DM2A 4ATLA 3CUHA 3K8MA 1NP0A 1VBUA 3AXIA 1LF1A 1JZ4A 2FHBA 3VIJA 3POCA 1JL8A 3BAXA 3ARQA 4P7NA 5JIWA 4MJ4A 1W1PA 2WLZA 1OGGA 3QHMA 2CCRA 2ZUMA 2YL9A 4PUDA 2VX4A 5LA0A 4PMOA 1EDQA 5LYRA 4FLRA 4D6IA 1UKOA 1XC6A 1QHZA 4M82A 3WNNA 1B3VA 3BAYA 3VM5A 1KBBA 1HJUA 2VX6A 2CNCA 2YA1A 1B3WA 1QNPA 2XTKA 2XVNA 3WENA 5JH8A 3T2OA 1IZKA 3AOFA 2GK1A 1GVIA 2VJXA 2D0FA 1E1EA 1UUQA 3VIIA 5EMYA 3WEMA 1B90A 4EK7A 2A3BA 1HJQA 1E6QM 5A3HA 5ABFA 4QCEA 4DWSC 1I75A 2EPOA 3AHZA 4Z2KA 1UD5A 1J9YA 4BF7A 2CPUA 3RO8A 4UQ9A 1M53A 1EHNA 2OYMA 3AMGA 4GI6A 4P7RA 2YBTA 1CXEA 3OGSA 2J78A 5A94A 3KZSA 3CZ8A 2XVKA 1OGSA 3E1F1 3VMPA 1AQHA 2DQXA 4AEFA 5A6BA 3ZO9A 4M29A 4WSJA 1R87A 3SEPA 1ZL1A 3ZMRA 2X2YA 2EXOA 1KQZA 2W66A 3BSGA 3WH5A 4OOUA 5D4YA 3ARYA 5FL0A 1V6WA 1KGWA 4OKDA 1AQ0A 4P7LA 2J75A 5JIPA 1XSJA 1QPKA 3BGAA 3VGBA 2JEPA 1OBAA 2AMGA 4JFTA 1E73M 5A6SA 2JIEA 4WIWA 1US2A 3AMCA 3HN3A 2QMJA 2EJ1A 2EPLX 2W91A 1FH8A 1BYDA 1DWIM 2CHNA 2VO5A 2V3FA 1JDCA 1OB0A 1OINA 5GPRA 2CXGA 5CPSA 2VCBA 2UY5A 4W5ZA 1EO5A 4M24A 3VGEA 1VIWA 5D8WA 1ISWA 2DSZA 3VD5A 4AZCB 1JD7A 3EDEA 5GNXA 2IUZA 3ARPA 1KFWA 3BH4A 4LXFA 1WAWA 1HT6A 3FHAA 1UR2A 1G5AA 2D0GA 1GOMA 2NW0A 4HOXA 1HP5A 4AC1X 5FIPA 1J01A 1CGYA 5CJ5A 3TTSA 2ZX8A 3SUWA 4NRSA 1Q6GA 2AAAA 4J3SA 1EO7A 4OUEA 2DIEA 3DYOA 1DTUA 1UKPA 4DUVA 2JEQA 4E4PA 3CGTA 3MU7A 4CKQA 1ZBVA 2WSPA 5DT7A 1JIBA 2V3DA 4PMNA 1SMAA 2PWEA 1CGXA 1FHDA 1VB9A 3U57A 2QF8A 4M8UA 1XCWA 3CMJA 4NSBA 2G3NA 4QDMA 5CSYA 1W91A 2XVLA 3CHCA 1E6SM 4UFJA 2X8RA 2AOSA 4M81A 1JXKA 2XWDA 4CU6A 4B15A 1OM0A 4HU0A 5KZ6A 3CO4A 2WWDA 4D6DA 3WIJA 1WB0A 3W38A 1J0ZA 1FP8A 2FGLA 3ARUA 3PTQA 2VRKA 3K4DA 1B31A 3WH6A 1H3GA 3CZKA 5FCZA 2O9RA 4N42A 3VNZA 3U7VA 1OD8A 1E5JA 1NP2A 2G3JA 1WDSA 2VT0A 4J3VA 3NUKA 3PZQA 1JYVA 1E0XA 1PBGA 1TA3B 2VCCA 3AFBA 2UY2A 1CWYA 1GJWA 3ZIZA 2W63A 4NI3A 6TAAA 5DT5A 1MW1A 3MV11 1E56A 4FK9A 1LL7A 1MQPA 4UFLA 8A3HA 4PMZA 1PAMA 3F5LA 5DO8A 3WMBA 5HPCA 1MYRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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