1LL4A

Structure of c. immitis chitinase 1 complexed with allosamidin
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
392
structure length
392
Chain Sequence
GGFRSVVYFVNWAIYGRGHNPQDLKADQFTHILYAFANIRPSGEVYLSDTWADTDKHYPGDKWDEPGNNVYGCIKQMYLLKKNNRNLKTLLSIGGWTYSPNFKTPASTEEGRKKFADTSLKLMKDLGFDGIDIDWEYPEDEKQANDFVLLLKACREALDAYSAKHPNGKKFLLTIASPAGPQNYNKLKLAEMDKYLDFWNLMAYDFSGSWDKVSGHMSNVFPSTTKPESTPFSSDKAVKDYIKAGVPANKIVLGMPLYGRAFASTDGIGTSFNGVGGGSWENGVWDYKDMPQQGAQVTELEDIAASYSYDKNKRYLISYDTVKIAGKKAEYITKNGMGGGMWWESSSDKTGNESLVGTVVNGLGGTGKLEQRENELSYPESVYDNLKNGMPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title THE STRUCTURE OF AN ALLOSAMIDIN COMPLEX WITH THE Coccidioides IMMITIS CHITINASE DEFINES A ROLE FOR A SECOND ACID RESIDUE IN SUBSTRATE-ASSISTED MECHANISM
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE 1
molecule tags Hydrolase
source organism Coccidioides immitis
total genus 152
structure length 392
sequence length 392
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ll4A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ll4A01
1V6UA 1VENA 1E4MM 1PX3A 2BVYA 3ZM8A 2A3AA 1R8LA 1FA2A 4DM1A 2EXOA 2EJ1A 4CD6A 4W89A 1RD6A 3WDJA 4AD0A 3SCSA 3EMQA 4LYRA 2VQUA 4HZ8A 3VD3A 5HNNA 5HDRA 1HVQA 3ARYA 2YJQA 3WQ8A 1JXKA 3T2OA 2O9TA 3GZAA 4H7VA 1JDDA 5E0CA 1VAHA 5I0DA 5A6BA 1GOMA 4IPNB 5C8BB 2ZXBA 1BG9A 2UY4A 1J11A 4CU7A 3VGEA 1UD4A 1V3KA 4UFKA 4UR9A 4MB3A 1J12A 4MNLA 2DQXA 5AC4A 5IFTA 1V6XA 2O92A 3CZJA 1UYQA 3OBAA 1H5VA 3BAJA 2XYLA 1NP0A 3VM7A 4HPGA 3K8LA 1JI2A 2G3MA 5DMYA 4AD4A 2J7DA 1UR4A 4TX8A 3VGFA 3I3BA 1CECA 1DWAM 1UH2A 4OBRA 2QMKA 3VPLA 2DT2A 1OT1A 2OSYA 5HPOA 3WEZA 4JFVA 3SCVA 4ZE4A 1W1YA 5FL1A 2AAAA 1OSEA 2G3JA 4A3HA 3CLWA 5GNYA 4CCCA 1MQPA 1OGSA 2XWDA 1ZJAA 2GJPA 1CGYA 1W3JA 2J8GA 2XVLA 4TOQA 5IXEA 1WCGA 3VGHA 4PMZA 1GONA 1DWJM 2EPMX 1GOWA 2VQTA 1UZ1A 1W9UA 2GFTA 3G6MA 4JL1A 1GCYA 1E1FA 3WN6A 5I78A 2VZUA 2JIWA 1NWRA 2AMGA 5F7UA 2A3EA 2JE8A 4BF7A 3WEMA 3KZSA 4DWSC 3WBAA 1BLIA 4GO9A 3T09A 1I75A 5BCAA 3GNRA 1A3HA 3VGBA 1EO7A 1E6XM 3HJEA 1R7OA 3DYOA 4Q22A 1QW8A 4PMQA 4S3JA 1G0CA 3ZO9A 4KRTA 3BAXA 3PZNA 2EPNA 4WKFA 3ARRA 3ZJ8A 2NT1A 5FKYA 4WJXA 5A6MA 4GI6A 4HA3A 1UOKA 2Z1SA 1BG4A 3F5KA 1EHNA 4OOUA 5E0FA 3W53A 3WH8A 2YBTA 4Z2GA 5CLWA 1M01A 1B3WA 1CENA 3O9NA 5E9AA 1TUXA 3GXIA 3WD2A 1JI1A 1GOQA 5BYWA 2CETA 3CIVA 3NJ3A 4D1IA 2JF6A 5JIWA 4LXFA 1O6IA 1JIBA 2BS9A 5CXPA 3AISA 1W3LA 2ZXQA 2X2YA 1JFHA 3GH5A 4FLSA 3WNPA 2WC4A 4QCFA 1GUVA 2ZUMA 5IFPA 4M24A 3W0KA 3K8KA 5A6AA 3W27A 3NCOA 1XD1A 1GQLA 4J7RA 4P7NA 4Z2LA 1U2YA 3I3EA 3VNYA 1L8NA 1B1YA 1GHRA 1H0GA 4NSBA 2GJXA 1UKPA 3MUIA 1JZ2A 2VR4A 5I24A 2WLZA 4UNIA 4PCTA 3ARVA 5I5RA 2ZICA 3SCOA 2ZUUA 4UTFA 4AIUA 1MFUA 1LQ0A 4PMUA 5DT7A 4V27A 5A2AA 1HKJA 1U30A 2W67A 2YBUA 2J8FA 2J7BA 3DYMA 3M07A 3PZGA 4E8CA 3IAQA 2DSVA 1YQ2A 5HBFA 2AOSA 1VJSA 2JEPA 1EDTA 1QHZA 5CPTA 4UFIA 5A6LA 1B3XA 3GH4A 3L4UA 3BSHA 3RJYA 4ATDA 1ZU8A 2QF8A 4M8UA 2YA0A 4C7DA 4AWEA 4MTVA 1WZLA 2EPKX 3WQVA 2HISA 2J7GA 2XVNA 3WSUA 1V0NA 5C71A 3VIHA 1OIMA 9CGTA 3WDPP 3T0AA 3PZQA 1CXIA 1WAWA 1GOKA 4TVDA 2E3ZA 3DHUA 3PZ9A 3ZR5A 4MNMA 3ARQA 1UH4A 5M5DA 3CBWA 4AD1A 1ZBWA 2XG9A 1SYTA 3BLPX 4OBSA 4J28A 4TTUA 1VIWA 1Q6CA 3WD3A 1QPKA 3EMCA 3AYSA 1A47A 3O6AA 1CPUA 2FHBA 4CCDA 4K68A 3U5YA 4AMCA 4D72A 3ZSTA 1CGTA 2IUZA 1PBGA 4CKQA 3CHCA 1TG7A 1XH0A 1C7TA 2WKLA 3GM8A 4HZ6A 1JG9A 3FAXA 4WSKA 3VU2A 2D20A 1UWRA 2ZXAA 4KWUA 4UFLA 1NWUA 1MXGA 5D9NA 1K6AA 2ZUNA 4DWSD 3SCPA 4QLKA 1QI5A 2FHCA 4JKMA 1MYRA 3GTNA 1HJWA 1EQCA 1ISYA 3VVGA 4QFUA 1B2YA 5AYBA 5JBEA 1DWFM 3EDEA 1NQ6A 3CUHA 1VFOA 4BCEA 3U57A 3EDKA 1EHAA 1DEDA 2WW5A 3OZPA 3AIEA 2QHAA 2FH6A 1UD3A 5LYRA 3IJ7A 2Y4SA 3UR7A 1TVNA 5ABFB 1G9HA 1XYZA 1TA3A 1V3HA 3TTQA 3VIJA 3MS8A 4F79A 1W91A 2X8RA 5I79A 1E55A 3CUJA 2D0GA 1E4LA 2PF0A 2BVDA 4E2OA 1C7SA 4UQDA 4XUYA 1V3IA 4TVUA 4ZEPA 1AQHA 1KWKA 3WY1A 3NIYA 1VBUA 4BQ3A 3IANA 2WZHA 2OSXA 2CBIA 1XC6A 1OD8A 4D6DA 4HA1A 1AQ0A 4P8VA 2ZE0A 1HP4A 5ABGA 1E70M 4PMRA 1EGZA 3BCDA 1KR0A 4ZENA 3AXIA 3ARWA 1PIGA 5CGMA 1XV8A 2WANA 4CU8A 3U7VA 3DHPA 1GHSA 2WMHA 4FF5A 1W3KA 4OOZA 1CGUA 1V0MA 4B3LA 2DT1A 1MQRA 4DUWA 4YHEA 4NZCA 2G3IA 3OB8A 4PEEA 1UWTA 4TX6A 4AZCA 1DWIM 3DC0A 1UWUA 2WHJA 2XM2A 3AXXA 5CPQA 2PBOA 1EO5A 3WD0A 1HKMA 1GVIA 1VFMA 5EFDA 1K9FA 3MKKA 3CZLA 3WL0A 2OYMA 1E40A 3W81A 2WMJA 3WDRA 4DUVA 1JYWA 1HXJA 2JF7A 1ITCA 2E9BA 1EOKA 1BFNA 3ZT7A 3AMLA 4H04A 1KWGA 4W7VA 1ZJBA 4HU8A 1CGXA 2FGZA 1HL9A 1NOUA 2D23A 1HF6A 3RPMA 1NM9A 2D22A 1TCMA 2WVTA 5D8WA 1SMDA 3RM9A 5A8PA 3WIJA 1LWHA 3RDKA 3VOCA 1E43A 3N04A 3WQ5A 5BXTA 1C3FA 4ZE5A 3W24A 3PHAA 2BFGA 2CHOA 3GXFA 3SCQA 3EYPA 4D6FA 2Q8XA 2XJ7A 2CKSA 1NWTA 1BYAA 4AISA 1JYVA 4KMQA 1MW1A 2A3BA 6CGTA 1BGGA 4A3YA 5ECUA 1J18A 2E8YA 3VILA 4MADA 3ARTA 4PMDA 3L2LA 1O7AA 1UD6A 2BY1A 2GJXB 1VFUA 3L2MA 1M04A 3T2QA 1QBBA 2FH8A 1ZL1A 1Q6DA 1DP0A 4U33A 2VX6A 4JKLA 4LYQA 2ZUTA 3NSNA 4CVWA 1BTCA 3OGSA 2WCAA 3ZIZA 4ACZB 2BXZA 1W9BM 3L4ZA 2WVVA 1JAEA 1W9VA 1E56A 5E09A 3VIFA 1Y7VA 4OZOA 1V6YA 5A6BD 4WK9A 3L4WA 4C7FA 3SCRA 2CHNA 3F4VA 4OJYA 5CQ1A 1MFVA 3WQ4A 4LGXA 2VURA 3GBDA 4F9JA 1KBKA 3SUWA 3PTMA 3FW6A 3VNZA 1US3A 4NI3A 3BC9A 1LLOA 5CJ5A 4B3KA 5DT5A 2PB1A 3CZEA 3CTTA 3WUEA 5D8ZA 2D2OA 2X1IA 3LPGA 4IUGA 1H41A 2UY2A 1VJZA 2DSKA 2VOTA 1DTUA 4P8UA 1OGGA 2YL8A 1ITXA 1UKSA 4D6GA 1DHKA 3ZR6A 3KWXA 1QHOA 3N12A 3VIMA 3A6OA 3CH9A 2IXUA 1IZJA 4JHOA 2O9PA 5I77A 1E4IA 4J3TA 4BS0A 1CXEA 2PWHA 3WH6A 1ODZA 1HT6A 2CERA 5AC5A 3CHDA 2J7FA 5A8MA 4F9DA 2QPSA 2WCSA 3VKKA 1LL6A 1V02A 3L4YA 5KEZA 1GQJA 2VT0A 1XH1A 3KL5A 3VIGA 4UQEA 3G6LA 3SIMA 1G1YA 1OT2A 4JZ5A 2VX4A 2WBGA 2Y8KA 1DWGM 2DIEA 3SUSA 3KL0A 3AIQA 4X0VA 4L4OA 1ZBKA 3IK2A 3ARXA 2JALA 2WB5A 3UG5A 3O2LA 3VINA 4AZHA 5D9OA 1W9PA 3VO0A 3GDBA 2ZX5A 1B3VA 4L4PA 4QLJA 1E73M 1XSJA 4HP5A 1S46A 2XIIA 4D6EA 3WELA 1E5JA 1B3ZA 3TP4A 4F66A 4GO8A 3IJ8A 3PZMA 3AQUA 1H49A 5M17A 1QNOA 1X1NA 4V2XA 4EKJA 5HXMA 4UFJA 1CXLA 2F8QA 4ATWA 4UFMA 1JZ4A 1UH3A 6TAAA 1GJUA 4AXNA 2VCBA 3WF2A 2XTKA 3SUVA 3ZMRA 5A8OA 5DEZA 1W1PA 3UERA 1TA3B 2WMIA 1V3JA 3VTRA 2BXYA 3W28A 1UR8A 1WB0A 2YL6A 3K46A 2WPGA 2UWFA 3WDHA 3A4AA 1LWJA 5AY7A 3U5UA 1E1EA 1JF5A 4PMNA 1WNOA 1JNDA 5TD4A 3WEOA 1CEOA 2PC8A 2WSPA 4MPKA 1E6QM 2WLYA 1NP2A 1UKOA 3AS1A 3K4DA 1J9YA 4DWSB 4PTWA 4W8AA 4CN4A 2E9MA 4FLRA 4PMOA 4MDPA 3FXYA 1PJ9A 4KRUA 5CG0A 2OWCA 4PN2A 1K9DA 5FCZA 2VTFA 5KZ6A 2ZWZA 2YIHA 3NUKA 3WQ6A 2GSJA 3HMCA 3TOPA 3MUAA 1TVPA 2DSWA 2DDXA 3N13A 3TONA 2GDVA 4W8BA 5EBAA 3K1DA 3CZGA 2ZUWA 3WMSA 1EIBA 3SUTA 4J3VA 4AZBA 1LG1A 4KGJA 2NSXA 1UA7A 1XYFA 4E8DA 1VB9A 1W1VA 1BYCA 1QBAA 1OIFA 1PZ3A 3N15A 1J0YA 4RL3A 3RJXA 2VL4A 3VGDA 1WPCA 4RE3A 7CGTA 1XGZA 2WVSA 2X09A 3ECQA 4TXEA 3SEPA 1ISWA 3GNPA 4RE2A 2VCAA 2MANA 5A8NA 4XB3A 2V3GA 4ZXOA 1UWSA 1TFVA 2JEQA 2VX7A 3VM5A 4QAWA 3W38A 1BPLB 3J7HA 3WF3A 1OD0A 3VMPA 2VI0A 3TTOA 4JAWA 5M3WA 2E8ZA 1VEMA 3NDYA 3PZIA 1MWOA 4ZXLA 5BRQA 4CD5A 4MAVA 3PZVA 3AS3A 4C7GA 1TZ7A 3OLEA 4MDOA 3ALFA 1G01A 1I1WA 2PWEA 4AZIA 3FHAA 2WCGA 3RM8A 2WBKA 3VIKA 2OYLA 1SR0A 2YL5A 5JUVA 4HMDA 3UCQA 2DSZA 4H8VA 3VUPA 5IDIA 4B16A 1WZKA 2GK1B 2Y5EA 3ZT5A 2XFYA 1W1TA 1WDQA 2PWFA 3WF0A 1EDGA 1UZ4A 2VRKA 2J7CA 2VO5A 3HN3A 2W66A 1ISVA 2VC9A 3DYPA 1BYBA 1Q6FA 3WDQA 1G5AA 3L4VA 1E6NA 3T0BA 2Z1KA 1JZ5A 1HIZA 4MB5A 1JDAA 1E72M 2WVVB 3AI0A 1UD5A 1D2KA 5CPSA 2VVSA 1UA3A 3IJ9A 1MQQA 4UQ9A 4BZYA 3F5LA 1UQYA 4J3SA 3WUBA 1KCKA 5AYIA 3T2PA 3WMBA 1KXVA 3NYDA 2GVYA 2WM0A 1CXKA 1IV8A 3D5HA 3ALGA 1CYGA 2BNJA 4W7UA 3TTSA 2CNCA 1HNYA 2Y8VA 4OKDA 4W86A 1JZ8A 3B9DA 1Q4NX 3UG3A 5JH8A 1WE5A 1BYDA 1V0KA 2WNWA 1CNVA 1JGIA 1XRVA 4TUFA 4JIEA 1H3GA 1WP6A 4GIAA 4CGTA 1X6LA 3LPFA 2D0FA 3TA9A 3W6MA 2EBNA 5BXSA 4AIEA 4DM2A 4CD7A 1BVZA 1JAKA 2XGBA 3FY1A 4Z2IA 4JFSA 4WKAA 3AMKA 3AYRA 4AIOA 2BHZA 1ISXA 1ODUA 3CMGA 4M82A 1QNPA 3ARPA 2BV9A 5D9MA 2XFFA 2F61A 4TVCA 1B3YA 1CLXA 1UWIA 3CUIA 3AJ7A 4MJ2A 3ZJ6A 4UZSA 2WSKA 3BMVA 4LX4A 3K4AA 1HP5A 2J62A 3IAPA 3WNLA 1J0ZA 2WHMA 3M46A 4JHZA 4D6IA 4YN5A 1GVYA 1OINA 2XVPA 1H09A 2BY2A 3N9KA 5DF0A 2DPEA 3AS2A 4M56A 3WFLA 3NDZA 3WL1A 2VX5A 3ZSSA 5A6KA 3AIWA 4UQBA 1J0JA 4WIWA 1H4PA 2E40A 5CSYA 4HA4A 1N82A 4AC1X 1OB0A 1JXJA 2WAGA 4HOZA 3UETA 4EANA 2QMJA 1MW2A 1XD0A 1AMYA 4FLQA 3MUY1 1JF6A 3OGRA 1TE1A 2V3FA 4W85A 3PBGA 1Q6GA 4IISA 1HL8A 1E6PA 4P7OA 5EFFA 3DECA 1OWQA 4GXPA 1CZ1A 4QDMA 1CTNA 1ESWA 4PMXA 2J47A 5BXPA 1E5NA 2WWCA 3BCFA 1PPIA 3MSGA 5D4YA 1NWSA 1KCLA 4MB4A 1BQCA 1E6ZA 4N0RA 1UD8A 2W63A 1R86A 4UZUA 2WVUA 3OIHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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