1LL6A

Structure of the d169n mutant of c. immitis chitinase 1
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
392
structure length
392
Chain Sequence
GGFRSVVYFVNWAIYGRGHNPQDLKADQFTHILYAFANIRPSGEVYLSDTWADTDKHYPGDKWDEPGNNVYGCIKQMYLLKKNNRNLKTLLSIGGWTYSPNFKTPASTEEGRKKFADTSLKLMKDLGFDGIDINWEYPEDEKQANDFVLLLKACREALDAYSAKHPNGKKFLLTIASPAGPQNYNKLKLAEMDKYLDFWNLMAYDFSGSWDKVSGHMSNVFPSTTKPESTPFSSDKAVKDYIKAGVPANKIVLGMPLYGRAFASTDGIGTSFNGVGGGSWENGVWDYKDMPQQGAQVTELEDIAASYSYDKNKRYLISYDTVKIAGKKAEYITKNGMGGGMWWESSSDKTGNESLVGTVVNGLGGTGKLEQRENELSYPESVYDNLKNGMPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title THE STRUCTURE OF AN ALLOSAMIDIN COMPLEX WITH THE COCCIDIOIDES IMMITIS CHITINASE DEFINES A ROLE FOR A SECOND ACID RESIDUE IN SUBSTRATE-ASSISTED MECHANISM
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE 1
molecule tags Hydrolase
source organism Coccidioides immitis
total genus 153
structure length 392
sequence length 392
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ll6A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ll6A01
3PTKA 4D6EA 4ACZA 1GOQA 1H5VA 1UKOA 2WMGA 1PZ2A 3MU7A 1CGYA 4BCEA 3W6MA 2D23A 1R87A 3AHZA 4LYRA 4PCSA 1WCGA 4NI3A 2XHYA 1KBBA 4PTMA 1CXFA 3AIRA 4OZOA 2JEPA 1VEOA 1ZB5A 3WD4A 2BHUA 4UQ9A 4DUWA 3NSXA 3GNRA 4XV0A 3F4VA 3DYPA 3AIWA 3WQ6A 1UOKA 2JF6A 2DQXA 4L4PA 5A8MA 4CCEA 3GDBA 1GNXA 2JALA 3RJXA 2J79A 1JDDA 2YLLA 2YOCA 1EDGA 1L0PA 1E6ZA 4ML4A 1UD3A 2DSZA 2WXDM 4AEFA 1HKIA 4P8XA 2ZOXA 4W88A 2EPNA 1HVQA 2J77A 3SUUA 1JNEA 3ARQA 4JKLA 1ODZA 2O9TA 2WZHA 1WZAA 4H8UA 2VCCA 4JFSA 2JEQA 4Z2LA 4JAWA 1XD0A 3T09A 1US2A 3WF0A 3AQUA 4UTFA 4CN1A 4AD1A 3W38A 2WZEA 1VFUA 3BLPX 4DM2A 2XVNA 5GPRA 2RGLA 1D7FA 2J78A 1CYGA 2DGAA 2D3LA 4W85A 3L4WA 4UQCA 4NF7A 1P6WA 4ZXOA 2AAAA 3OLGA 1PAMA 3QHOA 3SUVA 2ZICA 2ZX5A 2E9MA 3MUIA 1ISXA 1GOWA 4P7NA 1AVAA 2EEXA 4EK7A 4R27A 1ISYA 1JAEA 1BHGA 2WB5A 3F5KA 4OBSA 4CKQA 3VDCA 3KL3A 2IXVA 4QFUA 5GQBA 1V08A 2E9LA 2V3DA 1J9YA 1J0YA 1PX3A 2Z1SA 2W91A 1IT0A 2VZSA 3UERA 2BNJA 3ARRA 4Z2HA 4GZEA 4Z2IA 4OIFA 4N0RA 1GCYA 3VNZA 1CDGA 2VCBA 1BAGA 2DPEA 1K9TA 1H09A 1VJZA 2X0HA 3WFLA 4FLOA 3VUPA 2V38A 3WQ8A 1GOOA 1K6AA 4CN4A 1W3LA 1KR1A 3ALFA 2VVNA 5LA2A 4UR9A 3M6DA 3WNMA 1W9PA 2DH2A 1DWIM 3GXMA 3IAPA 3RILA 2E9BA 3VGBA 1UKPA 2DSKA 3WUEA 1W2VA 2EQDA 5EMYA 1J18A 1EH9A 1XH0A 2EBNA 1GORA 1YQ2A 4OUEA 3RO8A 4D6FA 1UH2A 4ATDA 1Q6EA 1WE5A 2EPLX 2WZIA 2Y8VA 1GQLA 4CU7A 1CEOA 1QI5A 1C91A 1XYZA 3OLEA 2CXGA 4UOZA 3VD4A 4AZCA 1B1YA 1F4AA 1E72M 5CPQA 5BRQA 1FH9A 5I2UA 3BAYA 1U2YA 1M53A 1EA9C 5JBEA 4P7OA 1H1NA 3AHXA 4F66A 2XM2A 4UZUA 3GM8A 1JXJA 2Y2WA 4IUGA 1QNPA 2E40A 3L4UA 4JKMA 1B3ZA 1KR0A 4HZ8A 4CCDA 1M03A 4HOZA 3DYOA 3K4DA 1CWYA 3WQ4A 2W66A 2UY4A 1GPFA 4DM1A 1DWFM 4TVUA 4PTXA 3WENA 3ARPA 4E8CA 4ZXLA 2BHYA 2HISA 4CGTA 1BYAA 2WC3A 5D4YA 2D1ZA 4TX8A 3D3AA 3WSUA 5A6KA 2DT0A 3VDBA 1EOKA 3QGVA 7CGTA 4MAZA 3WH8A 1JDCA 3VIFA 2V5CA 3EDDA 1V3IA 2F61A 3WQVA 3CHCA 1J0HA 1PIFA 1PEZA 1W9DM 2WNWA 2WWCA 1UA7A 4RE4A 4HMCA 5D9OA 9CGTA 4EKJA 1MW1A 1JF5A 2X05A 5A6AA 4BZYA 1CECA 5IDIA 2QV4A 1E4NA 4D1JA 4PCTA 1QHZA 4GIAA 1I1WA 2BFGA 3UESA 3AHYA 2PBOA 3CIVA 1PBGA 4GI6A 3KEHA 1W9BM 3VX0A 3IAQA 5F7UA 5EB8A 4S3JA 4U5KA 3VGEA 1EO5A 5BWFA 5M3WA 4J3UA 2YDQA 5E0CA 1MVYA 5I78A 1RP9A 1JIBA 3RMEA 1R85A 2CKRA 3TTSA 3FHAA 4P7LA 3AMDA 5A2CA 4PUDA 1AQ0A 4PMUA 2VQTA 1QPKA 1B31A 3SCVA 1OD0A 2XFFA 3ZIZA 2GJRA 1JYVA 1UKQA 3TTOA 1FH8A 3WNLA 1W1VA 1UKSA 2C0HA 3RCNA 1OT2A 1UR0A 1JI1A 1UG6A 2GJPA 3CUHA 5BYWA 3VIIA 2W5FA 1XSKA 2UY3A 1E73M 3AZTA 2X2YA 4WKFA 3TP4A 1CXHA 3VMPA 1UH4A 2XIBA 1GHRA 3TTQA 6TAAA 3B9AA 1WDRA 1E6PA 3AXHA 4TXEA 3PN8A 1E70M 7A3HA 2ZX9A 2DT3A 3DC0A 5DT5A 5GNYA 3WUGA 1JD7A 3MUZ1 2EPMX 3ZM8A 1WDPA 4L4OA 3MMUA 4GI9A 1BYDA 5E0FA 4M1RA 3DHUA 2XGIA 1BYBA 3PTMA 4F79A 3KWXA 1KB3A 3AZSA 1HN1A 4JFUA 1KGXA 4M82A 3WMSA 1K9FA 4MADA 1BGAA 6A3HA 3AMGA 2YL8A 2D20A 4CD4A 2F8QA 2PC8A 3ARZA 4PMDA 3AHVA 1C3FA 1NARA 1VJSA 1E71M 2OSWA 1QI4A 3BAKA 3EBVA 4HA1A 4W8AA 3II1A 1K9EA 1BYCA 2PI6A 1X1NA 2DT2A 3POCA 2XPKA 1R7AA 2XVPA 3AZRA 1C7TA 2OYKA 1EQCA 1NOFA 3OG2A 2GDUA 1CXEA 3AMLA 4JHZA 2ZUMA 1JAKA 5A8OA 1SR0A 3EDFA 1GVYA 1KXTA 3CZ8A 5A2AA 2W62A 2VUYA 5I24A 1CNVA 4MNKA 3BAXA 2B31A 1SYTA 4C7GA 3FNDA 1G01A 1Y7VA 3O9NA 1BFNA 1MXGA 3AIEA 2ZX6A 2VX7A 2ZXAA 3WD1A 4AMCA 1MXDA 4D6JA 2V5DA 3OZPA 4AD5A 4LGXA 3WMBA 1GOIA 2EPKX 3WDRA 3EMCA 1NWTA 2QMJA 1XCWA 1CIUA 3GH5A 4PBGA 3T0AA 4LX4A 2WVVB 1SMDA 1BSIA 1OCQA 1VB9A 1FA2A 1EGZA 1OWQA 4DWSB 3AS1A 5KEZA 5D9NA 3VOCA 2WLYA 3RJYA 3SEPA 1QVBA 4UFHA 1R7OA 2VX5A 2DT1A 2WVSA 1LG1A 1HP4A 1ZBCA 4W93A 1UD5A 4H2CA 2QF8A 1OD8A 1FHLA 1QBAA 5JIWA 4AZGA 3OLDA 2PWDA 1NH6A 4P8UA 1E4LA 1H4PA 1J0JA 5BXRA 3A4XA 2V3EA 2CBJA 5GNXA 1QI0A 4UFKA 1UHVA 5CQ1A 1V02E 4U2ZA 4JCMA 1W3JA 3ZMRA 3AHTA 3AROA 1QW9A 2ZUVA 4TOQA 2JFEX 3PHAA 4BS0A 2D22A 3VIOA 2WYSA 3WEMA 3ZJ7A 1GONA 3WF2A 1OB0A 1E1EA 1ZBKA 1G94A 3W26A 4AD0A 3FY1A 2Y24A 4P7QA 2A3CA 1VF8A 1EXPA 5A6LA 1W91A 4PMNA 3ZO9A 4AZIA 2XVGA 3QR3A 2VRJA 3CMGA 5M5DA 2CYGA 2O9OA 2J25A 4C7DA 5E9AA 2BY3A 3AIVA 4M81A 1E40A 2EXOA 3T2QA 4IISA 3VGHA 1VRXA 3W82A 4PMOA 2WPGA 4W86A 3AMKA 2WANA 3EDEA 5A3HA 3CGTA 4A3HA 3MV01 1VBUA 3NUKA 1QI3A 3WH7A 1MQRA 1E56A 5A69A 1JYWA 1ISVA 4URIA 1UYQA 2G3JA 2CBIA 4ATWA 5CJ5A 1B3XA 4KGJA 4JL1A 1RD6A 5I77A 4C7FA 4D6IA 2PF0A 1CGUA 3OBAA 4W5ZA 3FHQA 2CHNA 3SCTA 1OGBA 1EHAA 2YL6A 4U3AA 1LG2A 1MW2A 1FOBA 3ARWA 1E3ZA 1H3GA 3UR8A 1KXVA 2E0PA 4UQBA 1UQYA 4Z2KA 3OA5A 3CLWA 8A3HA 2BHZA 4J28A 2ZUNA 3VILA 1LL4A 3VDAA 4EAMA 5E6YA 3T08A 1E6NA 2CBUA 4FLRA 5FL1A 2G4FA 1JDAA 3SCPA 1KXQA 4GO8A 4OOZA 1ODUA 5IFPA 1BTCA 2E8ZA 4Q7NA 1UD6A 3CO4A 3JUGA 2ZXBA 5CG0A 2WC4A 3EMQA 1WO2A 2XM1A 2NW0A 1OSEA 4UQEA 4BF7A 1HKJA 4WLCA 4R5EA 3K1DA 3PZOA 3A3HA 3MO4A 2GDVA 1GJWA 1VENA 4LPCA 1HKMA 3WD3A 1E6SM 1UR4A 1BLIA 1G0CA 1M7XA 3MKKA 3OIHA 2DSUA 4AD3A 1QNSA 5JUVA 2A3BA 2DIEA 5FKYA 2XYLA 5D8ZA 1CXKA 3SCUA 4WSKA 2J7HA 4J3TA 5LA0A 1KQZA 4D6CA 3VDHA 4PSPA 3W24A 2ZUWA 3T0BA 3BXWA 3AISA 1GW1A 1CENA 4B9YA 1E15A 3AFBA 4JFVA 2UY5A 2E4TA 4AD4A 4DUVA 1WB0A 4GKLA 3SCQA 4AD2A 3N11A 3N13A 1E0XA 5FCZA 1B2YA 1GOMA 5IHSA 1CPUA 4UOQA 3ZT6A 4GI8A 4CD7A 4GQRA 5AC4A 2ZXDA 1TE1A 1NOWA 1E4MM 1NOUA 2XFRA 1GZJA 2FH8A 4OJYA 3UCQA 4D6DA 5CPSA 1HVXA 1ISWA 5CGTA 3L4VA 3W28A 3BAWA 1NWRA 2XTKA 3PZUA 3PZMA 4QLJA 3DECA 1R8LA 3ZJKA 3U7VA 1XGZA 4J3VA 1V6UA 3NDYA 1NM9A 4W5UA 3WUFA 3IJ7A 1TMQA 2Y8KA 2VURA 1L8NA 4EANA 1DEDA 2C8NA 4MJ2A 4PMXA 2JF7A 3OLIA 1EQPA 3U57A 2YLAA 5EFDA 3IJ9A 3VMNA 1R86A 3AYRA 3KL5A 1KBKA 5ABFB 4MB1A 1J11A 5IHRA 1PJ9A 5TD4A 1XRVA 2EPOA 2ZX8A 4TTUA 1HX0A 3QOMA 2TAAA 4D72A 1VEMA 3AIQA 4GZIA 4AZ5A 4UQAA 5JBFA 1QNRA 2CERA 1MWOA 3WNPA 7TAAA 4ZEPA 1HL8A 4HTYA 2YDSA 4YN5A 4XZBA 5DO8A 3AMCA 2DSWA 1E5NA 2CCRA 4CN6A 5IXEA 4PTWA 1WAWA 3WKZA 1BGGA 3GBDA 2WKGA 1CXLA 1W2PA 1BF2A 1ESWA 1BQCA 1O6IA 4ZENA 3F5LA 3OGRA 4YHGA 1MQPA 2YA2A 2X8RA 3NDZA 2GK1A 4HOXA 3I3EA 4J7RA 4CD8A 1LL6A 1XC6A 4JZ5A 3LPFA 2VZUA 1E55A 1W1PA 3BSGA 1H41A 4P8VA 2CPUA 1CGVA 1BVNP 1J0KA 1BPLB 1C8QA 2YL5A 3WD2A 3KL0A 3MV11 5I3DA 1TA3B 1NP2A 1KQYA 3WH5A 1UWTA 4CU6A 2OWWA 4H7VA 4WF7A 4GINA 4FF5A 5E6ZA 1GJUA 4OOUA 1NP0A 4M29A 3W27A 1QNOA 2X1IA 5EFFA 2J7EA 1UQZA 4AZ7A 4HPHA 1A3HA 4GQQA 1UWUA 1OIMA 1NWUA 2WHMA 4AXNA 2CNCA 1FFQA 5DT7A 2NT0A 4P8WA 2WVVA 4B3LA 1H0GA 4DWSA 2WMFA 5CLWA 5HNNA 3ZQ9A 3WUBA 2O9RA 4P7RA 5BCAA 1KCKA 2CITA 3ARTA 1CXIA 2OSXA 3VPLA 1HXJA 4H8VA 5I5RA 4F8XA 1N82A 3MS8A 2V3GA 4H41A 4V27A 1V3JA 1V3LA 5HXMA 3CZJA 4CD6A 4LQ1A 1TVNA 4TVCA 4HA4A 5A6BA 3WIJA 3K46A 2O92A 5D9MA 1JL8A 2VRQA 2YKKA 1KGUA 2VJXA 3VM7A 3RPMA 1LLOA 4Q22A 5E70A 1TZ7A 2ESCA 2GUYA 1HJSA 8CGTA 3AXIA 3AYSA 4JKKA 5D8WA 3ARVA 4WIWA 3CPUA 3VO0A 1HJXA 5C70A 2VL4A 4N42A 3QHMA 3TONA 5M17A 2GVYA 3FAWA 1ZJAA 4A4AA 2BV9A 4M80A 2VX6A 4PMZA 2WW5A 1JYXA 4XUYA 3ALGA 1J10A 3EYPA 2RGMA 3GXFA 2J8GA 3CMJA 1UR2A 2Y4SA 3FAXA 4DWSC 2VTFA 1AQHA 3TOPA 4B16A 3AS0A 3CZGA 3B9EA 2Z1KA 2WHJA 3A6OA 4AEEA 1B3WA 2DEPA 4LXFA 3MSGA 1C92A 1KXHA 1XCXA 3RDKA 2VZOA 3K8KA 1VAHA 4YPJA 1GOKA 2WCGA 1O7AA 1X6NA 2W63A 3WBAA 5FOOA 2WHLA 4W7UA 2WAGA 3A4WA 4U2YA 1RH9A 4UQDA 3UG3A 1IV8A 2XVKA 1D2KA 3SUTA 1B0IA 1MW3A 4GPNA 2FHCA 4IPNB 3WD0A 4D1IA 2GK1B 5A1AA 1W9XA 3VD7A 4AIUA 4AZHA 2VRKA 6CGTA 1EHNA 2AOSA 2CESA 1CLXA 5CSUA 3PBGA 2JE8A 4QDMA 1UD4A 1TG7A 1Q4NX 1V0LA 2WMJA 5A6MA 1H11A 1QHOA 4V28A 3VD3A 2J7DA 2VZTA 3MMWA 4B15A 4MNJA 2JIWA 4RE2A 3W37A 2J75A 3U7BA 3GZAA 4ZE5A 3ZSTA 1EDTA 3VIPA 1LF1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2XFY A;  2NSX A;  1E6Q M;  3WL1 A;  3VIM A;  4PMQ A;  2OSY A;  3WL0 A;  2W4X A;  3WMC A;  1PX8 A;  3VIG A;  2J7C A;  3SCW A;  2ZWZ A;  1C7S A;  3LPG A;  4BA0 A;  2OWC A;  3WF4 A;  4MB5 A;  3WN6 A;  3AXX A;  4CVU A;  1UA3 A;  4Z2J A;  3OGV A;  1GHS A;  1S46 A;  4ACY A;  3CH9 A;  1JI2 A;  1GQK A;  5BXS A;  3GNO A;  2J47 A;  1W1Y A;  4TVD A;  4GXP A;  4V2X A;  1C93 A;  1DP0 A;  2CIP A;  1J0I A;  3WF1 A;  3LMY A;  5CZK A;  3W0K A;  3PZT A;  1WPC A;  1V0M A;  2C7F A;  3B8S A;  5DF0 A;  2G3N A;  1JGI A;  4HPG A;  4CVW A;  4UOJ A;  4HZ7 A;  1V3M A;  3GBE A;  3L4Y A;  4YHE A;  4EE9 A;  1E5J A;  1EO7 A;  3RIK A;  2WMK A;  1M04 A;  2DIJ A;  4WJX A;  1KGW A;  1XH2 A;  4H8H A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1QBA A;  4P8U A;  2PLK A;  5BXR A;  1GKR A;  4CQA A;  1OZQ A;  1T8Q A;  2IPJ A;  4A35 A;  5MKG B;  2B7O A;  2ZZ3 A;  3TWB A;  4HAR A;  1DTN A;  5AHN A;  4QRO A;  3T05 A;  1EC7 A;  2FFC A;  3LU2 A;  4GD0 A;  2WYS A;  3WEM A;  3LXB A;  4J5N A;  3WF2 A;  4GJJ A;  2FPT A;  4ZCW A;  2ZFA A;  1ELS A;  3DEQ A;  5HJX A;  3EA1 A;  4AVF A;  1XLC A;  2AL2 A;  1XFB A;  4XBJ A;  3MYP A;  1EXP A;  4HSN A;  3GXT A;  3U4A A;  3QR3 A;  1FHV A;  2VRJ A;  3VE7 A;  4PCN A;  4LAN A;  4IME A;  3S5N A;  3NQ7 A;  4V1X A;  4M81 A;  3REQ B;  4EPE C;  1E40 A;  2E28 A;  4IIG A;  4IIS A;  3VZY A;  1GRJ A;  3AMK A;  2WAN A;  5A3H A;  4UTK A;  4A3H A;  3C5Q A;  1VPQ A;  3DI1 A;  1W26 A;  2G96 A;  2Z6I A;  1JYW A;  1ISV A;  1UYQ A;  1VBG A;  1FKF A;  3NQE A;  4KGJ A;  5CJ5 A;  2NQJ A;  5I77 A;  4C7F A;  4U4M A;  3TSD A;  3UNT A;  4ITZ A;  3OBA A;  3JS3 A;  4C6B A;  5H2Z A;  3UYC A;  5HWM A;  3FHQ A;  3SCT A;  3L68 A;  4DUO A;  1VBJ A;  1EZ2 A;  1MW2 A;  2ZR5 A;  3UR8 A;  3I6R A;  3PPH A;  4UQB A;  1VQT A;  1UQY A;  4Z2K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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