1LL7A

Structure of the e171q mutant of c. immitis chitinase 1
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
392
structure length
392
Chain Sequence
GGFRSVVYFVNWAIYGRGHNPQDLKADQFTHILYAFANIRPSGEVYLSDTWADTDKHYPGDKWDEPGNNVYGCIKQMYLLKKNNRNLKTLLSIGGWTYSPNFKTPASTEEGRKKFADTSLKLMKDLGFDGIDIDWQYPEDEKQANDFVLLLKACREALDAYSAKHPNGKKFLLTIASPAGPQNYNKLKLAEMDKYLDFWNLMAYDFSGSWDKVSGHMSNVFPSTTKPESTPFSSDKAVKDYIKAGVPANKIVLGMPLYGRAFASTDGIGTSFNGVGGGSWENGVWDYKDMPQQGAQVTELEDIAASYSYDKNKRYLISYDTVKIAGKKAEYITKNGMGGGMWWESSSDKTGNESLVGTVVNGLGGTGKLEQRENELSYPESVYDNLKNGMPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title THE STRUCTURE OF AN ALLOSAMIDIN COMPLEX WITH THE COCCIDIOIDES IMMITIS CHITINASE DEFINES A ROLE FOR A SECOND ACID RESIDUE IN SUBSTRATE-ASSISTED MECHANISM
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE 1
molecule tags Hydrolase
source organism Coccidioides immitis
total genus 144
structure length 392
sequence length 392
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ll7A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ll7A01
1GVYA 3PBGA 3DYPA 1JDAA 1IV8A 1MW2A 1Z32X 4MPKA 1TVNA 3DYOA 2E8YA 4UR9A 4GI9A 2WHMA 2ZX8A 4DM2A 3LPPA 1KBBA 5AY7A 4B15A 4EK7A 3WNNA 3B9AA 3VD5A 4W87A 5CSYA 3DC0A 4HU0A 4UTFA 1W9XA 3AMGA 1JD9A 3SEPA 3VU2A 1GZJA 4DWSB 1HL8A 1M7XA 1KXHA 2D20A 1MW3A 1DWGM 4AIEA 1D2KA 3AQUA 1E9LA 4HU8A 2ZUVA 2WBKA 1RP8A 4CCDA 3WDJA 4AZGA 1QI4A 4CCEA 5M03A 3ZT5A 1QBAA 4AWEA 4EE9A 3RDKA 4BQ5A 1JZ2A 1QHPA 1TA3B 1E4IA 2F2HA 1J0JA 2Y4SA 1TUXA 1GOIA 1NQ6A 3RJXA 3WNMA 2YBUA 2WCGA 3BAJA 3NDYA 4QAWA 1VEOA 1BYBA 1LL6A 2YDRA 4Z2LA 2WPGA 2J62A 4UFMA 1V6WA 4D71A 2D24A 3OIHA 1SYTA 3F4VA 3OGRA 1US3A 5ABFB 1KGXA 2Z1SA 4OUEA 3NUKA 4HA1A 4MNJA 3PZIA 3WBAA 5D4YA 1QHOA 4AZCB 1Q6GA 3DHPA 4X9YA 2W5FA 3EDJA 1E3ZA 1VJZA 4F9DA 3ARXA 3WBEA 3FHQA 1R86A 4UFIA 4D6CA 3AS2A 5HNNA 1CXKA 3BAXA 3ARTA 1VRXA 1EDTA 2RGLA 2C7FA 3FNDA 3BCDA 1UH3A 4PMXA 3N17A 3WH8A 2FHFA 2RGMA 1TCMA 1H5VA 4WKAA 2JALA 1E6RA 2X2YA 3PZUA 4ZXOA 1GOQA 1V03A 2XHYA 1O6IA 1NOWA 1PX3A 2W92A 2XM1A 4OBSA 1DTUA 1I75A 3AS1A 3N9KA 1V3IA 4RE3A 4BCEA 4BF7A 3UR8A 1BHGA 2ZIDA 4M24A 4W8AA 3GXIA 1MW0A 4AZBA 3WH5A 1H1NA 1BAGA 4JFWA 3ZT6A 4ATLA 2D3LA 1UUQA 3AHTA 1H11A 1LWJA 2XFRA 3AIEA 4N0RA 1NWTA 2CETA 4P7OA 3WDPP 2WNWA 3MMWA 2DDXA 5LA1A 1R85A 3TP4A 3VTRA 3PZTA 4LYQA 1DWAM 4F66A 4QLLA 1NOUA 1NARA 3CMGA 2VT0A 4QCEA 4XV0A 4D72A 1B3VA 3TOPA 4MDOA 4AZ5A 1E5JA 3CZEA 1UKSA 3FY1A 4WJXA 1HP5A 1E5NA 4PSPA 2G3MA 1C8YA 4GZEA 4P8XA 1EH9A 4KWUA 2NSXA 5A6JA 1CGVA 3N18A 1JDCA 1ZB5A 1JG9A 4HZ8A 1W9VA 2A3HA 1XCWA 4F79A 2WHJA 5AC4A 3U57A 4Z2JA 3W37A 1E4MM 3SCVA 2G8ZA 4W89A 2O9OA 1E0VA 7TAAA 2CESA 3AI0A 2VX7A 2CPUA 1H41A 4FF5A 4W7VA 3QHMA 5A6MA 4AZ6A 2J4GA 3OBAA 2ZWYA 1GONA 2FDMA 1QOXA 5JIWA 2GUYA 1LG2A 3WQWA 5CG0A 3PZQA 3CTTA 3AMKA 2YA2A 3KL5A 4U33A 4ACZB 1UG6A 4FMVA 2QPSA 5IHSA 1W9PA 3MUZ1 1V08A 3WF2A 3UERA 2AAAA 2J7DA 5E0FA 3AIUA 5D8WA 4E8CA 3VM5A 1C91A 4TTUA 1MVYA 1KGUA 4UZSA 1V3KA 4A3YA 4C7DA 2HISA 3AMDA 1JYNA 4NI3A 2IUZA 1BLIA 3G6MA 1WB0A 3FN9A 4M82A 3EDKA 4KH2A 1QBBA 3LPOA 3WUBA 4B9ZA 5CPSA 9CGTA 3W26A 4OZOA 2YA0A 3GM8A 1JYXA 3BLKA 3A4WA 2J79A 3NSNA 1BSIA 2CIPA 4MNKA 3I3DA 3KL3A 4R27A 4J27A 1MXDA 1HJUA 2OLHA 1UH2A 5I0DA 1RD6A 1PIGA 3WD2A 3ARUA 1GQLA 4RE2A 2XPKA 2WVVA 2ZXDA 3W6MA 3AIVA 2JE8A 4M81A 4CGTA 1E72M 2A3CA 3B8SA 1QI3A 2WMKA 3OGSA 4P7NA 1GNXA 1OSEA 8A3HA 1V02E 5ABGA 2EPKX 4D6EA 5M17A 1H3GA 1UD2A 7A3HA 4C7GA 1WO2A 1JYWA 5DT5A 2PI6A 1WPCA 5CPTA 1FH9A 3VGHA 3WH6A 4HP5A 3EMCA 3LPFA 4HTYA 3ARYA 1OWQA 1G94A 3SIMA 3W0KA 4IPLA 1TR1A 1WZAA 5I24A 3AMCA 3UEQA 1G1YA 1CLVA 4JL2A 2WMJA 3PZVA 4LGXA 3L4ZA 4UQEA 1BQCA 4CVUA 2ZE0A 2YDSA 5LYRA 1TZ7A 4PCTA 2BV9A 2QHAA 1C92A 1E4LA 1UH4A 3WD0A 5EBAA 3GXFA 3MMDA 3NDZA 3S2CA 2J47A 4MJ4A 1EO7A 1PX8A 4B16A 4PMOA 4Q22A 1E1EA 2G41A 3LPGA 1OGBA 2DSUA 1CZ1A 4CN4A 3W6LA 1JI2A 1UKQA 1ECEA 1UQYA 1H4PA 1V6YA 1ZU8A 4GO8A 4RL3A 4ATDA 1XH2A 3CZJA 2XVLA 2A3EA 3A3HA 1X6NA 1DWFM 3RM8A 2OWCA 4EKJA 2YLAA 3GYCA 1XD1A 4J3SA 4IM4A 4GO9A 2WMGA 4TVDA 1QI2A 3IANA 3NSXA 5I79A 3ZR6A 3WQVA 2O9TA 2QMKA 1JZ7A 1KQZA 4XZWA 1J9YA 1HNYA 1KFWA 4JFTA 1CENA 3GH7A 3WQ6A 1OCQA 2WC7A 1JDDA 2PBOA 4J3VA 3SCNA 1E6SM 3WQ4A 3THDA 3MANA 4PMQA 1M01A 4PTVA 1R7OA 4JFUA 2YJQA 1NWRA 3ZJ6A 5IHRA 5KEZA 5CJ5A 1BG4A 5BXSA 4XUYA 1EXPA 4HPGA 1GJUA 4JZ5A 4OIFA 1CXHA 5JBFA 2XGBA 5FL0A 4JFSA 4W88A 3BXWA 3CHCA 4E4PA 3WMSA 1LG1A 1E6XM 2ZUNA 3CH9A 2CYGA 1FH7A 1LL7A 4UQ9A 4J3XA 3VIHA 1W9UA 1UQZA 1HXJA 2XIBA 1MQQA 1S46A 4WSJA 4D6GA 3AS3A 3K8KA 4CD7A 2Y5EA 2XUCA 4A3HA 5JUVA 1UR9A 2WMHA 3ZT7A 1GPFA 1CYGA 3RM4A 4UCFA 5EFDA 4W8LA 1ZL1A 1UKTA 3PZ9A 3CUFA 3HMCA 2W91A 1IZKA 2VZVA 1ISWA 1UD4A 2VRJA 1PAMA 3OLEA 5A6BA 3WY1A 1JFHA 1HP4A 2WSKA 1YHTA 2EQDA 5I6SA 3D5HA 1JF6A 4U3CA 5GNZA 3T2QA 1R7AA 1UKOA 3W27A 4AD0A 2WMFA 3KEHA 3EBVA 2VZUA 4PBGA 1J12A 3HJEA 4PTWA 2PWFA 2XSAA 1H09A 1KR1A 5IFTA 4CD6A 4U31A 5I2UA 5AC5A 4ZE4A 4LYRA 2VVNA 1UWTA 2V38A 2DSZA 5CPQA 5FCZA 1UA3A 1C90A 4JKKA 3U5UA 4D6IA 4CD4A 2YA1A 3NYDA 4W85A 4LPCA 1C3FA 1GQKA 2UWFA 1UWRA 4UQAA 4ML4A 2XVNA 2ZX7A 3AJ7A 3OGVA 2VX6A 1GORA 3B9EA 1D7FA 4GI8A 1UZ4A 4E8DA 5M5DA 3NSMA 1E4NA 3EDDA 1WDRA 2OYLA 1KCKA 2BHUA 6TAAA 3SUWA 1ODUA 3ZM8A 4QLKA 3RMEA 1BVZA 4CKQA 5BCAA 1KCLA 5A2CA 5C70A 1LWHA 3N12A 3W25A 5AYIA 1V3HA 5E6ZA 3AIQA 4UNIA 2WC4A 2GDUA 2YKKA 4J7RA 4M29A 2VZTA 3CPUA 4JCLA 3VD3A 1PPIA 4CD8A 2PC8A 1N82A 1E0WA 2J7BA 1EDGA 3VDBA 1OM0A 1QI5A 3ZJ7A 5A2AA 4DWSD 4ACYA 3WENA 1FP8A 2D0HA 2WHLA 1XSIA 1LJYA 4YPJA 1MQRA 3J7HA 2WVTA 2J7CA 3QGVA 3QHNA 2XWDA 2E3ZA 5EB8A 4TOQA 3UETA 2Y2WA 3AHXA 4PYSA 1B31A 4W7UA 4PMNA 4GPNA 2X8RA 4DUXA 5I5RA 1UR8A 4N42A 4Q7NA 5ABHA 4GI6A 2GJPA 1Q6FA 5HBFA 2X0YA 4B9YA 4EAMA 1H2JA 4H7VA 1W2VA 2WVSA 5M3WA 1HT6A 1E6PA 3AHZA 4LYPA 5HPOA 5TD4A 1OGSA 1VIWA 1XV8A 1UR1A 2DEPA 3L4YA 3WDIA 4DWSA 4BA0A 3MKKA 2BNJA 3VVGA 3UCQA 8CGTA 3PZGA 4J28A 4L4OA 4ATWA 5CGTA 1H49A 2J74A 2ZX5A 2Y8VA 4MB1A 3ZQ9A 3KL0A 2MANA 1QHZA 4U5KA 2V3EA 2XYLA 1ISYA 4BQ3A 5A8QA 3WNKA 1LLOA 2YL8A 1FHDA 4AY1A 2XSBA 2WHKA 1XH0A 2XFFA 1VF8A 3VOCA 5EFFA 1EA9C 4UOZA 1AMYA 1C7SA 2WCAA 1HKJA 3K8MA 1V3JA 2E40A 5HPCA 1TA3A 2VQTA 3OB8A 1EOKA 3QOMA 4CN6A 1YQ2A 5E9AA 1W3HA 1OBAA 3I3BA 4YN5A 2WLZA 2XVPA 4D6JA 2DH2A 1LF1A 2EPNA 3O6AA 2CBIA 3VIGA 3IK2A 2WWCA 3W28A 3OLGA 1ISZA 2WK2A 3WELA 3THCA 2DT3A 1HKMA 2VQUA 4J3WA 1W9DM 1V6XA 3VMNA 2UY3A 2VTFA 4S3JA 4W7WA 1W3KA 2EEXA 1WZLA 2O92A 2WMIA 1J0YA 4NRSA 2A3AA 1B90A 3GBEA 1VENA 2ESCA 1FP9A 1QNPA 4DM1A 5A6AA 1TFVA 1OGGA 5BRPA 1A47A 1EHNA 3VIOA 4PMUA 1KXQA 3AIRA 2VR4A 1HN1A 3AXHA 4KGJA 3A47A 3K8LA 2OYKA 3BMWA 2DT1A 4JKMA 2VC9A 2GJXB 1V6UA 4AD2A 4CVWA 4KMQA 4QLJA 4AC1X 1ZJBA 4TX6A 2NT0A 4WSKA 3CUGA 2CKSA 3TTSA 2VNCA 2CCRA 4HA3A 2ZUUA 1XGZA 3JUGA 5EMYA 2WBGA 3FW6A 2DIEA 1J0IA 1E40A 2XVKA 2XWEA 4PRWA 2BS9A 4FLRA 3VIKA 3AOFA 2CHOA 5JIPA 4AYSA 1AQHA 2BFGA 3PTMA 3VMPA 4DWSC 4QP0A 1XD0A 1W1PA 3NIYA 4JCMA 4AISA 2D23A 1WKYA 2EPMX 4UFHA 3W29A 4CCCA 3FXYA 4A4AA 2DT0A 4GIAA 2E0PA 1G01A 3WEZA 1JZ3A 3EYPA 4UFLA 1GJWA 3UG5A 1VFMA 4MB4A 2BY0A 3K4DA 2WLYA 3VIMA 4JAWA 4GINA 1MW1A 4AIUA 4PTXA 3POCA 1CWYA 3WD1A 1UKPA 3WH7A 4W86A 3VD9A 5HDRA 3MUIA 1VEMA 2PB1A 1HX0A 3VM7A 3U5YA 1E6NA 3N13A 5CZKA 5D9NA 5IFPA 4Z2HA 4D6FA 1CTNA 2VMFA 1PIFA 4UQBA 5DT7A 4H8VA 1V3MA 5BROA 3K1DA 3DHUA 3AXIA 2PWGA 1I1WA 1QW9A 2QV4A 4JFVA 5A1AA 1JAEA 1K9FA 2ZUSA 2GVYA 3UG4A 3W81A 3WD4A 1DP0A 4AD1A 4H8UA 1HKIA 1HL9A 3SCPA 4HZ7A 2TAAA 1NWSA 1TMQA 3BMVA 3PTKA 1M04A 3F5LA 1E70M 1WDSA 1BYAA 1I1XA 1DWJM 2DQXA 1GOOA 5IXEA 5FL1A 1IT0A 3M6DA 1B9ZA 3AFBA 3AYRA 1EQCA 3AHVA 1JF5A 2BVDA 4M8UA 4P7RA 4U3AA 1XSJA 1UR4A 1E43A 3BLPX 3VINA 4AEEA 1ZBVA 1U2YA 1FOBA 4XX6A 1Q6CA 3WF3A 4TVUA 3WMCA 5CSUA 1GVIA 5ECUA 1JZ4A 2J77A 1JI1A 4OJYA 2XVGA 2W66A 1JYVA 1UD8A 2XFYA 1NH6A 1DWIM 3WUFA 2WW5A 4NRRA 3VGEA 1OD8A 1DHKA 7CGTA 5I23A 2WM0A 2ZUWA 5FOOA 2ZICA 4W93A 2WKLA 5BXPA 1JZ5A 3AISA 4Y7EA 1XYFA 2ZWZA 4MB5A 1C93A 5HOSA 2E4TA 3E1F1 1H0IA 2QF8A 4H41A 1CDGA 4ZEPA 5A2BA 3BGAA 2OWXA 2YL6A 1WCGA 4NZCA 3ZSSA 2WCSA 3M7SA 4J3TA 2ZUTA 3I3EA 4HA4A 1W1YA 3ZIZA 4DUWA 4KRTA 2W61A 3VDCA 3FHAA 1HIZA 2JEPA 4PEEA 3WH9A 1AQ0A 1GQIA 1W3LA 2J7EA 4V27A 4CU6A 4MTVA 3GZAA 4AZ7A 3CO4A 4MNLA 1KB3A 4CD5A 2J25A 1PEZA 3WSUA 2AOSA 1FFQA 1B30A 2ZUMA 2ZX6A 3D3AA 3EMZA 1KXVA 3WFZA 1AQMA 4W8BA 4JKLA 4WF7A 3RPMA 1KXTA 4PMRA 1E73M 3SCSA 3W82A 3WNLA 3IAPA 5C8BB 1FFRA 4PMDA 5FIPA 4AMCA 3DECA 4FLOA 3GH5A 1V02A 3IAQA 4IPNB 1TE1A 2FH8A 3VX0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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