1SR0A

Crystal structure of signalling protein from sheep(sps-40) at 3.0a resolution using crystal grown in the presence of polysaccharides
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFAGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDVGAPVSGPGVPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Unknown function
source organism Ovis aries
publication title Crystal structure of signalling protein from sheep(SPS-40) at 3.0A resolution using crystal grown in the presence of polysaccharides
rcsb
molecule keywords signal processing protein
total genus 116
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1sr0A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1sr0A01
3N11A 2YKKA 1W2PA 4L4PA 3VDBA 3ZMRA 1SFSA 1S46A 4LQ1A 1OB0A 2X8RA 1KGXA 1BTCA 1CXKA 2J25A 2WC4A 5ABEA 3POHA 2OWWA 4HZ6A 3WY1A 3UG5A 2G3MA 2DPEA 4WSKA 1ZBVA 2ZUTA 3GNOA 2WC7A 1ISZA 4HA3A 1CXEA 3VX0A 3WMBA 3WL1A 3EDJA 1V03A 2ZXBA 3PZQA 4MNJA 2GSJA 2CBVA 3WQVA 1H1NA 2BXZA 1ISWA 2O9OA 1B9ZA 4B3LA 4W5ZA 4UTFA 2JE8A 3EBVA 3WDJA 2D3NA 4GI9A 2WAGA 3K46A 1Q6DA 2NW0A 1FHLA 1W3LA 4B15A 3K1DA 1V02A 1GHSA 3GM8A 3NSNA 3AS1A 1ISYA 4PTXA 4CVUA 3OGVA 3IAQA 1HIZA 2D0FA 3MV11 2DSUA 3WENA 1GJWA 2DSWA 1XCWA 5EFDA 1M01A 3KE0A 5FCZA 2XFYA 5E0FA 3LMYA 4D1IA 5FIPA 5IHRA 3G6LA 5D8WA 1M7XA 2XVLA 1K6AA 1E4NA 1H41A 2BHZA 1DWFM 5BRPA 3CMGA 2DH2A 2ZWZA 3ALFA 4P7QA 4LXFA 1VFOA 1BYAA 3ZJ8A 1EQPA 1TFVA 1KR1A 3GH5A 3SCOA 4AIEA 4AZCB 4AWEA 1EIBA 1XSJA 3K4AA 3RM8A 2ZXDA 3AMCA 3VIJA 3PZUA 4NRRA 4PUDA 4AD2A 5TD4A 3KEHA 2J77A 3GXIA 1UH3A 4XZWA 2W66A 3VGDA 3VIKA 1HKKA 1R85A 3MKKA 3W6LA 2PWHA 3W82A 3WL0A 4KWUA 5IFPA 4TOQA 2CKSA 4XB3A 2JIEA 1GQKA 4ML4A 1E72M 3MUIA 5D9OA 1E15A 4GKLA 2YIHA 2PC8A 3CZ8A 3WD3A 1OGGA 5I0DA 2DSVA 1M04A 3WBAA 1QOXA 2XIBA 1UG6A 1WB0A 3WDHA 4CD7A 3RPMA 2VTFA 3VMPA 2WLZA 7CGTA 2BY1A 2XSAA 1Q4NX 1XRVA 4GPNA 3TOPA 2C7FA 4M80A 4AIOA 3AMGA 4LX4A 4F9JA 3VIMA 4PCTA 1UKTA 1ODZA 1EQCA 1XYFA 5EBAA 4A4AA 5GNZA 3WQ5A 2IUZA 4Z2KA 5FKYA 1MQPA 1WAWA 1OINA 3M46A 4AXNA 1NWRA 5CPTA 4ZXOA 4D6EA 1JI1A 3PBGA 2WNWA 1F4HA 3WD2A 1HVXA 4PYSA 3VOCA 4ATWA 1A3HA 1UD3A 1RH9A 3OG2A 2JEPA 1C93A 1U30A 4N42A 4AEEA 4JHZA 1W1PA 3CLWA 3PN8A 1ZL1A 1JG9A 3MMDA 1W1YA 4PMQA 2J7GA 4U2ZA 1UR9A 3ARQA 1V3KA 4PTVA 3ARZA 5E0CA 2Z1SA 1TR1A 1H2JA 2BVDA 2E9BA 3VGGA 1UD5A 1V3LA 3U7BA 1WZLA 4R27A 4J3SA 2J4GA 2PWDA 4CCDA 3VTRA 1UQZA 3WEOA 5I3DA 1NH6A 1ESWA 1SMAA 1VENA 2GJXA 1VEPA 2GJPA 3MU7A 2W92A 2V38A 3UESA 2ZUSA 3BCFA 2WZEA 3VDHA 3AIBA 2GVYA 1GVIA 3E1F1 4ZE4A 2Y4SA 2WVSA 2HVMA 1LWJA 1YQ2A 2FHCA 3UR7A 4QCFA 1W1TA 2A3CA 1E1FA 1MXDA 2J8FA 4UZUA 4V27A 5A6BA 3EMZA 1HL8A 2WK2A 1VRXA 3F5KA 1TVPA 3DYPA 4WSJA 1Z32X 1R7OA 1UR1A 2YDRA 4MAVA 4QCEA 1JZ7A 1LL4A 3BH4A 2VVSA 4PUEA 2QHAA 1BYDA 2VRJA 5JBDA 4UCFA 4FF5A 3L4YA 1DWHM 4KMQA 5D9MA 1C7TA 1JNEA 3K8KA 4HOXA 3WMCA 1EO5A 1IV8A 2ZX5A 4Z2IA 1UD2A 1NOWA 1M03A 4CKQA 3K8MA 1UWSA 2XG9A 5A6BD 1WDPA 2GDUA 1QBBA 3WF1A 5A2CA 1E71M 4TUFA 2EBNA 4D72A 2AOSA 2YL8A 4UQAA 2X1IA 2GFTA 3WD1A 1E1EA 2FH8A 4UR9A 4B16A 1ZBWA 1G1YA 2Y24A 3VGFA 1DWJM 4M56A 1PZ3A 1EOKA 4RE4A 2X2YA 2FGLA 4AD0A 4NZCA 4AZ7A 5E6ZA 2CEQA 1Q6GA 3OB8A 1B3YA 3HMCA 4HOZA 1ISVA 4UQEA 4U33A 3W53A 4V28A 5A6MA 4PCSA 3W26A 2WPGA 5A2AA 1US2A 1CIUA 4JFVA 2B31A 2W67A 1W3JA 3N12A 1BQCA 1WZMA 3BXWA 3AYRA 1CENA 5LA2A 3GNRA 2CIPA 4JIEA 3HJEA 1UKPA 1KXTA 4XX6A 1G0CA 1WCGA 1Y7VA 2WBGA 1V6YA 3N13A 2J7EA 1L0PA 1XD0A 4AZCA 3EDFA 2AAAA 4PTWA 4QFUA 4YN5A 1V0LA 1VEOA 5JIWA 1V6WA 3OIHA 4E4PA 3VX1A 3N1AA 1O6IA 1OCQA 1W2VA 1GONA 4QAWA 4HMDA 1J18A 4LYPA 4TXEA 5HPOA 5LA0A 1HKMA 3AZTA 3M07A 4D6JA 3ARRA 3WQ4A 4HPGA 4PEEA 4UQDA 2BY0A 1H4PA 2PBOA 4JFTA 1E43A 4AZIA 4YHEA 2CKRA 5ABGA 1V3MA 1UZ4A 3ZR6A 1H09A 5BXRA 5A8QA 3WUGA 3GH4A 3VILA 1NARA 4JKMA 2WMJA 1HJUA 5D4YA 1VF8A 2UY5A 2WKLA 3MMWA 4BCEA 1TA3B 3CZLA 4RE3A 3QHMA 5CG0A 3BGAA 2WSPA 1RD6A 3OGRA 3EDKA 3MSDA 3TTSA 4H8UA 1OBAA 2YL9A 3FHQA 1BYCA 2ZX7A 2J78A 4U5KA 4HPHA 3PTQA 1CEOA 5A6SA 4XZBA 2ZOXA 4AW7A 1KBKA 4KH2A 3APGA 2VQTA 1GJUA 3DYOA 3SUWA 4GQRA 1FHDA 4J3WA 1KCKA 4NF7A 3WDPP 4H41A 4J3VA 1UWIA 2ZXQA 1JL8A 3ALGA 3ZQ9A 1QI3A 1R87A 4TX8A 2G8ZA 1IT0A 1CGUA 4HA4A 1V0MA 1JF6A 3VIGA 4AD1A 3F4VA 1JDCA 1E56A 1WZKA 3W27A 1E4LA 5M3WA 3VD3A 2J8GA 3LPFA 1HP5A 1E3XA 1PJ9A 1PAMA 4D71A 4JFWA 1ECEA 3VIFA 4X9YA 2X0YA 1JFHA 1EDTA 3PTMA 1TMQA 3BC9A 1ZBCA 1MW3A 3GXFA 1AQMA 3CBWA 4U2YA 4KGJA 2XJ7A 3RMEA 5A8OA 1JDAA 3NYDA 2XWDA 1JAEA 2XFRA 1LWHA 4IUGA 3LPGA 3WFLA 4H2CA 4DUWA 2YA1A 4W87A 4NI3A 3B9DA 3ARYA 5JBFA 4UFLA 1JF5A 2FDMA 3EDDA 1DHKA 6A3HA 3BCDA 4HA1A 4X0NA 4AIUA 3L4TA 2UY4A 2NT0A 4OOUA 2XVNA 3EYPA 3WDIA 2E0PA 4MJ2A 3ZJ7A 4DWSB 4P7RA 1B3XA 3N9KA 3GNPA 2AMGA 3AMDA 1VBUA 4UNIA 2WANA 3QR3A 1PX3A 1FP9A 3VKKA 3OLIA 4EE9A 4UOZA 3N18A 4PMOA 2G4FA 4F79A 1E4IA 2UY2A 3BSGA 2E40A 2JALA 2ZWYA 3O6AA 1W9VA 2CBIA 3A47A 3POCA 3ZM8A 3SUSA 1V08A 4M29A 3VPLA 1Q6CA 3ARVA 3S6TA 4BA0A 1GUVA 3WNMA 3GXDA 4JFSA 4PMVA 1EDGA 1KXVA 2YJQA 1CGTA 1L8NA 2OYKA 4JAWA 3AQUA 4U31A 1BHGA 2FHFA 3T2OA 3DECA 2VX4A 1MFVA 4M1RA 8A3HA 2ZUWA 2FGZA 1UHVA 2WHJA 1PBGA 1KGWA 1ZB5A 3BAJA 1VAHA 1U33A 5CPSA 4CU6A 4XUYA 3MANA 5CLTA 1MWOA 4CU7A 1LQ0A 2DDXA 3THCA 2DH3A 1RPKA 4LGXA 1GOIA 1OSEA 4ACZA 2D22A 4UOJA 1ZU8A 3OGSA 3W25A 1R86A 4JKKA 3VD5A 1HJXA 3ZOAA 3VIHA 3UEQA 3WDQA 2IXUA 3CHDA 1W3HA 3FXYA 2A3BA 2PF0A 3ARWA 1UKOA 4HZ7A 2GJRA 4W85A 4IPLA 2PWFA 2VNCA 3N04A 2CBJA 4JCMA 5A8NA 2FH6A 3WH5A 2OWCA 1P6WA 1UD4A 4UQ9A 3AS0A 1CXIA 1GQLA 3A3HA 3T0AA 4IM4A 3IJ8A 5ABHA 1W9PA 3VUPA 1TA3A 1E5JA 4WKFA 3THDA 4F66A 4MNKA 1M53A 1UZ1A 4W8AA 1CXLA 1GVYA 2JF7A 2OLHA 2XGIA 1BAGA 3TA9A 1DWAM 1A47A 1B31A 4PMNA 2EEXA 1V6UA 2J7FA 3BAYA 3AFBA 5IDIA 1J0ZA 4GZIA 2WHLA 2DSZA 4MB1A 4WF7A 1UKSA 4GI8A 1I1XA 5A1AA 3VGEA 2XIIA 5IXEA 2GK1B 3ZSTA 3A4WA 1E55A 4H04A 2EPNA 3IAPA 4OZOA 1XH1A 1FFRA 3L4WA 2Y5EA 4D6DA 3AIQA 1OGBA 4BZYA 4W7WA 3VM5A 2Y8VA 3MV01 4P8UA 1W9UA 2MANA 1JZ6A 1CNVA 2BVYA 1U2YA 3BLPX 2WCSA 1MXGA 1E70M 3T0BA 1UH2A 3BMVA 1W9BM 3L4UA 3A4XA 4AISA 3AROA 1XCXA 2CBUA 4D1JA 3DHPA 4RL3A 1JD7A 2J75A 1QHPA 2UY3A 5IHSA 2DIEA 4LYRA 2QF8A 5HBFA 3K4DA 4A3YA 2J7CA 4PBGA 4N0RA 3SCSA 3KZSA 3J7HA 1E6PA 3SCNA 1ZJBA 1RP8A 3CZKA 2E8YA 3AHVA 2G3JA 5IFTA 2ZUUA 4CN6A 2BV9A 3TTYA 1E0XA 4BQ4A 3S2CA 4JFUA 1WDSA 4D6GA 4CN4A 3II1A 1EHNA 4Y7EA 4MJ4A 4CGTA 1G94A 3I3DA 1MFUA 1KB3A 4MNMA 2FHBA 3W0KA 4CD6A 3FY1A 2YDSA 3AZRA 3FW6A 4CCCA 1CECA 5AC5A 1SYTA 2PWGA 2DT0A 3O9NA 1W91A 2WZIA 1VFUA 4FLSA 5HDRA 1JAKA 2F8QA 2A3EA 1XD1A 4DWSA 5GPRA 1D2KA 3CUJA 3I3EA 1UR0A 3PZ9A 1UR2A 3W81A 3WNLA 1XGZA 2VCCA 2YBTA 3OLDA 3WF2A 3T08A 5LYRA 4J7RA 3D3AA 3VDAA 1TCMA 2Z1KA 3TTQA 2VX6A 1J10A 3WD4A 4GZEA 1PIFA 2OSWA 5DF0A 2E8ZA 1QVBA 1VFFA 1GOQA 3MMUA 4E8CA 1V6XA 1NWTA 1JYXA 1ZS2A 7TAAA 1JZ5A 8CGTA 1XH0A 1ZBKA 4DWSD 1E40A 3MUY1 5DMYA 1EHAA 3MS8A 4OKDA 2PBGA 3CMJA 3PHAA 3GTNA 1BGGA 4MPKA 2WKGA 5ABFB 1BG4A 5E70A 3QGVA 2XYLA 4YPJA 5AC4A 3TTOA 5A8PA 2OYLA 3WH8A 1JNDA 2EPMX 4AC1X 3AMKA 3SURA 4YHGA 3MUZ1 1EDQA 4Z2HA 5C8BB 3L4XA 2BFGA 2XGBA 4J3XA 2QV4A 1MW0A 2YLLA 3I3BA 3ARSA 1B2YA 1NWUA 4AZGA 5DEZA 2IXVA 4W5UA 5CZKA 1BF2A 1LLOA 1QBAA 4ZXLA 2OYMA 1CXHA 1QI4A 3CUHA 4MDPA 1J11A 5FL0A 4E8DA 5I23A 2A3AA 4URIA 2YOCA 5I2UA 4D6HA 2V3FA 3WN6A 1PX8A 2WVTA 5HXMA 2ZX6A 1WDRA 3SUTA 3WNPA 1WZAA 1EA9C 1EH9A 1Q6FA 2D3LA 4AZ5A 1NM9A 3T09A 1ODUA 1HXJA 4AEFA 1UH4A 3T0DA 2ZX8A 2PWEA 3BAKA 1QI2A 1FA2A 2XM2A 3BAIA 7A3HA 4MB3A 3L2MA 1GNXA 1UR8A 3T2PA 3AXIA 4H8VA 3WNOA 3ZT7A 2EO7A 1E6RA 3UERA 2E4TA 2RGMA 3VINA 5A3HA 1DEDA 1H11A 5FL1A 1KXQA 2VZTA 3L4VA 2UWFA 3BAXA 2OWXA 4GI6A 3DYMA 5AYIA 4QLKA 3QHOA 1X1NA 2DSKA 3SIMA 4WJXA 4AD3A 5E6YA 1XHGA 3GYCA 2VJXA 2BXYA 1GPFA 2YDQA 3UCQA 3ZO9A 2WW5A 2XVGA 1J01A 1PPIA 5FOOA 1UA3A 3CZGA 2WB5A 1W3KA 4CD5A 2ZIDA 4AZBA 1HX0A 1AMYA 5A8MA 1LG1A 5CGMA 5CJ5A 3CHCA 1W32A 1E6ZA 2C0HA 2WVVB 4W88A 3NUKA 3VMOA 1OM0A 3W4RA 4JL1A 1B3ZA 4D6FA 3IJ9A 2WWCA 3AS2A 3GBDA 2VO5A 4LPCA 1NWSA 1W9DM 2WMFA 2OSYA 4B3KA 2VZSA 4ZEPA 3GH7A 1MW1A 3VGBA 4UFJA 3SEPA 5A6LA 5JBEA 3QOMA 4W8LA 4BS0A 1G01A 1OIFA 2W91A 2XVPA 2G41A 4AD4A 3VIOA 1FH9A 3VD4A 4TTUA 3WF4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2J62 A;  3KL3 A;  2DT1 A;  3W38 A;  2ESC A;  2W63 A;  1MW2 A;  3PZT A;  2BHY A;  3W29 A;  4W7V A;  4NRS A;  1E4M M;  1DTU A;  1C3F A;  2J79 A;  5D8Z A;  1BLI A;  1LG2 A;  5BYW A;  2JIW A;  3MSG A;  5HNN A;  4WK9 A;  3GXM A;  4H7V A;  2VZU A;  1B30 A;  2Y8K A;  1LF1 A;  1J0K A;  1WKY A;  4PMY A;  1B3V A;  1IZK A;  1EXP A;  1UA7 A;  4DUV A;  5M5D A;  4CCE A;  3ZSS A;  1EOM A;  2JEQ A;  2VRK A;  4QLJ A;  2DT2 A;  2BHU A;  3PZV A;  1BFN A;  1JZ3 A;  3SCR A;  2GJX B;  4UFI A;  1CDG A;  5A6J A;  4GIA A;  5A69 A;  1NP0 A;  1MVY A;  3AIW A;  3WH6 A;  4AYS A;  5CSU A;  9CGT A;  2VQU A;  4F8X A;  5CLW A;  1CLV A;  1KXH A;  3IK2 A;  2DT3 A;  2D20 A;  3NJ3 A;  1H0G A;  3CGT A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3IEB A;  1B3O A;  2GQA A;  1UR3 M;  4TOQ A;  2CKS A;  4BEQ A;  1QPR A;  3OVR A;  4GWE A;  3M0H A;  2JIE A;  2CC0 A;  3G1R A;  3NZP A;  4DJD A;  1XIM A;  2DQW A;  3CIX A;  3WD3 A;  1OF8 A;  2DSV A;  5G1M A;  3WDH A;  1NU5 A;  3QM3 A;  1SZR A;  3VMP A;  3WK1 A;  7CGT A;  2XSA A;  4CQA A;  4EPD C;  3S6D A;  4GPN A;  5J5D A;  4ZOC A;  4HT3 A;  5D32 A;  2HPI A;  1XYF A;  5EBA A;  4QE4 A;  3G18 A;  3N34 A;  2V5J A;  4K1G A;  1N1A A;  4AXN A;  3UZW A;  2Z4G A;  1PDZ A;  2Y85 A;  4ZXO A;  1UC5 A;  3B0P A;  5HW7 A;  3PBG A;  2WNW A;  2FPV A;  3EWU A;  3H4X A;  1ADD A;  3GX9 A;  1PUD A;  2IW0 A;  4O4V A;  1A3H A;  1F07 A;  1TPV A;  3KZP A;  2DFA A;  4KRZ A;  4FXF A;  4UC5 A;  3OG2 A;  1CB7 B;  2P50 A;  4AEE A;  4FAL A;  4KCU A;  2CLL A;  3CLW A;  4GUI A;  1ZL1 A;  4IJB A;  1JG9 A;  3W87 A;  2DUZ A;  5BMW A;  1FBA A;  1W1Y A;  3W88 A;  2R6O A;  4U2Z A;  5D03 A;  4HYV A;  5G4W A;  2Z1S A;  3CAW A;  4LT9 A;  3TYE A;  4DRS A;  1UD5 A;  1V3L A;  2BGN E;  3V5C A;  1WZL A;  1C8V A;  2J4G A;  2PWD A;  6PTD A; 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 2VZU A;  4GVI A;  4QM1 A;  4M5P A;  3HG3 A;  1PTA A;  2EGZ A;  1IZK A;  3HF3 A;  4JN8 A;  3LCX A;  3KAH A;  1PO9 A;  1S2C A;  5ENL A;  3ZSS A;  3Q2D A;  3EWD A;  1F2J A;  1Q45 A;  1JZ3 A;  2GJX B;  4ITZ A;  4ERG A;  1ME8 A;  5A6J A;  2PDQ A;  1MVY A;  1GWJ A;  3KAG A;  2VQU A;  1PKN A;  1EJW C;  1FWN A;  2C14 A;  3IK2 A;  4Y9N A;  4DZH A;  5LNU A;  4HHP A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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