1WB0A

Specificity and affinity of natural product cyclopentapeptide inhibitor argifin against human chitinase
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Specificity and Affinity of Natural Product Cyclopentapeptide Inhibitors Against Aspergillus Fumigatus, Human and Bacterial Chitinases
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITOTRIOSIDASE 1
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 128
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
A PF01607 CBM_14 Chitin binding Peritrophin-A domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1wb0A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1wb0A01
2GJPA 3DHUA 4W93A 2V3GA 4U3CA 4LGXA 2FH6A 3F5LA 3WNOA 3UG4A 3PZTA 1NQ6A 2WMIA 4IISA 1GZJA 3SEPA 4P8UA 4AZBA 1JAKA 3DHPA 2EPMX 4ZE5A 1JIBA 1KFWA 4AZGA 5E70A 4QCFA 2WMJA 3RMEA 3SUUA 3T09A 4KMQA 3MV01 2YA0A 2JEQA 1W9UA 5DF0A 5BCAA 2J7HA 5FL0A 2YDSA 2WMIB 1V02A 3BCDA 5AC5A 3PZIA 2D3LA 3SCUA 3U7BA 3ZT7A 2A3BA 2QMKA 3AS0A 5JBDA 4JKMA 1OD0A 2XUCA 4EKJA 2VX5A 4OKDA 3VD3A 1V6YA 4WIWA 4LYPA 1UYQA 4KH2A 1S46A 2DSKA 3BAYA 2WANA 1OGGA 1WCGA 1V02E 1W9VA 3F5JA 3VMNA 1IZJA 1UA3A 3BC9A 2CHOA 4PSPA 1W9PA 5D8WA 7CGTA 1UWTA 1RP9A 4MADA 4RE2A 3VNZA 3ZJ6A 2EO7A 1GQLA 1JXKA 2EPLX 3OGVA 2JALA 2EPNA 1YHTA 1CXHA 1Q4NX 1CIUA 2DIEA 3UERA 3AYRA 4YN5A 3VIOA 1PX8A 4H41A 3NCOA 3T08A 2DSWA 4A3YA 3SUVA 1QI4A 2CESA 1G1YA 1WB0A 1VB9A 3WD0A 1RH9A 2ZXDA 3A4XA 1HJWA 3AMKA 4UNIA 3SUTA 1VFOA 3RDKA 2CYGA 5D9NA 4D6EA 5E9AA 4JCMA 2WBGA 2V3FA 1U30A 3FN9A 1W2PA 1CXLA 2XIIA 1WZLA 4BCEA 3OBAA 3SCRA 1GOKA 1BLIA 1BTCA 2BV9A 2ZX8A 5A8NA 2WHMA 3G6MA 3GXFA 4EE9A 1GOWA 2VOTA 3B8SA 1ZB5A 1CNVA 2BY2A 4UZSA 2JFEX 5CQ1A 3FNDA 3L2LA 2WM0A 1LL7A 3SUWA 5CLTA 2E40A 2YL6A 3AXXA 2WWDA 1C90A 4NSBA 4XUYA 3WBEA 1OBAA 3WF3A 4N42A 1E72M 1OIMA 4BQ2A 1Z32X 1CGVA 3AMDA 3S6TA 3IANA 3WH5A 3GXMA 5A2AA 1JD9A 3WQ6A 1UR8A 3ARQA 2XWDA 2W63A 1JYWA 1KQYA 4JFSA 2QPSA 2VT0A 2E8YA 3IAPA 3VO0A 1OT2A 4GZIA 1V3KA 3BMVA 3WQWA 4PMDA 2YIHA 5AYIA 1MVYA 1UKOA 3AHZA 4QDMA 1HP5A 1UA7A 1TR1A 4PTVA 4A3HA 2MANA 1E3XA 1H0IA 1TG7A 1G0CA 2J7BA 3CIVA 4PCTA 2BHUA 1JG9A 4PMOA 2J7EA 3EDDA 5CSYA 1L0PA 2JF7A 4HP5A 3AIVA 1OM0A 5A6LA 2ZUMA 2DQXA 2XHYA 3RPMA 4BS0A 4W8BA 8A3HA 4YHEA 4C7DA 3ZQ9A 3TONA 4DWSD 1KCLA 2WW5A 4D6IA 4CGTA 2UWFA 3AIEA 1UZ4A 2BVTA 1FP9A 3WUBA 4CN6A 4DM1A 3PZMA 4XV0A 1E6PA 5A94A 4TVCA 2Y4SA 1QBAA 2D2OA 4HZ8A 1E73M 1XH2A 3ARRA 5HPCA 3ARWA 5A6MA 3UG5A 2WAGA 2BXYA 4B3LA 4GXPA 4GZJA 3RJYA 1JZ3A 1VJSA 1QHPA 3DYOA 3WQ8A 5IHSA 2CXGA 4KRUA 1KXVA 4HTYA 3EDFA 5E09A 4Z2LA 2FGLA 2E4TA 2XWEA 3VDAA 5IFTA 1C8XA 3ZJ7A 2E8ZA 5I3DA 4U3AA 1ESWA 1GOIA 3HU7A 2WKGA 3CTTA 2XYLA 4JL1A 1BHGA 4W7UA 3VGEA 1ISVA 1WO2A 3OIHA 4R5EA 4AEFA 3WSUA 1V3MA 2X2YA 2CPUA 2QPUA 2CKSA 2W5FA 2A3EA 1EHNA 1ECEA 2RGLA 3BAJA 1VJZA 1BF2A 5I23A 1KB3A 1Q6CA 1BYAA 3WEOA 2XFFA 3AYSA 1DP0A 2HVMA 2WMFA 4JL2A 3BAWA 4XB3A 3GZAA 4M82A 1OT1A 1QI5A 3PTQA 4YHGA 3ZJ8A 1E4MM 1QI0A 4AD0A 2DSUA 3L4XA 3IJ7A 3WD2A 2OSYA 2X0HA 3AHTA 1W3KA 2WCAA 3OLGA 3N04A 3TP4A 5AC4A 3BSHA 1IZKA 1OSEA 3MV11 1H41A 3VINA 4D6HA 1CXFA 1F4AA 1ISXA 2WXDM 5M03A 2VURA 1V0MA 3KL0A 5A1AA 1B2YA 1WNOA 2AAAA 4MDOA 1MWOA 3GH7A 3W27A 3ZR6A 5A95A 5D8ZA 3GM8A 1JAEA 3CHCA 4LXFA 4DWSC 3N1AA 3UETA 1GNXA 1WZAA 1W9XA 4HZ7A 3AIRA 4P7LA 4V2XA 1E1EA 4MB4A 1V6VA 1AVAA 3OZPA 1MW1A 3MUAA 1NWSA 1B3VA 4AD3A 4ATDA 1C3FA 1HKMA 5HXMA 1R7OA 3HMCA 2Z1KA 4QCEA 1KCKA 1CLXA 5DFAA 5JH8A 2VVSA 2YBTA 3ALGA 1BVNP 1R86A 3WMCA 3CHFA 1E40A 3N9KA 3PZQA 1U2YA 4GKLA 2OYMA 3I3BA 2WVTA 3CMJA 2VRQA 4P8VA 2DPEA 1G5AA 1E70M 1H3GA 1JZ4A 3AMLA 1IV8A 1J0YA 1GVYA 1DWHM 4UZUA 3M6DA 4HMEA 1J11A 3WL1A 2GJRA 4NRSA 1J0KA 3MSGA 2JEPA 1UD8A 5FCZA 5CGMA 3U7VA 1E5JA 1AMYA 4U2ZA 2DIJA 4W86A 4E8CA 2GK1A 4UOZA 4CUCA 1XCXA 2WB5A 2W67A 2G3JA 3VD7A 4ZE4A 1WDRA 1EQCA 3VGDA 2CETA 2IXVA 3AMCA 2TAAA 1QBBA 4RE3A 2V3EA 4X0NA 2YKKA 1FOBA 3TOPA 4HOXA 5A8OA 1LF1A 4NRRA 2WMHA 1ZBKA 1XV8A 2YLLA 4QLJA 5A6AA 1MW3A 5A6BD 2BVYA 1CPUA 1J0ZA 3VIIA 1FP8A 4FMVA 4WKAA 3OB8A 4QAWA 5JBEA 1MYRA 1BYDA 3VIKA 2EXOA 2VZSA 5A8MA 2ZUNA 1A3HA 2A3CA 1EO7A 5A8PA 3E1F1 1NOUA 2XVLA 2GK1B 4WKFA 2BFGA 3BCFA 1EGZA 3AOFA 1HN1A 2IXUA 3AISA 3OGSA 5HDRA 1UHVA 1JL8A 1FH9A 3WQ5A 1E0XA 2ZUUA 1G9HA 3OLDA 2NT0A 1I75A 3SCVA 2J78A 2VVNA 3WFZA 1E55A 1EO5A 1UOKA 1AQ0A 1PPIA 2WVUA 3RJXA 1ZJBA 5GNZA 3AS2A 4U5IA 2F2HA 1CLVA 3DYPA 2FGZA 2E9LA 3NUKA 4D71A 5CJ5A 3WF4A 2W91A 2VO5A 3GH5A 3BLKA 4KGJA 1TVPA 3WNNA 2XIBA 3LMYA 4CU8A 3IJ8A 1E9LA 3GNPA 1DWFM 2BNJA 3DC0A 2D0HA 4E2OA 1CBGA 1IT0A 4IUGA 4JZ5A 4V27A 3K46A 4HZ6A 2G3NA 4TTUA 4CN4A 4D6CA 5CSUA 3W6MA 1WZMA 3A3HA 3PZ9A 4F9DA 3RILA 4A4AA 3CH9A 1LWJA 4LQ1A 1JDCA 3EYPA 1L8NA 1B3YA 3GH4A 1V3IA 3AIQA 3LPFA 4ZENA 5LA0A 1D3CA 4RE4A 1SMAA 4TUFA 1NP0A 4HPGA 2OWCA 4UFKA 2VI0A 3BLPX 4AEEA 4IPNB 4EANA 2PWDA 3VGFA 1VFFA 1V08A 1W1TA 4Z2JA 4UR9A 3LPGA 1OGBA 1MQPA 1DHKA 2XSAA 4B16A 5I78A 1VEOA 4HA4A 1ZS2A 1QNRA 1X6NA 4BZYA 3N17A 1E6RA 4JHOA 5I79A 1M7XA 5C70A 3OZOA 3ARVA 4CD8A 3AS1A 1QW8A 2ZOXA 3W29A 3T0DA 1ZBVA 1UWQA 4W88A 3II1A 4S3KA 1U33A 4MAVA 1H1NA 2O9PA 3O9NA 2PB1A 1UR0A 2XJ7A 4JFWA 4W87A 1BG4A 3VDBA 2A3AA 2Q8XA 1V3JA 1UH2A 3VOCA 1NP2A 5A8QA 3WY1A 1WPCA 2NT1A 4E4PA 3ZR5A 1EOMA 4ZEPA 1CGWA 4D1JA 1ISYA 3WEZA 2W66A 3RO8A 2JF6A 4HMCA 3L4WA 5FKYA 4W84A 3ZMRA 4CCDA 1BGAA 2G4FA 1UWRA 2YL8A 2VQTA 2XVKA 3L4TA 1C92A 1US3A 2BS9A 3GTNA 1CGUA 1CGYA 2NSXA 4HMDA 1TVNA 1TZ7A 4DUVA 4GI6A 1R8LA 4W5ZA 2XM2A 3WMBA 1HF6A 3KWXA 5FOOA 4AD1A 2GDVA 3EMCA 3K4DA 4ZXOA 5DO8A 1D2KA 2WCGA 5E0CA 4LPCA 2WSPA 4W89A 1V03A 1JZ5A 1XSJA 3WELA 1J0JA 2FDMA 4KRTA 5EBAA 4D1IA 2DT2A 3WQVA 1V6UA 4M81A 5EFDA 1QHOA 3KL3A 4OBSA 1KWGA 3N18A 1W91A 4AYSA 1CGTA 2V5CA 1DWJM 1WKYA 4U33A 3WDIA 2GSJA 1FFQA 1GORA 4PMRA 5I6SA 2CKRA 3WF1A 4MNLA 1TMQA 1B30A 3QHOA 3BAXA 1JI2A 2WKLA 3UG3A 4GQQA 1B90A 3CLWA 1UG6A 3A4AA 1KR1A 1ODZA 1M53A 1JNEA 1JDAA 3FXYA 3RCNA 4Q22A 5CPQA 2ESCA 1QW9A 2X1IA 4GI8A 1HJVA 2CERA 2G3IA 4U5KA 3W4RA 3WDRA 5FIPA 3VX0A 1SYTA 5BRPA 5JIPA 1GJWA 4FF5A 3ALFA 1BQCA 1UQZA 2BY0A 4PN2A 4AW7A 1V3HA 1UR2A 4FLSA 1DEDA 5BXPA 3GBDA 5FD0A 3G6LA 3W24A 1Q6DA 4UFJA 1QI3A 1Y7VA 3L4VA 4OBRA 1GONA 1LLOA 3W0KA 4AIEA 2WMKA 1JZ8A 4B15A 4LX4A 2WPGA 4UQBA 4XZWA 6A3HA 5KEZA 2YBUA 3IJ9A 4TXEA 2UY4A 3RM9A 2C7FA 1NWRA 4QP0A 5IFPA 5ECUA 2WMGA 3WIJA 1XD1A 3OGRA 2PI6A 4L4OA 1F4HA 1XD0A 1GOQA 4WLCA 4ACYA 4UQEA 1B31A 1X1NA 2DEPA 5A2CA 2E3ZA 3NDZA 1PZ2A 4CD5A 2VCCA 4AZIA 5AY7A 3AHYA 2ZWZA 1CYGA 3FW6A 3VUPA 4P8WA 2WK2A 4S3JA 1UKSA 3VDHA 3WDPP 4AZ5A 3SCQA 1JF5A 1MQQA 1VENA 3NSXA 3WNMA 3FHAA 2B31A 2OWXA 2ZUWA 4FK9A 9CGTA 1KWKA 4HOWA 3L4UA 2YL5A 2YDQA 1HJUA 2F8QA 4OZOA 3SCPA 5E0FA 1J0HA 1W1VA 2D0GA 4HU8A 3ZM8A 3M46A 4GINA 4MJ4A 1XCWA 4D6GA 4W7WA 3WBAA 3MMWA 3CHEA 1QNQA 1GCYA 2VRJA 3OLIA 4J3VA 4PEEA 5KZ6A 1WP6A 5LA2A 4PMVA 3TTSA 1BSIA 2VZTA 1RP8A 2QV4A 5ABHA 2O9RA 1BG9A 3MUZ1 4DWSA 3O2LA 4DUXA 4QLKA 4J3SA 4HPHA 1D7FA 1K9EA 4TVUA 1CGXA 3N12A 1V6XA 3I3EA 3PHAA 3ZT6A 1ODUA 5DT5A 3MSDA 1KXTA 5M3WA 2VNCA 2WLYA 2UY3A 4CD4A 4F9JA 3T2OA 1VEMA 3RM8A 3NSNA 3ZOAA 3W37A 2G8ZA 3FY1A 2YL9A 3BH4A 1MW0A 4TOQA 4DWSB 4BQ3A 4JKKA 3WNLA 3THCA 1GW1A 3DECA 1CECA 5M17A 1TUXA 1MFVA 1UWIA 2JIWA 3EDEA 1TCMA 1UQYA 4QFUA 4UOJA 2V38A 1KQZA 4BA0A 1E4LA 1Q6GA 5GPRA 2BY1A 2J75A 4PBGA 2E0PA 3WNKA 4URIA 2OYLA 3QOKA 2D20A 4D6DA 1W3HA 1SMDA 4OOUA 3AZTA 5AYBA 3F5KA 6CGTA 4WSKA 4PTXA 4K68A 2EPOA 2QMJA 3GBEA 4AD4A 3WD1A 5EFFA 3WH7A 2CHNA 1JYVA 1TE1A 2JIEA 1UR9A 3CZLA 4MAZA 3DYMA 1VRXA 1XYFA 1GJUA 3CZKA 2G3MA 4GIAA 3APGA 1TA3A 3CZJA 1UR1A 2VQUA 3CUJA 2FHCA 4WK9A 3ARTA 1V0KA 5E6YA 3SCSA 5HBFA 3ZSSA 1E43A 4UQ9A 1B3WA 3UESA 3SIMA 2GUYA 3AQUA 2D23A 3GXDA 1DWIM 3MU7A 5TD4A 1LG1A 1JZ6A 2J8GA 3PZUA 1E6ZA 5EMYA 3EBVA 5GQBA 4OUEA 1NOWA 4HU0A 2W61A 2Y24A 4AZHA 1JFXA 1TA3B 1R7AA 4NZCA 2EPKX 2VX7A 2J7FA 1C7SA 3EMZA 4Z2IA 1V3LA 3VPLA 1FA2A 1VFMA 1CZ1A 4PRWA 1EOKA 2XG9A 2X05A 3VGHA 3WF2A 3U5YA 5BXSA 4CU7A 3AS3A 3VMPA 1GQJA 2PWHA 1N82A 2J25A 1VF8A 4JIEA 3A47A 3CUIA 1BGGA 3CO4A 4Q7NA 3JUGA 2YLAA 4GO9A 1GHSA 2GDUA 2XFYA 1WAWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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