1ZBWA

Crystal structure of the complex formed between signalling protein from goat mammary gland (spg-40) and a tripeptide trp-pro-trp at 2.8a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSKIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTALVKEMKAEFAREAQAGTERLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFRGNSDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDVGAPISGPGIPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLARV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the complex formed between signalling protein from goat mammary gland (SPG-40) and a tripeptide Trp-Pro-Trp at 2.8A resolution
rcsb
molecule tags Signalling protein
molecule keywords Chitinase-3 like protein 1
total genus 117
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1zbwA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1zbwA01
2YDSA 4CGTA 2YL6A 3GXFA 3KL3A 1YHTA 3JUGA 5ECUA 1B3VA 2W63A 3EDKA 2OSWA 1MWOA 2W4XA 3AIWA 3W6MA 1E6SM 2XYLA 3GNOA 4OZOA 1E4LA 4V28A 4HZ8A 1R85A 1KQZA 3CIVA 4F79A 2YL5A 3WNNA 1NH6A 1H09A 4W7UA 5D9NA 1CLXA 1B30A 2TAAA 2JEQA 2ZX7A 1UKTA 3CHEA 2A3HA 4Q7NA 2CIPA 1V6UA 4GPNA 2J79A 4PMVA 2VC9A 2DSUA 1LG2A 1TA3B 2X05A 3K8MA 3QHMA 4DUWA 2VCBA 3TTSA 3WNOA 2D20A 1WAWA 3OBAA 2YA0A 2DPEA 1ITXA 1EA9C 4ZE5A 2QPUA 1E1FA 1M03A 1QPKA 1KXQA 1HKMA 1XCXA 4Q22A 3AIUA 3ECQA 5CXPA 4WSJA 4GQQA 3AS1A 3L2LA 3CTTA 3BH4A 3ARQA 1LL6A 2W92A 4BS0A 2J7CA 3WH5A 2CCRA 3ZM8A 2EPOA 4IM4A 2UY5A 2Y8KA 3WL1A 1W2PA 1OCQA 4GI9A 3W29A 5EMYA 1VEPA 2D0FA 4E8DA 2WMHA 3SCWA 5CG0A 1PX4A 1G01A 1VFOA 4PMXA 2QHAA 4JL2A 1ISYA 5FD0A 2IXUA 3WIJA 2JIWA 1DWGM 1A3HA 1HX0A 2FH8A 3ZR6A 2YBTA 2CESA 4D1JA 2WC7A 5GPRA 1BYCA 1TG7A 2QLYA 2VMFA 3W26A 2AMGA 3AMCA 3WF1A 2FGLA 2YDQA 1B3XA 3N13A 4DWSB 4V27A 4AZCB 4WKAA 1CBGA 2JFEX 5IFTA 2CPUA 3M07A 3A6OA 1KQYA 2BXYA 3WDRA 1PZ3A 1GVIA 3WENA 4JIEA 2NT0A 1JDAA 1PIGA 2CITA 1W9XA 2GSJA 3BMWA 3I3BA 1BYBA 1CZ1A 1VJZA 3WF3A 4XZBA 2WVSA 4AMCA 3SCPA 1UD6A 1QHPA 5CLWA 1UD2A 1EH9A 1UOKA 2JF6A 3OLIA 3W38A 3AHZA 1KGUA 3UR8A 1JF5A 3TTYA 1CGXA 3K4AA 3SUTA 1NP0A 4M29A 1XSIA 4HMEA 2YA2A 1W1VA 3VIKA 2YA1A 1LJYA 4IPNB 1NP2A 1QNOA 1CGYA 2XHYA 1JF6A 1P6WA 1BVZA 1UA7A 1VF8A 2DT2A 3F5JA 1C91A 1Z32X 1GONA 3K8KA 4D6FA 3IANA 1XYZA 3ALGA 2JEPA 1OIFA 1LL7A 2WSKA 4H8HA 3ARYA 3PZTA 2XGBA 2ZOXA 4BQ4A 4UQBA 5BCAA 2RGLA 5BYWA 1BG4A 3VVGA 5BXPA 1JNDA 3CHCA 2VR4A 1K9FA 2J8GA 5HPCA 2O92A 2EPLX 2DSZA 1JDCA 1JZ8A 4QDMA 2VR5A 1B0IA 1CGTA 3T08A 2WWCA 1JGIA 4ACYA 3GH5A 1C8QA 1HL8A 4UQDA 3ZSSA 2WBGA 1UR4A 5D9OA 1H4PA 4QAWA 1UKSA 1WZAA 3NJ3A 2VT0A 3CUGA 2A3BA 1J0YA 3RILA 2GDVA 1LF1A 2PBOA 1NWRA 5CPQA 3FAWA 2DIEA 3PZNA 4N42A 4P7NA 4D6DA 2DSWA 3BAWA 3SEPA 3N15A 3VIFA 1CGUA 1U33A 1GNXA 4PN2A 3GH4A 3NDZA 1BYDA 2G3IA 3ARTA 4WIWA 5ABFA 5A6AA 4DWSD 2EXOA 3PTQA 3I3DA 4AD4A 4BZYA 4JFWA 3LPPA 4XZWA 3B9DA 4H8VA 1OB0A 2XVLA 3VGBA 3SCSA 3SUSA 1E70M 2O9OA 2VZUA 2AAAA 4YHGA 4H41A 4WF7A 4KRUA 5BXSA 4A3HA 2OWWA 4WJXA 2J7EA 2V3EA 1E40A 1GQKA 2GJXB 2J7HA 3VPLA 1VBUA 2WAGA 1BTCA 4M81A 3M7SA 1WDRA 2VVNA 4D71A 1DWIM 3WF4A 1Q6EA 1H11A 2JF7A 3BC9A 3VMPA 5FKYA 1QW8A 1HIZA 3L4YA 3BXWA 2XJ7A 4Z2IA 4UCFA 2WMJA 4HA3A 3O6AA 1FH7A 3VU2A 2DSKA 5JH8A 2PI6A 2ZIDA 4GI6A 1HP5A 1LLOA 3W81A 2YBUA 1V3IA 1UR8A 3SCTA 3GXIA 3THCA 2Z1SA 3PZGA 1K9DA 4QP0A 3NCOA 1HL9A 2CBJA 3NYDA 1C3FA 5I23A 3ZQ9A 1OINA 3WH6A 4GZJA 4W8AA 1CXEA 4NSBA 1U30A 4DWSA 3PBGA 3HMCA 2WPGA 4PMRA 1O6IA 4NRSA 2VRKA 2PWDA 3W6LA 1JIBA 1EDGA 2YIHA 1B1YA 4UZSA 3FAXA 1GHSA 3OIHA 2FHCA 1JL8A 1FP9A 2GUYA 1PEZA 4RE4A 1QHOA 1X6NA 4UFIA 5M5DA 1B90A 3FW6A 1NOFA 4UOJA 4B3LA 3WQ5A 4R27A 1SMDA 3EYPA 1IZJA 4CKQA 3WQ8A 1HP4A 3GZAA 3VMOA 4E2OA 1G9HA 1CPUA 4FK9A 3OZPA 1DWJM 3OLDA 3ZOAA 3WUGA 1DTUA 2PF0A 1KGXA 4GO9A 5A1AA 5M17A 3U5UA 3UCQA 1QI5A 5CGMA 4OUEA 4B3KA 3KWXA 2V38A 1VJSA 1B3YA 3VD7A 4J27A 1GJWA 2PWFA 4JCMA 3AMLA 4PMZA 3PZ9A 3SURA 3RIKA 3WF0A 3WDHA 5F7UA 2J4GA 5IHRA 3N1AA 5I79A 1W9DM 4W5ZA 3CHDA 4CD4A 1Q6DA 1QNQA 3IJ9A 1UG6A 1FOBA 3T2PA 4XX6A 1L8NA 2XWDA 3PZOA 1OD8A 2DQXA 2Y5EA 3E1F1 3L4WA 1TCMA 1V3JA 1TVNA 5A8NA 1GW1A 3J7HA 3VDCA 4L4PA 3EDFA 5A2BA 4J3WA 1ODUA 2Y2WA 1DEDA 4E8CA 3LPOA 2Y8VA 3AZRA 2DT3A 1XD0A 3WY1A 3W4RA 2WWDA 5I3DA 2X1IA 4UR9A 3ZSTA 1H0IA 3POHA 5E70A 2DT0A 3AIRA 3PZIA 4CU6A 4AY1A 3WUFA 4P8UA 5A2CA 1H49A 2ZUNA 1OBAA 4Y7EA 1IZKA 1X1NA 2W62A 1B9ZA 5KZ6A 3VTRA 4HA1A 2VUYA 3NIYA 4ZXLA 3VGGA 4AIUA 1CXIA 4KMQA 5LYRA 1KWKA 3WKZA 1W91A 4ACZB 2DT1A 1UWIA 3PHAA 4ATDA 1K6AA 2IUZA 5AYIA 5JBDA 2BNJA 2UY4A 1G94A 3N9KA 1SYTA 4PMNA 3ZT7A 5IXEA 1D7FA 4LQ1A 2GJXA 1GOOA 3AI0A 2J25A 1V0MA 4P7QA 4GO8A 4JL1A 3VGHA 1M53A 4AW7A 1V0LA 2PWHA 2V3DA 2G41A 3CBWA 2BHUA 2CBUA 2CKRA 3LMYA 1FHDA 4B15A 1TFVA 4JHOA 1E0XA 2V5DA 4MNJA 1R8LA 1W9PA 2XSBA 3L4ZA 1C8YA 1V08A 3PZVA 2E9BA 3CH9A 3DHUA 2YDRA 5HNNA 2YKKA 4P7OA 4D6EA 3AIBA 6CGTA 1PZ2A 3VD4A 3KL5A 3AMKA 3WQWA 2UWFA 4HU8A 2D0HA 4JHZA 4HTYA 5CSUA 1ZB5A 1SR0A 5BRPA 1MXGA 1J0IA 2J7GA 4CN4A 3AQUA 3W0KA 4B9ZA 1W3LA 4LYRA 2J8FA 5TD4A 4PTVA 2DDXA 3TP4A 3T0AA 5ABEA 1HJUA 4MJ2A 4JCLA 3WEZA 2EPKX 4CU8A 3MS8A 3MSGA 3AZTA 4CD8A 1MFUA 4FLSA 2BV9A 5A6KA 3VX0A 4TX6A 1XV8A 1W1PA 3N04A 1JXJA 5IFPA 1E6ZA 1J9YA 1UQYA 4GZIA 2OYKA 3RCNA 2VZTA 3BMVA 4CN6A 4PMDA 3A4AA 5A8QA 1VBRA 1UYQA 1JD9A 3GNPA 3RM9A 3VOCA 1M7XA 2XM2A 2DH2A 4XUYA 3WDQA 5DT7A 5GNZA 4BF7A 4W87A 5GQBA 4W93A 2DGAA 2VQTA 1C90A 2D24A 3MANA 3ZR5A 1QW9A 3CUHA 3WMSA 5A6LA 3SUVA 4CU7A 3VD9A 1ZU8A 3RM4A 5AC5A 1UR2A 1CEOA 4UZUA 3MMDA 4HP5A 3KL0A 2JALA 4W7VA 1EQPA 2CNCA 1JAKA 2A3EA 2VTFA 1JYVA 4MNKA 3VDHA 3VIOA 3BAIA 1JAEA 4PRWA 3SCNA 3A3HA 4UFKA 1H2JA 1IT0A 3UR7A 5BXRA 1QI2A 1WZKA 2GK1B 6TAAA 1WDPA 1OD0A 2WHJA 1HN1A 1ZBWA 3WH9A 1HJQA 2OWXA 2XVPA 3WELA 1US2A 3CGTA 1EOMA 1W9VA 4WSKA 4ZENA 4D1IA 1JZ6A 2FDMA 1V6XA 3MV11 1H1NA 1OGSA 3IK2A 3M6DA 1V02A 1KWGA 3DYPA 1GQLA 1YQ2A 1B31A 4RE3A 5FIPA 1JYNA 2WZIA 4CD6A 3WH7A 4OIFA 2E3ZA 3A47A 3OGVA 2QMJA 3SCQA 1XD1A 2X0HA 2BFGA 2F61A 3CZ8A 3ARXA 1L0PA 2QMKA 4BCEA 1F4HA 7CGTA 3U7VA 3SIMA 4AC1X 1QI3A 3MUIA 2WMIA 4HZ6A 4PMQA 1UD8A 1MW0A 2XUCA 4QLLA 2NW0A 1GOWA 3IJ7A 3RDKA 3F5KA 2E9MA 1XH1A 1V02E 4J3UA 3CZKA 3VIIA 1VEMA 4P8XA 3AHVA 4W88A 1BLIA 3VINA 4PUDA 4JAWA 2ZXBA 3HU7A 4WKFA 4PTWA 4TVDA 1E73M 2X2YA 3M46A 1TMQA 3AFBA 1GOIA 1KXTA 1JI1A 1MW3A 1KBKA 5A69A 1OT1A 1XC6A 4B9YA 1JFHA 5BRQA 3U57A 4ACZA 3EMCA 3TONA 1WZLA 4JKLA 1PBGA 1HNYA 1GPFA 3RJXA 3WH8A 2UY3A 4QLJA 2NT1A 4D6HA 4H04A 1GVYA 1M04A 3WBAA 3T2OA 3VD5A 1E55A 4H8UA 4AZ5A 5I78A 3BLKA 4AZ7A 1E71M 1ITCA 1BG9A 3NSNA 3WDIA 5LA0A 4UNIA 2YL8A 4LXFA 3BGAA 4XB3A 5AC4A 3MO4A 1VAHA 5D8ZA 3PZUA 4CCEA 4WKHA 4LYQA 2J7BA 1ZS2A 3UEQA 4Z2HA 2ZUVA 3WL0A 4P7RA 3EMZA 2CHNA 2OYLA 1UWSA 4HOZA 3FHAA 3WD2A 3CZLA 4TUFA 4NZCA 5EB8A 3WEMA 5FL1A 2RGMA 3VGEA 2V3GA 1UWUA 1ECEA 1MXDA 4PMYA 2VQUA 5HXMA 3K1DA 3WSUA 3GYCA 5CLTA 4DM2A 1E72M 1V3HA 2O9RA 1F4AA 3HJEA 2D2OA 4PMUA 4MTVA 1W9BM 1D3CA 1BAGA 1EQCA 4M56A 1OGBA 1MW2A 2WSPA 1LQ0A 1WB0A 3W24A 4QCFA 1JZ4A 2WMFA 5CSYA 1WDSA 1N82A 3LPFA 2YLAA 1NOUA 3N17A 4U5IA 1AQ0A 3GDBA 3GTNA 4RL3A 1K9EA 4DUXA 3ZMRA 3CUJA 2QF8A 4HZ7A 3WD0A 2XVKA 1SMAA 1E3ZA 4W7WA 3SUWA 1TA3A 3CZEA 4GIAA 5KEZA 3UETA 4MNLA 7A3HA 2YOCA 5A94A 4UFHA 1FA2A 3BAXA 2D0GA 4TVUA 1QI0A 4YN5A 2B31A 2BHYA 5CPTA 1J18A 2PWEA 4N0RA 4J3SA 2YLLA 1GOKA 1U2YA 1RD6A 4PYSA 5CPSA 1XSJA 4F9DA 2W91A 3L4UA 5C70A 1BGGA 2CHOA 4MB1A 3AJ7A 4J7RA 1NM9A 2VI0A 2XWEA 3NSMA 3VM5A 1HKJA 2GK1A 1B3ZA 1XHGA 4QLKA 1BGAA 3WD4A 5FCZA 4EE9A 2ZX5A 1W1YA 1H5VA 4MAZA 1DWHM 2OYMA 1HF6A 1EHAA 3WNMA 3G6LA 3OLEA 3VD3A 4PSPA 2OWCA 2WM0A 5A2AA 4IPLA 3ARPA 1KBBA 1R7AA 4PEEA 1UR9A 1UH2A 1OGGA 4HOWA 3B9AA 2G3NA 5AYBA 4X0NA 4JKKA 2Z1KA 4LPCA 4D6IA 4F8XA 1TUXA 1QBAA 2BVTA 4FLQA 3K4DA 4AZCA 1MW1A 3RM8A 1ISXA 1E1EA 3ARRA 1EXPA 4V2XA 4MB4A 1VB9A 1TZ7A 1KCLA 4H7VA 1V0NA 5HOSA 1ZJBA 2C0HA 2E0PA 4PCTA 3L2MA 1NWSA 3HN3A 1FH8A 1VRXA 1Y7VA 2WHKA 3U5YA 3MKKA 4EK7A 1UR0A 4A3YA 2E4TA 3BSGA 3OGRA 4OOZA 3WFLA 3CMJA 4U2YA 3WUEA 4AZ6A 1NOWA 3VNYA 5A6MA 3WDPP 3WQVA 1GQIA 5CZKA 3OA5A 4JFTA 1CWYA 1GORA 3AS2A 1WKYA 2V5CA 3DECA 1OT2A 4ZE4A 1US3A 3WDJA 1MQQA 4CD5A 4AZIA 3AYSA 4PCSA 1J0ZA 2CKSA 4UTFA 1E4IA 5M3WA 3SUUA 2XVNA 4DWSC 1C7SA 4PSRA 2XFFA 1JYWA 2XPKA 2WHMA 5CGTA 4U31A 3FN9A 1J01A 2ZX8A 5BROA 1UWQA 1UHVA 2OSXA 3QOKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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