1ZL1A

Crystal structure of the complex of signalling protein from sheep (sps-40) with a designed peptide trp-his-trp reveals significance of asn79 and trp191 in the complex formation
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFAGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDVGAPVSGPGVPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the complex of signalling protein from sheep (SPS-40) with a designed peptide Trp-His-Trp reveals significance of Asn79 and Trp191 in the complex formation
rcsb
molecule keywords Chitinase-3 like protein 1
molecule tags Signaling protein
total genus 115
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1zl1A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1zl1A01
3ARVA 1FOBA 5BRQA 1HJWA 5BXPA 1BGAA 5A8OA 3THCA 2VJXA 1EDTA 3CZLA 3BAWA 3ZSTA 3PZTA 2UWFA 2BY3A 4U2YA 1UHVA 3ZR6A 1ZBVA 1V0KA 2FGLA 3MS8A 1OIMA 1TG7A 5HPCA 4PN2A 4UFLA 1UWUA 3SCQA 2XIIA 1KB3A 1E73M 4HP5A 3W38A 1YHTA 2E9MA 4HA3A 2WVSA 1E1EA 3AOFA 4UCFA 4NZCA 1DWHM 2CYGA 3WDIA 2QV4A 3NIYA 4DM2A 3S6TA 1V0MA 2A3CA 3VD4A 3FHAA 1QBAA 1UZ4A 4JKLA 1NP0A 5E0CA 1GW1A 2J62A 3L2MA 3EDKA 2YL5A 3WNPA 4W7VA 1LF1A 5DFAA 2GVYA 4GI6A 4E8DA 4UZSA 3FXYA 4UOQA 3VD7A 1DP0A 3VIKA 1K9FA 2VZVA 1B3WA 1QNOA 1N82A 3UEQA 1E6RA 1GQLA 2FDMA 3A4WA 2J7DA 5BXTA 3WL1A 5A69A 4WKHA 3WQWA 4GI8A 4BS0A 3SURA 2ZICA 4UFKA 2BFGA 3AXIA 2WMFA 1DWJM 3DYMA 3AHZA 5GNYA 1JG9A 4HA4A 3DC0A 2Y24A 2G3IA 2Y8KA 2VR5A 2CHOA 4HU0A 4CD7A 1DWIM 4AD0A 4TX6A 3WQ5A 3CBWA 5DT7A 1CGTA 4LX4A 1E5JA 3WDQA 4UR9A 1QI5A 3W81A 3GBEA 1OB0A 5A6SA 4GKLA 3VUPA 2EBNA 1FA2A 2WC4A 1DWGM 1EGZA 4R27A 3WBAA 4H8UA 3AXXA 3MMUA 3BC9A 1E6NA 2VQUA 3L4UA 2YA1A 3HU7A 3MUY1 3IK2A 2WHKA 3UG5A 1W3JA 4YN5A 4AZGA 2CBUA 2VVNA 4M81A 5A8PA 1LL7A 5JIPA 1J0JA 5DF0A 1V6XA 5CZKA 2WW5A 4F8XA 2W66A 2J8FA 2VOTA 1H09A 1JIBA 1E15A 4ML4A 4M1RA 4CN4A 2Y5EA 4BQ4A 4D6FA 2G8ZA 1EA9C 4OBRA 4K68A 3SCVA 3WN6A 5A6AA 1J0HA 1CIUA 3ZIZA 2E8ZA 3OZOA 1UOKA 5CXPA 3AMDA 1W2PA 2BXZA 1KR0A 1V3IA 4AD2A 2WZIA 3SCWA 4LPCA 4AZCB 1F4AA 2JF7A 3SCNA 1US3A 4CU6A 1TZ7A 4UQBA 4FLOA 1E0VA 1JFHA 1GOOA 1VJSA 4MJ2A 3VGDA 1UQYA 3WEOA 1HJQA 1ODZA 4PTMA 4J3XA 1IZKA 4HMEA 1XD0A 4BF7A 2XIBA 3VD9A 4LYQA 3TTYA 1XC6A 1ZJBA 2YIHA 4PCTA 1UKQA 3PZIA 1EIBA 4P7QA 4PMUA 1W32A 3B9EA 4LXFA 5BCAA 1J18A 3GNRA 2DQXA 3CIVA 3WNNA 4AIEA 1RPKA 4E8CA 3K1DA 1E5NA 4AEEA 1H41A 2V5DA 2IUZA 1E55A 1ISXA 1KGUA 1PIFA 4MDPA 2GJXB 1E0XA 2D0HA 1ISVA 3ECQA 5I0DA 4PUDA 3KL0A 4AD3A 3CUGA 4TUFA 3BGAA 3U7VA 1VF8A 3AQUA 4WIWA 2WZHA 3VOCA 3FAXA 2UY3A 1E56A 2ZWYA 5I5RA 3AIWA 1MW0A 1U33A 4UFHA 5CGMA 2VT0A 3JUGA 1M7XA 1BVNP 1XRVA 3ZJKA 1NH6A 4OOUA 3SUVA 4HPGA 3EYPA 5D4YA 4H8HA 3ZQ9A 2XSBA 2DT3A 4P8WA 1SYTA 1VFFA 4DUWA 1TFVA 3WH7A 5A2BA 3DYPA 2VQTA 5E0FA 5ABFA 1KWKA 2AAAA 2F61A 1OSEA 1Y7VA 1QI2A 4MB4A 4M56A 4Z2JA 2G3NA 5C8BB 4PMXA 3MU7A 3W82A 1BG9A 2J7GA 4GPNA 4P8XA 3GZAA 3IAQA 1VRXA 3F5JA 3AMCA 3VMPA 3VIGA 4CCCA 4UOZA 2GDVA 3LPGA 1MFUA 2JFEX 1JYVA 3EMZA 4PTVA 2G4FA 5LA2A 3RCNA 1NWSA 2X0HA 3HJEA 1JFXA 2Z1KA 3SCUA 2ZXDA 3ZJ7A 2FH6A 2WXDM 1BAGA 3ZMRA 3CHFA 1W2VA 2OSXA 3WUFA 1JYXA 4W7UA 2XVLA 4U31A 4AEFA 1WZAA 2J79A 3PZGA 2VNCA 2FHCA 3NSXA 1XGZA 1YQ2A 1VEMA 3CH9A 4UFJA 5A6JA 4D72A 2E4TA 1TVPA 3VDCA 1V02A 1J10A 1R8LA 1ISZA 4W8BA 1BGGA 3RM4A 1HP5A 8A3HA 7TAAA 3G6LA 3WUGA 2FGZA 3WY1A 3VIFA 2AMGA 4DM1A 5AYBA 3N15A 4D6CA 1CXKA 4PTXA 2VCBA 2JEQA 3CO4A 1UD5A 2E0PA 3AHXA 3WF3A 3ARRA 3CZ8A 1BQCA 2Z1SA 2V3FA 4BCEA 3ARQA 2EPNA 5A6BA 2DIJA 3O9NA 5ABEA 1W3LA 4F9DA 3IJ9A 1HJXA 3LPOA 4ZE4A 4QLKA 3GTNA 3N04A 1I75A 4LYPA 2RGMA 5CPQA 3VNZA 1W91A 2WC3A 5M3WA 3FY1A 4U3AA 1BLIA 4IPNB 3N11A 3U5UA 3WF1A 4LQ1A 3W4RA 4PBGA 3GH4A 2OWCA 3SCPA 2ZX5A 2CBVA 5JBEA 1CZ1A 5I23A 5E9AA 3W6LA 4D6HA 3VMNA 5LA0A 3D5HA 3L4VA 5I77A 2CBIA 4EKJA 4JL2A 1GJWA 4PYSA 4X9YA 7A3HA 5FCZA 4L4PA 5CSYA 1FP8A 4DWSD 1WDPA 4FLQA 4PSRA 3MKKA 3KEHA 4PUEA 1TCMA 4OJYA 1JDDA 3N17A 5EFDA 1HJSA 4W5UA 2A3EA 1DEDA 1GUVA 2ESCA 1GORA 2BVYA 1V02E 4JFWA 2ZXBA 5AC5A 5DEZA 4B3LA 1R87A 1VFMA 4PMNA 1HJVA 2WVTA 2MANA 4PMOA 3AXHA 4W87A 3WEZA 3KE0A 5HDRA 3WL0A 2E3ZA 2WVUA 2AOSA 1UH3A 4JFUA 1GHRA 4YHEA 2VCAA 3RILA 1H0IA 2WAGA 3CUHA 4QLJA 4CVUA 4ZXLA 3ZJ8A 4MNMA 4GXPA 2XM1A 4ACZA 4KWUA 3GBDA 1OCQA 1WPCA 2YA2A 4C7DA 1QI3A 2DSZA 2EQDA 2J75A 1QW9A 1TMQA 3MV01 4N42A 3AI0A 5I79A 3NDYA 3AZRA 2C7FA 2J25A 1GOKA 1EO7A 3POHA 5D9PA 4AZBA 4B15A 1AVAA 1WZKA 2ZOXA 3TONA 2VUYA 5A8NA 3OLIA 5GQBA 1TA3B 3AHYA 3K8LA 1HP4A 3W26A 2EPLX 1FFRA 4AW7A 1C8YA 4WKAA 4JFTA 1B30A 1UZ1A 5HXMA 1CGXA 1JDAA 2BNJA 3O6AA 4TOQA 1KWGA 5A6MA 2A3BA 2JALA 2J7BA 1AQMA 5D8WA 3WFZA 4M8UA 2WKLA 4D1JA 4QCEA 1OGBA 1JZ8A 1GONA 4HZ7A 2V5CA 1B3ZA 4HOZA 1CPUA 1JF6A 1XH2A 1H2JA 1SMDA 1Z32X 2VURA 3VM7A 4JAWA 5CSUA 4P7NA 1C8XA 1KGWA 3EDDA 3VM5A 3W24A 4C7FA 3PZVA 4U5KA 1QHZA 2XSAA 4WSJA 4CGTA 1EO5A 2D1ZA 2YLAA 3VIPA 3W6MA 2J8GA 5IFTA 3UESA 3BAKA 1WKYA 2X2YA 5CG0A 1CGVA 1K9TA 5DT5A 4UOJA 4AC1X 4IUGA 1RP8A 3VIJA 3ARXA 1CGUA 2RGLA 3WH9A 1V08A 5D9OA 9CGTA 5ECUA 4EK7A 4V28A 3KZSA 3QHNA 1UH2A 3BAJA 3CMGA 3FW6A 3N12A 1UA3A 1NM9A 1CXLA 2GJRA 4JCMA 5EMYA 1H5VA 3K4DA 1JZ4A 1WNOA 1QNQA 1LG2A 3NDZA 1OD8A 4LYRA 1W9VA 2WVVA 3AMGA 1GJUA 1LWHA 1V6VA 2YOCA 2VC9A 1KFWA 4XZWA 4OIFA 3TP4A 2WNWA 2PI6A 4MPKA 3OGRA 1HVQA 2WM0A 2O92A 4FK9A 3BXWA 5M03A 3AICA 1HN1A 3T2OA 1EDGA 1Q4NX 4X0NA 4OBSA 3WH5A 1WB0A 3CGTA 1KR1A 3AMKA 5E09A 1E6XM 3N13A 2WLZA 4KH2A 3FHQA 1ECEA 4D6JA 1UA7A 5KZ6A 1EOMA 1UR0A 5I6SA 2F8QA 1V3LA 1CECA 2WCAA 1PEZA 4DWSA 3VPLA 1HXJA 2YL6A 4IM4A 4MB3A 1UD3A 1E1FA 2XJ7A 2J47A 4S3JA 3SCOA 3PZ9A 2YDQA 2EXOA 2VX5A 1R7OA 1F4HA 4N0RA 4HZ8A 1HVXA 4H8VA 2ZIDA 1HKKA 3MSGA 3N9KA 3WUEA 2ZUUA 4PMVA 1E71M 5CLTA 4UFMA 3GYCA 1UWRA 2BV9A 3VGBA 4P7LA 2ZX9A 6A3HA 1FFQA 2DH3A 3II1A 2WHMA 2YL9A 3F5LA 1E72M 2XVKA 3M46A 4J3VA 2PF0A 1GOQA 6CGTA 3AHTA 1UWQA 2JEPA 1ODUA 2PWDA 3W27A 1MQPA 2OLHA 1ZJAA 5CPSA 2WANA 3ARTA 1K9EA 1E6ZA 1IT0A 3L2LA 2WBGA 4GO8A 1QHPA 3B8SA 4ZE5A 3AS0A 1B3VA 1B1YA 5I78A 4PEEA 3T0BA 4GQQA 2VL4A 2QF8A 1VJZA 2WC7A 1E4MM 1BYBA 1Q6GA 1CNVA 1QPKA 2D0GA 1JGIA 2BY1A 1D2KA 5CQ1A 4PMZA 4WLCA 1QOXA 1X1NA 1PAMA 1JYWA 2DH2A 1W1YA 4HTYA 1O7AA 3GM8A 4AISA 4J3UA 5CPTA 4JL1A 1UD8A 4C7GA 2QLYA 4ATLA 3E1F1 3WD1A 4TVUA 4UQEA 4J28A 2VRKA 3OLDA 3NSNA 4CCDA 2PBOA 4PMRA 1E70M 2YDSA 3VO0A 3KL3A 2ZE0A 3OB8A 4J3TA 4AIUA 1JZ3A 2EPKX 3SEPA 1J01A 3L4YA 5AYIA 5E6YA 1UKPA 1JL8A 4PMDA 3S2CA 3WNMA 3ZSSA 1CEOA 1CBGA 4J27A 3TOPA 1G01A 2VX6A 2OWXA 2CERA 3EMQA 3BCDA 3CTTA 2QMJA 1G0CA 4D1IA 1P6WA 4EE9A 2E8YA 1NWTA 3MUZ1 2BY2A 3PBGA 3K4AA 4A4AA 1XSJA 1L8NA 5LA1A 1BPLB 4TXEA 1PJ9A 1WP6A 2YBUA 4DWSC 2NSXA 3U5YA 3NJ3A 3BAYA 3AISA 2NW0A 5CLWA 2ZXQA 2XFRA 1WAWA 3G6MA 2O9OA 1QNRA 2OSYA 2VMFA 3WMBA 2CXGA 1XSKA 1VIWA 2GK1A 1OGSA 1C8QA 4ACZB 1UG6A 2PWEA 4AXNA 1OT2A 3BCFA 3WH6A 2PWHA 2ZWZA 1V3JA 1VBUA 5I24A 1E9LA 4WF7A 4PMQA 4CD6A 2OYMA 4LGXA 4Z2KA 2XFFA 1KXQA 2WMHA 4F79A 5JIWA 1H0GA 1EQCA 5HNNA 3BH4A 3I3DA 3ZR5A 3L4XA 3ZJ6A 3J7HA 1W9BM 2D22A 3FAWA 2DT0A 1UKTA 5FIPA 3I3EA 4KRUA 4KRTA 1IZJA 2EEXA 4HU8A 1B3XA 1HL9A 1K6AA 1TE1A 1W3HA 1H3GA 2XFYA 3ARWA 2EPMX 1GQKA 1UKOA 3EDJA 2ZXAA 4TVDA 3WQ4A 1PZ2A 4W8AA 2WMGA 1GHSA 1JI1A 3ARPA 4ZXOA 1JF5A 2YJQA 4BQ3A 1MFVA 1H11A 3M7SA 1UQZA 3GDBA 1ZBKA 3ZO9A 4A3YA 1MWOA 4DUXA 1NWRA 1E4IA 2V3DA 1V6YA 3K8KA 5D8ZA 4W84A 3WBEA 1B31A 5FKYA 3WD0A 4XB3A 3VGGA 1E3XA 2VVSA 3QHOA 1NOUA 3PZOA 5A1AA 1ZU8A 1J0YA 1QHOA 1JI2A 2D3LA 4XUYA 3WQVA 2FH8A 2W91A 4U2ZA 2W61A 3BAXA 2D0FA 3UERA 1XD1A 1US2A 1B2YA 2DT1A 3AS2A 4NRSA 4J3SA 1KCLA 4MJ4A 2XVGA 2X8RA 4OUEA 4D6DA 1KXTA 4D6GA 2X1IA 4HMCA 3VIMA 3PTMA 3KWXA 4KMQA 1LL6A 3WDHA 2XHYA 1ZL1A 3ZT6A 1R86A 3K8MA 1TVNA 3K46A 1BYDA 3NSMA 3OIHA 1BHGA 3SIMA 3N1AA 5TD4A 3BSGA 4TVCA 4ACYA 2XGBA 1LWJA 3SCSA 3OA5A 2WPGA 1UR1A 3WNLA 2BHYA 1NP2A 1H1NA 1KBBA 1E6QM 2XPKA 1FP9A 3VDAA 1G94A 3VDBA 1PZ3A 3AS1A 2CCRA 2W62A 1QI4A 1MW3A 3VINA 3F5KA 3VGHA 1CGWA 1UWIA 1HKMA 4W85A 3SCTA 2O9TA 4CCEA 1A3HA 3RIKA 2XVPA 4QAWA 1B3YA 4HOXA 3VKKA 2EJ1A 1EHAA 4X0VA 2J7HA 2VZOA 2WWDA 3UG4A 2B31A 2WYSA 4BQ2A 2G3JA 1NWUA 2JIEA 2XWDA 1J12A 1HKIA 3WELA 1Q6FA 4ZEPA 4FLRA 1E43A 2J7CA 1V3MA 4WK9A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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