1ZL1A

Crystal structure of the complex of signalling protein from sheep (sps-40) with a designed peptide trp-his-trp reveals significance of asn79 and trp191 in the complex formation
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFAGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDVGAPVSGPGVPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the complex of signalling protein from sheep (SPS-40) with a designed peptide Trp-His-Trp reveals significance of Asn79 and Trp191 in the complex formation
rcsb
molecule keywords Chitinase-3 like protein 1
molecule tags Signaling protein
total genus 115
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1zl1A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1zl1A01
2JIWA 3VX1A 2VMFA 2YL8A 4BQ2A 4UQ9A 4Z2GA 5DMYA 5FL1A 4U3AA 4Z2IA 1FH9A 5AY7A 3TONA 1MXGA 1QNRA 3WENA 2Q8XA 2WHJA 4H04A 4W5UA 5I79A 4AD0A 4EE9A 4PMYA 4QDMA 4HOZA 1OD8A 4MADA 5LA0A 1UA3A 4GI9A 3PTQA 2Y2WA 3N13A 4IM4A 4CGTA 1WZMA 2YL6A 3N17A 1NQ6A 2VCBA 3WDHA 4BS0A 5DFAA 3WEOA 1WCGA 3AIEA 4UOZA 2YLAA 1CGTA 3AXXA 3AZRA 3VIIA 3QOMA 4FLQA 1ITCA 4CN1A 4MB4A 4ACZA 1VJZA 3AS3A 2W5FA 5I2UA 6CGTA 2DH3A 3S6TA 2ZX8A 2D0GA 3EMCA 2JIEA 4LYRA 3AOFA 1V6YA 2VX5A 4AZBA 4PCSA 1TZ7A 3ARUA 5HBFA 3WD1A 3T08A 1V6UA 4ZXOA 1OM0A 1M53A 3CO4A 3L4UA 1AVAA 3VNZA 3EMZA 3OA5A 1V08A 1U30A 1E6NA 4FLRA 4LGXA 1XH0A 9CGTA 2J47A 2OSWA 6TAAA 3KEHA 1OT2A 3CZGA 3FAXA 4WK9A 2XM2A 1C8XA 3IJ9A 1EO5A 1BVNP 3CZLA 4JFUA 4MB3A 5BXSA 3K8MA 4W87A 1VB9A 5M5DA 4UFJA 1NP0A 4V2XA 2J7HA 3MUY1 2Z1SA 2BY0A 1FHLA 4AYSA 2XVKA 2VL4A 1E70M 4JL2A 5AYBA 5FL0A 3UR7A 1ISVA 3F5KA 4AMCA 1OT1A 1R87A 4RE4A 3HN3A 3WD0A 4GINA 1E6SM 2ZXDA 2G4FA 5A6JA 5IFPA 2DDXA 5C8BB 5BRPA 4JIEA 4CU7A 1MYRA 4AIEA 4BCEA 3CLWA 4F79A 2W61A 5ECUA 4CCEA 1E43A 2JF6A 2E8YA 2W4XA 4GZIA 4HZ6A 5E70A 4IISA 4NF7A 3EDEA 2J78A 1KGXA 2WYSA 4D6IA 2EO7A 1CGYA 1US2A 4BQ3A 1MWOA 3GTNA 4PCTA 4D6FA 2BNJA 2J74A 1EXPA 1XD1A 2E8ZA 2W66A 3WH9A 4AEFA 1AQMA 1CECA 1HKIA 2QLYA 1BPLB 2WBGA 3VX0A 1G94A 3WSUA 2D20A 1J11A 5BWFA 2G3IA 1OIMA 3FHAA 1E6ZA 4QCEA 3WIJA 5BROA 1I1XA 3O6AA 4ZXLA 4J3VA 1UOKA 5CJ5A 1EO7A 3BXWA 5I3DA 3TOPA 1CBGA 2PBGA 2WMIA 4GO8A 1PZ2A 2V5CA 1ZBKA 3WD4A 5IDIA 4M80A 4AZCA 2OWWA 2J8FA 3WQ4A 1CXKA 3L4VA 2E3ZA 4H8UA 3NCOA 1FFQA 3HU7A 1FH7A 3N12A 4M8UA 1VEOA 3WH7A 1ISWA 4AIOA 2BXZA 5GNXA 2VZTA 2BV9A 5CPTA 1MW0A 3W53A 2XWDA 5F7UA 1JDAA 4HMDA 1O6IA 2FGLA 4JFTA 3TP4A 4TUFA 2PBOA 3WELA 1GUVA 1UR2A 3FNDA 2FH8A 1JD9A 4QLKA 4KRTA 1Y7VA 3W29A 1JFHA 2CITA 2CKSA 1E4MM 1DWHM 2J25A 2YDRA 2V5DA 2XSBA 4PMXA 3AIQA 3BLKA 3ZIZA 4AZ5A 2A3EA 1UZ4A 1JZ7A 2FHFA 4JKMA 2DT1A 1EQPA 3AXIA 1E6RA 3W4RA 1V6XA 2WC4A 3QGVA 1SMDA 3AI0A 2QV4A 3VIMA 3SURA 1V3HA 3ZSSA 2VVNA 1QNSA 1BVZA 2O9OA 2VZSA 1KQZA 3B9AA 4NZCA 1B90A 1KGWA 1SMAA 4UOJA 4CN4A 1NWSA 4GZEA 4AISA 4V28A 5GQBA 4AC1X 3EYPA 2X1IA 3QHOA 3B9DA 4TVDA 5GNZA 3ARZA 1ZU8A 2GK1B 2WWDA 4UFKA 3CMJA 4GQQA 1JZ5A 1QHZA 2IXVA 1KR1A 2BY1A 4BQ5A 1CGXA 4HPGA 3WDRA 2ZIDA 1JAEA 3MANA 4D6JA 4OIFA 3ARPA 2WAGA 4UQEA 4UQCA 1JYNA 3WQ5A 3PTMA 3WBEA 2WMGA 3AHZA 1B3ZA 3EDDA 5A94A 2UY3A 4A3HA 4U31A 4P7OA 5CXPA 3GNPA 1YHTA 5CLTA 4UFLA 2XPKA 2E0PA 4DM2A 2JE8A 1K9TA 3EDJA 3T0AA 3ARQA 2XHYA 1Q6DA 3MMUA 3SCNA 5M3WA 3SUWA 2VR5A 2WVVB 1VFUA 2E40A 2OWCA 1W9DM 2WK2A 3IK2A 4A3YA 1UD6A 1XYFA 1QI0A 2OYKA 1JXJA 2A3HA 3ARRA 4HA1A 2C8NA 3SUUA 1GQJA 3W6LA 1GJUA 1TG7A 1ODZA 4M56A 4GZJA 1XCWA 1KXVA 4JHOA 4HTYA 5A6BD 2VNCA 2ZICA 2NW0A 3WNOA 2ZUSA 1FA2A 4J7RA 4EANA 4GIAA 1A3HA 4UNIA 2EPOA 2VTFA 2YJQA 3MMWA 1B1YA 1UR1A 4WF7A 3GNOA 2WHKA 2WCGA 4BQ4A 2ZXQA 1BYCA 4W93A 3AYSA 3AS2A 5D8WA 1XYZA 1KBBA 3WMSA 4R27A 2YL9A 2BVTA 2W63A 2GJXA 3ZJ7A 2DIJA 2WB5A 3G6MA 1PJ9A 1D3CA 3MO4A 4UQBA 1K9EA 1TA3A 1HKJA 4J3WA 2ZX6A 3VILA 1QNOA 1ZL1A 4D6HA 4DWSA 2QPSA 4XB3A 2VZVA 1W1PA 3PZIA 4D71A 4TOQA 2ZUUA 3AHYA 1CXEA 2DH2A 4OBSA 4B9YA 1CGWA 5E0FA 4UTFA 5D9OA 1E6PA 1NWUA 1JDCA 4EKJA 2ZOXA 3T09A 2OSXA 1OGBA 5I77A 2J77A 3WMCA 1HL9A 4ACZB 3A47A 3T0DA 1EOKA 1CXHA 1WDQA 3GH4A 3VGFA 2E9LA 1WNOA 3WH8A 3B8SA 1L8NA 4JHZA 3VDHA 3K8LA 3WF1A 1BYBA 1HP5A 2AMGA 1JF5A 4NRSA 4WKFA 3VDBA 3WF2A 2J8GA 3W24A 5DF0A 2ZX9A 5A8NA 1M03A 1E4IA 4H7VA 1HJVA 5A8QA 3CPUA 5A2CA 3M7SA 1J10A 3UEQA 1UWUA 3BAIA 1B3VA 3U7BA 4HOWA 5AYIA 3OZPA 1B0IA 3MUAA 5HDRA 2WLYA 2Y5EA 3W82A 3OIHA 3VD3A 3A4WA 1V3KA 2B31A 1MXDA 1DHKA 1ZBCA 1PIFA 3VD9A 1GOMA 3PZNA 1RD6A 3AMCA 3T2QA 1GJWA 2YLLA 4MDPA 1GHSA 1W91A 1UWTA 2FGZA 2HISA 3NIYA 1BAGA 3RILA 1BLIA 2WHMA 1E5JA 2EBNA 3SCPA 4D6DA 2XYLA 1JIBA 8CGTA 5CG0A 3OGVA 1ECEA 4LYQA 1X6LA 1W32A 4KMQA 5JUVA 4ATWA 2CBJA 5ABFA 4KWUA 1BFNA 5LYRA 1NOFA 4W88A 1UD5A 1QW9A 4E8CA 1NOUA 3WUBA 3SUVA 1HT6A 4OOZA 4U3CA 4TXEA 2VUYA 3AQUA 2RGMA 1JNDA 3RIKA 2D2OA 3PZOA 1KR0A 4HA4A 3EMQA 2Y4SA 2J7BA 3CZEA 4H8VA 1JYVA 5DT7A 2DGAA 4M81A 2VZOA 3VIHA 4CD4A 1VF8A 1J18A 2CHOA 1XSJA 1VJSA 1DTUA 1SYTA 3AZSA 4CD7A 1GZJA 4ATLA 1MW3A 5I24A 1R86A 3AHTA 1VENA 3KL5A 5A6SA 4D1JA 4YN5A 2D1ZA 2WBKA 1OIFA 3GXFA 3PZUA 5BYWA 1EA9C 3GDBA 3WNMA 2XSAA 3BCDA 3SCTA 2ZXBA 1OD0A 2QHAA 2XIIA 3T2PA 1NH6A 1W1VA 1E5NA 3WQ8A 3I3BA 3ARYA 4A4AA 1UR8A 3KZSA 4MB5A 4C7DA 1JGIA 5KZ6A 1PAMA 5CZKA 2WMIB 2DT3A 3RO8A 5GPRA 4OUEA 4TVCA 3VM5A 3DYPA 4AZCB 1IT0A 4P8VA 2VVSA 1V0LA 3NSNA 5A8MA 3L2MA 5I0DA 3VO0A 1TFVA 2CNCA 2CIPA 5A69A 5HPCA 1JZ8A 3WN6A 5HOSA 3WMBA 1XSKA 4XZBA 1RP8A 1VFOA 4GI6A 2VRJA 4UCFA 3PZVA 1TR1A 1MFVA 1W3LA 3UCQA 2XFFA 3KWXA 4JZ5A 1JYWA 2E9BA 1JZ4A 3BAJA 2W62A 3UERA 2WPGA 3VDCA 2RGLA 1VEMA 2DT2A 2O9TA 3GH7A 3RM4A 3CTTA 3AMKA 4J27A 4AZIA 2PI6A 2CBUA 1E0WA 2Y8VA 4CD5A 2ZXAA 3THCA 5IHSA 2XIBA 3GNRA 4MTVA 1VIWA 4MNLA 4MJ2A 4D6GA 3ZR5A 4UZUA 3GZAA 4N0RA 3ZSTA 5FCZA 3VU2A 2YL5A 1EDGA 5D4YA 1H0IA 1AMYA 2WMJA 2ZX5A 3VGBA 1W3JA 3ZMRA 3B9EA 4BA0A 1V03A 1MVYA 4GKLA 4MPKA 5I6SA 4ZENA 3IAQA 1M04A 4X0VA 1E3ZA 1H49A 1LWJA 1W9XA 5I23A 3IJ7A 1O7AA 1Q6EA 4TX6A 4CVUA 1TVPA 4PTVA 3N15A 1KXQA 2WMHA 3VNYA 1HVXA 4AD5A 1H1NA 2G3MA 1SR0A 3QHMA 3L4YA 1BSIA 1BGAA 4IPLA 2J4GA 1XH2A 1LL4A 1GOKA 1MQRA 3WNKA 1VRXA 5IFTA 2J7EA 3OG2A 1UH3A 5A1AA 1UWIA 1G5AA 4J3TA 2D24A 2XGBA 1MQPA 1RP9A 3GBEA 3RJXA 5A6KA 2VC9A 2XFRA 2V3FA 3NDZA 3AHXA 3W28A 3M6DA 3SUTA 3VIPA 1R7OA 2JFEX 1OINA 1P6WA 4WLCA 1CIUA 1QVBA 2NT1A 1US3A 2X0YA 3U5UA 1MFUA 1UA7A 4XX6A 1UUQA 4AZ6A 1JL8A 2ESCA 4U5IA 1UZ1A 2YDQA 4IPNB 4URIA 3WDJA 4B16A 1GHRA 4YHGA 3DC0A 2VT0A 2O9PA 1PBGA 1FP9A 1W1YA 2PWFA 3VD5A 3CUFA 1V6WA 3GXIA 3G6LA 1TCMA 1WDRA 3FN9A 4HMEA 2V3GA 3F4VA 4QFUA 1W9VA 1R7AA 2ZE0A 3VD4A 1J12A 1UYQA 3BSGA 2DEPA 1I75A 1EHAA 1BYDA 3VUPA 4QCFA 1F4HA 2VR4A 2Z1KA 2WM0A 1Q6FA 2A3BA 4AY1A 1HJWA 2ZUMA 3WKZA 1HL8A 1PIGA 4L4OA 4W8AA 4E2OA 3GXDA 1NARA 4CKQA 1CDGA 2EJ1A 1OGSA 1B3WA 1UR9A 4DUWA 5A8OA 3POHA 2HVMA 2GJXB 1UKOA 4MB1A 5IXEA 1DWJM 1KFWA 7TAAA 4GPNA 2DSWA 1C90A 1U33A 1TA3B 2J7FA 4Q22A 4MNKA 3K8KA 3ZOAA 3BGAA 2FHCA 3MUIA 4H41A 3BC9A 1LG1A 1J0JA 1HN1A 1ODUA 2PF0A 1W9BM 4DWSB 1CWYA 3I3DA 1GORA 1PZ3A 5ABEA 3VD7A 4JL1A 4M24A 3CZKA 3ZT6A 1GW1A 1B31A 1UWQA 4ZE5A 3W81A 3F5JA 3AROA 3BLPX 2OLHA 1EGZA 3JUGA 4AXNA 1JZ3A 2CBIA 1GVYA 4J3XA 3VTRA 2VCCA 4LPCA 2CYGA 4WSKA 1LQ0A 4P7LA 1MW2A 2WZHA 1J0IA 5EMYA 2VO5A 5EFDA 3HMCA 1DEDA 4Y7EA 4WJXA 1ZB5A 1QI2A 3NSXA 5ABGA 1KB3A 2EXOA 1G9HA 1UQYA 2BHYA 1CLXA 3PZTA 3OGRA 1LLOA 2OYLA 2F8QA 2XFYA 1CNVA 4DM1A 5BCAA 4IUGA 2UY2A 2XG9A 1Q6CA 3L4XA 2FDMA 1UD4A 3L4WA 1GNXA 3VMNA 2EEXA 1LG2A 3VKKA 3WFZA 3FXYA 1XV8A 3WEZA 4F66A 1W1TA 3U57A 1MW1A 1CTNA 1L0PA 1C7TA 4YHEA 1PX4A 1BTCA 1BG4A 1XD0A 4M82A 4P7NA 3MU7A 1E55A 2GFTA 2PWDA 3WH6A 1A47A 4AD4A 3M46A 3BAWA 1ESWA 1WP6A 3VM7A 1E6QM 1UHVA 4MAZA 3VGEA 3ZJ8A 4AD3A 2J7DA 4NSBA 5ABFB 7A3HA 1FH8A 3QHNA 1KGUA 2OWXA 2FH6A 5BXPA 4HOXA 4J28A 4JFVA 2E9MA 2GUYA 1TE1A 4F9DA 1HKKA 1E1FA 4PMQA 4MNJA 4L4PA 2XM1A 4CVWA 4BZYA 1NP2A 1UQZA 1XHGA 4FK9A 1XRVA 4TVUA 2G41A 4S3KA 1JF6A 3AIRA 3PHAA 2WZEA 3LMYA 4C7FA 3GXMA 1RH9A 2YKKA 4V27A 1FHDA 3WEMA 1ZJAA 3LPFA 4J3SA 2VRQA 3BMVA 4KH2A 3W27A 1B2YA 1PX3A 3CUHA 1E6XM 1FFRA 1H11A 2CBVA 3SEPA 2A3CA 1IZKA 3VVGA 3WUGA 2WVTA 4MDOA 1WKYA 1E40A 1G01A 3AIBA 1V02E 4OOUA 3RCNA 5CPQA 2JEQA 2BY3A 2XTKA 3QOKA 4P7QA 3POCA 2EPKX 5A6LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3DFN A;  2ZQT A;  2NWS A;  7CGT A;  5J5R A;  1PUD A;  4WDT A;  4B5X A;  3VOI A;  1P0N A;  2OGY A;  4LX4 A;  5E6Y A;  2DSV A;  2Q3R A;  3FY1 A;  3WF0 A;  3GD6 A;  2ZWZ A;  7REQ A;  1XYA A;  2FGB A;  4PGL A;  2HPM A;  4JFI A;  3WQV A;  3WBY A;  3K46 A;  2VZU A;  3KTX A;  5FEX A;  4W8L A;  5JU6 A;  2GGI A;  5C54 A;  4ADS A;  4AH7 A;  3PC0 A;  3MDW A;  3ECQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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