1W9PA

Specificity and affinity of natural product cyclopentapeptide inhibitors against aspergillus fumigatus, human and bacterial chitinasefra
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Specificity and Affinity of Natural Product Cyclopentapeptide Inhibitors Against Aspergillus Fumigatus, Human and Bacterial Chitinases
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 146
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1w9pA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w9pA01
4EANA 1WNOA 5A6MA 3UR7A 2NT1A 3SCQA 3I3DA 2YOCA 4BQ3A 1QNSA 3CHCA 3NYDA 1MFVA 2EJ1A 3POHA 3NDYA 2DQXA 1DWFM 4FLRA 1W9DM 1G94A 2X2YA 2DSZA 1E6XM 3VGGA 4D6EA 3T2OA 1NH6A 4BQ4A 5A95A 5C8BB 4UQAA 3DC0A 3GXFA 3VUPA 2J8GA 2HVMA 3A6OA 4TVCA 4YPJA 4MAVA 1KXVA 2CBJA 1E70M 4GO8A 2CEQA 3OLDA 1XH2A 4QDMA 3BLPX 2V3EA 2WHKA 1GOQA 9CGTA 2VL4A 3T09A 3W4RA 4BF7A 3BSHA 3VILA 1BAGA 4W8LA 4TTUA 5I2UA 1X6LA 4UNIA 2WYSA 1CTNA 4AD1A 2XM1A 1JIBA 1OINA 2YKKA 1ITCA 1CLXA 4UQCA 4YN5A 2NT0A 4AZ6A 4NZCA 5BXSA 1CZ1A 4N0RA 4D1JA 4OZOA 4AW7A 2E40A 1TZ7A 1PX8A 3ARVA 2HISA 1C8XA 3ZM8A 1QHPA 4GQRA 1OT2A 4AZIA 1QPKA 2O9TA 1V02E 2W92A 1G9HA 1JZ6A 3VIMA 4ACYA 1J0ZA 3WUBA 1ITXA 3CHDA 1RH9A 4UZSA 4AZHA 4B15A 2DEPA 4BCEA 4GXPA 5A2BA 2E3ZA 5CXPA 3THCA 4ZXOA 2WBKA 1JGIA 1BG9A 1WKYA 2WKGA 3AMCA 1WZMA 1US3A 1ZBKA 3VMNA 4U3AA 2PWHA 3ARQA 2QMJA 3WMBA 4N42A 3VGEA 3ZT5A 3VIJA 3VD9A 4U31A 4M81A 3PZ9A 5I23A 4KRUA 8A3HA 1I1XA 4PBGA 3W24A 1EOKA 3AQUA 1HVQA 1E4NA 4AZCB 5D8ZA 2J7HA 2Y4SA 4WK9A 1J10A 4JFTA 1DP0A 3WNLA 2PBGA 2D22A 3CMGA 4CD4A 1TR1A 4W7VA 4OOZA 3EDKA 3U5YA 3PN8A 2YDQA 3WSUA 2PWEA 3K8LA 2J7GA 2ZX5A 5M3WA 2WNWA 1UH3A 1EDQA 4W85A 1EQPA 1TG7A 5BWFA 1WE5A 1CNVA 1VAHA 2XFRA 4W93A 1F4AA 1JL8A 2WZEA 2UY2A 4PCSA 2J77A 3HU7A 1R87A 3WH8A 1J18A 2BY0A 1XH1A 1CPUA 4C7GA 3WQ4A 1K9FA 4MADA 2CETA 2XGBA 2V5CA 1ODUA 4H04A 5EBAA 3WEOA 2F61A 2XFYA 3RJXA 3T0BA 2VRQA 4F8XA 2VNCA 5I6SA 2QPUA 3U7VA 2PF0A 3CO4A 1XYZA 1EHNA 1HKKA 1FFQA 4FMVA 4HZ7A 5JIWA 1KQZA 1H41A 1E6SM 3AIQA 1FHLA 3A4XA 3TTQA 1W3HA 1IT0A 3WH6A 1W9VA 1UD4A 3AIEA 3BSGA 4M1RA 2QMKA 4RE3A 3PZOA 2C8NA 3TA9A 1JYWA 1E6RA 3OGSA 4B9ZA 1EOMA 1JXJA 3GNPA 2ZUVA 2MANA 3BAJA 1DWHM 1DTUA 3PZQA 4UFLA 3WDQA 1CBGA 1E55A 2O9OA 7TAAA 5CJ5A 1UD8A 4JCMA 4WKFA 3BMWA 2XTKA 1OB0A 2J25A 3TTSA 4JHOA 1E9LA 2AOSA 1PZ2A 5FD0A 1J0HA 1JDCA 2VZSA 3CZ8A 4NRRA 1CXLA 2Y8KA 4CUCA 2B31A 4W5ZA 4LYRA 2G4FA 4MB5A 2CCRA 3SCVA 3GTNA 1S46A 3B9DA 3ALGA 1BQCA 2J7FA 3SIMA 3GXIA 2WM0A 1ZL1A 4BZYA 5AY7A 2GFTA 1JXKA 4WF7A 2IXUA 2Q8XA 2DSWA 3CZEA 2ZICA 1Z32X 2DT1A 4KMQA 1J12A 3AISA 4HZ6A 4E4PA 4TUFA 1NWUA 1UWQA 3WBAA 1UD3A 4QFUA 4JHZA 5I5RA 4OUEA 4EK7A 2XUCA 3E1F1 2XVNA 4OJYA 1HXJA 4W8AA 1UD6A 4OIFA 4CD8A 1EGZA 3ARYA 3CH9A 4PCTA 3BAKA 4PYSA 1HIZA 1CGUA 1SFSA 2WVUA 4LQ1A 4XZWA 3EMCA 4U5KA 1EXPA 1WB0A 2J7BA 2EBNA 3U7BA 2WMGA 2J75A 4IM4A 3KZSA 2CBIA 1B30A 2BV9A 2WZHA 5A2AA 3D3AA 4UOZA 3ZIZA 5DT7A 3UETA 3G6LA 1H0GA 1DEDA 2VZTA 3UG3A 1B3YA 3L4UA 1UD2A 3WELA 2X8RA 1CGXA 1W91A 4HMCA 5BXRA 5DF0A 1JZ8A 1XSKA 3IK2A 5D9PA 4CU7A 2EXOA 1UR2A 1UWSA 4EAMA 4PMYA 1BPLB 4H8UA 1JDAA 1QVBA 5D9OA 3VPLA 2DT2A 3DYPA 4GZIA 3VO0A 2E4TA 1C90A 2VZOA 1JYVA 4D6GA 3WDIA 2DIEA 3M6DA 1JZ2A 3AXXA 4MB1A 1PEZA 1NWTA 1JF6A 4JKLA 3AFBA 5D9NA 3I3EA 4WSKA 1E5NA 3VIPA 1EIBA 1BYCA 3VDAA 4AD0A 2DPEA 4HMEA 4LGXA 1XCXA 5AC5A 3SEPA 1GNXA 1KR0A 3WF4A 1GVIA 4P7NA 3AYSA 5A3HA 1OM0A 1WO2A 4J3TA 3ZJKA 4V27A 4GIAA 4J3XA 5HOSA 2WVSA 2GUYA 4UQ9A 4HU0A 5CGMA 1ZJAA 2CKRA 1PBGA 3MKKA 2GK1B 1A3HA 3RIKA 2IXVA 4ATDA 2G3NA 1ZBWA 1KB3A 4L4PA 1J0IA 1OGSA 1TVPA 1DWGM 4AIEA 3AIWA 4V28A 4W7UA 2WVVB 1JAKA 2D24A 3L4YA 4D6JA 1JAEA 2ZXDA 4X9YA 3VX0A 3KL3A 1V3HA 1WP6A 3VDHA 3PTQA 1E72M 1KCKA 2BHYA 5DFAA 1IZJA 3WY1A 1E40A 5A8MA 4AZBA 4TTGA 2VO5A 8CGTA 1SYTA 2WPGA 5CPQA 2XG9A 1LL4A 1KXTA 1NOWA 1PPIA 1D7FA 5CZKA 2VX5A 5JUVA 5A6AA 4AWEA 3SCNA 1PIGA 5A8NA 1KXHA 1OGGA 2WMFA 1EQCA 5A1AA 4P8UA 1D2KA 5AYIA 2VR5A 2XYLA 3PZIA 4D1IA 4KRTA 5IDIA 1U33A 4F66A 3GH4A 4P7OA 3WH7A 2NSXA 1RP9A 2W91A 1E6NA 3WKZA 3MUIA 1XSJA 1MFUA 2XWDA 4F79A 4JFSA 5ABHA 3N1AA 5JBFA 2OSWA 1QNPA 2XVLA 3EMQA 1JNDA 3U5UA 3BH4A 2D0HA 4CGTA 3ZSSA 1OWQA 3VGBA 4AIOA 4U5IA 1W9XA 3EDDA 4P8VA 3WUFA 3ARUA 4FLOA 2A3CA 2CPUA 1RD6A 1AQHA 2E9LA 3RM9A 2OWCA 4TXEA 5JH8A 3AIRA 2G3IA 3IJ8A 1EO5A 1CEOA 2WLZA 1CIUA 4ZXLA 3PBGA 1QBBA 1FFRA 2FHFA 4AEEA 2DT3A 4CN1A 1FHDA 4H8VA 3QHMA 3WH5A 3OIHA 4U2ZA 3LMYA 2DSUA 1B9ZA 4HA4A 1B3ZA 4MPKA 1LQ0A 3VD7A 2FHCA 4D6IA 2VMFA 1L0PA 1V0KA 2VZVA 1UG6A 5HDRA 5DO8A 3IAPA 5A8QA 1OIFA 1WPCA 1P6WA 2GJXB 2E9MA 1K9EA 1UKOA 1JZ5A 3EDFA 2WMIB 1JYNA 4KWUA 5HPCA 1JD7A 4CVUA 1LG2A 3GBDA 3APGA 3SUSA 1NM9A 1U30A 3CHFA 2JIWA 4ATLA 5LA1A 4TX6A 1KQYA 4W8BA 4JFVA 3VU2A 3EYPA 2WCGA 4PSRA 1GORA 1B0IA 4DM2A 1GW1A 1G1YA 1KCLA 1ECEA 4F9DA 3AIVA 2YBTA 1SMDA 2VX4A 4URIA 1G01A 1NOFA 1VFMA 1JI2A 3WF2A 4DUXA 4XX6A 1TA3B 1XCWA 1BYDA 1E3XA 2WXDM 4JKMA 3VIHA 3QOMA 3W6LA 3W29A 3MS8A 1US2A 2OYLA 4A3YA 4R27A 3L2LA 3ZR5A 3L4TA 5CPTA 3N12A 1GUVA 3ZMRA 1KBKA 3ZT7A 2F2HA 2JF6A 5A6BA 4WLCA 1ISXA 5EFDA 3WNPA 4GI6A 3VM7A 1BG4A 1KGUA 3K4AA 1CWYA 1Q6FA 3WL0A 2E0PA 3ZR6A 2ZUNA 3POCA 1ISZA 5CSUA 3CZLA 5BYWA 2CESA 3WN6A 3N04A 5ABEA 1X6NA 1KWGA 1E6QM 3GNRA 5GQBA 1UQYA 3AIUA 3CGTA 5A6BD 4V2XA 2D2OA 3VIIA 2X1IA 4AD2A 3CPUA 2WW5A 4HOWA 3WBEA 3KE0A 1MVYA 3VIKA 3QHOA 4RL3A 1W1TA 1W2PA 2W4XA 4HMDA 4AY1A 1UA7A 1GHSA 1VFOA 1H3GA 3WQ5A 1G0CA 5LYRA 1UKPA 3VD4A 1W9BM 4FK9A 3FAWA 2TAAA 5I77A 2BVYA 5IXEA 1UKQA 2DSVA 3W82A 3FHAA 4DWSD 2VRJA 3KL0A 3CIVA 2XSAA 4FLQA 1DWIM 3F5JA 4PN2A 1UR0A 1UUQA 3MUZ1 4IISA 3CTTA 5I79A 1VF8A 1E4MM 2BY3A 1HJWA 2CNCA 1KR1A 3WNNA 5GNXA 3MMDA 5IFPA 4OOUA 3AROA 4IPLA 1KGWA 2JALA 3PZMA 5E9AA 1BF2A 5A6LA 1VJZA 2W67A 1OIMA 4J3UA 3SURA 3OA5A 4B3LA 1CXFA 2X09A 5JBDA 2QF8A 2JEPA 2OWXA 1J9YA 1CGWA 1UKSA 2ZOXA 1VEOA 1W1VA 3LPFA 2UWFA 4CCCA 3PZNA 1KWKA 1NWRA 1E71M 4LPCA 5HPOA 1VJSA 1CGYA 3IAQA 4CVWA 3MU7A 2D3NA 2WMKA 3PTMA 2EPKX 2FGLA 1QHOA 3VM5A 1UR8A 3TONA 1UWUA 2EPOA 1ZBVA 1R85A 2YA0A 2C0HA 4E2OA 1JZ7A 4W7WA 2GK1A 2ZUTA 4HOXA 1ISWA 1YHTA 4B3KA 1LG1A 1QNQA 2BHUA 2CKSA 2YA1A 3G6MA 4AZ5A 4W86A 3CUIA 3T2PA 3SCRA 2Z1SA 3MUAA 1C91A 2WVVA 3MV11 4M24A 3AS0A 4MNMA 1BFNA 3A3HA 4PMQA 1FP8A 4BQ2A 3AHZA 5E0FA 3TP4A 1PX4A 4J27A 1CENA 4GPNA 2FHBA 1VBRA 5A6JA 4U33A 4AZGA 2WWCA 3SCUA 2ZUUA 1MQQA 4LXFA 4GO9A 1GQLA 3BAXA 4Z2JA 1NWSA 1H11A 3WF3A 2PWGA 2XPKA 2YBUA 5FL1A 4U2YA 1GPFA 1NQ6A 1V03A 3ARSA 5E6YA 1L8NA 4K68A 1JNEA 1ZU8A 2W5FA 4AD4A 5M5DA 3AS1A 4M56A 3SCPA 3SCSA 1AQ0A 2WHMA 3WF0A 4MB3A 3BCDA 3ECQA 3QR3A 4P8XA 4LYQA 1J11A 3VIOA 3F5LA 3BGAA 3VTRA 2ZX9A 1E15A 3BAIA 1VFUA 3VX1A 2YJQA 4W87A 3HMCA 4H41A 5A94A 3SUVA 1WCGA 3VINA 3FHQA 4WSJA 3WFLA 1MW2A 3AOFA 1UHVA 3VMOA 3SUUA 4Q7NA 4DWSB 3W0KA 2CHNA 3N11A 1MQPA 4UQBA 5I0DA 4AXNA 1HP4A 3VGDA 4YHEA 3RPMA 3AS3A 5DT5A 1NARA 1C93A 3VDBA 3SCTA 3AMDA 5EFFA 2WC3A 3M46A 5E70A 2J62A 1W9UA 2CBUA 1W3KA 1TMQA 4ZE4A 1E5JA 3WD3A 4HZ8A 4PMXA 3ZJ7A 4P7QA 4LX4A 3W27A 4CD7A 4JFWA 1Q6GA 3UG5A 2Y8VA 4HA1A 2X05A 1B1YA 4FF5A 2D20A 4W5UA 1GHRA 1Y7VA 1B31A 1HJQA 5IFTA 5DMYA 3NSNA 4A4AA 1E1FA 3LPOA 2J4GA 4GI9A 1XD1A 2YL8A 1NOUA 5CLWA 3S2CA 2E8ZA 1LF1A 3WMCA 1V3JA 4UOQA 3WL1A 2V3FA 4UZUA 1GCYA 3W81A 4QLKA 5EB8A 1R7OA 4MJ4A 1BYBA 1GOOA 4QCFA 3FY1A 3K46A 3CBWA 3CUGA 1VIWA 1IV8A 3CHEA 3OGRA 4OBRA 1QBAA 2FH6A 1FH7A 2VCAA 3VDCA 2EPMX 1O6IA 4WKAA 3WUGA 4E8CA 2CXGA 3VGFA 3SUTA 3DECA 3T08A 1BVNP 4Z2HA 1TA3A 1TUXA 3A47A 5M17A 3EDJA 1XRVA 2OYMA 2O9RA 3K4DA 5C71A 4JAWA 3WNKA 1DHKA 3SCOA 4OKDA 3QOKA 4UOJA 2CIPA 1TCMA 1MQRA 4EKJA 1HJXA 2XHYA 3GXDA 2FDMA 2YLAA 4UFHA 1GOMA 3WD4A 4B16A 1AMYA 2OSXA 1E3ZA 2DH3A 4RE2A 3UR8A 1QW9A 3AMGA 1JFHA 1HL8A 3CZGA 3DYMA 3HJEA 2PB1A 1M03A 1B2YA 1Q6CA 3ARPA 3OZOA 1E0WA 4U3CA 1H1NA 5AC4A 5CG0A 3MSGA 1FOBA 4ACZB 2GVYA 2ZE0A 3WQ8A 3OBAA 2WLYA 1ESWA 1R8LA 4D72A 4OBSA 5A69A 4AC1X 3GNOA 1CXEA 3K8MA 3OG2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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