2YBTA

Crystal structure of human acidic chitinase in complex with bisdionin c
Total Genus 126
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
AYQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNIKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAP
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS15 (332-335)AH3 (113-130)S2 (53-62)TI2 (47-50)S1 (23-29)TI1 (29-32)S3 (65-67)TI6 (361-364)3H1 (32-34)AH1 (72-82)O3 (26-51)3H3 (43-45)O4 (49-394)TVIII1 (51-54)AH2 (103-110)TIV2 (61-64)TIV9 (375-378)3H4 (83-85)TI3 (87-90)TVIII2 (85-88)S4 (91-97)TIV3 (139-142)3H5 (99-101)AH4 (150-172)S5 (134-138)TI'2 (144-147)TII1 (141-144)S6 (179-184)3H7 (236-240)AH5 (188-194)O2 (240-242)S7 (206-209)AH6 (197-203)AH7 (243-253)TVIII3 (204-207)S14 (324-329)TIV5 (224-227)S12 (300-302)TIV4 (211-214)3H6 (217-219)TVIII4 (213-216)S8 (221-222)TI4 (231-234)S11 (283-288)TII2 (280-283)S13 (315-319)AH8 (303-312)S9 (260-265)3H8 (257-259)S10 (267-273)TVIII6 (276-279)TVIII5 (273-276)TI5 (275-278)TIV6 (292-295)TII3 (297-300)TII'1 (329-332)TI8 (366-369)TI7 (362-365)TIV8 (359-362)TI9 (369-372)3H2 (37-39)S16 (356-360)AH9 (339-352)3H9 (320-322)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Analyzing airway inflammation with chemical biology: dissection of acidic mammalian chitinase function with a selective drug-like inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACIDIC MAMMALIAN CHITINASE
total genus 126
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2011-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 2ybtA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2ybtA01
2CBIA 4UOJA 3JUGA 1GOKA 3WNLA 1EGZA 1JAKA 4ZEPA 1CIUA 5FL0A 3ZSTA 3VGEA 2D1ZA 3WN6A 2A3HA 5HNNA 4UFLA 4QCEA 2VCCA 1GOMA 3ZJ6A 4XV0A 2WVTA 2CYGA 2W63A 2ZUNA 3K8KA 1GOQA 3CTTA 4PSPA 1VENA 1E0XA 3CMJA 1O7AA 4AIEA 4NI3A 4R27A 5I23A 2UY5A 1W9BM 1MQPA 4ATLA 3DECA 2X2YA 2XWEA 4W7UA 3ZMRA 1HJWA 3SCWA 5ABGA 4PMUA 5JBEA 1OD0A 4JKLA 2ZWYA 2WMGA 2WB5A 1DHKA 3BC9A 2CBUA 4IM4A 4KGJA 4GI8A 3DYPA 1UR9A 4KRUA 3KEHA 3WKZA 3FHQA 1C90A 3K8MA 5BXSA 3PZQA 1WZMA 1UQZA 2XVNA 4GO9A 5LYRA 1JFXA 4J27A 3BMWA 4Z2LA 1KBKA 1JZ6A 3M7SA 2Y8VA 1V6WA 1VFFA 3EDKA 1EQPA 3ARZA 1KGUA 1ODUA 4F79A 1HP5A 3AZTA 1BF2A 4BS0A 5A6KA 3WF4A 4UNIA 1CXEA 3WF1A 1JAEA 2XIBA 7TAAA 3OGVA 2BNJA 2E9LA 8A3HA 5CG0A 2VRKA 2EPOA 3MUY1 3O9NA 2D0HA 3M6DA 4GPNA 2O9TA 1F4AA 1NWUA 1FOBA 4TTGA 5A2AA 2VI0A 1B0IA 2CETA 3IJ8A 5ABFB 1QOXA 5IFTA 2VQTA 4CN4A 4W86A 4MB4A 4QP0A 3N1AA 2UY2A 1M53A 1UR8A 5CJ5A 3VD5A 3VDAA 1UD5A 3NSXA 1E6NA 2DT2A 2IXUA 4ACYA 3VX0A 1OWQA 2XJ7A 4YPJA 3SCNA 5IDIA 2WVUA 1CTNA 5F7UA 1KQZA 1KR0A 3VTRA 4QLLA 1MWOA 2J8FA 4MAZA 1W1TA 2DQXA 4CCDA 2EPMX 1W91A 3PZUA 1UQYA 1VB9A 2XWDA 3UG4A 1EDTA 4QLJA 4MJ2A 3QR3A 4U2ZA 5AC4A 3SUVA 4AEFA 1IT0A 1DWFM 4CVWA 1MFVA 3VMNA 2FHCA 4XZBA 3L4TA 2OSWA 2X0YA 1UR1A 3QGVA 1N82A 3WD1A 2PWDA 3WQVA 2D22A 1K9TA 4AZBA 2VCBA 3VX1A 1O6IA 2UY4A 1ZBWA 2XGIA 1LWHA 1UA7A 3WH9A 2JIWA 2CERA 1CXFA 1OT1A 2G3IA 3MS8A 4P7LA 3LMYA 4PTMA 1WZLA 2F8QA 1HKIA 3U7BA 4GIAA 5CLWA 4TTUA 1TA3B 1W3LA 4HP5A 1IZKA 4X0NA 3NDYA 1QNQA 3CHCA 3L4WA 4UFMA 1HVQA 4P8VA 1E55A 2D23A 3AHXA 1JZ2A 2XVPA 3T2PA 4GZIA 5A69A 2EJ1A 2VR4A 4W8BA 3VNZA 4W7WA 3AS2A 4RL3A 3RO8A 1KWGA 4TX6A 3PTKA 1JNEA 1UZ1A 3NSNA 3HJEA 3MMDA 3OLIA 5I2UA 3AYSA 1BPLB 4ZXOA 1XD1A 1BG4A 1OT2A 2BY2A 4FMVA 1RPKA 5D9PA 4EE9A 1JYWA 1HJSA 5CZKA 4OIFA 4MNMA 1CGXA 2GVYA 4B15A 2Y24A 3W6MA 3FAWA 3ZM8A 2D2OA 2X1IA 3WNMA 5JIWA 4QLKA 3AIEA 4IPNB 3WUFA 2J25A 4AIOA 3MO4A 3CZLA 3HMCA 1UWSA 3IANA 1V3IA 1E6ZA 3WNPA 5HPCA 1G0CA 3SCTA 4NZCA 3CZJA 3POCA 5AYIA 1W9XA 5D9NA 1HN1A 1VFOA 4LPCA 4CU6A 3W0KA 1UUQA 1UWIA 2CIPA 1H5VA 1E40A 1US3A 3WBAA 3W29A 3CUGA 4CD6A 2DH2A 1QHZA 1NOWA 5LA0A 2Y5EA 4H7VA 4U3AA 3VIOA 3AFBA 2WC7A 4M8UA 1CGWA 1OIMA 3AIVA 1WDQA 4TVCA 1ECEA 2WWDA 5DT7A 2WLZA 4HA3A 5DF0A 2EPNA 1B3ZA 5GNXA 1LWJA 4B3LA 1FA2A 3IJ9A 3VD9A 4MDOA 4ML4A 4CGTA 3U5UA 2VQUA 2E9BA 4FK9A 1RH9A 1Q6FA 4DM1A 2E9MA 4J3UA 1TR1A 3VO0A 5CGMA 2J7GA 1GQJA 5TD4A 2GK1B 3QOKA 4W8LA 4OBRA 4GZJA 1J10A 5JIPA 3WQWA 4AZCB 3RM9A 2V5CA 1HJVA 1MYRA 1XSJA 3T0AA 1EOKA 1H4PA 4JL2A 1HXJA 4CD5A 1V08A 1Q6DA 1H0IA 5JUVA 5CXPA 4IPLA 1FH9A 1H41A 2BVYA 4MTVA 3WEOA 5A2CA 2GK1A 1LF1A 4E4PA 2DIEA 1AMYA 2CESA 4HOWA 3I3DA 1GJUA 1PPIA 1J11A 2GSJA 2WAGA 4W85A 1E1FA 3K1DA 4YHEA 3MANA 4HU8A 2QF8A 2EEXA 4HZ7A 4JL1A 4PRWA 1UWRA 4AD1A 1A3HA 1C8QA 1QNPA 5GPRA 1E70M 1BSIA 1NP2A 3AS0A 1ISZA 4AD4A 3PTMA 5A6BA 3BXWA 7A3HA 3CHDA 2CHOA 2XIIA 3WMCA 2A3EA 4TVDA 1DEDA 4PBGA 1E5JA 4PTVA 3D5HA 4P7OA 2BXZA 1I1WA 1ZBVA 3IAQA 3AZRA 1BYCA 1LL7A 2ZXAA 4PMDA 1DWGM 3WDPP 2Y4SA 2VX4A 2J7BA 2WXDM 4GI9A 2O9RA 3ARUA 1MW0A 1X6LA 2WBGA 3M46A 1GQKA 1R85A 1E1EA 4UZUA 5EFFA 5LA1A 1BVZA 4J28A 2YL8A 3AMGA 2XVLA 2YA1A 3SCVA 2PWGA 4GKLA 1KXQA 1VJZA 1BYDA 2BY1A 4FLOA 5HXMA 1UZ4A 3CUIA 3F5JA 4Z2JA 3WFZA 1JD7A 3LPFA 2HVMA 1AVAA 3UEQA 4MADA 3ZIZA 3EYPA 3II1A 3BAWA 1QNSA 3OGRA 2C0HA 4W8AA 3WH7A 1YQ2A 1NM9A 5A1AA 1QVBA 2QPSA 1AQHA 1FP8A 1ZL1A 1V0KA 2OSYA 2Y8KA 2WW5A 1H2JA 2VO5A 1GJWA 1CYGA 2PF0A 2DSWA 2OYKA 4U5KA 3WUGA 1EO5A 2YBUA 3E1F1 1UR0A 4UFKA 4AMCA 4KWUA 2RGMA 3ZJ8A 2W5FA 2JE8A 2UWFA 1KWKA 3BCFA 4WJXA 1C93A 4WIWA 4AD3A 2A3AA 1V0LA 1JIBA 3WY1A 4XX6A 3AI0A 3ARYA 4TOQA 2BXYA 3AIRA 2OWXA 1W9DM 1CNVA 1J01A 2YLAA 5A8MA 1D3CA 2J74A 3CO4A 3RDKA 4DUWA 4H04A 5EFDA 2DH3A 5JBDA 1XHGA 3CZGA 5BCAA 3WSUA 3FW6A 1W3JA 4DWSB 4J3TA 4EKJA 4PMYA 1MQQA 3ZO9A 3KL0A 1CGUA 5GQBA 2Z1SA 1EA9C 5GNZA 5A95A 1W3HA 4GZEA 2JFEX 1W1PA 2PB1A 3ARWA 3WQ8A 2G3MA 4AWEA 3WBEA 2D0FA 5I77A 4KMQA 2AOSA 5BXRA 1J18A 3QHMA 1LLOA 5GNYA 1HJQA 3HN3A 1LQ0A 3TONA 1H3GA 4JHOA 4PEEA 1BAGA 4UR9A 1OGBA 2WK2A 4PCTA 1VBUA 3NDZA 5BROA 3VGGA 2F2HA 3RIKA 1LL6A 4P7QA 5ABEA 1GONA 2V38A 4UQAA 5BXPA 1E4NA 2E8ZA 4PMZA 4WKHA 3N11A 4MJ4A 4WSKA 2UY3A 4AXNA 2VUYA 2ZXDA 1JG9A 1SMAA 1JZ3A 3WNKA 2VZOA 4V27A 3I3EA 2DT3A 1ISVA 5E70A 4OZOA 2WHLA 4E2OA 1EHAA 2J7EA 3WDQA 4W88A 1ITCA 2ZX6A 1B31A 2J7DA 2WMJA 1PIFA 3AYRA 2XVGA 3K4AA 3WDHA 4C7DA 5I0DA 1V3JA 3T09A 1C3FA 3ZT5A 2WCSA 2DSVA 3A47A 3AHYA 1CLXA 1W9PA 2C8NA 1KQYA 1MXGA 1NWTA 4IISA 3CH9A 4MPKA 1WCGA 2J7HA 3GXIA 4MNLA 3SUTA 3ZT7A 3ZR6A 5AY7A 2DSZA 1XH0A 3MUAA 1H09A 3TTYA 2BY0A 1CENA 4CKQA 5E0CA 1OGSA 1JYXA 3DC0A 3BLPX 4EANA 1KXVA 3GXMA 4H41A 4HZ6A 4GXPA 3L4YA 4H2CA 3LPPA 4DWSD 3ECQA 3GXDA 3AIQA 3L2MA 4JCMA 3ZJKA 2J75A 1MW1A 3GH5A 3AXHA 5FCZA 3KL3A 3POHA 1I75A 2ZUTA 3ZT6A 3U5YA 4HTYA 1VF8A 2PWHA 2YKKA 4WSJA 1DTUA 1F4HA 3OBAA 3OA5A 4E8DA 1JZ8A 3N12A 3O2LA 4BQ4A 2VT0A 2ZUUA 4Z2GA 3PZTA 4PSRA 3GH7A 1WZAA 4AC1X 1ODZA 1MQRA 3WDIA 1KXTA 2WKLA 6CGTA 1XRVA 1W9VA 3ARQA 3WD4A 1FHDA 5FKYA 4PMOA 5CSYA 2RGLA 1UR2A 2OWWA 1UD4A 4HMCA 3ZQ9A 2YDSA 5DFAA 4FLQA 3MSDA 1KGXA 4PTXA 2W67A 2WCAA 4Q22A 7CGTA 5BWFA 3NSMA 1BFNA 1QI5A 4WF7A 1CGTA 1JYNA 5I5RA 4D6DA 2CBVA 4LXFA 2CXGA 1UD8A 2YLLA 5BRPA 2WMFA 1ZJBA 3W37A 4BA0A 4GI6A 1J0HA 1TVPA 2EBNA 5CQ1A 2DDXA 2E40A 4D72A 2FDMA 3SUSA 1JXJA 4D1JA 1UD6A 4AISA 2F61A 5EB8A 2V3DA 2DSKA 2VNCA 1NH6A 3THCA 5LA2A 3NUKA 1XD0A 3WMSA 2XVKA 3WUEA 3WDJA 3FHAA 1ISWA 1HKKA 3N13A 1HKMA 5A6JA 1E5NA 3S6TA 2WLYA 2VR5A 4HPHA 3RJYA 1SR0A 5E09A 2WSPA 2C7FA 5D9OA 1KGWA 4Q7NA 1W32A 4Z2KA 1G9HA 3A6OA 3ARXA 4J3WA 2IXVA 1JZ7A 5I6SA 3AHVA 1W3KA 2VRQA 3AMCA 3VM5A 2X0HA 3UG3A 1HIZA 1Q6CA 4KRTA 4J3SA 1VEMA 1X1NA 3CGTA 1OSEA 4ACZA 4QDMA 2DIJA 4UTFA 1JNDA 1E6SM 1HKJA 3GDBA 2BHYA 3U57A 4F9JA 5BRQA 2OLHA 1V6VA 3VD7A 3AROA 1WDRA 3BSGA 1FFRA 4BQ3A 2IUZA 4OOUA 4S3JA 2Y2WA 1BYAA 1HJUA 3ALFA 4RE3A 5A3HA 1W1VA 4ZE5A 2VL4A 2CITA 3VIHA 4DUVA 4PN2A 1H0GA 9CGTA 5DT5A 3VVGA 3RCNA 3CPUA 4PUDA 1WDSA 3MUIA 3DYOA 2X05A 4CD4A 2VRJA 3APGA 3T0DA 1Y7VA 4PMNA 3VD4A 1M01A 4LYPA 1YHTA 3L4XA 1XYZA 4N42A 2J62A 1R87A 1B3XA 4P7NA 3T2QA 1ZBKA 8CGTA 5DO8A 1JF5A 1K9FA 1PZ2A 4A3YA 1V0MA 3SCUA 2ZUSA 2FH8A 3VIKA 1OIFA 4UFJA 1J0IA 3MV01 2D20A 4JKMA 2W61A 1G1YA 1KBBA 1NQ6A 1ZB5A 5AC5A 3W53A 1UA3A 2WANA 1CDGA 1E3ZA 1EIBA 1V02A 5A6MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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