3ALFA

Crystal structure of class v chitinase from nicotiana tobaccum
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
348
structure length
348
Chain Sequence
QNVKGGYWFKDSGLALNNIDSTLFTHLFCAFADLNPQLNQLIISPENQDSFRQFTSTVQRKNPSVKTFLSIAGGRANSTAYGIMARQPNSRKSFIDSSIRLARQLGFHGLDLDWEYPLSAADMTNLGTLLNEWRTAINTEARNSGRAALLLTAAVSNSPRVNGLNYPVESLARNLDWINLMAYDFYGPNWSPSQTNSHAQLFDPVNHVSGSDGINAWIQAGVPTKKLVLGIPFYGYAWRLVNANIHGLRAPAAGKSNVGAVDDGSMTYNRIRDYIVESRATTVYNATIVGDYCYSGSNWISYDDTQTVRNKVNYVKGRGLLGYFAWHVAGDQNWGLSRTASQTWGVSF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and mode of action of a class V chitinase from Nicotiana tabacum
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase, class V
molecule tags Hydrolase
source organism Nicotiana tabacum
total genus 127
structure length 348
sequence length 348
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3alfA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3alfA01
2VCBA 4JFSA 1HN1A 3RCNA 2V3FA 2ZX5A 3WSUA 5FOOA 3WD2A 1ITXA 1RP8A 1RH9A 2DT2A 4W7WA 3WUEA 3WH5A 2WMFA 1TCMA 3VIFA 2CHNA 2VR4A 5A6SA 1B2YA 4QAWA 2XTKA 5A8NA 1OGGA 4H04A 1V03A 1BGGA 1DWJM 1JXJA 4AZ7A 2OSXA 5AYIA 4HZ7A 3PTKA 1PBGA 2NT0A 2XVKA 1JYVA 2PC8A 1I75A 3CZEA 3WDRA 1YQ2A 1OGSA 1QPKA 4R5EA 1WDRA 2Z1SA 3W24A 1UQZA 2WCGA 3SCWA 5GQBA 1W3HA 4BF7A 1LG2A 1KQYA 3BCDA 1MFVA 1WZLA 2VNCA 4MB4A 5GNXA 3ZT6A 2PBOA 4J3VA 4DWSC 1B3ZA 1F4HA 5FCZA 2WMGA 1BF2A 1UYQA 1CXKA 1QNQA 2VZTA 4AZIA 4AEFA 1CZ1A 1JDCA 3DYMA 3WKZA 2XVLA 5BROA 3WUFA 1ZB5A 2EO7A 2XGIA 4M8UA 3NSMA 3WEMA 3CUIA 1GORA 3CO4A 3OLEA 4EE9A 2QPUA 3VX1A 1UKTA 2ZUMA 1J0JA 2DIEA 1E56A 2X1IA 2W67A 4JCLA 3SUSA 2WHMA 4OOUA 1CGWA 4DUWA 5A94A 3MV01 3L4UA 3VIPA 3QOMA 4QP0A 1AVAA 2A3BA 1BYDA 1VBUA 3TTYA 3VDBA 3GXMA 1KBKA 5ABEA 3D5HA 3WY1A 3II1A 1BG9A 4X0NA 1MQPA 3AJ7A 4MPKA 3AFBA 5A6BD 3WD1A 3ARVA 2EPOA 1CDGA 1HVQA 5BRPA 1GOIA 1H41A 4JHZA 3PZVA 4A3HA 4PMZA 1FFRA 4Z2LA 4BZYA 4Z2GA 1VEPA 4FLQA 4TVUA 4GPNA 1NWSA 4CKQA 4J3WA 2C8NA 2W63A 1FH9A 1KWKA 1R87A 4PMRA 1E70M 4X0VA 3I3BA 4D1JA 4F66A 1UR1A 1Q6EA 1VBRA 4V27A 1UWTA 1H0IA 3CZLA 3HJEA 2WMJA 1IV8A 5HXMA 1DP0A 2JF7A 4HTYA 1W1YA 4XZBA 2ZXQA 3GBDA 1E1FA 1OB0A 4M56A 2CXGA 2CNCA 1VFFA 1MXGA 4JL1A 3CUJA 1E73M 3GBEA 1C91A 3UG5A 1NP2A 1ISZA 3ZT7A 2WSPA 1ZJBA 1BVNP 4EKJA 1PZ3A 3PTMA 1XD0A 3EDKA 2D1ZA 3PZGA 4AZHA 3TP4A 3W29A 3CMJA 1U30A 1X6NA 2WHLA 1KXQA 1OIMA 3S6TA 1JZ6A 4Z2JA 4D6HA 2F8QA 2CKRA 1VJSA 4C7GA 3VD7A 5JUVA 4X9YA 1VFOA 3VMPA 1M01A 5LA1A 4LYQA 2CCRA 1XSIA 1TG7A 5FKYA 5FL1A 3EDJA 1MQQA 1JD7A 5I5RA 1RPKA 2WANA 1V0KA 4RE3A 3MSDA 2CBIA 2FGZA 2V3DA 1OM0A 3CUGA 2OWCA 1VB9A 3L4VA 4GQQA 8A3HA 4IM4A 4HOZA 4YHGA 1ISWA 2PF0A 2G3NA 2BXYA 3GNOA 3S2CA 5ABFB 5D9NA 1YHTA 5BCAA 1ZBKA 1XC6A 4TVDA 1WZKA 5HPOA 1HL8A 1JIBA 1UR8A 3AMCA 3THDA 1LF1A 1BHGA 1V02A 2D3LA 3ZJKA 1E3ZA 3GTNA 5A2CA 1G94A 1JDAA 3SUUA 1WDQA 2D0GA 2IXVA 4WSJA 4P8WA 3MANA 5AC4A 3N18A 1HKKA 2V3EA 1NWTA 5E9AA 4TTGA 3SUVA 3WNPA 2XM2A 1O6IA 2ZUNA 1EOKA 4M81A 4W87A 3TTSA 1M04A 1PX8A 1PJ9A 3DYPA 3N1AA 4Y7EA 1R85A 4E2OA 3GH7A 4MJ2A 4RE2A 1HXJA 1LJYA 1H09A 5A8OA 1GVYA 1NH6A 3M07A 1HKJA 4UQDA 5IFPA 4C7DA 4AY1A 1GW1A 3RJYA 4P7RA 4GZEA 5KEZA 1CLXA 2OYMA 2XSAA 3A4XA 4F9DA 3AS0A 2E8ZA 4CVUA 1HKMA 2J7BA 4XUYA 4JIEA 3W82A 3BAJA 3DHPA 5JBEA 3AS3A 3SCRA 2AMGA 4CN1A 1JFXA 4FK9A 1AMYA 3JUGA 4FLSA 4MB5A 3WH9A 3WH8A 5D8ZA 4UZSA 1EA9C 1HNYA 1BSIA 1ZL1A 4PMXA 1JZ3A 1UH2A 3K1DA 4DM1A 3TTQA 3AIVA 2BHZA 2BY0A 4PSPA 5DEZA 3AS1A 2QMKA 4PCSA 3HN3A 5BRQA 1E6SM 3CZ8A 2ZUWA 3N04A 5A6KA 3UERA 4CVWA 1UD3A 4TX6A 3WNMA 2ZXBA 2RGLA 2E9BA 3WD3A 4Z2HA 1HP4A 3FN9A 2OLHA 4P7LA 4PYSA 1XSKA 5E6ZA 3N12A 2PB1A 3FY1A 1DEDA 3SUWA 3AYSA 3WMSA 4DM2A 3MU7A 1UD6A 1XHGA 1JD9A 2ZX7A 4OBRA 3WIJA 2VX7A 4NRRA 1WAWA 5I78A 3TTOA 4MNKA 3CHDA 2W66A 3VIMA 5D9MA 3VIGA 4GO8A 1BTCA 1FP8A 2WXDM 2WZIA 2PWHA 5A6BA 1W1PA 2J7EA 9CGTA 4JFTA 4W88A 3VPLA 2J7HA 3ARRA 5DFAA 1DWHM 1ISXA 4H8HA 1CGUA 1NOUA 1UD5A 3AYRA 3K4DA 5M17A 1XRVA 3I3DA 1OT1A 4OUEA 4MDOA 2HVMA 4CN6A 1C93A 4OOZA 5BXRA 2QPSA 4GI9A 3THCA 2AAAA 2ZWZA 4H8VA 3N11A 2D0FA 3VMNA 3ALFA 4ZE4A 1IT0A 1E71M 3WF3A 3WFZA 3AIEA 1M7XA 1UD2A 2DDXA 4UZUA 2E8YA 1E6NA 1RP9A 2ZX8A 4JFUA 1BGAA 1HJSA 2RGMA 3LPGA 3AZSA 4J7RA 2ZUVA 2VX6A 3A6OA 2J74A 3LMYA 1UG6A 1E4IA 3UR7A 1EDTA 3EYPA 3L4WA 4WF7A 1FHDA 3VNYA 1WZAA 4PMUA 2JE8A 3KL3A 1CEOA 4CU7A 1CTNA 1CGYA 2G4FA 2X8RA 4W8LA 4AYSA 3AHYA 3B9DA 4PMVA 2PWGA 2WLZA 2YLLA 1UWIA 2WB5A 2WZEA 5CGMA 1ZBWA 2YL6A 1VIWA 2GSJA 1ECEA 4UFIA 3QGVA 2YLAA 2E40A 1B3VA 1SR0A 1L8NA 1NQ6A 3ARZA 1V3KA 3RO8A 5CLTA 5CG0A 3RJXA 5KZ6A 4CCEA 5CZKA 1H3GA 3VD9A 2WMKA 1JFHA 4N0RA 2TAAA 1QNRA 1WZMA 3O9NA 4PMNA 1ZBVA 3EBVA 3VIHA 3T0AA 2VCCA 4HU8A 2J47A 4AZ5A 4XX6A 3TONA 2WWCA 4UQBA 4TUFA 4CU6A 5CJ5A 2E0PA 2NSXA 2WSKA 1GQLA 3ZJ8A 4UTFA 5C8BB 3PZMA 1G9HA 3AMKA 4GQRA 5D4YA 1B9ZA 1MYRA 2VQTA 5HDRA 3AIUA 1OIFA 5E0FA 4IISA 2D2OA 2XVGA 1B3YA 4PUDA 2W91A 3WQWA 1V02E 5A6MA 1CLVA 2DSVA 3B9EA 5I0DA 2E9LA 4W93A 4AC1X 1K9EA 2GJXB 5CLWA 3GM8A 2G41A 4MAZA 1JAKA 2J77A 5FL0A 3I3EA 1W3LA 4TTUA 4ZXLA 2XFRA 3RM9A 2WKLA 4EK7A 5EFFA 5F7UA 3W6MA 3T08A 3MS8A 4IPLA 1GOKA 1B3XA 2E4TA 4KGJA 2G8ZA 2ESCA 4CN4A 2J25A 2PI6A 1OINA 4HMEA 2HISA 3KWXA 1BYAA 3VINA 2J79A 3LPPA 1BAGA 2XM1A 2BV9A 4HPGA 1LL6A 1KGXA 4BCEA 2Y8KA 3GNPA 4CCCA 3CUFA 3WQVA 3ARTA 1UKQA 3EMQA 3FHAA 1WDSA 3W28A 3FNDA 3BAWA 1UKSA 1GOQA 2WVTA 5HNNA 3NCOA 1Y7VA 5FIPA 1HX0A 4UNIA 2J4GA 5JH8A 3BSGA 3LPFA 1JZ2A 4XV0A 2QF8A 3EMCA 3MUZ1 1UWRA 2G3JA 3SCVA 2VURA 2WBGA 4UOZA 3WEOA 1H4PA 3IK2A 3VMOA 2JFEX 2BXZA 2DT1A 3BAKA 2BHYA 1XD1A 2DIJA 1EIBA 1UA3A 1V08A 3OGSA 1U33A 1O7AA 3UETA 5ABGA 5A8MA 2ZE0A 4FLOA 4ZENA 4WIWA 1GQIA 1S46A 2UY4A 4PTWA 4U5IA 4HA4A 1LWJA 1SMAA 3AMGA 2GK1A 4HP5A 1J0ZA 2BVYA 1CECA 4W8AA 1HJQA 1J9YA 3VGDA 5DO8A 4D6CA 4P7QA 4UOQA 1TFVA 1EXPA 2PBGA 5I77A 1LL4A 1CGXA 3WL0A 3WMCA 1UKOA 3L4ZA 1GZJA 4U2ZA 5CPSA 3B9AA 1NWUA 2GJPA 1H49A 1VENA 1ZJAA 2GVYA 3L4XA 4J3SA 5E09A 2WC7A 1XCXA 1SFSA 1ZU8A 4W89A 1GJUA 3B8SA 2D3NA 2WVSA 4WK9A 4JFVA 4W85A 2BHUA 1J12A 2VI0A 8CGTA 1KB3A 4GKLA 2Q8XA 3DECA 1MW2A 1CNVA 4AXNA 4RL3A 2VMFA 5AYBA 3MMUA 3U57A 4CU8A 2VZSA 1V0LA 2YL5A 4BA0A 4CCDA 3BAIA 2FH8A 2DSWA 2XJ7A 2J7DA 2Y4SA 4TVCA 2WAGA 2O9PA 4H7VA 4U3AA 4ATLA 2BY3A 1VFUA 1WP6A 4NSBA 1JNDA 4OIFA 4YHEA 3OA5A 3QOKA 1XH1A 1C8YA 5JBFA 3ARXA 3GXFA 1E6XM 3TOPA 4GXPA 5D9OA 4V2XA 4BQ4A 4S3JA 4GI8A 4B3LA 5A69A 3FAWA 1JDDA 2O9RA 3NSXA 5BXTA 2D22A 3PTQA 4YN5A 1XYZA 1OWQA 2VVNA 1UZ1A 1NOWA 1PX4A 1UR0A 4IPNB 4WKFA 4WSKA 1UD8A 3F5LA 4GO9A 2FHBA 3GZAA 1FH8A 4JHOA 4EAMA 4AMCA 1BLIA 4S3KA 3AMLA 4PMDA 1FHLA 1NP0A 3W26A 3RIKA 2VL4A 1CGTA 4KWUA 2IXUA 3CZGA 4M1RA 2VO5A 3WEZA 1AQ0A 1VJZA 1BYBA 3SCSA 4JZ5A 3L4YA 1UR9A 2BFGA 4GZIA 1FOBA 1XGZA 4CD5A 1JYWA 1KGWA 4GI6A 3EDEA 3MUY1 3WNKA 3PHAA 2JIWA 4D1IA 5A95A 1KQZA 1OD0A 1D3CA 4M80A 3AZTA 1JL8A 1OSEA 1VRXA 4P8UA 1WPCA 3T2OA 3GH4A 3UG4A 3MMWA 4M24A 3ARUA 1GPFA 1R7OA 2GJRA 1MW3A 5CPTA 3GNRA 1G0CA 3WQ5A 3MMDA 4MDPA 1W1VA 1NM9A 2WM0A 4PBGA 2ZUSA 4OKDA 4PUEA 3CIVA 4UR9A 1FH7A 1E6ZA 3AISA 4B9YA 4W5UA 3RM8A 4PMYA 1HF6A 1SYTA 3AMDA 1QNOA 1E6RA 4MADA 4HOWA 2DH3A 3F5KA 1C3FA 3NDZA 1W9VA 3OGRA 3AIWA 1UR4A 3T2PA 4HMCA 1Q6CA 1PPIA 4UCFA 3L2MA 4XB3A 4MNMA 2CITA 1GHRA 4JKMA 2J7CA 3WELA 1KXVA 3AXXA 3DC0A 2J7FA 3AOFA 4P7OA 4AD3A 3NDYA 1N82A 3WDQA 5M03A 3EDFA 2E9MA 5A6LA 1UHVA 5JBDA 1OT2A 3IAPA 3WD0A 1XYFA 1BG4A 4N42A 3GXIA 3NIYA 1W9XA 3ZJ7A 2UY5A 3ZSTA 7CGTA 1QNPA 1E55A 3IAQA 3WDHA 4D6DA 3W27A 3VD4A 5JIPA 2ZIDA 1DHKA 4URIA 3WF2A 1K9TA 4UFMA 2X0YA 4FMVA 3T0DA 3FXYA 2NT1A 1WE5A 3L4TA 2IUZA 4PMOA 4FF5A 4AIEA 1G01A 2DT0A 1H0GA 1DWFM 3SEPA 2WHJA 1B31A 1E5JA 4ZE5A 2W62A 3ZSSA 3WFLA 3SCQA 2D0HA 1A3HA 1V6VA 1UA7A 1QI4A 4NF7A 3WQ8A 2J75A 3AHTA 5LA0A 2XVNA 1XCWA 1H1NA 2BNJA 2VCAA 3WQ4A 3VIOA 4QCFA 1E4MM 2F61A 3OB8A 1MFUA 4R27A 4DUVA 3WNNA 1TR1A 2O9OA 5CXPA 4W8BA 1GCYA 3MUAA 3BMVA 1JNEA 5EFDA 5TD4A 5HPCA 2CBVA 4OBSA 2W92A 4UQCA 1KXHA 1G1YA 1EOMA 2X05A 1Q6FA 1E4NA 2OSWA 1BVZA 1WB0A 4JL2A 2QMJA 2EPNA 5E70A 5A8QA 5EBAA 3W81A 2DT3A 2YDQA 4CD8A 4PN2A 4Z2KA 4UQ9A 1UH4A 2GDUA 1W3JA 5GPRA 1FP9A 2JF6A 2GFTA 3U7VA 3W38A 3LPOA 1UZ4A 2X0HA 5A2AA 4QCEA 6CGTA 3BGAA 1K9FA 2PWDA 4Q7NA 2EQDA 4LYRA 2J8GA 2XVPA 3ZR5A 2EPKX 4NI3A 2ZOXA 1C92A 1US2A 1UD4A 1UQYA 2J8FA 3OG2A 4LX4A 3VTRA 3SCUA 3VGFA 2XFYA 3OLIA 1CIUA 3AICA 4XZWA 4YPJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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