3AQUA

Crystal structure of a class v chitinase from arabidopsis thaliana
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
TVVKASYWFPASEFPVTDIDSSLFTHLFCAFADLNSQTNQVTVSSANQPKFSTFTQTVQRRNPSVKTLLSIGGGIADKTAYASMASNPTSRKSFIDSSIRVARSYGFHGLDLDWEYPSSATEMTNFGTLLREWRSAVVAEASSSGKPRLLLAAAVFYSNNYYSVLYPVSAVASSLDWVNLMAYDFYGPGWSRVTGPPAALFDPSNAGPSGDAGTRSWIQAGLPAKKAVLGFPYYGYAWRLTNANSHSYYAPTTGAAISPDGSIGYGQIRKFIVDNGATTVYNSTVVGDYCYAGTNWIGYDDNQSIVTKVRYAKQRGLLGYFSWHVGADDNSGLSRAASQAWDAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A class V chitinase from Arabidopsis thaliana: gene responses, enzymatic properties, and crystallographic analysis
pubmed doi rcsb
molecule keywords At4g19810
molecule tags Hydrolase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 120
structure length 344
sequence length 344
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3aquA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aquA01
1HL8A 1OD8A 3FHQA 3WNKA 3VDHA 4BQ5A 2A3HA 2A3EA 1OM0A 1UQYA 1FOBA 1NOFA 3HN3A 1EIBA 2Y8KA 4J7RA 5EMYA 4FLSA 3OB8A 2W92A 5CQ1A 4P7NA 2ZX5A 2GUYA 2HISA 3ARQA 4TVDA 4AD0A 1UWRA 2WYSA 3BAWA 3KZSA 4U31A 2DGAA 5JBEA 4M8UA 2J4GA 2VMFA 2J7FA 1JYXA 5BWFA 1E40A 3SEPA 1KWGA 3WH7A 3DYPA 3ZJ7A 3WQ8A 1E56A 5IDIA 4TTGA 2WC4A 4M24A 2WVSA 2XPKA 1KXTA 1UZ1A 2B31A 2VCBA 1JFXA 2GJXA 3ZT6A 4CCDA 1QHZA 2WZEA 1XH2A 1S46A 2C8NA 3PZNA 1PX4A 4JFWA 4MB5A 5BXPA 1GQJA 4BQ2A 5A6KA 3F5KA 3UR7A 3WD0A 4P8UA 3WF0A 3T0DA 4NSBA 4MPKA 2BS9A 3MKKA 1W1VA 1JIBA 1O7AA 4CN6A 3SUWA 4XZWA 1OCQA 1VIWA 2G3IA 2XVPA 2ZWYA 2WCSA 4W93A 4AEEA 4NRSA 1HVXA 3MV01 3VIFA 1HJXA 4MDPA 1K6AA 3WF3A 3WUGA 4N0RA 2FDMA 3W82A 3RPMA 5JH8A 2GJRA 2WC7A 3PZVA 4LYQA 3VMOA 1W2VA 3GDBA 3N15A 4UOQA 3WNPA 1C7SA 1HJUA 5I6SA 3VILA 2PWFA 2YL5A 2XM2A 3FAWA 3WDQA 3AICA 2V38A 1UH3A 3EDEA 3CZEA 3WNLA 5FOOA 1YQ2A 2CEQA 4Z2LA 5D8WA 3WL0A 1BGAA 1UHVA 3AMGA 5BRQA 1SYTA 2J7HA 4J27A 4KRUA 2VX7A 2Z1SA 3LPFA 3MANA 3AOFA 1IZJA 4UR9A 1K9EA 3U7VA 4KRTA 3AXIA 5FKYA 4P7LA 3I3BA 5E0CA 4JL1A 1IV8A 2WVUA 3OGVA 4WK9A 1GOWA 3BAYA 4IPNB 5BYWA 4E8DA 3ZR6A 1IT0A 1MW0A 3AIBA 3FY1A 2YA1A 5A2CA 3AYRA 1XD1A 4D6IA 3IAQA 1U33A 1KR0A 3IJ7A 3ARWA 3GM8A 1J0KA 2GFTA 1E3ZA 1JXJA 5JIWA 2WPGA 3UR8A 2YDSA 1NH6A 1V02A 2DSUA 3VIPA 1BHGA 3BLPX 1P6WA 4IUGA 3CPUA 4C7GA 3VGEA 4NF7A 1GVIA 2ZWZA 1E0WA 3TONA 5KEZA 3VINA 4E2OA 2O9TA 4MNJA 1F4AA 2D0FA 1B3XA 3AROA 5AC4A 2D20A 3B8SA 1J0ZA 4JKKA 3ZQ9A 2BXZA 4W5ZA 1GQIA 6A3HA 1BSIA 1BYCA 3AIRA 4LGXA 4XUYA 2X05A 1OD0A 3FN9A 1CGUA 4Z2KA 4QLLA 1WDQA 1J0JA 2GVYA 1KCLA 3SCTA 1UOKA 3WEOA 4LYPA 3DHUA 4PUDA 3RM9A 1MFVA 3WF2A 4ML4A 5A6AA 1LG1A 1NQ6A 2FHCA 1PJ9A 2YA0A 2UY5A 3SUSA 1GORA 1V3JA 7A3HA 2D22A 3WBEA 3CTTA 4PMNA 2WB5A 3GXIA 4LQ1A 4F8XA 1EH9A 2F8QA 3WENA 3CMJA 3N1AA 5A94A 1HJWA 4QCEA 4FMVA 3TTOA 3F5JA 3AFBA 1EDGA 3K1DA 1JYWA 1ZBKA 2QPSA 4U2YA 2BNJA 1NWUA 2G3NA 4LYRA 2WHKA 1UZ4A 4OZOA 1NOWA 2VURA 1UKPA 3NCOA 3ZOAA 1QHPA 2WW5A 2XFFA 4AD3A 1UG6A 1TA3B 5CGTA 4AY1A 1MXGA 1DWFM 3L2MA 1V3MA 2YJQA 3LMYA 1HNYA 2O9RA 3PHAA 4F66A 5D9NA 2G3JA 1ISVA 4MAVA 3VD7A 1W9PA 1HKMA 3IJ9A 2XJ7A 3SUVA 5A6LA 3SIMA 3WBAA 1KB3A 1H0GA 4JIEA 1QW8A 4PTXA 3AXHA 3L4YA 4J3UA 4UFKA 3WIJA 5IFPA 5LYRA 1R7OA 4AZ5A 4RE2A 4GI9A 3OZPA 4UQCA 2WVVB 1QI2A 1V0LA 1XYFA 1SMDA 3W24A 1VEOA 2Y4SA 3ZJ8A 3D3AA 3UETA 2X09A 1MQQA 1W9DM 4PTMA 3CH9A 1LQ0A 1N82A 2J7CA 1CGWA 3EMCA 5I77A 3WNNA 3VDAA 1UWTA 2V3EA 1UKTA 5C70A 3RILA 4ACZB 1J10A 3BMVA 1XH0A 2W4XA 3WQ6A 1CTNA 3BC9A 3ZJ6A 1VENA 4MTVA 1F4HA 2WMIB 4M81A 3VMPA 3BCDA 2DSKA 3UERA 2VX6A 1H2JA 1E9LA 1ZB5A 3FAXA 1W9VA 3OLIA 2Y24A 5D9OA 1GPFA 2CCRA 4HTYA 4OBRA 1JI1A 2IXVA 2YA2A 1R7AA 3K4AA 5EFFA 1UR1A 1KGWA 3CHEA 2O92A 1H3GA 1JZ7A 5BRPA 1IZKA 5IHRA 2ZUNA 2ZUTA 3GTNA 2PWEA 4V28A 2DT1A 1TVNA 2C0HA 1QI5A 1TG7A 1MQPA 4GZIA 3EDJA 3PZTA 4AXNA 1PIGA 2CKSA 2J7DA 2WMKA 4DM2A 4X9YA 1XV8A 2VQUA 3HMCA 4WJXA 1M01A 4B3LA 4WSKA 2YBUA 1JNDA 1H09A 3QHMA 2FH6A 5DMYA 1G94A 2ZICA 1BGGA 1GUVA 3SUUA 1W9BM 1SFSA 1WDPA 1NOUA 4E4PA 1V0NA 1JDAA 1UD2A 1E0VA 3WUBA 4GXPA 2BV9A 4ZENA 2FHBA 1CLXA 1VFUA 4PTWA 4CVUA 4GIAA 3VTRA 2Y5EA 3AIWA 1Y7VA 1LL4A 4CCEA 4BZYA 3SCUA 3UEQA 2JE8A 3GH4A 1HKKA 1GNXA 1NM9A 1VBUA 1Q6GA 1QW9A 2BVTA 1B31A 1UD8A 3GBEA 5I78A 3TP4A 5CXPA 3W6MA 1LL6A 1GOOA 3L4WA 3VUPA 1HF6A 1ITCA 1B2YA 5AC5A 1HP5A 3SUTA 2WAGA 5JBDA 1B90A 4Z2JA 5A6JA 5FD0A 3QHOA 1ZS2A 3M6DA 4AZCA 2CKRA 2D3NA 4PTVA 2VZVA 3RCNA 2ZXBA 1JZ5A 3RM8A 4DWSB 4AZBA 1AQMA 1RD6A 3GH5A 2CHNA 2VVSA 5AYIA 3BXWA 3S6TA 2VR4A 2D2OA 2XHYA 2XG9A 2NW0A 1KGUA 1DHKA 1I1XA 1EO7A 4PCTA 3W29A 2EQDA 2WC3A 2IUZA 1I75A 2WK2A 1PX8A 4DWSD 1E4MM 1E72M 3I3DA 5JIPA 4GPNA 5CSYA 2A3CA 1RH9A 2J47A 4V2XA 1SMAA 1QNSA 2ZOXA 1E1FA 4GI6A 6TAAA 3L4UA 4BS0A 3BH4A 4PBGA 1WPCA 3VD4A 3CMGA 1GVYA 5HBFA 1WZMA 3AZTA 1G9HA 3NSMA 4PMXA 4UZUA 3K46A 1HIZA 2VCAA 4JFTA 1NP0A 3CZGA 2QPUA 1AQ0A 5DF0A 2DT2A 1E15A 4QLKA 1EHAA 2D24A 3O6AA 2GK1A 4MJ2A 2WZHA 2DPEA 4D6HA 4UFHA 1ZJBA 4MADA 3VDCA 2E8ZA 3WNMA 4P7RA 4XV0A 1MW1A 3EDKA 8A3HA 2JIEA 4MNLA 1V6VA 1JL8A 4HPGA 5A8PA 4B9ZA 3VIJA 4YPJA 1H49A 5HOSA 3N12A 3IK2A 3T0BA 4IM4A 3WEZA 2AOSA 1KGXA 3VMNA 3GNPA 1VRXA 1RP8A 1KQYA 2XSBA 3GZAA 1XCWA 2C7FA 5A2AA 3NUKA 3W27A 3ARSA 3NSNA 4DUXA 1H0IA 4P7QA 2BVDA 4TX8A 1DWAM 1ESWA 3KL0A 1BYDA 1JDCA 2EPKX 1GOMA 4CD5A 2DIJA 3VIKA 1LJYA 1G1YA 1TUXA 3FHAA 1QNRA 1BQCA 2VR5A 1MYRA 4AD4A 1PZ3A 3UG3A 3BAXA 3SURA 1V6UA 1AVAA 3W81A 3G6MA 3AHXA 4D72A 5A6BA 3PTMA 1V02E 1ZL1A 4OBSA 4M82A 1V3LA 3T2OA 1KFWA 1D7FA 3WDJA 1LL7A 1HX0A 4M80A 3KE0A 4HU8A 5GPRA 3GBDA 4Y7EA 4AW7A 1MWOA 5D4YA 3W0KA 2YL9A 3AMDA 2WBKA 1OIFA 3OGRA 4RE4A 3DYMA 4IISA 3WMCA 5FIPA 3ARYA 1E6ZA 1A3HA 1G5AA 4PMDA 2EBNA 3WF1A 1E1EA 3U5YA 1EHNA 3W26A 5TD4A 1DWHM 2V5CA 1BTCA 1J11A 3CIVA 3AIUA 2D0HA 3G6LA 2DSVA 5LA0A 1V6YA 2JF7A 1W32A 4AD2A 3CUIA 1SR0A 1PPIA 2DEPA 4UFJA 1OIMA 2VVNA 2CERA 1R85A 4JFUA 2VC9A 3AIQA 4WLCA 3PZUA 3GNRA 4J3SA 1CXKA 1VEPA 3N17A 1GJUA 2Y2WA 4UFLA 4CVWA 5E9AA 3RDKA 1B0IA 4PMVA 1EOKA 4D6EA 2UY4A 3B9DA 4URIA 2X1IA 4GQRA 2WWCA 2QHAA 2ZE0A 1K9DA 2G41A 3DYOA 1VF8A 1OGBA 3VGDA 2GDVA 5F7UA 5JBFA 5CSUA 2W67A 4PMOA 3THDA 1E3XA 2W61A 2UY3A 3PZGA 2ZUUA 3K8KA 3IAPA 1VJZA 2D3LA 4QP0A 4TUFA 1BPLB 2VI0A 4XX6A 1CNVA 4AIUA 4AZGA 1GZJA 2CYGA 2XWDA 4H8VA 1DP0A 4W85A 4HZ7A 3NJ3A 1AQHA 3KL5A 2ZX8A 3WH6A 5HXMA 3WD2A 3QGVA 1B30A 4UCFA 1K9TA 1EGZA 4Z2IA 2OSWA 2J79A 3K8LA 4B3KA 2G3MA 3BSGA 4AIOA 4D6GA 5ABHA 1Z32X 5FCZA 3AJ7A 1DTUA 3ARXA 4AMCA 4PRWA 1EQPA 3VX1A 4TOQA 1KQZA 2VRJA 1QI0A 3VPLA 3JUGA 1GHSA 1JG9A 2OYLA 4R27A 3ZO9A 4N42A 2VUYA 4ZEPA 5BCAA 3VX0A 1OT2A 1JFHA 4GO8A 3N13A 4QLJA 5BROA 1GHRA 3VGBA 1DWGM 3BGAA 2PF0A 1QNOA 5CGMA 4FF5A 4CN1A 1D2KA 3PBGA 3CUHA 4FLRA 3POCA 3THCA 2D0GA 1C90A 4AD5A 1E71M 1UKOA 5E70A 3ZT7A 4KGLA 1DWIM 1CXIA 1CXLA 1Q4NX 1HJVA 5AYBA 1H1NA 2WKGA 4CUCA 4AWEA 1C8XA 1W3HA 4W7WA 2BXYA 1CGTA 1JGIA 4DM1A 3CLWA 1CDGA 3AHYA 2QV4A 2JIWA 2OYKA 3RM4A 1XGZA 3GYCA 1FHDA 4A3YA 3ARTA 2E9MA 5E6YA 4AEFA 5ABFA 3VDBA 1JD7A 1UR2A 2DQXA 1NP2A 3MO4A 2J8GA 1HJSA 1UWIA 3GXDA 4OOZA 1JZ6A 3NYDA 1QI3A 4OJYA 4XB3A 3NIYA 4UFMA 1XCXA 3A4WA 3MUZ1 3W37A 1GOIA 1NARA 1V03A 3BCFA 5I3DA 2BFGA 3WDRA 4CGTA 1WO2A 4KH2A 4MDOA 1VJSA 2XWEA 2DIEA 3EBVA 5E6ZA 2WMGA 3UESA 2WLYA 4OKDA 1C93A 1B9ZA 2JFEX 3TTSA 3WQVA 3WH9A 4YN5A 4JFVA 3WN6A 4H8UA 2ZX9A 2OYMA 1JZ3A 1I1WA 1ZBCA 3AMKA 3L2LA 2ZXAA 5I23A 1OINA 3PTQA 1V08A 4W8LA 2G8ZA 3ZMRA 3AISA 3CZJA 1C91A 1KCKA 4TTUA 4NI3A 3L4VA 1Q6FA 2XM1A 1QBBA 3GH7A 4BF7A 1E6RA 5CPTA 4OUEA 2OWXA 3W38A 2QLYA 3CZ8A 1MVYA 2A3BA 4W86A 4LX4A 4AC1X 4AZCB 2G4FA 2OWCA 1CXHA 1NWSA 1E73M 5A1AA 5I79A 2ZUMA 2GJPA 1NWTA 2ZUSA 5D9MA 4CN4A 4PYSA 1ITXA 2YBTA 1E6PA 2CBJA 9CGTA 4J3TA 5IFTA 1WZLA 4NZCA 1M53A 4AISA 2EJ1A 3EYPA 3SCVA 2J77A 4CKQA 3ECQA 4X0NA 1XSIA 4ZXOA 4WIWA 2PC8A 4JHOA 3J7HA 4U3AA 2YDRA 1EA9C 1W1TA 3D5HA 2VRQA 5CPSA 3PZIA 1TVPA 4AYSA 4P8WA 4BQ3A 2CHOA 3AMCA 3VGFA 3ARZA 3BMWA 1CEOA 2XTKA 3RO8A 3WH8A 2CPUA 4KMQA 4TXEA 4AZHA 3WF4A 3ZR5A 2EXOA 2WXDM 4PMQA 2XGBA 4E8CA 2PWHA 4JL2A 2CIPA 3CUGA 2J8FA 1OT1A 3VM5A 4M56A 3A6OA 1UD6A 3QHNA 1JAKA 1UR8A 4W8AA 1A47A 2YOCA 3W53A 1L8NA 4HZ6A 3IJ8A 1ODUA 3AQUA 3ZIZA 3ZSSA 4GINA 2VX4A 4GQQA 4UOZA 1ZJAA 2GK1B 1LWJA 4M29A 1VFFA 3U7BA 2D23A 3VIMA 4TVCA 4U5IA 3QR3A 2WHLA 2WVVA 4P8XA 1BG9A 1J0IA 4AIEA 3AS3A 3L4TA 3K4DA 3MMWA 4IPLA 4W8BA 4U33A 2CETA 4CD8A 3N9KA 1CGVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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