3CHCA

Crystal structure of aspergillus fumigatus chitinase b1 in complex with monopeptide
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based dissection of the natural product cyclopentapeptide chitinase inhibitor argifin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 147
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3chcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3chcA01
4GZEA 3CZJA 1HJVA 4W89A 3RM8A 3WBAA 3NSNA 5M03A 2PWDA 5BXPA 2JF6A 3AHTA 2VZTA 1CGWA 2D3LA 1UUQA 1NWSA 1E6NA 2J4GA 3TOPA 2EBNA 3AHXA 1B2YA 3GXMA 1V08A 2OSXA 2J25A 4RL3A 5BRPA 1HVXA 3AZSA 3DYPA 1PPIA 1U30A 3PZOA 2J75A 1J10A 1E0WA 1CXFA 1E4NA 2YA0A 4MDOA 3AXIA 3T09A 1QI5A 3VM5A 1LL4A 4KGLA 1UD2A 3RILA 2WM0A 2DSVA 4UNIA 2XG9A 4B16A 1TA3B 2VRQA 2GSJA 1LG1A 1HJXA 3APGA 4RE3A 1GONA 3WF3A 3VX0A 3NSMA 3OLIA 4H04A 1UWIA 1JAKA 3BXWA 1E5NA 1UZ1A 1FH7A 1MQRA 2J7EA 1GVIA 1CNVA 1JDAA 1XSJA 1CWYA 4RE2A 1BAGA 1BYBA 3L4YA 1CXKA 3ZOAA 1J0HA 5DT7A 1E1EA 1UD8A 1FHLA 2VQTA 4P7RA 5BXRA 2WVUA 2V5DA 3VX1A 3IANA 1XV8A 3WENA 1QI3A 2CYGA 1M7XA 4HMEA 3WD4A 4PCTA 1A3HA 3CMJA 1O6IA 3VINA 1CXLA 3W6MA 5HBFA 3W28A 1EDQA 4UQ9A 1Q6GA 3WEOA 2E4TA 3HMCA 5AC5A 3WH6A 3NDYA 1B90A 5I78A 4M81A 1QI4A 3ZJ6A 1ISXA 1UR8A 2VR4A 5TD4A 3OG2A 1B3XA 1EHAA 3MV11 4QAWA 4CU6A 4L4OA 2ZUSA 4TVDA 4E4PA 3ZT7A 3AICA 3AMCA 3K46A 4DUWA 1G0CA 1HN1A 3CUHA 1KR1A 3CTTA 2BV9A 1HKIA 2YJQA 1XH0A 5LA2A 1M53A 3RIKA 1E55A 1UYQA 4QFUA 4MJ4A 1J0ZA 4MAVA 3K8KA 1JZ8A 3BGAA 2ZWZA 2WMGA 2WNWA 3RJYA 2X2YA 1V3JA 4EAMA 1K9DA 5A8QA 1VFUA 3WDPP 2OWWA 1G94A 2X8RA 1C7SA 5E9AA 4AD0A 2E9BA 4KGJA 4LYQA 2DT0A 5A8OA 1GVYA 5I0DA 4J3TA 3NCOA 1MQPA 3SCPA 4B3LA 1CIUA 3BAWA 1LL7A 3EYPA 1UKOA 3WF0A 3PN8A 1OGBA 2VX6A 4F8XA 3OLEA 2BVYA 3PBGA 4AEEA 2VVSA 3PTMA 5BYWA 3OGRA 4PMOA 3POCA 2XWEA 2Y4SA 4IPLA 4ZE4A 1V3MA 1XYZA 3ARUA 2VC9A 2JEPA 3VD7A 1KXTA 2CBVA 4W7WA 1JAEA 4C7DA 1NQ6A 3BAIA 3ZQ9A 1CZ1A 2DIJA 1PZ3A 2ZUTA 5CPQA 1Y7VA 3WL1A 4TUFA 1KBBA 3KL5A 4WSJA 5D8ZA 3ZJ8A 3HJEA 3W24A 3SEPA 2CHOA 4AZCA 3VOCA 1XSIA 5FD0A 3RM4A 4OKDA 1B0IA 3VGBA 1NP0A 1WZMA 5LA1A 3AS2A 4TX8A 4ZXLA 2YOCA 4W7UA 3VIGA 1EO7A 1E6ZA 4C7FA 3PHAA 2ESCA 3VKKA 5D9OA 3VDBA 1R87A 3VDCA 2CBIA 1C92A 4NZCA 3AOFA 1Q6FA 3WFLA 5D4YA 3WDQA 1JF6A 4JAWA 2GFTA 4LYRA 4UOZA 4HU8A 4AY1A 1BFNA 2VRKA 4P8VA 4JFSA 4URIA 4AISA 4EANA 2CETA 2YDQA 3GNPA 4GI6A 2VR5A 4HA1A 4FLOA 3M6DA 1B1YA 3MUIA 4M29A 4W86A 4JFTA 1AQ0A 4M24A 1V3IA 1B3YA 2EPOA 2FGLA 1DP0A 3NJ3A 1GOMA 2XVGA 4PMNA 1HL8A 1EOMA 2VCBA 3S6TA 2YKKA 1TFVA 3RJXA 3AISA 3AMDA 4B3KA 3KWXA 2BHYA 1IZKA 5EMYA 4JHOA 2C8NA 1UWTA 3K4AA 1W2VA 1FFQA 1TMQA 4CU8A 3G6LA 2X09A 4S3JA 3GXDA 4N0RA 1NARA 4W7VA 5DO8A 4NI3A 3WMBA 3WBEA 3VIOA 1MW2A 3W38A 5A3HA 3WQ5A 2BVTA 2X0HA 1L0PA 4GZJA 2XSAA 2EO7A 1UH3A 3WKZA 3M07A 3MKKA 1R7AA 3CMGA 1JYWA 1I75A 2ZXBA 4E2OA 2WHKA 3LPGA 1Q6EA 1TUXA 2ZX5A 3WNLA 1BVNP 1WAWA 1D3CA 5E6ZA 4WK9A 1O7AA 4PMRA 4MNKA 5IFPA 1OD0A 1JDCA 5CXPA 3ARXA 4QCEA 2WLYA 1MXDA 3A4XA 4DWSA 2DT2A 3BAKA 2O9OA 2ZX7A 1FHDA 1ODUA 2WBKA 3CZKA 3E1F1 3SCWA 1K9TA 1UHVA 5A2CA 9CGTA 2W67A 1AVAA 4J3WA 3W26A 1W3HA 1OGSA 4DUXA 3NUKA 3CLWA 3QGVA 5BCAA 4U5IA 4GI8A 2PC8A 2NT0A 3QHMA 2ZIDA 1VFOA 1ITCA 3WD0A 1VB9A 4PCSA 3T2PA 3WSUA 5ABGA 2GK1B 4V27A 3SCSA 1TVPA 1UH4A 1W9BM 2ZX8A 2W91A 4AIOA 2W92A 2XIBA 4PMUA 4U2ZA 1EQCA 1KB3A 2WMKA 3W6LA 5FIPA 1WB0A 4AZCB 4HTYA 2YL8A 3DECA 5A95A 3LPFA 2A3BA 1OWQA 5DEZA 1E9LA 2W5FA 3ZT5A 4V28A 3WN6A 1VF8A 1V3HA 3W29A 5A6BA 1XSKA 4Y7EA 1B9ZA 2ZICA 3FN9A 5CGMA 2WCSA 5A6AA 2D0GA 5E0CA 4MADA 4ACZA 2D0FA 2YA1A 4D71A 2ZUNA 4PMXA 2W66A 4E8DA 2ZE0A 1HKKA 3M7SA 3QOMA 3AHZA 1UKSA 4IPNB 2O9PA 4D6IA 2XGIA 1W9UA 4PTMA 3BAJA 2AMGA 3N04A 2WXDM 2WZHA 4HOZA 2VURA 1F4HA 4UFIA 1ZBVA 1QI0A 5BWFA 3TA9A 5E6YA 2NT1A 3WNMA 4ML4A 2ZUVA 1U2YA 1ECEA 5JIPA 3AI0A 1UR9A 4MTVA 2DQXA 3G6MA 1BG9A 3GDBA 2WW5A 4PSPA 3GBDA 1BF2A 3CH9A 2BY3A 2YDRA 3TTOA 1GOWA 1CXIA 1BQCA 1VEMA 2WB5A 1EXPA 1UWRA 3T08A 5FCZA 7A3HA 4D6CA 2D22A 1EIBA 3IJ7A 2OWCA 3RO8A 4EKJA 1RP9A 3DC0A 2VI0A 1FH8A 2GDUA 2OWXA 1OIFA 2BVDA 3SCTA 2F61A 4W5ZA 1JXKA 1GJUA 3WDRA 3WQ8A 3SUSA 4P7QA 2WPGA 3O2LA 1NWUA 3OZPA 1ITXA 2WHMA 3AYRA 3UEQA 2J7CA 1VIWA 1W9PA 1QW8A 2EPMX 4D6FA 3RDKA 2PBOA 3BSHA 4FMVA 1TR1A 1HKJA 1FFRA 1IT0A 3M46A 1RPKA 1XD0A 1KBKA 2VX4A 4JKLA 2HVMA 1XGZA 3U57A 3OZOA 3ECQA 1QNOA 2VUYA 1CENA 2BFGA 3PZNA 3ZO9A 1V6VA 4Z2GA 3CHDA 1HX0A 2QMKA 5M3WA 3J7HA 1U33A 4AC1X 1MVYA 4V2XA 4W88A 1OD8A 4UOJA 1WNOA 2JFEX 4ZE5A 4GXPA 5E70A 1VENA 2GJXB 3MV01 1WP6A 1UR1A 4H7VA 1HP4A 3N18A 4NRSA 5LYRA 2V3EA 2DEPA 2CKRA 1EQPA 3AIEA 2UY2A 3OA5A 4AW7A 3CPUA 4JFWA 3PZMA 4BA0A 4J28A 5CZKA 3CZLA 4ZEPA 2V3FA 4FLRA 3MSDA 5AY7A 2Z1KA 1UWQA 3K4DA 1HT6A 4W8LA 1NH6A 4CVUA 4PN2A 3GZAA 4JKKA 3AHVA 2MANA 1ESWA 5GNXA 1MFUA 3WUGA 4F79A 1SYTA 1EHNA 2J77A 4DM2A 2DH2A 1ZU8A 3BAYA 1MW1A 4A4AA 3N12A 1V02A 4BS0A 4CCEA 4JL1A 5D9MA 2WCAA 2WMIB 3VTRA 3W82A 3AIBA 2J78A 4J7RA 4Q7NA 2CBUA 1V03A 1SMDA 4U2YA 4ACZB 4ZFMA 4P8UA 3AYSA 3EDJA 3WMCA 2X1IA 1W3KA 1E56A 1QI2A 3AROA 1B31A 3MUAA 1HP5A 3VNZA 4P7LA 3AIUA 4AZIA 5A94A 1X6LA 1UQZA 1E0XA 5GPRA 3WFZA 3VU2A 2QMJA 5AC4A 3W37A 2AAAA 2ZXQA 1OM0A 1S46A 2VX7A 3SCUA 4D6HA 4UOQA 1KGWA 4UQEA 2CERA 1VRXA 2WMJA 2E8YA 4KWUA 2VCAA 3O6AA 3I3BA 4CUCA 5IHSA 1H1NA 2BHZA 3EMCA 5E0FA 3VM7A 5A8NA 3BLPX 2J7BA 4GINA 4AZGA 3BMVA 5CPTA 3VDAA 4AD3A 1WDPA 4FK9A 1CTNA 1KCKA 3ARWA 4ACYA 2ZWYA 4BQ5A 1BGGA 3QHOA 1US3A 3D3AA 2J7DA 3GXIA 3T0DA 3BAXA 3MUZ1 4S3KA 3BMWA 5BXSA 1LF1A 1V0MA 4JZ5A 4PSRA 4LGXA 4D6JA 4UQCA 3FAXA 3DYOA 3UG4A 2E40A 3I3EA 3WF2A 1W1PA 4CN6A 3BCFA 5DT5A 2YLAA 1YHTA 5C70A 1E4MM 1VBRA 1OT2A 4LQ1A 4U33A 1RD6A 5CG0A 4MAZA 1GQJA 2B31A 2VL4A 4M56A 3BSGA 2CCRA 2VMFA 3VGEA 1WDRA 5D9NA 1HJUA 3MMWA 3IAPA 7TAAA 3ZSSA 3A4WA 3WIJA 2QF8A 2CITA 4QLJA 3VILA 1D2KA 3A47A 4J3VA 3SIMA 1WKYA 1PIGA 2V3DA 3CHEA 1C93A 1LWHA 3SUUA 2DT1A 1E6SM 4WKHA 2UY5A 3RMEA 4HA3A 1MW0A 2ZXAA 2G3NA 2FHCA 1H11A 4PMDA 3MMUA 3S2CA 2XIIA 3UETA 3GH5A 1QOXA 1UQYA 4OBRA 3GH7A 4AIEA 1G1YA 2WWCA 4NSBA 4LXFA 1HKMA 3MSGA 1BTCA 3SCVA 3L4XA 1C8YA 1CECA 3IAQA 4AD2A 1W2PA 2DDXA 5ABFA 3MANA 1MW3A 4HMCA 1HF6A 3EDDA 5ABHA 1AMYA 1KQYA 3F5KA 4UR9A 2DT3A 2EPLX 4K68A 2XYLA 2WC7A 3GBEA 4QLKA 5CQ1A 4OOZA 3VPLA 3AIRA 4W93A 1LLOA 3ZJ7A 3WH8A 5JBEA 5IHRA 1ISZA 1CGTA 1XHGA 3ZJKA 4BQ4A 1CXHA 5JH8A 3D5HA 1V0KA 4PEEA 1R86A 2Y8KA 2WKLA 2VZUA 4H2CA 3U5YA 4HMDA 3GM8A 2JF7A 4PMZA 5FL0A 3PZQA 1PX4A 2J79A 2DH3A 4UCFA 2JE8A 1E6RA 3W27A 4M82A 3VGDA 1W3LA 1CYGA 3WUFA 3ARPA 2WZIA 3ZR6A 3TTQA 5HDRA 2WCGA 1LG2A 3I3DA 3EMZA 4FF5A 4Z2HA 2HISA 3VO0A 3PZVA 4AXNA 1ZL1A 3WNNA 1ISVA 3GNRA 5M5DA 1R7OA 1ZJBA 4DUVA 1V6YA 1L8NA 3HN3A 3THDA 4PUDA 2VNCA 1QNSA 2CEQA 1KQZA 3O9NA 1GQKA 1UD5A 2CPUA 2XHYA 1JZ6A 1UOKA 5A6MA 1QW9A 1W1VA 1BYCA 1ZBCA 4WKAA 2J8GA 1ODZA 3T2QA 1IZJA 3LPOA 2PB1A 1KCLA 3EDKA 1BYDA 4XV0A 4XZBA 1CDGA 4JFVA 4OJYA 1BLIA 1W9VA 2C7FA 4U3AA 4R27A 5AYIA 1E73M 2XJ7A 1ZB5A 2D1ZA 4UFLA 2UWFA 2XVPA 3EDFA 3HU7A 3ZT6A 4WJXA 1FOBA 3EMQA 3WUEA 4MB4A 4BQ2A 1BGAA 1XYFA 1GOQA 1VFFA 2VJXA 4PYSA 1UR4A 3WNPA 1YQ2A 4AIUA 4HZ6A 1B3WA 4F66A 3NDZA 1J18A 2IXUA 5I2UA 5GQBA 1DTUA 3UG3A 2PWEA 3UCQA 2X05A 3CHFA 1JZ7A 4F9DA 4CCCA 1UD4A 4OZOA 4ZXOA 5AYBA 3DHUA 1GZJA 2FHFA 3N15A 3AFBA 1CLXA 1UR2A 4HPGA 2FDMA 2W62A 5I6SA 4PBGA 1MYRA 1CLVA 3KE0A 3T0BA 2W63A 2X0YA 2NSXA 5HPCA 1MQQA 1DWIM 1K9EA 1PX3A 2O9RA 3PTQA 3N9KA 1OBAA 1GUVA 5E09A 3FW6A 1C90A 1UD3A 3AMLA 2XFFA 4BZYA 3CIVA 4CD8A 3WH5A 3VGGA 1Q4NX 1UWSA 2QV4A 1GCYA 4XUYA 1J9YA 1LL6A 5HOSA 1I1XA 4CCDA 2JALA 1H0GA 4ATWA 1H4PA 4Z2JA 2OYKA 1VJSA 3VIIA 2XGBA 1M01A 2GDVA 1SMAA 2WHJA 1J0IA 4BQ3A 1V0NA 2ZUMA 1ISWA 1FP9A 4U3CA 4HPHA 1LWJA 3SUWA 1NOUA 2YL9A 3OB8A 2WAGA 3UR8A 4AZBA 1DEDA 1UA7A 3OGSA 1JD9A 1TZ7A 1E0VA 1TA3A 1HIZA 1BPLB 3KL0A 4XX6A 5BXTA 3VDHA 2CNCA 2EQDA 2ZOXA 3UR7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KR0 A;  4FLQ A;  4L4P A;  5DFA A;  5F7U A;  2YBU A;  4UFJ A;  3W81 A;  4AEF A;  1WZK A;  3FAW A;  3LPP A;  1QPK A;  1JGI A;  2WVT A;  4MJ2 A;  1CGX A;  3ZIZ A;  1E5J A;  1JYV A;  3AIV A;  2WZE A;  1QHO A;  4R5E A;  3SCR A;  1B3V A;  1WO2 A;  2ZUW A;  1RP8 A;  4X9Y A;  3AZR A;  3ZMR A;  3QOK A;  1OIN A;  1SR0 A;  4CD5 A;  3TON A;  7CGT A;  1EDT A;  4XZW A;  1M03 A;  2VZS A;  1H5V A;  1OCQ A;  2V5C A;  2BY2 A;  3K1D A;  1DWG M;  2WC3 A;  2D23 A;  3FHA A;  6CGT A;  2PWF A;  4CD7 A;  2ZXD A;  3A4A A;  4AD1 A;  2WYS A;  1UKP A;  4CVW A;  2PBG A;  2E3Z A;  3ZM8 A;  4TXE A;  2YDS A;  2J8F A;  5HXM A;  5A6L A;  1GOK A;  3MUY 1;  2O92 A;  2VRJ A;  3SUV A;  3ARZ A;  1HJW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GZE A;  5HW8 A;  4IFK B;  1HJV A;  5LNW A;  5M03 A;  2PWD A;  5BXP A;  2JF6 A;  1F3W A;  4KES A;  2D3L A;  3QPZ A;  1NWS A;  5K4X A;  2J4G A;  3TOP A;  3EWW A;  4RE0 A;  4XD5 A;  3AHX A;  5JQ9 A;  3S6O A;  4BK9 A;  4AVN A;  2OSX A;  1ROT A;  2QCD A;  3URB A;  4G7E B;  3N6J A;  2CHR A;  1G4T A;  1TPU A;  1NF0 A;  4FX7 A;  2VD8 A;  2P53 A;  3VM5 A;  1LL4 A;  2AL2 B;  3RIL A;  2P5N A;  2MPH A;  1GVO A;  2VRQ A;  1E1C B;  1W8S A;  2GUB A;  4I7V A;  1GON A;  4ZMG A;  2YBV A;  3VX0 A;  2X1R A;  1ZHA A;  1KC7 A;  1UWI A;  4ADU A;  4NL1 A;  3CYJ A;  1E5N A;  4Q8V A;  4GC3 A;  4IGN A;  3K2G A;  1DJZ A;  4RE2 A;  1BAG A;  4TMB A;  1B57 A;  3G77 A;  1E1E A;  4A3R A;  1JPK A;  2FTW A;  1DTN A;  4P7R A;  1EJT C;  4NAE B;  3PY2 A;  2V5D A;  5BMW A;  1ZLP A;  4DIP A;  4TYO A;  2YYT A;  4JYE A;  5CC3 A;  1W17 A;  1FWH C;  1V77 A;  2CYG A;  3OG3 A;  5D02 A;  2I57 A;  1EC9 A;  3CMJ A;  4AHP A;  2Y6Z A;  4XZ9 A;  1EC7 A;  1G69 A;  5FI8 A;  3SRH A;  3VIN A;  6PTD A;  3K13 A;  4MZY A;  5F2I A;  1YBQ B;  4ML9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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