3CHCA

Crystal structure of aspergillus fumigatus chitinase b1 in complex with monopeptide
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based dissection of the natural product cyclopentapeptide chitinase inhibitor argifin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 147
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3chcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3chcA01
4HMDA 1XCXA 2X1IA 2VJXA 2VQUA 1JFXA 2GJRA 1SFSA 3VD5A 4A3HA 3W0KA 1AQ0A 1ZB5A 3QHOA 1F4HA 2A3CA 3B9AA 5KZ6A 1WPCA 5CPQA 4PCTA 3WMCA 2YDSA 4HP5A 4D6GA 1E3XA 4IPLA 2WZIA 1Q4NX 5FKYA 1HXJA 3GXIA 3BAYA 3PZNA 4JIEA 4HZ7A 1EDQA 2VMFA 2WPGA 1VBUA 3ZT7A 3KL3A 4PRWA 3DECA 1PJ9A 4UFHA 1R7OA 4LYPA 3KEHA 2O9PA 1QNSA 2ZWYA 4S3JA 3TTYA 4EKJA 4GKLA 4WSKA 3HMCA 4F9JA 3GH5A 1UOKA 1VFFA 2Q8XA 2J62A 2JF6A 2JALA 5FL0A 4ZE5A 5EFDA 1UHVA 1V3HA 3CMJA 3TTSA 6CGTA 2WCSA 4PMDA 4ZXOA 5IHRA 4ATLA 4KRUA 2ESCA 1VF8A 4TVDA 4ZE4A 3QOKA 1UKSA 5A2CA 3WF1A 2D20A 2YDQA 1UKPA 1WB0A 1GOOA 1JYXA 2EQDA 3ARPA 4W8LA 4A4AA 1XSKA 4MB5A 3A6OA 3WDIA 1TFVA 4IPNB 2OYMA 3WMSA 4IISA 1DWHM 3M46A 5I2UA 3NDZA 1PIGA 3PZQA 4R5EA 1MQPA 1GQKA 1L0PA 2J7HA 1NARA 5CGTA 4MDPA 3IANA 5CLTA 3AROA 3NYDA 4AY1A 1PPIA 3ZSTA 1E70M 1HKIA 2X0YA 4UOQA 2CHNA 5BXPA 3OG2A 4FLSA 2CBUA 2J7GA 3A4AA 1RH9A 3GNOA 3VX0A 4AYSA 2HISA 1HT6A 1J11A 5A69A 1JG9A 3VKKA 1MQRA 4W7VA 2EO7A 1JDCA 2YLLA 3B8SA 2AMGA 2D24A 2WKGA 4KMQA 2J78A 5HNNA 3T09A 1WAWA 1CLVA 1AVAA 2VR4A 5FOOA 3AXHA 4P7QA 3ZJ6A 1J0JA 1JNDA 5I3DA 5BROA 1XRVA 3VIKA 2W62A 1W91A 1UR2A 1XSJA 3AIEA 2VZOA 4XZBA 4UFKA 1UKOA 2YDRA 3OGVA 1KBBA 5IHSA 5I77A 3HJEA 1SMAA 4KH2A 1V02E 2J7BA 3OLIA 5BRPA 4X0VA 1E56A 1X1NA 5A95A 5HXMA 1HL8A 1MW1A 3CZKA 4V2XA 4UFIA 1GJUA 3IAPA 3VINA 1WZKA 1E4MM 2GJPA 2DEPA 4PMUA 3BLPX 1LG1A 3AZTA 1UWSA 3KL0A 2CXGA 3WF2A 2JF7A 1UZ4A 2ZOXA 1ITXA 2BVTA 1WDPA 5JH8A 5GNZA 1U2YA 3L4VA 4MNJA 4OOUA 1WZAA 2JFEX 3NSNA 1ZBKA 4PMXA 1JYNA 2VX4A 3SUWA 1WE5A 1JF6A 4CD8A 1GORA 2Y5EA 1G1YA 2Y4SA 3VTRA 4C7FA 4DUWA 1CGUA 5DMYA 1KR1A 1E0XA 1JAEA 1ITCA 1TUXA 4H8UA 4RL3A 1FA2A 3BAXA 4M29A 3SCSA 3VD9A 3W25A 1OD0A 3AS3A 2PWHA 1H4PA 2DIJA 3N11A 1G5AA 4Q7NA 1CXIA 2F8QA 4U2ZA 2D0HA 4D72A 3DHUA 1PX8A 3AHXA 2QMJA 1BAGA 1V3LA 2D1ZA 5ECUA 1BYCA 1CNVA 1UH4A 3ARWA 3TOPA 5EBAA 4E2OA 1C93A 1CWYA 1NP0A 1JZ7A 1OINA 4D6IA 1QW9A 3EBVA 3AS2A 2GK1B 1FH7A 3QHMA 4DWSB 2EPNA 1EH9A 3SURA 1ODUA 3I3BA 2YBUA 1JXJA 3N1AA 2PWDA 3MKKA 4OJYA 3WH8A 1HJSA 4L4PA 4PBGA 4W84A 3VVGA 1LLOA 3WEOA 1KQZA 1R8LA 4AMCA 1EO5A 3WQ5A 4CN6A 3TTOA 2VT0A 2WSKA 4Q22A 3WL1A 3VIPA 2XYLA 1GVYA 2WMGA 2VVNA 2D22A 1C7TA 4W5ZA 3FY1A 1K9DA 3ZO9A 3U5UA 4UQ9A 5GNXA 5LA1A 2PI6A 1W3LA 2NW0A 2VNCA 4K68A 1B0IA 3LPFA 2E0PA 4W86A 1E1FA 1UD6A 3VNZA 4U33A 2J77A 2WSPA 2CITA 1JZ8A 1QVBA 4GZEA 3L4WA 3NIYA 2DH3A 3VGDA 4W8BA 1W3HA 2CETA 1G0CA 2J7CA 3SCRA 3OZPA 2Z1SA 3BAJA 3U7BA 3QOMA 5GPRA 1XH1A 5A6BD 1H1NA 1JD9A 4TUFA 2ZIDA 1FP8A 1CGVA 2YL5A 1OWQA 4CU8A 1Z32X 4X9YA 1TCMA 2ZXDA 1E6QM 3ARRA 3N17A 2WC4A 1W2PA 2WMIB 2VUYA 3WKZA 4MB3A 1E4LA 4LYQA 3SIMA 2ZX5A 2W91A 5IXEA 2XTKA 1E1EA 4P7NA 3WQWA 3G6MA 3EYPA 3BMWA 4QP0A 3BXWA 5A2AA 1TVPA 3A47A 3MV11 2VVSA 2WANA 3ZSSA 4AISA 9CGTA 1B30A 4JCMA 1JZ3A 2UY3A 3DYMA 1XHGA 4MADA 3L4TA 3NJ3A 4F8XA 3CPUA 4B16A 1OIMA 1CYGA 2BNJA 2QMKA 2G41A 1B9ZA 4GI6A 5D9NA 3VPLA 7A3HA 1JZ2A 3SCNA 4CUCA 1PEZA 1HIZA 5D8WA 4TTUA 5HDRA 3PTQA 3W29A 2YA1A 2DT3A 3THCA 3GBDA 4AZHA 3WIJA 3ZR5A 4OKDA 4CCCA 3CZGA 1BGAA 1V6WA 2WMJA 1LJYA 3KZSA 1QW8A 4OZOA 3MV01 1MQQA 3OBAA 3W81A 3WENA 3IJ7A 2J8GA 1Q6DA 3SCPA 2QPUA 3SCTA 4BQ4A 2DT0A 3WFZA 1EOMA 1UKTA 2G3JA 4D6HA 1GOKA 2VX5A 3UETA 3WD2A 2VX7A 1WCGA 2E9BA 1BFNA 4W7UA 2QF8A 1E4IA 2F2HA 2YA0A 1LG2A 3OLDA 4AD4A 2E8ZA 3ARXA 1DEDA 1WDRA 2OSWA 4PTVA 1BVZA 2WHKA 1B3VA 1HP4A 3CHCA 2OSYA 2V3EA 1NH6A 3RJYA 4WIWA 2XVGA 3SUTA 1MW3A 2O92A 3CZLA 3ARTA 1RP8A 1CENA 5A3HA 4C7GA 3CHEA 2ZX9A 2GFTA 1ZBVA 5ABEA 1ZJAA 2WC7A 3MANA 3TP4A 1D3CA 5FCZA 1QHOA 3W28A 1G01A 2J25A 2DT2A 1DWIM 4H2CA 2WBGA 2X8RA 3AMCA 3SCWA 2DSUA 1TR1A 5TD4A 2WVTA 3ARQA 2DSZA 2GJXA 1E55A 4UOJA 3RO8A 5A8OA 4AC1X 3GBEA 1R85A 1L8NA 2E8YA 1SYTA 4ML4A 3AZRA 4HMCA 2WNWA 5A6BA 1W1PA 1CEOA 1QNRA 4H8VA 4D71A 4TVUA 4AIUA 4JHZA 2WHLA 1DWJM 1QHZA 2J7EA 1GPFA 2ZUUA 3EDKA 1HL9A 3AIUA 1TZ7A 1B90A 5CZKA 4U3CA 5BXTA 4GINA 1UD2A 4BQ5A 4J3VA 5KEZA 4N0RA 4DM1A 3WD4A 4GI9A 1NP2A 1W9PA 3WF4A 4EANA 1QBAA 1M03A 4TOQA 4M1RA 3PBGA 2VZVA 5DO8A 4MTVA 1EHAA 2WK2A 1JFHA 4AXNA 1NQ6A 1BYBA 1FFQA 3ECQA 5BWFA 1EOKA 4NRSA 2D0GA 1LL4A 3UR8A 2D0FA 2OYLA 2BHZA 4PSRA 4HMEA 1UD4A 2BV9A 1JIBA 3GXDA 1XD1A 4AEFA 1P6WA 4Z2HA 1YQ2A 4AW7A 2VO5A 2AOSA 1PX4A 1KXHA 3BCDA 1QBBA 4CN4A 3AI0A 1V6UA 3T2PA 5DFAA 4AZBA 3O6AA 2X2YA 4HU0A 1ISVA 4EK7A 1GHSA 7TAAA 1GOQA 5D9OA 2WC3A 1UWRA 4M8UA 2DSKA 4CCEA 1UUQA 1WP6A 3SCVA 1E40A 2BY3A 4P7OA 2ZICA 5D9PA 1UR1A 2BVDA 2JIWA 4PMYA 4ZENA 3WH5A 3WEZA 4UOZA 2WLYA 4ATDA 1WNOA 4R27A 4QFUA 3VMNA 1GQIA 1HVQA 3SEPA 4BF7A 2X0HA 3UG4A 3PZUA 1W9VA 2ZUVA 1O7AA 1QI4A 5JBDA 1HJWA 3W53A 3UR7A 1JI1A 2CBVA 3AFBA 2WVSA 2E9LA 4QLLA 1C8YA 1EXPA 4P8XA 1EDGA 3A4XA 1R86A 5CJ5A 2W67A 3E1F1 2WHJA 1B31A 4B15A 4AD2A 2ZE0A 1WDSA 3PZMA 2FH8A 2VRQA 1OCQA 4FMVA 4BA0A 1GZJA 1I75A 4M81A 2GUYA 1GCYA 4UQDA 3VGEA 1H41A 4J3WA 2FGZA 3ZMRA 3FN9A 1H5VA 2V5CA 5E9AA 3VDAA 2BY2A 2ZX6A 2NT1A 3BLKA 3O9NA 4URIA 4D6DA 3I3DA 3ZR6A 2WVUA 2VOTA 2BFGA 1E15A 5A6AA 3RM8A 3M7SA 3GZAA 4WJXA 1W1TA 3MMDA 4P7LA 2X09A 3N18A 3BAKA 3CHDA 1I1XA 3K4DA 5I0DA 3T0DA 2OWCA 4JFWA 1UD5A 4M80A 3RMEA 3SUUA 1SMDA 4XV0A 1EDTA 3AMGA 1CGTA 5A6SA 1XYZA 4C7DA 1CDGA 1J18A 1KXTA 3ARYA 4L4OA 1C7SA 5JBFA 1H11A 5IFPA 4PMQA 1V02A 1TE1A 2DT1A 1DTUA 1HJUA 1PZ2A 2XJ7A 4QDMA 4QLKA 2VURA 4UZSA 4B9ZA 2EEXA 4TTGA 3PZ9A 5D4YA 8CGTA 5ABGA 2XIBA 3N15A 4PN2A 1DP0A 1JYVA 1BF2A 1FH9A 1J12A 2Y8KA 2CHOA 1W3JA 2W5FA 1W9BM 1E6NA 3WQ4A 1BHGA 5EMYA 1VB9A 2Y8VA 3WH6A 2XFRA 4HOXA 6TAAA 4HA3A 3GXMA 4J3XA 1CZ1A 1PAMA 2UY2A 1C90A 2VTFA 3CUFA 4U5IA 2JEQA 1E6RA 2YL6A 2W92A 3RIKA 1NWUA 3FNDA 4IM4A 1H0IA 1HX0A 3BCFA 4E8DA 2F61A 3AZSA 3DHPA 3K8KA 1JAKA 1NOWA 4V27A 1QI0A 3UG3A 2VX6A 3WQVA 3UG5A 4WF7A 2J74A 3CBWA 4HA1A 3ZM8A 3D3AA 3AOFA 3ALGA 4UFMA 2XGIA 3VGFA 5DT5A 1HKJA 1EQPA 2EPLX 3W38A 1J10A 3WDJA 3ZJ8A 3OIHA 2PBGA 3QHNA 1UA3A 2RGLA 2A3HA 4JFTA 4QAWA 3T08A 2HVMA 4DWSD 1O6IA 2VRJA 1HF6A 1EQCA 4FLQA 1ISYA 3IJ9A 3F5KA 4Z2IA 1R87A 1AMYA 1W1VA 2VCBA 4XB3A 1QNQA 4P8WA 2ZUMA 1C8QA 1KCLA 2CCRA 3N04A 5ABHA 1BG4A 3KWXA 3N13A 2XM2A 3OLEA 4BQ3A 2FH6A 3GH7A 4AZCB 2PB1A 3KE0A 1LL7A 1G9HA 1XCWA 1ISXA 1XH0A 2VCAA 3NDYA 3WNMA 2OYKA 4JFSA 3CUIA 4Z2GA 2C0HA 3CIVA 1US3A 3W6MA 3SCQA 1H0GA 4CD4A 1UR9A 5BCAA 3VDBA 3S2CA 3WQ8A 4BS0A 5E09A 4GZIA 4P7RA 2DDXA 1HKMA 4ACZB 1LWHA 1CGWA 4CU6A 1N82A 4MPKA 3PTKA 3MUAA 4HZ6A 5EFFA 1CPUA 3AS1A 1MVYA 3GDBA 2E9MA 3K4AA 4GO9A 1NOFA 3WNPA 4D6FA 3PTMA 2TAAA 4GO8A 1DWAM 4JKLA 2Y2WA 4GQQA 1FHDA 4WKAA 2WWDA 3W4RA 3T2OA 1J0IA 1UG6A 2XFYA 1JXKA 3T2QA 1RP9A 5EB8A 4OIFA 3VD7A 1JZ6A 3WL0A 4UR9A 1IT0A 4F66A 3HU7A 3VOCA 1OT2A 5A6KA 4Y7EA 3L4ZA 4CD6A 3MU7A 5M3WA 4AEEA 1C3FA 4PUEA 4JCLA 4AD1A 5M17A 3PZVA 2WYSA 1Q6GA 1H09A 1BYDA 1UA7A 4JZ5A 3AMDA 1RD6A 2XM1A 2ZX7A 4P8UA 3WUEA 4PMVA 3VO0A 5A8NA 3VIFA 4JKKA 1ESWA 4UZUA 4PMRA 3DYPA 2O9RA 3POHA 5I79A 2A3AA 2RGMA 1MXDA 1WKYA 1DWFM 5M5DA 2BY1A 2DSVA 1E6SM 3DYOA 3PZOA 1GOWA 3WDQA 2Z1KA 1E4NA 4GZJA 3RPMA 1CIUA 5HOSA 1EIBA 4BZYA 1V6XA 3AIVA 3G6LA 3T0AA 3EDDA 1FH8A 4HOWA 5CQ1A 3AHVA 4D6JA 1VEOA 2GVYA 1J9YA 4RE4A 1X6NA 7CGTA 4WKFA 1QI3A 4CN1A 4KGLA 2G3MA 4F9DA 3IAQA 1Q6EA 1E0WA 1JZ5A 3K46A 3OGRA 3CUHA 3NSXA 2GK1A 4PMZA 3WNLA 1H2JA 4DWSA 1KQYA 2DGAA 2BXZA 4PUDA 5FD0A 3KL5A 5BXRA 2EXOA 3NSMA 3UERA 2CKSA 1GQLA 1QOXA 1HJQA 5I24A 3T0BA 4YHEA 1ODZA 1B3YA 4H7VA 1LWJA 4PCSA 4ACZA 2BHUA 3S6TA 4Z2JA 2O9TA 1TA3B 2VL4A 2YBTA 4MAZA 4W85A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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