3CHEA

Crystal structure of aspergillus fumigatus chitinase b1 in complex with tripeptide
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based dissection of the natural product cyclopentapeptide chitinase inhibitor argifin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 146
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3cheA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cheA01
1ITXA 1E5JA 4ZE4A 1U33A 3LPPA 2J8FA 3W38A 3BAXA 1V3LA 4HMCA 5LYRA 4JL1A 1WNOA 3QR3A 1KGXA 4H8HA 4AEFA 4UOZA 2J75A 4M82A 2GJXB 1FFQA 1VFOA 5DEZA 1EQPA 4OBRA 3ZOAA 3BAWA 3WNPA 5DT7A 4TVDA 1R87A 4PSPA 3GH5A 3TONA 5I24A 1CGWA 2WVSA 1PIFA 2J7FA 2W63A 4KGJA 4N0RA 3S6TA 1R85A 2D24A 2BY1A 1KWKA 3PZMA 3VDAA 4MNLA 2W62A 2GVYA 4M29A 4PMQA 3N12A 3U5YA 3W37A 2BNJA 4W7VA 9CGTA 4MNKA 1JG9A 4AW7A 4D6GA 2WKLA 1HKMA 1BYBA 5D9OA 1FA2A 1IV8A 4JKKA 2YA0A 3WQVA 1E5NA 4W86A 2DDXA 3LPOA 3AQUA 3NJ3A 3MKKA 4C7DA 4C7FA 3CZLA 3EMZA 3FXYA 3G6MA 1QHZA 2VC9A 3AROA 3GBDA 5E70A 4GI8A 1QW9A 2OSYA 2CBUA 5JBEA 5E9AA 5E0CA 1FH9A 3ARWA 1C7TA 3CUGA 2Y8VA 2OWCA 2DH3A 3S2CA 5EB8A 2Q8XA 3ZT5A 1UR2A 4Z2GA 1WZKA 4GQRA 3TTSA 3ZT7A 1XYFA 1TVNA 3AICA 5A6SA 4J3TA 3ARSA 2XWEA 1ZJBA 1DHKA 1M01A 4J3XA 4W89A 3U7VA 1MW3A 1UWUA 1E0WA 1J0JA 3GNRA 1TE1A 3OG2A 1CXLA 1SMDA 3VDCA 2J47A 3SUVA 3VD4A 2CKRA 2JF7A 2JIWA 1PZ2A 4Z2IA 3E1F1 3GXIA 4OOZA 4UZUA 3AIUA 5CQ1A 1ZL1A 2PB1A 2VCBA 1J01A 3EDJA 1JI2A 1CECA 5CPQA 4MDPA 3GDBA 1UD2A 4J7RA 1PAMA 2FGLA 1OB0A 1B3YA 4TOQA 4BA0A 3EDKA 3GYCA 1XSJA 2IUZA 4CU8A 1UQZA 1OIMA 1GCYA 3T2OA 1PIGA 3SIMA 1CEOA 2XIBA 1W2PA 5ECUA 5E6ZA 4WK9A 1I75A 4OZOA 1UWSA 4A3HA 5D8WA 1CLVA 5FOOA 3N11A 2VZSA 4AZHA 1UQYA 3TOPA 1EO7A 1V6XA 4TTGA 2V3EA 1BQCA 4AD2A 4DM2A 1LLOA 1H09A 2XWDA 1GOMA 1ECEA 4AD3A 2F2HA 5JIWA 3UERA 4HU8A 2ZUVA 4D6DA 4JHOA 4F66A 3FHQA 3VVGA 1JFXA 1UG6A 4NSBA 3W53A 1E6XM 1OBAA 2J7CA 4Z2LA 4JFSA 1R86A 2F8QA 5HPOA 3THCA 3UETA 4FK9A 4FLRA 5EMYA 1E56A 2AAAA 3PZVA 1XV8A 3PZ9A 4ZEPA 5GPRA 3CH9A 4PTXA 3RCNA 3WMSA 1VRXA 3CZ8A 5C8BB 3T0BA 3ZT6A 1GJUA 2XHYA 2W66A 2J62A 3J7HA 5IFTA 4QLJA 1F4HA 1KBBA 5I3DA 2WHMA 1LL6A 2D20A 2DIJA 4P7OA 1E6ZA 2O9PA 1E1FA 1ZBKA 2WVUA 3W29A 4XX6A 2CITA 2CHNA 3EDFA 3WY1A 1J18A 3JUGA 3TP4A 2QPUA 3FW6A 2EO7A 1B30A 1L8NA 4PUDA 1KBKA 3SCVA 1HJVA 3RIKA 1AVAA 3W24A 3APGA 1VJZA 1NWUA 4R5EA 4IPLA 1V0KA 5CSYA 1V02E 1ITCA 3M7SA 3A4WA 2G3IA 4S3JA 3IJ8A 4QFUA 5KZ6A 4ATWA 1KWGA 3VMNA 3NSNA 3ARVA 1E73M 1KXQA 3UG4A 5HOSA 2PWFA 1K6AA 1M53A 3WDPP 4N42A 3VNZA 5A1AA 5HNNA 1GQKA 2MANA 1JIBA 2J77A 1C91A 4OBSA 4MJ2A 1YQ2A 1WKYA 2IXVA 1MWOA 1D3CA 4PMYA 3VMPA 2VRKA 2ZIDA 3M46A 4FF5A 4DUVA 1UKOA 2D2OA 1E3ZA 1VFFA 4OUEA 3PTKA 2YKKA 2EPNA 3SUSA 3O9NA 4E2OA 3AIEA 1VB9A 3UEQA 4ATLA 1Q4NX 5GQBA 1NWRA 4HTYA 1HVQA 3A4XA 3WEOA 4NZCA 2FHBA 2CBJA 5IHRA 3IJ9A 4UCFA 7A3HA 4KGLA 2VZTA 3UCQA 1LL4A 2ZUWA 4CVWA 2ZX6A 3VGFA 1V02A 1CIUA 3GNOA 5A8QA 1EOKA 3ARUA 3CUIA 4E8DA 4WSKA 3PZUA 3VM5A 4UFMA 1UR8A 4DWSA 3WQ4A 4MJ4A 1V0NA 3DC0A 1EGZA 5BXRA 2WLYA 4QLLA 1M7XA 2Y8KA 1ZU8A 1ISYA 3T08A 4HA3A 3MANA 1HL9A 2XVNA 3GTNA 5I78A 4EE9A 3AHYA 1C90A 3L2LA 2CBVA 2WCGA 5CPSA 3AXHA 3PZOA 1GORA 4B9ZA 2DIEA 2WCAA 1G9HA 3U57A 1KXVA 3VX1A 1HNYA 2CCRA 2VX5A 3WNNA 3RJXA 3GH4A 2Y4SA 1JZ6A 5IDIA 3RO8A 4BZYA 2X0YA 3ARTA 1JNEA 1G94A 1MVYA 1QI0A 4M1RA 4UFLA 4LGXA 4XZWA 3ZR6A 3WDHA 2WNWA 4W8BA 1W3HA 1DEDA 2ESCA 7CGTA 1OWQA 1DTUA 1V03A 2XM2A 4JAWA 3WH8A 2XSAA 1V6WA 1KR1A 3SUWA 4CN4A 1IT0A 5DT5A 2XVKA 1J10A 3PZIA 1NP2A 1UOKA 1G1YA 5BCAA 3CZJA 2WCSA 2CEQA 3DHUA 1HX0A 3WL0A 1KGWA 5FL0A 3WQ8A 1KFWA 2B31A 1FHLA 2A3HA 4GI6A 3CHFA 1KGUA 1G01A 3WH7A 2J78A 5C70A 4P7RA 2DSKA 2UWFA 1DWGM 3LMYA 1J0IA 5I77A 2C8NA 3W4RA 5AYIA 4AEEA 2XG9A 2CBIA 1RH9A 4RE4A 3VTRA 1JYVA 3IAQA 3WNOA 1FOBA 1NOFA 4W5ZA 4PMZA 4OJYA 2ZXDA 1BYAA 2XVLA 3WF4A 2XFFA 1MFUA 1H0GA 3D3AA 2DT3A 1U30A 1ODZA 2YL8A 5BXTA 1QI3A 2J74A 1W32A 4D6CA 1ISVA 1TUXA 1DP0A 5D9NA 3MUIA 4PN2A 4W7UA 3ZIZA 3B9DA 3VIIA 3CTTA 4AD5A 4M24A 1QHOA 3VGHA 1E6PA 3AIVA 1GOWA 1J0HA 2X05A 1B3WA 1BSIA 3WUBA 2CHOA 1R8LA 1EHAA 5M3WA 4NF7A 5LA0A 3L4VA 3QHNA 3O6AA 1JZ2A 1XH0A 5C71A 3B8SA 5CSUA 1WZMA 4PMNA 1XSKA 2BS9A 3IAPA 4NRSA 5HPCA 5JBDA 1FHDA 3A4AA 2WMFA 2XYLA 2XUCA 2BVDA 2BVTA 1LG2A 4W5UA 2IXUA 2EBNA 1V3IA 1NWSA 1E0VA 1C3FA 4AC1X 4UOQA 3AZSA 2WPGA 4ZXLA 1TFVA 3QOKA 1JYNA 1UKTA 2PWHA 4UFIA 3SCSA 2VZVA 3SCUA 3WNKA 1W91A 3ARPA 1ZS2A 3WFZA 1GPFA 2WB5A 2BV9A 1BAGA 4F79A 2DSZA 2D0GA 4CD8A 3BAKA 2EPLX 4P7LA 2G3MA 5CLWA 2WHKA 3F5JA 3MMWA 1HJXA 2Z1KA 1CZ1A 1E71M 5HDRA 1CPUA 1GZJA 1CNVA 2A3BA 2YA1A 3K1DA 2OYMA 3ZMRA 1UR0A 1JAKA 4A3YA 4AZBA 4MB4A 3FAXA 1V6VA 5A6KA 1JD7A 1V0MA 1V08A 3B9AA 1WPCA 2VQTA 1X6NA 1HIZA 2VRJA 4U3CA 3VGGA 1UYQA 2VMFA 1QI4A 1VBUA 2O9RA 2WYSA 3VIPA 3AJ7A 4PRWA 5A8OA 1E15A 3RM4A 1PZ3A 1UWQA 2E8YA 5ABGA 2YBTA 3BMVA 1YHTA 3AMCA 2E9MA 4FLSA 4AD4A 5BWFA 1WE5A 3EBVA 3AMDA 1XRVA 5E09A 3PZTA 1GHRA 4CN6A 4XZBA 2WHJA 5I23A 1Q6FA 2D0FA 1VEPA 4AZ6A 3WQ6A 3VOCA 2CXGA 2WK2A 1JXJA 4P7NA 2VZUA 4C7GA 1N82A 1MYRA 2J4GA 2BHZA 1E55A 3W6MA 3CPUA 1PX8A 3BXWA 1WDPA 2WWDA 4YPJA 1UWTA 4ML4A 1WB0A 3AMGA 4CU6A 4H41A 3QHMA 4MDOA 2XGBA 2C7FA 4XUYA 1DWJM 1KCLA 3B9EA 3ZQ9A 3A47A 3BH4A 3AIBA 2V3GA 4D1IA 5A6BA 2JEQA 1Y7VA 3T2PA 1UUQA 2DSVA 5KEZA 1CDGA 1VFUA 5AC4A 1V3MA 3BSHA 5I0DA 1CXKA 2Y24A 3MUY1 1HN1A 4DUWA 5A8MA 1JZ7A 1R7OA 6CGTA 1MQQA 2ZWYA 3GM8A 2WXDM 1B9ZA 1EDQA 3WENA 3WF3A 2EQDA 2DH2A 4AZ5A 3NCOA 1OSEA 3UR8A 4WSJA 3I3EA 3IJ7A 3RMEA 1UH2A 5CZKA 1FP9A 4CCCA 4BF7A 1UA3A 3D5HA 1AQ0A 3THDA 1UWRA 1ZJAA 1WZLA 5JH8A 2WMKA 1E43A 2E8ZA 2WHLA 2G3NA 5A2AA 4FMVA 1BGGA 1ISZA 3WDJA 3AHVA 1DWHM 1EXPA 3DYPA 3ZJ6A 2QPSA 3BSGA 3L4YA 3EMCA 1E0XA 3KE0A 4HPGA 3CGTA 3BAYA 4HZ6A 3PTMA 1QBBA 4FLQA 2X2YA 3DYMA 1E4MM 3OLIA 2UY2A 2YA2A 5A6JA 5IHSA 4A4AA 3KZSA 3RM8A 3WMBA 2ZXQA 4E8CA 3KL5A 4HPHA 3AXIA 4PMRA 3WSUA 1BYDA 1MXDA 4B3LA 5EBAA 3K8MA 2ZX8A 1TCMA 3MU7A 3MSDA 5AY7A 3VKKA 5HBFA 1JZ4A 3CIVA 1JNDA 1F4AA 2JFEX 4PUEA 1XH1A 2Z1SA 1A3HA 4DWSD 3BCFA 5CGTA 3VD7A 2DGAA 3FY1A 4JZ5A 5FKYA 4KRTA 3PBGA 1VFMA 1GOIA 5E0FA 2JE8A 1B3ZA 2WBGA 2WBKA 1JGIA 3GXDA 1K9TA 1LWJA 2OWWA 1JF6A 3W28A 1V3HA 2V3FA 2Y5EA 1FFRA 1HP4A 4OIFA 3SCQA 3WD0A 1QVBA 1XHGA 4MNJA 3SURA 1QBAA 1Q6EA 2VR4A 2W91A 4J3VA 4MNMA 1E1EA 3KEHA 2VVNA 1W1VA 1E72M 2G3JA 2BHYA 2X1IA 4GI9A 3AI0A 3AXXA 2ZXAA 3K8KA 3ARRA 3NYDA 4GZIA 3WUFA 2E3ZA 4JFTA 1HL8A 4ZFMA 3I3DA 1C8XA 4AXNA 2G4FA 3CZEA 3AHXA 2VTFA 1XD1A 2WSKA 1CLXA 2VI0A 3VIFA 5HXMA 4M8UA 2YL9A 4JFVA 2VURA 2W67A 1GW1A 3HN3A 3OGVA 1B3VA 3W27A 3VINA 3BC9A 3AZRA 2DT1A 1CBGA 1CXHA 5DO8A 1ISWA 3BCDA 3SCNA 2E9LA 2EPKX 3FNDA 1J11A 4IUGA 2VT0A 1B2YA 3U5UA 1H2JA 1JYWA 4RE3A 4AZCA 3MMDA 1QI5A 3QOMA 3L4ZA 1W9PA 2D3LA 1J12A 3T0AA 1EA9C 4UQBA 5DFAA 4D72A 1JZ3A 3AFBA 3UG3A 1M04A 3RILA 1HJWA 2VRQA 3RDKA 3EYPA 3SCPA 2EPOA 4CN1A 2BXYA 1HXJA 1LL7A 1JDDA 2GJRA 4J3SA 1C93A 3OB8A 3AIQA 2E4TA 4HA4A 1JD9A 4ZENA 1V3JA 3OLDA 4ACZA 2CIPA 3HJEA 5JUVA 4F9DA 4PMDA 1NM9A 3N9KA 5A2CA 1LJYA 1JL8A 1O7AA 2CYGA 1J0ZA 1ZBVA 3OA5A 1XH2A 3VDHA 4UQDA 1BGAA 4UFJA 4P8WA 1C8QA 1RD6A 4BQ4A 1K9FA 1QNSA 2PI6A 1K9EA 4UZSA 3PZGA 5LA1A 1OCQA 1W3LA 1LF1A 4MB3A 1LG1A 4AZGA 3WUEA 3NDYA 3LPFA 2BVYA 5A6LA 1E6NA 4F9JA 1GONA 1KQYA 2J8GA 2VZOA 4GKLA 1TZ7A 1D7FA 2J7GA 2EXOA 3AHTA 3AIWA 3W25A 1UR9A 2FHCA 3W26A 2OYKA 1QOXA 3VIJA 1JFHA 3CZGA 4GZEA 5JBFA 3UESA 4J27A 3BLKA 1U2YA 1UKPA 4Q22A 4UQEA 1EHNA 2WMHA 3BAJA 4IPNB 3ZJKA 3GZAA 2EJ1A 1UWIA 3PHAA 1GQIA 3ZJ8A 3OIHA 4P7QA 2WC4A 4MADA 4EANA 1SMAA 2BHUA 4M80A 3WELA 1OT1A 2YL6A 2XIIA 2QLYA 5I2UA 4MPKA 1UHVA 4JHZA 1AMYA 2WWCA 3AS0A 3VILA 4PCSA 3SUUA 4JFWA 2DSUA 1X6LA 3WNMA 1NH6A 1US3A 2O9TA 1ODUA 6TAAA 3WF0A 3VPLA 4M56A 3WD4A 4DWSB 3ARZA 1B31A 4JKMA 4U3AA 3ALGA 3NSMA 4WKFA 1BHGA 5FIPA 2WSPA 4URIA 3VNYA 1JZ5A 3WBEA 4WKAA 2WMGA 4WIWA 2DT0A 2UY5A 1EQCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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