3FXYA

Acidic mammalian chinase, catalytic domain
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
YQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNVKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAPAQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Triad of polar residues implicated in pH specificity of acidic mammalian chitinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acidic mammalian chitinase
total genus 132
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3fxyA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3fxyA01
2BY0A 1JDCA 3ZT7A 4HZ6A 3VDBA 5CGMA 1DWGM 4P8VA 4M80A 3RILA 1TMQA 1B3VA 3AS1A 1EDTA 3BAWA 1HJSA 3CHDA 4MTVA 2GSJA 3MUY1 3SCUA 2XFRA 4M81A 1GW1A 2JEQA 2IUZA 2O9TA 3N12A 3NDZA 3VILA 1BSIA 2J25A 1UKPA 1EA9C 2EBNA 2WC7A 4PBGA 3BCDA 1WO2A 2XGIA 4PMXA 4ACZB 3EYPA 2A3EA 2VOTA 1QVBA 1BGGA 4W84A 3L2LA 1FFRA 4W85A 5CSYA 1WB0A 2UY3A 1W9PA 3VOCA 5JBEA 4CCDA 4MPKA 3WSUA 2DDXA 4FK9A 1D3CA 1E3ZA 2D1ZA 5ECUA 3IAQA 1SFSA 4PTMA 2E40A 1XD1A 2WSPA 2V38A 4ATWA 3VKKA 3WUFA 5BXPA 2WHKA 4XV0A 1B31A 1DWAM 1PJ9A 2XPKA 2BY2A 1W32A 1UR1A 1M04A 1MW1A 3IAPA 3PBGA 3ZJ6A 3RO8A 1XGZA 1HT6A 3EDFA 3CZJA 3FHQA 3K8KA 2YA2A 2A3BA 4PN2A 1IZJA 3PZOA 5A6JA 2WLYA 4LYRA 5ABEA 3GXMA 3VGDA 3ZJ8A 3AHZA 3T0DA 5E0FA 3SCWA 1W9UA 4QLJA 4AWEA 2OSYA 1LWHA 3GXDA 1TA3B 1CDGA 1GUVA 5DT5A 3A4XA 2YIHA 3WF3A 1IZKA 5CXPA 2YL5A 4UOQA 3CUIA 4L4PA 1UWQA 4UQ9A 3L4UA 5DO8A 1E4IA 1R87A 3CZLA 3M07A 2DGAA 4GQQA 2WWDA 3GZAA 3MSGA 5I6SA 4PUDA 2BVDA 1EOKA 4V2XA 4JFSA 4CUCA 3NUKA 3ARSA 1VRXA 4V28A 5A8QA 2Y2WA 3MU7A 5IHRA 1R86A 4KMQA 2VZVA 3RJYA 5BWFA 1KXVA 1NOUA 1JD7A 4BF7A 1C93A 1KWGA 2PF0A 2B31A 2BVYA 2G4FA 3GBDA 1Q6CA 1GOQA 1V08A 4JL2A 4GI6A 3VM5A 1GQKA 2XWEA 5GQBA 1UWSA 2PWDA 4BS0A 3SEPA 3LPGA 2VMFA 4FLQA 5EB8A 3WQWA 2WMKA 1QI0A 3BH4A 3WF0A 2D3LA 4TOQA 1E6NA 1CXEA 1MVYA 4XZBA 2CPUA 4AZHA 5BXSA 1DP0A 3BSHA 5I5RA 1V0NA 1ISWA 3FW6A 1JFHA 3FY1A 3CZEA 2Y8KA 1G0CA 1HKMA 4AIOA 5D9PA 1GONA 4UQAA 2J7EA 3SCRA 3MUIA 4E4PA 1NQ6A 4ATLA 1WZAA 1DEDA 5CJ5A 1OBAA 5BXTA 2EPNA 3N04A 2V3GA 2VR4A 2ZX7A 2W5FA 1DWFM 4E8CA 1Q4NX 4QDMA 3DHPA 3EDEA 2YBUA 4CN4A 5BROA 1UYQA 1NWRA 4M1RA 4P8UA 4DWSC 1UR2A 1E55A 3L4ZA 3F5JA 2CYGA 2C8NA 1UKOA 1LJYA 1ZL1A 2DSUA 2V3FA 1EQCA 1QI4A 4M82A 2HISA 1VFFA 3SUUA 3CH9A 1W3LA 1ODUA 2ZUSA 4F9JA 2E9LA 1H0GA 5LA2A 1JGIA 3L4WA 3CIVA 3EDKA 4GZIA 4U31A 4AYSA 1KBBA 3CHEA 4MJ2A 3GYCA 4PSPA 4B3KA 3LPFA 1QHZA 1U2YA 4ZEPA 3BGAA 1XD0A 4LXFA 2F8QA 2Z1SA 5D4YA 5I23A 1PZ2A 4LQ1A 1QI2A 1WE5A 1E4MM 3GH4A 2XIBA 1CIUA 1LF1A 2ZX5A 2WMGA 5FOOA 4J7RA 4UZUA 2J75A 1V3LA 1DWJM 4U2ZA 2F2HA 4EKJA 3SCSA 3WMBA 1CGYA 4W8BA 5C70A 1E6RA 1GJWA 3DYMA 2JF7A 5F7UA 3O9NA 4PTVA 3VMOA 3AIBA 2PWFA 1OGGA 1ITCA 1R85A 3WQ8A 1NM9A 1GORA 2ESCA 2VX6A 3WEZA 4J3XA 1TG7A 4N42A 3ALGA 2J4GA 3M6DA 3ZT6A 1B90A 3OG2A 3QHOA 1R7AA 1B30A 3ARXA 1KR0A 7A3HA 5CLWA 2J77A 4CU8A 3VTRA 1FFQA 3WUGA 1E70M 4AIEA 3OLDA 5BRQA 1H3GA 3QGVA 1CLXA 2X1IA 3VDAA 1CGTA 1E4LA 3ZMRA 2D0GA 5FKYA 5HPOA 1JDAA 1G5AA 4MB3A 3W26A 4HOZA 1X6NA 4NZCA 1TA3A 5BCAA 4PMVA 3NYDA 4HOXA 1C92A 1HJWA 2CETA 3BAKA 4CCCA 2D20A 2PB1A 5ABFA 1GHRA 2ZX8A 3EBVA 3OLIA 4H8HA 1D2KA 3SIMA 1LQ0A 3VNYA 1TZ7A 3WBAA 1E43A 2VCAA 5D9NA 1Q6GA 4W7VA 1OIFA 4UQBA 4Z2JA 3CBWA 3WH5A 3SURA 3UR8A 2BFGA 1XCWA 5CG0A 3F4VA 3ZSSA 5BRPA 3PZUA 2J74A 1EQPA 4GZJA 3DHUA 4DWSD 3AXIA 3WD4A 3JUGA 3O6AA 3OIHA 1GJUA 1ODZA 1FH8A 4ZXLA 2V3EA 4D6GA 1UD2A 2Y5EA 2QMKA 5A8NA 1JYWA 3B9AA 1HL9A 3GH5A 5IFPA 1W1TA 2UY2A 1MWOA 3UCQA 4RE4A 2Y4SA 4JFUA 2OSXA 3L4VA 3FNDA 2WHMA 3T0AA 3EMZA 1GQJA 2XM2A 1BAGA 2WCSA 2VZUA 3W37A 3MSDA 4R27A 4BQ3A 1KQYA 3LPPA 4C7FA 1WP6A 5EFDA 1HJVA 2Y24A 1CNVA 1MW3A 3AS3A 3MV11 3ARPA 4HA3A 2XJ7A 4WSKA 2D3NA 1NWTA 4P7QA 4F8XA 3WUBA 4PTWA 1C7SA 3TTQA 3WF2A 1CWYA 4UOJA 3BMWA 2XUCA 1B3WA 1FOBA 2JIWA 2NW0A 3WMSA 4KGLA 2GJRA 3WH9A 4HMEA 6TAAA 4JHOA 4MADA 1V6UA 5A94A 3LMYA 4P7OA 1E6ZA 1OGSA 2X0YA 3VIGA 5A8OA 3THCA 4WKHA 3WKZA 3UG4A 3ZIZA 1JZ7A 4CD7A 1MQPA 4NF7A 3UESA 1NWSA 3CHCA 3ECQA 2W63A 1LLOA 2BHZA 5IHSA 1EO5A 3PTMA 4FLSA 1CEOA 2X2YA 4IPLA 5D8WA 1WNOA 4W87A 5BYWA 3AS0A 1US3A 3FN9A 3BMVA 2PWEA 4A3YA 3HN3A 2XG9A 3SUVA 3U7VA 3B9EA 3VDHA 4W8AA 1YQ2A 1E56A 2GK1A 3AZRA 4ML4A 1UWUA 4HZ7A 4CVWA 2TAAA 2BHYA 3O2LA 4C7DA 3WNNA 2DT3A 3N9KA 3N11A 4B15A 1UA3A 3AROA 3ARVA 3QHNA 4IUGA 2XFFA 3VGBA 1XH0A 2BNJA 1DHKA 1EHNA 1M53A 4LPCA 1KGUA 1KGWA 5A6BD 3VIFA 1SMAA 1X6LA 3VM7A 1J0ZA 4W89A 3WDQA 5IXEA 1J0YA 4JKKA 4J3TA 4JL1A 3VIIA 1LL7A 1OM0A 4KWUA 4CCEA 2D0HA 1QW9A 3RJXA 1E5NA 1MFVA 3VD5A 4HP5A 2GJXA 4J28A 4ZXOA 1AQ0A 3RMEA 1HNYA 4HOWA 4V27A 1V3HA 2UY5A 3EMCA 1ITXA 2MANA 5FD0A 1A3HA 3A47A 1NH6A 1BQCA 4HU0A 3GM8A 1W3JA 5HBFA 3WDPP 3CUJA 2ZXDA 2BHUA 5LA0A 2E8YA 2BV9A 4AEEA 4LGXA 1E15A 2QPSA 3WNMA 6A3HA 2WHJA 2VTFA 3D5HA 5I0DA 4TX6A 1JYNA 3TTOA 3PN8A 4ZENA 1JZ3A 2XIIA 4GI8A 3TP4A 1U30A 5HXMA 2VRQA 2G8ZA 4DWSA 2XM1A 4X0NA 2J47A 4PTXA 1GPFA 1BHGA 1BFNA 3N15A 3WDHA 4YN5A 4Z2IA 3E1F1 3HU7A 1ISVA 2GJPA 5CQ1A 2EQDA 3WNPA 1HVXA 5IFTA 3AIQA 1UKTA 1HL8A 2O9OA 4J3WA 2WM0A 2VC9A 1SMDA 1M01A 2DH3A 3K46A 3W82A 1PBGA 2QV4A 1KWKA 2YL9A 2WC3A 1L0PA 3AHXA 3IJ7A 2PI6A 3KEHA 1UZ1A 3UERA 3K4DA 5A69A 1F4AA 3ARUA 3L4YA 3VIPA 2O9RA 1K9DA 4MAVA 4RL3A 3U5UA 2ZXBA 2FGZA 2OYKA 1CLVA 1CBGA 1OT1A 2OLHA 1OWQA 2G3IA 1OT2A 3ZJKA 2WSKA 5A8MA 1R7OA 1KQZA 3OBAA 1NARA 4B9YA 5A95A 2J7CA 5C8BB 2AOSA 5I3DA 1E1EA 4QLLA 3CUHA 3W6LA 4GINA 3QHMA 4W5UA 1H11A 4QFUA 1GOKA 4W7UA 3WQ6A 1QNPA 2CNCA 4AD0A 3UEQA 1L8NA 1VFOA 3RM9A 2J79A 5EFFA 1J0IA 2X09A 1WKYA 1B3ZA 1OSEA 4H2CA 2YL6A 3ARRA 1W3HA 2QLYA 3RPMA 3SUWA 2J7BA 5ABFB 4UTFA 4CU6A 5JUVA 1ISZA 1UWIA 4UQEA 5CSUA 3PZVA 1B1YA 2JFEX 3THDA 8A3HA 4E8DA 1HKIA 2IXUA 4KRTA 1GNXA 1KB3A 2O9PA 1GHSA 3KL3A 4MB5A 3OLGA 3VX0A 3G6LA 1E40A 3WDJA 3QOMA 1HP5A 2EPOA 2YLLA 1H09A 2VX7A 4QLKA 3AIWA 1V02E 2YOCA 3PTQA 1V0MA 4NRSA 2WKLA 1QNQA 5D8ZA 4HMDA 2EJ1A 3BAJA 5FL1A 2YDRA 1VFMA 3WBEA 4D6CA 2GDUA 1RD6A 4IM4A 2Q8XA 1KFWA 1CGVA 1V3IA 4JKMA 1EH9A 2G3NA 4EE9A 1NWUA 2VO5A 3ZSTA 4U3AA 1MW2A 3CUGA 4GIAA 3AS2A 1FA2A 1W3KA 4B3LA 1H2JA 3WNLA 3CO4A 1BGAA 1V6YA 1TVNA 1JI2A 3I3DA 3OGSA 4PMYA 2PWHA 1UR9A 2WZEA 1SYTA 2QHAA 3VUPA 4H8UA 4FLRA 3T0BA 1EDGA 1I75A 2EPKX 1VJZA 3AISA 1JDDA 3WFZA 1JZ5A 1PIGA 1CXLA 1UKQA 4K68A 1E3XA 5E6ZA 3BAIA 2V5CA 2Y8VA 2PBOA 3GNRA 3DYPA 3IJ9A 4CVUA 1UQZA 4JIEA 3AYSA 1JF6A 2ZX9A 4CD4A 3WUEA 1CYGA 2YDQA 1PX4A 2GK1B 4W93A 3ZM8A 1RP8A 1HIZA 5ABHA 1P6WA 2WMIA 2CXGA 1S46A 4QCFA 1FHDA 4UNIA 1CGXA 4UR9A 3SUSA 4JAWA 2E0PA 3ZR6A 3OGRA 4OOZA 3WD3A 1J9YA 4U5KA 1CXHA 4MJ4A 2FHBA 3UG3A 3WDRA 5JIWA 1ZBKA 4KRUA 3WD1A 3EDJA 4DM2A 1BTCA 4CD5A 4GPNA 4KGJA 3AIVA 1XV8A 2WMHA 4JFWA 2F61A 3WH8A 2C0HA 5FIPA 2CHNA 2VVNA 3AHTA 4HU8A 4H41A 5KEZA 3VD9A 2BXYA 5A2BA 2DIJA 3CHFA 2GJXB 4TXEA 2WZHA 2YDSA 1XHGA 5LYRA 2W61A 1HJQA 1KBKA 1EHAA 1HF6A 1WDPA 3UETA 3OLEA 3NJ3A 2VURA 1J11A 3D3AA 4XZWA 1WDRA 1V02A 2WPGA 3HJEA 4AW7A 3W28A 2VR5A 5GNXA 2YL8A 4P7NA 4PMZA 5M17A 1OCQA 3OZPA 4D6HA 4LYQA 4M56A 1J01A 4JFVA 3SCTA 4Z2GA 3GH7A 4JFTA 4RE2A 2CKRA 1FH9A 1JXKA 2VQTA 1GOIA 2VL4A 3WF1A 1KXHA 1HXJA 4J3VA 2X0HA 3VGFA 4OBRA 4DWSB 1NOFA 3MMUA 1JZ2A 4BQ4A 1CENA 4GQRA 3POHA 5DEZA 2OWWA 4R5EA 1QNOA 2XFYA 2EEXA 2CHOA 1HKKA 1G9HA 2CESA 4XB3A 1UQYA 1J18A 3VD4A 1NP2A 1XSIA 2FH6A 1UWRA 3W6MA 4D6EA 4D6FA 1E4NA 4GO9A 2WXDM 1AVAA 1V03A 4B16A 3W24A 2J78A 3F5KA 1OGBA 1BPLB 4TX8A 4PCSA 4BZYA 2D0FA 4W5ZA 2D2OA 1XSKA 1DWIM 3GBEA 4H7VA 2JF6A 3NIYA 1JF5A 1CXKA 1VIWA 4UFMA 1GVIA 1WZKA 1AQMA 2VT0A 2DT2A 1ECEA 2W67A 5A6LA 2ZXQA 3WL1A 5A6KA 1HJUA 3K8LA 5KZ6A 3WD2A 3SCQA 3WH7A 2CITA 2E4TA 5JIPA 3AJ7A 3WIJA 2WVSA 3PZQA 4P7LA 5FCZA 1D7FA 4B9ZA 2VRKA 3VMPA 4UFKA 2DSKA 1UHVA 1TE1A 2VVSA 1CTNA 4GI9A 1YHTA 3F5LA 4NSBA 4P7RA 1JG9A 1JZ4A 3BLKA 4U3CA 1PZ3A 5AYIA 1ZBCA 5DMYA 4PEEA 1MQRA 3BXWA 3M46A 1C8QA 1OD8A 2W92A 1IT0A 5D9MA 3W53A 3KL5A 4DUVA 2WZIA 4XX6A 2E3ZA 4NI3A 5AY7A 2BVTA 4MNKA 4AEFA 3WEOA 3TTSA 3PZNA 2VX5A 4PSRA 1W1PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BY0 A;  4LS1 A;  3LOT A;  4WSH A;  3GFZ A;  5CGM A;  4K8H A;  5ECV A;  4TYO A;  1NDV A;  3VKA A;  1B3V A;  1IIH A;  1JPK A;  3IUD A;  2PTZ A;  3CHD A;  4M81 A;  4L4L A;  2JEQ A;  4JTL A;  5C54 A;  3KAG A;  3GTH A;  5AEC A;  3C61 A;  1KRB C;  1BSI A;  5DAN A;  4HU4 A;  4K3Z A;  1K3U A;  1VBJ A;  3NPW A;  1WO2 A;  3U48 A;  2E77 A;  4ACZ B;  3EYP A;  2ZA1 A;  1K8Z A;  3UXA A;  3UZZ A;  2VOT A;  3T4C A;  5U7S A;  3A24 A;  3L2L A;  4NZF A;  7ODC A;  1UP0 A;  3VOC A;  3WSU A;  1D3C A;  5CBB A;  1MDL A;  1E3Z A;  2POT A;  3B0Y A;  1SFS A;  1XIN A;  2E40 A;  1XD1 A;  2WSP A;  2PRL A;  4QG8 A;  4ZST A;  2WHK A;  2XH2 A;  4PGL A;  1B31 A;  1CW2 A;  5G1Y A;  3S1V A;  2BY2 A;  4A8N A;  3VDG A;  4GNV A;  1HT6 A;  4PN2 A;  4FNS A;  1IZJ A;  3GK0 A;  5ABE A;  3ZJ8 A;  1RBO B;  5E0F A;  1J79 A;  3SCW A;  5F1V A;  5FAC A;  2C6Q A;  5D2X A;  1TA3 B;  4IL0 A;  4XD3 A;  1I2N A;  4NAE A;  3A4X A;  3DFY A;  2YIH A;  4MWA D;  3KS6 A;  1IZK A;  4C1K A;  4L4P A;  1UWQ A;  4WQ6 A;  1RLC L;  4NX5 A;  2ZQU A;  4F40 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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