3OA5A

The structure of chi1, a chitinase from yersinia entomophaga
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
515
structure length
515
Chain Sequence
KSNLIYDKDPGYVWDNKNECEGAAEETYQELNYEPSISADKLTWTPTRLAKTVFNTYEDDDDFNVLCYFTDWSQYDPRIINKEIRDTGGRSADILRLNTPDGRPFKRLIYSFGGLIGDKKYSADGNASIAVRLGVATDPDDAIANHKGKTIPVDPDGAVLASINCGFTKWEAGDANERYNQEKAKGLLGGFRLLHEADKELEFSLSIGGWSMSGLFSEIAKDEILRTNFVEGIKDFFQRFPMFSHLDIDWEYPGSIGAGNPNSPDDGANFAILIQQITDAKISNLKGISIASSADPAKIDAANIPALMDAGVTGINLMTYDFFTLGDGKLSHHTNIYRDPSDVYSKYSIDDAVTHLIDEKKVDPKAIFIGYAGYTRNAKNATITTSIPSEEALKGTYTDANQTLGSFEYSVLEWTDIICHYMDFEKGEGRNGYKLVHDKVAKADYLYSEATKVFISLDTPRSVRDKGRYVKDKGLGGLFIWSGDQDNGILTNAAHEGLKRRIKNKVIDMTPFYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural analysis of Chi1 Chitinase from Yen-Tc: the multisubunit insecticidal ABC toxin complex of Yersinia entomophaga
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi1
molecule tags Hydrolase
source organism Yersinia
total genus 187
structure length 515
sequence length 515
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3oa5A01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3oa5A02
3QHOA 2ZX9A 1B3WA 1UR9A 5E9AA 1I1XA 5BCAA 2JIEA 5I2UA 1EGZA 2WVVA 3WDJA 2GJXB 2ZWYA 4MDPA 4H8VA 1VENA 2V3FA 2ZUWA 1TA3B 3BH4A 4MPKA 1J0HA 4X0VA 4OOUA 4P7OA 2DQXA 2ZUSA 4C7FA 4NI3A 4QLKA 2OLHA 4J3UA 8A3HA 4L4PA 3WELA 2GVYA 2X09A 3N12A 3WD3A 2OWXA 3WKZA 1BGAA 2BHZA 4QLLA 4EANA 3NIYA 4HTYA 1YQ2A 1E6QM 5CPTA 3IJ8A 2VR4A 1GPFA 5JH8A 4AC1X 4AZ7A 4EK7A 3AS0A 2YL9A 4J28A 1WAWA 2DSKA 4LXFA 2WC3A 1CECA 2CBJA 3O9NA 9CGTA 1B0IA 2EQDA 2OSYA 1MWOA 2CEQA 1OINA 4BZYA 1W9UA 3M46A 2WNWA 3N11A 3SCTA 2IXVA 1QPKA 1UWIA 1EQCA 3T09A 1JNDA 2WHKA 1SFSA 4D6JA 2DGAA 4GZIA 2D0FA 1CGWA 2FHBA 1MFVA 1JL8A 4CN6A 4TTUA 5DMYA 2Y8KA 4PTMA 5C71A 3UERA 4P7NA 4ML4A 2EPMX 1B30A 3MO4A 2G3IA 3WH9A 3QGVA 4TXEA 1UWTA 4NSBA 1W9DM 4PUDA 2VJXA 2WCAA 3EDDA 3G6LA 1GOMA 2VURA 1PX3A 1NWUA 2XM1A 1AVAA 1ZBCA 4DM2A 1V3IA 5HDRA 5D9NA 1OD8A 3GYCA 2CKSA 4MAZA 5JBDA 1WZLA 1CXKA 2BVDA 1GQJA 5D9MA 3KL3A 2WWCA 4P8WA 5CGTA 4AEFA 1XHGA 2PI6A 5FL1A 3K46A 3MV01 4CVWA 5KZ6A 4MNJA 1NP2A 3VIGA 2F2HA 1V6YA 3VKKA 4TX8A 1XH0A 2JF7A 4A4AA 3CMJA 2J78A 2VI0A 4GI9A 1LL6A 1OIFA 4K68A 4XZBA 2BS9A 3PZ9A 1FH7A 4XUYA 3OA5A 1Q4NX 1Q6DA 3GDBA 3FY1A 4BQ5A 5FKYA 1G94A 2W5FA 2YDSA 4AIUA 2X2YA 1Q6FA 1H2JA 4GQRA 4JFWA 1H49A 3AIVA 4D1IA 4GO8A 1R86A 3L4UA 5A6MA 2VT0A 1UD3A 1UYQA 4R5EA 4UQBA 2Y4SA 1CGVA 3AHVA 1QNSA 2XIIA 4QCFA 2VQTA 4Z2LA 1X1NA 5A6LA 3L4XA 4WSJA 3FW6A 3TTOA 3U5UA 1E43A 5IHRA 2DEPA 2BVYA 4PSPA 5FD0A 3BCDA 2C7FA 1TCMA 3WNMA 5TD4A 3BLPX 3N15A 4W88A 3WL1A 1V3LA 2WSKA 4AZIA 3A4AA 1AQ0A 2EBNA 4W8AA 3W53A 2DH2A 2PWGA 2CIPA 2CYGA 3EDEA 4AZ6A 1BSIA 4CVUA 3CZKA 3MMWA 2CHOA 3AZRA 2PBOA 2A3EA 1GW1A 2RGMA 1FFQA 1XSIA 3AIBA 3GTNA 1PIFA 5CXPA 3PHAA 3L2MA 4XB3A 3HJEA 1UD4A 2W67A 3L4VA 1KXTA 3DHPA 4B9YA 1MW3A 1V0NA 2EPLX 1TG7A 1DWGM 3ZOAA 1GUVA 1TZ7A 4HMCA 2NT0A 3SUSA 2DIEA 3AFBA 4PBGA 4F79A 4BQ2A 3AXIA 1IV8A 1C91A 5CSYA 2OYLA 1CXFA 4OIFA 7A3HA 1E6PA 2CBIA 5JUVA 3WENA 4HZ8A 1HJWA 1HL9A 1B2YA 1B1YA 1FP9A 4UFMA 3B9DA 1W3LA 3EDKA 1BHGA 1V0KA 3HMCA 2VL4A 3W0KA 1UQYA 2ZE0A 1CTNA 2VCBA 3VO0A 2WPGA 2O9TA 2O9RA 4BS0A 4B3LA 3RJYA 2NSXA 1B3ZA 1LWHA 1E6RA 1LQ0A 4QAWA 4AD3A 2PWHA 4AW7A 2WKLA 3SCRA 3NSNA 1EHAA 4GZEA 1K6AA 3GNRA 3CIVA 3PZVA 2BY0A 4WK9A 1C7SA 2YBUA 4EAMA 1QHZA 2ZICA 1MXGA 1JGIA 4W86A 4Z2JA 3A4WA 4PMQA 4M29A 4JIEA 5AYBA 4HU8A 1HT6A 2E3ZA 6TAAA 3RM8A 1E9LA 4H04A 1ZBWA 4CD6A 1PAMA 1OM0A 3KWXA 1XSKA 1J0KA 3AROA 1KWKA 3GM8A 1KXQA 3OGRA 4AMCA 3BMWA 5LA2A 1FA2A 1ODUA 1OT1A 3ZMRA 2QV4A 1GCYA 2J25A 2XWDA 4JFSA 1M7XA 5GQBA 4PMYA 2VR5A 1FH8A 1QNRA 1HX0A 2PF0A 3L4ZA 1DWHM 4AIOA 2VZTA 1TVNA 1DWFM 2QMKA 2J7EA 2BFGA 1EOMA 1ZJAA 3MUY1 1VRXA 4GI6A 1X6LA 2WMKA 5E0CA 2FGLA 2GK1A 4PMXA 1BYCA 1JYNA 1H0GA 5D9PA 1NOWA 5BXTA 1WKYA 2XVPA 2VC9A 1WZAA 2PC8A 1QNPA 4FK9A 2XM2A 1DP0A 1JD7A 5A1AA 1V02A 3PBGA 2DDXA 1GOOA 3AHTA 4H41A 1HJSA 4D6FA 4OUEA 3WSUA 4UFHA 1C3FA 3VIHA 2J7GA 3OLEA 2XWEA 3CMGA 1EQPA 3AS1A 3VD7A 3N17A 3EMCA 4DUXA 2DT2A 4DWSD 2WBGA 5CZKA 1UZ4A 4PRWA 1US3A 3GBEA 4D6GA 2V3DA 1OGBA 1XH2A 1CLXA 3D3AA 1K9EA 1HIZA 3AMKA 3UG5A 1JAEA 1LWJA 5LA0A 3AXXA 4OBRA 1QI0A 2PBGA 3M07A 1V08A 3CGTA 1OBAA 5DO8A 1O7AA 3DYOA 4YHGA 1Z32X 3VGFA 4MJ2A 4N42A 2FGZA 4RE2A 1BPLB 3AIQA 1CGUA 4GKLA 4PMVA 3W29A 3T2QA 2PWEA 3W38A 3GBDA 1XYFA 3EMQA 4F8XA 1HP4A 3DYPA 2WM0A 4FMVA 4DWSB 3WQVA 4CU7A 3W81A 1BG4A 3IAQA 2VNCA 1UD2A 3QHNA 4CKQA 1PX8A 4FF5A 3AI0A 5HPOA 2VO5A 3VD5A 1V6XA 4JL2A 3T0DA 1GQKA 2GDUA 1U2YA 1UR0A 1D2KA 1UWSA 1W1PA 1VFMA 1QOXA 2ESCA 2JIWA 3OZPA 3WMCA 2EXOA 3NDZA 3TONA 4FLRA 1OT2A 3AJ7A 2UWFA 2GUYA 1BYAA 3TA9A 2WZEA 2C8NA 3K8MA 1NOFA 3VIKA 3ZJ7A 1W32A 3RCNA 3WH6A 4P7RA 4JHZA 4PUEA 1WPCA 1FH9A 3WQWA 3BXWA 3VIIA 5I3DA 1TVPA 4CD4A 1E4NA 4ZENA 1V6WA 2CITA 3SIMA 2WCSA 4HA4A 1GNXA 2J7BA 2WMIB 1UOKA 2VZVA 1UD6A 3OLDA 1W9BM 1ISWA 2J77A 4MB4A 1J12A 3W4RA 3BAXA 4IPNB 1PIGA 5I77A 2CESA 3SCWA 1ZS2A 4UFJA 1HKKA 3SCSA 2YL6A 3THDA 4J7RA 3N1AA 3CHCA 4MTVA 3WUBA 2VVSA 3WNPA 3GH4A 1MFUA 5ABEA 4WKHA 1J10A 3OB8A 4CGTA 5HBFA 4JKLA 3U7BA 4U33A 4QFUA 3IANA 5FL0A 1HN1A 1JDCA 1XD0A 1IZKA 1W2PA 4ZXLA 3WNLA 4BA0A 1KXVA 1NWSA 1JNEA 4W89A 1BVZA 1A47A 1C90A 4PTXA 1GQLA 2VZOA 1JYVA 1Q6CA 4XX6A 1KBKA 4AIEA 1FP8A 2IUZA 3AS2A 5CG0A 1HP5A 3WD0A 1GVIA 2XFFA 1E6XM 2X1IA 1Y7VA 1DEDA 1QHOA 1B3VA 2WHJA 1J9YA 4PMZA 1GORA 1TE1A 3LMYA 2FHCA 3MMDA 3DECA 4EKJA 1XH1A 5M17A 2WHMA 5BXSA 5EFDA 4MADA 1BLIA 2VCCA 1GJUA 1E3ZA 3CZGA 4PMOA 2DT0A 2BHUA 3EBVA 1NM9A 4OBSA 1JF5A 3W6LA 3UG3A 5C8BB 3VINA 2TAAA 1EH9A 3FAXA 1BAGA 1V3KA 1K9DA 1W3JA 4MNKA 5EFFA 1HJVA 3JUGA 5DFAA 1EXPA 1KGUA 5JIWA 5LA1A 3WDPP 4UR9A 2NW0A 2WCGA 4LYQA 1DWAM 3CH9A 1QI3A 3A3HA 3VIFA 4NZCA 3VMOA 3F5LA 2V38A 1CEOA 4H8UA 4UOQA 1WDQA 1ZBVA 4D1JA 3CHEA 2XVKA 1UWQA 1HJXA 1UKQA 1EIBA 3PZTA 2D23A 1D7FA 4U3AA 3BAIA 5IXEA 1VB9A 4MJ4A 3MKKA 3VIOA 5EBAA 2JEPA 2YA2A 4HMEA 1KR0A 5E0FA 3OZOA 4PEEA 3ALGA 4OOZA 5A8NA 5C70A 1QW8A 4UFKA 2DSWA 2QPUA 3NUKA 3VOCA 1UD5A 1UH2A 3E1F1 1E6ZA 1U33A 5A6BA 4W5ZA 2FDMA 1ZBKA 3GZAA 3DC0A 1ZU8A 4F66A 1OGGA 5A2AA 5GNYA 4UZUA 1ITCA 5JIPA 4H7VA 3ZSTA 1W9VA 5LYRA 2DSUA 1WNOA 3UESA 4B9ZA 4WIWA 3UR7A 4PMDA 4MNMA 4KWUA 2RGLA 3FXYA 3ZO9A 3UEQA 1ISXA 1KCKA 5A6AA 4S3JA 1MW1A 3U5YA 1H11A 1Q6EA 2AAAA 1C8QA 3VIMA 1HJUA 5A6SA 1J0JA 2J7CA 1GVYA 5ABGA 3WF1A 2J62A 2VCAA 1FOBA 5D4YA 2BVTA 1OD0A 3CZJA 2CKRA 3ZT7A 3MSGA 4DWSC 5FIPA 5CLTA 1JD9A 4HZ6A 3SUTA 4JHOA 2XFRA 1TFVA 3POCA 4KH2A 2GJPA 3TTSA 4J3WA 4XV0A 3QOMA 2W61A 1E40A 4J3TA 1JYWA 3FAWA 5GNZA 2OYMA 1MVYA 4TUFA 3WF0A 1HL8A 2VX5A 1I1WA 3SCNA 1V02E 5AC5A 1DWIM 4DUVA 3LPOA 5ABFA 4LX4A 1UA7A 1CXLA 3OBAA 1CGTA 1MW2A 1WE5A 4UQDA 4HU0A 1TUXA 4UFIA 4U3CA 3AZSA 1UKTA 3KL5A 1CXHA 1E4IA 1OIMA 1HNYA 1E56A 3N13A 1JZ3A 2J7FA 3MUAA 3FN9A 1ZJBA 2DH3A 4M56A 2UY3A 4W8BA 4XZWA 3CPUA 4JL1A 4C7GA 4P7QA 1VFUA 2XVLA 4FLSA 1VBUA 3RO8A 1OSEA 1G01A 3U7VA 2G8ZA 1UR2A 5A69A 3VDBA 4WJXA 1QNQA 3F5JA 4GI8A 3SUWA 3ZQ9A 1US2A 2OSXA 2V3GA 4BQ3A 1JZ2A 1HKIA 1GHSA 1XGZA 3WBEA 2DT3A 5D9OA 1EHNA 1UKOA 1CPUA 3VGEA 4J3XA 1JDAA 3VNZA 2XIBA 3AIRA 4AISA 2GSJA 3VIJA 2A3CA 3M6DA 1L0PA 3WFZA 3SEPA 3AQUA 3RMEA 2E4TA 2GFTA 1JYXA 3K8KA 4MNLA 8CGTA 4HA1A 5BROA 2UY4A 1R7OA 1E72M 3II1A 1PX4A 2DPEA 4B16A 3QR3A 3B9EA 1W9PA 3AIWA 2NT1A 2WB5A 1BTCA 1OB0A 4MB5A 2O92A 4GINA 1B3XA 2WZHA 5A3HA 4Z2HA 3VGHA 3ZSSA 1R87A 3T0AA 4Q7NA 3POHA 1XRVA 1ZL1A 2E8YA 3RILA 4RE3A 1H4PA 4NRRA 4UOZA 3AXHA 2WVVB 3O6AA 1GOKA 2E0PA 2E8ZA 2XTKA 1VFOA 2XFYA 1NWRA 2J4GA 2WAGA 2EEXA 1OWQA 1UHVA 2CETA 4OKDA 2GJXA 3G6MA 3TOPA 3UR8A 4AD5A 1YHTA 2J7HA 1TA3A 4L4OA 1GHRA 3EDJA 4KGLA 3WUGA 2BY3A 2YLAA 3WEMA 3VVGA 5AY7A 3KZSA 1PZ3A 4X0NA 4BQ4A 3WFLA 1J18A 3BC9A 1RD6A 4JCMA 3THCA 4CCCA 4JFTA 3VDHA 4Z2GA 4W7WA 3RDKA 2HISA 4TVDA 1GONA 3K1DA 3K4DA 4UQ9A 4W87A 1LLOA 2VQUA 5I0DA 1G1YA 3NYDA 2BXZA 4JKMA 1QI4A 1XCXA 1QBBA 1V3MA 5D8WA 3RIKA 1G0CA 1G5AA 3MV11 5A6JA 2QHAA 1BVNP 1EOKA 3J7HA 4F9JA 1QNOA 2JALA 1NQ6A 3IAPA 5A8MA 1OCQA 3AIEA 1BF2A 7TAAA 3L4WA 1XYZA 4LPCA 3K4AA 4Y7EA 1V03A 2ZUTA 3WNOA 3CZEA 3L4TA 2D3LA 5I24A 1B31A 4HZ7A 1E5JA 1R7AA 3PZUA 2J8GA 2YDRA 4M81A 5HOSA 2D1ZA 1ITXA 3VUPA 3VIPA 1HJQA 2YA1A 1V6VA 4AD1A 4TVCA 1M53A 3WF3A 3VD9A 3ARSA 1HVXA 2QPSA 4MAVA 3OG2A 4U5IA 4HOXA 3VDCA 2E40A 1CLVA 3VMNA 1MXDA 1HXJA 3ZJ8A 2WVSA 4HOWA 4TTGA 2VX6A 3AS3A 3BAKA 3WDQA 2HVMA 2XYLA 3WH8A 4S3KA 4CN1A 4AY1A 1MQRA 1J11A 1VF8A 2FH6A 4WF7A 2JF6A 1AQHA 2OWCA 4AZCA 5IDIA 2WKGA 2B31A 1J01A 3VX0A 4Q22A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3CGM A;  2G41 A;  3ITY A;  2R8W A;  3E96 A;  3OOQ A;  1I2O A;  3NL5 A;  1FKG A;  1X1O A;  2X0S A;  4NXS A;  3K30 A;  2KR7 A;  3STC A;  4LS0 A;  3BMV A;  4YVX A;  3T8L A;  4IUG A;  3I6R A;  3NG3 A;  1IQ8 A;  4EE9 A;  2O9O A;  1LYX A;  1CBG A;  1E55 A;  4O1A A;  4UTH A;  1OYA A;  4IQD A;  1V6U A;  3IKD A;  4F2B A;  1Q85 A;  3MKC A;  1OFR A;  4CQ9 A;  3QQ0 A;  3L68 A;  2Q09 A;  1UZ1 A;  1DTU A;  3C3U A;  1WA3 A;  1YEY A;  3UND A;  2KGJ A;  4A3U A;  3W28 A;  3MC5 A;  4RL3 A;  2QCF A;  1PBG A;  3W1X A;  1HXV A;  3OHI A;  2WAN A;  4MWA E;  1JFH A;  5EMM A;  1XIN A;  4HYV A;  3QM3 A;  4MB3 A;  2QAF A;  3R8H A;  3NJ3 A;  1H5V A;  4HSN A;  2YCJ A;  2J47 A;  3VIL A;  4AHP A;  2WV8 A;  1E0V A;  3A4X A;  5I79 A;  3WEO A;  1CNV A;  1V51 A;  3TC3 A;  1S2T A;  4Q8T A;  3WZ0 E;  1J4H A;  1MYR A;  2JKP A;  2GQ9 A;  3CUH A;  4CCZ A;  2OSW A;  4LFY A;  3V0S A;  3WL0 A;  1JUE A;  2HS8 A;  3ZIZ A;  2QJM A;  3M44 A;  1NIU A;  3ARR A;  4KER A;  2MNT A;  4US5 A;  1TCD A;  3UD6 A;  3GD6 A;  3MYO A;  3B40 A;  4TVU A;  3VGD A;  3MU7 A;  3CWO X;  4A3Y A;  4GQQ A;  2W66 A;  2WVT A;  2F8Q A;  3N34 A;  3TIM A;  4GVF A;  2POD A;  4MSS A;  1RP8 A;  5PTD A;  4O10 A;  4POC A;  4JFI A;  3W7J A;  4DPQ A;  4HJW A;  1P48 A;  3ES7 A;  2BLE A;  2HXU A;  3RU6 A;  3SCV A;  1EO7 A;  5JQ9 A;  2VXN A;  1JXK A;  2ZOX A;  4C65 A;  2CLE A;  3IJD A;  3VNJ A;  5CQ1 A;  3CGN A;  1KGX A;  1SSD A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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