3WL0 | Genus

Total Genus 139

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	139
sequence length	383
structure length	383
Chain Sequence	RARVVCYFSNWAVYRPGVGRYGIEDIPVDMCTHIIYSFIGVTEDTQQVLIIDPELDVDKNGFKNFTSLRSKHPGVKFTVAVGGWAEGGSKYSKMVAAKSTRMAFVRSVVDFLNKYNFDGLDLDWAYPGAADRGGSFSDKDKFLYLVQELRRAFIREGKGWELTAAVPLANFRLMEGYHVPELCQELDAIHVMSYDLRGNWAGFADVHSPLYKRPHDQWAYEKLNVNDGLQLWEDKGCPTNKLVVGIPFYGRSFTLSSGNNNYNLGTYINKEAGGGDPAPYTNATGFWAYYEICTEVDTADSKWTKKWDEHGKCPYAYKGTQWVGYEDPRSVEIKMNWIKEKGYLGAMTWAIDMDDFQGLCGEKNILIKLLHKHMSAYTVPPPR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structural characteristics of an insect group I chitinase, an enzyme indispensable to moulting. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Chitinase
molecule tags	Hydrolase
source organism	Ostrinia furnacalis
total genus	139
structure length	383
sequence length	383
ec nomenclature	ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date	2013-11-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00704	Glyco_hydro_18	Glycosyl hydrolases family 18

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.50.10	Alpha Beta	Roll	Chitinase A; domain 3	Chitinase A; domain 3	3wl0A02
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3wl0A01

4UR9A 3W53A 4PSPA 1H3GA 2YLLA 1UWQA 1E73M 1K9FA 2DSZA 1E71M 1UD2A 3PTKA 1B3ZA 3WDJA 2QMKA 4JKMA 1QNRA 3NSMA 5GPRA 1ZBKA 1BHGA 1HJUA 1PZ3A 3OGRA 2QLYA 1BAGA 1V0KA 4PTMA 4CVUA 4PMYA 1GHSA 1E72M 4JCMA 1EO5A 4V27A 4KMQA 4QLLA 4P7OA 4UNIA 2VZVA 1NOFA 1EDGA 2OWWA 3AHYA 2VR4A 5DEZA 2WLYA 2E9MA 3NYDA 1AQHA 4Z2GA 5JIPA 1W9UA 1JYXA 1ZS2A 4PTXA 3EMZA 3W24A 1QBBA 4MAZA 1XRVA 3IAPA 3AYSA 4XUYA 3WN6A 1VIWA 1H0IA 3ARRA 3N17A 1QNSA 5BRQA 1C8XA 3VIOA 5JH8A 3WY1A 2GJPA 4PMNA 1CPUA 3N12A 3WIJA 1E4IA 2XIBA 5D4YA 1C93A 1SMDA 4HTYA 5HBFA 2BHUA 4AYSA 4F9DA 3PBGA 5A2BA 1NWUA 2ZXBA 5I2UA 1UR4A 4HZ7A 4U33A 2BVYA 4CVWA 3W81A 2WC7A 1UWRA 1W2PA 2OYMA 4OZOA 3SCNA 2DSVA 5A8MA 3W38A 3ZIZA 3OGSA 3ZM8A 3D5HA 2NW0A 2DSUA 2JFEX 3K8LA 2QMJA 2WLZA 2XM1A 1PBGA 3VD4A 2XFRA 2EPNA 1LL4A 4LXFA 3W26A 1JI2A 2VC9A 4OUEA 3W0KA 3ZJ8A 4C7DA 4Z2HA 3T0BA 4AWEA 2WMIB 1V3MA 5ABEA 1XH1A 4JL1A 2YJQA 5I79A 1UKSA 1J0YA 2XVLA 4LYQA 3AMLA 4DWSD 1TVNA 3BH4A 1QI2A 5A6MA 1WB0A 4W5ZA 3UCQA 2XTKA 2WCSA 1JIBA 3W4RA 2BY1A 1MXGA 4UQBA 2JF7A 2ZX7A 4AMCA 3SURA 2VI0A 1E4MM 5CPTA 3TTQA 2X0YA 3I3BA 3L4XA 1W91A 1BQCA 1J0KA 3OA5A 2VVNA 4PCTA 1IZKA 1LF1A 1BTCA 1BPLB 5A6BA 2DH2A 3HJEA 1E15A 3S2CA 4DM2A 3WMBA 1C7SA 1EGZA 1QBAA 2E40A 1V0MA 4WF7A 2ZXAA 2WBGA 3AXHA 3ZQ9A 2E9BA 2B31A 3ZJKA 2G3NA 2CERA 5D9PA 3FY1A 3BAKA 4UTFA 3GH5A 2WMHA 4QFUA 3TA9A 3VGGA 2E4TA 2ZUTA 2DPEA 4ATDA 1C90A 2D24A 1JYVA 4B9YA 2RGMA 1B9ZA 1CGYA 5AC5A 4U31A 2ZUVA 3I3DA 4BF7A 1E55A 3CZKA 5CLTA 2EJ1A 4FF5A 2WYSA 1X6NA 4UZSA 4L4PA 3WL0A 4CD4A 1QI4A 5CSUA 2OSWA 4P8VA 3EDDA 1GUVA 4NI3A 4BQ3A 5JBEA 1ISYA 2J7BA 3OB8A 3AYRA 1KQYA 4P7RA 4GI6A 2CXGA 4WJXA 3GBDA 1JAEA 1EIBA 1NM9A 4MB3A 2JIWA 3W29A 4TUFA 2WC4A 2A3AA 1JZ5A 5KZ6A 5E0CA 1UQYA 2QPUA 3MMUA 2BS9A 1FA2A 1HXJA 1WZLA 4HA4A 2DDXA 2Y24A 3GXFA 2FHFA 3CPUA 5GNYA 1JXKA 4CD8A 4OKDA 2YDSA 4AC1X 1DEDA 3WD0A 1LWHA 1CECA 4KGLA 1CGVA 3MV11 4HZ8A 1W3JA 3FAXA 3N1AA 3VMPA 3CGTA 3GBEA 1FOBA 1BSIA 4AEEA 5AC4A 3BC9A 3OGVA 4M29A 1HJVA 2DGAA 1J0HA 2XSAA 3NCOA 4J28A 1V6YA 4HZ6A 3LMYA 1CWYA 2WMGA 4M82A 2ZUSA 5I5RA 2D3LA 3AMKA 1WDSA 4FLRA 4PUEA 1MWOA 1GVYA 3QOMA 3UG4A 1PPIA 1US2A 5DFAA 1UR0A 4J3TA 2D0HA 3SCRA 3WUEA 1RP9A 1UD6A 3K8MA 5HPOA 4TOQA 1Y7VA 1NWRA 4W84A 3WD1A 4CU7A 7TAAA 2ZUNA 1L0PA 2J78A 1OD8A 1GORA 3ECQA 4IISA 4IM4A 3QHNA 2VZUA 3AROA 3ZR6A 5A8QA 3WUBA 4KH2A 3POCA 4ACYA 1E0WA 4TVCA 4AZIA 4FK9A 3U5YA 2WK2A 2BNJA 1MFVA 3A4XA 1WZMA 2YBUA 2W63A 3NUKA 3GTNA 4FLOA 3MSGA 1OGSA 1RH9A 3BAYA 1JDAA 4CCEA 5LA1A 5BXTA 5CSYA 3WDHA 1V6VA 5A1AA 4MNLA 4D6JA 4U3CA 2CBIA 5TD4A 7A3HA 4QP0A 1N82A 1Z32X 3N04A 3WSUA 2ZUUA 3L4YA 1WDRA 3PZ9A 1HKJA 1C91A 3WNMA 1WE5A 3B9EA 4P7LA 4QCFA 4HPHA 4E2OA 4XX6A 2GVYA 1V6XA 5GQBA 2J4GA 1OIFA 3L2MA 2XG9A 4B15A 1XC6A 3PZVA 3AS2A 5E09A 1LL6A 2BXYA 2PWEA 2WXDM 1BG9A 1QVBA 5D9NA 4MB1A 3QR3A 1ODUA 2WW5A 4WK9A 4C7GA 3A47A 4WSKA 1RPKA 3S6TA 4GI8A 1HIZA 4F79A 2X09A 1W9BM 4DM1A 1M03A 2WHLA 2A3HA 4AIEA 1CTNA 4CU8A 1VFOA 4E4PA 2JALA 1C8QA 1Q6FA 2G3JA 3SUUA 1FHLA 1EXPA 4Q22A 1PX4A 3CZLA 1Q6DA 4LX4A 2YL6A 1I1XA 4UQAA 5IDIA 5JBDA 1KB3A 2YA1A 5I23A 5I3DA 4J3WA 2X8RA 1SR0A 5ABFA 2VX6A 3CMJA 2EO7A 1GPFA 4CKQA 1KXQA 4YHGA 2EQDA 1JAKA 2QPSA 2JEPA 2OLHA 4UOJA 1OB0A 1D2KA 3NDZA 4GZEA 3CZJA 4XZWA 1A47A 5A8NA 4MAVA 2VZSA 1PX8A 4PBGA 2ESCA 2J7CA 3CUIA 4WKFA 3AHTA 5ABHA 4W88A 3IAQA 1JGIA 3NIYA 1XGZA 4UQCA 1JZ7A 3T09A 2PI6A 4P7NA 5ABFB 1JZ2A 5C70A 4IPLA 4EAMA 1J18A 1HX0A 2CBUA 3QGVA 4ACZA 2YL9A 3SCOA 4URIA 1B31A 5A69A 3BAJA 1QI3A 1QI5A 3VGHA 1UKPA 3RJYA 4MB4A 3VO0A 4A4AA 1KQZA 1XYZA 4W89A 2XFFA 1KWKA 1HVXA 1WCGA 1ISXA 1HKIA 5IHSA 1JL8A 1E6PA 3BGAA 3HU7A 4BCEA 4JCLA 3VX0A 1A3HA 2WPGA 5EFDA 5A6SA 2XJ7A 3UEQA 2G4FA 3CUGA 1VEOA 1QHZA 3CUJA 2YA0A 1HL8A 2GFTA 1VFUA 2VVSA 4KGJA 3VIKA 1NP0A 4ACZB 1H2JA 4UQ9A 1UR8A 4PMQA 3PZMA 4LGXA 3ARYA 5IFPA 1B3YA 3GXDA 1B3VA 1UD5A 4R5EA 2WCGA 3MUY1 4DUXA 4LPCA 3T2PA 3AIWA 4HMDA 4UFLA 1JZ3A 2CHNA 2AAAA 2NSXA 3AZRA 3WQWA 3DECA 4JAWA 3W28A 2DT3A 3DHPA 3VILA 1W1VA 3VGFA 5EMYA 3AMDA 1W9XA 4PMVA 4PUDA 2OYKA 4N0RA 4E8DA 1V6UA 1C3FA 3ARVA 2WVTA 3VD5A 1OBAA 3DYOA 1QHOA 1GQJA 3WQ8A 4MPKA 3ARPA 2GJXA 1E9LA 1GOWA 3WUFA 3PTMA 1J0ZA 4Z2KA 2RGLA 2MANA 2WZEA 1W9PA 1LG2A 2DIJA 4D6DA 4QCEA 2YBTA 1HVQA 1BGGA 2WMKA 2YLAA 3QHMA 3CHFA 3WQ6A 4HOZA 3N15A 3RILA 2J7DA 1U2YA 3CZ8A 3TTOA 3LPPA 2UY4A 4HU0A 4HP5A 1HJQA 3VIGA 2WAGA 3L4UA 3EDEA 1UH2A 3UETA 2XWDA 4UFJA 5CLWA 4PMXA 3WQVA 1OSEA 5M03A 2GJXB 2EXOA 3VNZA 4GQQA 1CIUA 2WC3A 1FH9A 3ARWA 4Y7EA 1NWSA 3MU7A 1OT2A 3AXIA 1KR0A 3FXYA 1JNEA 2E8YA 3VM7A 4P8WA 1UD8A 2XGBA 3VIPA 3FHQA 2OWXA 3OLIA 4UFMA 2V3FA 4YPJA 5I24A 1BYBA 4FLSA 1VJZA 3SUVA 3VGDA 3OLEA 5A6LA 1WPCA 2W61A 1B3WA 2VOTA 1HF6A 2WKLA 1ZB5A 2WM0A 1MFUA 4PSRA 2WMIA 3SEPA 7CGTA 3KE0A 3N9KA 3AHVA 4C7FA 2VNCA 3A3HA 3VGBA 2V5DA 1GZJA 1TMQA 3JUGA 4Z2JA 1WP6A 1KBBA 3VMNA 3AJ7A 4EANA 1WO2A 1PEZA 1KWGA 4MNMA 3BMVA 2OSXA 4A3HA 4ML4A 5BRPA 3ARUA 1EA9C 1F4HA 2XVPA 1JYNA 1FFRA 2EEXA 1ISVA 3CH9A 5M3WA 1Q6EA 1L8NA 9CGTA 5I77A 3VMOA 4W8LA 3CZEA 4P8XA 1X6LA 1DWFM 4HOWA 1H09A 1VFMA 1E0XA 2V38A 1XD0A 4GINA 4GZIA 2ZXQA 3DYMA 4M8UA 1QPKA 3ZJ6A 2VL4A 2G3MA 1C92A 2DT0A 4TX8A 1DTUA 3CHDA 4J27A 5A6BD 2ZWZA 2XFYA 3T08A 1JF6A 1BLIA 3GNPA 2VZOA 4AXNA 1RD6A 2VZTA 1VBRA 1E6ZA 1KXHA 3GZAA 2VMFA 4UQDA 4QLKA 1O7AA 1GJWA 1XCXA 5ECUA 1E4NA 4QDMA 1GOKA 3VD3A 3OZOA 1UZ4A 3WKZA 2WWDA 1JI1A 2VURA 4IUGA 2WHJA 3ARZA 1OT1A 3BLPX 1EHAA 1WAWA 3WMCA 4CD6A 4GZJA 4UFIA 4MDOA 2PB1A 2CESA 1E43A 4OBRA 3VDHA 1QNPA 4B16A 1MQPA 5A95A 1K9DA 1UWIA 5AY7A 1GJUA 1LWJA 3PTQA 5FKYA 3CMGA 1HJWA 3PZOA 1YHTA 3AXXA 2WVUA 3NSNA 3O2LA 2O9PA 1O6IA 1UH4A 1H41A 5A2CA 3KL0A 3VVGA 4QLJA 3ARTA 1CGWA 1V0LA 3TONA 1MYRA 1UQZA 4AD5A 3BCFA 1E5JA 3QOKA 3VIHA 2GDVA 3FN9A 2Y2WA 3CZGA 2Z1KA 4PMDA 2QHAA 3KL3A 2DEPA 4UOQA 1ITXA 3WH7A 3NSXA 1OWQA 2O9RA 4KRTA 3CLWA 4KWUA 2DSWA 1LLOA 4M80A 3OIHA 2V3DA 2VUYA 4DWSB 2JF6A 4M1RA 1EHNA 2D23A 4N42A 3VX1A 3AHXA 5CGMA 3GH7A 3AISA 4PMRA 4B3KA 3N11A 2VRQA 2XUCA 1GQKA 3T2QA 5F7UA 3U57A 3WD3A 3AFBA 5HOSA 4GIAA 3VDBA 1ZU8A 8CGTA 3BCDA 4CCDA 5CZKA 1JD9A 1K6AA 1W1YA 1OIMA 4AZCA 1M01A 4DUWA 2E9LA 3VINA 3ARXA 2ZICA 4MTVA 4PRWA 5FOOA 2XSBA 3WNOA 1DWGM 3WNLA 3QHOA 4W93A 3OG2A 4S3JA 3TTYA 1ZBCA 4PEEA 3ARSA 5LA0A 1UD4A 4JHZA 2A3CA 3KWXA 3B9DA 4NSBA 3EYPA 1VJSA 5DMYA 1U33A 1TA3B 2BY0A 2GUYA 3ALFA 1HP4A 3GM8A 3WEMA 1UOKA 4CU6A 1UHVA 4AZCB 2XPKA 4JKKA 3FNDA 3AHZA 3IJ7A 1H1NA 2BHZA 1V6WA 4F9JA 2CIPA 1CGXA 2CKRA 1R85A 2J77A 5BYWA 1JG9A 2ZX8A 2G8ZA 2GK1A 1PAMA 3PZNA 3EDKA 1Q6CA 2V5CA 4OOUA 3T2OA 4AD3A 1NP2A 1GOOA 2BY2A 1XYFA 5C71A 1MVYA 2E0PA 5DT7A 3RO8A 4GI9A 3AS1A 2JEQA 4GQRA 4HOXA 1BYDA 1JD7A 1NARA 2D2OA 1H49A 2XM2A 4BA0A 3TTSA 4UFKA 3CUFA 1HNYA 3KEHA 2Y8KA 4W8BA 5D8WA 3W27A 4AZ6A 2XHYA 3WMSA 1VENA 4MB5A 5EFFA 3F5LA 4GKLA 1XV8A 3CHCA 4PMOA 3VIFA 5D8ZA 2GK1B 4AEFA 1FH7A 3PN8A 1GOMA 1JDDA 1X1NA 2VRKA 2WMFA 3AMGA 5A3HA 1UH3A 1UWTA 2C7FA 1UR9A 4AD2A 1QOXA 1QNQA 1JZ6A 1E5NA 4QAWA 1CXEA 1G1YA 5CXPA 4U5IA 5CG0A 5GNZA 2IXVA 1CXKA 3GYCA 4TTGA 2DSKA 3K1DA 3SUTA 2BVTA 2YL8A 2W91A 4AIOA 3VD7A 1V3JA 2J8FA 1I1WA 2UY5A 1NWTA 5CPQA 3VU2A 5EB8A 2XIIA 2Y4SA 1EOMA 4PMZA 1KCLA 4J3XA 1UR2A 2JE8A 2CHOA 1FFQA 2WNWA 1LQ0A 2VQUA 4ZXOA 3BAIA 2J7GA 4LQ1A 3VPLA 3WD4A 3WF4A 5AYBA 1UA3A 3TP4A 2CITA 3MS8A 3A4WA 1VAHA 3FAWA 4TVUA 2Z1SA 2VX4A 2ZE0A 5I78A 2XGIA 2VX7A 4Z2LA 2WVSA 4M56A 3CBWA 2VTFA 1VBUA 1B1YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NOW A;  4FLQ A;  3VUP A;  1CZ1 A;  2X2Y A;  4AZH A;  4WKH A;  3M46 A;  4ZE5 A;  3WBA A;  3IJ9 A;  3O6A A;  4JFT A;  4F8X A;  2W66 A;  1BFN A;  3I3E A;  3WDQ A;  3KL5 A;  3M7S A;  1CYG A;  2VJX A;  4AZG A;  5BXP A;  1PIG A;  2IXU A;  3F5K A;  1EDT A;  3PZT A;  3L4T A;  2PBG A;  4J3S A;  1K9E A;  1J0J A;  3J7H A;  4PYS A;  2WWC A;  2ZX6 A;  1E3X A;  5FIP A;  2CCR A;  3ZT6 A;  4TTU A;  1CXI A;  4JHO A;  3SCQ A;  1OM0 A;  1V03 A;  4CUC A;  3WFL A;  2CET A;  1UR1 A;  3PHA A;  2WB5 A;  4JFU A;  3MUA A;  1W9D M;  4AD0 A;  4HA1 A;  1DWH M;  1WDQ A;  5A94 A;  3B8S A;  4W7W A;  4V2X A;  5IHR A;  3G6L A;  1BGA A;  3BXW A;  3AS0 A;  4EKJ A;  2AOS A;  2PWH A;  3RM9 A;  2HVM A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5C9Z A;  4K2S A;  4IMA A;  3SRD A;  3I7R A;  1K9E A;  3LK6 A;  3W2J A;  1J0J A;  1RLC L;  4PFM A;  3ZT6 A;  5I09 A;  1RJR A;  3DX5 A;  3EB4 A;  4GX9 A;  4I9A A;  4ZO8 A;  1V03 A;  3M0H A;  1UR1 A;  4JFU A;  1W9D M;  4HA1 A;  3LNM A;  3E02 A;  3QJA A;  3B8S A;  1VLW A;  5DEL A;  3G6L A;  1BGA A;  4JS3 A;  5EPD A;  2PWU A;  4EKJ A;  2ISD A;  3RM9 A;  2NWS A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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3WL0A

Total Genus

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Chain Sequence

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