3WQVA

Crystal structure of ostrinia furnacalis group i chitinase catalytic domain in complex with a(glcn)5
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
RARVVCYFSNWAVYRPGVGRYGIEDIPVDMCTHIIYSFIGVTEDTQQVLIIDPELDVDKNGFKNFTSLRSKHPGVKFTVAVGGWAEGGSKYSKMVAAKSTRMAFVRSVVDFLNKYNFDGLDLDWEYPGAADRGGSFSDKDKFLYLVQELRRAFIREGKGWELTAAVPLANFRLMEGYHVPELCQELDAIHVMSYDLRGNWAGFADVHSPLYKRPHDQWAYEKLNVNDGLQLWEDKGCPTNKLVVGIPFYGRSFTLSSGNNNYNLGTYINKEAGGGDPAPYTNATGFWAYYEICTEVDTADSKWTKKWDEHGKCPYAYKGTQWVGYEDPRSVEIKMNWIKEKGYLGAMTWAIDMDDFQGLCGEKNILIKLLHKHMSAYTVPPPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Fully deacetylated chitooligosaccharides act as efficient glycoside hydrolase family18 chitinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase
source organism Ostrinia furnacalis
total genus 140
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wqvA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wqvA01
1HF6A 1ZBWA 5IHSA 3DYPA 2CPUA 3OLEA 4BZYA 3I3BA 2VZVA 2XGBA 4CU7A 3WL0A 3ALGA 3AS0A 5D4YA 3WDJA 3VGGA 1G1YA 2W5FA 3TTQA 2WWCA 2XPKA 3VNYA 3AHVA 1HJVA 2YA0A 1ISVA 3BSGA 3RM8A 1ESWA 2DEPA 1CGTA 3ARZA 2Y2WA 1LLOA 2XWDA 2MANA 3AROA 2ZXBA 1V6YA 4UOJA 1NWUA 1XCWA 5A6KA 2VZOA 1VEOA 1W9XA 1MW3A 2J7CA 2J7DA 3SCSA 4JKLA 5A6MA 1SFSA 2XVGA 2VI0A 1FFQA 1QNQA 3L4VA 1BYBA 1CGXA 4J3XA 4HPGA 1BLIA 2WSPA 4RL3A 2J47A 1JZ3A 4NSBA 2ZXAA 3VKKA 2V5DA 4W93A 3VU2A 3IAPA 1UR9A 3UR8A 2O9OA 1E6SM 1W3KA 2C7FA 2XJ7A 4AIOA 3AIQA 5A6AA 1WDPA 3CMGA 4BF7A 4UFMA 2OLHA 4EAMA 3W26A 4OUEA 2X05A 1QNOA 1UD6A 1QI3A 3KE0A 4AYSA 2CBIA 2IXUA 3CHFA 3VGBA 3AS3A 2EQDA 3CZ8A 3L2LA 4MNLA 4PMRA 3VD4A 3AFBA 2BNJA 1C93A 3THCA 1ITCA 1QOXA 3AMKA 4AIUA 2D1ZA 4EK7A 1V3JA 2J79A 4W8AA 4H2CA 4C7FA 3A47A 1JD7A 3GNRA 5A8QA 3G6LA 5A95A 1WO2A 2XFYA 2WHJA 1K9EA 1VB9A 2VURA 4W7UA 1QHPA 1J0HA 1W1PA 5A8OA 5I0DA 3MUZ1 4HA3A 2ESCA 3K4AA 1QPKA 2VTFA 4DWSC 2DH3A 1BVNP 4GPNA 1LWHA 1C8YA 4W84A 3BAWA 2WBGA 4TTGA 3A4XA 4KWUA 1CXFA 3OG2A 4P7LA 3CUIA 1KXVA 4OBSA 3VDHA 4MNJA 4AC1X 2ZUVA 3EBVA 1BYDA 2QMKA 4QCEA 4F9DA 1GQIA 5I77A 2Q8XA 3PTQA 3PZMA 1KR1A 1JYXA 3OZPA 1TVPA 2GJXA 3LPGA 1US2A 4AD2A 2NT0A 2W67A 3VD9A 2AMGA 3KEHA 1ZB5A 1TFVA 4W7VA 5ABFB 4HZ7A 3ZJKA 1JDCA 1H1NA 1FH8A 1LG1A 1HL9A 5A2BA 3KZSA 1FA2A 3WUFA 3VPLA 3ARPA 2WCAA 3WNPA 1MXGA 1A3HA 3QHMA 4MNMA 4D71A 2VNCA 5LA1A 2ZXQA 5D8ZA 3EMCA 3M46A 2WLYA 3VIPA 2DSUA 2YLAA 1QI0A 3OGVA 1QW9A 2C8NA 4X9YA 2J74A 1UH2A 3ZSSA 3WD1A 3SCRA 3J7HA 1KBKA 2VRJA 3VGFA 5GNYA 2WC4A 3WQ8A 4D6DA 3EMQA 2ZWYA 4UFIA 5FL1A 3W27A 3A4AA 4AISA 4PSPA 2XVPA 2JF6A 2J7EA 4DUWA 1UG6A 1V02A 4A3HA 3AHYA 4MB4A 2O9PA 1MQPA 4E2OA 2VVNA 4GINA 3THDA 2XWEA 1GVIA 3WQ4A 3LPPA 4HTYA 4L4OA 3CHEA 2VCCA 4NRSA 4KMQA 3VILA 1RD6A 3AJ7A 2G3JA 1K6AA 1FHDA 1WZLA 4JKKA 5D9OA 3WKZA 3WNMA 1OD8A 1VIWA 1I1XA 3SCWA 4IM4A 1GCYA 5D8WA 2WBKA 1W1TA 4W89A 4WSKA 3AI0A 4A4AA 4CVUA 1FP8A 1QBBA 3PHAA 1UWUA 1NWSA 3OLDA 4HZ8A 4AW7A 4GKLA 1E0XA 3VX1A 4CD7A 2VOTA 1WZAA 5CPQA 3ZT5A 1V3MA 4WLCA 6TAAA 4XZBA 2EPKX 4CCCA 3EMZA 1B3YA 1EHAA 4H7VA 1C91A 4AD4A 1ZBCA 2DSKA 4QFUA 3CIVA 2VC9A 3GDBA 4OBRA 3WF4A 1JZ8A 1JIBA 1ZL1A 4PYSA 3VD3A 2BFGA 2Z1KA 5A8PA 1UOKA 5A94A 3FAWA 4UQDA 3N9KA 2YL6A 1Q6FA 5HXMA 1JZ4A 1BTCA 2EO7A 2DIJA 1QI2A 2CERA 3VIKA 1MFVA 4GIAA 3T0DA 2CNCA 3ZT7A 2XYLA 3OA5A 2E3ZA 2NSXA 3WEMA 5A6JA 1E4NA 4P7NA 5C8BB 1BYAA 4PTMA 3ZM8A 3MV11 3M07A 3AMCA 3BAKA 1VBUA 1PZ3A 3CHDA 4B3KA 3F5LA 3WF2A 1GORA 1GOMA 2WKLA 4N42A 1EHNA 4UR9A 5A2AA 4AD1A 4PEEA 4GO8A 3WBEA 1KXQA 1TCMA 1EQPA 1US3A 1BAGA 2GVYA 3L4ZA 5FKYA 3W38A 3CGTA 3VX0A 1JI1A 3CUJA 1B2YA 5BRQA 1HJXA 5I2UA 2A3CA 3ZSTA 2CESA 3OB8A 2E0PA 3U57A 4UCFA 3SCVA 4WJXA 2XVLA 3QR3A 4UZUA 4W88A 2CXGA 3SCOA 3AIWA 5HDRA 1OM0A 5I23A 3MMDA 1UA7A 1E6PA 4CD6A 2E9MA 4YPJA 1JNDA 4UQCA 2PF0A 1HXJA 3FAXA 1U2YA 2G3MA 4ZEPA 5D9NA 4KRTA 1E3XA 1XH1A 4MPKA 3GTNA 4TVCA 1LWJA 2FGZA 3VNZA 4OJYA 3WUEA 3CO4A 3AHZA 3UCQA 4GZJA 4YN5A 1VRXA 5LA2A 1TG7A 1QHZA 3AXIA 3BAYA 5BXPA 2E40A 2XFRA 3SUSA 3ZIZA 4LYQA 3ZMRA 4IISA 4U31A 5M5DA 4JFTA 1W3JA 3WMCA 3BC9A 1GQKA 5FOOA 4PTWA 1LG2A 1IZJA 1J12A 4JHZA 1BQCA 1X6NA 5JH8A 3CPUA 3BAJA 3GNOA 3BSHA 2A3EA 2WMHA 1G0CA 3EDEA 4PTXA 3K8MA 3N04A 3F5JA 1ISWA 3NDYA 5ABEA 4J3WA 5JIPA 3UETA 1GPFA 1WB0A 4J28A 4M82A 2WHKA 3MKKA 1E4LA 3RDKA 3L4TA 5ABHA 3RMEA 3A6OA 4TVUA 4AD5A 3FHQA 4FLRA 1ZBKA 4UOQA 3TONA 1EQCA 4D6HA 3MUAA 4FF5A 2XSAA 2JIWA 1JFHA 1IZKA 5CLWA 4U3CA 1BGGA 3T0BA 1E1FA 1UUQA 3A3HA 3BMWA 3VIIA 1FH9A 3HJEA 4JFSA 4Q22A 4UQAA 1U33A 4D6IA 1MFUA 4ATDA 5CZKA 1V3LA 1CGVA 4MJ2A 4AY1A 3FW6A 2VJXA 4P7QA 8CGTA 1Q4NX 1CGUA 3W53A 1JYWA 3U5UA 2GFTA 2WK2A 3PZOA 2E8YA 1RPKA 1ITXA 1BFNA 1UHVA 3DYMA 5HBFA 1UWSA 1EDGA 2J78A 4CUCA 1B3VA 3W81A 2J8GA 3NIYA 1W2PA 9CGTA 1E3ZA 1OIMA 1UZ4A 4F9JA 1XSKA 3MO4A 1FOBA 3NSNA 5FL0A 2V3EA 3ZJ6A 4J3VA 5HNNA 2ZUNA 3CZGA 3EDJA 1EA9C 4FLOA 4JFUA 3AS1A 1D3CA 2GDUA 1CNVA 3F4VA 1CXIA 2ZX5A 4GZIA 4LX4A 1E6XM 2UY2A 3W29A 1AQMA 1C8QA 2YJQA 3WSUA 3I3EA 5AC4A 4HOWA 1UWTA 3WN6A 3G6MA 1EGZA 1ZJBA 3WH6A 1V0NA 2ZUTA 1E6QM 3NSXA 5I78A 1BGAA 3EDKA 2Y4SA 4EE9A 1CYGA 3AZTA 2D3LA 3CUFA 3M6DA 4CU8A 3AHTA 4IPNB 1PJ9A 3AYRA 1XHGA 4WKFA 4PRWA 1SMDA 4PMVA 1LL6A 1V0MA 3WQ5A 1TUXA 3N13A 1JL8A 2WMJA 3T09A 1B3ZA 3B9DA 2VR5A 1FFRA 2PWGA 5DT5A 1DP0A 2CKRA 4JFWA 2F2HA 5KEZA 2ZICA 2RGLA 1J0YA 4U2YA 2YBTA 3B9AA 4GQRA 3T2OA 4AWEA 4Z2IA 1BHGA 4CN6A 4AEFA 2D20A 1ISYA 1JZ5A 2G4FA 4BQ5A 5AYBA 3RO8A 4E8DA 1PAMA 2E9BA 4NF7A 1Q6DA 1GOOA 3GH4A 1H4PA 2ZX6A 3AQUA 3T0AA 4WSJA 4ACZA 4Z2LA 1DWIM 2QPSA 1OGBA 1GONA 3ARYA 1UR0A 5A1AA 2BHZA 3TTOA 2OWXA 4PCSA 5A6BA 2E9LA 1KGUA 3AXHA 4K68A 2G3IA 2WPGA 2W63A 1J0IA 1J01A 1G9HA 4QCFA 5M17A 3SUVA 2GDVA 2J7GA 2FHCA 5CSYA 5LA0A 2VX6A 4LYRA 1U30A 3WUBA 1QBAA 3AISA 5HOSA 1JDDA 4OOZA 1P6WA 3HU7A 4BQ2A 4QLKA 2BHYA 1NP2A 4LGXA 4AZCA 1TE1A 3DHUA 3IANA 5BRPA 2X09A 3PTKA 4M29A 6A3HA 1W9UA 2D0FA 2PI6A 2BXZA 5I6SA 2V3FA 2YOCA 1LQ0A 2YIHA 2BY1A 2F61A 1XRVA 3NSMA 1PPIA 2CKSA 2W4XA 3OGRA 3PTMA 5BCAA 1V08A 2OSXA 4UOZA 1UR8A 2EBNA 3MMUA 1K9FA 1UR1A 3POHA 1PX3A 1SYTA 4LQ1A 2ZUSA 5BYWA 7TAAA 2XGIA 1D2KA 2WM0A 3W6MA 1CIUA 1HJWA 2VX7A 1BYCA 3DHPA 1KFWA 3ZQ9A 1M04A 2FHBA 2GJXB 1H49A 2DQXA 4CVWA 1GVYA 3PZ9A 2Z1SA 2QPUA 4U5KA 4QP0A 1UKQA 2JE8A 1UQYA 5AYIA 2VVSA 1I1WA 1HJSA 1JNEA 4CCDA 1HP4A 1GQJA 4Y7EA 2CEQA 3MSGA 1BF2A 1Q6CA 2EPOA 5A69A 1E4IA 1OWQA 3RM4A 2BHUA 3VIHA 3VD5A 5DMYA 4DUVA 3ARVA 3WQVA 3CUGA 3ARSA 2D24A 3RCNA 4HU8A 3K4DA 2BVDA 1JFXA 1JXJA 5CLTA 1O6IA 3N18A 4E8CA 2BV9A 1F4AA 3SURA 2YLLA 4MB5A 4E4PA 1OCQA 5C70A 4WIWA 2XTKA 3WBAA 3FN9A 3ARRA 3EYPA 4V27A 4BA0A 1LL7A 1E1EA 4D72A 3K8LA 1E6ZA 3ARWA 4DWSA 1VENA 4J27A 2FH8A 1X1NA 3VIJA 4GI6A 4U33A 2FHFA 3ZO9A 1RP9A 4QAWA 3L4YA 1VFMA 4GQQA 2D23A 2NW0A 4W5ZA 4PTVA 1H09A 1UKSA 5M3WA 1JZ6A 2GK1A 2ZXDA 4CD4A 4JHOA 1R86A 4ZENA 4V2XA 1JF6A 1J0KA 2WB5A 1HN1A 4P7RA 2FH6A 2EEXA 4EKJA 5BXTA 1XCXA 3WIJA 4AIEA 2WMFA 2WNWA 2WZHA 4F79A 4JZ5A 5A6BD 2WMGA 1GJUA 5M03A 1OD0A 4HP5A 2E4TA 4M8UA 3B8SA 3ECQA 3ZOAA 4PUDA 4ZE4A 4R27A 3BCDA 4FK9A 3I3DA 5JBFA 4WK9A 3GH7A 2ZE0A 1E71M 2PWHA 3SIMA 4DM1A 2Y24A 5CGTA 3VMPA 3OIHA 2YDRA 1UYQA 4UFKA 1FP9A 5CSUA 1XGZA 3HMCA 4BQ3A 3CZJA 2GSJA 4CGTA 1HVXA 2ZOXA 3AIRA 4UZSA 1PX8A 2A3BA 3KL3A 1CLVA 1W3LA 3CZEA 1V3HA 3GNPA 5HPCA 4Z2HA 1G94A 1NH6A 2PBGA 3WH8A 3GXDA 4H8UA 3RIKA 2D3NA 5HPOA 1IV8A 2D2OA 4M1RA 4ATLA 1VJZA 3APGA 2X8RA 3ARQA 4OOUA 4MJ4A 1SR0A 1MW1A 4OIFA 1CXEA 4L4PA 1TZ7A 4AEEA 2VO5A 3TOPA 2EXOA 2VX5A 3UERA 4DM2A 1JAKA 1EXPA 3VM5A 4GZEA 2WVTA 1H41A 1EDQA 2QF8A 1B0IA 1H2JA 3SEPA 4CD5A 3VTRA 3VVGA 4P8VA 4ATWA 3HN3A 5BXRA 2XIIA 1XSJA 2VX4A 1BG9A 1VFUA 3O6AA 3WDHA 4PMZA 2XM2A 2FGLA 2YL8A 4TXEA 1E73M 2QLYA 2WMIA 2AOSA 2IUZA 1AVAA 1MQQA 5IXEA 4H41A 1I75A 4P8WA 3U7VA 5JIWA 1KBBA 2WZIA 2D22A 4MB1A 3WH5A 3VGDA 1TA3A 2XVKA 1R87A 5IFTA 4UQBA 4RE3A 4V28A 5I24A 3S2CA 2QMJA 1EOKA 3IK2A 2BVYA 3TP4A 1TMQA 2FDMA 3POCA 3S6TA 2VCBA 1DEDA 1C92A 5A8NA 4AZGA 5BXSA 5F7UA 2YBUA 3CH9A 4XB3A 2VZTA 3NUKA 1Q6EA 4HPHA 1BSIA 4DWSD 3AICA 4M24A 4M56A 4XZWA 5BROA 3WNLA 2D0GA 4HMCA 1OB0A 1NOUA 4B15A 3AMGA 1WKYA 4TTUA 3VIOA 5GPRA 2VCAA 3WQ6A 2CHNA 3BXWA 5AY7A 3D5HA 2WHLA 3K46A 1VJSA 4NI3A 3K8KA 3WFLA 3DECA 3ARUA 1DTUA 4TUFA 2WVSA 2DH2A 2V3GA 1G01A 2YA2A 5EFFA 3PBGA 2RGMA 3ZR5A 3IAQA 1C8XA 4JL1A 4BS0A 3UR7A 2OYKA 1V0LA 2WAGA 3VDAA 2O9TA 1QW8A 1HT6A 2VQTA 4TX6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DCD A;  1HF6 A;  3RUB L;  1PUD A;  4XBS A;  2CPU A;  4BZY A;  4R53 A;  3I3B A;  4RJE A;  3N4E A;  4LCR A;  2XGB A;  3KVK A;  4QSH A;  4L6D A;  4JXC A;  5D4Y A;  1GJP A;  3NDO A;  2E7F A;  2PDW A;  1H60 A;  3TTQ A;  1FTX A;  2OFJ A;  2WWC A;  4F2T A;  3EWW A;  1Q2S A;  2AKM A;  2DEP A;  2Y63 A;  3PB0 A;  4FXR A;  3UXD A;  4GH1 A;  2RHG A;  7REQ A;  1BXC A;  2XWD A;  4H00 A;  5C54 A;  3N4A A;  1V6Y A;  2IKI A;  4IP5 A;  5A6K A;  1SW3 A;  1POJ A;  3H54 A;  1VEO A;  2IS7 A;  4JDY A;  1W9X A;  2J7C A;  3SCS A;  2OMA A;  2XVG A;  4IIG A;  4X60 A;  1IWA A;  1CGX A;  4J3X A;  4EP8 C;  4HPG A;  1BLI A;  3SN4 A;  1JZ3 A;  1G4E A;  3QC3 A;  4LAU A;  2B81 A;  4W93 A;  1GOX A;  1E6S M;  1V77 A;  3C56 A;  4F0M A;  2I5I A;  1BRL A;  4MF4 A;  5A6A A;  4DH0 A;  3ABX A;  1JPD X;  3CMG A;  3ANY A;  4JTG A;  2GUU A;  1P0E A;  2OLH A;  4EAM A;  2TOD A;  1QI3 A;  2X41 A;  3CAS A;  3M5V A;  4AYS A;  3C0L A;  3CZ8 A;  2BNJ A;  3KRB A;  1QOX A;  3AMK A;  5CEW A;  4DHG A;  4AVF A;  4TYO A;  3A47 A;  3G5E A;  4QAI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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