3CH9A

Crystal structure of aspergillus fumigatus chitinase b1 in complex with dimethylguanylurea
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based dissection of the natural product cyclopentapeptide chitinase inhibitor argifin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 147
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3ch9A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ch9A01
4HA3A 1XH0A 2EBNA 4M56A 1K9DA 2A3CA 3HMCA 2YA2A 4QLLA 3AMKA 3CH9A 1RH9A 1BG4A 4EAMA 1W9DM 2Z1SA 2J7FA 5BROA 4MB3A 4FLQA 4P7RA 1UR0A 4UR9A 4S3JA 1HF6A 1JDAA 1XH1A 1PPIA 2DT1A 2CHOA 3SIMA 2WAGA 1VB9A 3AISA 4JHOA 4AZCA 4TTGA 2A3BA 2V3FA 1OIMA 3W82A 1W3LA 3ZR5A 2ZX5A 5A1AA 3MV11 5CJ5A 1UR4A 2DGAA 7TAAA 2J74A 5CSUA 4QLJA 1ZJBA 3HJEA 4UOZA 1EQPA 2D20A 5FIPA 4EK7A 5E6ZA 1KFWA 4PYSA 3VNZA 4CKQA 1QVBA 1H4PA 1U33A 4UQEA 1PBGA 1BTCA 2EJ1A 1WCGA 1BLIA 4JAWA 1OSEA 1SR0A 4PMUA 5JH8A 2XFRA 1G5AA 2UY3A 1OGBA 1K6AA 5BXPA 1JYXA 1E6ZA 4ACYA 4C7GA 2QHAA 3WQ6A 4JKKA 4GQQA 1JL8A 4AD3A 2DIJA 1H0IA 1UH3A 2FHCA 5LYRA 3MSGA 2GJXB 4XX6A 5GNXA 3VIOA 1LQ0A 4AY1A 4W84A 2C8NA 3F5KA 1XCXA 4P7OA 4W8LA 5JBFA 4LX4A 3WMBA 5DF0A 2IUZA 5A8QA 5GNZA 3WKZA 1H5VA 3N13A 3MUAA 1VRXA 3CBWA 2VVSA 4MNKA 5JUVA 2YJQA 4PTVA 3F5JA 4XUYA 2PBGA 2A3HA 4DM2A 1V6YA 1BYCA 2ZX6A 1IZJA 2CKRA 2E9LA 1GVIA 1UUQA 4KGLA 3SCTA 1PX3A 5BYWA 5DFAA 1R8LA 1XYFA 1PEZA 1GPFA 2VURA 2XGIA 1DHKA 4HU8A 1MFVA 3SUSA 4AZIA 4DWSA 2ZXBA 3OZOA 1JIBA 1VBUA 1QI3A 5CLTA 3N18A 3MO4A 1CXLA 5AYBA 3VGFA 1WPCA 4AC1X 1K9EA 4GI6A 4JL2A 1H11A 2VQUA 5E9AA 1E5JA 2V3DA 3VIGA 1ISZA 3GBDA 2D2OA 2XVPA 3OGSA 2WMGA 3MMDA 2C7FA 4WIWA 1HJXA 4PUDA 1ISWA 2VC9A 1N82A 4U5KA 2DQXA 4KGJA 3N17A 4FK9A 3WF3A 4M29A 1HT6A 2BV9A 1PIFA 3IAPA 3WNNA 4YHGA 3UG4A 1E6SM 5E0CA 1KR0A 2G3NA 1WE5A 3WQ4A 4J3VA 1L0PA 2F2HA 2DH2A 1E4IA 3WMSA 1GVYA 4TVUA 1ZS2A 1UA7A 3RJYA 3KWXA 4JCLA 2YA1A 1JDDA 1EXPA 4EKJA 3AIQA 4HZ7A 3WNOA 4CN4A 1B9ZA 1VAHA 3AIWA 3EDJA 2NW0A 3ARTA 3IAQA 1R87A 4CD7A 4PMQA 1J0HA 2OLHA 3LPPA 1W2VA 2GSJA 2QPSA 2XGBA 2X09A 2G3JA 3PZUA 1B30A 1AVAA 1IT0A 1NOWA 3KL0A 1JNEA 2XVLA 2CNCA 4BQ4A 5BRPA 4NF7A 4OUEA 4XV0A 3GXDA 2DSZA 1I1XA 2GK1B 3NSXA 1Q4NX 2VTFA 4D6DA 2WPGA 3L4TA 3VD7A 4HOXA 1WNOA 3ZO9A 2WCSA 1QHOA 1WDRA 1R7AA 4TUFA 8A3HA 3JUGA 4AZBA 4HZ6A 3PZVA 4HPHA 3ZSTA 4U3AA 3BAJA 4FLOA 2QF8A 3AHZA 3TTSA 3ARRA 2VJXA 1LG2A 2PF0A 3WSUA 1UR8A 4OJYA 1KBBA 3VPLA 1E43A 1UKOA 3L2LA 1QNQA 1W9XA 3KL3A 1W9VA 3UR7A 2E40A 2XM1A 1JZ4A 2F8QA 1WDPA 3D5HA 3TA9A 2BXZA 2V5DA 4AZ5A 4EE9A 3QGVA 2CHNA 4H8VA 1NQ6A 3NSMA 1F4AA 4FF5A 1DWIM 2A3EA 3CHDA 5FL0A 1EH9A 1SFSA 1BYBA 3CHFA 1E0VA 1B3ZA 2ZUUA 2BFGA 2WZEA 2VRQA 1KXTA 3ZT5A 1CNVA 3CUJA 4PTMA 3A6OA 1V3IA 1M04A 3WFLA 5CXPA 4HMEA 4OKDA 2VZSA 3WDHA 3NDZA 2VCAA 2WB5A 4W8AA 3ZJKA 3VD3A 1KWKA 1GCYA 3PZNA 3WQ8A 4GI8A 4DWSD 1BQCA 1C90A 4MJ4A 1HP5A 4DUVA 4D72A 2WZHA 4AIOA 2EQDA 4GXPA 2D3NA 4GZJA 3N15A 3QHOA 3CPUA 3S2CA 3WFZA 4PMRA 4MB4A 4C7DA 1VENA 2FH8A 4GO9A 1B3VA 2XTKA 3DHUA 1TMQA 4UFKA 1KGXA 1W9PA 3NCOA 1OBAA 5DT5A 4AISA 2J8GA 2VR4A 5A2AA 1E4MM 4H8UA 2XVNA 3KL5A 5I77A 4B9YA 2CKSA 2WANA 4UFMA 2XWDA 4GINA 2NT0A 4UFLA 4M8UA 1KXVA 2GK1A 4E2OA 2VL4A 3VGHA 1YQ2A 3WIJA 1W3KA 4CCEA 1HVQA 4LYPA 1H3GA 4UQAA 1H2JA 3GNOA 1MXGA 2BY3A 1CBGA 1NP2A 2CYGA 4KWUA 2AOSA 2YIHA 3SUUA 1Q6GA 5CPSA 3AROA 1LJYA 3RO8A 1WDSA 2W91A 4AZ6A 2YBTA 3VGEA 3CZEA 1QW8A 2XSBA 4AD4A 2BVTA 2CETA 7A3HA 3CZGA 2J8FA 3W28A 1TUXA 3WF2A 1ODZA 2YL5A 3BAWA 4BQ5A 1CTNA 5I0DA 4LYQA 3UG5A 5GQBA 2WVTA 4PSPA 4HZ8A 3UEQA 1V3KA 2VCBA 4RE3A 3RDKA 4UNIA 3B9AA 2W62A 3WDJA 1FOBA 5JBEA 2VX4A 4CCCA 2Y5EA 2YDSA 3AFBA 4FLSA 1B1YA 3AIBA 2G8ZA 1NWUA 3GXFA 3ARPA 4FLRA 4NI3A 3WD1A 4D6IA 1E40A 5HPOA 1QHPA 1B3YA 5F7UA 1G01A 3GM8A 4W87A 2CIPA 3WEZA 3EDFA 4K68A 4ATDA 4W86A 3T08A 2WCAA 3MMWA 3WDQA 2WLYA 4E8CA 3ARSA 1LF1A 4W5ZA 1CDGA 3AS3A 2WW5A 4QP0A 1V02A 1UD2A 4BCEA 3K8MA 3VINA 3U5UA 4CVUA 3AHTA 3ZSSA 1EO5A 1QI0A 7CGTA 3W24A 4D6FA 3FXYA 3VGDA 3VU2A 3WEMA 1XYZA 3ALGA 2D22A 1K9FA 1TA3B 2J7EA 3RCNA 3SUVA 1R85A 1HN1A 5CPQA 1GOMA 3EMCA 3LMYA 2G41A 1XSIA 1RP8A 3WF1A 1MXDA 3CZJA 4GPNA 3WBEA 3L4YA 4XZWA 2E4TA 3ARXA 5HDRA 1UHVA 4M80A 3VX1A 2XVGA 3I3EA 1GOKA 1PZ3A 3BXWA 1GOQA 3AMLA 2JFEX 4MPKA 1ZU8A 1W1TA 2ESCA 1TCMA 2J77A 3CGTA 4QDMA 1FFRA 3OLDA 1QOXA 4B9ZA 1VFMA 5FOOA 1MW0A 1J12A 4AEFA 4PMXA 3VDAA 5I79A 2ZUVA 3VIMA 1GHRA 2ZX9A 2X0HA 2CPUA 1W32A 2ZUSA 2EPOA 4MAVA 1V03A 1XV8A 1CECA 3AHVA 3IJ9A 5ABFA 3WH9A 3K4AA 3MUY1 2J7CA 4JKLA 3VMPA 1MQQA 1AQHA 1NOUA 2JIEA 3K46A 1NH6A 4S3KA 1WZAA 2PI6A 1GQJA 2IXUA 5I23A 3UCQA 4WSKA 1EOMA 1BFNA 2G3IA 1CXFA 4V28A 1V6WA 1EQCA 4W93A 1IV8A 1KBKA 2FHFA 4B16A 3U7BA 1OB0A 3VM5A 1V6UA 1G1YA 4M81A 1EOKA 1E71M 1WB0A 4PTXA 1X6NA 1E56A 4IUGA 4ATLA 4BA0A 1KXQA 5BCAA 5HBFA 1ZBVA 1KCLA 3KZSA 1GORA 2V38A 2VZUA 5DT7A 5CLWA 3CUHA 1HNYA 2JEQA 5JIPA 1NP0A 3PZTA 2BHZA 1BVZA 5CZKA 2VRJA 1LG1A 3T2QA 3SCRA 4DUXA 3FHQA 2PWDA 3SCPA 3MSDA 1UR1A 1UKQA 1CLXA 4ZE4A 4CCDA 3SCNA 1V08A 1GOIA 2O9OA 5A6LA 3BMVA 1CGUA 1C3FA 4ZEPA 2FGZA 4MDPA 3WH8A 3ZOAA 1CIUA 4M24A 3NSNA 2WSPA 3AJ7A 3WUBA 1VFOA 4H7VA 3W29A 3BCDA 4P8WA 5I5RA 1ZB5A 3VUPA 2OYKA 1JD9A 2WMHA 4JCMA 3GNPA 4UZUA 4HOZA 2EPLX 2ZICA 3GBEA 5A8PA 1FFQA 3TONA 2E0PA 2Z1KA 3HU7A 2VRKA 3WUGA 3WF0A 1EO7A 2WVVB 1GQLA 1AMYA 5M17A 3APGA 1JYNA 5GNYA 2VX5A 2WMIB 1M03A 2F61A 3SURA 4PBGA 3G6LA 4CD8A 4UOJA 3ARVA 4W8BA 2O9RA 3EMQA 2OWXA 5DMYA 5ABHA 3WD0A 3RM9A 1NWTA 5A95A 1GONA 2C0HA 1E6XM 3PBGA 4CN6A 2ZOXA 3WENA 1K9TA 3RM4A 1XHGA 1HKMA 4TTUA 4B3KA 2WVUA 4PCSA 3L4VA 1V3MA 3W37A 3VM7A 3CZKA 3W0KA 1CYGA 2CITA 4F9DA 1HX0A 2WK2A 2FHBA 5AYIA 1JGIA 4D6CA 2JIWA 1GJUA 4HTYA 3AOFA 3MS8A 3EMZA 1HP4A 3VVGA 1BGAA 5I78A 1OWQA 1CLVA 3L4XA 2OWCA 1BAGA 2GDUA 5D9PA 1GUVA 1UWSA 4A3HA 4AD5A 3GZAA 1UWIA 3NUKA 1XSJA 5FKYA 1DWHM 3BCFA 4PMYA 2ZUTA 3WH6A 3PZIA 5A8MA 1C7TA 2WBKA 2EPMX 4J3SA 1E70M 1SMAA 1KWGA 1E1EA 1BG9A 4HMCA 1BSIA 4LXFA 3OIHA 1BYDA 3GDBA 5HNNA 4ACZB 1PZ2A 2QV4A 4R27A 4H8HA 2CEQA 3CUIA 4JFVA 4PCTA 1V3HA 3T0BA 1DTUA 2D0GA 1PAMA 1UH2A 4X0VA 3M6DA 1VFUA 2VZOA 1US2A 1GZJA 2E3ZA 2G3MA 4U33A 4MJ2A 4V27A 3O9NA 3RIKA 1E1FA 4ZXLA 2JF7A 4P7NA 2OYLA 3VD4A 1UYQA 5I3DA 2XSAA 3M46A 4ZE5A 5IDIA 2YL8A 3UR8A 3VD5A 1TG7A 1JYWA 1ESWA 3WL1A 2HISA 1UZ4A 3U7VA 3LPOA 3WY1A 2ZUNA 1KQZA 4W85A 5A2CA 3GXMA 1NOFA 2J25A 4JIEA 4Z2LA 1JAKA 3BC9A 3VGBA 3UG3A 1C91A 2W4XA 2GJXA 3GH7A 1JZ2A 3FAXA 1J0YA 3WL0A 3IANA 5LA1A 5A8OA 4ATWA 3N1AA 1BGGA 2CXGA 1MWOA 3LPGA 3MUZ1 3ALFA 2GJPA 1JXJA 1MW2A 2BHUA 3CTTA 4PMVA 3CMGA 4U5IA 5HXMA 4AZ7A 1UWRA 2RGLA 1MW1A 3N11A 3AMCA 1KQYA 1D7FA 2WVSA 4JFSA 2WBGA 3M07A 3VOCA 4HP5A 2MANA 5C70A 1HJUA 1GHSA 3K1DA 5D8ZA 4DM1A 4U3CA 5M3WA 4UFHA 3WNPA 4UOQA 1FH9A 1OCQA 3VGGA 3PZQA 1B90A 1DWFM 3AMGA 3RM8A 1C8QA 3W38A 2J78A 2J47A 3M7SA 1R7OA 2XVKA 3AS0A 4PMZA 4BQ3A 3GXIA 3PHAA 2WC3A 2WSKA 2VCCA 4WLCA 4H2CA 1EIBA 3SEPA 3U57A 1E15A 2Q8XA 4NRSA 4AD2A 2W92A 5CG0A 3SUTA 1X6LA 4HMDA 3AIRA 3OGRA 2DSUA 2FGLA 5I2UA 3QOKA 2CBVA 1OM0A 2E8YA 3ZQ9A 1V0MA 2YL9A 5A69A 3IJ8A 3MV01 3RJXA 1E5NA 1NARA 4CVWA 1GNXA 2CBIA 3N12A 2ZXQA 2WKLA 3T09A 2DT3A 4L4PA 1PX4A 2OYMA 4Z2GA 4MB1A 1C8XA 3W4RA 1UR9A 1JXKA 5CGMA 3A4WA 3UETA 3WQVA 2XFYA 1J0KA 3D3AA 3W25A 2WYSA 1Z32X 1P6WA 1FHLA 1ITCA 3F4VA 3FNDA 1A47A 4JL1A 1U2YA 3MUIA 5CGTA 1M01A 2V3GA 3S6TA 1NM9A 5ECUA 1LL6A 1E9LA 1ZBWA 1OIFA 1EA9C 3W53A 2VUYA 1PX8A 1V02E 3CZ8A 4PTWA 1HIZA 3SCUA 6CGTA 3ARYA 2CESA 4N42A 3PTQA 1JAEA 5D4YA 1C7SA 1QI4A 9CGTA 4JZ5A 2BY2A 2J62A 1M53A 2VVNA 3A47A 1JFXA 4PEEA 4P8VA 1VEMA 4TOQA 4UQ9A 5A6KA 1OGGA 2BY1A 4AWEA 1VIWA 1CENA 3MANA 4W88A 2YA0A 3OGVA 2WMJA 2J79A 4NSBA 5D9OA 4PMDA 1XD1A 1VFFA 1JZ7A 1UD4A 4HPGA 1HKJA 4UFJA 2DT0A 2W63A 3B8SA 4W5UA 1HKIA 3IK2A 1ISVA 1EHAA 3WH5A 4AYSA 4W89A 1C92A 2XHYA 1UH4A 3AXHA 3EYPA 1LWHA 2DIEA 5BXSA 1HL8A 1UQZA 2Y4SA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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