3CHEA

Crystal structure of aspergillus fumigatus chitinase b1 in complex with tripeptide
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase
publication title Structure-based dissection of the natural product cyclopentapeptide chitinase inhibitor argifin.
pubmed doi rcsb
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 146
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3cheA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cheA01
1B31A 3KL5A 2E0PA 2VRKA 2CESA 1HKMA 3W25A 3VGBA 7TAAA 1D7FA 4JFTA 3DYOA 3OLEA 4CN6A 2JIEA 4ZENA 1QHZA 5A2CA 5IFPA 4PMNA 3I3DA 4PMUA 5CPQA 3A4AA 1AQHA 3WDHA 2C8NA 3HN3A 4MB3A 1E55A 1J0ZA 3U57A 2W67A 5BWFA 2VX6A 4HU8A 3U7BA 3F5KA 2D0HA 3VPLA 1CENA 3AIWA 3L4TA 1AVAA 1OIFA 1HJWA 3VGFA 4AXNA 1BG9A 3IJ9A 1UZ4A 2YLLA 1DWJM 2DSUA 2J7FA 4GZJA 3DHPA 4GKLA 1EHNA 2BY3A 1EDGA 5M5DA 1EGZA 3AS0A 1W3JA 5I77A 2ZXAA 2JE8A 1GPFA 1C7TA 4WK9A 4B3KA 1NWSA 1H49A 2YLAA 3O6AA 2WM0A 1E56A 1MWOA 2X0HA 4OBSA 4QAWA 1W1YA 1WZKA 5CQ1A 2FHFA 4W7WA 2OLHA 4UFJA 3F5LA 2J7BA 4BZYA 1LL7A 3GNPA 4CN4A 2WBKA 2WB5A 1KBBA 4AMCA 4AZBA 2VO5A 2BXYA 2YDSA 1CGTA 5EB8A 1OBAA 4UCFA 4L4PA 1A47A 2VRQA 1V0MA 4DUVA 3IJ8A 4MADA 1ZL1A 3GYCA 2Z1SA 1KFWA 1UWRA 4MTVA 1J01A 3CZLA 3WIJA 3BMVA 4UFIA 4GZIA 1V0NA 2EPNA 4DM1A 1JFXA 1HP5A 2CKRA 1F4HA 1VEPA 3ARTA 2O92A 2VCCA 4J28A 4ACYA 1UH4A 4AD5A 2PI6A 4ZE5A 4KH2A 1K9EA 5BXRA 1UD8A 1FHDA 5HBFA 2VMFA 3M07A 3RCNA 4Y7EA 3L4UA 2JF7A 4PMQA 1JGIA 4HPGA 1I1WA 4JL1A 1LQ0A 1JYVA 3VD5A 1GVIA 2XYLA 4AZIA 1JZ7A 1B2YA 2X8RA 1NOFA 3AHVA 3NDZA 1JDCA 5BXSA 2WVVA 4JFVA 4ATWA 4GO8A 3SEPA 5LA0A 5HPOA 1PEZA 1IV8A 1PX3A 1UKQA 1XD1A 3N04A 3MMWA 1UWIA 3CUFA 4XB3A 3BGAA 4UQ9A 2WMIB 5DT7A 1DTUA 4AD4A 3W4RA 3VILA 4HU0A 3T0DA 2E3ZA 2GSJA 1CECA 1DHKA 2VCBA 3VNZA 1JI2A 2WZHA 4H8UA 3EMCA 3B8SA 3FW6A 3WH6A 1ZBWA 5EMYA 1EQPA 2CYGA 2QPUA 3WNPA 3PZVA 6CGTA 5M17A 3OB8A 3VIJA 5A6MA 1JYXA 3OLDA 1TUXA 2VT0A 4W93A 1HKJA 3LPFA 2V5DA 3PZUA 4X0VA 3ZO9A 2YDQA 4BCEA 1NOUA 4FLQA 3VX1A 1UWSA 3CHCA 1OGGA 3CUHA 2DIEA 2QLYA 2ZIDA 2WHJA 3S2CA 3OGVA 2DSZA 1BGGA 5IHSA 4W7UA 1X6LA 3WL1A 2V5CA 3TA9A 4IISA 1W9BM 3GXMA 4YHGA 1ZBVA 4EANA 1DWIM 4HOXA 3B9DA 2O9RA 1W3KA 3BAWA 4FLRA 3GH7A 3WH7A 3FHQA 1J10A 2QHAA 5C71A 3RILA 5FL1A 3CZJA 1UR0A 4P7RA 4W5UA 1MW3A 2HISA 1NP2A 1HNYA 5D4YA 2WC3A 1H5VA 3W82A 5I3DA 1VFUA 1GOQA 2DDXA 2HVMA 3NSMA 1V3MA 3GZAA 3VM7A 2DSVA 1ECEA 2ZWZA 1OT2A 1FA2A 2XFYA 5EBAA 1QBAA 2VX4A 5HOSA 1W1VA 5GQBA 3WMSA 4LXFA 3W28A 4OIFA 1TVPA 3AIBA 3EDDA 4PMXA 2YL8A 4KGLA 2GDVA 3JUGA 3UR8A 3W53A 4D71A 2CHOA 4TTGA 4BQ3A 4S3KA 1W3HA 2EPLX 2VVNA 1E0WA 4W86A 3WN6A 2G3MA 2FHBA 3WDPP 3W6LA 3CHFA 1B1YA 1ODZA 2J77A 3CHEA 3WF4A 4PMOA 5EFFA 4UQEA 4P8XA 2W91A 4D6IA 1NM9A 9CGTA 4LYRA 3ECQA 3FAXA 3QHMA 1Q6EA 3DYPA 4LX4A 1HF6A 1KR1A 1BVNP 5I0DA 1JDDA 2V3EA 3ARXA 1E6QM 2OYLA 1QBBA 4WF7A 2AMGA 5D9OA 1OD0A 2E9BA 4XUYA 2NT0A 1C92A 4HPHA 1V6YA 2E8YA 2YOCA 1ISVA 1JZ6A 4PN2A 2CITA 1VAHA 2JEPA 1HXJA 4KWUA 2EO7A 3WBAA 2FDMA 4TTUA 2YL5A 1J11A 3TP4A 1NQ6A 1BHGA 3RM8A 4PMDA 4D6CA 2YA0A 1UR2A 3OGRA 3AXIA 3K8MA 4F9DA 4CN1A 4V28A 4ZXOA 3D3AA 5DF0A 1KXVA 4H7VA 1M01A 2PWGA 4JHZA 5ABFB 3RM4A 2DT0A 3VX0A 3ARPA 1WDRA 4JFWA 1B90A 5A6SA 1DWGM 1LG2A 4AZCB 3MUIA 1V02E 4NRSA 1W9DM 2WHMA 5A2AA 1UD6A 1UKSA 2JIWA 3ZT6A 1V3IA 3UESA 2CETA 2VVSA 3OGSA 5AYBA 2YDRA 4XZBA 1P6WA 3RPMA 4H8VA 5A8QA 4HP5A 1UQYA 4U3CA 2A3BA 3N1AA 2EPMX 2QMKA 4UQAA 4JKKA 3E1F1 4D6GA 3ARVA 3CGTA 3WNOA 1PZ3A 1MXDA 1CXIA 1GQLA 4PTVA 3THDA 4R5EA 4JKLA 5A8NA 3RO8A 3BAKA 3SCWA 4QDMA 3ZJ6A 3BSHA 4AWEA 1YQ2A 3VGHA 3PBGA 4JFSA 4QFUA 3SUTA 4WLCA 4DWSD 1NWUA 3IANA 3ZIZA 4ZE4A 3AYRA 4PCSA 1GW1A 2GJRA 4RL3A 3RJXA 3FHAA 3CZ8A 1AQMA 1LF1A 1SR0A 2EBNA 1SMAA 2JEQA 1NWTA 4W8AA 1CGVA 3UEQA 5JH8A 1PX8A 2BV9A 1J0HA 4M24A 1PIFA 4MB5A 4UNIA 3AQUA 3AFBA 1JXJA 2CERA 2WNWA 5CSUA 2WMHA 5A6BD 3WNNA 1QOXA 1UWTA 1TA3B 3AI0A 4S3JA 4P7LA 2O9PA 2XUCA 2Y8VA 1CGUA 3CUJA 2X1IA 2BXZA 3W26A 1E73M 1WNOA 1MQPA 3WD1A 1QI0A 3HMCA 5D8ZA 2E4TA 3WQWA 3VD3A 3BSGA 7A3HA 2W5FA 4MB1A 3VD7A 1EO7A 1IT0A 3PZNA 3VDBA 4W7VA 1XSJA 3SUSA 1GOOA 2G3JA 4K68A 4E8DA 2J8FA 2EPKX 3WNMA 3CPUA 2D1ZA 3UR7A 4IPLA 4TUFA 5JBFA 3K1DA 4AZGA 1FP8A 2WC4A 3W81A 3FNDA 4CU6A 1EIBA 1TZ7A 3SCPA 3L4WA 1ZJBA 1E1FA 2V3FA 4QP0A 2NT1A 1UKTA 4HZ8A 1DWHM 4HMDA 1WZAA 3WUBA 5A6JA 1QI2A 4M29A 5E0CA 4EAMA 2UY5A 1E4LA 4BA0A 3APGA 3GXIA 2PWDA 3WENA 3GNOA 5GPRA 2PWEA 4PSPA 3VD9A 1E6XM 3ZQ9A 2VZTA 4ACZA 3WD4A 1QNSA 1VFFA 2A3HA 4X9YA 5CPTA 5DEZA 2VJXA 4M1RA 1CXHA 1PX4A 3B9EA 4P8WA 3KWXA 1VBRA 5A69A 3GH5A 1UA3A 3F5JA 1BYAA 1G94A 3WFLA 1S46A 2XVLA 1C91A 1KXQA 4AD3A 2A3EA 2J78A 4PUEA 1QW9A 4TOQA 4P7OA 1VRXA 1GUVA 1US3A 1BYCA 4Z2HA 4AZ7A 3KE0A 1C8QA 4HTYA 4XZWA 1W1TA 2WVTA 3UG3A 1KXTA 3I3BA 2GK1B 1HKKA 3RM9A 1LL4A 4WJXA 1E72M 1CXKA 3WELA 1XH2A 1XSKA 1UH2A 1GHRA 2ZUTA 4PSRA 1O7AA 3ARYA 1EA9C 4OOZA 2F2HA 3EYPA 4LYPA 3EDEA 4OBRA 4F8XA 3SCTA 3VINA 1XHGA 3OZPA 1RH9A 4J3VA 3EDKA 2XTKA 3CHDA 2CBJA 2ZX5A 5ABEA 2YL9A 3VTRA 1QHOA 4GQRA 1K6AA 3BCDA 2EPOA 1PAMA 1UQZA 4NRRA 4HOWA 2WXDM 2TAAA 1H4PA 4AZHA 2O9TA 2VOTA 2XGBA 1B3ZA 1E3XA 4LYQA 3BXWA 4H04A 2WVSA 4ML4A 4AISA 2BHUA 4B9ZA 2WHKA 3EMZA 4D6DA 2DIJA 3MU7A 1E4IA 2RGMA 2Y8KA 3AIQA 3MUAA 1XH1A 1UR1A 1BSIA 5BROA 4CD7A 2C0HA 5CZKA 1EOKA 2YBUA 3MO4A 3OLGA 3SUUA 4BF7A 1JG9A 3WMCA 3ARSA 1V3LA 4U31A 3QHOA 4Z2GA 4FK9A 1WDPA 4EE9A 4TVDA 1HVQA 4UFHA 4YHEA 1WO2A 2DH3A 1OD8A 4URIA 3PZMA 1QNOA 3DYMA 1E6PA 2G41A 2WMJA 1KGWA 3QOKA 1K9TA 4PTWA 4UQCA 2VR5A 3ALGA 2A3CA 1VEOA 1M7XA 4C7GA 4FF5A 2CBVA 1PJ9A 1WKYA 4W5ZA 4LQ1A 4V27A 3HU7A 3VMNA 1JZ8A 3FAWA 5CLWA 1A3HA 2FH6A 2V3GA 5C8BB 4BS0A 4U5IA 3L2MA 5BXTA 1QI3A 4KRUA 1UWUA 2G3NA 4GQQA 4B15A 2VZUA 3AZRA 4JCLA 1HJSA 3N18A 2WWDA 3W29A 2BY0A 3QOMA 2WCSA 4ATDA 3L4XA 3ARUA 4W8BA 8A3HA 1ISZA 4W84A 3PZIA 1BYBA 1SMDA 4CD4A 3ARRA 2D3NA 2O9OA 4U2YA 4DM2A 1UA7A 1G5AA 4PMZA 3SCRA 2BS9A 4LPCA 4YPJA 2VQTA 2XVKA 3VDAA 2GJXB 3LMYA 3AOFA 4J3TA 3WQ5A 3WF1A 5C70A 2QV4A 3WD3A 1MQRA 2XVPA 4U5KA 3TTYA 3W38A 3VDHA 1FP9A 4PRWA 2XHYA 3IJ7A 1FFQA 2GFTA 2WC7A 1V0LA 1US2A 3VOCA 1HT6A 4W87A 1W2PA 3RJYA 5E9AA 2D22A 1F4AA 1UR9A 5TD4A 1WDSA 3SCUA 4C7FA 4B3LA 3PZGA 3GBEA 3AMCA 4NZCA 2VI0A 5CGMA 2W66A 5IFTA 1GOKA 3ALFA 1MVYA 1V0KA 1H3GA 5A8PA 1V3HA 1CEOA 1JZ5A 1Z32X 2NW0A 1WE5A 1RD6A 3MMUA 1DP0A 2PB1A 2WBGA 3WFZA 4Q22A 3NJ3A 5CSYA 1QNRA 5IDIA 5CXPA 4CD8A 2J79A 2RGLA 5A3HA 1CBGA 2D23A 1FFRA 2DSKA 5I5RA 1QPKA 1E6SM 2E8ZA 4NSBA 4RE4A 3W24A 5HXMA 4UQBA 1CIUA 2W4XA 4NF7A 3PHAA 3PTMA 2YBTA 1GORA 4H2CA 4OJYA 3ZR5A 2WHLA 6TAAA 2X0YA 2OSWA 2W63A 4CD5A 3A3HA 5DMYA 3RIKA 1E0VA 3WNLA 1JZ4A 3QGVA 1JD7A 3IAQA 2WK2A 2VQUA 4E8CA 2VL4A 3WY1A 5LA2A 1UHVA 3DHUA 1IZJA 2WCGA 3WQ4A 1QNQA 3ARQA 4H41A 2DT3A 3VD4A 4OOUA 3PN8A 1R85A 2VRJA 1JYNA 3AICA 4MAVA 5JIPA 3N9KA 5A6AA 1W9XA 2OWXA 1DWAM 3OG2A 3VIOA 2OWWA 3KEHA 5CJ5A 3T0BA 3ZJ7A 1H11A 1BFNA 3WEZA 3AIRA 5FKYA 2AAAA 3WUFA 1KCKA 1Q4NX 3O9NA 4KGJA 2DT1A 1E4NA 4P7QA 4B16A 1GHSA 5D9PA 4J27A 2VZSA 3W0KA 3PZTA 4N42A 4D6EA 3AS2A 2Y5EA 5I23A 4D72A 3BLPX 5A2BA 1Q6DA 5ABHA 2BVYA 2PWHA 2X05A 5GNZA 3G6LA 3ZT7A 1XH0A 4TVUA 3W37A 2WAGA 1KWGA 1C3FA 1C7SA 5DT5A 3A47A 3VIPA 4GI8A 2E9LA 1UYQA 3VIHA 3SUVA 3WF2A 2XVGA 5JBEA 5ABGA 2CNCA 4AEEA 1AQ0A 2OWCA 3T09A 1LL6A 3UETA 2WVVB 2GUYA 1FHLA 1UWQA 2UY3A 5DFAA 4ZXLA 3FY1A 1JZ3A 3VIIA 4DUXA 3WDRA 3U5YA 2ZICA 1XC6A 1VIWA 4D1IA 3PZ9A 1ZS2A 4BQ2A 2J7EA 1W1PA 1B0IA 4AZ5A 2DSWA 1M03A 3J7HA 1GCYA 3AHXA 1KBKA 1CNVA 4MNLA 4L4OA 5D9NA 1MYRA 2CEQA 3VIMA 1HKIA 1UUQA 3WMBA 1BLIA 1D3CA 2ZWYA 3T2QA 3SURA 4QLKA 2XJ7A 1VENA 3QR3A 1E71M 1GONA 3CUIA 1V02A 2CKSA 3TONA 3WL0A 1BQCA 4GI6A 1PPIA 1NP0A 3AMGA 4W85A 5I6SA 2CXGA 1E15A 1B30A 3N15A 3U7VA 5FD0A 1QI4A 1UD3A 1FH8A 1CLVA 2D24A 2VURA 3PTQA 3N12A 1V3KA 3FN9A 3L2LA 1SYTA 3DECA 3B9AA 2EXOA 3VKKA 4ZEPA 2W62A 2CIPA 1B3WA 1LJYA 3S6TA 1JXKA 4AEFA 3VGGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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