3FXYA

Acidic mammalian chinase, catalytic domain
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
YQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNVKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAPAQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Triad of polar residues implicated in pH specificity of acidic mammalian chitinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Acidic mammalian chitinase
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 132
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3fxyA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3fxyA01
5A6AA 1V0LA 2ZUNA 4U5KA 8CGTA 4JKKA 4TX6A 1QVBA 1GPFA 2X8RA 1CGYA 3OZPA 3LPFA 3GNRA 3AMLA 1LWJA 1NP2A 5CG0A 1DWHM 2ZICA 1W1PA 4F79A 1CXHA 4TTGA 4Y7EA 5KEZA 2ZWZA 3QOMA 4V2XA 4AIEA 3MUIA 4V28A 5I79A 4UTFA 3SURA 4JL2A 5D4YA 3ARTA 2GVYA 5DMYA 2CEQA 2CXGA 4R5EA 1EO5A 4TUFA 5I0DA 1MYRA 4PCTA 3UESA 2A3EA 4UQBA 5CLTA 4WKFA 5HOSA 1SMAA 3B8SA 4F66A 1E71M 1CBGA 3BLPX 3WNMA 3AS3A 5JBEA 1J11A 5DT5A 3OG2A 2J7CA 5HNNA 4D6DA 3LPGA 3OGSA 4KRTA 3WDIA 4AMCA 4U5IA 5KZ6A 1ZJAA 1FH7A 3VDBA 4RE4A 2CBVA 1LJYA 2NT0A 4HU0A 3WDJA 5C70A 2VUYA 3KL3A 1E5NA 3BMVA 1W32A 5AYIA 1VJZA 1B0IA 1OD8A 2YOCA 4MJ2A 2O9RA 2FGLA 1C8YA 3ZJ7A 2WVTA 1ZBVA 3CLWA 5D9OA 1H1NA 1V02A 4UNIA 3VMOA 3OIHA 3W27A 1R85A 4UQDA 1JF6A 2AOSA 1XD0A 2PWDA 4BQ4A 5CLWA 4UFMA 3VIKA 1BF2A 1JI1A 4JFTA 3WF1A 4W8AA 2VZTA 4M29A 4PMUA 4MB4A 2GK1B 2YBUA 3UG3A 2ZX8A 1KXHA 4MDOA 3AIQA 4MAZA 4QFUA 5LA2A 3JUGA 2DSUA 1UOKA 3WL0A 4UQ9A 5BXRA 3VTRA 3QHOA 1NARA 2ZX5A 4AZHA 1E1FA 1XRVA 2X09A 4XZWA 3QR3A 1PJ9A 4LYRA 2OYMA 2AAAA 2ZUMA 4QLJA 4MNJA 3MO4A 3OA5A 3SUSA 1GOQA 3SCVA 1JI2A 4AZBA 4AZ6A 4AZIA 1UR1A 5EMYA 1J12A 4BA0A 4ZXOA 4NRSA 3VD9A 2WWDA 1WZMA 2WXDM 4M82A 3GH4A 4LYQA 4CD8A 1BG9A 1J0KA 1VFFA 4PMOA 1UKQA 5JBFA 3W82A 4AZCB 1CXIA 4ZFMA 5BWFA 3TA9A 5FOOA 1EOMA 2DSZA 3GZAA 4MNMA 1LWHA 3PHAA 1MXDA 3CHDA 4UQEA 2D22A 1CIUA 1UKOA 3GXMA 3GTNA 5HPCA 4PMNA 1W9PA 1VRXA 1J10A 1E5JA 4AXNA 1BYAA 4H8UA 4XUYA 2YKKA 1CXLA 1JZ3A 4RE2A 4N0RA 1VFUA 1FH9A 2C8NA 2Q8XA 3QGVA 2D0HA 5CXPA 3FAXA 4TTUA 1E4LA 5I24A 1EDGA 3L2LA 3VIJA 3POHA 2CESA 2YDRA 1DWIM 5CJ5A 1XSIA 1HP5A 5ECUA 1FP9A 2WZIA 3CZEA 2E9BA 5BRPA 2BHYA 2W63A 3UETA 2VMFA 5BRQA 2G8ZA 2VCAA 2WMHA 4AIOA 3WFLA 1BGAA 2XSBA 4GZJA 2BY0A 1VEOA 4DM2A 1KWGA 3RCNA 2VZSA 3TTSA 3VIOA 1KGXA 3D5HA 4D72A 3VDAA 1WNOA 3VD4A 1H3GA 3TTOA 1PX3A 1IT0A 4D6JA 5IDIA 3BCFA 4JCLA 1JD9A 3PTQA 4MADA 4N42A 3WMSA 1ZS2A 3AJ7A 2GUYA 4CD7A 4AD5A 3FXYA 4KH2A 2FHCA 4NI3A 4L4OA 5BXTA 5GNYA 2PWGA 4LX4A 1GVIA 5JBDA 1M03A 2UY3A 5FIPA 1UWIA 1LL4A 5D9MA 3T0AA 5GNZA 3CH9A 3RPMA 2J7HA 2Y24A 5CGMA 1MQPA 2WVVB 3AS0A 1U2YA 3DHUA 3AQUA 1WDPA 3FHAA 3N9KA 6A3HA 3ZSSA 4DM1A 4QLKA 4D6FA 3PZIA 4URIA 4OJYA 2ZX6A 1DEDA 4WKHA 1UD6A 4NSBA 1C93A 1EH9A 4UFHA 1PZ2A 1ZJBA 1E15A 3K8LA 1G0CA 3WQWA 2WMIA 1LL7A 1W3HA 4WLCA 2JF7A 3A4WA 3KL5A 4HMCA 2DEPA 3ZR5A 2WLZA 3MV01 2VX6A 1UR2A 5HDRA 1EQPA 5IHRA 1QI4A 5A6KA 2DPEA 1EQCA 3GBDA 1LQ0A 1AQ0A 2OWWA 5AY7A 4P7LA 4GINA 2Y8KA 5BROA 2FHFA 4GO8A 3T2PA 5HBFA 4OKDA 3BLKA 2GJXA 3ZM8A 2OSXA 2BVYA 2YL5A 1JZ5A 3AROA 3AMKA 3PBGA 1KFWA 2QLYA 5LA0A 4YPJA 4L4PA 1R7OA 3T2QA 4EK7A 4LQ1A 4H8HA 2IXUA 3TTQA 1RP8A 1B30A 4U33A 1WZAA 5M17A 4C7DA 1EDTA 3W4RA 3CZJA 4AWEA 2FGZA 1MW0A 4X9YA 5JIWA 2OWXA 4WIWA 3ARSA 1E6PA 1EDQA 1E55A 1ISVA 1PX4A 2E9LA 5IHSA 4B9YA 4DUXA 1K6AA 1KGUA 3CUIA 2BY1A 1KXTA 3CZKA 2JEQA 4QCEA 3HMCA 4CCEA 1QHPA 3WQ6A 3WBAA 1DP0A 3AXIA 4W87A 1B90A 1BLIA 1B3WA 4W7UA 3ZIZA 1JNDA 3N18A 1U30A 2ZOXA 3VO0A 2CKRA 4UQAA 1ITCA 2JIWA 7A3HA 2WMKA 3W81A 1CZ1A 2XFYA 2CETA 4H2CA 2B31A 5E9AA 1CXFA 4ML4A 4D1JA 1XYZA 4P7NA 2YLLA 1WAWA 2WHKA 3W28A 1JDAA 4UQCA 1G1YA 2ZUTA 6TAAA 2E40A 1H2JA 4AZGA 5ABHA 1CPUA 4AD2A 2OSYA 1JFHA 2CCRA 2YLAA 2W5FA 3WQ8A 3THDA 1GOWA 2Z1SA 1KR0A 3SEPA 2XUCA 1TVPA 6CGTA 1JZ2A 2JIEA 1QPKA 3CTTA 1GZJA 5I78A 3WNNA 1FHLA 3SUTA 5EFDA 2JALA 3ARZA 1UH2A 2XWEA 4W8BA 5CSYA 4AZ7A 1KWKA 3POCA 3IJ8A 1G9HA 3OB8A 3VINA 4LXFA 1WDRA 4TVCA 1PAMA 5LYRA 1W3KA 1KQYA 1C3FA 1QBAA 1E72M 4FF5A 3BCDA 1I1XA 3BSGA 3W37A 1JZ7A 4BF7A 1BPLB 1I75A 1WKYA 4JKMA 3CUFA 3FHQA 1HN1A 2WHJA 4KGLA 4KMQA 2ZX7A 2EPOA 3GYCA 4J3SA 4M80A 4GI8A 3T09A 3AICA 1US2A 1ISXA 1SFSA 3ZO9A 2X0HA 3K4DA 3ZT6A 3M07A 4BQ3A 3ZMRA 1CLVA 4GQQA 1VENA 4BQ2A 2WNWA 1Q6GA 2WPGA 2YBTA 4P8UA 1UQZA 1CECA 2TAAA 1XV8A 4UFKA 2QMKA 1V3IA 3UCQA 1HJXA 3A6OA 4WSJA 4JCMA 3BXWA 3LPPA 4X0NA 2NSXA 1QHOA 5HPOA 3L4YA 1W9XA 1CGWA 3WEZA 1Q4NX 1LLOA 1E3XA 2WW5A 1UD4A 1V0MA 5E0CA 1E0VA 3GNPA 1XHGA 1JFXA 3CZGA 1J0JA 4Z2KA 3WL1A 1VFOA 3BH4A 4M56A 3GNOA 1V6WA 4AISA 4CKQA 2EPKX 3VX1A 1HL8A 1TMQA 4MB5A 3AIVA 4JHOA 4M24A 4GI6A 3PZNA 4KRUA 1E6XM 1NH6A 4B3LA 2BY3A 2E9MA 4D6HA 2YL6A 4PRWA 2C0HA 3EBVA 3CBWA 1UR9A 3CUGA 2PWEA 1CDGA 3FNDA 2OSWA 1XH2A 2WC3A 9CGTA 3IAQA 2EJ1A 2CBUA 1OGSA 3WD0A 3S6TA 1TR1A 1MXGA 3VOCA 2WBGA 1HJSA 3MANA 3AISA 1EOKA 4PYSA 1C91A 5IFPA 2J7DA 4TOQA 4PUDA 1W9VA 1FH8A 3ARQA 1B2YA 1Q6DA 1TZ7A 3L2MA 4Z2HA 2NT1A 3VD5A 4P8VA 1QOXA 1C92A 1JYWA 3ZQ9A 2V38A 3BGAA 3WD4A 2CBJA 3MMUA 4LYPA 2UY2A 3I3EA 3OZOA 4OUEA 3RM9A 5CQ1A 5FL0A 1XCXA 5GNXA 5BXSA 3F5JA 1JAEA 4FLQA 1A47A 1BVZA 4AD1A 4JZ5A 3EYPA 2PI6A 2XPKA 3EDKA 4W93A 1L0PA 4OOZA 4DUVA 2D1ZA 1JYVA 2VR5A 1RD6A 5JIPA 3PZQA 3K1DA 1C8QA 2D0FA 2GJPA 2YA2A 2WHMA 2G4FA 1EO7A 1DWJM 4HOXA 3OGRA 4OZOA 1XSKA 1JZ6A 5BXPA 5AC4A 1UQYA 3CHCA 3ZR6A 3AIEA 1C8XA 3SCQA 4J27A 3WNOA 1FOBA 3HU7A 1K9EA 3AMCA 3N1AA 4Z2LA 1KBBA 2D3NA 4W8LA 3GBEA 1JDCA 1TUXA 5I5RA 2GK1A 3W53A 3WH5A 2EPMX 4HZ8A 3DYMA 4AD0A 2Y5EA 3AIBA 3PN8A 4WJXA 2D2OA 4CU8A 1R86A 1ZBWA 1L8NA 3L4WA 4MNKA 3VNZA 1XH1A 1QI2A 2VZUA 1C90A 4M81A 4A4AA 4GXPA 1BYCA 1V3JA 3ALFA 3VPLA 3AOFA 4HPGA 2J7FA 4PCSA 1B9ZA 1BQCA 3ZJKA 2WLYA 1H11A 4HMDA 5M03A 2VX7A 2WM0A 1GOOA 4MB3A 2GDUA 5C8BB 3VD7A 4CN4A 1BGGA 2YA0A 2YL9A 4AZCA 4GO9A 4J3VA 2V3DA 4QP0A 4MJ4A 4ZE4A 2WCSA 3VU2A 3VIIA 4ATDA 4MDPA 1H0IA 1E43A 1J0YA 2ZUSA 3M6DA 3SCPA 1YHTA 3AIRA 2J47A 1ZL1A 4Q22A 2DT3A 1FHDA 1V3LA 3WUBA 3ZJ8A 1J0HA 1HKIA 3CZ8A 3WF3A 1D3CA 1J9YA 1VFMA 1XC6A 3BAXA 4CCCA 2ZX9A 1HP4A 5I3DA 1OT2A 3KL0A 3UG5A 3G6LA 2VCCA 2BVTA 1E4NA 4PTWA 1U33A 5ABEA 3MS8A 1BHGA 4E4PA 1GHSA 1UH3A 1VEPA 3CHFA 1M01A 2WC4A 4MTVA 1GOIA 2WHLA 1E6RA 1X1NA 4HA3A 2J4GA 4HZ7A 2E8YA 3ZT5A 1ODZA 1E9LA 1EA9C 1V6VA 1JXKA 1W91A 3OLIA 4PMDA 5A3HA 1UKTA 2XTKA 2EQDA 3D3AA 2ZXAA 5FD0A 3A4AA 3VMNA 4AEEA 1B1YA 1PX8A 1HXJA 1QNPA 2DSWA 3IJ7A 3ZOAA 2V3GA 4HP5A 4AZ5A 1BFNA 4JFVA 1EXPA 3F5LA 4D71A 3DYPA 2WMJA 3U57A 4JKLA 4EAMA 3SUVA 1TG7A 3SCRA 2WVVA 3O9NA 1WDQA 2BXYA 4CVWA 4CUCA 3BAWA 1IV8A 5HXMA 2D3LA 5BCAA 2J8FA 3VGBA 4MNLA 1GQJA 1H09A 2RGLA 4JFSA 1EIBA 4ZXLA 1OB0A 4OOUA 1JD7A 4PMQA 2EXOA 3PTKA 1F4AA 4PUEA 3AYSA 1RH9A 1JF5A 1GJWA 1CGTA 1K9DA 1SR0A 1E6SM 1PZ3A 1XD1A 4WF7A 4IPLA 3VUPA 2AMGA 5FCZA 3WEOA 3WF0A 5GQBA 5E6ZA 3ZJ6A 4P7RA 3NYDA 1E0XA 3NJ3A 2X2YA 3ARRA 2WZEA 3II1A 4PMXA 5C71A 5DFAA 3CHEA 3RILA 3MUZ1 2DGAA 1NWRA 3WN6A 2A3CA 1JL8A 3WDHA 1CNVA 1BSIA 2MANA 3VDCA 4UR9A 5GPRA 1KBKA 2WVUA 2Y4SA 1CYGA 3WDRA 3AZTA 4PBGA 3ARUA 1F4HA 4AC1X 1PPIA 1B3YA 5CPSA 3L4XA 1O6IA 5A8NA 3ECQA 3KE0A 2BFGA 3WUFA 1A3HA 7TAAA 4TX8A 3SCNA 3AIUA 3W25A 3G6MA 1W1VA 2VVNA 3AHVA 4Z2JA 3BAYA 5JH8A 3W38A 1ISWA 1ECEA 2A3BA 4PMVA 1OM0A 3WD2A 1GQLA 4JIEA 4HZ6A 5EBAA 2GJRA 3F4VA 5IFTA 1J0IA 1E1EA 3T0BA 1HVXA 1JNEA 2O92A 4XB3A 2BHZA 1SMDA 2CITA 3N12A 1VJSA 5DT7A 3MSDA 3W0KA 4P7QA 1BTCA 1DWFM 3E1F1 3WD1A 4ACZB 2CPUA 4R27A 2F61A 2Z1KA 3VIMA 3W6LA 2ZUUA 4U3CA 3WNPA 4AEFA 4J7RA 1XYFA 1M04A 4DUWA 1W2PA 2F2HA 3NSMA 3LPOA 4M8UA 1B31A 5TD4A 2VQUA 1C7SA 3WY1A 4DWSC 4W88A 1NOUA 3EDDA 4HOWA 4RE3A 4W89A 1WDSA 2XIIA 3WDPP 1CGXA 2DH2A 2HISA 1UWQA 1JIBA 3A3HA 3AHYA 1I1WA 3VNYA 3F5KA 4UOJA 2WC7A 2EPLX 3K8MA 4JFUA 1TVNA 3N04A 3VGDA 1J0ZA 2OYKA 4EKJA 4HTYA 5ABFB 2NW0A 3PTMA 4KGJA 4QAWA 3ARXA 3TP4A 4HPHA 1MWOA 4S3KA 1JXJA 1TFVA 4H8VA 1XCWA 2W4XA 3N15A 5DEZA 3QOKA 4D6IA 1E4IA 1PIFA 1B3VA 1V6XA 3AS1A 4CU7A 2BXZA 8A3HA 4B3KA 3VIHA 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 2DSV A;  3M7S A;  2XVG A;  1E0W A;  4GIA A;  1GHR A;  2Y8V A;  5FKY A;  2VRQ A;  3NCO A;  2DIE A;  4AYS A;  2VTF A;  1WPC A;  1E6Z A;  3BSH A;  4Q7N A;  1UYQ A;  2VRJ A;  4DWS A;  1MW3 A;  3WMC A;  1NM9 A;  4B16 A;  1RP9 A;  4UZS A;  5AC5 A;  1UR0 A;  1BVN P;  5D9P A;  5LA1 A;  1MFU A;  2PB1 A;  1GCY A;  1G01 A;  4CD4 A;  1LF1 A;  3GM8 A;  5A8Q A;  1J18 A;  2D20 A;  1TA3 A;  5ABG A;  5CSU A;  5BYW A;  3RJY A;  3DEC A;  1NOW A;  4XX6 A;  4DWS B;  3EMC A;  3B9D A;  1GJU A;  2D23 A;  1JYN A;  4A3H A;  4V27 A;  5CZK A;  4H7V A;  1ISZ A;  4ZEN A;  1GON A;  1Q6C A;  2VOT A;  5EFF A;  4WSK A;  1ESW A;  2GSJ A;  2F8Q A;  2J25 A;  1HT6 A;  1JG9 A;  1D7F A;  1GVY A;  1AQH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1V0L A;  3DI0 A;  4U5K A;  4LAU A;  1GVF A;  4JKK A;  3A3W A;  1S3T C;  5CC5 A;  1NP2 A;  1P5B A;  1DWH M;  2I16 A;  3QLD A;  3UZJ A;  4S1F A;  4IIB A;  3ID7 A;  3CPG A;  5J5R A;  1ITQ A;  1VH7 A;  3PTD A;  1QPN A;  3LRK A;  1OY0 A;  3NPU A;  2ADA A;  4V28 A;  1EJT C;  5I79 A;  3ART A;  8XIA A;  1JNS A;  5I0D A;  1MYR A;  2A3E A;  2ZRV A;  4WKF A;  1B4E A;  3BLP X;  3A5F A;  4DX3 A;  1EBG A;  3NL3 A;  3G24 A;  1OAB A;  5HMD A;  1XQK A;  1H7N A;  2I9U A;  3LPG A;  3OGS A;  5U4N A;  1H61 A;  5AB3 A;  5KZ6 A;  4XSL A;  1ZRQ A;  4PUN A;  4BF5 A;  3H9R B;  2UV8 G;  1TPH 1;  2VUY A;  1WYI A;  3BMV A;  1PSC A;  4ZOE A;  3KTC A;  3BLF A;  4MJ2 A;  2FGL A;  4EPD C;  3RRX A;  3WLR A;  1V02 A;  4UNI A;  4YLW A;  2XPB A;  3OIH A;  4KES A;  4DB7 A;  3UYC A;  4XBK A;  3W27 A;  2G0W A;  4AY7 A;  1J6O A;  1JF6 A;  4Q4S A;  2PWD A;  2ALR A;  1S5V A;  2WOQ A;  3UJS A;  1BF2 A;  1JI1 A;  4HD5 A;  3VYL A;  4W8A A;  1TMH A;  1YBQ B;  4PMU A;  4HPJ A;  4MB4 A;  1XFB A;  3UG3 A;  4MKV A;  4AST A;  1Q66 A;  2VFG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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