3OA5A

The structure of chi1, a chitinase from yersinia entomophaga
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
515
structure length
515
Chain Sequence
KSNLIYDKDPGYVWDNKNECEGAAEETYQELNYEPSISADKLTWTPTRLAKTVFNTYEDDDDFNVLCYFTDWSQYDPRIINKEIRDTGGRSADILRLNTPDGRPFKRLIYSFGGLIGDKKYSADGNASIAVRLGVATDPDDAIANHKGKTIPVDPDGAVLASINCGFTKWEAGDANERYNQEKAKGLLGGFRLLHEADKELEFSLSIGGWSMSGLFSEIAKDEILRTNFVEGIKDFFQRFPMFSHLDIDWEYPGSIGAGNPNSPDDGANFAILIQQITDAKISNLKGISIASSADPAKIDAANIPALMDAGVTGINLMTYDFFTLGDGKLSHHTNIYRDPSDVYSKYSIDDAVTHLIDEKKVDPKAIFIGYAGYTRNAKNATITTSIPSEEALKGTYTDANQTLGSFEYSVLEWTDIICHYMDFEKGEGRNGYKLVHDKVAKADYLYSEATKVFISLDTPRSVRDKGRYVKDKGLGGLFIWSGDQDNGILTNAAHEGLKRRIKNKVIDMTPFYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural analysis of Chi1 Chitinase from Yen-Tc: the multisubunit insecticidal ABC toxin complex of Yersinia entomophaga
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Yersinia
molecule keywords Chi1
total genus 187
structure length 515
sequence length 515
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3oa5A01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3oa5A02
5A6MA 2V3GA 1XYZA 1JXKA 1HP4A 2FHCA 3NIYA 4P8WA 4AZCA 4OUEA 2XSBA 4CN6A 3BLKA 1V0MA 4LYPA 3LPOA 1KBKA 1XSJA 2WANA 3OBAA 2VZOA 2XJ7A 2Z1SA 1GORA 2CITA 4B9ZA 4M24A 4MAZA 3FAXA 4DWSC 1FHLA 4OOUA 1C90A 3KE0A 2WW5A 4CGTA 3EMQA 3BSGA 1NH6A 1KQZA 4W8LA 5BXPA 1I75A 4CD8A 4M81A 1H49A 1BHGA 1KFWA 5BRQA 3DC0A 3QHOA 2AAAA 1BQCA 1GPFA 1DWGM 1HNYA 2Z1KA 4KRUA 4MAVA 1E6SM 1OGSA 4J28A 1V3KA 3ZSSA 4D1IA 1QVBA 3HN3A 2BXZA 1J11A 2J7FA 3W53A 5HXMA 4UFMA 4DWSA 3KL3A 1HX0A 2D24A 5JBDA 5BXSA 1NOFA 3KL0A 1B3ZA 1UKOA 2ZOXA 3QOKA 3WD2A 4M8UA 1N82A 2IXUA 3POCA 1J0HA 3BC9A 1NQ6A 4H2CA 1HIZA 4C7DA 1W1VA 2A3EA 3VD3A 3VGHA 3ZSTA 2CKRA 3D5HA 1HJSA 1CGVA 6A3HA 1E72M 3PZNA 1VBRA 2PWGA 1WO2A 1FH7A 1EOMA 2WZIA 1W2PA 1E6ZA 1ECEA 2J25A 1FFRA 5CSUA 1V6UA 3AI0A 3SUWA 4GPNA 3SURA 4JAWA 4V2XA 5AC4A 4CKQA 2EQDA 1I1WA 5A8MA 2AOSA 1VEOA 4PTWA 1VENA 1EH9A 1B0IA 1UKSA 3WDPP 4E2OA 3SIMA 5C8BB 3HU7A 2J7HA 3ZR6A 3VTRA 3WIJA 5TD4A 1EGZA 3ZR5A 3AHTA 3MV01 1HP5A 1CWYA 3BAJA 3AHVA 3KEHA 4HA3A 2J78A 1MQRA 2X0YA 3QOMA 4CU8A 3BCDA 2OYMA 3RCNA 4JFVA 3EYPA 3WDIA 4H7VA 3WBEA 1NM9A 4A3HA 5BWFA 1YQ2A 2XYLA 1NARA 3FHQA 1SR0A 2WCSA 1E40A 1OGBA 1CENA 3PZUA 1DP0A 3SEPA 1TR1A 2B31A 1FP8A 1V03A 1W32A 2UWFA 4PMZA 3WDHA 2PBGA 5CPTA 5I6SA 2ZICA 4HOWA 2ZUTA 1PIGA 4XV0A 4D6GA 1J0KA 1CGTA 2DIEA 5FD0A 3W27A 1UYQA 5E0CA 1ODZA 5IFTA 3VIOA 4PCTA 1WDRA 1EDGA 3KZSA 3RJYA 1M53A 1CXKA 2BXYA 1J0ZA 4E8DA 2UY4A 4AY1A 1ESWA 1JI2A 4PMUA 3SCTA 3WF3A 3AYSA 2VUYA 1V02A 2V3EA 3OA5A 3WFZA 3AHYA 1UD8A 1V3MA 4ATDA 4MNJA 3WKZA 2DH3A 1UUQA 1JD7A 2PWDA 4GZEA 4TVDA 3RM8A 1KB3A 1M04A 4GI6A 3VIJA 2PF0A 2EPOA 1PBGA 3KL5A 4HZ7A 2F61A 2FGZA 1R85A 3CZKA 1ODUA 3MUAA 2E9BA 1HJVA 1CZ1A 4C7FA 1BYBA 2WKLA 3UERA 4E8CA 3SCUA 2E8YA 2VT0A 5LYRA 3PZTA 1JYVA 1V6WA 2VZVA 3N12A 1EA9C 3AHXA 1JZ2A 2BY1A 3AYRA 4FLQA 4CD7A 4IM4A 4AISA 3WD1A 2DQXA 2OSYA 4TXEA 4RE2A 2QF8A 3WEZA 3WDRA 3VGEA 4D6FA 1E4MM 4TTUA 4AZGA 3T0DA 1E6XM 3U5YA 3AFBA 1L0PA 3NSXA 2VO5A 1PZ3A 1GNXA 1OT1A 4MDPA 3BSHA 3RM4A 1XH1A 4MJ2A 1UG6A 1WDPA 4MADA 4U5KA 1ZJBA 1KBBA 4F66A 2CIPA 3OGVA 7TAAA 2XFFA 4BS0A 1LQ0A 4OBSA 1E6NA 4UQBA 1ZBKA 4Z2JA 1JGIA 1DWHM 4W7UA 2VQTA 2XSAA 4ZFMA 3MUZ1 4AZ5A 1VEMA 1K9TA 4TX6A 3HJEA 3WNLA 2E3ZA 3VIPA 4Z2HA 2G3MA 1WB0A 1TA3B 3AIRA 2XM2A 3BAIA 1LJYA 1CXEA 4UQAA 2XGBA 3ZQ9A 2CEQA 3WL0A 2VVSA 1Q6GA 5FL0A 4W7WA 2GJPA 1W9XA 4D6CA 3CHDA 4CCEA 1TVPA 1RD6A 3WD4A 1KWGA 1CXLA 4D6HA 5M03A 2F2HA 2X8RA 2DT1A 1UR8A 1XGZA 5FL1A 3MANA 1JAEA 2HISA 1UR1A 4EKJA 5CJ5A 3SCOA 2VRKA 3OG2A 2ZXDA 4M82A 1XD1A 2WVUA 3U57A 1CNVA 3U7VA 2G3NA 4X0NA 3ARVA 2G41A 1K9EA 3AS0A 1W1PA 1OSEA 3MSGA 5ABFA 3AIBA 2BY2A 1E55A 1FOBA 1V0LA 3TONA 2J79A 3ZT5A 1GQJA 1OIFA 4AEFA 1JI1A 4TOQA 3L4YA 2JEQA 4BF7A 3ARUA 1NP0A 1CXIA 4W87A 2W63A 4JL1A 2O9RA 1QI3A 2PWEA 3AMCA 4B3KA 4U2YA 5FKYA 1WP6A 2D23A 5A6AA 3WUGA 3KWXA 4HA4A 3WQWA 1GONA 3APGA 3MMUA 3K4DA 3VD9A 3ZIZA 2VCCA 4HPHA 3U5UA 3VM5A 1XV8A 2Y2WA 5BXTA 4MB5A 5JIWA 1PX8A 1XCWA 4ACZA 1UD2A 3T08A 4RE4A 2GK1B 2VZSA 1V0KA 4Z2KA 4N42A 2VCBA 1QW8A 3CH9A 2FHFA 4OKDA 4UFKA 1BG9A 3I3BA 1XC6A 4TUFA 1C7TA 2WHMA 1J12A 1UQYA 1IZJA 2GDVA 4PMNA 3PTQA 5GNYA 2J74A 3JUGA 5D9NA 3PTKA 5BYWA 1HVXA 1B2YA 2EEXA 1H3GA 4IUGA 8A3HA 2QMJA 1UH4A 1HL8A 3SUTA 5CPSA 1E6QM 1NP2A 1TZ7A 1EXPA 1U2YA 1CXHA 2WZEA 3NJ3A 3IK2A 8CGTA 3WSUA 4W5UA 4BA0A 4CN1A 1K9DA 2X0HA 3WEOA 2WSPA 4P7LA 3WBAA 3GDBA 2G4FA 3W0KA 5HPCA 2V5CA 2Y24A 1B3WA 4MNMA 3SCNA 2DSUA 2WZHA 2WWDA 2EPLX 3OGRA 3UEQA 2DSWA 2PC8A 1NOWA 1BLIA 3GTNA 4DUVA 5LA2A 4F9DA 5A6JA 1B30A 5A8PA 1GHSA 4N0RA 1OBAA 5CPQA 3GH4A 4QLJA 1FA2A 1JFXA 3B9AA 4J3UA 1AQ0A 4OBRA 1H11A 4AW7A 2WMJA 1GOIA 3IJ7A 5DT7A 1GQIA 1PEZA 3F4VA 1AMYA 3AICA 2FH6A 2WMIB 3TTOA 1GHRA 1ZB5A 3BMWA 3T0BA 3CO4A 2BHUA 2WYSA 5IDIA 4NRSA 4Y7EA 1Q6DA 1UD5A 3VU2A 2JALA 4UQEA 5I78A 2WVTA 2XPKA 2WMFA 1E70M 2QPSA 3VPLA 2WSKA 1KXTA 3CUIA 3WNOA 5GPRA 2VZTA 1YHTA 4FLRA 2XFYA 4UQCA 3OIHA 1JZ6A 1C92A 1EDTA 2WC3A 2WBGA 4WF7A 1S46A 3M7SA 2CETA 5ABHA 5CGMA 5HOSA 4OJYA 2YLAA 3VGDA 1BVZA 2D3NA 5HPOA 4D1JA 1CGXA 2ZUMA 2XVNA 2PI6A 3A6OA 1G5AA 5CXPA 4YN5A 3M07A 5HDRA 2ZIDA 3G6MA 4GZIA 2YDQA 3J7HA 4UFIA 1H5VA 1UWRA 4GZJA 3L4ZA 1XSKA 1JZ5A 3SCWA 1VAHA 3L4TA 3F5JA 2A3HA 3N17A 1KCKA 2JF7A 5FCZA 3IJ9A 2CPUA 4GIAA 1KGUA 1UZ4A 3VIHA 3ZJ7A 5CZKA 1AQMA 2VR5A 1EOKA 1LL6A 1WCGA 2C7FA 4HU8A 2VX5A 1UKQA 2CESA 1EQCA 1UR0A 4MJ4A 3AXXA 1LLOA 2E4TA 1G94A 1LF1A 3LMYA 2VRJA 3QHNA 5BCAA 4WIWA 4EK7A 1QHZA 4HU0A 1QNQA 2WC4A 1JYWA 3BAYA 1MXDA 5A6BA 3MUY1 2WWCA 2XGIA 4NF7A 2A3AA 4ZENA 3VIIA 3SUSA 3GNOA 4YHEA 1F4HA 4UR9A 1PAMA 3VIGA 3FNDA 3TTSA 4DUXA 1W9PA 4IPNB 4E4PA 4LXFA 1CPUA 4PN2A 1GOQA 4ZE4A 2V5DA 1WZMA 4B9YA 1QBAA 4XZWA 4GKLA 2XM1A 4BQ2A 4H8HA 4QAWA 1C3FA 3VNZA 1R7OA 1JNEA 1A3HA 1W9DM 2WVVA 4PMRA 2XVLA 4AZCB 2PBOA 4S3JA 3QHMA 4GINA 4P8VA 4MB4A 4AMCA 2JIWA 1LWJA 1UQZA 4PEEA 4WLCA 3MKKA 2CBJA 2ZE0A 4AD0A 2D0HA 4KWUA 2CCRA 2YL5A 1DTUA 3CHEA 5CLTA 1D2KA 3WQ8A 1XH2A 2WMGA 1VJZA 4A3YA 3AIQA 4YPJA 3F5LA 2VJXA 3DHUA 4RL3A 2ZUUA 2J7DA 3A4AA 3WH9A 5A69A 3GBDA 1C8XA 2BNJA 3NUKA 4H8UA 4QCFA 1EQPA 1CGUA 1E3XA 1H1NA 4GI9A 4W84A 4JHZA 3W81A 1AVAA 1SYTA 2QV4A 4WK9A 1VJSA 1B3VA 5E70A 3PBGA 2DSVA 3VDHA 3DECA 3ALFA 5GNZA 2W91A 1OGGA 2XFRA 3NDZA 5EFFA 4ZE5A 3EDFA 1CEOA 2BFGA 1QBBA 3ZJ8A 5FOOA 2A3CA 4BQ5A 2ZX5A 1Q6FA 4AD4A 3ZJKA 2UY2A 1E0WA 3AMDA 4UZSA 2XG9A 1E4LA 4L4OA 1MFVA 1MW0A 1UA3A 5C71A 1TFVA 2ZX9A 1J10A 2WHLA 1E71M 1CLXA 3WEMA 5AY7A 4J3WA 3BAKA 2YOCA 3L2LA 2CNCA 4GO8A 2W66A 4MNLA 3WH8A 3AMLA 3U7BA 3UR8A 1ZBCA 2WHKA 5DEZA 1MW1A 4LX4A 4JCLA 4TTGA 2JEPA 1B9ZA 3A3HA 1JZ7A 1FP9A 2GJXB 2EO7A 3ZM8A 3BCFA 1EHAA 1UZ1A 1KCLA 3TOPA 3LPPA 2J47A 5M5DA 3WNPA 4A4AA 2BS9A 3CGTA 2ZUNA 1JXJA 2DEPA 3GNPA 4WKAA 1QI5A 2WHJA 1C8QA 3ARZA 1B31A 1IZKA 2G3IA 4LYRA 4PRWA 2CBVA 2D1ZA 1U33A 3SCRA 3SUUA 1AQHA 3CMGA 1VFOA 5DT5A 1EIBA 1W9VA 1TCMA 1X1NA 4JKMA 1GUVA 3GXFA 5C70A 1E9LA 5FIPA 3WD3A 4CN4A 2GVYA 4AD1A 2J7EA 2WMKA 3W37A 4JKLA 4HMEA 2PB1A 1KR0A 1UKTA 4WJXA 1W3KA 2BVTA 4Q22A 2DSKA 1IT0A 2XWDA 5EMYA 3A4WA 2OWCA 1V3IA 1CBGA 1GVIA 2NT1A 4LQ1A 4PSRA 3UR7A 3W4RA 1V3JA 1ZBVA 2YKKA 1H09A 3LPGA 3ZJ6A 1V08A 1JDAA 7CGTA 2XVPA 2ZX6A 1UWTA 4P7NA 1LL4A 5A1AA 1ISWA 2RGLA 4IPLA 1TE1A 2AMGA 1JFHA 2XTKA 1TA3A 3CHFA 1V6VA 3T2PA 1J9YA 2YA2A 3AZTA 1E3ZA 3K1DA 1QPKA 2J8GA 3M6DA 1K9FA 1GJWA 2WCGA 3VDCA 2X09A 2WLZA 4QLKA 3WH5A 1EO5A 3WF1A 2JFEX 3NYDA 4C7GA 1OB0A 1CGYA 1D3CA 3IANA 2VRQA 2BHZA 4J7RA 2BY3A 5D9MA 3VGBA 3DHPA 1BF2A 3T09A 4AIUA 1US3A 1ZJAA 2WPGA 4UQ9A 3ZMRA 4B3LA 4J3XA 4HA1A 3WNNA 3MO4A 4RE3A 3VDBA 2F8QA 1H41A 5CG0A 4PUDA 2YL9A 3AIWA 2VX4A 4PMQA 2FH8A 5I3DA 1ISZA 4HMCA 2NW0A 3WUFA 3WH6A 1HN1A 3ECQA 1E1FA 2MANA 2QLYA 5GNXA 5A2CA 1JNDA 2ZWYA 5F7UA 4CCCA 3EDEA 1SMDA 4PTVA 4M29A 1IV8A 3K8LA 1ISXA 3GXMA 2WCAA 1OINA 1FH9A 4PYSA 5M17A 5CGTA 4BQ4A 5GQBA 4NRRA 3BGAA 1R7AA 3VUPA 3CZ8A 1UR2A 3GH7A 3VD4A 2ZUSA 5E09A 1NWTA 4HZ8A 5A8OA 2E8ZA 3AMGA 2GUYA 2Q8XA 3FAWA 2IUZA 4OZOA 4MNKA 1C8YA 3L4WA 5EFDA 2V3DA 4EAMA 2J75A 2UY5A 1EO7A 2XVKA 2UY3A 5IHSA 2JIEA 1UR9A 4JHOA 2WVSA 4D6IA 2EBNA 5I0DA 2GFTA 1W1YA 1ISYA 1H4PA 3PZVA 3ARYA 2E0PA 2W61A 4ACYA 4UTFA 4MB1A 1X6LA 1J0IA 2J77A 5JBEA 5BRPA 4JFWA 4GO9A 2WM0A 4DWSD 1OM0A 3WNMA 2CBUA 3NSNA 1QNSA 4OOZA 3AS1A 1HL9A 5CQ1A 1ISVA 1JD9A 1E4IA 1QHOA 3VO0A 3FXYA 2ZXQA 3ZO9A 3PZMA 3AS2A 1WDSA 2Y8KA 3O9NA 3WY1A 1CDGA 3THDA 3GXDA 4CCDA 5I23A 3VX0A 3AIVA 2W5FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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