3OA5A

The structure of chi1, a chitinase from yersinia entomophaga
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
515
structure length
515
Chain Sequence
KSNLIYDKDPGYVWDNKNECEGAAEETYQELNYEPSISADKLTWTPTRLAKTVFNTYEDDDDFNVLCYFTDWSQYDPRIINKEIRDTGGRSADILRLNTPDGRPFKRLIYSFGGLIGDKKYSADGNASIAVRLGVATDPDDAIANHKGKTIPVDPDGAVLASINCGFTKWEAGDANERYNQEKAKGLLGGFRLLHEADKELEFSLSIGGWSMSGLFSEIAKDEILRTNFVEGIKDFFQRFPMFSHLDIDWEYPGSIGAGNPNSPDDGANFAILIQQITDAKISNLKGISIASSADPAKIDAANIPALMDAGVTGINLMTYDFFTLGDGKLSHHTNIYRDPSDVYSKYSIDDAVTHLIDEKKVDPKAIFIGYAGYTRNAKNATITTSIPSEEALKGTYTDANQTLGSFEYSVLEWTDIICHYMDFEKGEGRNGYKLVHDKVAKADYLYSEATKVFISLDTPRSVRDKGRYVKDKGLGGLFIWSGDQDNGILTNAAHEGLKRRIKNKVIDMTPFYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chi1
publication title Structural analysis of Chi1 Chitinase from Yen-Tc: the multisubunit insecticidal ABC toxin complex of Yersinia entomophaga
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia
total genus 187
structure length 515
sequence length 515
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3oa5A01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3oa5A02
4JFTA 2VVNA 3SCPA 2D23A 4AEFA 1V3KA 3GH7A 3DYOA 4D1IA 2WZIA 2J7HA 1HL9A 3WD1A 1E6NA 1IV8A 1Q6EA 3VKKA 3WDPP 1XH0A 1WO2A 1GOMA 3WEOA 4EANA 1FP9A 1FHDA 2CETA 4BQ2A 2V5DA 1C7SA 1GQLA 3AHYA 1QPKA 1HJXA 1TFVA 3IK2A 4JFSA 2XHYA 5DT7A 2CHNA 4AZ5A 4UTFA 2XVLA 4OBSA 2BY1A 4TTGA 3W29A 4Z2IA 2WCGA 4JCLA 1UR2A 2QHAA 2J75A 3LPFA 2CBIA 3BC9A 3AYSA 2D0HA 2J78A 3OGSA 1UH3A 4W8AA 4UQEA 3UETA 3ZO9A 3OG2A 4CU8A 1JAKA 1QVBA 3L4ZA 1RD6A 1J0KA 3ALFA 3WNOA 1V3HA 2WMHA 4JZ5A 1UR4A 1OT2A 4C7GA 1C3FA 1UKOA 3ZSTA 4P7LA 1QBBA 4BF7A 1ZS2A 1FH9A 2F8QA 2J74A 2V3DA 1WAWA 3DHUA 1XSIA 2DH2A 4MDOA 3OZPA 4BA0A 1B31A 4HA1A 3VGFA 4UQCA 2CEQA 3T0BA 3BLPX 4D1JA 1HJVA 2UY2A 4AIOA 1UR1A 2VC9A 4J3VA 1TZ7A 4MB4A 1ZJAA 1YQ2A 2NSXA 1OGGA 2DQXA 5HDRA 2OSXA 1V3MA 5LYRA 4PMXA 2BY0A 2D0GA 1XC6A 1EO5A 4LYPA 3VX1A 2Y8KA 3SCQA 4AWEA 1R87A 4CGTA 1MW1A 4D6FA 1XV8A 3SCVA 1V3IA 3AROA 2J8FA 3T2QA 1NARA 2GJRA 1ISVA 4HMDA 4ATLA 1LG2A 4CVWA 1V6VA 2DH3A 9CGTA 3FHQA 2WSKA 3SUTA 4PTMA 1VJSA 2GK1A 1JGIA 4NSBA 1TE1A 5A1AA 3VIIA 5FOOA 3A4XA 1Y7VA 3EMQA 5FKYA 2OYLA 1E1EA 1UR0A 4WJXA 4HTYA 2VUYA 1V0MA 4U5KA 4YN5A 5I6SA 4BZYA 4UFMA 2BFGA 1HP5A 2EPNA 5ECUA 3ZT5A 1HT6A 1I75A 3HN3A 2VRJA 3LPPA 2GJXA 1H11A 2JIWA 4XB3A 2YA2A 2D0FA 2A3BA 3T2OA 2BY2A 4ML4A 1G01A 3ARTA 1QNRA 3QOMA 5D8WA 3RCNA 2EPOA 4YHGA 2OYKA 2WMIA 1UOKA 1JDCA 1FOBA 4RE3A 4M29A 2ZOXA 5A6BA 2J4GA 1MQRA 2WC4A 1LL7A 1JD9A 4F66A 1WZMA 5E09A 1UD3A 2DT3A 4NZCA 3BGAA 4U2ZA 1VEPA 3ZR6A 2CXGA 4Z2KA 1BG4A 1BQCA 3TA9A 5A6KA 3DYMA 5EFDA 4UFKA 1J0IA 1DWFM 1UQYA 1KCLA 1E72M 1CENA 1JZ2A 5HOSA 3I3DA 1G0CA 1GHSA 2J7FA 3BMVA 5HBFA 4W7VA 3L4WA 1UKPA 2ZXDA 1H49A 2YA0A 3SCNA 4AZHA 4W93A 2ZXAA 5IDIA 3FHAA 1UD8A 3UERA 2VVSA 4CU6A 4PN2A 3L4YA 2VCBA 2ZXQA 1CNVA 4F79A 2YKKA 3ARWA 2WB5A 5E9AA 1UQZA 1BTCA 4PUEA 1WZAA 8CGTA 1UZ4A 5C70A 5ABEA 1EHNA 3VDHA 4Z2JA 3AJ7A 3ARVA 2ESCA 3OA5A 4PUDA 3AS0A 1GQKA 2XSAA 4QP0A 4J3WA 1NP0A 2D3NA 3CHEA 3KEHA 1LG1A 1VRXA 4TVDA 2CKSA 4UOQA 1DEDA 3VGBA 3GH4A 3L4TA 1CECA 1KBBA 2VX4A 3VIMA 1JFHA 1CXKA 3VD4A 2JE8A 3SCRA 4ZFMA 2W67A 3WDHA 4WSKA 2YIHA 3MSDA 2J7BA 1JYXA 1OGBA 1W9VA 1JFXA 1AVAA 4CD6A 4E8CA 4V27A 1EHAA 1SMDA 4GIAA 2UY5A 2XSBA 3ZR5A 1E5JA 1O6IA 3BXWA 4PMYA 5I2UA 5JBFA 2WMIB 3VGGA 4U3CA 2OYMA 5EFFA 1DWJM 4CD7A 1JF5A 2VRKA 3W53A 4W5ZA 2OSWA 3VDBA 5AYIA 2YA1A 3T0AA 2ZICA 5CGMA 5A6BD 2RGMA 3SIMA 4AIUA 4PMOA 4PTXA 2G4FA 4U33A 1V6YA 1GNXA 4PYSA 2E3ZA 5CLWA 4F9JA 1MXGA 3L4XA 1JNEA 3QR3A 2WLYA 1BYCA 3G6MA 3WQ8A 5D9PA 2WW5A 2ZUMA 3WKZA 5BXRA 3AQUA 2XVPA 1CXIA 5FIPA 4LX4A 2XWDA 3PTMA 4H2CA 3WF1A 3BMWA 1BGGA 2CYGA 3RO8A 2FH8A 1MVYA 3ARYA 3VGDA 5JIPA 3PHAA 5A8QA 1VENA 4P8XA 3U7BA 1C93A 4RL3A 1FA2A 2E8YA 1V6XA 2WAGA 1DWIM 4QCFA 1KR0A 1F4AA 5BXTA 3AIVA 2PWGA 4HOWA 4RE2A 3PTKA 4WKAA 3KL3A 1MFUA 1EIBA 1HJSA 3OLGA 2GUYA 3VD3A 4TX6A 4FLSA 4X0VA 3PZVA 1BYBA 1KGWA 1UWSA 1E5NA 1GVYA 1K9FA 1MW0A 3W38A 2XVKA 1VF8A 2ZXBA 2G3NA 2OLHA 4C7DA 1CZ1A 4PRWA 4PMDA 1TVNA 3MO4A 3VOCA 1V08A 4GZJA 3WNLA 3UR7A 3FNDA 1UUQA 2VZTA 4P7QA 2WWCA 2XPKA 1GPFA 4HA3A 1J10A 3W25A 3PZUA 1PX3A 1HJWA 1JF6A 2WMFA 3A6OA 3WQ4A 1OSEA 3AS2A 3CUFA 1E6SM 4D6GA 3ZJ8A 4UFJA 3ZSSA 1G94A 1SR0A 4J3XA 1FH8A 4IISA 4OOUA 2X8RA 4P7NA 4W7WA 5ABFB 1EQCA 4AIEA 1HX0A 1R7OA 1QI2A 1W2VA 1NOWA 1VBUA 2XTKA 2WVVA 2JF7A 3GXMA 1O7AA 2V3EA 2VX7A 3F5JA 3WL1A 5EMYA 1PIGA 3WF0A 4CD4A 3ALGA 3WQVA 1B9ZA 4WIWA 3NIYA 5HXMA 1UR9A 1J12A 7TAAA 4TVCA 5C8BB 3AIQA 3VMPA 1W32A 1Q6CA 2VR5A 1JI1A 1E0VA 4CCDA 3AIEA 1EXPA 2YDRA 3ARXA 4ZENA 1HVXA 3WH9A 1JIBA 2YLAA 1KQYA 3AOFA 1WDQA 2WKGA 2Y8VA 5FL0A 2QLYA 4DM2A 1VAHA 1CWYA 4CD8A 2G3MA 3MKKA 3WUGA 1GONA 3CZ8A 3EDKA 1JYVA 1QNQA 2X09A 2VCCA 1ITXA 3GXIA 3NSMA 1UA7A 1GOWA 3VM7A 2FDMA 2C8NA 1BFNA 3UEQA 2VQUA 1CGWA 1PZ2A 5GPRA 1GOOA 4R5EA 1CGVA 4PMNA 1RPKA 1W3KA 1BG9A 3BAWA 1KWKA 3K46A 1MXDA 4KH2A 2WHKA 4HOZA 1UWTA 3DC0A 1U33A 2BVYA 1CLVA 3II1A 3WBAA 3K8KA 3VU2A 5A6LA 1BPLB 4UCFA 2WBGA 3IAPA 1G1YA 1US2A 2V5CA 1V0LA 6CGTA 2YOCA 1E56A 2D24A 3AMKA 4LPCA 1EO7A 3HJEA 1XSJA 2W61A 4HZ7A 3N15A 2WLZA 2O92A 2F61A 5CSUA 3W6MA 2W5FA 1H5VA 1MWOA 4JFUA 3WUBA 1D3CA 4EKJA 3MV11 1IZKA 4NRSA 1OWQA 2YL5A 4PCTA 5BRPA 2J62A 1PX8A 3NYDA 4MPKA 4EK7A 4NF7A 1XHGA 4AZCA 4NRRA 2VZUA 1H2JA 2PWDA 4UQ9A 2VX6A 1OBAA 5A6AA 4UZSA 2EEXA 2E9BA 3QHOA 4P8UA 3I3EA 2WC3A 3A4WA 1QW8A 1V3JA 2X05A 1GJUA 1GORA 4M82A 3VUPA 1W3HA 1PJ9A 2DIJA 3WMSA 1E55A 3PN8A 1C90A 1MQPA 4BCEA 3TTOA 2A3CA 4MB5A 5GQBA 4KGLA 1DWHM 2O9TA 1PBGA 3VMNA 3WELA 3AZRA 3WIJA 1ODZA 4CN4A 3WSUA 3ARSA 3I3BA 4JL1A 3AS1A 1XH1A 2VCAA 2IXVA 1JXKA 2WK2A 3MUZ1 3GYCA 1UHVA 4WKFA 3AS3A 1QBAA 1NWTA 4AD1A 4A3HA 1DHKA 4BQ4A 4OOZA 2J7EA 1UG6A 3NCOA 1JD7A 1KXTA 1W9PA 1CXFA 4V28A 3GXDA 4LYRA 4QLLA 1FFRA 1GHRA 1BLIA 3AZSA 1EDTA 2V38A 2XG9A 3O9NA 3VMOA 5DO8A 5KEZA 4JFVA 4JKMA 4ZXOA 3KL0A 3WF2A 4LGXA 1XD1A 1UA3A 1BHGA 3WFLA 5CSYA 4UFIA 1BAGA 2WPGA 2ZUWA 1JL8A 3BH4A 1WKYA 2GSJA 1WNOA 2Y4SA 5GNYA 3N13A 2VZSA 2YDSA 3N17A 4M24A 3GZAA 4LXFA 5JBDA 1W9XA 2JALA 1B0IA 3OB8A 3ZJKA 5I5RA 1UKTA 2E4TA 2E8ZA 1BVNP 4AW7A 4J27A 3WD2A 3PZMA 1D7FA 3AMLA 3EYPA 1JDAA 3SEPA 1JZ6A 1HKMA 3ARUA 3GTNA 5A8OA 1XH2A 2ZX6A 3M7SA 3MUY1 3SUVA 4N42A 1HJQA 4X9YA 4JIEA 3U57A 1JZ7A 5BXSA 1HIZA 2WHMA 2OWWA 1V0KA 1V6UA 1KCKA 4N0RA 3K1DA 4OBRA 4GI9A 1OB0A 2WWDA 3UG5A 1GUVA 4UNIA 1UKSA 4ZE4A 2CPUA 5I24A 3MMWA 3PBGA 1V02A 4OZOA 2JFEX 1EDQA 2X0YA 4GI6A 1KBKA 2X0HA 3WQ6A 5DMYA 2PWEA 1WDRA 1TR1A 1ZB5A 1NP2A 2MANA 1LLOA 1E6ZA 1Q6FA 5CLTA 5D4YA 1M04A 1XYFA 3WH8A 1S46A 4RE4A 4QLJA 3ECQA 4MTVA 3T2PA 3WQ5A 3BSHA 1NM9A 2WHJA 3S6TA 3ARQA 1MYRA 1K9TA 3AMGA 1QNPA 1C92A 5DEZA 2E9MA 3N04A 4AZBA 1B3ZA 4ZE5A 1CDGA 3SUUA 2WVUA 1B3VA 2YL8A 5TD4A 1CXHA 2CESA 2ZUNA 1EGZA 2JF6A 1ITCA 4D6EA 1WCGA 4MB1A 3B9DA 4ACYA 2Z1KA 4PMQA 4QCEA 1J18A 2FGZA 5HPOA 1UWRA 3EBVA 4Z2GA 5IHSA 3RPMA 4CCEA 3F4VA 2O9RA 4PMRA 4C7FA 2FGLA 3CBWA 1ISYA 1ZBKA 1BGAA 3WF4A 3A47A 5HNNA 2YDQA 2ZUSA 4GI8A 2EJ1A 2WZHA 2WVTA 1E15A 1V03A 1JI2A 1HNYA 4M56A 1WB0A 3BAXA 3BSGA 1DTUA 3LPGA 4B9ZA 4PSRA 1U30A 2OSYA 4AZGA 1HP4A 1DWAM 4OUEA 4OKDA 5I23A 2DPEA 3CZKA 4URIA 3DHPA 3U7VA 1OD8A 1XGZA 2AOSA 4J7RA 3CHDA 3AICA 3RMEA 2GK1B 1NWSA 4D6IA 3NSXA 4NI3A 4B3LA 4HOXA 1D2KA 2A3HA 1L0PA 1UD4A 4M1RA 3K8MA 1R8LA 5EBAA 4HZ6A 1Z32X 3M6DA 4UZUA 5IXEA 4JFWA 2GVYA 3KWXA 2XFFA 3N11A 4GQQA 1QI0A 1UD5A 2W66A 1B3XA 5A95A 4XX6A 3PZOA 2D20A 2DSKA 4D71A 3W27A 3WY1A 4AMCA 2GJXB 1E70M 1RP9A 2VT0A 4PMUA 3AIUA 3SUSA 3SCTA 4UFLA 3FAWA 4ATWA 2BXYA 4F8XA 2XWEA 4H04A 2E9LA 4FF5A 5JIWA 1CLXA 4IUGA 1EA9C 4AZIA 4BQ5A 4M81A 1CYGA 2Z1SA 4MDPA 3IANA 1KQZA 4Y7EA 1NH6A 1V02E 4R27A 5CZKA 4A3YA 4UOJA 5ABHA 1Q6GA 4MJ4A 3VGHA 3A3HA 4MAVA 2ZX7A 1J0ZA 5A2AA 3IAQA 2NT0A 3AISA 2AMGA 4JAWA 5LA0A 3CGTA 3POHA 2W63A 1NWUA 1I1WA 3W26A 2XFYA 4LQ1A 1J11A 1MFVA 1JZ8A 3ARPA 1JXJA 5LA1A 2CKRA 1E0XA 3AI0A 3AIWA 4PMVA 1E71M 4GZEA 5M3WA 3SUWA 5BWFA 2Y5EA 3GXFA 1PPIA 3HMCA 3ZJ7A 2XUCA 2XVNA 2JEQA 1UWUA 1XCXA 4U2YA 1E6PA 4Q22A 3CIVA 1JZ3A 1KGUA 3RDKA 2IUZA 3FN9A 1MW2A 4EAMA 5FCZA 1TA3A 4J28A 1E73M 1E4NA 2X1IA 1QI3A 3VD5A 3CLWA 1X6NA 5CPQA 1DWGM 2WCAA 1LF1A 5CJ5A 1OGSA 3TP4A 1YHTA 3THCA 1W9BM 1HKJA 1LJYA 4UQBA 5EB8A 3RJYA 1JYNA 1QNOA 1W9DM 4JKKA 3MMUA 2GDVA 2VI0A 3VD7A 3VVGA 2EPMX 3QGVA 2PF0A 3NJ3A 2XGIA 3CMJA 1H4PA 1UH2A 3QHMA 1QHZA 1GOKA 4ZEPA 3EMZA 1CGXA 3RILA 4HPGA 5D9MA 4Z2LA 1UWIA 1LQ0A 2O9OA 1EH9A 1TVPA 1TMQA 4ACZA 3MSGA 2VZVA 3F5LA 1X6LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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