3QOKA

Crystal structure of putative chitinase ii from klebsiella pneumoniae
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
PLMSVGYFNGGGDVTAGPGGDIDKLDVRQITHLNYSFGLIYNDEKDETNAALKDPAHLHEIWLSPKVQADLQKLPALRKQNPDLKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSAQKIIQQYGLDGIDLDWEFPVNGAWGLVASQPADRDNFTALLKSLREAVGEQKLVTIAVGANAESPKSWVDVKAVAPVLNYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSSHWPTVAAADKYSADFVVNNYLAAGLKPSQMNLGIGFYGRVPKRAVEPGIDWTKADAQNNPVTQPYFGPQQIALFASLGYDLSKDTYVKYNDIVGKLLNDPQKRFTEHWDDEAKVPWLSVQSAEGKPLFALSYENPRSVAIKADYIKAKGLAGAMFWEYGADDQNQLARQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Putative chitinase II
publication title Crystal structure of putative chitinase II from Klebsiella pneumoniae
rcsb
source organism Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae
total genus 124
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3qokA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3qokA01
3ARSA 1K9DA 4Z2JA 1KCKA 4E4PA 1UQYA 1E73M 1UWSA 1EQCA 3N11A 4PMQA 1B9ZA 2DT2A 5A8MA 2D3NA 2G3NA 3JUGA 2VVSA 3VGFA 1I1WA 2GDUA 1G1YA 2J7BA 2V38A 5E9AA 3QR3A 1OD8A 4CU6A 3WNOA 2YDRA 4AISA 2EJ1A 2DSUA 2WKLA 2EO7A 4F9JA 1QNRA 1W1TA 1MVYA 3WUGA 3WDIA 3SCTA 1B30A 4DM1A 1J12A 2OWCA 4UZUA 2FH6A 4JKKA 3W6LA 4M24A 4W5UA 1IZKA 2E8YA 4URIA 4WKAA 9CGTA 3GYCA 1W1VA 3BAWA 2QLYA 4FF5A 2X1IA 3CGTA 3KL5A 3ZJKA 5ABFB 1UD4A 3PZNA 3AS3A 1WB0A 4CVUA 3W29A 1G5AA 2YDSA 1CPUA 5I5RA 4JFUA 4J3SA 3ALFA 4YN5A 1MW3A 4W8LA 3GH7A 2J78A 4AZHA 4W93A 4DWSC 1LJYA 1Q4NX 3WH9A 1OD0A 4KMQA 1D3CA 2DSKA 1B0IA 1GJUA 1O6IA 1C7SA 5CQ1A 3VD9A 1X6LA 3PZIA 3W82A 2CXGA 2YLAA 4B3LA 3RIKA 4NRRA 5I2UA 2W67A 3K4DA 3TTSA 3VD4A 2E8ZA 2XFYA 1VF8A 1JXKA 4D6JA 2D23A 3CHCA 3L4VA 3OLGA 3OBAA 1ISWA 3ALGA 1GOKA 1VFUA 1SR0A 2JIEA 1KXVA 3OB8A 2G4FA 3VIHA 2YOCA 2WLZA 2PB1A 4A3YA 4J3WA 4B9YA 4UOZA 5ABEA 5HNNA 4CUCA 2V5CA 1B3XA 1BVNP 5CLWA 5FKYA 1FHDA 4XUYA 3GZAA 3LPPA 2CHNA 1HKMA 4UCFA 1VJSA 2IXUA 1CGXA 5IFPA 4YPJA 4HMCA 3BLKA 1E72M 2W66A 2YL6A 5C71A 5IXEA 5JIPA 3AZTA 1U30A 1FP9A 1W3JA 5ABFA 5JBDA 5GNZA 1LWJA 3SCSA 3AHZA 4AIEA 3WUBA 1Q6CA 4M56A 1W9VA 1U33A 2VX5A 2HVMA 1NH6A 1EHNA 1J0ZA 2FHBA 3WEMA 3APGA 2YL5A 4W8AA 5CGTA 3AIEA 2XGBA 2J8FA 4EE9A 3B9AA 1AVAA 1E6XM 2PBGA 1CXEA 2EQDA 1MQQA 4NI3A 4AEFA 5A6LA 1V3IA 1ZBKA 4P8VA 1QHZA 1VRXA 4HA1A 2VZVA 5BXRA 1QOXA 1LQ0A 3TA9A 5LYRA 4FK9A 2J75A 3WL1A 3WDJA 2EXOA 3CTTA 2JFEX 2DPEA 4JAWA 4AD3A 8CGTA 2XVGA 2XWEA 5GNXA 4AIOA 3PHAA 2J7GA 1J0YA 5I77A 2WMGA 4W89A 5D9PA 3EMCA 3AS1A 1UD2A 3VOCA 2VZTA 4J28A 1BQCA 3DHUA 2ZIDA 1CNVA 2WZIA 4BQ5A 5CLTA 3M46A 5IDIA 2EPLX 3KE0A 4AW7A 3BCDA 3AOFA 3N15A 4CD4A 1NARA 3PZUA 1XSJA 2CBVA 4PMDA 1QBBA 3VU2A 2PWGA 3AMDA 1EGZA 2YL8A 3GBDA 2VO5A 2XSBA 4TXEA 2QF8A 4LQ1A 1PX3A 2J7CA 1VFFA 4H41A 1HIZA 1HVQA 3U5YA 3ZT7A 5ABHA 3MANA 5LA1A 5TD4A 1XD0A 1OT1A 1QI5A 3VGHA 4V27A 5A6MA 2ZUWA 4C7GA 1VIWA 2WMKA 1IZJA 3GNOA 4WLCA 2XVNA 3S2CA 5ABGA 4U2ZA 3DHPA 3VX1A 3VD7A 1PZ3A 4QDMA 4M29A 1UKQA 1EO7A 3MV01 2EEXA 3EDKA 4HA4A 1ZU8A 2CIPA 3BLPX 2J25A 3TOPA 1J0HA 3ARYA 4U3CA 1GOOA 3MSDA 5A1AA 2A3BA 3WMCA 1WDSA 1R8LA 2V3EA 1UR0A 1BGGA 3L4XA 1ISZA 4OZOA 3I3DA 3ZQ9A 3U5UA 3RM9A 2WNWA 5D8ZA 2WK2A 1QHPA 4FLSA 3IJ8A 3CUFA 3EDJA 2BY3A 3EDFA 3EMZA 2WKGA 3NSXA 1BYDA 2A3CA 1DP0A 1MFVA 4GINA 2O9RA 1E5JA 3OGRA 2VR5A 3FNDA 3K1DA 3VIIA 2YBUA 4EAMA 4HMEA 2Y8KA 1QW8A 1KXHA 1JDAA 1N82A 2D0GA 2CESA 4GQRA 2BY2A 3VGEA 5AC4A 1ZB5A 1ZJBA 2W92A 2YA2A 1E6RA 2NT0A 3F5LA 3NCOA 6A3HA 2YDQA 2V3DA 1E9LA 4WKHA 1DHKA 3BC9A 2VT0A 2J74A 3VUPA 1RD6A 2OSXA 3U7BA 3ZJ7A 4AWEA 2FHFA 4AYSA 1O7AA 1DWGM 4WJXA 1MQRA 1CXKA 5IHRA 2XFFA 1RP9A 1D2KA 4H8VA 3ZO9A 1KGXA 1V03A 2XTKA 2UWFA 4EKJA 2RGMA 4A4AA 4M81A 4W8BA 1WZKA 5A6BA 5CGMA 2ZXDA 3FY1A 1JL8A 3QHOA 1CBGA 4L4PA 4UZSA 2QHAA 5HXMA 4TTGA 3VD3A 4P7QA 4TVCA 2XVPA 3WQ5A 2OYMA 4JFTA 2VRQA 1WDQA 5HDRA 1M03A 4JCLA 4ZE5A 5DFAA 3GNRA 3IAPA 5CJ5A 4GO9A 2V3GA 4IISA 1V02A 1R7AA 3TTYA 3G6MA 4F79A 4Q7NA 1UUQA 4NZCA 3VIOA 2D3LA 1HKIA 3WIJA 1E3XA 4P7OA 3II1A 1E1FA 1KGUA 4H8HA 1UWQA 3WQ4A 1HXJA 5DT5A 3CMGA 3FXYA 3WNKA 3W25A 5D4YA 3T0BA 1ISXA 4TOQA 3BMVA 1R86A 4M8UA 3D3AA 3LPGA 2VZOA 4MNKA 2XIIA 2VJXA 1HJQA 2NSXA 2ZUMA 2EPKX 2DSVA 2E9MA 1VBRA 3A6OA 3HMCA 2CETA 4OBRA 2A3AA 1NWRA 5BXTA 1HJWA 2YLLA 1WKYA 2DDXA 2Z1SA 1JFXA 1TVPA 3WBEA 2BVTA 4CU7A 2XVKA 1OGGA 3F4VA 4MDOA 4Z2IA 3SCOA 3WF3A 4CD7A 3UEQA 2WHLA 3AXIA 4ATLA 1E4LA 5LA2A 1WZLA 1JG9A 2E0PA 1YQ2A 3HN3A 3S6TA 4UFMA 2ZX6A 3BGAA 2WZEA 4ML4A 1UR4A 1E40A 2QMKA 3VDAA 1CXLA 4TTUA 1CWYA 3ZT6A 2ZX7A 1U2YA 2FHCA 2VTFA 2JIWA 5BROA 3TTQA 4PMRA 3QGVA 4XX6A 1R7OA 5A6KA 3UR8A 3WDPP 3GXFA 4CD5A 2W63A 1Q6GA 3G6LA 2J7HA 1HJXA 2WMFA 2XYLA 4F66A 2ZE0A 4YHEA 1K9TA 4WIWA 3AQUA 3B9EA 1GOQA 3O2LA 3W6MA 5EB8A 5EMYA 1W3KA 2EPOA 4D1JA 2GDVA 1AMYA 4QCEA 1GPFA 1IT0A 1UR1A 5A8NA 4HU0A 4KRTA 2OSWA 1M53A 2BV9A 3ARZA 3B9DA 1EH9A 3W4RA 1G94A 3CO4A 3CZJA 1H0IA 1PEZA 4UOJA 1JD7A 2ZWYA 4N42A 4LGXA 3D5HA 1TZ7A 1PX8A 4RE2A 2WC3A 4PMYA 4AZ5A 1J18A 4DUWA 3CZLA 1HP4A 3EYPA 3W26A 1WZMA 1JZ5A 3NDYA 2VMFA 1R85A 1HF6A 3VIJA 2VX4A 3OLEA 4LYRA 5GNYA 4QLLA 3CHDA 3RM4A 1CEOA 1KWKA 1E4IA 3E1F1 2WC7A 1KR0A 3RO8A 1BAGA 1LG2A 3N9KA 1TFVA 1G01A 3WH6A 1GJWA 4IPLA 1JGIA 2YA0A 2YIHA 4B9ZA 3BH4A 3AIBA 4AMCA 2CBIA 5KZ6A 1L0PA 4PRWA 3WDQA 1WP6A 4MADA 1XYZA 4J27A 2W5FA 2XVLA 4UQEA 3WSUA 1GW1A 3WNPA 3ZM8A 1ODUA 1GCYA 4D6HA 2ZOXA 1MXGA 1UR2A 4U31A 1GUVA 2AMGA 4NF7A 4PEEA 1ESWA 4WKFA 1E6ZA 1XRVA 3K46A 4D71A 2Y5EA 3PZMA 5FL1A 1E4NA 3MSGA 4B16A 3IJ9A 1V3KA 3KL3A 4AD0A 3PZVA 2UY2A 1I1XA 5JUVA 3QHMA 4P8XA 1CXHA 1KB3A 3FW6A 2DGAA 1E5NA 3O9NA 3SIMA 1E0VA 1VEOA 3SUWA 3CMJA 1BGAA 3IK2A 3WQWA 2ZICA 1VBUA 1W9BM 4MNMA 3KEHA 2X0HA 1NOUA 1US2A 1XSIA 2WCGA 3OGVA 2JF7A 3M7SA 2EBNA 3SCNA 5HPCA 4UOQA 3DECA 1Q6FA 1E56A 1V0KA 3VD5A 1HP5A 1CGVA 4Z2HA 2VL4A 2BVDA 4Z2KA 4WSJA 2DT0A 4BQ2A 4J7RA 4PSRA 1HL9A 1KBKA 2XIBA 5A2BA 2ZX9A 4PCTA 1UR8A 1MXDA 3ZR6A 3POHA 1E3ZA 4BA0A 1NQ6A 3SCQA 3CZGA 1AQHA 1OT2A 1PX4A 1GQIA 4UQ9A 1X1NA 3VGBA 2X2YA 1C92A 3W0KA 4CKQA 3CPUA 5A94A 1RP8A 2NT1A 2VRKA 3FAXA 3AZRA 3WNMA 1ZJAA 1XH2A 3VM5A 2EPNA 1ZL1A 5EFDA 4MAVA 3FHQA 4BQ4A 4ZEPA 2XGIA 1Z32X 1ODZA 1TR1A 4PMUA 2BY1A 3WEOA 1ZS2A 1C8QA 1J0KA 4GI9A 5AY7A 3ZJ8A 1CGWA 3PTMA 2WMIB 1LL4A 3WF4A 3FN9A 1OWQA 3PZQA 1CDGA 3DC0A 4AY1A 4X0VA 4JFSA 1C3FA 5FIPA 3VIKA 1C90A 4H8UA 2J79A 1BVZA 1EQPA 1GQKA 1H41A 4IUGA 4HOXA 2VVNA 1UA3A 5M3WA 3SUSA 1W9XA 3WH7A 4QLKA 5FL0A 5E0CA 2PBOA 1TVNA 1HJUA 2C8NA 4HOWA 2D24A 1W2PA 2D22A 3QHNA 1UA7A 2Q8XA 1JF6A 1HJSA 3CZKA 5DEZA 4U2YA 1RH9A 3GBEA 3VMOA 2WHKA 4PUDA 1V3MA 3VKKA 5CXPA 2DIEA 1OCQA 1KBBA 1EDTA 5I3DA 1JNDA 2CCRA 2WCAA 3WUEA 2ZUUA 1V3LA 1B3ZA 1SMAA 3CUGA 2WBGA 4GPNA 3RMEA 1E15A 5FOOA 1GQJA 3WKZA 3ZOAA 1UH4A 3WN6A 4A3HA 1XCXA 3L4UA 2J7EA 2WMIA 2GK1B 2GVYA 4MB3A 3BSHA 4E8CA 3BAJA 2BXYA 2ZWZA 5BYWA 2DSZA 2RGLA 2J77A 2WPGA 2IXVA 3UESA 3MU7A 3MMWA 1NOFA 1CLXA 1M04A 1MW0A 4JL1A 4UFLA 1TA3B 3WMSA 1FOBA 1NWSA 1KXQA 4GI6A 1VFMA 1B3WA 2GUYA 1F4AA 3CZEA 2IUZA 1MFUA 1UH3A 4PYSA 4MTVA 2WHMA 1V6VA 5A6BD 1W32A 1V02E 1KFWA 4R5EA 1GZJA 2Y4SA 4NRSA 1HKJA 1HNYA 1DWJM 1UQZA 1V6UA 3VINA 5CPSA 5AC5A 1J0IA 3RPMA 4LX4A 4BQ3A 4TVUA 1VEPA 1JZ3A 3HU7A 3OZOA 2TAAA 2PI6A 3AYSA 4CU8A 3BMWA 2UY3A 1J01A 1CGTA 3KZSA 4AIUA 1W2VA 2WYSA 4D6EA 1DWFM 2DIJA 2WMJA 4AZCB 1BF2A 3F5JA 4ZE4A 3VDHA 1GOWA 4MPKA 1B1YA 1UKPA 5A2AA 3WMBA 3THCA 1QI2A 3VTRA 2GK1A 1XYFA 2CBJA 2V5DA 3T2QA 4NSBA 1MW1A 2G3JA 3CLWA 3AHTA 4BCEA 1GVIA 3K8MA 1GNXA 1TE1A 2XM1A 3I3EA 4F8XA 2PWEA 4ZFMA 2GFTA 3PTQA 1TA3A 4PSPA 3AIWA 3L2LA 1V0NA 2OSYA 2ZXAA 3DYMA 3AHYA 1GHSA 2G3MA 4P7RA 3NIYA 4S3KA 3DYOA 4FLOA 5FD0A 3UG4A 1WPCA 5A3HA 2VZUA 4MDPA 1M7XA 1WAWA 2VURA 3RDKA 3UCQA 1E71M 4Z2LA 1OGBA 2WM0A 4GZIA 4W84A 2W61A 1WE5A 4UFHA 3PN8A 4PMOA 4B15A 4AZCA 1CXIA 4W7UA 4AZGA 1JYXA 1EA9C 1WO2A 3OGSA 5JBFA 4CVWA 4UR9A 2VX7A 1NWUA 3MO4A 2BVYA 1JYNA 1PAMA 1VENA 4E2OA 4RE3A 3NSNA 5I79A 4MAZA 4D72A 4DUVA 3AHVA 3WQ6A 2YJQA 1JD9A 4WF7A 3NYDA 3WELA 1HVXA 1H2JA 4GXPA 4Y7EA 5AYIA 4JFWA 3ARVA 4LXFA 1CIUA 4P8UA 1CGUA 1G9HA 2A3HA 1TG7A 5IHSA 3IAQA 3VO0A 4MJ2A 5BRPA 5HOSA 5C70A 4P7NA 3SCPA 3HJEA 5HBFA 1NM9A 2BHZA 1OB0A 4L4OA 2W91A 4J3UA 2CHOA 3VIFA 3GDBA 1EDQA 2D1ZA 2O9OA 4PMXA 5HPOA 4PTVA 2VCBA 3CUHA 1F4HA 2HISA 2E3ZA 4H2CA 4MJ4A 4JZ5A 1CENA 1Y7VA 1QNSA 2OYLA 1W1PA 3VPLA 2OWWA 5JBEA 4HA3A 1OINA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1SFS A;  3AI0 A;  1UZ1 A;  2NW0 A;  5BWF A;  1JZ8 A;  3UG5 A;  2WHJ A;  1B31 A;  3CHF A;  3A3H A;  1UD8 A;  1MWO A;  4W7V A;  1QNQ A;  3MV1 1;  5D8W A;  2DH2 A;  3WQV A;  1B2Y A;  4BZY A;  4W87 A;  1J11 A;  3OA5 A;  2E9B A;  1FH8 A;  3U7V A;  3PZO A;  3PZ9 A;  4GQQ A;  5IFT A;  1NOW A;  4KGL A;  2CKR A;  2D2O A;  4CCD A;  7CGT A;  5M5D A;  1UG6 A;  1V3J A;  3ARU A;  3NDZ A;  1NP0 A;  1CTN A;  2CPU A;  4FMV A;  4AD5 A;  4AZI A;  4WSK A;  1RPK A;  5JH8 A;  4N0R A;  3VVG A;  4D6C A;  1JFH A;  2VX6 A;  2YL9 A;  2F61 A;  1LL6 A;  2G8Z A;  4MB4 A;  2UY5 A;  1VFO A;  4GI8 A;  4HP5 A;  3A4X A;  1BLI A;  3GTN A;  4X9Y A;  1ITX A;  4DWS A;  1XD1 A;  4J3T A;  2DH3 A;  3AHX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3CHC A;  1S5N A;  3OLG A;  3BLO A;  1IXO A;  4BY3 A;  3LXA A;  2E1D A;  1VFU A;  5GJP A;  2PPN A;  1J2B A;  2FZB A;  2PLJ A;  4JII X;  4FAP A;  3H8A A;  1MUM A;  4FP1 A;  2G4F A;  2INZ A;  5KIN A;  3VIH A;  4J3W A;  5ABE A;  1B3X A;  4M6U A;  1EXB A;  2PDJ A;  1HKM A;  4UCF A;  4YPJ A;  2PRH A;  3BLK A;  1E72 M;  1TZZ A;  1X98 A;  3HGS A;  3NDO A;  2YCE A;  1YLV A;  5C71 A;  5ABF A;  1U30 A;  1FP9 A;  1W3J A;  2ZQ0 A;  3SCS A;  5BWA A;  3C8N A;  3AHZ A;  4AIE A;  3WUB A;  1VGA A;  2VEN A;  4M56 A;  1U33 A;  4GQB A;  1J0Z A;  1UJP A;  3APG A;  3WEM A;  2XGZ A;  4JQA A;  4AVN A;  2XGB A;  5J5D A;  2FTW A;  1LOR A;  4GJI A;  1KM2 A;  1MQQ A;  1L6S A;  3W7C A;  4AEF A;  3GK0 A;  1DJN A;  1OK6 A;  3DI1 A;  4KES A;  4QG9 A;  3KAC A;  3U3H A;  1TX0 A;  5FAJ A;  4O1C A;  3JS3 A;  1KV8 A;  3TWB A;  4IPX A;  1Z3N A;  2CLE A;  3IVS A;  3RXZ A;  3VKC A;  3R89 A;  4NKC A;  4E38 A;  3LGD A;  4JAW A;  2XVG A;  4F2U A;  4ZFC A;  5GNX A;  3TNO A;  3KAD A;  2WMG A;  5AYX A;  4QM1 A;  2NQJ A;  3CWH A;  4WOZ A; 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 1NOW A;  3O5Q A;  2CKR A;  3UQA A;  5B8I C;  3C2E A;  5M5D A;  4JPG A;  3G0S A;  4LTS A;  1XIF A;  3NDZ A;  4O0K A;  4Z17 A;  4AD5 A;  1JPH A;  2J8T A;  1Q8A A;  5JH8 A;  4D6C A;  4DJF D;  2IPJ A;  3GHT A;  4MM1 A;  2NUY A;  1OC7 A;  4JEJ A;  2ISD A;  1QU4 A;  3SY1 A;  4HP5 A;  3KTX A;  3Q67 A;  4MJZ A;  1BLI A;  1XFC A;  4LVF A;  4Y8F A;  1P0B A;  2DH3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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