3RM4A

Amcase in complex with compound 1
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
YQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNVKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Acidic mammalian chitinase
publication title Identification and Characterization of Acidic Mammalian Chitinase Inhibitors
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 131
structure length 373
sequence length 373
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2011-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3rm4A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3rm4A01
5M17A 4FLSA 1J0KA 5D8WA 3BLPX 1JFXA 3WUFA 4GO9A 2OYMA 1V02A 4PTVA 3B9DA 4S3JA 2ZXAA 4W86A 3RM4A 1QOXA 2AOSA 3WMCA 1KR0A 1LWJA 2NT0A 3F5KA 4HOWA 2GJXB 1UKPA 4C7FA 5DMYA 2ZUSA 5EFDA 1B0IA 1NWTA 3DC0A 3TONA 5A2BA 3QHOA 3RJXA 3DECA 1OT1A 4CD4A 5A6SA 3FY1A 1W9XA 1V0KA 4BZYA 4J28A 2ZXBA 3AI0A 3GNPA 3IJ8A 4WF7A 4P7NA 1OSEA 4Z2HA 1H2JA 2ZUWA 2O9TA 4C7DA 1L8NA 3A4XA 5FD0A 3AMLA 1K6AA 1CGVA 4X0VA 5E6YA 4E8CA 4U2YA 2CIPA 1HXJA 3GTNA 4PMNA 5I77A 5HDRA 3AHZA 1LLOA 3WQ5A 3WNLA 3L4UA 4V2XA 1VEMA 1J18A 1H0GA 1HJWA 3GH4A 2G8ZA 1J10A 1A3HA 3AHVA 3PTMA 3GH7A 3BSHA 3QHNA 1E6NA 3VKKA 1NARA 1NOFA 5HPCA 2DSKA 3M6DA 3ZSTA 1UQZA 1CWYA 3WMBA 5EMYA 1KGUA 1Q6EA 5BCAA 5AC5A 4OZOA 2CBIA 4OBRA 2BHYA 2E8YA 1EO5A 3OG2A 3RJYA 2GUYA 3VIKA 1UWTA 4UFLA 4W5UA 4D6IA 2DSUA 5DF0A 3OIHA 3UR8A 2W92A 1E6ZA 1JZ8A 4PMRA 1TVPA 3A4AA 1BYDA 4UR9A 1Q4NX 3UG5A 2YLAA 4ATLA 1VFOA 1B2YA 1HJQA 4RL3A 4AD4A 3W28A 3FAWA 3KEHA 2CXGA 2FHFA 4RE2A 1NP2A 3AYRA 3BAKA 3KL0A 1MXDA 2VO5A 1GVIA 1XCXA 1H0IA 2J7EA 2AMGA 2ZUMA 3VU2A 4DWSD 3BAIA 4AC1X 1XYZA 1BF2A 4QAWA 2GJRA 6CGTA 1QI5A 2UWFA 3ARRA 3L4ZA 1CZ1A 8CGTA 4QCFA 2D1ZA 1QVBA 3O2LA 4YPJA 3GM8A 3F5LA 1KXHA 3WDPP 1ZJAA 1UD8A 3VX1A 4JZ5A 4J3XA 4UFIA 4E4PA 1E1FA 3CHFA 3LPPA 3VOCA 4S3KA 4D6JA 5BROA 2VC9A 1LL7A 1WB0A 2BY1A 1HKJA 4H8HA 3KZSA 3WNOA 3WEMA 1VRXA 4GI9A 1CXFA 2XSAA 1B3VA 1PIFA 1QW9A 5DO8A 1HJUA 2ZX7A 3FHQA 4MPKA 3MUZ1 2J79A 3WMSA 3FHAA 3SEPA 5AY7A 2CESA 2G3JA 2UY5A 4PMYA 3AZRA 2ZOXA 5CJ5A 5ABFB 4GO8A 1CGUA 2VX5A 1JZ5A 3ZR6A 1G01A 3MO4A 1MVYA 1E4MM 4QLJA 2YA1A 2D20A 5ABEA 1ESWA 4HU8A 1UH2A 2QMJA 4L4OA 4GKLA 5CGMA 3W26A 1OIMA 2J78A 4PMDA 1E9LA 4UQDA 1WPCA 4JFUA 1UWUA 3WF4A 3WUEA 4TVCA 5BYWA 1J0ZA 4GINA 2VMFA 3J7HA 3TTOA 1UOKA 4DUVA 1ISXA 1KGXA 1J0YA 1PJ9A 2WWDA 1ISZA 3OGRA 3WY1A 4JFWA 3HU7A 1VFUA 4M82A 4PRWA 2CNCA 4CGTA 1O6IA 4MJ4A 2PBGA 4M8UA 3NSMA 1BVZA 1CECA 1JAEA 3AHTA 2G3IA 2CHNA 1PEZA 3EDFA 2XVKA 2ZX6A 1E4LA 1XCWA 1KXQA 2BXYA 3WF1A 4IPLA 1ISYA 2WK2A 1XH0A 2DSWA 3BMVA 4P8WA 4UQ9A 3O6AA 2ZUVA 1V6XA 1E6SM 3MSGA 1GHRA 2XYLA 1CLXA 2WMGA 1B3XA 2WMHA 3DYPA 1I75A 4TX8A 2EBNA 3WEOA 3K4DA 4AZCB 4B3LA 4JIEA 4KRUA 4PUDA 4W87A 1UWSA 1XSIA 5FKYA 2CHOA 2D3NA 4M80A 2JF7A 2ZX9A 3AXHA 1MW1A 5D9PA 1E15A 5CXPA 4UQBA 3L2LA 2E0PA 4P8VA 3ECQA 1E3ZA 2CKSA 1GOQA 2QV4A 4AEFA 1JZ4A 4B16A 3VMPA 2Z1SA 5A6JA 5GNYA 1PAMA 3BH4A 4X0NA 1QBBA 3VTRA 2D23A 1C8QA 3SCRA 1VJZA 4XX6A 4ACYA 3CUIA 1CXKA 2DSVA 5CGTA 1GPFA 2GJPA 1M03A 1XYFA 1CEOA 3ZR5A 1W9UA 2PI6A 1R7AA 3SUTA 1BYCA 3F4VA 1G5AA 3APGA 3W0KA 1V3LA 1JD7A 5CPTA 1E55A 3RPMA 5I3DA 4Q7NA 3VMNA 1OCQA 5CZKA 3GNOA 2VVSA 4MB1A 2Y4SA 3AS1A 3ARTA 4JL2A 4ATDA 4WSJA 5TD4A 1Y7VA 2BFGA 4P7QA 1ZL1A 1J01A 2X0HA 1JYNA 3N12A 3B9EA 4AZ5A 3IANA 5A8QA 1B3YA 4WK9A 2CERA 2XWEA 4PMOA 3KL5A 3AS0A 2D0GA 2XWDA 2V3GA 3ZIZA 1H3GA 1IZJA 3VD9A 1WDQA 3CHDA 2VTFA 2CCRA 1MW0A 3SIMA 1OWQA 1QNPA 4B9ZA 2DH2A 4BQ3A 3AIVA 1WO2A 1BLIA 4FF5A 2UY4A 4F9JA 5LA1A 1XC6A 1G1YA 5C71A 1E5JA 2QMKA 3FW6A 4Z2KA 3PBGA 2WMIA 3JUGA 4H41A 1UYQA 2OSYA 3T2PA 1HX0A 3AMDA 4GQQA 3UEQA 5BRPA 4D1JA 2DT1A 4D71A 1J0JA 2YBTA 1CTNA 1X6NA 3VD5A 4HPHA 4LYRA 3A3HA 4PMUA 3T2QA 4IISA 3VIIA 1UZ1A 4PEEA 4CD5A 4EAMA 3SCTA 3O9NA 5AYIA 3GYCA 3GXDA 2DT0A 3NCOA 4W89A 2BVDA 4AEEA 3L4XA 1WDRA 2WNWA 4R27A 1BAGA 3WDJA 2JFEX 2Z1KA 2WXDM 3M7SA 1W3LA 1JDAA 1W3HA 1WZKA 4JFTA 2YDRA 1EOMA 1MFUA 4JKLA 2J7HA 5I24A 1HJSA 4CD6A 2WYSA 2HISA 2WZIA 2BNJA 3WNKA 1E56A 4YHEA 3MKKA 4KRTA 3CLWA 4W8AA 1ZBCA 3AICA 3BAXA 1TZ7A 2GK1A 1GJUA 1JNDA 4MNKA 3K8MA 1NQ6A 3ZT6A 1GQLA 1I1WA 4BQ2A 1JFHA 4M29A 3QR3A 2WZEA 4A3YA 2WMKA 3MMWA 1C7SA 1E40A 2PWGA 1CXLA 4HMEA 1WAWA 3W6MA 1RP9A 2YBUA 2G4FA 1UG6A 3PZGA 1HKKA 3L4TA 1C93A 2WKGA 3BAWA 4W88A 5I5RA 5A8MA 1AVAA 2GDUA 3WBAA 1NWUA 2XGBA 1JI2A 4UOJA 3K46A 5E09A 5JH8A 3NIYA 5EFFA 3MUAA 1W3KA 2WCAA 5I0DA 3OZPA 1E70M 2YDSA 3AXIA 1MFVA 4XZWA 4Z2JA 4U2ZA 3CH9A 3WF0A 3OBAA 2YL6A 2YJQA 5HPOA 4UFHA 1U2YA 3THDA 2BVTA 3VIPA 4BCEA 2JE8A 1GQIA 1HVQA 2EPNA 4WJXA 1KWKA 1W9VA 3I3BA 4JFVA 2WC3A 4KGJA 1GJWA 1DP0A 3UETA 1SYTA 1V0MA 3U7VA 1SMAA 3N15A 1JZ6A 4W84A 4LYQA 2J7DA 1EDTA 2E8ZA 1UZ4A 4LX4A 3ZT7A 4CU6A 1HT6A 4AYSA 3PZUA 2DQXA 3SURA 1AQHA 2CETA 2DT2A 1OGSA 1Q6DA 2DPEA 2D22A 4FMVA 1CXEA 4MDPA 3TA9A 2YL9A 3AS2A 2WHJA 1E6PA 2WB5A 4AW7A 1DWFM 1V3MA 3VUPA 3W25A 5A6BA 4GPNA 4K68A 3GDBA 2YKKA 1UR8A 3WQWA 1UR0A 4UQEA 2E9LA 1W1YA 1ITXA 3W6LA 5AYBA 1SR0A 4JKKA 2FDMA 1LL4A 2XVLA 4RE3A 3D3AA 1GOOA 1OB0A 3ZJKA 4PCSA 1IV8A 1U33A 4JHOA 3PHAA 4D72A 1F4AA 1B1YA 1E4IA 2JIWA 4ZXOA 3HJEA 1V3IA 4AY1A 1FHLA 4GZJA 3CZLA 3FN9A 1TCMA 3VDBA 1EA9C 4HMCA 4ZENA 1CIUA 3WD4A 1VENA 1KCKA 2IXUA 1H4PA 2V5CA 3ZOAA 3CUJA 4CCDA 2F61A 3MS8A 1W9DM 2O9PA 1UD2A 4GZIA 4ML4A 2EPKX 3ZSSA 2G3NA 1EQPA 1GOMA 1EGZA 3M07A 4D1IA 3G6LA 4ZE4A 1WE5A 1CYGA 2FHCA 5C70A 1C90A 1HNYA 1SMDA 3SUUA 1HP5A 3WIJA 4U5IA 1UA7A 2VVNA 1C8XA 1UD3A 2EQDA 1V6YA 1OBAA 1GUVA 2WPGA 1V3JA 2W67A 4WSKA 2W62A 4W7WA 3RILA 1FFRA 2JIEA 2BY2A 1K9TA 1CGTA 1QW8A 2QLYA 3FAXA 3CMJA 2J47A 3AOFA 3RDKA 1V02E 2VZUA 3WFZA 4UTFA 3VIFA 3L4WA 3AISA 4BS0A 3QOKA 4D6DA 2OWWA 3EDKA 4PUEA 3ALGA 3BCDA 4NRRA 2WVTA 1BSIA 3CO4A 2WCGA 2A3EA 2DDXA 4MADA 3L2MA 3AIUA 4HOZA 2VZOA 2VQUA 2OYKA 3VIGA 4PSRA 1GORA 1U30A 3VDCA 4F8XA 4EE9A 1W3JA 1ZS2A 3POCA 3WL0A 3ARQA 2XFRA 4PYSA 1PIGA 5CQ1A 4HOXA 3IJ9A 3CZGA 1LG1A 3B9AA 4DUWA 2PBOA 3QOMA 4MDOA 2VQTA 4F9DA 1XHGA 3PZVA 3NDYA 5GNXA 3OLDA 3GXMA 1BYAA 2YL8A 3II1A 4HP5A 1MQQA 3OZOA 3WQ6A 3NDZA 4CN4A 3GXIA 3E1F1 1TFVA 4Q22A 1KCLA 1JXJA 5F7UA 2WVVB 4NF7A 4QLKA 4F66A 4AZBA 3MU7A 1K9EA 5CLWA 2V5DA 3SCPA 1G9HA 5E6ZA 2ZUUA 3EDEA 3S6TA 1H1NA 2BXZA 4AXNA 1DWAM 2WSKA 1KQZA 1QPKA 3AIBA 2XIBA 4AIEA 1ZB5A 4GI6A 2O9RA 4BA0A 4QFUA 1US3A 3ARWA 4C7GA 1IZKA 4EANA 2JEPA 4NI3A 2YLLA 1TVNA 1E4NA 3F5JA 1MXGA 1DEDA 3VM5A 4BQ4A 2V38A 1EXPA 4HA4A 2EEXA 1S46A 4KWUA 4HPGA 3WSUA 1UQYA 1TUXA 3T0AA 4D6EA 2BVYA 3PTKA 1QNRA 2VX4A 1GQJA 4LGXA 2QPSA 4CN1A 1E1EA 3WFLA 1L0PA 4HU0A 1US2A 4PMQA 3BLKA 2ZXQA 1XSJA 4V27A 3RMEA 1Q6FA 1TMQA 1LJYA 3SUSA 1NOUA 2F2HA 1R86A 3IAQA 3VNYA 1A47A 3WQ4A 4R5EA 1KGWA 4WKHA 4RE4A 3WNPA 3EMQA 1UWIA 1KXTA 2WANA 5ECUA 5D9MA 2UY3A 4UQAA 2RGMA 1OM0A 3FNDA 4AZ6A 1W9BM 2VJXA 5ABGA 1QI4A 5M5DA 1WZMA 4LXFA 4A3HA 4URIA 2EJ1A 1LQ0A 4TTUA 3U57A 2GDVA 2XFFA 4P7RA 4DWSA 1M04A 4CU7A 1XV8A 1XH2A 3WH6A 4XV0A 1R87A 5E0FA 3OLIA 2ZWYA 1BFNA 5I23A 4CCEA 1GZJA 1AQMA 2Y5EA 4HZ8A 4F79A 5BXRA 1EQCA 1ZBVA 1CDGA 4CU8A 1HJXA 2XGIA 3A4WA 4UNIA 1WNOA 2NSXA 3ZJ8A 1KXVA 4MTVA 1WKYA 2PWDA 3AIWA 2VX7A 5BWFA 3WENA 2X8RA 5A1AA 4AIOA 1OIFA 1Q6CA 1WDPA 4MNMA 3UR7A 1FH8A 1EDQA 1MYRA 3AXXA 4E2OA 2YOCA 2VZSA 1W2VA 2DGAA 5C8BB 3ZO9A 2XM1A 3RM9A 2VI0A 1KBKA 3SCSA 2JF6A 3CBWA 2ZUTA 4AZ7A 2BHZA 3THCA 3T0BA 3SCVA 4W85A 1B9ZA 4LPCA 1SFSA 1J0IA 1N82A 2CBVA 1YHTA 3N17A 1AMYA 2X2YA 4Z2LA 4M56A 1HKIA 1B90A 3AS3A 3AYSA 4P8UA 4IPNB 4ZXLA 4TTGA 1PX3A 4AD0A 1V0NA 3VD3A 1Q6GA 4TUFA 2BS9A 3ARVA 1QNOA 2D0FA 3W4RA 5I79A 6TAAA 5BXTA 1QI2A 3GZAA 3ZQ9A 2DIJA 5IFPA 1V08A 3ARUA 3CGTA 1FP8A 1H11A 4QP0A 4V28A 1QNSA 4QLLA 5A3HA 3GXFA 1D2KA 4CVWA 1UKOA 1MQRA 2J25A 3WH7A 1FP9A 3M46A 5DEZA 1W1VA 4WKFA 4PMXA 5ABHA 4UFMA 1GCYA 4UZUA 2DT3A 2YL5A 3W53A 2VOTA 2CPUA 2BHUA 1E6QM 2GJXA 4N42A 4HA1A 2JALA 4PTMA 1XD1A 3NJ3A 3NSNA 3EBVA 1CGYA 3QGVA 4UZSA 4CD8A 5IFTA 2E3ZA 4UOQA 2ZICA 4J27A 2MANA 3TOPA 1W1PA 4DM2A 2WHMA 5JUVA 2WC4A 1VEOA 2GVYA 1H41A 1WCGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1MZR A;  1UWT A;  4FPS A;  4D6I A;  3S9Y A;  4UUI A;  5HJY A;  5DRI A;  1TR9 A;  1ENU A;  3UR8 A;  3FYO A;  1E6Z A;  4PMR A;  3A4A A;  5G5I A;  1Q4N X;  1ZRQ A;  2YLA A;  4YS1 A;  1B2Y A;  4QIB A;  1OYC A;  3EWC A;  3IVS A;  1PO9 A;  5G1M A;  3W7E A;  2VO5 A;  3SQS A;  1NMW A;  2CLI A;  2GL5 A;  2HS6 A;  3BLI A;  3BJT A;  3M4H A;  2XSX A;  1XCX A;  4ZGY A;  3R58 A;  1GTE A;  3T8Q A;  2J7E A;  4NX0 A;  7XIM A;  2ZUM A;  5F2L A;  2P8B A;  3BAI A;  3HPF A;  4QAW A;  2UWF A;  2D1Z A;  3GS6 A;  1QVB A;  2VGI A;  3CC1 A;  2Y63 A;  1KXH A;  5DAN A;  3VX1 A;  3C86 A;  4PL2 A;  4Q32 A;  5LIX X;  1SFJ A;  4UFI A;  3CHF A;  4MWA B;  3QW3 A;  1EYW A;  1LL7 A;  1TJ2 A;  3KZS A;  1ZK6 A;  2KGJ A;  1WUF A;  4FS9 A;  3EOE A;  1J96 A;  1PIF A;  1HJU A;  4X2P A;  4L9X A;  1TPE A;  1UP3 A;  2XP5 A;  4LCR A;  4QHR A;  2E6F A;  4MPK A;  1UWA A;  2RDW A;  3O06 A;  3MUZ 1;  3CQI A;  3P82 A;  4JR5 A;  1KC7 A;  3KM8 A;  5AY7 A;  2CLL A;  1I2N A;  2UY5 A;  4PMY A;  3Q4D A;  5ABF B;  3VFC A;  5EMK A;  3ZR6 A;  3PRD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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