3WIJA

Crystal structure of a plant class v chitinase mutant from cycas revoluta in complex with (glcnac)3
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
344
structure length
340
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGGGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase A
publication title Crystal structure of a plant class V chitinase mutant from Cycas revoluta in complex with (GlcNAc)3
rcsb
source organism Cycas revoluta
total genus 121
structure length 340
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wijA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wijA01
3AIQA 4W87A 4DWSA 1V6VA 1JD7A 1UHVA 1CGWA 1GHSA 3L4TA 1WNOA 3SIMA 1X6LA 1XRVA 3AQUA 5E0CA 3ECQA 2W5FA 3HN3A 2JE8A 2OWCA 3PHAA 4J3WA 2WC3A 2WKLA 1NH6A 3WF1A 3ZJ6A 2Q8XA 4W7UA 1R7AA 5CPTA 3VKKA 4PTWA 4LX4A 3PZIA 4D1JA 1JNEA 5M5DA 2OLHA 1CXFA 4ZXLA 3MMUA 3VNYA 4PMYA 3VVGA 4JFSA 3WN6A 4HA1A 4C7DA 2V3EA 4PMUA 1TA3B 3NDZA 2WVTA 1TUXA 5HBFA 3U7VA 3N15A 2CEQA 3UR8A 1UYQA 5JIWA 1V3JA 3SCRA 1XHGA 1WO2A 2ZX6A 2ZXBA 5LA1A 4AZCB 1KXTA 1LL7A 2NT0A 5A2BA 2BS9A 1GQLA 4AZ5A 3W81A 3MUAA 2J74A 2DT3A 2D3NA 4S3JA 2VMFA 5HPCA 3K1DA 4QDMA 5ABFB 2XFYA 1MFVA 3NCOA 1H5VA 1GUVA 5GNYA 2DT2A 4U31A 1SMAA 4JFWA 1PIFA 4HMEA 2XGBA 1BF2A 2A3BA 2F2HA 1ZU8A 1OINA 1V03A 2C0HA 3CZGA 5LA0A 1UZ4A 1F4AA 1V08A 3OLDA 3DC0A 1K6AA 4AZCA 3WIJA 3ARVA 2WMFA 5A3HA 2VZUA 2WMIA 1KWGA 1JFXA 1OBAA 1HL8A 2VI0A 4XX6A 1PX8A 3RILA 1GCYA 2MANA 4QLKA 2Y5EA 3WQVA 1V6XA 1EHAA 4P8UA 1WDQA 2J62A 2VOTA 3EMCA 3RJXA 1V6YA 2JF6A 2WBKA 4M81A 4WKAA 4HA4A 1MQRA 1DHKA 1J11A 2ZX8A 4AD0A 5I6SA 4UFIA 4DWSC 1EIBA 3AHZA 5GNXA 1P6WA 2ZUNA 2J7FA 2OYLA 4PMNA 4LYQA 2XVGA 3RM4A 1FHDA 5FCZA 2J77A 4XB3A 1WDRA 3RJYA 4HZ6A 3WBEA 1WAWA 3AMLA 1UA7A 1GW1A 2X1IA 4HMDA 3GXDA 4WKFA 1H11A 1UD3A 3CZKA 2W63A 4RE4A 1JD9A 2XGIA 2ZXDA 4MB3A 2BHUA 4ML4A 1UUQA 3WUBA 3W29A 2V3DA 5CSYA 3FN9A 3PZOA 3AXHA 2CIPA 4D6HA 1GQIA 4QP0A 3AROA 5DO8A 3UR7A 1UH2A 3W37A 1TMQA 4M8UA 5A94A 1PBGA 1ISWA 5E6YA 1EXPA 3N18A 4D71A 3WNNA 3WSUA 2VC9A 2XVKA 3GM8A 1O6IA 1OT2A 2VRKA 4P8XA 1ESWA 1KB3A 5CGMA 1KXQA 2ZUUA 3VIPA 1E55A 3M7SA 4CD5A 4BCEA 4J7RA 1V3MA 2J8FA 1I1XA 2XVNA 2OSYA 4U3AA 5CPQA 4U5IA 4H2CA 4D72A 2VJXA 3MU7A 1WZKA 1HVQA 3PZNA 3MUZ1 3I3BA 1PX3A 3VIFA 3E1F1 2EPMX 5BXPA 1ZJBA 4KMQA 1TE1A 3KL5A 4JKKA 5FL1A 1AQHA 1ECEA 4UFKA 1CGYA 1SR0A 1VFMA 2GJRA 1EGZA 3PTKA 4S3KA 4MTVA 4WK9A 2WC7A 1VBRA 4M29A 1UKTA 3ZJ7A 2YKKA 3AS2A 1PZ3A 3GXMA 4U33A 4GKLA 1JI2A 3WMCA 2PWGA 3ZJ8A 1ITXA 2GUYA 1QNPA 1V0MA 4PMOA 4CN1A 3TTQA 2W62A 1BTCA 4HOWA 3KWXA 1GOMA 1UWSA 4HZ7A 1EDGA 2VZVA 4A3YA 3BLKA 1VFUA 1ISYA 2YJQA 3QOMA 3L4XA 5LA2A 3I3DA 3WD2A 1R8LA 2UWFA 2ZXAA 2DIEA 2DQXA 3W82A 1C7SA 1E56A 2DSWA 2YL6A 1GQKA 3CUJA 4J3VA 4PMXA 3LPFA 3W6LA 3G6LA 5JBDA 3SCOA 1UR8A 1CWYA 5I79A 1B30A 3WKZA 4GI6A 1JZ4A 3WQ8A 2BNJA 3PBGA 3CMGA 4AMCA 4J28A 4TTUA 2BHYA 1UD8A 3WH5A 4WF7A 3OLEA 3WDRA 3SURA 2EQDA 3CGTA 1MW0A 4UQDA 2X09A 1W32A 3SCNA 1E4IA 3MKKA 3O6AA 3WF0A 3T2PA 3ZT6A 2ZUMA 4UOJA 1E6SM 5GNZA 1GOQA 4N0RA 5JIPA 4GZEA 3AHTA 2CESA 2E0PA 1CTNA 3K46A 1UWIA 3WQWA 1OGBA 3THCA 3VOCA 1GJWA 1CGTA 2BVYA 3VDBA 4HZ8A 8A3HA 3BLPX 1VJZA 5JBFA 1W9DM 2XTKA 4PMVA 2D23A 5DFAA 3W4RA 1W1VA 1IT0A 1W9XA 2GK1B 5AC4A 3UEQA 3K4DA 1W9BM 2IUZA 2VCBA 4UOZA 2BVDA 2QF8A 4QAWA 1LL6A 4CD6A 4YPJA 3F4VA 1JAEA 4V2XA 4PTVA 1JZ8A 2OYMA 4L4PA 2D24A 2PC8A 4MDPA 3SCUA 1CXKA 3ARSA 2ZOXA 1NOWA 2CERA 5A95A 2X8RA 1MWOA 1BYBA 1KR0A 1L0PA 3RIKA 2XVPA 1H2JA 3L4UA 1W9UA 4GI8A 3GH4A 1VAHA 1NP2A 4CU6A 1G0CA 1PZ2A 4L4OA 5EFFA 2EPOA 4IISA 3CO4A 1NWRA 1GZJA 5EB8A 3WUGA 1ZBWA 1GOWA 4HU8A 3WD4A 1JNDA 1B3ZA 4H41A 2XFFA 2GFTA 3BAJA 3OGVA 2PF0A 1LF1A 2JALA 4E2OA 4FLQA 1E6PA 3WBAA 1Q6GA 5KEZA 4GXPA 2J78A 3VUPA 3SCPA 3G6MA 1UWUA 4OBRA 3AFBA 3BMVA 1BQCA 4ZXOA 5M3WA 1W3HA 1CXHA 1C8YA 4KRUA 3EMQA 4UCFA 1U30A 3T2OA 1ZBKA 4UTFA 3AXXA 3HJEA 5D8WA 3VD4A 4BZYA 1HJVA 2FDMA 4Z2JA 1XC6A 1K9FA 1B90A 2DT0A 2W67A 4PN2A 3WL1A 1C90A 2VCAA 1WZAA 1E5NA 2WVVA 3VDHA 1B1YA 1Y7VA 3AISA 4W7WA 2Y8VA 4WKHA 3K8LA 3BAKA 4W84A 3SUVA 3AZRA 1XH2A 4ATWA 4KRTA 1R87A 4JHOA 1BG9A 2V5DA 4P7OA 1X6NA 3VX0A 2V38A 1JXKA 2X0HA 2DSVA 2FHCA 2G4FA 2VRJA 2VX7A 1WCGA 5BRPA 4OOZA 1RP8A 3VIGA 1OT1A 1J9YA 4WIWA 5BCAA 1E1EA 1MW1A 2CXGA 3WDJA 2CKRA 2G8ZA 2NSXA 3WF4A 5C71A 3KEHA 1FHLA 2WHJA 1CGVA 1B3VA 5TD4A 1H0GA 3AYRA 4AIOA 1UWRA 2GJPA 4HOXA 2VQUA 3LPGA 4UOQA 1E3ZA 1EHNA 1HJWA 2WMGA 3BSGA 5C70A 2HISA 5CG0A 2JF7A 1DWAM 3NYDA 4CU7A 1UG6A 2VZSA 3FAXA 3F5JA 4JL1A 4BQ2A 4GZIA 3NDYA 1ZBVA 2PWDA 3SUUA 3UERA 3II1A 2A3AA 4MDOA 2E9BA 4MAZA 4AC1X 2EBNA 3QGVA 1RD6A 1MXDA 4OJYA 5E6ZA 3BAXA 1ITCA 5A6MA 4QCFA 4N42A 3NUKA 1C8XA 2C7FA 3GNRA 4YHEA 2WANA 4ZEPA 1E0XA 2GDUA 1XSIA 1HKKA 1XV8A 4FLRA 3WQ6A 5JH8A 2YL5A 5AY7A 3IJ9A 4XUYA 4D6GA 1QPKA 2QPUA 2E9LA 2YOCA 3N13A 2X05A 4CU8A 3VTRA 1DEDA 2HVMA 1E6QM 4E8CA 1J0HA 3L4VA 2VNCA 4GINA 2WMHA 9CGTA 4NI3A 2WZIA 2A3EA 1Q6FA 2EPNA 1HJXA 1HX0A 1J10A 1HKJA 4JIEA 3UESA 3GBEA 1G9HA 4U2YA 4NF7A 1IZJA 1B31A 4AZBA 4QLLA 4W88A 3ALGA 1E4MM 3GBDA 1GVYA 3VNZA 1IZKA 1QW8A 1UKSA 3GXIA 3ZT7A 4UFMA 3GDBA 4PMDA 1HVXA 3VIMA 4NRSA 4J3UA 3VILA 1PEZA 1UH3A 2GVYA 1J18A 4TXEA 4IUGA 4J3TA 3CTTA 2WMKA 2J7BA 3WELA 1V6UA 1V3LA 2WMIB 1Z32X 3AI0A 1C92A 1US3A 5CPSA 1MQQA 4W8BA 1D7FA 1JFHA 4UZUA 1OD0A 1AQMA 3VIKA 3NSMA 1XH1A 1H49A 4M1RA 2WYSA 1G5AA 2TAAA 1QHPA 2YIHA 3ZT5A 2G3NA 2EXOA 3F5KA 3GNPA 4CVWA 1NQ6A 1NWSA 1UD2A 3T0DA 5DEZA 4LGXA 3FNDA 3EYPA 2E3ZA 2WVUA 3QHNA 2XIIA 2ZUVA 1SMDA 2FHFA 4C7FA 1BLIA 1KQYA 4JAWA 4PCSA 1H09A 2IXVA 1LWHA 4WLCA 2OYKA 2YA1A 4F9DA 1UR0A 1VENA 2UY4A 3PZ9A 4ACYA 4F66A 1QBAA 3CHEA 5A6LA 1BPLB 3DECA 1WDSA 5A2AA 2JEPA 2PBGA 3PTMA 1TZ7A 2D0FA 4AD3A 4B3LA 3VD9A 1DWJM 1VEPA 1AVAA 1KBKA 3N12A 2Y2WA 3UG3A 1JXJA 2RGLA 2VQTA 5M03A 3UG4A 4WJXA 2A3HA 1B9ZA 1UD4A 4BQ5A 4OIFA 3CUFA 2WCAA 5I77A 1GVIA 2WCGA 3U5UA 1CGUA 4UR9A 1E6NA 1CXEA 2YBUA 1ODUA 3THDA 7TAAA 3K4AA 4LYPA 2J7DA 4ZENA 3VIOA 5D8ZA 1GJUA 4P7NA 3EMZA 4W85A 5ABGA 2XG9A 2ZUTA 1KCLA 1XSKA 4HOZA 4P7LA 1CDGA 3W28A 4H8HA 5BXSA 3EDDA 2BFGA 2WW5A 4IM4A 4PEEA 4LYRA 3M6DA 4EANA 1JDAA 5IFPA 2EPKX 1QW9A 1NOUA 2PBOA 3A3HA 1JYWA 1EH9A 4CCEA 4UFJA 1YQ2A 2PB1A 2O9PA 3IAQA 4HP5A 5C8BB 1JZ5A 4UQAA 3AMDA 2DH2A 4KWUA 1A3HA 2Y4SA 1BGAA 1MYRA 2V5CA 1CLVA 3TOPA 1UR9A 1JZ7A 4X0NA 4B15A 3BH4A 1HN1A 2GJXA 2OSXA 4W5UA 3WQ5A 3OG2A 1JDCA 3L4WA 3U7BA 1BG4A 4B3KA 3CBWA 3WENA 2PWHA 1KGXA 3VD3A 3AXIA 1NARA 4ZE4A 1YHTA 5E0FA 1E15A 2YDRA 2DSZA 1QI3A 4CCDA 5EBAA 3CLWA 5A6SA 3PZMA 4AZHA 1WZMA 3ZSTA 1GORA 4C7GA 3MS8A 4FK9A 3VIJA 1HXJA 2WHMA 5CGTA 2G3JA 3ZM8A 2E9MA 1M01A 2X0YA 3VGDA 3AIUA 1KCKA 5DMYA 1LJYA 3GYCA 1HT6A 1LQ0A 1V6WA 4P8VA 2ZIDA 3VINA 4K68A 3NIYA 3VGGA 5IHRA 3KZSA 4W5ZA 1UWQA 1CNVA 5A6KA 1JZ3A 1NWUA 1W9VA 2FGZA 4D6FA 2O92A 3WNMA 4BF7A 1OIMA 1G1YA 4D6DA 4MNJA 5FD0A 2CYGA 1V0KA 3FW6A 4AD5A 1M03A 3PZUA 3EDFA 1BVZA 4RE2A 4A3HA 1E6RA 2YA0A 1JZ2A 2VX4A 3SCQA 3TP4A 1JF6A 1FH9A 3IK2A 1HNYA 3ZJKA 1I1WA 3GXFA 1OSEA 4ACZA 3WDQA 4AIUA 1V02E 1DWHM 1VRXA 1UKOA 1ISXA 4AY1A 1FOBA 3WEZA 1HJSA 3W38A 3M07A 1E6ZA 3OLGA 1VFOA 2EJ1A 4M80A 3EBVA 1C93A 1HJQA 1V0LA 3CPUA 2BY1A 2PI6A 2Z1KA 2WZHA 4DUVA 4PRWA 1O7AA 1NP0A 3EDEA 5HDRA 3QOKA 1ZBCA 1ZJAA 1E3XA 4AZ7A 1W91A 3ZIZA 1VFFA 2DGAA 2ZE0A 2AAAA 5IFTA 3POHA 3AIWA 3ZMRA 1CGXA 1G01A 4AZ6A 1D3CA 1GQJA 1GOKA 2WSKA 1VJSA 1J0JA 2VX5A 1C3FA 1EQCA 3F5LA 4CD4A 2E8ZA 4AZGA 1OM0A 1XH0A 1CXLA 1JYVA 1FFQA 3WH9A 3LMYA 3PZGA 4TVUA 3CH9A 3T0BA 4P8WA 3RPMA 3AHYA 3JUGA 3AS1A 4HTYA 5DT5A 1HKMA 1US2A 2OSWA 4BS0A 3PZTA 1UOKA 2XM2A 2XVLA 5HXMA 2CITA 3WNLA 4CD8A 4TX6A 3SCWA 2FHBA 2WVVB 3FAWA 2GDVA 3WH8A 5EFDA 5IXEA 1OIFA 2ZX7A 1KXVA 5D9MA 1R86A 3J7HA 4PYSA 4GQQA 5I23A 4W86A 1KR1A 4X9YA 5EMYA 3WFLA 3VPLA 2XFRA 3N1AA 3POCA 1LL4A 3AS0A 1GNXA 5DT7A 1JZ6A 1XYFA 4KGLA 4PMRA 1GOIA 4GZJA 4HPGA 5BROA 3A4WA 5FL0A 1JIBA 4H8UA 4JCMA 4XZBA 3AYSA 1A47A 1RH9A 3VGBA 3AIVA 3EDJA 4PSRA 5IHSA 4UFLA 2YA2A 4PTMA 4DM1A 4MB5A 3VD5A 2WNWA 2V3FA 3RM8A 4EE9A 1PIGA 5ECUA 1HP5A 3W26A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1S46 A;  2WC4 A;  1KWK A;  1BGG A;  4URI A;  2JIE A;  2CPU A;  4H7V A;  4AYS A;  2W4X A;  2YLL A;  2WHK A;  4DWS B;  1E70 M;  2QHA A;  2ZX9 A;  2WK2 A;  3ZR6 A;  2WKG A;  1TG7 A;  1WB0 A;  5HNN A;  2BXY A;  3VII A;  1GHR A;  2YDQ A;  3WY1 A;  3AOF A;  3CUG A;  1H4P A;  1OB0 A;  2XWE A;  1GPF A;  4UQE A;  2WMJ A;  2XSA A;  3N9K A;  4U2Z A;  1MXG A;  5A6B A;  5A8Q A;  1EO5 A;  4AW7 A;  2DT1 A;  3WNO A;  4AXN A;  4M56 A;  4TX8 A;  5LYR A;  3VM5 A;  3W6M A;  3ARX A;  2J79 A;  5FKY A;  1KBB A;  3WF3 A;  3OIH A;  1E73 M;  2WCS A;  4Y7E A;  2JEQ A;  1KGW A;  2E40 A;  2C8N A;  4PUD A;  3BXW A;  2F61 A;  3SUS A;  2ZIC A;  5ABE A;  4JL2 A;  2J7G A;  4U3C A;  3QR3 A;  4PBG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3MMT A;  1DPM A;  4GPN A;  3RLG A;  5AYX A;  1ZAH A;  3PSV A;  3WQF A;  4LV9 A;  3UU0 A;  3C3N A;  3W73 A;  1GVQ A;  3R7M A;  3WEM A;  4MNM A;  1BYD A;  1ISV A;  2W91 A;  1NFG A;  3QBU A;  2BY0 A;  2WB5 A;  4H6K A;  4FSA A;  4BQ3 A;  5DCD A;  1MDL A;  3C4U A;  3B0X A;  4JXC A;  2HJP A;  3TLL A;  1QI4 A;  4MLR A;  3KBJ A;  1V0N A;  4DRK A;  3C0S A;  1LRN A;  3O2L A;  4QS5 A;  2QNE A;  5HUO A;  4KRZ A;  3TC3 A;  4L72 B;  1EPX A;  4DXV A;  2UZ5 A;  1R3W A;  3S42 A;  5GPR A;  2CBU A;  3WH7 A;  3GVG A;  3ARZ A;  1Q6U A;  2WLY A;  3H2M A;  4BQ4 A;  1BD0 A;  2LLE A;  1F6Y A;  2Z7G A;  3SEP A;  1S2A A;  1FWH C;  1M7X A;  3WL0 A;  4PBF A;  4FIR A;  2B5U B;  3O07 A;  3JW7 A;  4ZOE A;  3RCY A;  4ATD A;  4NIR A;  5PTD A;  2AMG A;  1EP2 A;  4IPL A;  1S46 A;  3T07 A;  2Z1X A;  4URI A;  3BL3 A;  4DWS B;  4IQL A;  1KM1 A;  1KNW A;  4CNS A;  3KX6 A;  4GIY A;  4NJK A;  1ZK6 A;  1R3S A;  1FKR A;  1GHR A;  3M0Y A;  3MHF A;  1OC5 A;  1IGW A;  2Z1W A;  1PDY A;  2WMJ A;  4LAX A;  2F84 A;  3E2Q A;  3KCE A;  2PP0 A;  4U2Z A;  2NVC A;  4Q32 A;  1JQV A;  5A6B A;  4ZVJ A;  1EO5 A;  4AW7 A;  4FNQ A;  5H8P A;  4HK7 A;  3V0T A;  5BU6 A;  3TIM A;  2OQY A;  2QCC A;  1AD4 A;  3WNO A;  1YE4 A;  4K2S A;  1FD9 A;  4H4I A;  3ARX A;  4GI4 A;  3WF3 A;  3UJ2 A;  1KW1 A;  2DW7 A;  1E73 M;  2WCS A;  2DJX A;  4RX0 A;  5AHL A;  3BXW A;  1SZG A;  3SUS A;  1BXN A;  3EB3 A;  2YCJ A;  2J7G A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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