4DWSA

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 186

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
543
structure length
526
Chain Sequence
GAVPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEKIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADETIDMGPLYNPGEIYLSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
total genus 186
structure length 526
sequence length 543
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsA02
2A3EA 1A47A 3VM7A 1PX8A 1J0KA 3WEMA 4ZEPA 2W63A 3MO4A 3W26A 1J0YA 4QDMA 2VL4A 4CU7A 2PF0A 1I75A 4MTVA 4PN2A 1OT2A 4PEEA 3L4WA 5GNZA 4F9DA 1JDDA 1B90A 1XSIA 3W38A 2XM1A 3VIPA 1A3HA 3CHCA 4EAMA 5D8ZA 1QNQA 3RDKA 3UERA 1UR2A 2AAAA 3WELA 3GH7A 1DEDA 3ZM8A 4P8WA 2DPEA 1V0LA 1H5VA 2XFYA 2G8ZA 1JG9A 1LWJA 1XYFA 2VNCA 3VNZA 3N1AA 2X0YA 3AMLA 1K6AA 4BCEA 1QNPA 3WSUA 2WXDM 1GOMA 2VX7A 1LL6A 1RP8A 2GK1B 2GFTA 3QOMA 4M80A 3AJ7A 4UCFA 3EDDA 4UQ9A 3CHDA 4XZWA 5AY7A 1FH9A 5A95A 1X6NA 3FAWA 5E70A 4Y7EA 2WLZA 4RE2A 2XVGA 3VD7A 1BFNA 2PWFA 1GHSA 1OD8A 1UH4A 5CGMA 2YL5A 3B9AA 1E72M 2J79A 4LPCA 2VZTA 4YHEA 1RD6A 3VGEA 5CSYA 4JKMA 1MFUA 4WIWA 3ARRA 4UTFA 3GBDA 1EOMA 1OINA 3GYCA 4X9YA 4GQRA 4NRRA 2QLYA 5I0DA 2X05A 5JIPA 1UWUA 4BS0A 4CN1A 2W61A 4J3XA 1V6XA 4UR9A 1W9PA 1JIBA 5JBFA 4M81A 4D6GA 4URIA 1VFOA 4WKFA 1CYGA 3BMWA 3EMCA 3PZIA 4W7VA 3AIEA 2D2OA 5BRQA 1ESWA 5HPOA 1GOWA 1Q6DA 3HMCA 2FGZA 3BCDA 2YBUA 4HTYA 4BZYA 1OT1A 2GK1A 2C7FA 5KZ6A 3BLPX 5IXEA 2X09A 2Y24A 1PAMA 2DT3A 5LYRA 2PWGA 3F5LA 1DWIM 3ARZA 1PJ9A 1O7AA 5BWFA 4MB5A 1UR0A 1P6WA 3PZGA 1KXQA 2AOSA 2VRQA 4GO8A 4D6JA 1V6WA 1N82A 5I23A 5C70A 4WKHA 3S6TA 2EJ1A 3CIVA 4EKJA 1W9UA 1E6PA 1UA7A 4FK9A 2WC3A 3N11A 2GJXB 4GO9A 3PZMA 5E6ZA 1JD7A 3CUGA 3WMSA 1OIMA 4D6DA 4HZ7A 2X0HA 1CECA 4D72A 4V2XA 3POCA 4PMZA 1J12A 1DWGM 4JHOA 3NSMA 2WANA 1C91A 3NSXA 1V6UA 1V0KA 3PN8A 1GOQA 1JD9A 2WCGA 5D4YA 4XX6A 1IV8A 4FF5A 4D1IA 4WKAA 1AQMA 2EPOA 4JZ5A 3ZIZA 4H8HA 1WAWA 4B9ZA 1VF8A 1E6ZA 5CZKA 1BPLB 3K8LA 3RJXA 1GQIA 1RP9A 2BHYA 4W85A 2OWCA 1HJWA 3WDRA 4LGXA 2CHOA 3E1F1 5A3HA 2J25A 1WP6A 3WUEA 6TAAA 1UQZA 2F2HA 1OSEA 1JZ7A 2YA1A 4W89A 2XHYA 1C92A 3UG5A 4HOZA 1B0IA 4L4PA 1FOBA 1ITXA 1CTNA 4BQ3A 2D24A 1AVAA 5M17A 2WWCA 4JFSA 1JNDA 4W5UA 1QI4A 4GI6A 5I3DA 1UD4A 1UOKA 2YL8A 1VB9A 5IDIA 1UD2A 5E9AA 2FDMA 2VURA 4CUCA 1UKPA 2FHCA 3MSDA 2J7FA 3L4UA 4MB4A 2E3ZA 1DWJM 1QOXA 3THDA 1HL9A 4OBSA 2OLHA 2WZIA 2J8GA 2E8YA 3BAXA 4U3CA 2DDXA 2FHBA 4W8LA 1UKQA 4DUWA 5CLWA 2CKSA 1I1WA 3EMQA 2ESCA 4CD6A 4HZ8A 3VD4A 1FFRA 1E3ZA 1BYAA 3N13A 4NRSA 5D9OA 3ZT5A 2CBIA 3WDIA 1UKSA 4P8XA 1UKOA 2O9PA 2A3HA 3W4RA 1MQRA 3VILA 2XFRA 4W88A 2DSKA 1LG2A 2V38A 2Y8KA 2CITA 1E4NA 2BXYA 3WNMA 4TVCA 5IHRA 3KL5A 1JXJA 5A6BA 1R8LA 1NQ6A 3WF3A 5HNNA 2X8RA 2JIWA 5A2AA 1OGGA 1OCQA 3QOKA 3CUJA 3GH5A 4PMXA 2ZWZA 4UQEA 5FCZA 2QPSA 1TUXA 3MANA 4UQDA 1K9TA 2ZX7A 3VPLA 4UOJA 1NWUA 2FGLA 1CXIA 1H4PA 2OSXA 2D0HA 3GNRA 4MAVA 3WEZA 3ZJKA 3UCQA 1VJSA 2WSPA 1HP5A 4KH2A 4J3WA 5I79A 4CCDA 1B30A 1LF1A 2WHKA 3WH7A 2UY3A 4AC1X 2CERA 1TFVA 3CO4A 1TE1A 3VTRA 1CXHA 1ISZA 3PZOA 2J4GA 3AIQA 2XGIA 2V5CA 1EDTA 2JFEX 3MS8A 3BSGA 3TTOA 2BVTA 4W8AA 3WDQA 4MNLA 1V6VA 2Z1KA 2ZX9A 3AHYA 1OGSA 1HP4A 4CKQA 5I2UA 1ZU8A 1MXGA 3AFBA 3ZO9A 3PTQA 3F5JA 5E6YA 1JYWA 1EH9A 2XM2A 3O2LA 2OSWA 3VDBA 1KWGA 3MUY1 3L4VA 1XH0A 3T2QA 3GZAA 1CGTA 5CGTA 3ARPA 4KRUA 4DWSD 4CVUA 2WSKA 3AIBA 1LQ0A 1H3GA 4U33A 4U5KA 3D5HA 1Q6FA 4GZIA 1UHVA 2JEQA 2OYKA 4P7OA 2D0FA 4NF7A 2WZEA 3AMGA 4LX4A 4AD1A 4Z2HA 2BHUA 3WD0A 3HU7A 1VBRA 4GXPA 3G6MA 3SCNA 3APGA 1E3XA 3GXIA 2CKRA 1CBGA 2W67A 3IK2A 1UG6A 3CUFA 1B3WA 4N0RA 1GNXA 2RGMA 2G3MA 1MXDA 1HVXA 5D9NA 2WHJA 4TX6A 1JI1A 3CHEA 4Z2KA 4RE3A 2WM0A 3BCFA 1O6IA 3WBAA 5E0FA 2VC9A 2DQXA 1OIFA 2WMFA 2WVSA 4PMOA 3MV01 5A8NA 1U30A 4IPNB 5IFPA 3TA9A 5M3WA 1WE5A 4DWSB 5JBEA 5A94A 3O9NA 2QMJA 2VZVA 3W0KA 3L2LA 3A4WA 2XUCA 4ZE5A 1DHKA 2W4XA 5A6SA 4PSPA 1WDSA 4M56A 2WMHA 1QW8A 1W9XA 1AQHA 3ARWA 1WCGA 2UWFA 4OIFA 1HJVA 3RPMA 1GPFA 4Z2JA 1QI0A 3DHPA 2CEQA 1M04A 1E0XA 1V3KA 1XSJA 3WQ8A 3OGRA 2QF8A 1NOFA 3WFLA 5BRPA 1NWSA 2ZOXA 1V0NA 2ZX5A 4HMDA 5CSUA 3NJ3A 3JUGA 1B31A 2ZWYA 3KL3A 3TP4A 1G0CA 3U5YA 4JHZA 3WNNA 1CXKA 2VX6A 1QBBA 1WDRA 5CG0A 3FXYA 4PCSA 5A2BA 1OBAA 4PSRA 4AZCA 3VD3A 1VFFA 3K4AA 3U7VA 4BA0A 4ACYA 3WNOA 3KL0A 1V6YA 5KEZA 3WD3A 2J74A 1HIZA 2W62A 1W32A 3GXFA 3OZOA 4AW7A 1LL7A 3VVGA 1W1TA 4DWSA 3WKZA 1XRVA 3PTMA 1UZ1A 2DT0A 3ZJ6A 1JXKA 1FP9A 1XD0A 4J28A 1UKTA 3VU2A 3MUIA 2W5FA 2WMIB 1ZJBA 4QCEA 2ZUSA 3CZEA 1VFMA 3WQ4A 3ZJ8A 2YA2A 4MADA 2EPNA 3ECQA 1J10A 4H8VA 3QHOA 4PTWA 1GZJA 1EA9C 1FA2A 1V3LA 1CNVA 5DT5A 2D20A 3WEOA 1XSKA 2BV9A 3GXDA 3ARSA 2J47A 1HKKA 2WHMA 4HPHA 1CGUA 1KGUA 1CPUA 3NYDA 4PRWA 4PMQA 1UR8A 4W8BA 1W91A 2BY1A 1MQPA 4OKDA 4IISA 4AXNA 1HT6A 3T2OA 1OB0A 1L0PA 3OLIA 2WZHA 5A2CA 4ATLA 5I6SA 3CUIA 5HOSA 3KZSA 3W53A 2V3DA 2E9MA 1C3FA 5FKYA 8CGTA 1WNOA 3MUAA 1LG1A 5FOOA 3GM8A 2WWDA 4UFJA 3O6AA 1EDGA 1CWYA 2WMIA 1G01A 4MNJA 1L8NA 2PWEA 5EMYA 3OIHA 1BHGA 3CZGA 1KQYA 4RL3A 3MMDA 2XVKA 4QLLA 4W7UA 2PBOA 5I77A 2DSZA 3LPPA 3QGVA 2ZICA 3ZOAA 1JYNA 3FN9A 1E70M 1BGGA 1E4LA 4DUVA 1V02A 4J3TA 5CPSA 1VEOA 1IT0A 4FLRA 4J3SA 1HJUA 4CCEA 3THCA 3M7SA 3NDYA 4TTUA 4NSBA 3WDJA 4EE9A 1UYQA 1UD6A 1PX4A 3WH8A 1UR4A 1J0JA 3VIFA 2ZXDA 1KB3A 1UQYA 4LQ1A 1K9EA 4UFMA 4AZGA 4CU8A 1C8XA 1RH9A 1ODUA 3PHAA 2VO5A 2E4TA 4U31A 3T0AA 3PZUA 4XV0A 3B8SA 4AIOA 1DWFM 4UNIA 4D6CA 3CZJA 3CZKA 3DHUA 1QI2A 2ZX8A 1KCKA 4JFUA 1NM9A 2D23A 3FW6A 4W5ZA 3RM9A 1FP8A 3DECA 3VM5A 2UY4A 3M6DA 2A3BA 1JF5A 2E0PA 2PI6A 3VMOA 2WC4A 4XB3A 3VIIA 1C7TA 1LWHA 1E55A 2XIIA 4HMCA 2DSWA 2EPKX 3FAXA 5BXRA 2NT0A 2IUZA 1LJYA 2IXUA 1Q4NX 4CD8A 2O9OA 2VCAA 4CCCA 4L4OA 3T08A 3VIHA 4M1RA 2G4FA 2WB5A 4M82A 5A6KA 2ZUTA 1GOOA 2CCRA 4ZFMA 3KE0A 4TXEA 4N42A 3IANA 1D7FA 2WNWA 4J7RA 1BSIA 1MFVA 3SCWA 1TZ7A 1G1YA 3OLGA 4BQ5A 3MKKA 4W93A 3WQWA 3TTYA 2Y8VA 1C93A 1XD1A 3WDHA 1H41A 3N15A 3UG3A 3ZT6A 3PZ9A 2W91A 1MQQA 1AQ0A 1BAGA 2ZUVA 3T2PA 5LA1A 1KXVA 4AWEA 3ARQA 1JZ2A 2JF7A 1R87A 2XGBA 4UFIA 1BG4A 2IXVA 1HNYA 4P7RA 4IM4A 5CPTA 1GUVA 3GH4A 3SCPA 2WLYA 4LYRA 1ITCA 3AMDA 3W81A 4OBRA 4BQ2A 1HN1A 4CU6A 1W1PA 2WVVB 2XSAA 2GSJA 4JCLA 3TTQA 1UH2A 3F4VA 3BGAA 1GQJA 1WKYA 2VR5A 1BYCA 2WKLA 4CVWA 3VNYA 2Y5EA 3VGDA 1BGAA 2ZE0A 3ZR6A 1CXLA 4DUXA 2YDQA 1GQKA 3VOCA 2GJXA 1HJXA 1D2KA 1UZ4A 2GUYA 3GNPA 1GQLA 2AMGA 4KMQA 4Z2IA 3OGSA 4JKKA 5HBFA 3VIKA 4UOQA 4PMVA 1XC6A 3MUZ1 4HA4A 2UY2A 4ATWA 3W29A 4WK9A 4E8CA 4PMUA 2D3NA 2DH3A 4Q22A 3TONA 4HOXA 1DWHM 2DEPA 5F7UA 3CLWA 2XFFA 3EDKA 1UR1A 3EDFA 1CEOA 1MWOA 1C90A 1E6RA 4DWSC 4HA3A 1OGBA 1UA3A 4GQQA 3CPUA 4M29A 1CENA 2WVVA 4ZENA 1KGWA 7TAAA 4HZ6A 3EYPA 2X2YA 1QNRA 3VMPA 4AEEA 1JDCA 3UESA 3ARXA 2EPLX 1EO7A 1PBGA 1WDPA 3AROA 2CESA 3CGTA 3OG2A 1CZ1A 2GVYA 5BXTA 2CHNA 3N12A 1GOKA 3LPOA 3AS1A 4Z2LA 2WK2A 5IFTA 3CH9A 4UQCA 1ZB5A 4OJYA 2WAGA 3RCNA 1QI5A 2Z1SA 2VZUA 4OUEA 5E09A 3DC0A 1GONA 2O92A 2BNJA 4K68A 5DT7A 4GINA 2WHLA 2XTKA 5BYWA 1H2JA 4W86A 1YHTA 4AMCA 4W7WA 4UFHA 3CBWA 4R27A 3MMUA 3GNOA 3UR7A 4MDPA 4CD7A 1HJSA 2JF6A 1W9VA 3ARUA 1ZBKA 3SCSA 2DGAA 1UWIA 5A6LA 3L2MA 4UOZA 3WNKA 1VJZA 4H2CA 4D6FA 3WF4A 2ZUUA 1BLIA 5EBAA 1G9HA 1WZKA 3W28A 5ABGA 2C8NA 3K4DA 4GPNA 4KWUA 1JYVA 1E6SM 4GI9A 4ZXOA 3ALFA 2OYLA 1V0MA 1UUQA 2QHAA 1DTUA 1H0IA 1F4AA 1HKJA 1CXFA 3PZNA 1NOUA 4KGJA 1B2YA 5LA2A 3AIUA 3N9KA 1ECEA 1U33A 4F9JA 5LA0A 3AS2A 3VDHA 1E15A 2V3GA 2FH8A 2TAAA 1F4HA 2BHZA 2HISA 1ODZA 3K8MA 4GZEA 3AHZA 1V3JA 4LYPA 2PWHA 4A3YA 1EQPA 1S46A 4MB1A 1US2A 4F79A 2VVSA 1B3VA 2XVLA 4JFVA 1ZBCA 4HPGA 3RILA 2VOTA 3A47A 1FHLA 1PZ3A 2G3IA 3AZTA 3WN6A 2WMKA 1VFUA 5CXPA 2NSXA 2DT1A 4CN4A 2VQUA 1B9ZA 1BYDA 4FLQA 5DMYA 4U2ZA 4QLJA 1B3XA 1QHPA 1IZKA 5CLTA 1Q6GA 4S3JA 1UD5A 2YDRA 3VGHA 3CZ8A 1QNSA 5GNYA 3HJEA 1W3JA 1ISXA 2FHFA 1OM0A 4YHGA 2J7GA 2VMFA 3ARTA 1UWQA 2ZXAA 4IPLA 1WO2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5FJU A;  4O0Z A;  2EF9 A;  2VUY A;  1TPB 1;  5A69 A;  4RE0 A;  1PBK A;  2ZFA A;  4S39 A;  1JPD X;  1MW0 A;  1SMA A;  4GI4 A;  1EGV A;  3QW3 A;  1IF2 A;  3LY0 A;  1KQZ A;  1ISV A;  1KM3 A;  2OR2 A;  2YCL B;  4UQB A;  3UYI A;  2DSV A;  4GUG A;  3QV9 A;  3OGV A;  1FH8 A;  3RGT A;  2IKH A;  3LSB A;  1YEY A;  3IAC A;  4ODN A;  4DNM A;  3G6L A;  3H26 A;  4O8R A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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