4DWSA

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
543
structure length
526
Chain Sequence
GAVPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEKIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADETIDMGPLYNPGEIYLSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 186
structure length 526
sequence length 543
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsA02
3WQ8A 1JI2A 5DT5A 1EO7A 3BSGA 3IJ9A 3LPFA 4D72A 2XWDA 1V3IA 4PYSA 2WMHA 3EDDA 2W91A 1UH2A 1OWQA 1JZ4A 4P7NA 3NSNA 4M29A 4HOZA 2YL8A 3ARYA 3NCOA 4D6FA 1NARA 1XGZA 5HPCA 2XHYA 1MXDA 4AZIA 1X6LA 1E56A 4JCMA 3LPOA 2D0HA 2OWXA 3MUAA 3L4WA 1XH0A 3RJYA 1UKQA 2CKRA 3GM8A 3AMKA 5E6YA 3BAIA 3D3AA 5D9NA 4DUWA 1C8YA 4U2ZA 4CD6A 4D6EA 4U3AA 2ZUVA 1XH2A 5LYRA 4UQ9A 4QLJA 2XYLA 4R27A 4XV0A 4B16A 4MAVA 2XSAA 3CHEA 1PIFA 1US2A 4WSKA 1GPFA 4Z2JA 4A3HA 3VM5A 3N12A 5FIPA 4F9JA 1XCXA 3W29A 1UD3A 2WMIA 4CCEA 2AOSA 1QOXA 1NOFA 1M7XA 2NSXA 1L0PA 4X9YA 3EDEA 2E9LA 1F4HA 4C7GA 1XSKA 2DSKA 3SCOA 5HBFA 4MB3A 3WL1A 3OZPA 3W25A 4JFTA 4ATLA 4PSRA 4KWUA 3W26A 4MB4A 4AZHA 5FL1A 3CLWA 4JFSA 1HT6A 3MKKA 3CZ8A 4UQEA 3ARQA 3RO8A 1OIFA 1QW9A 1TUXA 1VEMA 3UEQA 4JFUA 4AZ6A 3EDJA 4NRSA 2ZWZA 4ZENA 4U3CA 2ZUUA 2ZX8A 4BF7A 4W7VA 5CLTA 2ZX5A 1W9DM 2D22A 4H8HA 1J10A 1ZB5A 1GOIA 2WZEA 5IHSA 4NRRA 4JL2A 4W8AA 1IT0A 2XIBA 3VNZA 5AC4A 5D8ZA 2GJRA 4LYRA 2O9OA 2EPKX 1GNXA 4ZXOA 5A8NA 4UFIA 1OIMA 3VIMA 2JALA 2VX4A 1W1YA 3BAJA 3L4YA 1Q6FA 2WKGA 4M81A 4TTGA 2WZIA 5A6BD 2WW5A 5M17A 1JL8A 3ECQA 2VZTA 1VBUA 4MNMA 1LG2A 3DC0A 1J0KA 5ABFB 1PZ3A 3AROA 4XB3A 1E4LA 3WEMA 3SUVA 1MW0A 2WMKA 4FF5A 4AD0A 1EA9C 3VUPA 1G9HA 4ATDA 4W7UA 3ZR5A 1VEPA 5EBAA 1J0YA 1DWJM 2E9MA 3PZGA 4ACZB 1P6WA 3AYRA 4FK9A 2JEPA 3AQUA 4FLRA 1OT2A 4LYPA 4Z2IA 4CKQA 4AY1A 3OA5A 1TVPA 3PZNA 2BHZA 1KQZA 2E4TA 1QNSA 1A47A 2XJ7A 3WN6A 1XYZA 3ZM8A 3TTYA 3AIRA 3CPUA 2WB5A 4M80A 3B9AA 1LLOA 3T2QA 2UY4A 4H04A 4DWSA 3GXIA 4MJ2A 1FFQA 2J79A 1KFWA 3L4TA 2VCCA 5FOOA 1NQ6A 1V0NA 3ZT5A 5ABEA 2ZICA 2VRJA 3BGAA 4AZCB 3N15A 4YHEA 1CTNA 1IZJA 2VCBA 1W9VA 1B3ZA 1TR1A 3WF0A 4GI6A 2WHKA 1BYDA 2WVUA 3VMOA 4JFVA 4UFJA 1UKSA 3N13A 1JZ6A 3FW6A 1C8XA 2EPNA 1VBRA 1G1YA 3T09A 2PBGA 3SUTA 3CHFA 1UZ1A 2ZXBA 2WSPA 2J7GA 3BSHA 2O9RA 3BLPX 4M82A 1BPLB 1BYAA 2IXVA 3APGA 4BQ2A 1UD5A 4OOUA 2ZE0A 4TX6A 1NM9A 2J47A 4KGLA 3VDCA 3OZOA 4KRUA 1G01A 3CUFA 2Y2WA 2WM0A 5JBEA 3RDKA 2VURA 5JIPA 4KMQA 2DDXA 1W9PA 1J12A 2A3CA 4FLOA 4H2CA 1PEZA 1ESWA 5A1AA 2J75A 4J3UA 3VVGA 4HU0A 4GQRA 3N18A 3AFBA 3F5KA 3FN9A 1E71M 4B15A 1VIWA 1KQYA 1QI0A 3RIKA 1PBGA 1V0LA 2E8YA 2W5FA 4JZ5A 3A4XA 3RJXA 3OLDA 1U2YA 3AHTA 1JGIA 1HL9A 1HKIA 4OZOA 1ISWA 4WLCA 2ZUMA 4N0RA 2UY2A 3ZIZA 4MPKA 4DM1A 5LA2A 2BVDA 2CBVA 4GO8A 3OBAA 4J3SA 1TMQA 2WMIB 3W6LA 3WEOA 3E1F1 4W88A 3L4UA 4LXFA 4UZUA 1KXHA 4EE9A 5I23A 1GCYA 1EOMA 3WBEA 2VI0A 4PMDA 4HPGA 3WENA 1MXGA 4UOJA 3II1A 4A3YA 1JXJA 4QFUA 2XFYA 3VNYA 4Z2KA 1HJQA 3M7SA 4PMOA 1UKTA 1O6IA 2JF7A 3HMCA 4UQCA 2DIJA 4GPNA 1SMAA 2DH3A 3QHNA 2OYMA 3WH9A 5BYWA 4QLLA 2GJXB 5GNXA 2C7FA 1PJ9A 5LA1A 3WSUA 4AIOA 1FHLA 3B8SA 4AZ7A 5M03A 1GOMA 1R87A 1JYVA 3AS3A 5GQBA 4B9YA 2VZUA 1QBAA 3DHPA 2CHOA 3L2MA 3S2CA 1LWHA 4HOWA 1BSIA 3GXDA 1UR1A 4Z2GA 5E09A 3VGFA 4XZBA 1PX8A 2FGLA 3L4ZA 5BXPA 1ZJBA 3ZJKA 2VZOA 3VGEA 2QLYA 3ZSTA 4A4AA 3WF3A 4HA1A 3HU7A 4P7LA 2PI6A 4CD4A 1UR2A 1CLVA 1R86A 4CN1A 4S3JA 3WUFA 1XH1A 4W5UA 1VF8A 3OLIA 3MUIA 3CBWA 5GPRA 3VIGA 1R7OA 3EBVA 1OINA 2BY0A 5CSUA 1XCWA 5BCAA 1GVYA 3AXHA 3TP4A 3ZQ9A 2D0FA 3AS1A 1C93A 2W61A 1W9UA 3CMJA 5C8BB 1Q6DA 3AZTA 4MB5A 1XD0A 4JKLA 4P8UA 3KEHA 1ZJAA 3WFLA 1E6NA 4PMZA 4UFHA 4J7RA 2DSWA 1HL8A 3AI0A 4CU6A 4FLQA 7CGTA 1K9TA 1PIGA 1BG4A 1H11A 2F61A 4BQ3A 3QOKA 1CENA 2ESCA 4PMQA 3OGSA 3UERA 1JZ7A 3PTKA 1B1YA 1DWFM 3BAKA 1M53A 2WZHA 1MQPA 4W8LA 5AYIA 1KR1A 1HJWA 4AEEA 1OGBA 4PN2A 1OGGA 3IAQA 1C91A 4DWSB 1UQYA 3SCQA 3WNNA 4M24A 4AYSA 1BFNA 2W63A 3OLEA 5IFPA 3U57A 1UHVA 3K8LA 4J28A 3AXIA 4GI9A 4IISA 1GQJA 1GORA 1VJZA 2DGAA 3K1DA 3MU7A 2OSWA 3AHXA 5A6AA 1K6AA 4W84A 3WF1A 3RCNA 5KEZA 4C7DA 2CKSA 3BXWA 1HJUA 1PAMA 3ZT7A 1J18A 2WVVA 2V3GA 3T2OA 2WBGA 4U5IA 2QMJA 1D3CA 3GYCA 2DQXA 3NUKA 1UH3A 3WD3A 5CLWA 1UUQA 4H8VA 4WKAA 1GONA 4QCFA 4ATWA 1HF6A 1WZAA 5CGMA 3AIEA 1E15A 2OSYA 3WNMA 3UR7A 3UETA 4U2YA 4HPHA 3M46A 1NWRA 2CIPA 2PB1A 1CEOA 4V27A 2Y8VA 3NSXA 5A69A 1Y7VA 1MVYA 4WSJA 2VC9A 3QGVA 4B3LA 4J3VA 3WDPP 4GZJA 1E6SM 1JF6A 1FP9A 4GZIA 4UR9A 2YA2A 1TFVA 3I3DA 4UQBA 3THCA 3PZVA 2DPEA 3I3BA 5AY7A 5D8WA 1HXJA 4DWSD 1CGUA 4DUVA 2J78A 5HXMA 3K4DA 4TVCA 3GBDA 1HN1A 1KCLA 2XGIA 2V3FA 3WH5A 1J0JA 4W8BA 3RM8A 1EQPA 1FH8A 4MNKA 2G8ZA 3CIVA 1QI4A 3MUZ1 3U7BA 5A2BA 5F7UA 2XIIA 5IFTA 2WVSA 4AW7A 3A4AA 3W82A 1XYFA 4U31A 3SCRA 4AMCA 3POCA 1UR0A 1VAHA 3W24A 2OLHA 1QI3A 1G94A 4E8CA 1BVNP 2J7BA 4MNLA 3D5HA 3ZOAA 2YOCA 4RL3A 3PZUA 2WNWA 1JIBA 1HP4A 1WNOA 1B3VA 2UY3A 2EXOA 2Y5EA 3VTRA 2VMFA 2OSXA 5I3DA 1W1TA 2VNCA 3BAXA 3IJ7A 3L2LA 1QW8A 4JCLA 1OSEA 3VO0A 1I1WA 1WAWA 3AHZA 1M03A 3TTSA 1GOWA 1UQZA 1OD0A 2D3NA 3BC9A 1JZ2A 2ZX9A 1W1PA 3THDA 4NF7A 3WMSA 3ZSSA 4ZE5A 3PTMA 2J77A 1XSIA 4AZGA 3K8KA 4ZXLA 4HMCA 3WNPA 2XFRA 3ARZA 1C3FA 8CGTA 2DSUA 1WDSA 1FH7A 1UZ4A 1HNYA 3UESA 1WPCA 4HU8A 2QHAA 2A3AA 1HP5A 4BCEA 3WH6A 1CXEA 5DF0A 1D2KA 4KRTA 1FFRA 1H5VA 4UQDA 4NI3A 3CH9A 4GI8A 1E4IA 3CUHA 3VGDA 3VX0A 1VJSA 1DTUA 1E1EA 4PMVA 3RMEA 1DEDA 4M1RA 3VD5A 3CHCA 3W37A 1V0MA 1EDQA 1I75A 4L4PA 4CCDA 5GNYA 2DT2A 1J9YA 4OKDA 1IV8A 5IDIA 4JAWA 5E6ZA 3PZ9A 4J27A 1EDGA 4MTVA 3VX1A 2QV4A 5E9AA 2VO5A 4P8XA 1BQCA 4P7QA 2C0HA 2E9BA 4W85A 1GQIA 2EPOA 1FOBA 1QHOA 5I6SA 3SEPA 5EMYA 3WY1A 1E0VA 1ZS2A 3ZT6A 2VX5A 1JAKA 4MDPA 1KWKA 3VD4A 4PMRA 1Q6CA 2G4FA 2CYGA 1R85A 1CGYA 1M04A 3MANA 1CIUA 1E72M 1KXTA 2NT0A 2WVVB 4QLKA 1WDPA 2XVLA 4IM4A 4PEEA 1X6NA 3VD7A 3SCSA 4HZ8A 2E40A 1EDTA 1EH9A 2EEXA 1E1FA 1VENA 4YPJA 4GKLA 1PX4A 1ISXA 3ZJ7A 2QPUA 2BY1A 4XUYA 1B0IA 2PWFA 2X09A 5AYBA 5EFDA 2G3MA 2VQTA 1VFOA 1XV8A 4CU7A 5HNNA 4MNJA 1GW1A 3WNKA 1W3LA 4WF7A 3ARPA 3OB8A 2D24A 4CD5A 1V3MA 5KZ6A 3F5LA 1OB0A 3KL0A 3VMPA 1LJYA 3WD0A 2JIEA 1C90A 3GNOA 1GHSA 3M07A 3NDYA 2V3EA 1WZLA 4F79A 4HZ7A 3SUUA 2FDMA 4XX6A 4LQ1A 1HVQA 1ZBCA 3U5YA 2V3DA 3W27A 1TA3B 1U30A 2WXDM 3GZAA 5FL0A 5A6MA 3EMQA 2J62A 3CO4A 1UR4A 4PCTA 3VU2A 1SMDA 3NDZA 4UFLA 2VUYA 3IK2A 2CBJA 2QMKA 3AYSA 2ZUWA 1EOKA 1W32A 1NWUA 5JIWA 3EYPA 1PX3A 1H4PA 6A3HA 1UR9A 2XG9A 3SCNA 2WMGA 1H1NA 4L4OA 5A8PA 2JIWA 4AD1A 3HJEA 1BHGA 2UWFA 1H3GA 2BY2A 1E55A 2BVTA 3W0KA 1E4NA 2DSZA 4D1JA 2W66A 5C71A 3VIOA 1KB3A 4MDOA 1ISYA 3AHVA 1QBBA 5A94A 2F2HA 5EFFA 2XFFA 2VZVA 2J8FA 3PZOA 2ZX6A 1KXVA 2J7EA 1BYCA 4UFMA 3PN8A 5I2UA 1V6XA 4D1IA 1DWAM 3WNOA 1UWIA 3ARVA 4X0NA 1E40A 1ODUA 5D4YA 2JFEX 3ZJ8A 2V5CA 5FCZA 4Q22A 2ZUTA 4PMUA 3WDQA 2GFTA 3EDKA 3WQ4A 3OGVA 3WDRA 1E4MM 2Q8XA 1E9LA 2WSKA 1BF2A 3W6MA 3WDIA 4E2OA 3N11A 2YA0A 4D6GA 5A8MA 2BS9A 2PWDA 4AZ5A 4GIAA 1GQLA 1V6WA 1WCGA 4QCEA 2CNCA 1WDQA 4GO9A 1CECA 1B3WA 2RGLA 2G3IA 1MFVA 4GZEA 4RE3A 1C92A 1NOWA 4Z2LA 2VZSA 2FGZA 2WANA 3W81A 1AQ0A 3AS0A 2WLYA 5A6LA 1KXQA 1V02A 1B3YA 1UD4A 3UG5A 3VGGA 1HJSA 2YKKA 1JF5A 1Q6EA 3VD3A 3N9KA 2EO7A 3CHDA 5DO8A 3KWXA 1UG6A 5BWFA 3ALFA 2PC8A 2UY5A 1C7TA 5CPTA 1V0KA 3SCVA 5ABGA 5JUVA 1OD8A 1YHTA 5D9MA 3POHA 2ZUNA 1FP8A 3WL0A 1ECEA 3A6OA 2GVYA 1LL4A 1GHRA 1HX0A 1JZ5A 1OGSA 3GBEA 1BGGA 1UD8A 2CETA 3LMYA 1FH9A 2WC3A 4HA3A 1JZ3A 1J0ZA 4OOZA 3VIPA 5BXSA 2IXUA 3OG2A 4GQQA 5FKYA 1UWTA 4AZBA 2DSVA 1BLIA 3QHMA 4CD7A 3W38A 1IZKA 3IAPA 4ZE4A 5A6KA 2BHYA 5TD4A 3IJ8A 3O9NA 1JFXA 1Z32X 4EAMA 3A3HA 2VQUA 2NT1A 3AJ7A 1AMYA 1E3XA 2YLAA 3VIKA 1MQQA 2WMFA 1MFUA 4W86A 3N17A 3CZGA 3PBGA 2HVMA 3WD4A 2CITA 1TCMA 4YHGA 4LYQA 1KBKA 2CEQA 4TX8A 1MWOA 3O6AA 4TXEA 4F9DA 4PRWA 2QPSA 3WD1A 1CLXA 3SUSA 2G41A 1J0HA 2BHUA 1G5AA 1GOQA 2HISA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3FAP A;  2YCJ A;  2GJL A;  1TJR A;  4JQA A;  3WUG A;  4F2U A;  3NTY A;  1ZJI A;  3WQP A;  1MI3 A;  1US0 A;  1UD6 A;  1E0U A;  1LG1 A;  3T0D A;  4AWE A;  3PFR A;  2R1P A;  1TO3 A;  4QAW A;  1VBH A;  4QAI A;  2E6A A;  3S1W A;  1I0B A;  4M56 A;  1GYM A;  3DC8 A;  4WJX A;  1Z9A A;  4V2X A;  4ZOC A;  2OKT A;  3MV0 1;  4W93 A;  2ZID A;  4HMD A;  4IG2 B;  2QCD A;  3RXZ A;  2XP8 A;  1DE5 A;  3VKD A;  3LMZ A;  2XSB A;  3W1X A;  4N19 A;  2CER A;  3VGH A;  4UTK A;  2Z2B A;  4DBE A;  3UPM A;  2GL5 A;  1R2S A;  2DT1 A;  3ISI X;  3SCP A;  2V8Z A;  2QJN A;  1RLD A;  5M1T A;  1ZPT A;  1YQ2 A;  3GXF A;  2KO7 A;  1TPC 1;  1UML A;  3A47 A;  4HYR A;  4S38 A;  2JK2 A;  4PUJ A;  3G6M A;  2AQV A;  3O2L A;  1R3R A;  3P84 A;  1TV4 A;  1A0C A;  1TWS A;  1UWR A;  2XU2 A;  2YFO A;  3UXK A;  3RYS A;  4GXP A;  5FF0 A;  4TW7 A;  1ZP3 A;  4LGX A;  2D23 A;  3DFT A;  3P80 A;  3WF2 A;  4L6H A;  2D73 A;  2PZ0 A;  3FVD A;  2X0Y A;  1UWU A;  4MZY A;  3FND A;  1QK2 A;  3PR9 A;  4GFI A;  4PEK A;  2VDH A;  1KCK A;  3NDO A;  1TA3 A;  2A85 A;  3BMX A;  3RX4 A;  4BF9 A;  1B3X A;  2BFG A;  1N82 A;  4D6C A;  2Q8Z A;  2OLS A;  2ZDR A;  2VRK A;  3KVL A;  3PA7 A;  3E0L A;  4QX4 A;  2J7H A;  1UIP A;  2PWG A;  3GXM A;  2V38 A;  1NIU A;  4FNQ A;  1WKD A;  4AB4 A;  3C2F A;  3C86 A;  5I3G A;  1H09 A;  1OM0 A;  4N9B A;  4FX8 A;  1NFG A;  3IUH A;  4QRN A;  4R34 A;  3I7R A;  3LTS A;  1JG9 A;  1SUX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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