4DWSA

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
543
structure length
526
Chain Sequence
GAVPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEKIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADETIDMGPLYNPGEIYLSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 186
structure length 526
sequence length 543
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsA02
3AIUA 1RPKA 5CJ5A 2WZEA 3UG5A 4AZBA 1V3MA 3ZSTA 3WDHA 2BNJA 2WLYA 2XTKA 3ZSSA 4CD6A 4BA0A 2ZOXA 1G9HA 4QLKA 3AI0A 4QLJA 1B31A 3VIKA 3CHDA 1XSKA 2Z1KA 3SCQA 3BSHA 4ML4A 4W5UA 1FP8A 2BHYA 4DUWA 2QHAA 5A2AA 1MFVA 3AZTA 1WDPA 4D6HA 1V3KA 1V03A 3VIFA 1V3LA 5GNXA 3T0AA 1JDAA 1FA2A 1M53A 3EYPA 2WKGA 1OGGA 3FY1A 4GI6A 3NSNA 2XVNA 4PMXA 3W6LA 1E5NA 3ZJKA 5AC5A 1PPIA 1XRVA 3AMGA 1KGXA 3FW6A 3RM8A 5CPTA 1W32A 3QGVA 1JGIA 3KE0A 4AZ6A 1UD6A 1MQRA 1KQZA 3LPPA 1UWTA 3FAXA 1NOUA 4D6EA 3WD4A 2ZXBA 1ISZA 1R87A 2XFYA 4AW7A 2EPNA 1JG9A 2VNCA 3CZKA 3NSMA 1HKJA 1DEDA 2DT0A 5A6BD 1TG7A 2WMIB 2G41A 2XG9A 4GI8A 3CTTA 4AIEA 2NSXA 1E15A 5CXPA 1B3ZA 2D0GA 4Z2IA 1GOOA 2CIPA 3UESA 3M46A 2WKLA 1CECA 1JFXA 1QVBA 2UY2A 1W9UA 3RM9A 4MAVA 4M80A 3LPGA 1NM9A 2G4FA 3AOFA 2DSKA 5FIPA 4NF7A 5ABFA 3RJXA 4UOQA 3WQWA 3I3DA 3VD3A 1XH2A 1OWQA 4R27A 3KZSA 1HJQA 3M6DA 3OLDA 4FLSA 2CBIA 4CD4A 1EO7A 1FH9A 3VIPA 3VNYA 1JD7A 4FK9A 4Z2JA 4P8VA 3QHOA 1E6XM 1E6SM 3ZJ7A 4AD5A 2WAGA 3A4AA 3WDJA 5CGMA 1QI2A 1GVYA 3CZLA 4PMYA 1JF5A 4M82A 4KGJA 3IJ8A 2W91A 1E5JA 1NQ6A 1QPKA 2D2OA 3WQ6A 5A3HA 5HXMA 2DH3A 3J7HA 3KL0A 2GSJA 3UETA 1B0IA 1L0PA 3VGEA 2PBGA 4C7GA 4X0NA 2W4XA 1TZ7A 2WMGA 4UQEA 2OYKA 3BCDA 3W25A 4AMCA 2V3FA 3L4UA 5BRQA 3WENA 2YKKA 3CPUA 5A6SA 3W29A 2UY4A 1UH4A 2GDUA 2D22A 5BROA 5D8WA 3BAIA 4TVCA 1MYRA 4NRSA 3ARXA 2J62A 4LYPA 1VAHA 3HU7A 1W2VA 2F8QA 2VMFA 4HA4A 4UQBA 3AIVA 2WM0A 4RE3A 1OGBA 1R85A 5I6SA 3OG2A 1GCYA 3WL0A 3CO4A 1KCKA 1ZJAA 3SCPA 4U3AA 1LWJA 5DT7A 3WELA 2J25A 3NUKA 3WF4A 1BYCA 1K9FA 3KL3A 3U57A 1EGZA 2GUYA 2GFTA 3CUIA 5JBDA 3CZJA 5HPOA 2PWDA 4D6CA 1PX4A 4BZYA 5IFTA 4FLOA 4EAMA 4HU8A 3E1F1 5IXEA 4AZ5A 3SIMA 4H2CA 3K4AA 4P8XA 3W6MA 3CHFA 1KXQA 1H5VA 3RPMA 5D4YA 2X0HA 2XSBA 1U30A 2DIEA 2GK1A 3RM4A 1W3KA 4AEFA 1OD8A 1ODZA 1QNSA 1DHKA 3T2QA 3GH5A 2GVYA 3WD1A 4UFLA 2O9OA 1ECEA 1FH8A 3EMCA 3FAWA 1JI1A 5C8BB 1GHRA 3WH9A 2D3LA 1PBGA 3U5YA 1HXJA 3O2LA 4OOZA 1B90A 1KCLA 5A6JA 1LG2A 1B2YA 2AOSA 4HZ8A 4CGTA 5A2CA 4UNIA 3BAJA 3QOMA 1H49A 4RE4A 4PTWA 1ISVA 1W3HA 3KWXA 4J3UA 2X09A 2EXOA 1PIGA 4QCFA 2CESA 2XGBA 4ACZA 3VD9A 1B3VA 4JAWA 1JI2A 1HJVA 5I0DA 5A6BA 3PZOA 3BXWA 1OM0A 2PB1A 3BGAA 3EDFA 3POCA 4DWSC 3DC0A 4M8UA 2G3JA 4LGXA 2BXYA 4C7DA 2ESCA 1JZ2A 1QHOA 1QNRA 1CLVA 4MB4A 4HZ6A 3NJ3A 5A2BA 1KR0A 2CBJA 4V28A 2JEPA 2WWDA 2UY3A 3AZSA 4PMZA 2J78A 4V27A 2XM1A 3BLPX 2BY1A 2E9LA 2VVSA 4B16A 1EHAA 2CHOA 4FLRA 3OBAA 4URIA 3THCA 2VQTA 4JFSA 1UWIA 3FNDA 1KGWA 3GNRA 3PZQA 1CYGA 2Z1SA 2CKSA 4DM1A 1E6NA 1E9LA 1B1YA 1JYXA 2GJRA 1CXKA 3VMNA 2WVSA 3AMKA 1ZBCA 1JXKA 1WZMA 1DWAM 4PCTA 2CXGA 4JFTA 4UOZA 4PMUA 3UG4A 1M04A 3U7VA 4U33A 2E9BA 4NI3A 4QP0A 2WK2A 3A4XA 4AWEA 2ZXAA 2Y2WA 1LG1A 5M03A 5F7UA 3TA9A 1Y7VA 1V3IA 4A3YA 2QV4A 3GXMA 2WHJA 3F4VA 1QI3A 1MVYA 3QHNA 3N18A 4MB3A 3EDDA 4D71A 5LA1A 2BVDA 2QMJA 2VTFA 3SCRA 1BYBA 1NWSA 3WKZA 1JZ6A 4NSBA 1J0JA 2W5FA 3WNPA 2Y24A 3K1DA 1W1PA 2WHLA 5EMYA 3WL1A 2WWCA 3SUWA 3AS0A 1ZBVA 4GQQA 2XVGA 1V02A 1EH9A 3BAYA 4W7WA 1XSJA 2ZUTA 4HZ7A 2J75A 3VIMA 2YL9A 2D23A 1JF6A 3KL5A 4M56A 1C8XA 4QLLA 3OGRA 1XYZA 2DPEA 1QNQA 4RL3A 1E6ZA 1WDSA 2EEXA 1CENA 3BMWA 3AIEA 3K4DA 3AXHA 1FHDA 1HJSA 1NWTA 5JUVA 4XB3A 4MAZA 1UA7A 3AROA 3SCTA 2DT2A 3F5LA 3EMZA 1E6RA 3MUAA 4J28A 5ABFB 3WQ5A 4H04A 1W1VA 3VIIA 2VZUA 3VVGA 1J0IA 2Q8XA 2O92A 1UR8A 1XSIA 3ZT5A 1GOIA 1UKPA 2TAAA 1BYAA 1FP9A 2VVNA 3BAKA 1VIWA 4HA3A 5E70A 2O9TA 3D5HA 1MW0A 4GI9A 1NWRA 2QF8A 3GH7A 2F61A 5JH8A 3U7BA 2VX5A 5DMYA 2QPSA 4J27A 1TR1A 3WDIA 3GH4A 2BY2A 4PCSA 1OB0A 1EDTA 1KWGA 2XSAA 1VFMA 1JZ4A 1KQYA 3GXFA 4S3KA 3WNKA 2YL6A 1VF8A 3APGA 5A6LA 2YOCA 4UFJA 4UFKA 4CCEA 1MW2A 3JUGA 3SCSA 4NZCA 1Z32X 3WFLA 3WUGA 3MU7A 1GPFA 1V6XA 3AMLA 3BSGA 1US2A 3WEMA 4ZENA 2WVTA 4M81A 1GVIA 2WBGA 2YDRA 3VD7A 3L4TA 2QPUA 1VBUA 2HISA 5DFAA 4ZEPA 4GZEA 4BQ2A 1UD5A 3TTOA 1GJWA 2QMKA 2Y4SA 3AIWA 5ABEA 2WW5A 5CPQA 3VD4A 4HPHA 4MNMA 2XIBA 1WZLA 2EJ1A 1V6YA 1J01A 5AYIA 3WUFA 1KGUA 1UA3A 1VB9A 3AZRA 3W82A 4JFWA 3AS1A 1EOKA 1V3HA 4PSRA 4B3KA 1W9BM 1Q6EA 2MANA 1PZ3A 5A94A 4WKFA 2J4GA 2W61A 1SMAA 3MMDA 4UQ9A 5LYRA 2V3DA 2A3AA 3ARZA 1C8QA 3AS2A 4ATWA 3GNOA 2CNCA 4DM2A 3GM8A 4H8VA 4N0RA 3TP4A 1OT1A 1E4MM 4L4PA 1VEMA 4PMDA 4YHGA 4YN5A 4BS0A 2PC8A 3DYPA 2GK1B 2WVVB 4HOWA 3PTQA 3CGTA 3ZQ9A 2WMKA 1LJYA 2ZIDA 1GQLA 1G1YA 2YDSA 2VX4A 4GZJA 2YDQA 3FHAA 3L4XA 3T2OA 3WNNA 1V02E 4HP5A 3UERA 4AD4A 1K9TA 9CGTA 3SCVA 2VCAA 2C8NA 4D1IA 1W9XA 2ZX8A 2D1ZA 4UFIA 2DT1A 3W27A 2WNWA 1XC6A 1MW1A 2D3NA 1OIFA 1WZAA 1Q4NX 2J7BA 3MV01 2D0HA 1JYWA 4UQCA 4PSPA 4CCCA 1HIZA 2WHMA 1QW8A 2NT0A 4TX6A 2CBVA 4H8UA 4ACZB 3PZ9A 1MQQA 1YQ2A 5KZ6A 2UY5A 4AZ7A 2ZX5A 1S46A 1H1NA 1ITXA 2XWDA 2GJXA 2WMHA 4AIOA 1CGXA 4GO8A 5I3DA 1HX0A 1BVNP 3IK2A 1NP2A 1E71M 2FH6A 2D0FA 3MMWA 4LXFA 2CEQA 1JZ7A 2ZUVA 5AY7A 5CZKA 1HJWA 5GQBA 1GQKA 2FGLA 1NH6A 4TOQA 1ISXA 2J8FA 3DYOA 3UR7A 5ECUA 4AC1X 4F9DA 5IHSA 3VDAA 3KEHA 1GNXA 1R7OA 2VT0A 4OIFA 3VGDA 1QOXA 1G5AA 4WSJA 3ZR6A 1G0CA 3UEQA 5E09A 1CGVA 2VQUA 3PZUA 5IFPA 4OBRA 4OZOA 1QBBA 1SR0A 4AD2A 4U31A 1CZ1A 1W9DM 3MO4A 4PN2A 1O7AA 3VIGA 3RJYA 1CXIA 3W53A 4U3CA 5ABGA 3BC9A 1UR4A 2BVTA 5M17A 4CN1A 1UR9A 2A3HA 3WBAA 3WNLA 2YL8A 3VUPA 2VUYA 1XCXA 3EDEA 1KBKA 1WPCA 4OJYA 3PZGA 1UQZA 1XGZA 3ECQA 2OWCA 1Q6FA 1AQMA 3OGVA 5HBFA 1H4PA 4P7OA 2YLAA 3L4ZA 2WXDM 2XFFA 2W63A 3WY1A 3VDHA 1CDGA 4HA1A 4CVWA 3VGFA 1E1FA 4E4PA 1BGAA 4XZBA 4CD7A 4W87A 1UZ1A 3GZAA 4PYSA 2ZE0A 3L4YA 4EE9A 1DWGM 5C70A 3ARRA 1KB3A 3ZOAA 1BYDA 4UFHA 4W7VA 3WQVA 4FMVA 5FOOA 2YJQA 1ODUA 3MMUA 3FXYA 5JIWA 2WSKA 1FOBA 4IM4A 1H09A 2YIHA 3CUFA 2FGZA 1BQCA 4D72A 1HP4A 3VINA 1B30A 3EMQA 3AMCA 2WVVA 2XYLA 3WFZA 3WH6A 1MXDA 2C7FA 2E8YA 2Y5EA 3CLWA 4N42A 5DEZA 1ZL1A 1DWHM 1HL9A 3AHXA 4D6IA 3A4WA 3WF2A 2GJPA 2CERA 2ZX7A 4JKKA 2YA2A 1FH7A 1NP0A 1K9EA 3AIRA 2JIWA 2ZUSA 2ZUUA 2J7DA 3W28A 3RDKA 3S6TA 3VX1A 1UD2A 1F4AA 1W3JA 4JFUA 5JBEA 4TUFA 3G6LA 5EB8A 4MJ2A 3RCNA 6A3HA 3W24A 1HN1A 1NWUA 2V3EA 1ZB5A 2VCBA 4GIAA 1XHGA 3SCWA 3MSGA 3QOKA 5E6YA 4HOZA 5CLTA 5CSYA 2FDMA 3MANA 3RO8A 4H8HA 1BF2A 5CPSA 1US3A 1H11A 3AHZA 2VRJA 3AISA 3IJ9A 4MNKA 4PTVA 1SFSA 1BG4A 3VGGA 4JIEA 5E9AA 1A47A 3SCNA 5I24A 4S3JA 1OIMA 2JF7A 2E40A 3A3HA 3WSUA 2WSPA 3BCFA 1WE5A 4YHEA 2PI6A 3MUY1 4CD5A 1L8NA 1UD3A 3DYMA 2ZXQA 1J9YA 5FL0A 1NOWA 3WEOA 1HVQA 2V5CA 4X0VA 2WMFA 1FFQA 1W9VA 1JAEA 1GOWA 3NCOA 3VIOA 4AD3A 3QR3A 4AXNA 4UZUA 3SCUA 3AYRA 3WD2A 3N13A 2VI0A 1G01A 1C90A 1GONA 3CUHA 3ZJ6A 1D2KA 2PBOA 1EDGA 4JZ5A 2XJ7A 5D8ZA 4TVUA 1M7XA 5A8NA 4WJXA 1VEPA 2EQDA 2G3NA 4AD0A 3EDKA 5I78A 4MB1A 3MKKA 2ZX6A 2V5DA 3WH5A 1H41A 2VURA 2E9MA 2EPMX 3ZT7A 3WIJA 3NDYA 3NDZA 3VGBA 4XUYA 1OINA 1HJUA 1IZJA 2CITA 3TONA 4PTXA 2GDVA 2OSXA 4LYRA 2O9RA 1V6WA 1VFFA 3VM5A 2ZWZA 3PBGA 1GJUA 1W91A 2JF6A 2XHYA 3VILA 4B9YA 3W4RA 2YBUA 3UG3A 3VO0A 4ZE4A 1IT0A 1C91A 4HPGA 2WC3A 4PRWA 3AJ7A 4XZWA 4H41A 4CN6A 1OGSA 2J47A 1QI5A 1J10A 1E0XA 4LPCA 4KRUA 1F4HA 4CUCA 1QNOA 2WZIA 1E55A 4CKQA 5AYBA 5BYWA 4W88A 2VO5A 3RIKA 1PJ9A 4KMQA 1BG9A 5BRPA 3AICA 2DT3A 2ZICA 1BAGA 2J79A 3L4WA 2CETA 1DWIM 4X9YA 1O6IA 1GOKA 1LLOA 3WDRA 3MUZ1 2FHCA 3CHEA 2NW0A 1VFOA 4IPNB 2GJXB 1CLXA 1UZ4A 1HP5A 2VL4A 3PTKA 4CU7A 2BHZA 3DHUA 5I5RA 4PTMA 1E4LA 5IDIA 5A1AA 4AISA 4RE2A 4P7NA 1QI0A 2X1IA 2X2YA 5FKYA 1ZS2A 4XV0A 3OLGA 4PMQA 2VC9A 2UWFA 1E0VA 5FD0A 3M7SA 1GQIA 2XPKA 2EO7A 3L4VA 1ISWA 3LMYA 2VR4A 3TTYA 4KH2A 3ZIZA 4KRTA 3SUTA 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 1RP9 A;  5A8M A;  4M1R A;  2EBN A;  2G8Z A;  3B8S A;  3WEZ A;  1LWH A;  2DIJ A;  3T0D A;  4IPL A;  4U5K A;  1ISY A;  5A6A A;  8CGT A;  1HT6 A;  3PZV A;  1UKO A;  1HVX A;  2QLY A;  4QAW A;  3BAW A;  3N04 A;  4HTY A;  3BAX A;  2J7G A;  5I2U A;  3PZN A;  2XUC A;  3VIJ A;  1TMQ A;  1TA3 B;  1HL8 A;  1UYQ A;  1UKS A;  3B9A A;  1UKQ A;  1KXV A;  1Q6D A;  4GPN A;  4C7F A;  1V08 A;  3VM7 A;  1W3L A;  1C7T A;  1J0K A;  1UR0 A;  2CBU A;  4MDO A;  2VR5 A;  1WAW A;  2ZUN A;  4LYQ A;  5A95 A;  1U33 A;  1AMY A;  2OSW A;  2OSY A;  4DUV A;  4BQ3 A;  5I79 A;  1BHG A;  5BCA A;  4V2X A;  1UKT A;  3T09 A;  4AEE A;  4CD8 A;  3OIH A;  2ZX9 A;  1RD6 A;  1HNY A;  3ZJ8 A;  2VX7 A;  3G6M A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4DF2 A;  3GXP A;  3MB9 A;  2ZRZ A;  5T9C E;  3LYE A;  4NVT A;  3LPG A;  5FIP A;  3R8R A;  4HBE A;  2BLE A;  3KTS A;  4GUJ A;  4H2H A;  2XP6 A;  3VD3 A;  1O12 A;  1XH2 A;  1OWQ A;  1XG3 A;  3H54 A;  3KZS A;  5AHM A;  1MUC A;  3OLD A;  4FLS A;  3DFT A;  1NQK A;  3KHD A;  2E09 A;  3NM3 A;  1KRB C;  4HYV A;  2O4Q A;  5CC6 A;  3JVA A;  4L1G A;  2E25 A;  1V5X A;  3UYC A;  3RFA A;  3M43 A;  3LQG A;  2V5B A;  4AD5 A;  1H50 A;  4QAI A;  1BF6 A;  3JZE A;  3KBN A;  1QO2 A;  3FKK A;  4IPI A;  2KAU C;  4AXK A;  5LSM A;  1NQ6 A;  1OFR A;  1GYN A;  3J7H A;  4NI8 A;  1BRL A;  2GGI A;  4L1X A;  2OQH A;  3WLP A;  2MNT A;  4C7G A;  5HNU A;  5BU9 A;  5AHF A;  1OF6 A;  6ENL A;  3H4W A;  3U0H A;  4LCS A;  4L4M A;  4F4R A;  3CPU A;  4B5N A;  2GOK A;  1KW1 A;  1UH4 A;  2DZW A;  5FF4 A;  1UBS A;  1XLA A;  2JQX A;  1EEX A;  3GVW A;  4XD5 A;  3HU7 A;  1W2V A;  1XRF A;  2PDH A;  5TNV A;  4RE3 A;  3BLI A;  1XM3 A;  3T0T A;  1US0 A;  4QE5 A;  1ZJA A;  2J25 A;  3WCZ A;  3KL3 A;  3U57 A;  4U86 A;  2FMO A;  3CUI A;  5JBD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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