4DWSB

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
540
structure length
527
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 190
structure length 527
sequence length 540
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsB01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsB02
2XVKA 4P8UA 1TVNA 1UR0A 5DF0A 2BFGA 5FD0A 4AIEA 4D6IA 1XH0A 4HA4A 2PBOA 3EMQA 4E2OA 3KEHA 4NSBA 3SCRA 3SEPA 2EEXA 2WWCA 4FLOA 4PEEA 4A3YA 2DDXA 1MVYA 3E1F1 4DUVA 1DEDA 2WMHA 4E8CA 3WNKA 4WK9A 4LYRA 2GJPA 1HP5A 1H2JA 2WWDA 2XIBA 2XJ7A 4W7WA 5DFAA 3PTQA 3W26A 1ZBVA 2C7FA 3BCFA 1F4HA 4GO9A 3NSNA 1JDDA 2XHYA 4ML4A 2CEQA 4AZCB 4ZXLA 2E0PA 3GH4A 3QOKA 3CH9A 1B1YA 5EB8A 1ISXA 5CXPA 2WVSA 2D3LA 4YHGA 5ABHA 3VGFA 1UD4A 5GPRA 1B31A 1J18A 5A1AA 2J7FA 3VDCA 1GOMA 1KCKA 1JYXA 1JYWA 2J74A 1OSEA 3D3AA 5LA1A 4P8VA 4ZEPA 1MW2A 2JE8A 3IJ8A 1HL8A 1R86A 1VFMA 5E70A 4XUYA 1B90A 1LG1A 1U30A 2CESA 4ATDA 1ITXA 3FHQA 6TAAA 3CZEA 1CLXA 4WLCA 2CBIA 3ZMRA 4MAVA 4IPLA 1UA3A 2W4XA 1NH6A 1JZ7A 3EDFA 1ODUA 1HJVA 4B16A 1UWTA 3II1A 5DO8A 4N0RA 1BVZA 3WUEA 4D1IA 1LWHA 1VEMA 4PSPA 3VIGA 1L0PA 3MMUA 5BXSA 3L4UA 4S3KA 1LF1A 2XYLA 3AHYA 3AOFA 1NOFA 1E3ZA 1KGXA 1EIBA 4LXFA 4YHEA 7TAAA 2CIPA 1PEZA 4L4OA 2WMGA 4TTUA 2BY3A 3N04A 1RH9A 2NT0A 4C7GA 1UA7A 4TVCA 3IAPA 3CUFA 3ARPA 3K8MA 3SCQA 2UWFA 4MTVA 1HJQA 3MANA 3RPMA 3HU7A 3VGBA 1Q6CA 1UKTA 1DWGM 3WF4A 3WD3A 1QNQA 1E6RA 1W2PA 1E6QM 3BAIA 3PZUA 2OWXA 4AZHA 1K9TA 1NWRA 3CUGA 3G6LA 2EPOA 3VNZA 5BWFA 3AMKA 1CBGA 1QNOA 3BMWA 5AC4A 1VENA 4PMQA 2W67A 2CETA 2CNCA 5CG0A 2DSVA 1ISYA 4DWSC 4H8VA 3RO8A 1V03A 2G3JA 5IDIA 4PTVA 1UWSA 3DYOA 3B9EA 2W61A 3WDQA 1E43A 1XRVA 4PMUA 3NJ3A 3AS1A 4P7QA 4TVDA 4CN6A 4D6HA 8A3HA 3TOPA 2PWDA 3EDJA 5EFDA 3U5YA 1V0LA 1KFWA 1H11A 4W5ZA 3ZJ6A 1GQKA 3RM9A 3SUSA 2GJXA 3W25A 1UQZA 5A6BA 3MSGA 1KGUA 3CZGA 4Z2KA 4OUEA 4F8XA 2V5CA 1LJYA 4PMRA 2VNCA 3CO4A 1UKSA 4WSKA 3VINA 2UY3A 4J3XA 5A95A 1EO7A 1K9DA 3WH5A 3MSDA 3VIPA 4IUGA 1E1EA 2XFYA 1M03A 3WQ6A 3ZSTA 1E0VA 2XVNA 1E4LA 1C8XA 3VVGA 2VCBA 5CZKA 5D9OA 1X1NA 5ABFA 3WD4A 4C7FA 1W1PA 1C93A 3F5JA 3U57A 4AEEA 5CPTA 3MS8A 2JFEX 2CHNA 3L2MA 2UY2A 3CZLA 2V3FA 1WP6A 3MMDA 4TVUA 3VIIA 2G3NA 3CPUA 2D23A 5IHRA 1DWFM 4EE9A 5M03A 1K6AA 1B3ZA 1ITCA 1CXEA 3FN9A 2WK2A 4W7VA 3AIEA 1W9BM 3N15A 1NOUA 2C0HA 4U31A 4JFWA 4JFTA 2XIIA 4GQRA 4OIFA 1E73M 5DMYA 2WSPA 3CZKA 2GSJA 2W63A 3J7HA 4L4PA 3WN6A 1UKPA 2VZSA 1V02A 3AJ7A 4UFIA 3PTMA 3K4DA 3VGHA 1JYNA 1G0CA 1HXJA 3T2PA 3TTYA 1GOWA 1NWTA 1VEPA 1VJSA 3OLEA 2CXGA 4W84A 1DWAM 2X1IA 5BXTA 3T08A 5A69A 3UESA 3IJ7A 3WDJA 4D6CA 1TR1A 4H2CA 4MADA 1H4PA 1JZ8A 1SFSA 2VVNA 5JBDA 1FH8A 1FP8A 2WMIB 3RJYA 1VBUA 1GHSA 5A8NA 4U5IA 2J25A 1OGSA 2E3ZA 1TA3B 1J12A 3WDHA 1V3JA 3PZOA 4W85A 1WE5A 4W87A 1BYCA 2JIEA 1GPFA 1HKMA 3SCNA 1R7OA 3WQ5A 1JXJA 1HJUA 1KXVA 4PRWA 3RILA 3VX0A 1EGZA 1ZBCA 1CNVA 3RM4A 1RD6A 3L4WA 1HNYA 1BSIA 1UQYA 4RL3A 4JL1A 2PWFA 3SCUA 4P7OA 4XZBA 2QMKA 3KWXA 4EANA 2J77A 2VC9A 3WL1A 3WBEA 3HJEA 1EQPA 3AHVA 2ZX6A 4HA1A 1HL9A 5FIPA 5A6LA 3M07A 2J7HA 4P8XA 1WPCA 4MJ2A 2WHMA 4CCCA 3VGEA 1XD1A 5A6AA 2VMFA 3VIHA 4X0NA 3BAJA 4UFKA 1BG4A 3GXIA 5TD4A 1G1YA 4HMCA 4IISA 1JNEA 1PZ3A 4M81A 3VIMA 2PWEA 3WQWA 1UHVA 3WQ4A 1GONA 2FH6A 2JF7A 3AIRA 5ABEA 4HOXA 2XFRA 2DSZA 3MUY1 1UR9A 3UG5A 4TXEA 3N12A 3VMPA 3CGTA 2DH2A 2WVUA 1F4AA 5HNNA 1UKOA 9CGTA 1QNSA 4PMNA 2BV9A 3ARWA 2DSWA 5AC5A 1VJZA 4JHOA 1US2A 4NI3A 4CCDA 4N42A 5CSUA 2YLAA 3AIUA 3JUGA 2WVVA 3QHOA 5HDRA 2D0FA 4MB5A 4JKMA 3T2OA 1CGVA 2A3CA 2CBJA 1VB9A 4W93A 4DM2A 3K4AA 2BS9A 1MW3A 3RIKA 3VM7A 1DWHM 3UR8A 1Z32X 3WBAA 2FGLA 1EDGA 2Y24A 1FOBA 4Z2JA 2X05A 4CU8A 2BVDA 1V3LA 2DIEA 3TP4A 4MNLA 5DEZA 2X0HA 1E4IA 4U2ZA 3WIJA 4W88A 3WENA 4J28A 2YL6A 3VDHA 3M7SA 4CU6A 2ZUTA 1KCLA 3VMOA 4UOQA 5GQBA 1GVIA 2VX5A 1E40A 1J0HA 1AQHA 2VJXA 3EBVA 4AD0A 3POCA 4UZUA 3KE0A 1E72M 1UH2A 1DWJM 1UYQA 4NRSA 1E3XA 2HVMA 5LYRA 3OGVA 4CU7A 3CIVA 2WW5A 1ZJAA 3W6MA 4UCFA 4D6JA 4M29A 1E4NA 1C91A 2X8RA 3MUIA 3ZQ9A 1H1NA 4AW7A 4PUEA 1WB0A 2J47A 4HZ6A 1GQJA 4PTXA 4V28A 2ZWZA 1BVNP 4F9DA 3FHAA 4AZCA 1NWUA 4CD4A 2J7EA 5HOSA 4OOUA 3SUVA 3U7VA 5BROA 4GZEA 5BYWA 4JKLA 3DYPA 4CD8A 1HJWA 4AY1A 4MB1A 4ATWA 2DT0A 2ZUVA 2WLZA 2W66A 4UFJA 5GNZA 1V0KA 2QHAA 3AIBA 1W3KA 4UQAA 4PMVA 5AY7A 2V3GA 2VZTA 2XTKA 1OD8A 2ZICA 4AD4A 2J7CA 1JI1A 3EDEA 1H0IA 4PMDA 2DPEA 8CGTA 1QNRA 3BSGA 1W9PA 4QLJA 1CTNA 2W62A 3AXHA 4UOZA 3EMZA 1MW0A 3PZQA 3NIYA 4BQ3A 1J0YA 1QHZA 2WAGA 3U7BA 1JFHA 4MJ4A 4AEFA 1QBAA 4M82A 2FHBA 2VZUA 1UD5A 1G9HA 1D2KA 4IPNB 2PWHA 4M8UA 4U5KA 2OYKA 4P7NA 2EBNA 3D5HA 2Y5EA 3ARVA 2BHYA 3QHNA 1BFNA 5JIPA 1H41A 3L4TA 4B9YA 2YBUA 3WMCA 4JZ5A 1E6ZA 5IFPA 3PZ9A 1CECA 3WD1A 1M01A 1JAEA 3AS0A 1JL8A 5E09A 2DT3A 2O92A 4WJXA 4J3UA 4AIUA 5E0CA 1D3CA 3SCSA 1Y7VA 4URIA 5EFFA 3VM5A 5I77A 1V6VA 3ARUA 1XHGA 4P8WA 3WF3A 3GBDA 5A2AA 3SUUA 3WNNA 4FMVA 4Z2LA 1H3GA 4MDOA 2PF0A 5CQ1A 3BLPX 1TVPA 5A2BA 3T0DA 3BCDA 3SCOA 2VRQA 4TX8A 1EHNA 4PN2A 2JIWA 2VZOA 1N82A 3WEZA 1W9XA 1E71M 3PHAA 1V3HA 5EBAA 2AOSA 3AHZA 3W38A 3VX1A 2NSXA 3ZO9A 3W0KA 5A6SA 3THCA 2BHZA 1E4MM 1MYRA 3L4XA 4JCMA 1PPIA 4EKJA 4JIEA 1V6YA 3WFLA 4EAMA 3BH4A 1H5VA 3VIKA 2WBKA 1UG6A 2VCCA 2WHJA 4JCLA 5F7UA 3CHCA 3B8SA 4Q7NA 1QHPA 2W91A 3WD0A 1XYZA 4EK7A 3BC9A 1HP4A 1XSIA 3A4WA 1W3JA 1CGUA 1W91A 4TOQA 3RDKA 1DHKA 4BA0A 2VURA 1HN1A 1NWSA 4CD6A 1B3XA 3GH5A 1JD9A 2GDUA 1EA9C 5I0DA 1EO5A 1E1FA 1MWOA 4MNJA 3WH7A 2ZXBA 4DM1A 3CHEA 4XX6A 1ZB5A 2GJRA 1BGAA 3W82A 4F66A 2YBTA 2XVPA 3W28A 1VF8A 3KL3A 4UQBA 4DWSD 1Q6FA 4YPJA 5JIWA 2O9RA 4FLRA 3GXFA 3ZR5A 4AISA 3WELA 3VPLA 4DWSB 4UQDA 1JYVA 4FF5A 4JAWA 3N13A 4NZCA 1XGZA 3OGRA 1R87A 4CN4A 2VZVA 5D9NA 1CGWA 1EDQA 4MDPA 3BSHA 2VR4A 5A8OA 3N1AA 4F9JA 7A3HA 3VGGA 1W3LA 2YOCA 1V02E 3L4ZA 1XYFA 2O9OA 1IZJA 4CD5A 1UR2A 2YL8A 2VTFA 3MU7A 5A6KA 2ZX7A 4AC1X 4HOZA 4HMDA 5CPQA 1K9FA 1B2YA 1ZL1A 5C71A 1UWIA 2ZUMA 2GUYA 2VRJA 6A3HA 3GXDA 1VRXA 1OWQA 3ARTA 1WKYA 1XSKA 4GPNA 1KXTA 2WB5A 4CCEA 1PJ9A 3B9DA 3CUHA 5A8PA 1J9YA 1GW1A 1YHTA 3I3DA 3FW6A 1J0KA 4GXPA 1ISWA 3LPPA 3ZJKA 2WMIA 3ARSA 3B9AA 3T2QA 2WHLA 1TA3A 2WVTA 2TAAA 3CMJA 1OBAA 2YDRA 1BPLB 4MNKA 2X2YA 1UH4A 2EO7A 1OINA 2PC8A 4H8UA 3WNPA 1KXHA 2IXUA 2DGAA 1MQQA 3I3EA 2RGMA 4AD2A 3S6TA 5CPSA 4U33A 4E8DA 3I3BA 1JZ5A 1EDTA 4QDMA 4RE4A 3ZJ8A 5I3DA 2WCSA 4XV0A 1KXQA 5ABGA 1JZ3A 2DQXA 4UZSA 5E0FA 2WC3A 1XH1A 1VFFA 2D24A 4GZIA 1EHAA 3UG3A 1FFQA 1ZBWA 3FAXA 3ZT7A 2Y4SA 1NM9A 3IAQA 1TFVA 3O6AA 4CD7A 3THDA 4OBRA 1UD8A 5I24A 4PBGA 1LL7A 3UETA 2Z1KA 1PZ2A 1V6UA 3QOMA 1BYBA 2GK1B 4W8AA 1W1TA 3TTQA 3ZOAA 4QP0A 4DUXA 4AZ5A 1UKQA 2DEPA 2XGBA 1LLOA 5DT5A 3ZM8A 1JZ4A 1V6XA 3BAXA 3VU2A 5A94A 1R85A 3HMCA 1KWGA 3WD2A 1QHOA 1BLIA 3UG4A 1OIFA 1MFUA 2NW0A 1SMAA 3L4YA 2YA1A 1Q6GA 3WQ8A 4AZGA 2OSXA 3AMGA 1B3VA 5E9AA 4J3WA 1PX8A 1JF5A 2XWDA 4PCSA 2J79A 2WYSA 3AXXA 5JBEA 2WKGA 2QPUA 4K68A 4W5UA 2J62A 1OGBA 5FOOA 3K46A 4IM4A 1ODZA 1P6WA 4YN5A 5ABFB 3NSMA 3W37A 2VOTA 2YKKA 3PZIA 1HJSA 1I1WA 1W1VA 4OKDA 1E0WA 2Y8KA 1UD6A 2PI6A 1WZAA 1CDGA 3WDPP 4ACZB 5BCAA 2ZUWA 4CGTA 5KEZA 3F5LA 1RPKA 1XC6A 2D0GA 2PBGA 2WMJA 1B9ZA 4ZE5A 2G41A 4DUWA 3WDRA 3RMEA 2WC4A 2XG9A 3OIHA 4MAZA 2OWWA 4JFUA 4NRRA 5I2UA 1E55A 1WDQA 4P7LA 5CGMA 3A6OA 1KWKA 2G3MA 2YL5A 4PTMA 1HIZA 1NARA 1W3HA 4W8LA 3WFZA 1ESWA 3WL0A 1CXHA 2DH3A 1JI2A 2J75A 2XVLA 1WDRA 3CZ8A 3OB8A 5GNYA 4HU8A 4AZ6A 2VCAA 2WM0A 2J8GA 3K8KA 5I78A 3GTNA 4AD3A 1CXFA 1KQZA 2E8YA 2V5DA 2G3IA 1V3MA 4V2XA 2V3EA 4AWEA 4M1RA 3WF1A 2WANA 2WBGA 2FDMA 4W8BA 4CVUA 3SUTA 3BMVA 3PZNA 5AYBA 5CGTA 5ECUA 4MNMA 1UZ1A 3MMWA 2PWGA 1TE1A 3AXIA 1GQIA 1GUVA 2F2HA 2RGLA 3AZSA 1KR0A 4PYSA 5CSYA 3LPFA 5I5RA 3UCQA 1A47A 1BTCA 4LGXA 5D8WA 4MPKA 4AD5A 5C8BB 1OIMA 2WSKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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