4DWSB

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
540
structure length
527
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 190
structure length 527
sequence length 540
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsB01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsB02
3LPFA 1Q6GA 1M03A 4DM1A 3AOFA 4B15A 1QPKA 5I2UA 2ZXBA 2VQTA 3AZSA 5GQBA 2YDRA 2ZUNA 1E3XA 1V6XA 3TTQA 1OBAA 3B9DA 1UA7A 3PZVA 1V3IA 1B1YA 4FLSA 3VDCA 5CPQA 4W5ZA 3EDFA 1WE5A 4H8HA 3T08A 4R27A 3AHXA 3GXIA 4AZCA 2CXGA 4PTVA 3FAXA 4KGLA 3G6LA 1CGWA 1BG9A 2YLAA 3VILA 2CBUA 2J74A 2VX4A 4PMNA 4A3YA 3F4VA 3SUVA 1UR0A 5DT7A 4W5UA 3DHPA 3GNPA 1G01A 3ZMRA 1J9YA 2XVPA 1OT1A 4OKDA 1UKQA 4OBSA 4QLJA 2V3DA 5FIPA 2VRJA 4TX8A 1LJYA 5CGMA 3K8MA 1UD6A 2VVNA 4HU0A 1WDPA 3GDBA 5A95A 4KMQA 3SUWA 2EEXA 3EMQA 5IFTA 1H0IA 3WL1A 1IZJA 3VIIA 4U5KA 2IUZA 2WCGA 4UQAA 1GHSA 4H8UA 4J7RA 4GZEA 4TVCA 2A3BA 4QP0A 4BQ3A 5C70A 3EBVA 1KQZA 4OOUA 1GNXA 3CMJA 2W92A 2WM0A 2XTKA 2J77A 1ZBVA 1E6SM 2IXVA 1ESWA 4KGJA 4V27A 2W91A 3LPGA 2PWFA 2WVSA 2ZUSA 1WNOA 4B16A 2ZX6A 3VM5A 1M7XA 1HJSA 1QNSA 2WZEA 1CYGA 4M80A 4Z2GA 4KH2A 3SUUA 1L0PA 2X05A 2E3ZA 2WNWA 1UD8A 1V3MA 1NQ6A 3RM8A 3MO4A 1C3FA 2DIJA 4J3WA 4DWSA 2NW0A 2BV9A 1VFMA 1BQCA 4IUGA 4PTMA 2PF0A 3OZPA 5I0DA 2O9PA 3NSXA 3VPLA 4AWEA 2OYLA 3D3AA 4Q7NA 1KR1A 3RILA 1HVXA 1VF8A 2EJ1A 2WSPA 2WLZA 2CHOA 4CKQA 1GQLA 5D8WA 4AISA 4MB1A 1GQKA 5ECUA 3VVGA 4P8UA 1RP8A 1V6VA 5BXRA 1K9FA 3PZNA 5HPOA 4XV0A 5LA2A 1BVZA 1N82A 4LXFA 1BVNP 1V02A 1E72M 3AIQA 3W27A 3T2PA 4J3VA 3NJ3A 1JZ4A 5ABHA 2A3AA 4U2ZA 3W82A 4U3CA 4AEFA 1VAHA 1V6WA 4HTYA 1QNOA 3ARXA 4DWSD 2VZSA 5BROA 2O9OA 1UUQA 1XGZA 3ALFA 4D1IA 3AHTA 4H8VA 1UH2A 2VL4A 2G3MA 3K4AA 1J18A 3WMBA 1J10A 1JFXA 2JIWA 1VEOA 4E8DA 5IFPA 1E6XM 4W7UA 2D0GA 2O9TA 3U7BA 1W3KA 5D9PA 1PAMA 1QBAA 1NARA 4UZUA 3BAWA 2G3NA 1VENA 5EFDA 1MFUA 4CVUA 2FH6A 4X0VA 3GBEA 2XG9A 1IZKA 1CPUA 3VGDA 1WZAA 2WC7A 1D3CA 3WIJA 1I1WA 4U5IA 4HMCA 1JAEA 4QLLA 5M03A 2BNJA 4QFUA 1W1PA 1CEOA 1ZJBA 3POHA 1BYCA 1MQQA 2VR4A 4M29A 4V2XA 1BGAA 1NWUA 1RPKA 1UKSA 1CDGA 1OD0A 1KGXA 4XZWA 1YQ2A 1EHAA 2XJ7A 5FL1A 2DDXA 1E15A 5IDIA 1O6IA 3HMCA 1DWGM 5A8PA 2E8ZA 5GPRA 4J3SA 4PUEA 1UH3A 1NP2A 1DWJM 2XM2A 1OIMA 1NWSA 1DWFM 1K9EA 5E0CA 4MNKA 5BXSA 1CXLA 3VGBA 1V0LA 3T0BA 3BMWA 3MS8A 3GZAA 2Y2WA 2YA1A 3NSMA 2EPLX 3TOPA 1LWHA 2PBGA 3A47A 3AHZA 4PBGA 4CGTA 4NRSA 3KL0A 4OZOA 4KWUA 2ZIDA 1V6YA 4DWSC 5I23A 1ZBCA 4HA3A 2J8FA 3VIPA 5AYBA 2DIEA 1TMQA 1BTCA 1JNEA 3PZIA 1R7OA 4MDPA 2X8RA 4HA4A 1UWIA 2OSXA 3LPOA 2J7FA 3ZJKA 2V38A 3GH4A 4HZ8A 4CU8A 2RGLA 3BAYA 4JFUA 4D6HA 1JXKA 3PZOA 3B8SA 3U5UA 3AMCA 4M1RA 1J01A 3KE0A 2WPGA 4AC1X 1W9PA 1OM0A 4S3JA 3EDEA 2IXUA 2YA2A 3RO8A 2J79A 4W93A 2QF8A 1GOQA 3OB8A 3AYSA 1UWRA 1JZ2A 3OLIA 3ZIZA 1SR0A 3DYOA 4RE3A 4RE4A 3WQ4A 3S2CA 1HXJA 3A6OA 1H3GA 4UQDA 3VGGA 1TFVA 5A8OA 1CGVA 3T2QA 4B9ZA 4EKJA 3KL5A 5JH8A 2UY4A 4MNMA 1XD0A 4UOJA 1GVYA 3ZSTA 4AZHA 3S6TA 3WNKA 5LA1A 1TCMA 3L4VA 1VFFA 1GUVA 1AVAA 3WF0A 2QMKA 2ZUTA 4LYRA 3WDHA 4YPJA 4BA0A 2G3IA 1H4PA 3QHNA 3VM7A 1CIUA 4WKAA 1V3JA 2WK2A 4BCEA 4BF7A 1B3WA 1BLIA 1QI2A 2J62A 4MNJA 3MUIA 1UZ4A 1WO2A 5A2BA 2X0HA 1US2A 3OLEA 3B9AA 3ARYA 4V28A 1EOKA 3L4UA 4ML4A 1J0JA 3D5HA 3K1DA 2ZXQA 2WXDM 2X0YA 1SMAA 5KEZA 3GTNA 2YOCA 1LL6A 1W91A 2XVLA 1W2VA 3UG4A 3WNOA 4CCDA 2J78A 1UA3A 1QI0A 1BHGA 2ZX8A 3SCTA 2J7GA 5BRPA 1W9BM 2E9MA 2PWDA 4OBRA 1W1TA 5A6KA 3N15A 1WDQA 5A6BD 1GOMA 2A3CA 4AIUA 3WNNA 2VO5A 2WMGA 3EYPA 3W6LA 3GXFA 4UCFA 3ARUA 1H1NA 3BLKA 3CMGA 4JFVA 1Q6EA 4WK9A 4NSBA 1EO5A 3UG3A 3SCSA 4EK7A 1WP6A 2BXZA 1OSEA 4PCTA 4JFSA 3VDAA 4Z2KA 2VZUA 1W3HA 1H0GA 3CLWA 1EGZA 2V3EA 3DHUA 1E6ZA 1H49A 5D9OA 4W7VA 3FXYA 1VEPA 4B9YA 4CD5A 4WF7A 4GO9A 4EANA 3WDIA 5EFFA 1XHGA 1E4LA 4Z2IA 3AXIA 5HOSA 3AS0A 3RM9A 5JBFA 1U2YA 3ZOAA 1GQIA 9CGTA 4B3KA 2XFYA 3CZ8A 4ZFMA 3ZJ8A 2AAAA 1W32A 3VIOA 2D20A 1TUXA 3DC0A 4PTXA 3CZGA 3U57A 1VBRA 1C8QA 3ZT5A 2EPOA 4ATWA 4F8XA 2CHNA 3ARQA 2VT0A 1GORA 1X1NA 4HMDA 4ZE5A 5JIPA 3L4XA 4UZSA 2JALA 1J0ZA 4AD4A 2V5DA 4CN6A 4GQRA 2WYSA 4L4PA 1JDCA 3VO0A 1ITCA 2BY0A 3VD5A 1EQCA 3FHAA 3ARSA 2WMFA 1DWIM 1OB0A 4UFLA 4P7OA 1HP4A 4FF5A 4FK9A 1JD9A 1FFQA 2YL6A 1EHNA 3BSGA 3ZR6A 4E8CA 3RMEA 4ACYA 2DT0A 3WL0A 3BMVA 3CPUA 5LYRA 1EDTA 3WELA 5I77A 3BXWA 2WZIA 2DSVA 2W66A 2J7DA 4YHGA 5E6YA 3W24A 4Z2LA 2BHYA 2E8YA 4MJ4A 1LWJA 3WH9A 2JE8A 4J27A 1BFNA 2VC9A 4TX6A 3IANA 2HVMA 4PMYA 2BVTA 5E0FA 1BF2A 1PBGA 2CEQA 2WCAA 3QHMA 4QDMA 3DYMA 2JEPA 2D2OA 2DGAA 2W62A 4MB3A 1HNYA 1KXHA 1E6QM 3CHEA 4CN4A 3PHAA 2YKKA 2J75A 3UESA 3VIJA 4K68A 2WMIA 1E5NA 5CQ1A 4W87A 1HP5A 1CWYA 1PJ9A 2OWCA 1M01A 1PPIA 1VJSA 1XH2A 2QLYA 2VCCA 2G4FA 4EE9A 1UD5A 4LQ1A 3GBDA 1J11A 2CKSA 4AD5A 4CU6A 4WKFA 2GDVA 3N1AA 1MXGA 3WENA 3CUGA 4RL3A 3PZUA 1UD3A 3AQUA 1H2JA 1JXJA 3MMWA 4AD3A 3FHQA 1KR0A 5KZ6A 5HNNA 4HOXA 4JHZA 1FFRA 5I24A 1C91A 4JZ5A 5FD0A 7CGTA 2XFFA 2PI6A 4ATLA 1KQYA 4YHEA 2Y24A 1C92A 4AZ6A 3AYRA 1C7SA 3SCPA 2XSBA 4TTGA 3PTKA 1HJQA 4HP5A 2OWWA 4JKKA 1E0VA 2ZX9A 1TZ7A 4QCEA 3VDBA 4AYSA 1W9XA 1JF6A 1CGYA 5A1AA 3WD1A 3BLPX 4C7DA 3BCFA 1WDSA 2BS9A 1B3YA 3WKZA 2FHFA 4JCMA 1OT2A 3J7HA 3VIFA 4P7LA 2WC4A 3THDA 4HOZA 2BHUA 3VKKA 3IK2A 4W8BA 2CBIA 2CNCA 4LYPA 3PZMA 1JDDA 3IJ8A 1H5VA 2GK1B 5EBAA 1J0HA 1E4IA 4H7VA 1PEZA 4UOZA 2WHMA 2XVKA 2BVDA 1E73M 2PWGA 5C71A 1UH4A 1OGGA 4MDOA 3CH9A 2UY2A 3QOMA 2JIEA 5AYIA 3WMSA 4GINA 3MSDA 1W3JA 3WQWA 1E6NA 4OIFA 1OD8A 1VFUA 2GJPA 4CD4A 3SCNA 4BQ4A 4WJXA 3RCNA 4M24A 5JIWA 2V5CA 1HJVA 1WB0A 4UR9A 4JCLA 1M04A 3W28A 4UFKA 4BQ2A 1NOWA 5HDRA 1XSJA 3L4YA 3UR8A 4CCCA 2ZE0A 2WB5A 4MB5A 1LL4A 1FHLA 1FP8A 1MW0A 1KB3A 4P8XA 1J0KA 1XYFA 4E4PA 2WZHA 1QHPA 1C90A 2XWDA 4GI8A 4WKHA 1V6UA 1XYZA 3W0KA 5FCZA 3CHFA 1E1FA 1JYXA 5FKYA 1V08A 1XD1A 2GFTA 3N12A 3VU2A 1GPFA 1EDGA 1JI2A 2GSJA 1ZBWA 1JZ8A 3PTQA 3VINA 2J8GA 2OSWA 2VUYA 4Z2JA 1UQZA 3ZJ7A 3PTMA 2X1IA 2BHZA 5M3WA 3N13A 2J7CA 3MUAA 3KEHA 3E1F1 1H11A 4ZEPA 4GO8A 4F9DA 3RJYA 1HKMA 4UQ9A 2ZOXA 4P7QA 2UY3A 1GOOA 1D7FA 3OG2A 5A69A 1HN1A 3VX0A 2BY3A 4CCEA 3WBAA 1EIBA 3W37A 1Z32X 3N17A 2XGBA 6TAAA 4Z2HA 1UWTA 4JAWA 3AISA 2WMHA 3AIRA 5HXMA 2WLYA 1UHVA 1X6NA 1JFHA 1VRXA 1CGTA 2VX7A 2CESA 2CERA 4TXEA 3ZT7A 3VD4A 3F5KA 4GIAA 4P8WA 1HKIA 3K4DA 3SUTA 3CUIA 2D22A 3FNDA 4A4AA 2YL9A 3QGVA 1HL9A 1JD7A 2XUCA 1KXTA 2WBKA 1KFWA 4PCSA 1PIGA 3AHVA 4JHOA 1C8XA 5D9NA 3ZR5A 8A3HA 5I79A 3ZQ9A 5E6ZA 2EXOA 3DYPA 2BY1A 1EO7A 1QHOA 1I75A 3WUEA 4HOWA 4ACZB 1HJXA 3F5JA 3AS3A 5I6SA 3VTRA 1ZS2A 3L4ZA 4IPNB 4W89A 3AXHA 1W9VA 2XGIA 1CXFA 5IHSA 1A47A 1ISVA 2QV4A 4GQQA 4PSRA 1K9DA 4W7WA 5EMYA 1BYBA 1NWTA 4M82A 4MAVA 1MW3A 3VD9A 4IM4A 5IHRA 2DH3A 2AOSA 1QI3A 1V3HA 3CUHA 3O6AA 1JYVA 1EQPA 3WNPA 1E70M 5DF0A 4TOQA 2GUYA 4FMVA 1DWAM 4M8UA 3IAPA 3IJ9A 3U7VA 1W9UA 3WDQA 1FH8A 1MFVA 5FOOA 2XSAA 1E0WA 1ISXA 3TTSA 3BH4A 2E40A 2NT1A 3AXXA 3OGSA 3WD2A 1EOMA 2WVTA 2XM1A 4JFTA 2CETA 2WMKA 3NIYA 2VZVA 1HF6A 1HIZA 1OGBA 4WSJA 3RJXA 1CGUA 5M17A 5A8NA 3I3EA 3W26A 3WD4A 4UOQA 1Q6FA 4QAWA 5JUVA 2D3LA 3JUGA 4J28A 4GXPA 1DWHM 4MNLA 2W63A 1MQPA 3CTTA 4UFHA 4GZJA 2PB1A 2VRKA 3VMPA 2EPKX 3WH8A 3CGTA 1G1YA 3AIEA 3L2LA 3OLDA 1UR8A 3MANA 4UTFA 3VD7A 1VJZA 1BSIA 3GH7A 3AZRA 1S46A 2UY5A 3BAIA 3OBAA 5EB8A 1HJUA 1R86A 4PMVA 5F7UA 1GZJA 5A6AA 1HVQA 1AQMA 2WSKA 4DUVA 5A6BA 2AMGA 4X9YA 5CG0A 1LLOA 4JKMA 4JKLA 1QI4A 5A6LA 4AD2A 1JGIA 4CU7A 3NYDA 2DEPA 1E5JA 1X6LA 1JG9A 1UOKA 4U3AA 4Q22A 2EPMX 1LF1A 3GNRA 4BQ5A 2NT0A 1BG4A 1HL8A 1QOXA 2Y5EA 3NDYA 4D6EA 3WNMA 1W3LA 3W38A 4AEEA 4U31A 1PIFA 3TTOA 2HISA 4LYQA 2XVGA 3AMDA 4HU8A 3PN8A 2GJXB 2VRQA 2Y8VA 1DP0A 1CGXA 3QHOA 3PZQA 2ESCA 1ZB5A 1EH9A 4UFJA 1B90A 2ZXAA 2CBJA 3AIVA 1UR2A 5HBFA 2W4XA 3K8KA 4Y7EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1M53 A;  1ADO A;  2G37 A;  3OGR A;  2G41 A;  1FWA C;  4C65 A;  3W53 A;  4IIE A;  4W9T A;  2G8Z A;  1EJ7 L;  1V4Y A;  3PRB A;  4ADT A;  2GDQ A;  4BF8 A;  3WD3 A;  4XWU A;  1VB9 A;  1FAP A;  1BXB A;  4W4Q A;  2EUL A;  1P6C A;  2QJH A;  3W7M A;  3SJN A;  4E38 A;  3LN3 A;  5FF4 A;  5DQP A;  1KLZ A;  4F40 A;  2O0T A;  3WBE A;  3MKV A;  4QX4 A;  2Z2U A;  3FA5 A;  1WV2 A;  3E5P A;  4EWN D;  5G2I A;  4R34 A;  3MW7 A;  3EXR A;  4C1K A;  2MLY A;  1H7O A;  3TVA A;  3WQF A;  3IHZ A;  3DIP A;  1JZ5 A;  4IOT A;  5D9M A;  1TZ9 A;  3Q45 A;  4JL1 A;  1EYM A;  1BYA A;  4DJD C;  5FEX A;  4XK2 A;  2NUW A;  1OK6 A;  3AUJ A;  4LAW A;  4O0Q A;  1MZH A;  1ZJA A;  2CU0 A;  2DSU A;  1UR4 A;  1R3Y A;  2L2S A;  2YDS A;  3GH5 A;  1TV3 A;  1XYB A;  2QT3 A;  4H00 A;  5JH1 A;  3EWB X;  3IAR A;  4XTI A;  4O52 A;  4H8N A;  4HCL A;  5BU6 A;  1AMK A;  5A6T C;  2YIH A;  4D72 A;  3SEC A;  1NOU A;  4AY8 A;  5F1V A;  4YJ5 A;  1RVK A;  3W9Z A;  2DT3 A;  1QUM A;  4HYV A;  3DHF A;  4X0N A;  4OUI A;  1OF6 A;  3N2C A;  1VBH A;  5BW6 A;  4KWS A;  4G2D A;  3EOL A;  2WMI B;  3QMS A;  2HS8 A;  3ARW A;  5CSS A;  4JII X;  3LHT A;  3QQW A;  3MYO A;  3KAD A;  3ENL A;  3TON A;  3CV2 A;  2HXT A;  2X2G A;  3THC A;  1QPL A;  2JK2 A;  1TPE A;  1R8L A;  1LRO A;  3GHS A;  2IKJ A;  1SZF A;  3EA2 A;  3EMC A;  5CZK A;  2E0P A;  3CV7 A;  1WDR A;  1UKO A;  2KE0 A;  1KBJ A;  3UER A;  3O15 A;  1UW9 A;  4GFS A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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