4DWSB

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
540
structure length
527
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 190
structure length 527
sequence length 540
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsB01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsB02
2FGZA 4GI8A 5M3WA 3W6LA 1GOOA 2G3JA 3K8LA 1E6RA 5DEZA 3VD7A 4LYRA 3BCFA 3K46A 3BGAA 4EK7A 5C71A 4GPNA 3EDFA 2XIBA 2BVDA 3ZT7A 1E6ZA 1QHZA 2Y2WA 3SUTA 2YDQA 4R27A 3WH8A 2BXYA 5BCAA 2J7CA 2WVVA 3RJYA 3THCA 4M24A 3GXDA 4D6GA 2OSXA 4P7OA 2X0HA 3QGVA 2WPGA 4MADA 5BXTA 3B8SA 2CXGA 4CU6A 2VX6A 4J27A 3VINA 4QFUA 1QW8A 1JL8A 3VU2A 1LF1A 2FGLA 2O9TA 1UKTA 5I79A 3ARVA 3W24A 5ABEA 4EKJA 1GQIA 2WKLA 3WBEA 5CPQA 1Q4NX 5GPRA 3U7VA 4X0NA 3PN8A 3CMJA 4W93A 2DT0A 3KE0A 3SIMA 3VDAA 1MFVA 3WUGA 1TR1A 2RGMA 1UR4A 3VNYA 4BS0A 5HNNA 1CGVA 3TTOA 4JFVA 2EQDA 3QR3A 3NUKA 4PMOA 3SURA 4JCLA 1H5VA 4PMVA 2QPUA 1CGYA 1W1TA 1ECEA 4DM2A 3UETA 1XYFA 5HXMA 4YHEA 1Q6CA 2XM2A 4MPKA 4BA0A 2CCRA 2C0HA 1M04A 3APGA 3WDRA 3WIJA 1JAKA 2XGBA 2V38A 4GO8A 3ARRA 1H49A 3GNPA 2GSJA 3MANA 4J28A 1YQ2A 5E6ZA 3MU7A 4MB5A 3AHXA 3WQ5A 1WDRA 1C92A 3RMEA 1QI0A 1PZ2A 3W81A 2WM0A 4KH2A 3VDBA 4EE9A 3WNNA 1GJWA 1W2VA 1CXKA 3S6TA 4NZCA 2PC8A 2J74A 2YOCA 3SCVA 5A2BA 2JEPA 1KCLA 1U30A 4XX6A 1GJUA 1GVIA 2D24A 1CIUA 3AMKA 4MNJA 1XV8A 4AZBA 4TTUA 5AY7A 2WHLA 3WD3A 3AOFA 1KXQA 2YA0A 4X0VA 3WSUA 4E2OA 1WNOA 4ZXLA 4JCMA 3SCQA 1HP5A 1G1YA 3ZIZA 3L4UA 3VIHA 2XFFA 2ZWZA 3PZOA 1GOKA 4BQ4A 1VFOA 3BAJA 1JGIA 3ZJ7A 1R7AA 1E5NA 4H04A 1J0YA 1UWTA 1H4PA 3FY1A 1MFUA 3HU7A 2DT3A 1FH7A 1JNEA 4W5ZA 2ZUWA 4Z2JA 1JDAA 4MB4A 3RDKA 2BVYA 4CCDA 1HP4A 1E6SM 2ZXAA 3RM8A 3N11A 4B15A 1KGUA 2FHFA 4UFKA 1TA3B 1K9TA 2DH2A 1E5JA 4GZEA 4MNMA 1EDQA 1UA7A 2QMKA 3WNPA 4C7DA 1V3HA 2YJQA 4HPHA 1N82A 4PCTA 1ISVA 4OBSA 3VIIA 3POHA 1MXDA 4HMDA 2DQXA 1E40A 3HN3A 3W38A 2ZUSA 4YHGA 3QHNA 2J79A 1UA3A 4CD5A 1XRVA 4D1JA 1MQQA 4MNLA 1C7TA 3O9NA 3EYPA 1VEPA 3N17A 2JIWA 3THDA 2GUYA 3AJ7A 5CGMA 4EAMA 2WNWA 4H8HA 1HJQA 2G4FA 3EMCA 5EB8A 3RCNA 4OOZA 1PX3A 2D0GA 1EHNA 3L4YA 2J25A 2QHAA 1P6WA 2D2OA 1TA3A 2QMJA 1WB0A 1KXVA 3WDIA 4W89A 4AZIA 2CYGA 2VZSA 2V3DA 2ZOXA 3OA5A 2XJ7A 4UR9A 3WH5A 1C93A 1DP0A 2E9BA 4NSBA 2GJRA 4TVCA 4W87A 4JIEA 3ARWA 1WCGA 2JFEX 3EDEA 2WMIB 3RM9A 1MW1A 2DIEA 1J0IA 1EO5A 4TXEA 2WVSA 4D6HA 4BQ2A 1W9BM 5IXEA 3CIVA 3VVGA 3UESA 3PZNA 1I1XA 4S3JA 5ABHA 3ZJ8A 4D6IA 2YL6A 1JZ5A 4RE3A 4OIFA 3MUZ1 2XM1A 3UG4A 4KGLA 4KRUA 3WF4A 2J4GA 4XZWA 1TFVA 1O6IA 4ACZB 2O9PA 1BG9A 5A8PA 1VF8A 2QV4A 4PCSA 3EMQA 1CNVA 3WNLA 4AIOA 4U5KA 3U5UA 2XTKA 2VR4A 5A6JA 3ZSTA 3WY1A 1QVBA 1WDPA 4PMZA 2ZE0A 3WQWA 3N12A 1JFXA 1CXIA 3MO4A 3NCOA 4D6EA 4ML4A 1TG7A 3ZJ6A 5LA0A 3WF2A 3EDJA 4BF7A 1VEOA 1JZ3A 2EPOA 1JXKA 1OWQA 4UQBA 5I24A 3AS2A 1UWUA 3D5HA 2FH6A 3WD0A 2UY4A 2WC7A 1NWSA 2J7GA 3WEOA 4ACZA 1IT0A 1VENA 2CBVA 5GNZA 3A6OA 2XWEA 3II1A 5A2AA 4XB3A 1CECA 1XGZA 3B9DA 4WJXA 3AIVA 3W26A 4OKDA 5D8WA 2GFTA 4N0RA 4TVDA 3CUGA 2CESA 3EDKA 1JF5A 4V27A 3F5KA 2OSWA 3HMCA 1VAHA 3CZKA 1CGUA 2D0FA 4P7RA 1QHPA 4E8CA 5I77A 2XFRA 2EPNA 3AHZA 4AD1A 4QCFA 1JDDA 4C7GA 4DWSA 1K9DA 2D23A 1VJSA 2A3BA 3FXYA 2BY0A 1UG6A 4X9YA 1CTNA 5D9OA 2XWDA 5A8NA 1C8XA 2XFYA 2XHYA 1K9FA 4ZENA 3I3BA 5CQ1A 5HPOA 1EIBA 3OZPA 4JL1A 1W1PA 2PBOA 3MUIA 4A4AA 4LPCA 4QP0A 1W1VA 3WNOA 4AZ7A 2F2HA 1PBGA 5JIPA 5EBAA 5LA1A 3SEPA 3PHAA 5IFPA 4B9ZA 5DT5A 3PZGA 1XH2A 1UD6A 2EXOA 4F79A 1WZKA 4KGJA 2Z1KA 1NWUA 4CD6A 4J3VA 5GQBA 1QNPA 1W3LA 1M7XA 3AHYA 3TTSA 1UZ4A 1XD0A 1MW2A 4MDPA 1B3WA 2A3HA 4QAWA 5A6LA 3VX1A 4TVUA 1XSKA 2DDXA 3NYDA 3UR8A 3M46A 2CHOA 3CPUA 1WZAA 3L4TA 2WZHA 4LQ1A 1IZKA 1UD4A 4KRTA 4NF7A 3MUY1 1B3YA 2WHMA 4J3TA 1CPUA 2ZX8A 3BAWA 4D72A 3EMZA 1R7OA 3T2OA 5FCZA 2DSWA 1E70M 4HA3A 3U57A 1TE1A 2ZICA 2O92A 1GQLA 3W53A 2OLHA 1LLOA 3MS8A 1E72M 3AZRA 4CVUA 1UQYA 3N9KA 2X0YA 4CCEA 3WH9A 3AICA 3VILA 2EBNA 8CGTA 1EDTA 2IXUA 5A6SA 3T09A 3IAQA 1JYNA 1UH4A 1GOQA 1BF2A 8A3HA 2ZUTA 4XV0A 3ARTA 4ZFMA 4UQCA 1BYBA 1V3JA 3N15A 1WAWA 4NRRA 4F8XA 2OWWA 1LL4A 3MSDA 5BROA 3CTTA 1B2YA 3SUVA 3UEQA 2PWEA 5A94A 1BGGA 1G94A 3AS1A 1J0ZA 2ZXQA 2YIHA 5A8MA 1EOKA 2VCBA 3VKKA 4UZUA 2E0PA 4CN4A 3MV11 1Q6FA 2TAAA 4GXPA 1PZ3A 3CH9A 3PZUA 1J10A 1PAMA 4PMXA 3WH6A 1B0IA 1UR1A 3OLGA 4YPJA 1KR1A 2D3LA 1VJZA 3FAWA 1U2YA 1CGXA 3CZLA 3N1AA 3GH7A 3NJ3A 1DTUA 3ZT6A 3KL5A 1GHRA 1JI1A 2E9LA 3RILA 2XSBA 4AW7A 1AQHA 1SR0A 5KEZA 3CLWA 3WF3A 4Y7EA 4WK9A 4KWUA 3WUBA 2CITA 4KMQA 1UKQA 1J0JA 4HPGA 1H09A 3AIRA 1J9YA 4AISA 3AHVA 5HPCA 1WO2A 4W8BA 1UD8A 2YA1A 3VMPA 4JZ5A 2WCSA 1E1EA 2NW0A 3ZSSA 1B9ZA 1CZ1A 2Y4SA 1HKMA 3BMVA 4D6JA 1LQ0A 1BG4A 3OLDA 4CU7A 3VIKA 4B9YA 1CGWA 3B9AA 1EQCA 2VZUA 1CENA 3VGEA 1MVYA 2VOTA 4M81A 1H41A 2JE8A 1AQ0A 2DIJA 4E8DA 1DHKA 1V08A 2WLYA 2WBKA 5A6BA 1PEZA 4XZBA 4FLSA 2XVKA 3VX0A 4B3KA 5DO8A 5I0DA 3CO4A 4P7LA 1ESWA 1V6YA 5I2UA 3VMNA 4UZSA 4TX6A 3L2MA 3BH4A 1W9PA 5CLTA 1E6NA 4GO9A 3WH7A 3AXXA 4AD2A 1HVQA 1HF6A 4P7QA 1JYVA 2W67A 1HN1A 2YLLA 1YHTA 2YA2A 2FH8A 1UR2A 3W27A 5A6BD 2EEXA 3VGBA 5IHRA 5CPTA 1FP8A 2IXVA 3VD5A 1AQMA 1DWGM 1CXLA 3KWXA 1WPCA 2J7EA 3VMOA 3AIUA 4GINA 3OGSA 3PZQA 1FFQA 3SCWA 2VJXA 3BCDA 2OYKA 3WEMA 4UQ9A 7TAAA 4J7RA 2EJ1A 1V3KA 4W7VA 1IZJA 4L4PA 4ACYA 1BFNA 1WZLA 2WKGA 2W61A 4U31A 1QOXA 3TTQA 1WKYA 3WQVA 4PTVA 5A6KA 1GCYA 5E0FA 1QPKA 3WEZA 5BXSA 2A3AA 1VB9A 2A3CA 3GM8A 1WP6A 2V3EA 2YL8A 2E9MA 1TVNA 2J7FA 4UQEA 5M5DA 2XYLA 2YL5A 1GW1A 2WB5A 4MTVA 2W5FA 1JYXA 3AIBA 3RO8A 1V6XA 2PF0A 2EPMX 1C91A 2ZXBA 3BSHA 4DWSC 1V02E 1NOUA 3KL3A 1ZBCA 3T0AA 3WNMA 1VFFA 3MSGA 4J3UA 4CUCA 3WF0A 1B1YA 1XYZA 2WSPA 4CKQA 2ZX7A 4CVWA 3UCQA 5JBDA 4LXFA 3K4AA 1HT6A 1US2A 2ZX9A 4HOZA 1OM0A 2W66A 3A4XA 2WC4A 4IISA 7CGTA 5FD0A 3EDDA 2ZWYA 2WYSA 4LX4A 2X2YA 2DH3A 1DEDA 4TTGA 2DSKA 2QLYA 4BCEA 3GTNA 4WSJA 2W4XA 3IAPA 1UHVA 2Y5EA 3I3DA 4UFMA 1SMAA 3QHOA 1B31A 3JUGA 1E73M 5EMYA 3AFBA 6TAAA 3SCSA 1AVAA 4BQ3A 2ZUVA 5JH8A 4QLJA 1M53A 1RH9A 3WNKA 4HOWA 2WK2A 1V6UA 3T0BA 3AS0A 1KQZA 5A6MA 3CUHA 1QHOA 2VR5A 3AISA 4J3SA 4JFWA 2VX5A 1MW3A 4ZE4A 4ZE5A 3CUJA 1E9LA 4JKLA 1KGWA 3VDCA 4CN1A 1D2KA 1MWOA 3N04A 1UR8A 1UUQA 2W92A 3SCUA 2OYLA 1TVPA 1E0VA 2J47A 1E71M 3VIGA 1MXGA 4W86A 4PN2A 4UTFA 1LL6A 1VBRA 4H7VA 1V6VA 4QLKA 1XCWA 1UKPA 2BV9A 3UERA 1OB0A 1US3A 1QBBA 2Q8XA 4UQDA 2X05A 1RPKA 3AHTA 1HX0A 4PUEA 4TX8A 3PTMA 3AI0A 3SCRA 3DHUA 2UY2A 2WAGA 1IV8A 5E6YA 5FOOA 3WQ6A 1ZJAA 2XIIA 2VVNA 1UKSA 3K1DA 4AD5A 3BAIA 3W6MA 1X6NA 1ODZA 3OBAA 3GXFA 1XSIA 4WKFA 4BZYA 2ZUMA 4U33A 1EDGA 1FHLA 2VUYA 4HP5A 2WCAA 1HL9A 2Y8KA 3ZT5A 2VVSA 4PMRA 3VGDA 2CKSA 1JZ2A 3CMGA 2NSXA 1J18A 3ARPA 4P8VA 4TOQA 1BYAA 3KEHA 1BHGA 1L0PA 4UFJA 2WMGA 1BVNP 3SCPA 2BNJA 4F9DA 4Z2IA 1B3VA 4DWSB 3BLPX 3AZSA 4AD4A 4PTWA 3E1F1 3PZIA 3ARUA 2WCGA 1UR0A 3SCTA 1O7AA 3DYPA 1E6XM 3GNOA 1DWHM 2W62A 1EH9A 1EOMA 1KGXA 5ABGA 4PMDA 1HXJA 2CEQA 2J78A 4MAVA 2IUZA 4YN5A 3OB8A 5EFDA 4UOZA 2EPKX 3BAKA 3DECA 4CD7A 3SUSA 1U33A 1L8NA 4FMVA 4OZOA 3RJXA 2WHJA 3BXWA 2V5CA 1OGGA 2WMJA 3W0KA 1NWRA 1JG9A 3LPOA 4CU8A 2V5DA 3A3HA 1ISXA 1TZ7A 3ALFA 4NI3A 4D71A 2GK1A 3NDYA 5AYBA 4GKLA 1JFHA 5LA2A 3VD3A 4K68A 4U3AA 1E6QM 1HJSA 4C7FA 4U2YA 5BRPA 1J12A 1UQZA 5D9PA 5E0CA 4AWEA 3AIQA 1KWKA 1D3CA 5IFTA 1QNQA 2FHBA 2PB1A 5DFAA 3VOCA 4DWSD 1KQYA 5E9AA 2VX4A 5TD4A 2Y8VA 1LWJA 3K8MA 1VFMA 3TP4A 4F9JA 3LPPA 3WF1A 5BYWA 1ZBVA 5IDIA 4UOJA 2CBIA 5M03A 2VRJA 2WC3A 1EQPA 3ARSA 3AROA 1GQKA 1CWYA 1RP9A 1OBAA 3I3EA 4H8UA 1OD8A 4CN6A 1DWFM 1OT2A 1GONA 2JEQA 3T08A 4HA1A 4V2XA 4EANA 5GNXA 4URIA 2VURA 5CLWA 3IK2A 2O9OA 4AZHA 4D6DA 4FK9A 1HJXA 2O9RA 4JFTA 4MDOA 4MJ2A 4HMCA 1KXTA 1GORA 2ZX6A 4A3HA 2D0HA 3FAXA 1DWIM 3AXIA 1V0MA 1DWJM 2WLZA 4Z2LA 1OGSA 3UR7A 2D20A 4PMYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1OT1 A;  3F4V A;  1RD6 A;  3K8K A;  3BSG A;  1ZJB A;  2CKR A;  4ATW A;  5C8B B;  2RGL A;  2VQT A;  6CGT A;  1OGB A;  4PBG A;  2BY1 A;  1HVX A;  4M80 A;  1B30 A;  1UH2 A;  5D4Y A;  2DT2 A;  3AXH A;  3F5J A;  2YDR A;  3A47 A;  1KXH A;  5A8O A;  2WBG A;  5FKY A;  4PMN A;  2E40 A;  1V3L A;  1I1W A;  2GDV A;  3WN6 A;  2WMF A;  4S3K A;  3BAX A;  3WMC A;  2WVT A;  2HIS A;  2BVT A;  3SCO A;  1JZ6 A;  1BPL B;  3CZ8 A;  4MAZ A;  1M03 A;  4OJY A;  3FHA A;  5HBF A;  2XVN A;  1LWH A;  5LYR A;  1EHA A;  2JIE A;  3SUU A;  2WVV B;  2CIP A;  1Z32 X;  1UH3 A;  4GQR A;  2NT1 A;  1JD9 A;  4IPL A;  1J0H A;  1H11 A;  2V3F A;  4FF5 A;  4JHZ A;  1GHS A;  3BMW A;  1X1N A;  1MQP A;  1E4N A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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