4DWSC

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
539
structure length
526
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGEIYLKSISEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 184
structure length 526
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsC01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsC02
1VEPA 4AWEA 4J3WA 5FD0A 2IXVA 3PZVA 3CUIA 2IXUA 2O9PA 2E40A 4AZHA 2D22A 5AC5A 1W9VA 3GXIA 1O7AA 3GXDA 5D8ZA 3VU2A 1MVYA 3WBAA 3B9AA 3MV11 2PB1A 2FH8A 2W62A 2ZX9A 5C8BB 3EDFA 1KXHA 4HOZA 2VX6A 4F9DA 3RDKA 4CN1A 3CUFA 3RJXA 3DC0A 1JF5A 1E4LA 5E6YA 1ITXA 3BAJA 4MAVA 3F5LA 4HMEA 4AY1A 4JAWA 3DYPA 3KL3A 1LL4A 1RP8A 4KRTA 2VX7A 1V3JA 3DHUA 1UKOA 1GQIA 1W9DM 2JEQA 2X05A 3ZO9A 3N13A 3A6OA 3BGAA 2CBIA 2FHBA 2EO7A 3T0BA 3AIQA 3W28A 1ZL1A 2VZVA 4XV0A 1ZJAA 1U2YA 2E9BA 1V3IA 3GTNA 3WFLA 4LYQA 2CYGA 2JIWA 2QV4A 1PIGA 2JE8A 4H8VA 1BYAA 1XH1A 4ZEPA 2JIEA 3WEMA 5CZKA 1SMAA 3CLWA 5JIWA 1D2KA 2WMGA 1UD5A 4D1IA 3L2MA 5D9NA 1HX0A 3UETA 5CPTA 3HN3A 2V3EA 1BLIA 3B9EA 2EQDA 2WC7A 4AD1A 2OSXA 2DGAA 1JG9A 2ZXDA 3AMDA 5CSYA 3N17A 4AD5A 1QNQA 3T08A 2JEPA 1KCKA 3ARQA 1OGSA 3VD9A 3EMQA 5EB8A 3WEOA 1C8YA 3TTSA 3CZGA 3WFZA 2V5CA 2WHLA 4HA1A 4CGTA 3OBAA 1ZBKA 1MW3A 4H41A 3BAIA 5GNZA 1XSJA 1QI3A 1N82A 2BY0A 5GQBA 4D1JA 3ZOAA 5JBEA 3CZKA 2XHYA 1U33A 4YHGA 1HJQA 2X0HA 4GIAA 3PZ9A 4W85A 5DT7A 2C8NA 3CUGA 3VIFA 4PMXA 2DH2A 1HIZA 1XSKA 2V38A 1QHOA 4N0RA 1GOQA 1V6WA 2WZHA 3CIVA 1TZ7A 1B31A 3A4AA 4QLJA 4Y7EA 5CJ5A 1UKSA 1QBAA 3MUAA 3AS1A 3ZT7A 5D9PA 1W9PA 2WKGA 3VGFA 1HN1A 1UR2A 2VRQA 4P7LA 4OOZA 5CXPA 3FAXA 4Z2JA 1JYWA 4CD4A 1BHGA 2Z1SA 2J8FA 1GVIA 1EQPA 7CGTA 1NOUA 1BTCA 1M03A 4QAWA 2XJ7A 1WNOA 1OBAA 2JFEX 1KCLA 2VUYA 1IT0A 1LG1A 4B9YA 5A6AA 4F9JA 1ITCA 2OLHA 3WNLA 2CITA 3AMGA 1FFQA 1EIBA 3K1DA 1OB0A 2WAGA 3MUZ1 1E1FA 1PZ3A 2UY3A 2YBUA 1GONA 3WQVA 1CGWA 1XCWA 4HOXA 3OZPA 1LL7A 1VJSA 1G0CA 3N15A 1SYTA 3EMZA 4R27A 1B3WA 5I6SA 2WB5A 4OBSA 5CPSA 2WM0A 1ISWA 3SUVA 4FK9A 1MQPA 1UOKA 3L4TA 3OLEA 2WVVA 1H1NA 3CGTA 1E56A 2WSPA 3BH4A 4PTXA 2G3JA 5BXPA 2UY4A 4HZ6A 2ZOXA 1SMDA 4HTYA 1VJZA 4PMRA 2X1IA 1C90A 3AMLA 1XC6A 3RIKA 5BRPA 4HP5A 1TFVA 4ZENA 4JHOA 2XVLA 3WQ5A 2XVPA 1IZJA 2J79A 3AZRA 1B3YA 5M3WA 4R5EA 3VINA 2GJPA 3WQ8A 1UR4A 1MQQA 1J0IA 1EH9A 3GH7A 1E6XM 2DSZA 4ZXOA 1J0HA 2FGLA 1LQ0A 4PUDA 2ZX5A 4KGLA 3BAWA 5CPQA 3WMCA 5ABFA 2WWDA 3WDQA 5BXSA 1GJUA 1WE5A 2WMJA 1H0IA 1ESWA 3AIBA 4QCEA 3W4RA 1C8QA 1MXDA 3W25A 3LMYA 2WVVB 5A6BD 1WZMA 2XFYA 4IM4A 3PZIA 8A3HA 4EAMA 1M53A 5A8NA 2NSXA 2VX4A 1TMQA 1JAEA 4HMCA 1LJYA 2QHAA 2F2HA 4AMCA 4CD7A 1E6ZA 2YDRA 1KXQA 4UFKA 4J7RA 2DT3A 5E6ZA 3WNOA 2FDMA 2D20A 3F5JA 5DT5A 1KGXA 4UOJA 3VM5A 1C93A 2CPUA 3AIEA 5BCAA 5ABFB 3WL0A 2CIPA 1E0XA 4ML4A 2Y8KA 2WLYA 1E4MM 4L4PA 1UH2A 3ZJKA 2VR4A 5BRQA 1Z32X 4CD8A 2E8YA 4CD5A 5FL1A 3VDAA 2OSWA 3WD0A 2WANA 4UQBA 4TX6A 3TTOA 3CBWA 3KL0A 1AQHA 3ZR5A 5HOSA 5AC4A 1E72M 1ZU8A 4GKLA 2YKKA 4W93A 4J3VA 3CH9A 4UOZA 1R86A 1B3XA 4M81A 1TUXA 1W2PA 2WCGA 3CUHA 3L4XA 4CD6A 1V6VA 4W7WA 1B2YA 7TAAA 2UY5A 3VTRA 4C7FA 3I3EA 2DT1A 3MS8A 1E6PA 1ECEA 5IFTA 4QP0A 4TTGA 3LPPA 2BHUA 4PMNA 2W92A 3K4AA 1NP2A 3IJ8A 2DT2A 1VF8A 3N1AA 1MWOA 1UD2A 3SCUA 3HU7A 3VPLA 2FH6A 1CNVA 4H8HA 2E4TA 2WMFA 2OWXA 1UWTA 4A3HA 4PUEA 5A3HA 3CPUA 2VVNA 2GUYA 4ZFMA 1HKJA 1V0NA 2D1ZA 2J7BA 2G41A 1I1WA 3VIOA 2WLZA 2G8ZA 2XUCA 3WD2A 1G1YA 1OT2A 4XUYA 3BMWA 1KB3A 1GORA 4EKJA 2BVTA 4M82A 3AHYA 3EDJA 1EDGA 3WF1A 2D24A 2V5DA 4OBRA 4J3SA 3BAKA 2XVNA 2O9OA 4JL2A 4FLQA 4OKDA 3CMJA 4WKAA 4ACYA 2WC3A 1OGBA 2E9LA 3WH6A 1UR9A 2Y2WA 3AS0A 2ZUSA 3NSMA 3PZUA 3MANA 5A2BA 2CXGA 3VVGA 2YLAA 2WK2A 1UA3A 3B9DA 3OA5A 2VOTA 4QLLA 2QPUA 1JFXA 1CLXA 4AZ7A 5A6MA 2CETA 1HJUA 3AZSA 4D6HA 2BXYA 1VENA 2VRJA 3WMSA 1C92A 1W3HA 1CTNA 1NOFA 3WDHA 4CCCA 4AZ5A 1ODUA 5F7UA 1VAHA 1KBKA 3CHCA 2W66A 1V6XA 1RH9A 2X8RA 2A3CA 3GDBA 3AQUA 4JZ5A 4FLSA 4D71A 1CENA 2AOSA 1BF2A 5ECUA 4AISA 4MAZA 1W1YA 3K8MA 2J78A 1Q6DA 4Q7NA 2ZICA 4IISA 3WDRA 1UWUA 3S6TA 3ZIZA 1HNYA 3M07A 4P7OA 5EMYA 4JCMA 3OLDA 4JKMA 2BV9A 1HP4A 1J12A 4RE3A 4PYSA 5IHRA 1GVYA 3UESA 1PPIA 1JIBA 1HJXA 2D23A 3WQWA 1JD7A 1FFRA 4GI9A 2YA1A 1CPUA 5FIPA 2GK1A 4AYSA 1L0PA 1WZAA 1HXJA 4TVUA 2QMKA 1FH7A 1E4IA 1DP0A 3CZLA 5BROA 4U2ZA 4MB1A 1VBUA 1E71M 1Q6CA 1HJVA 3DYOA 1JZ5A 3O6AA 1GJWA 5IHSA 4MTVA 4LYPA 1UZ1A 1QVBA 3N9KA 2W4XA 3WD4A 1DWIM 3EYPA 4OOUA 1TVNA 2VJXA 3ZT5A 1UQZA 1XSIA 4Q22A 1BFNA 3VDCA 2D2OA 2DIJA 1E3XA 5A6KA 1CYGA 3RO8A 1ISVA 4KGJA 2RGLA 2J7CA 3OGVA 5DEZA 3MUIA 4CVWA 3M7SA 1A47A 5I24A 3K8KA 1TR1A 3PZQA 1J0KA 4BS0A 5A6JA 4UQ9A 2XFRA 1VFFA 1BSIA 2VCCA 4MNMA 3UG3A 2GK1B 4GPNA 3QGVA 1WP6A 1NWRA 2Y4SA 1JDAA 3OIHA 4E8DA 3WY1A 1QOXA 4PMQA 3IK2A 1KGWA 4ACZA 2J62A 2JF7A 1ZBCA 1OD0A 1CZ1A 4W89A 5A6LA 4WSJA 1E5NA 4HZ7A 1WDSA 4PEEA 3CO4A 2BS9A 1HJSA 3ZQ9A 3SCSA 2VQTA 3KZSA 2WKLA 1TE1A 2XIIA 4FF5A 4PMOA 1CGYA 1P6WA 3NDZA 1CBGA 4UFJA 4U33A 1VFOA 2CKSA 3MUY1 3W38A 4CKQA 3VD5A 4U31A 3DYMA 1KGUA 2WHJA 2EPMX 1YHTA 4Z2IA 5DMYA 3AHXA 2D0FA 2VNCA 3L4ZA 4ACZB 1Q6EA 5CSUA 4BQ2A 3I3BA 5HDRA 2G3NA 4MNKA 3TA9A 1JDCA 1XCXA 2XG9A 1V3HA 3ZT6A 3A3HA 2F61A 3N12A 3SCVA 3WH9A 2PBOA 3UCQA 5I5RA 2E9MA 4H2CA 4WKHA 3KL5A 1I75A 1XD1A 3WUFA 1C7SA 1XHGA 4AXNA 4ATWA 1MW2A 3DECA 2ZUVA 1JXKA 2Q8XA 4P8UA 3W82A 2VZTA 3IAPA 4JFUA 3NDYA 4B3KA 2O92A 4AZGA 3T0DA 3WENA 3IANA 1H2JA 4GZIA 2VI0A 2OWCA 3SEPA 2C7FA 2D3LA 1UD6A 2XM2A 1JL8A 1W91A 2VZSA 4A3YA 3AXXA 1W9XA 2WCAA 3NYDA 1ZBVA 3EDDA 1NWTA 2XGBA 3AIWA 3PZGA 4AC1X 2W61A 1BPLB 1NH6A 3G6LA 1PX4A 1D3CA 1XD0A 2BNJA 1W32A 2ZUUA 1MXGA 4OZOA 2GDVA 2QF8A 2VZOA 3MMUA 3U7BA 6TAAA 3BLPX 1KQZA 2EPKX 3WUEA 2WBKA 2Z1KA 3U5YA 1M04A 3GBEA 1KQYA 2WPGA 4E8CA 5D9MA 1R85A 4OJYA 1J10A 4UTFA 2ZUTA 1EDQA 4Z2LA 4DUWA 2YA0A 1US2A 4V28A 3K8LA 2XSBA 3POHA 4UCFA 1CXFA 2B31A 1GHRA 5ABGA 4F8XA 3NSNA 5LYRA 1EO5A 4PMZA 5A2CA 2VR5A 1ZBWA 3PHAA 4PTMA 1R87A 4QDMA 5LA2A 1XV8A 1X6NA 1Y7VA 3AIVA 2NT1A 3JUGA 4Z2KA 4TVCA 2XPKA 3N04A 2ZWYA 3BMVA 2DDXA 2PI6A 3AFBA 1QW9A 3PN8A 4EE9A 4DWSA 4NRRA 4M80A 1PAMA 2J75A 1XYFA 4W87A 4YHEA 1J01A 5AYBA 2VO5A 1S46A 2J25A 2G4FA 3AXIA 1UKTA 4AD4A 1K9EA 1HL8A 1G94A 3FY1A 3ARXA 2W63A 2BHYA 2BY2A 1AQ0A 1OT1A 3F4VA 3VDHA 1VRXA 1DWFM 1OWQA 5A8OA 5HPOA 4EK7A 1V08A 3RPMA 1B3ZA 2WNWA 4GI6A 4WSKA 3MMWA 4U5IA 1QNRA 3L4WA 3VIPA 3UG4A 1UZ4A 4AEFA 2A3HA 4MB5A 5I3DA 1HKKA 1JI1A 3ZM8A 3T09A 2PWHA 4YN5A 4W86A 2OYMA 2WYSA 2J7EA 5CGMA 1WPCA 4GZEA 5KZ6A 4MB3A 1CGVA 1MW0A 3FN9A 3ARRA 4DWSB 1D7FA 1GQJA 2Y8VA 1CXLA 1PEZA 2BVDA 4BQ3A 1WAWA 4HZ8A 1QNSA 7A3HA 3A47A 4ZE4A 4D6EA 2YIHA 3PTMA 2W67A 1VEMA 4P8VA 3VKKA 1K9DA 3SCRA 4TXEA 1CGUA 3VDBA 1VFUA 4LYRA 3ARTA 5IDIA 1NP0A 1QNOA 5GPRA 2YDSA 1HVQA 2VZUA 3GNRA 1E43A 4HU0A 5M5DA 2NT0A 3AMKA 5GNXA 1JYXA 3WQ4A 2YJQA 4XZWA 3EDKA 3SIMA 1V3KA 2C0HA 3FHQA 1B30A 2PF0A 3AYSA 3RJYA 4AZBA 3AMCA 1EXPA 4LGXA 5I2UA 1GQLA 3U5UA 5LA0A 1NWUA 3WF3A 1H5VA 3SUTA 2YLLA 5A69A 5HBFA 1U30A 1QPKA 1UWIA 4Z2HA 2E0PA 1B0IA 1EHAA 4J3UA 5EFDA 1X1NA 2CEQA 2XIBA 4CU8A 3RMEA 1RPKA 4CVUA 2O9TA 3AS2A 4PSPA 5C70A 3SCNA 2WVTA 3WDJA 1LF1A 1J11A 3QOMA 3AIUA 1FOBA 2D0GA 2EBNA 3VNYA 1IV8A 3AHTA 4MNLA 3ARUA 4MDPA 1E6QM 3KWXA 3O9NA 2VC9A 5A8MA 6A3HA 2WMKA 4KRUA 3CZ8A 2BY3A 1V03A 3FNDA 1E1EA 2TAAA 1C3FA 1V6YA 1MFVA 1GZJA 3G6MA 1CWYA 1W1TA 3A4XA 1WDRA 2CHOA 2DSVA 2FHFA 1E4NA 1W3KA 1W1VA 4C7GA 4M29A 2DEPA 2WHKA 3W6LA 4AD3A 1WZLA 2J7DA 3BSGA 3GH5A 3MO4A 1W2VA 1WZKA 3IJ7A 3SCQA 4GO9A 2PWDA 1WDQA 5D9OA 3CHFA 1UH3A 1QNPA 2A3AA 1FH9A 1UWQA 3ARYA 4U3AA 2Y24A 1I1XA 1QI5A 1GQKA 1DWJM 1NARA 2WMHA 2XTKA 1GUVA 3AIRA 5FKYA 4N42A 2VRKA 1JF6A 4IPNB 5GNYA 3IAQA 4AIOA 2BHZA 4NRSA 3VIIA 1XGZA 2CBVA 2DSUA 1UWSA 1EGZA 2GJRA 3DHPA 2XSAA 4LQ1A 3WH5A 3QOKA 3CUJA 1KWGA 1DWGM 4IPLA 1V02E 4NZCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1GOM A;  4B15 A;  1DWA M;  2G3M A;  3AJ7 A;  3GNP A;  3OGS A;  2YL6 A;  3I3D A;  1LG2 A;  3WL1 A;  2EEX A;  2VMF A;  1H41 A;  3L2L A;  1Q6F A;  2X09 A;  3ALF A;  1UUQ A;  4RE4 A;  4S3K A;  1H09 A;  1QW8 A;  2CHN A;  3ZR6 A;  1CIU A;  4B3L A;  1JGI A;  3OB8 A;  1KXT A;  3NUK A;  3ZJ8 A;  1CLV A;  4CCD A;  3W0K A;  1XH0 A;  3ALG A;  5JBF A;  1C7T A;  4PMU A;  1E3Z A;  4LPC A;  4J3X A;  4F79 A;  4RE2 A;  2ZUN A;  5HXM A;  1V0L A;  3GNO A;  1AMY A;  1K6A A;  3J7H A;  1OIM A;  3WNN A;  4FMV A;  1GNX A;  2PWE A;  2XFF A;  1ZS2 A;  1JD9 A;  3AIS A;  4UQA A;  5AYI A;  5AY7 A;  1WDP A;  2ZX6 A;  1ZB5 A;  1HP5 A;  3VMO A;  1TVP A;  3OLG A;  4WF7 A;  3ARO A;  4UFH A;  1XRV A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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