4DWSC

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
539
structure length
526
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGEIYLKSISEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 184
structure length 526
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsC01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsC02
3MSGA 3RM4A 4BA0A 1LF1A 1E73M 3L4XA 1K9EA 3WBEA 2W67A 4B16A 3RILA 1E5JA 1TVNA 3OLIA 2J47A 4X0NA 2UY4A 3VNZA 4U3AA 3SCWA 1JZ6A 5EB8A 1BYAA 1JG9A 1UH4A 3W27A 3AHYA 3WDQA 2CPUA 4EKJA 2XYLA 1J0ZA 2GSJA 1CIUA 1FH7A 2CEQA 4W7UA 1RP8A 3CHCA 2VI0A 1GHSA 2NT1A 2A3HA 3OBAA 1EA9C 2WNWA 4AZ5A 2PI6A 4Z2IA 4YHEA 3GXIA 4UFLA 1ZB5A 3IJ7A 4OIFA 2VVSA 5A8NA 4JFTA 2OSYA 3WD4A 2A3EA 2F2HA 1W1PA 3CHFA 4W8BA 2GJXA 3FAWA 1H2JA 4V28A 2W62A 1C3FA 3AYSA 1E6SM 1D7FA 1H41A 4OZOA 1GOOA 4C7GA 1U2YA 2WKLA 3VVGA 4GPNA 3VILA 2XVLA 3HU7A 3AYRA 4IPLA 3WF2A 3CUFA 2XG9A 2WBKA 3WSUA 1CZ1A 1W9VA 3ZJ7A 2V3EA 2VCBA 3A47A 4F9DA 2YL8A 2VO5A 3GBDA 3NUKA 4J3UA 4AZHA 5HOSA 5FOOA 2J7FA 3AJ7A 4M24A 3GH4A 2EEXA 4ACZB 1Q6GA 1PAMA 4W89A 2GJRA 2BVTA 4NRRA 5A94A 4GKLA 3QHNA 4D6GA 4UZUA 1E1FA 1WO2A 1KB3A 5HDRA 3VD5A 4W93A 1E4NA 1CLXA 3HJEA 3G6MA 5HPCA 3VM5A 1DHKA 3S2CA 5LA1A 4CCDA 4CCCA 3BLKA 3W0KA 2QLYA 3BCFA 4AYSA 2WMIA 1NWSA 2ZUMA 2VZOA 4Z2KA 1UHVA 5A8MA 2ZX6A 4JFVA 2WHMA 2BV9A 1DWJM 2WHLA 2J7EA 4PTWA 1B0IA 1ZS2A 3D3AA 2UY3A 3AS3A 3AZRA 4HU8A 1DWFM 3WMCA 1LWHA 2VZVA 1UD3A 3AMCA 2XSAA 4AZGA 5HPOA 1VF8A 1HJSA 4V27A 1PJ9A 3WQ4A 1JYVA 1Q6CA 1I75A 1E55A 4W8LA 1XD0A 4CVWA 2WZIA 5DO8A 4AZBA 2BNJA 2WC4A 4N0RA 3TTYA 3WQ5A 2O92A 5D4YA 4ZFMA 1I1XA 4U2YA 4AZCB 3E1F1 4UOZA 2X09A 5CJ5A 2YL5A 1V02E 4WSJA 2G3NA 1XV8A 4D6CA 4AZ7A 2WMGA 3BAJA 4ML4A 1YQ2A 1QNRA 2WLZA 1QNOA 2JALA 1GQLA 3PN8A 1JXKA 5ABHA 2B31A 2J7DA 5BWFA 2G3JA 3VIFA 1XYFA 1X1NA 4TUFA 4CD7A 3OGRA 2D20A 4GO8A 2DT0A 3WMBA 1VFUA 2YBTA 2V5CA 3DHUA 4QP0A 3CZJA 4ATWA 3WDHA 1UWUA 4UQAA 1RP9A 1WPCA 1CTNA 1C93A 4E8DA 1UKOA 5BXSA 2WSPA 3WNNA 3WD0A 2D1ZA 1BVNP 2W61A 1MQQA 1JYNA 4R27A 3UG5A 3ZR6A 1UKQA 1RPKA 4KRTA 2RGMA 2WWDA 3WIJA 1I1WA 2V38A 1ITXA 3WNKA 3VIPA 1UA3A 4PSPA 1HL9A 2J4GA 2OWXA 2VTFA 3CUHA 3IANA 2Y24A 2YA0A 2C7FA 4UOQA 4PRWA 4PTVA 1CGTA 3GXFA 1V08A 1KQZA 3ZJKA 1OM0A 3CZEA 1H3GA 2NW0A 2WMHA 4BQ4A 2BS9A 1GVIA 1QHPA 4HZ8A 3B9EA 4YN5A 1B3WA 1B3XA 4PMZA 3WEMA 1PPIA 3FHAA 4J3TA 2DEPA 1FOBA 1US2A 3QHOA 3AS2A 1BYDA 1JZ4A 1V0KA 5ABGA 2IXUA 1E70M 3VD7A 3K8KA 1J11A 1E4IA 3KE0A 1FP8A 5BXRA 1V3MA 5JBDA 8CGTA 3WDIA 1QHZA 3W37A 2WVVB 1E4LA 2W63A 4Q7NA 1CXLA 4MB1A 3SCQA 3SUSA 3AXHA 1PX3A 4HOWA 3WFZA 2DT2A 4WIWA 1W9UA 5I79A 1FP9A 1KXTA 2EXOA 3ARRA 2ESCA 1ITCA 1R7OA 4X0VA 1V0LA 3FW6A 5D8ZA 2F8QA 2VX4A 1UD8A 4AEFA 3CZGA 4F79A 4KGJA 3VD9A 3AISA 3WEOA 3K8LA 1IZJA 1B9ZA 1DWGM 1UZ4A 4N42A 3A4AA 4DUXA 3DECA 1KXHA 4J27A 3MMUA 1SMAA 4WKAA 1E9LA 2VRJA 2AAAA 3VMPA 2PWFA 2O9TA 1NOWA 2QMJA 2HISA 3U5YA 3U5UA 1Q4NX 5A95A 3OLDA 4KGLA 2V3GA 1OBAA 1QVBA 1W3KA 3L4YA 3L4TA 4TX6A 2J62A 4H2CA 4JCLA 3WNPA 5FL0A 1VJZA 1R85A 4QLKA 1HJWA 3EBVA 1XC6A 3EDJA 1VFOA 1ZBWA 2E9LA 2OYMA 4D1JA 3W82A 3VIMA 1HJQA 4UQ9A 3AHVA 4JFSA 1CNVA 3ARUA 4JL2A 2YA2A 2ZXDA 1LLOA 5A2CA 2ZX8A 5BRPA 1GOKA 3PBGA 4F9JA 3MSDA 5M3WA 4M29A 1N82A 2E9MA 4KRUA 4P7LA 3WNLA 4ACZA 4TVDA 1B30A 3N15A 3PTQA 3VIJA 3CLWA 4HPGA 5M5DA 3D5HA 1HKMA 2VMFA 2GJPA 3KL3A 3L4WA 7A3HA 3WDJA 3WY1A 1BLIA 1C91A 1UD2A 3AS0A 4A3YA 3ARXA 1UOKA 3PTMA 3F5LA 3CUGA 3K4DA 1MFVA 2CBJA 2BVDA 5C71A 4ZXLA 4MNLA 1EDGA 3VX0A 1NWUA 2XGBA 4UFIA 5GNYA 4S3JA 1FH9A 2QF8A 2FH8A 1VFFA 1VIWA 4MB5A 1G1YA 5JBEA 3WMSA 2DT1A 4RE3A 1WZMA 1UG6A 1E6ZA 3WD2A 4MNKA 3N18A 1EQPA 3WDRA 3WQVA 1OWQA 3PZUA 1KR1A 2VL4A 3RPMA 4D71A 1Y7VA 3CBWA 1GJUA 4FK9A 5FKYA 2ZWYA 1CXEA 4J3VA 2JIEA 1UR1A 5EFFA 3WENA 1JDCA 3WD3A 4DWSB 1XGZA 5AYIA 1W1TA 3ZJ8A 4EANA 1O6IA 4MDOA 4J28A 3N04A 1OD0A 4CN6A 2FHFA 1VB9A 2J79A 2ZUTA 1F4AA 1UR0A 2YJQA 5A6KA 1W9PA 1QI4A 2BY1A 5A6SA 1QI2A 2ZXQA 1UKTA 4M80A 3EMZA 1BG9A 1JL8A 3MUAA 2A3CA 1E6XM 3SUTA 4MNJA 1UR9A 2XJ7A 1KGWA 3BSGA 3NYDA 3WELA 5KEZA 4CU6A 5CQ1A 2FGZA 1EDQA 1EO7A 3EMQA 1H0GA 2GK1B 2PBOA 2VR4A 3K46A 1R8LA 5M03A 2W92A 3T09A 2J78A 2YLLA 4HMEA 1W9BM 4XZWA 1W3LA 4JZ5A 1UR4A 1VRXA 3WF1A 2WMJA 3SCTA 2WCAA 1LL7A 4QCFA 4PMOA 1QNSA 1Q6DA 1VEMA 3SIMA 4NSBA 1M03A 3RM8A 3QGVA 3NDZA 2DH2A 1FFRA 5E0FA 2CETA 1KXVA 3WKZA 2J7HA 2OWWA 2XIIA 1VAHA 4PYSA 3ARPA 4QCEA 3TTSA 1H49A 1R7AA 2CESA 3L4ZA 3UG4A 4B3LA 2QHAA 4LYRA 2X2YA 2Z1KA 2RGLA 1NARA 5CPTA 1HIZA 3VNYA 3M6DA 4TTUA 5BCAA 4L4PA 4AD0A 1GUVA 1TG7A 1QW8A 3K8MA 4GI8A 1EOMA 2XSBA 2EPOA 1C8XA 4D6HA 3DYMA 1ZJAA 3IAPA 1MW3A 1JYXA 3U7VA 1DWHM 1ISZA 4W5ZA 3KL0A 3VGDA 1KR0A 3ARTA 5IFTA 2VJXA 1FH8A 1LL6A 1E6NA 1E43A 1HP5A 3BSHA 1BVZA 2QPUA 2YBUA 4AD1A 5JIPA 5E09A 3WBAA 4AISA 4UQBA 2VZTA 1PIFA 3AXIA 3W81A 3QR3A 2WVSA 3K4AA 4IM4A 1QBAA 3PZVA 3ZMRA 5JUVA 1UA7A 3OGSA 4AC1X 3CMGA 4ATLA 5A8PA 1GOIA 4LX4A 3T2PA 2JEPA 4A3HA 4CKQA 2DPEA 2OWCA 1Q6EA 2D22A 1K9DA 3CTTA 1FHLA 4F8XA 3DYOA 2XGIA 2OLHA 2O9OA 5CZKA 3W26A 1JYWA 2CBUA 2A3AA 4CD6A 2TAAA 1CDGA 1UQZA 2V3DA 3GBEA 1V6UA 4LPCA 1BFNA 3WQ8A 3VUPA 2Y8KA 1B3VA 3LPFA 3VGFA 3T0BA 1E0XA 1JXJA 3SEPA 3VDCA 1C8QA 3DYPA 1ECEA 5GNXA 5LYRA 3LMYA 2WYSA 4X9YA 1K6AA 2DIJA 2DDXA 4XX6A 7CGTA 4YHGA 3U7BA 1LG1A 2EPKX 1QOXA 1XCWA 1J0HA 4PMDA 2Y8VA 3WH7A 1G9HA 2BY0A 1WB0A 1BGGA 2GUYA 5A6LA 4CN1A 3VGHA 2BY2A 1XYZA 2CERA 5DT5A 1TR1A 3N11A 1VENA 2X0YA 3GM8A 3MMWA 2VRKA 2WWCA 4PMUA 4JFWA 1CECA 2C0HA 1SR0A 1JZ8A 4JHOA 4EE9A 2DT3A 2J77A 3N12A 1OIFA 4PSRA 2WZHA 5JH8A 2XHYA 3OG2A 3MU7A 1HP4A 4UNIA 5ABFB 1KBKA 3OIHA 4J3XA 5GQBA 2YKKA 4FMVA 5AYBA 1JFHA 1TUXA 1JD7A 1KFWA 4AEEA 3W4RA 3SCOA 3BAIA 2ZUUA 3PZQA 3GDBA 1CYGA 3ZO9A 1K9TA 4B9ZA 3APGA 3ARWA 5CPQA 2WHKA 2J25A 1BQCA 1V3IA 3PZMA 1M04A 4WKHA 2MANA 2BY3A 5CSYA 3TA9A 2WMFA 1UKSA 2VX7A 3BAKA 3VIKA 5HNNA 5C8BB 1IT0A 2VURA 5A1AA 6A3HA 2HVMA 1V0MA 3PZ9A 1EOKA 3LPOA 4KH2A 3TOPA 1NOFA 4QLJA 2DSVA 3WN6A 1HVXA 2DGAA 1UD6A 4HA1A 3T08A 4OOUA 2VX6A 2XPKA 4Z2LA 1QHOA 3RIKA 4UFHA 1PZ2A 2YLAA 4W5UA 4UOJA 1UUQA 3DC0A 3ECQA 2AOSA 3AQUA 2D3LA 3ZSTA 4URIA 1JNDA 3ZQ9A 1ZBVA 4JCMA 4OJYA 4D6IA 4TTGA 4D6EA 4Z2HA 3VMNA 3FY1A 1E0WA 4IISA 4UQDA 3OA5A 3TP4A 4WSKA 2Y2WA 3J7HA 3WQWA 4PMRA 1U33A 3VIIA 2XFRA 3WEZA 2OSWA 3ZT5A 5DEZA 3N1AA 3WF0A 2Y5EA 3AIBA 3CZ8A 1W91A 4CUCA 3WQ6A 5HXMA 3AIWA 5A2AA 3VDHA 1OINA 1BTCA 2DH3A 5I6SA 2WCGA 1JZ3A 2G3MA 4U2ZA 3A3HA 3SUVA 2CXGA 1KWKA 4LYPA 2J7GA 1VEOA 2YA1A 1QI3A 1QNPA 1GOQA 1GQJA 3BXWA 1WP6A 1VFMA 4J7RA 1ISVA 2NT0A 1JF5A 4M56A 1E5NA 4H41A 3L2LA 4TX8A 1NWTA 4WK9A 1C8YA 4PMYA 1E3XA 1V3LA 5FL1A 2VC9A 1LWJA 1XSJA 2PF0A 1WZAA 2E0PA 2D3NA 5GNZA 1TA3B 2VNCA 1HNYA 4HMDA 4CU7A 1RD6A 4K68A 3HN3A 1MXGA 5AC4A 3S6TA 1AQMA 5LA2A 3T2OA 3F5JA 4CGTA 4MTVA 4OBSA 1R87A 2VZUA 3N17A 4BS0A 5CGMA 4OBRA 1UWIA 2CITA 1C7TA 1J0JA 2WCSA 1NP0A 1NWRA 3AIRA 3WL0A 3PHAA 4KWUA 3T2QA 1OT1A 5E70A 4EAMA 3WUFA 2XFYA 3ARYA 1EO5A 2PWDA 3RO8A 1AMYA 1PZ3A 2CBIA 3IK2A 1HJXA 2VX5A 4WKFA 1DP0A 1LL4A 2G3IA 3UERA 4TOQA 4HOXA 2XM2A 1UR8A 2ZICA 3CGTA 4NZCA 2D23A 2G4FA 2GJXB 3I3BA 1KXQA 4JL1A 2XUCA 1TMQA 1WKYA 3BMWA 4V2XA 5A6MA 4HZ6A 3OB8A 1CGUA 3CUIA 4PTMA 4HOZA 4QLLA 6TAAA 2WXDM 1V6YA 1E6PA 4CCEA 1LJYA 2DSZA 3CZLA 2ZXAA 1GZJA 1TFVA 3SCPA 3N9KA 1UWSA 2JIWA 3WL1A 1W9DM 2XWEA 4HP5A 3UCQA 1BSIA 5ABEA 4MDPA 3UESA 1EHAA 2XWDA 5CLTA 1XD1A 4C7FA 3O2LA 3SUWA 2J8GA 4DM1A 4DWSC 1HF6A 3GH5A 4GZIA 3MV11 4A4AA 1OGSA 1H11A 2GFTA 1FA2A 3I3DA 1UWRA 1BG4A 4FLSA 1CENA 1GONA 4LQ1A 4U3CA 4GI6A 3B9DA 3ALFA 4FF5A 3ARQA 5BXPA 2OYKA 4D6DA 2PBGA 3VKKA 3BH4A 1Q6FA 2WHJA 4W7WA 1JI1A 1XSKA 2BHUA 3FXYA 2Q8XA 1OGBA 3DHPA 2CIPA 4YPJA 1PIGA 1J9YA 2VVNA 3CHDA 2E8YA 4H7VA 2BXZA 1JDDA 3AZTA 3CZKA 1HKKA 1KWGA 3L4UA 2YOCA 1B31A 1V6XA 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 3WH6 A;  1GNX A;  4HU0 A;  5I3D A;  5CGT A;  1YHT A;  1L8N A;  4GZJ A;  3OZO A;  1GVY A;  3MUY 1;  1AQ0 A;  1XH1 A;  4IPN B;  5E6Z A;  3ZOA A;  3WH9 A;  1B1Y A;  1H1N A;  4FLR A;  4BF7 A;  4NI3 A;  4HTY A;  4D6F A;  1QNQ A;  4NRS A;  5BRQ A;  1CGV A;  5ECU A;  4W87 A;  3AOF A;  1KCK A;  1OIM A;  3THC A;  3MAN A;  4PMN A;  5LA0 A;  1JZ2 A;  2FH6 A;  2VT0 A;  2D0F A;  1XRV A;  2OSX A;  2GDU A;  3FHQ A;  3VIN A;  1E0V A;  3AML A;  8A3H A;  4HA4 A;  4JIE A;  5E6Y A;  2XIB A;  4NF7 A;  1CEO A;  2X1I A;  3WF4 A;  2EPM X;  2UY5 A;  1WDP A;  2VCA A;  1JDA A;  2PB1 A;  3TON A;  3QOM A;  1B2Y A;  3NDY A;  4CN4 A;  1NM9 A;  1AQH A;  1CLV A;  3VDB A;  2CBV A;  4EK7 A;  3MUI A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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