4DWSC

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
539
structure length
526
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGEIYLKSISEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
total genus 184
structure length 526
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsC01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsC02
2XVLA 3SIMA 3VD7A 3VMOA 2QLYA 1EO5A 3EDDA 4ACYA 1V0KA 2WLYA 1VBUA 2E8ZA 3FAXA 1XYZA 3ZOAA 1ZBVA 4CVUA 3GH7A 3AISA 4TTGA 1RD6A 5GPRA 3PZMA 2DT0A 3N15A 5A6SA 2OWCA 4GPNA 1V3IA 4S3KA 2WHMA 2WCAA 1ZS2A 1NOUA 1W91A 2ZX5A 3AYSA 4AIOA 1MQPA 3TONA 2WHKA 2Y5EA 2YA1A 2W5FA 4QLJA 1H1NA 2ZX9A 1US3A 2J7HA 3WF4A 1BVZA 1KGXA 3GZAA 5LA1A 4D6GA 2DSKA 2WHJA 2Z1KA 1V03A 1NOFA 5I3DA 1ISVA 4UR9A 4F66A 1OIFA 4AEEA 4UTFA 5AC5A 2FHFA 3F5LA 4HA3A 4HA4A 4MB4A 1BGGA 4UZSA 1UR0A 1UD2A 3CMGA 5ABFB 2PWGA 2UY2A 4W7WA 3W81A 2BHYA 5CZKA 1GQKA 1OINA 1X6NA 4GO9A 4JL2A 4M24A 1HKIA 3VDBA 5BRQA 2BY3A 4B16A 3MKKA 4W8LA 4M29A 5E70A 3N18A 4M81A 4BA0A 3I3EA 3ALGA 2BV9A 1BYBA 3VIOA 4M1RA 2GSJA 3CMJA 1VJSA 3OG2A 1H41A 2JF7A 5D4YA 4MB5A 3N17A 1CLXA 4JFTA 4CU7A 2DIJA 2J7GA 1WAWA 2VX5A 2A3AA 2WMFA 4H04A 5IHRA 1HJUA 3UCQA 5JBFA 2VR4A 2BHZA 3MUIA 4D71A 1TMQA 2OWXA 1WPCA 5GNXA 1B3YA 1BAGA 5D9MA 1HN1A 2G3JA 4PSRA 3AHXA 2GK1A 2E0PA 2CYGA 3WY1A 5M5DA 3VIMA 1V3JA 3AHTA 2YJQA 1NH6A 3EMQA 5A95A 3ARVA 2EO7A 3WNKA 2XFYA 4ZXLA 2OLHA 4TUFA 3WIJA 3BAKA 4UFJA 1BTCA 3ALFA 1K6AA 2GJPA 2O9OA 1FH7A 3AZSA 3AIEA 3TTSA 5JBDA 5CPSA 2NT1A 2WVVA 4W8BA 1VEOA 3NIYA 4D6EA 4WKAA 1ISXA 2ZIDA 3LPGA 3W38A 2WHLA 4WSJA 4P7RA 4E4PA 1G01A 1XGZA 1BYDA 3SCOA 4PTWA 5A6BA 3EMZA 3W28A 4IPNB 2PWFA 4W89A 2HVMA 3SCRA 5ECUA 5IHSA 1QNRA 3MMUA 4V28A 4P8WA 3WL0A 1P6WA 3K8KA 2GVYA 3CPUA 5BCAA 3PTMA 3BC9A 2BY2A 3RCNA 2WVSA 4MNLA 1EH9A 6A3HA 3WH6A 1CGYA 3AIRA 3G6MA 3BMWA 3I3DA 2ZICA 1R7OA 1H5VA 1JFHA 2JEPA 4PMRA 4P8XA 1E0XA 3B9DA 3AROA 4JKKA 3TTQA 4CD5A 5A6KA 5AC4A 4U2ZA 3BLKA 5FL1A 2D0FA 3A4WA 1K9DA 2VZUA 1CXIA 5D8ZA 1GVYA 1JZ2A 1E5NA 4XX6A 3T0AA 3GNOA 2WZIA 3WF0A 4AIUA 2WBKA 3OGSA 1V6VA 4HMEA 1LWHA 7TAAA 2J8FA 3WD3A 1OWQA 4F8XA 3PZGA 3S6TA 4U5KA 5FOOA 1C8QA 4DUWA 3OZPA 1CNVA 1JZ3A 5CLWA 1JXJA 2VZTA 2Z1SA 2D0GA 1UKSA 4IISA 1OIMA 3CZJA 3CHCA 2BNJA 2ZXDA 1E1EA 4OOUA 5LA2A 4URIA 1Z32X 3LPPA 1ZL1A 3ZIZA 1CYGA 3ZJKA 3POCA 4CD6A 3F5KA 4HOXA 1UKTA 4AZCB 4TOQA 3AI0A 1XSIA 4ZXOA 1R8LA 2WPGA 3VNYA 3M7SA 3MS8A 3MSGA 1BYAA 4C7DA 4P7LA 1JNEA 3DC0A 2FH8A 1GZJA 3L4VA 4OBSA 1OCQA 2EJ1A 3WQ5A 1JG9A 5A6BD 3K8LA 4GI6A 5I24A 4WKHA 3W25A 1XHGA 4MB1A 2A3BA 5A6MA 4PYSA 3L4XA 2WMIB 3LPOA 2YLLA 2G3IA 2X8RA 2PC8A 3RM9A 5A2CA 5I77A 4UOZA 3TTOA 1B30A 4Z2LA 3U7BA 1GOOA 1WDSA 1BG9A 4PSPA 3AS1A 2ZWZA 1YHTA 1EGZA 4IPLA 1ESWA 4UOQA 1U33A 4K68A 4H8VA 4LGXA 5DEZA 1MXDA 1TE1A 3II1A 1ZB5A 3PBGA 5AYIA 3WBAA 4PMXA 2Q8XA 4UQCA 1KR1A 4J27A 4F9DA 3WDHA 2WVTA 3WUGA 3GTNA 3DHPA 3ARUA 5CLTA 2DGAA 3IAQA 3UETA 1K9FA 2NSXA 2V3DA 3MV01 1NP2A 3AOFA 3OLGA 4PRWA 4AXNA 1EDGA 1G5AA 4EAMA 3QOKA 1BLIA 3E1F1 3VDAA 4JCMA 2J4GA 4LYRA 4M8UA 5HOSA 1XH1A 4W87A 1NQ6A 2XG9A 1XD0A 1QI3A 4GINA 3WH5A 1DWFM 3FY1A 4PN2A 5A6LA 3O2LA 4BQ2A 3DHUA 1HJWA 1KCKA 3AFBA 3BAYA 3L2LA 4HMCA 1DWHM 3AIVA 3VGFA 1K9TA 4OOZA 3RM8A 2X0HA 3WL1A 4JHZA 2AMGA 1GONA 3K4DA 3VGGA 3VD3A 1G94A 4TX8A 1W9UA 1SYTA 3THDA 3B8SA 1X6LA 1JZ4A 1EXPA 2ZUNA 1GW1A 4LYPA 2V3FA 4D6IA 2DDXA 4W84A 4ZFMA 2VVSA 1KQZA 5TD4A 2DH2A 3PZOA 3RJXA 4AWEA 5DF0A 2JIWA 3CO4A 1E6ZA 1GPFA 3BSGA 2UY3A 3CUHA 4ACZA 4KMQA 4X0VA 3K8MA 1GOMA 3D5HA 4AMCA 3T0BA 3TP4A 1C8YA 1RP9A 2JE8A 1E6NA 3VIHA 4D72A 2BFGA 4NRSA 3OLEA 2XVPA 1D7FA 2VCBA 2VX7A 2VZOA 3BMVA 3ARWA 4U31A 3ZMRA 4CD8A 1DWIM 1BFNA 2E8YA 5I6SA 3NSNA 4PMNA 3SUWA 1KCLA 3GH4A 2WMHA 3AMDA 1YQ2A 5KEZA 5BXPA 1EOKA 3OBAA 2E3ZA 2J78A 1BVNP 3AHZA 4OZOA 3IK2A 1H11A 5C8BB 3OGRA 2W67A 1CXHA 1V6UA 4JAWA 4TX6A 4P7OA 1TA3A 1B90A 4U2YA 4YHEA 3ARTA 4W5UA 2BXYA 2VMFA 3FNDA 4AD5A 1J18A 1HP4A 2ZUMA 1EA9C 4GI8A 2WSPA 3BCDA 3CTTA 3UERA 4Z2HA 5BXRA 5A69A 2J74A 1E3XA 4XB3A 3FAWA 3T2PA 4CN4A 4J3TA 2O9PA 1TR1A 2UY4A 2WSKA 3GNPA 2MANA 3K4AA 2XSAA 2YL5A 3AIUA 1E0WA 3THCA 1B3WA 3DYMA 5CPQA 2XHYA 5E6YA 2V5DA 3B9AA 3SCUA 1JZ6A 3CGTA 5I79A 3A4XA 2EPKX 3W27A 4ML4A 1ITXA 4GKLA 1KGUA 2CBJA 1M7XA 2FHBA 4Q22A 5EFDA 2YKKA 4B3LA 1W9DM 2YBTA 2ZX6A 2J7BA 3VM7A 2X1IA 3CUIA 4V2XA 1Q6GA 1IZKA 1NM9A 2GJRA 4D1JA 3PTQA 2DPEA 2G8ZA 2VCAA 1EDQA 1WZKA 4WLCA 2WC7A 3NCOA 1C90A 1GQJA 2YLAA 4HU0A 1WDRA 4AY1A 1CIUA 2XTKA 3WH7A 4AZBA 3T08A 2OYKA 1E3ZA 4MAVA 2CERA 4AISA 3RIKA 2XSBA 4JHOA 5BRPA 1EO7A 3WMBA 5BXTA 1L0PA 3ZJ8A 4A3YA 4FLSA 3W4RA 1B0IA 4WKFA 3L4YA 5CG0A 3QHNA 3W6LA 1OGGA 2ZOXA 5I23A 4CD4A 1GNXA 4D1IA 4PMZA 4AYSA 2DEPA 4UQEA 2XFFA 3PZ9A 3VDCA 1W2VA 3VGEA 1H0IA 1M04A 1CLVA 2XIBA 1KBKA 1Q6DA 2CXGA 2D1ZA 5JH8A 3GXIA 1C92A 5D9NA 1EQPA 3VDHA 4MNJA 1E72M 2E4TA 4J28A 4BQ3A 1CECA 4WJXA 2GK1B 3U57A 2BVYA 3VIPA 1H4PA 3ARZA 4GXPA 1V3MA 1WZAA 4PMQA 2QPUA 5A94A 4LX4A 1MWOA 4BQ5A 3RPMA 5E0FA 1C3FA 2QHAA 5EMYA 1W3HA 4PBGA 1IT0A 3KL3A 4XV0A 1UR9A 2C8NA 5GQBA 3VGHA 5CGMA 2ZE0A 1XSKA 1B31A 4PUDA 2WVVB 4M56A 3WF3A 2C0HA 3T0DA 1QHOA 5CPTA 3VO0A 2CBUA 3HMCA 2A3CA 2VX6A 1JD7A 4H7VA 1E1FA 4ATDA 3WKZA 1B1YA 2ZUWA 3VILA 4L4OA 3WEZA 3BAXA 2QV4A 2XVGA 4OJYA 1OT1A 3QR3A 3DECA 3MV11 4HZ6A 5A8PA 4D6FA 3BCFA 3U5YA 3W24A 1VFMA 4CN1A 4AW7A 4HMDA 1B3XA 1V3LA 4RL3A 1PX4A 2YBUA 4W88A 1LG1A 5I78A 1QNPA 3UG3A 3PZTA 3CHEA 3GXDA 3VPLA 4UFHA 3SCWA 2Y8VA 1J10A 1XCWA 2ZUUA 4JKMA 4U3CA 4WSKA 2D20A 1UKPA 3WUBA 1MVYA 3PZVA 2G3NA 4XZWA 4E8DA 1TCMA 3WF2A 1UWUA 3IANA 1JI1A 2BXZA 4PUEA 2VNCA 3I3BA 2EXOA 4GI9A 2D2OA 4JFUA 1CENA 4B9YA 5HPOA 5IDIA 1VFOA 4CCDA 4UCFA 3WNNA 1DHKA 3WNLA 1NWRA 4Q7NA 2FHCA 1E15A 4TVCA 2W62A 3NDZA 4B15A 5BYWA 3HN3A 3KWXA 2DIEA 3EDKA 1CGXA 4HOWA 5F7UA 2OYMA 3ZT7A 3WDRA 4RE3A 2G4FA 7A3HA 1B9ZA 2EBNA 1EOMA 2CIPA 2XPKA 5BROA 1UD5A 1HJXA 4CU8A 3VMNA 2ZUVA 3GM8A 1VEMA 5ABEA 2WC3A 5FCZA 1ISYA 1FFQA 3FW6A 2WZHA 1VFFA 3RM4A 1UZ4A 5HPCA 2YDSA 3ARPA 1VB9A 3A47A 4JIEA 3AS2A 3QOMA 1GHSA 3QHMA 1R86A 3K1DA 1LLOA 3MU7A 3AMLA 2BVTA 2WAGA 3VX0A 2EEXA 2YL9A 3ECQA 1QPKA 2WVUA 2C7FA 4W5ZA 6CGTA 1LJYA 4FLRA 5A8MA 3EMCA 4P8VA 4ZENA 3N9KA 3PN8A 3WNPA 4KGJA 1UWQA 1H2JA 2WBGA 1MW2A 2X05A 1WKYA 4H8HA 2ZWYA 1HVXA 2DT1A 2JF6A 4D6DA 4DUXA 3QHOA 3EYPA 3K46A 3FN9A 1UD3A 2W66A 3BAIA 4DWSA 3W53A 1TVPA 1QBBA 2ZUSA 3SCSA 3SUTA 3OIHA 1OM0A 1S46A 2FGZA 1J0ZA 4PMDA 3VX1A 3A4AA 4MNMA 4MJ4A 4E8CA 2RGMA 4J3SA 3CIVA 1N82A 1R87A 1J0JA 3AQUA 2ZX7A 3EDFA 3S2CA 3BGAA 1JZ5A 2WW5A 3N13A 2J7CA 3PZNA 2E9LA 5I2UA 3GDBA 5HNNA 2XVNA 2YA2A 1QHPA 3CH9A 5LA0A 5ABHA 3MO4A 3WQ6A 3WEMA 2VTFA 4GO8A 3U7VA 2F2HA 2D3LA 3LPFA 4WK9A 3SCPA 3EDJA 4GZIA 1X1NA 1E4IA 5JBEA 3RO8A 2DSZA 3CZEA 1VENA 2PBOA 3LMYA 1JYNA 2VOTA 1LL7A 5E9AA 4OKDA 3L4TA 1QNOA 2VRJA 3CZKA 4NRRA 2WCGA 1VIWA 3OLIA 4PMVA 1UR8A 1QI2A 3L4ZA 3CUGA 3U5UA 1HT6A 2QMKA 4H2CA 3ZT6A 4QP0A 5A1AA 3ZR6A 3WNMA 5HXMA 3A6OA 5CJ5A 4CN6A 2GFTA 1ZBWA 4ZE5A 4HTYA 5CXPA 3ZO9A 4U33A 4KGLA 1E43A 1FOBA 5C70A 4M82A 1VEPA 2EPNA 3MANA 4EE9A 1HKKA 3WUFA 1ZJBA 1PZ3A 3GXMA 3M46A 9CGTA 4ACZB 1UHVA 5E6ZA 1A47A 1WP6A 2XGBA 3NSMA 3BH4A 1OBAA 3WD1A 2EPOA 1PIFA 4MADA 2X2YA 3AXXA 4JFWA 4FK9A 1WCGA 4DWSC 3VD9A 4DWSD 1HJQA 1W9BM 2BY1A 1VF8A 3L4WA 1CXFA 4R27A 1CXLA 1KFWA 1WB0A 3N12A 1NP0A 1XCXA 2CEQA 3VD4A 4AZ5A 1J0KA 2E9BA 4DM2A 1JDDA 1UOKA 4LQ1A 2D22A 1FHDA 2X0YA 4NF7A 2V3GA 1WE5A 2CITA 4IUGA 3WDQA 4ZE4A 3IJ7A 4AD4A 1Y7VA 1UYQA 3GYCA 1FP8A 4ATLA 1UR1A 4TTUA 1TA3B 2DH3A 1TVNA 1V6YA 2O9TA 1BG4A 2PWHA 4GQQA 3ZQ9A 1CWYA 3WEOA 1JYVA 1M03A 2ESCA 4MDPA 3HU7A 1W9VA 2WMGA 1UA3A 1J9YA 3MUY1 3VNZA 3ARSA 1WNOA 1BGAA 2VI0A 3SUVA 3KZSA 3W29A 2GJXA 4F9JA 2JIEA 1VBRA 1LF1A 3EDEA 2XFRA 4IM4A 2WCSA 3CHDA 4D6HA 1EDTA 4W8AA 1PAMA 3CZLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1E6P A;  5D8W A;  1W1T A;  1E4N A;  1CEO A;  2VUR A;  4HOZ A;  5A8O A;  3PHA A;  3AMK A;  5D9P A;  3WN6 A;  5I5R A;  4YPJ A;  1O7A A;  2WB5 A;  3NSX A;  1CZ1 A;  1M01 A;  4HPH A;  5AY7 A;  4QDM A;  4AD0 A;  3ZT5 A;  4PTM A;  1D3C A;  1DP0 A;  2GDV A;  4C7G A;  1AQH A;  4HPG A;  3WBE A;  4HU8 A;  3WFZ A;  4R5E A;  2V38 A;  1ISW A;  3L2M A;  2YDR A;  2XM1 A;  2NT0 A;  1JGI A;  2O92 A;  3VGD A;  3WH8 A;  4AZI A;  3TA9 A;  3TTY A;  1G1Y A;  2D3N A;  3BAJ A;  3CUJ A;  1QNS A;  2PBG A;  5M03 A;  1H3G A;  1XH0 A;  1C7T A;  2OSW A;  1KR0 A;  1U2Y A;  1FH9 A;  1VAH A;  1XRV A;  1BQC A;  1ZBK A;  3SCV A;  4AD1 A;  3FHA A;  4JL1 A;  3ARY A;  2A3H A;  4OIF A;  2XVK A;  3POH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ODR A;  1Z9A A;  2PDK A;  3B4U A;  3VMO A;  4H9T A;  1W5M A;  4JXC A;  1EO5 A;  1Z7A A;  2OZ0 A;  1V0K A;  1OG6 A;  4UR7 A;  2QCG A;  2D2G A;  3FAX A;  3ZOA A;  4ZL1 A;  4DUO A;  4DXX A;  4E2B A;  3RMJ A;  3AIS A;  4JIH A;  1I6N A;  1X98 A;  3F7J A;  3DEN A;  4AIB A;  5HMS A;  2KFW A;  2ZX5 A;  4AIO A;  1MQP A;  2PA6 A;  2YA1 A;  2XIM A;  2AGT A;  2P10 A;  3P60 A;  4WSH A;  4GI4 A;  2ZX9 A;  2J7H A;  3WF4 A;  1J8V A;  4N6F A;  1KM1 A;  4M6Q A;  4FA3 A;  5LA1 A;  3QV6 A;  1K4H A;  2VGB A;  2WHJ A;  4JYF A;  5K4Z A;  1V03 A;  1RAL A;  1NOF A;  2HXT A;  3GO2 A;  1OFA A;  5D75 A;  1ALD A;  1EPX A;  3N2T A;  4DZA A;  1OFP A;  1VFT A;  4ROP A;  1GRJ A;  1DJQ A;  3DI1 A;  1ICS A;  2ATS A;  3CMG A;  1F40 A;  2PWG A;  4UWM A;  1GK8 A;  2RSE A;  3H7V A;  2PAJ A;  1OIN A;  2QKF A;  1XLD A;  2CLL A;  4I5R A;  5CC7 A;  3IV3 A;  4M24 A;  2PCE A;  3BO9 A;  2HRO A;  4JEJ A;  2FDS A;  2FTY A;  4B16 A;  1EF2 A;  3G0U A;  3KP0 A;  3CT2 A;  2ZZ4 A;  1IZC A;  2ZZ3 A;  5E70 A;  4Q7I A;  2A4A A;  4GCA A;  1RJP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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